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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1821 | 2024-08-07 |
Standardizing Automated DNA Assembly: Best Practices, Metrics, and Protocols Using Robots
2019-06, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/2472630318825335
PMID:30768372
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研究论文 | 本文探讨了标准化自动化DNA组装的最佳实践、指标和协议,使用机器人进行高效和高通量的DNA片段组装 | 开发了一种新的DNA组装指标(Q-metric)和软件工具Puppeteer,用于评估自动化方法相对于传统手动操作的优势 | NA | 开发和测试协议、硬件和软件,以通过可量化的指标优化DNA组装 | DNA组装的标准化、高效和可重复的MoClo协议 | 合成生物学 | NA | 自动化DNA组装 | NA | DNA序列 | 多个不同的DNA组装配置 |
1822 | 2024-08-07 |
RNA-aptamers-in-droplets (RAPID) high-throughput screening for secretory phenotypes
2017-08-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-00425-7
PMID:28835641
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RNA-aptamers-in-droplets(RAPID)的高通量筛选方法,用于检测微生物分泌的高价值化学品 | RAPID方法通过使用适配体将细胞外产物浓度转化为荧光信号,实现了对数百万变异体的高通量筛选 | 目前的高通量测试和筛选速度跟不上基因工程微生物库的生成速度 | 旨在通过高通量筛选技术提高微生物生产高价值化学品的能力 | 基因工程改造的微生物,特别是酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 滴液微流控技术 | NA | 荧光信号 | 数百万变异体 |
1823 | 2024-08-07 |
Direct Analysis of Gene Synthesis Reactions Using Solid-State Nanopores
2015-Dec-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5b05782
PMID:26580227
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研究论文 | 本文利用固态纳米孔技术对基因合成反应中的分子进行分类,区分正确和错误的组装 | 提出了一种新的方法,通过固态纳米孔技术实时监测基因合成反应,提高了复杂性和降低了成本 | NA | 探索和优化基因合成反应,提高其效率和降低成本 | 基因合成反应中的分子分类 | DNA纳米技术 | NA | 固态纳米孔技术 | NA | 分子 | NA |
1824 | 2024-08-07 |
DNA Assembly in 3D Printed Fluidics
2015, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0143636
PMID:26716448
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研究论文 | 本文展示了在3D打印流体设备中进行Golden Gate DNA组装的过程 | 利用3D打印技术制造微流控设备,降低了成本并提高了制造速度 | 3D打印微流控设备的操作可能需要专业知识 | 探索3D打印技术在合成生物学中的应用 | 3D打印的微流控设备及其在DNA组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | 流体设备 | 反应体积最小为490 nL,通道宽度精细至220微米 |
1825 | 2024-08-07 |
Polymersomes with micellar patches
2024-Oct, Journal of colloid and interface science
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.jcis.2024.05.177
PMID:38815380
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研究论文 | 本文介绍了两种利用静电作用将聚合物囊泡和模型胶体(胶束)组装成混合簇的新方法 | 提出了两种新的静电驱动方法来组装聚合物囊泡和胶束,一种通过pH调节静电相互作用,另一种通过酸触发剂的酸解来实现时间控制 | NA | 探索聚合物囊泡作为胶体构建块用于创建更高阶簇结构的新方法 | 聚合物囊泡和胶束的组装 | 材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1826 | 2024-08-07 |
Metabolic Investigation and Auxiliary Enzyme Modelization of the Pyrrocidine Pathway Allow Rationalization of Paracyclophane-Decahydrofluorene Formation
2024-04-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00684
PMID:38576157
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研究论文 | 研究了真菌中含paracyclophane-decahydrofluorene的天然产物的生物合成途径,通过基因失活、代谢分析和分子建模来阐明关键酶的作用 | 揭示了pyrrocidine生物合成基因簇的非凡可塑性,并通过分子对接实验和模型化提出了新的生物合成机制 | NA | 研究pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶的作用机制 | pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶 | NA | NA | 基因失活、代谢分析、分子建模 | NA | 代谢物 | 九种pyrrocidine及其类似物,以及多种突变体中积累的代谢物 |
1827 | 2024-08-07 |
Genetic Engineering of Resident Bacteria in the Gut Microbiome
2023-07-25, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00127-23
PMID:37382533
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综述 | 本文综述了肠道微生物群中常驻细菌的遗传工程技术及其在评估宿主-微生物相互作用和调节人类生理中的应用 | 新兴的合成生物学工具集为非模型常驻肠道微生物的遗传工程提供了改进的基础 | NA | 探讨遗传工程在肠道微生物群中的应用及其对宿主健康的影响 | 肠道微生物群中的常驻细菌 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
1828 | 2024-08-07 |
Characterization and engineering of peroxisome targeting sequences for compartmentalization engineering in Pichia pastoris
2024-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28706
PMID:38568751
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研究论文 | 本研究通过建立基于β-胡萝卜素生物合成途径的高通量筛选方法,评估了Pichia pastoris中PTS1s(过氧化物酶体靶向信号类型1)的靶向效率,并进行了定向进化,以增强过氧化物酶体靶向效率,最终应用于香叶醇生物合成途径的过氧化物酶体区室化。 | 本研究首次在Pichia pastoris中系统地表征了25个假定的内源性PTS1s,并通过定向进化方法构建了两个PTS1突变库,识别出51个具有更高过氧化物酶体靶向效率的PTS1s。 | 研究中过氧化物酶体的丰度和蛋白质组成在特定碳源诱导下高度可变,这可能影响PTS1s的靶向效率和应用。 | 研究旨在通过表征和工程化过氧化物酶体靶向序列,推进Pichia pastoris中的过氧化物酶体区室化工程。 | 研究对象包括过氧化物酶体靶向信号类型1(PTS1s)及其在Pichia pastoris中的靶向效率。 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选方法 | NA | 图像 | 25个假定的内源性PTS1s,51个PTS1s(29个经典和22个非典型PTS1s) |
1829 | 2024-08-07 |
Leveraging the histidine kinase-phosphatase duality to sculpt two-component signaling
2024-Jun-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49251-8
PMID:38858359
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研究论文 | 本文研究了细菌双组分系统(TCS)中传感组氨酸激酶(SHK)的激酶-磷酸酶双重活性如何影响信号响应 | 通过改变激酶-磷酸酶平衡,提高了系统的红光敏感性,并展示了如何通过故意扰动激酶-磷酸酶双重活性来解锁新的信号响应机制 | NA | 探究细菌双组分系统中激酶-磷酸酶双重活性对信号响应的影响 | 细菌双组分系统中的传感组氨酸激酶 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
1830 | 2024-08-07 |
Thermostable in vitro transcription-translation compatible with microfluidic droplets
2024-Jun-10, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02440-y
PMID:38858677
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研究论文 | 本文开发了一种能在高温下操作的体外表达系统,该系统与酶学检测和微流控水油滴技术兼容,适用于超高通量蛋白质表达。 | 首次实现了在微流控水油滴中进行高温下的体外表达,使用来自Thermus thermophilus的细胞提取物,包括热稳定酶级联和中等热稳定的RNA聚合酶。 | RNA聚合酶的热稳定性限制了蛋白质合成的温度。 | 开发一种能在高温下操作的体外表达系统,以筛选大量天然或人工遗传多样性中的高度热稳定酶或酶变体。 | Thermus thermophilus的细胞提取物及其在高温下进行体外表达的能力。 | 合成生物学 | NA | 微流控水油滴技术 | NA | NA | NA |
1831 | 2024-08-07 |
A novel nucleic acid linker for multi-gene expression enhances plant and animal synthetic biology
2024-Jun, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16714
PMID:38470090
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研究论文 | 本文报道了一种来自真菌Glarea lozoyensis的26个核苷酸的核酸连接子NAL1及其截短衍生物,能够在玉米原生质体瞬时表达系统和人293T细胞中连接两个基因作为双顺反子,实现独立翻译 | 开发了一种新的核酸连接子NAL1,能够有效连接多个基因,增强植物和动物合成生物学中的基因表达 | NA | 探索和优化用于多基因表达的核酸连接子,以促进植物和动物合成生物学的发展 | 核酸连接子NAL1及其在植物和动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1832 | 2024-08-07 |
Optogenetic therapeutic strategies for diabetes mellitus
2024-Jun, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.13557
PMID:38751366
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review | 本文综述了光遗传学在糖尿病治疗中的最新进展及其与合成生物学方法的结合,用于生产光响应细胞以改善胰岛素/GLP-1生产和胰岛素抵抗 | 光遗传学作为一种新型治疗策略,利用遗传编码的光敏感蛋白精确控制细胞功能,为糖尿病治疗提供了创新方法 | 讨论了光遗传学在细胞治疗临床转化研究中面临的挑战 | 总结光遗传学在糖尿病治疗中的最新发展和应用 | 光遗传学技术及其在糖尿病治疗中的应用 | NA | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | NA |
1833 | 2024-08-07 |
The view of synthetic biology in the field of ethics: a thematic systematic review
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1397796
PMID:38863492
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综述 | 本文通过系统综述方法分析了2000年至2020年间合成生物学领域的伦理辩论,旨在确定伦理在合成生物学中的地位 | NA | NA | 确定伦理在合成生物学中的地位 | 合成生物学领域的伦理问题 | 生物技术 | NA | NA | NA | 文献 | 58篇出版物 |
1834 | 2024-08-07 |
Comparative transcriptomic analysis revealed important processes underlying the static magnetic field effects on Arabidopsis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1390031
PMID:38863539
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研究论文 | 本研究通过比较转录组分析,探讨了静磁场对拟南芥生长和发育的影响及其分子机制 | 发现不均匀静磁场通过上调生长素合成和信号转导基因以及维持铁稳态来促进植物生长 | NA | 探究静磁场对植物生长和发育的影响及其分子机制 | 拟南芥 | 植物生物学 | NA | 比较转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
1835 | 2024-08-07 |
Glutamine-derived peptides: Current progress and future directions
2024-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13386
PMID:38847753
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综述 | 本文综述了谷氨酰胺单体在临床、运动和肠内营养中的应用,并比较了单体与谷氨酰胺衍生肽的功能效果 | 探讨了基于人工智能(AI)的肽组学和合成生物学在谷氨酰胺衍生肽从头设计和大规模生产中的潜在整合 | 目前对谷氨酰胺衍生肽的结构-功能关系的理解仍处于探索阶段 | 旨在综述谷氨酰胺衍生肽的应用及其在食品科学中的发现、功能验证和生物制造的未来发展 | 谷氨酰胺衍生肽及其在食品科学中的应用 | NA | NA | 肽组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
1836 | 2024-08-07 |
Chemotactic Interactions Drive Migration of Membraneless Active Droplets
2024-Jun-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c02823
PMID:38620052
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研究论文 | 本文研究了无膜活性液滴在化学趋向性作用下的迁移行为 | 首次展示了酶活性细胞大小的液滴能够自由移动,并通过化学梯度与周围液滴集体交互 | NA | 探索无膜活性液滴在化学趋向性作用下的迁移行为及其在生物启发材料和合成生物学工具中的应用潜力 | 酶活性细胞大小的液滴及其在化学梯度下的迁移行为 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1837 | 2024-08-07 |
Functional Characterization and Catalytic Activity Improvement of Borneol Acetyltransferase from Wurfbainia longiligularis
2024-Jun-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c02915
PMID:38813660
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研究论文 | 本研究对来自Wurfbainia longiligularis的龙脑乙酰转移酶(BAT)进行了功能表征和催化活性改进 | 首次鉴定出能够乙酰化龙脑合成龙脑酯(BA)的BAT基因,并通过分子模拟和定点突变提高了其催化效率 | 研究主要集中在龙脑类型的底物上,对其他类型底物的催化活性未详细探讨 | 旨在提高龙脑乙酰转移酶的催化活性,为植物代谢工程和合成生物学提供关键遗传元件 | 龙脑乙酰转移酶(BAT)及其催化活性 | 生物化学 | NA | 分子模拟,定点突变 | NA | 基因序列 | 三个BAT基因 |
1838 | 2024-08-07 |
Building Synthetic Yeast Factories to Produce Fat-soluble Antioxidants
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103129
PMID:38703526
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学技术,通过改造酵母微生物工厂生产脂溶性抗氧化剂的最新进展 | 探讨了酶工程、产物隔离、亚细胞区室化、多级发酵和形态工程等创新方法 | NA | 探讨通过微生物工程生产脂溶性抗氧化剂的前景 | 脂溶性抗氧化剂,包括类胡萝卜素、维生素E和二苯乙烯 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1839 | 2024-08-07 |
Plant synthetic biology for human health: advances in producing medicines in heterologous expression systems
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103142
PMID:38735192
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综述 | 本文综述了利用植物合成生物学在异源表达系统中生产高价值植物天然产物及其在药物合成中的应用 | 利用'omics'技术加速了药用植物中基因的发现,使得复杂结构的生物活性植物天然产品的多步生物合成途径能在异源植物表达系统中更快地重建 | NA | 探讨植物合成生物学在药物生产和供应中的应用 | 药用植物中的生物活性天然产物及其生物合成途径 | NA | NA | omics技术 | NA | 基因 | NA |
1840 | 2024-08-07 |
Synthetic biology advances towards a bio-based society in the era of artificial intelligence
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103143
PMID:38781699
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学与人工智能结合在构建生物基社会中的应用 | 将人工智能方法引入合成生物学,加速了生物基社会目标的实现 | NA | 探索合成生物学与人工智能结合在多个领域的应用,以实现可持续的社会生产系统 | 合成生物学与人工智能在健康、工业、农业和环境等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 人工智能 | NA | NA | NA |