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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1801 | 2024-08-07 |
Cell-Penetrating Peptide Delivery of Nucleic Acid Cargo to Emiliania huxleyi, a Calcifying Marine Coccolithophore
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00670
PMID:38147049
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研究论文 | 本文研究了使用细胞穿透肽(CPP)将核酸货物递送到一种钙化的海洋颗石藻(Emiliania huxleyi)中 | 设计了一种包含高脯氨酸含量的CPP,并评估了其对颗石藻细胞的递送性能 | NA | 探索合成生物学在颗石藻生物矿化中的应用 | 海洋颗石藻(Emiliania huxleyi) | NA | NA | 细胞穿透肽(CPP) | NA | 合成肽核酸(PNA) | NA |
1802 | 2024-08-07 |
Fine-Tuned Gene Expression Elements from Hybrid Promoter Libraries in Pichia pastoris
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00534
PMID:38150419
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研究论文 | 本文构建了一个梯度强度启动子库,通过随机杂交和高通量筛选,优化了Pichia pastoris中的基因表达组件。 | 通过构建和筛选新型杂交启动子,实现了基因表达水平的精细调控,并在生物技术生产中验证了其广泛应用性。 | NA | 优化Pichia pastoris中的基因表达组件,扩展其在代谢工程中的应用潜力。 | Pichia pastoris中的启动子和上游调控序列。 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个启动子和调控序列的变体。 |
1803 | 2024-08-07 |
Plant Artificial Chromosomes: Construction and Transformation
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00555
PMID:38163256
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综述 | 本文综述了植物人工染色体的结构、构建方法及其在作物改良中的应用潜力 | 介绍了植物人工染色体技术在作物改良和基因功能研究中的进展 | 目前人工染色体技术在合成重复序列和转化大DNA片段方面仍存在局限 | 探讨如何通过人工染色体技术提高作物产量、品质和抗病性 | 植物人工染色体及其在农业革命中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工染色体技术 | NA | NA | NA |
1804 | 2024-08-07 |
Cloning and sequencing analysis of whole Spiroplasma genome in yeast
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1411609
PMID:38881660
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研究论文 | 本文通过合成生物学技术,成功在酵母中克隆并测序了螺旋体细菌的全基因组 | 首次在酵母中成功克隆了与昆虫相关的螺旋体细菌的全基因组,并验证了克隆效率高且突变率低 | 文中未明确提及具体的局限性 | 探索在酵母中进行全基因组克隆和移植的可行性,以及其在合成生物学中的应用 | 螺旋体细菌的全基因组 | 合成生物学 | NA | Illumina测序 | NA | DNA序列 | 1.12 Mbp的全基因组 |
1805 | 2024-08-07 |
Automated Platform for the Plasmid Construction Process
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00292
PMID:37948662
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研究论文 | 本文报道了名为DNAda的应用程序的开发,该程序能够为J5 DNA组装程序生成的任何给定DNA构建体设计编写自动化指令,并描述了自动化流程及其多个实用功能 | 开发了一个能够自动化编写DNA构建体设计指令的应用程序DNAda,并展示了其在组合DNA组装构建中的实用性 | NA | 开发一个自动化平台,用于处理大型合成生物学实验中的质粒构建过程 | DNA构建体设计的自动化指令编写及组合DNA组装的构建 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | 构建了一个包含120个质粒的库,这些质粒大小从7到14 kb不等,由4到7个DNA片段组成 |
1806 | 2024-08-07 |
GENETTA: a Network-Based Tool for the Analysis of Complex Genetic Designs
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00333
PMID:37963232
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研究论文 | GENETTA 是一种基于网络的工具,利用图论将合成生物学设计转化为网络进行分析和操作 | GENETTA 能够将复杂数据表示为互联点,允许动态定制可视化,包括交互网络和部件层次结构,并能合并来自多个数据库的设计数据 | NA | 开发一种用于分析复杂遗传设计的网络工具 | 合成生物学设计 | 生物信息学 | NA | 图论 | NA | 网络数据 | NA |
1807 | 2024-08-07 |
The Laboratory Automation Protocol (LAP) Format and Repository: A Platform for Enhancing Workflow Efficiency in Synthetic Biology
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00397
PMID:37982688
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研究论文 | 本文介绍了实验室自动化协议(LAP)格式和存储库,旨在提高合成生物学中的工作流程效率 | LAP采用标准化脚本格式,模块化设计,可无缝组合创建定制的目标特定工作流程,并经过实验验证确保可靠性 | NA | 解决实验科学家在实施开源自动化解决方案时缺乏标准化工具包的问题 | 实验室自动化协议(LAP)格式和存储库 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1808 | 2024-08-07 |
Using Methyl Bromide for Interspecies Cell-Cell Signaling and As a Reporter in a Model Soil Consortium
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00559
PMID:37991716
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研究论文 | 研究评估了在土壤微生物群落中,通过合成生物学工具编程单一成员来报告基因表达的可能性,无需破坏土壤基质。 | 通过将甲基卤素转移酶表达与组成型启动子耦合,实现了在土壤中合成甲基卤素,并能通过气体色谱直接读取或通过土壤衍生生物间接响应甲基卤素。 | NA | 开发用于研究土壤微生物群落响应动态水分条件的合成生物学工具。 | 五成员土壤模型群落(MSC)及其在不同环境相关水分条件下的行为。 | 合成生物学 | NA | 气体色谱 | NA | 气体信号 | 五成员土壤模型群落 |
1809 | 2024-08-07 |
Tunable Dynamics in a Multistrain Transcriptional Pulse Generator
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00434
PMID:38016068
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研究论文 | 本文展示了通过调整合成微生物群落中菌株的比例来调节电路动态 | 开发了一种由三种工程菌株组成的微生物群落,利用同型丝氨酸内酯介导的细胞间信号传导形成多菌株不一致类型1前馈环路,作为基因表达的脉冲发生器 | 数学模型在极端比例下的预测准确性有待验证 | 研究如何在合成微生物群落中通过调节菌株比例来实现基因电路的特定行为 | 合成微生物群落中的基因电路动态调节 | 合成生物学 | NA | 细胞间信号传导 | 不一致类型1前馈环路 | 数学模型 | 三种工程菌株组成的微生物群落 |
1810 | 2024-08-07 |
Establishing Tunable Genetic Logic Gates with Versatile Dynamic Performance by Varying Regulatory Parameters
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00554
PMID:38033235
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研究论文 | 本研究通过调整调节参数,设计并构建了具有多功能动态性能的可调遗传逻辑门 | 本研究首次将香豆酸生物传感器系统与tetR或lacI调控系统结合,构建了AND遗传逻辑门,并结合反义RNA或单导RNA构建了香豆酸触发的NOT遗传逻辑门 | NA | 扩展遗传逻辑门在代谢工程和合成生物学中的应用 | 遗传逻辑门的设计与构建 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1811 | 2024-08-07 |
Creation of Architecturally Minimal Transcriptionally Activating Riboswitches Responsive to Theophylline Reveals an Unconventional Design Strategy
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00519
PMID:38052004
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研究论文 | 本研究开发了一种新型设计策略,用于创建结构最小化的转录激活型茶碱响应性核糖开关 | 提出了一种新的设计方法,通过合成茶碱RNA适配体和设计表达平台,实现了高效且广泛兼容的转录激活型核糖开关 | NA | 开发简化的合成核糖开关,以便于集成到复杂的基因电路中 | 转录激活型核糖开关的设计与应用 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计 | NA | RNA序列 | 设计并构建了多个序列,通过虚拟筛选确定了两种转录激活型核糖开关 |
1812 | 2024-08-07 |
Navigating the Frontier of Synthetic Biology: An AI-Driven Analytics Platform for Exploring Research Trends and Relationships
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00192
PMID:37648657
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研究论文 | 本研究利用主题建模技术全面映射合成生物学领域的研究主题,揭示子主题及其关系和时间趋势 | 本研究通过分析合成生物学的文献,揭示了研究主题的子领域和它们之间的关系,以及时间趋势 | NA | 旨在深入理解合成生物学并为其分析提供基础 | 合成生物学的研究主题、子主题及其关系和时间趋势 | 合成生物学 | NA | 主题建模 | NA | 文本 | NA |
1813 | 2024-08-07 |
Nonsterilized Fermentation of Crude Glycerol for Polyhydroxybutyrate Production by Metabolically Engineered Vibrio natriegens
2023-11-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00498
PMID:37856147
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研究论文 | 本文通过基因工程改造快速生长的盐和有毒物质耐受性强的细菌Vibrio natriegens,实现了从非灭菌发酵的有机废物中高效生产聚羟基丁酸酯(PHB) | 通过基因编辑和过表达关键基因,成功提高了PHB的产量和耐受性,且在非灭菌条件下表现出色 | NA | 探索通过基因工程提高微生物发酵生产聚羟基丁酸酯的效率和成本效益 | Vibrio natriegens细菌及其在PHB生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 微生物发酵 | NA |
1814 | 2024-08-07 |
The "Duckweed Dip": Aquatic Spirodela polyrhiza Plants Can Efficiently Uptake Dissolved, DNA-Wrapped Carbon Nanotubes from Their Environment for Transient Gene Expression
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554121
PMID:37662322
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研究论文 | 研究报告了水生植物大浮萍(Spirodela polyrhiza)能够高效地从其生长介质中吸收包裹在DNA中的碳纳米管(DNA-CNTs),并实现转基因表达 | 提出了一个简化的转基因传递工具——“浮萍浸泡法”,无需大量纳米材料或直接渗透到植物组织中 | NA | 探索浮萍在合成生物学中的应用潜力 | 大浮萍植物及其转基因表达能力 | 植物生物技术 | NA | 碳纳米管(DNA-CNTs) | NA | NA | NA |
1815 | 2024-08-07 |
Robust soybean leaf agroinfiltration
2024-Jun-05, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03245-4
PMID:38837057
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研究论文 | 开发了一种基于农杆菌渗透的稳定基因瞬时表达方法,用于大豆叶片 | 创新了一种在大豆中更为稳定的农杆菌渗透方法,适用于全球广泛种植的豆科植物 | NA | 旨在开发一种在大豆中稳定进行农杆菌渗透的方法,以直接在作物物种中测试转基因构建体的性能 | 大豆叶片 | 植物生物技术 | NA | 农杆菌渗透 | NA | NA | 两个大豆品系(V17-0799DT和TN16-5004)的年轻叶片 |
1816 | 2024-08-07 |
Introduction to Engineering Biology: A Conceptual Framework for Teaching Synthetic Biology
2023-06-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00194
PMID:37322886
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research paper | 本文介绍了一个可适应的课程模块,用于教授工程生物学的基础原理和应用 | 创建了一个由工程生物学专家设计的概念性幻灯片组,涵盖了关键主题领域,并可在现有课程材料中独立使用或整合 | NA | 旨在提高当前工程生物学主题的教学便利性并增加公众对该领域的参与度 | 工程生物学的基础原理和应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1817 | 2024-08-07 |
Decoding the photoprotection strategies and manipulating cyanobacterial photoprotective metabolites, mycosporine-like amino acids, for next-generation sunscreens
2024-Jul, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108744
PMID:38781638
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综述 | 本文综述了利用蓝细菌合成的光保护代谢物——类海藻氨基酸(MAAs)作为下一代防晒剂的潜力和策略 | 探讨了通过基因组挖掘、异源表达和合成生物学等工具开发下一代防晒剂的新方法,并提出了生物纳米共轭结构的概念 | NA | 探索和开发有效的光保护策略,特别是利用蓝细菌产生的类海藻氨基酸(MAAs)作为商业防晒剂的替代品 | 蓝细菌合成的类海藻氨基酸(MAAs)及其在防晒剂中的应用 | 生物技术 | NA | 基因组挖掘, 异源表达, 合成生物学 | NA | NA | NA |
1818 | 2024-08-07 |
[Closed-loop synthetic gene circuits for cell-based therapies]
2024-May, Medecine sciences : M/S
DOI:10.1051/medsci/2024054
PMID:38819279
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研究论文 | 本文探讨了利用闭环合成基因电路的细胞疗法,这些细胞能够自主治疗慢性疾病 | 最新一代的合成电路通过先进的生物工程策略来解决安全性和可行性问题 | 这些疗法在临床上仍面临安全性和体内实施可行性的挑战 | 旨在开发新的细胞疗法,用于自主治疗慢性疾病 | 闭环合成基因电路的细胞 | 合成生物学 | 慢性疾病 | NA | NA | NA | NA |
1819 | 2024-08-07 |
Shared and more specific genetic determinants and pathways underlying yeast tolerance to acetic, butyric, and octanoic acids
2024-Feb-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02309-0
PMID:38419072
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研究论文 | 本研究通过化学基因组学分析和生理学研究,揭示了酵母对醋酸、丁酸和辛酸耐受性的共享遗传决定因素和途径 | 首次报告了丁酸和辛酸的耐受基因列表,并提供了对线性链单羧酸毒性和耐受性机制的新生物学知识 | NA | 指导基因组工程,开发更健壮的酵母菌株,以实现可持续的生物转化过程 | 酵母对醋酸、丁酸和辛酸的耐受性 | NA | NA | 化学基因组学分析 | NA | 基因组数据 | NA |
1820 | 2024-08-07 |
Marine Microbial-Derived Resource Exploration: Uncovering the Hidden Potential of Marine Carotenoids
2022-May-26, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md20060352
PMID:35736155
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综述 | 本文综述了海洋微生物产生的天然类胡萝卜素的研究进展,讨论了类胡萝卜素的发现方法、生物活性、代谢过程及其在健康和制药行业的应用 | 介绍了使用生物合成基因簇(smBGCs)的计算机方法和基于规则及机器学习的生物信息学工具来发现类胡萝卜素的新方法 | NA | 探讨海洋微生物产生的类胡萝卜素的最新研究及其在工业中的应用潜力 | 海洋微生物产生的类胡萝卜素及其生物合成过程 | NA | NA | 生物信息学工具 | 机器学习 | 基因簇数据 | NA |