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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1841 | 2024-08-07 |
Recent advances in plant-based bioproduction
2024-Jul, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2024.01.007
PMID:38614829
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综述 | 本文综述了基于植物的生物生产领域的最新进展和前景 | 随着组学、生物信息学、合成生物学及其他多种技术的发展,植物生物生产的吸引力不断增加 | NA | 探讨基于植物的生物生产技术的现状与未来发展 | 植物来源的低分子量化合物、蛋白质以及相关生物生产技术 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | NA |
1842 | 2024-08-07 |
Thermostable WW-Domain Scaffold to Design Functional β-Sheet Miniproteins
2024-Jun-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c03498
PMID:38853610
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研究论文 | 本文介绍了设计一种高度耐热的WW结构域,这是一个三股β片层结构,具有约90°C的优异熔化温度,可作为核心支架,在其上可以嫁接受体样性质。 | 本文通过特定的序列迭代和NMR光谱技术,确定了影响结构和热稳定性的序列位置,从而设计出高度耐热的WW结构域支架,并成功嫁接了不同的结合模式。 | NA | 设计高度耐热的WW结构域支架,用于合成生物学和材料设计中的功能性β片层肽迷你蛋白。 | WW结构域支架及其在合成生物学和材料设计中的应用。 | 合成生物学 | NA | NMR光谱技术 | WW结构域 | 结构特征 | NA |
1843 | 2024-08-07 |
Exploring plant-derived phytochrome chaperone proteins for light-switchable transcriptional regulation in mammals
2024-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49254-5
PMID:38849338
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研究论文 | 本文验证了源自植物的phytochrome chaperone蛋白FHY1和FHL在哺乳动物细胞和小鼠中的转录激活功能及同/异二聚化活性,并开发了一种光控转录调节平台 | 利用FHY1/FHL与phytochrome ΔPhyA相互作用形成的光感应转录调节复合体(PTRC),实现了通过红光或远红光切换活性状态的光控转录调节 | NA | 开发一种光控的、正交的、模块化的和可调的基因转录控制平台,并将其应用于生物医学工程 | 源自植物的phytochrome chaperone蛋白FHY1和FHL在哺乳动物中的应用 | 合成生物学 | NA | 光感应转录调节 | CRISPRa系统 | 基因表达 | 哺乳动物细胞和小鼠 |
1844 | 2024-08-07 |
Emerging trends in production of plant natural products and new-to-nature biopharmaceuticals in yeast
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103098
PMID:38452572
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母生产植物天然产物和新颖生物制药的趋势 | 文章介绍了基于合成生物学的创新策略,主要依赖于工程微生物系统进行化合物合成 | NA | 旨在探索和优化酵母中植物衍生代谢物的异源生产 | 植物天然产物和新颖生物制药 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 酵母 | NA | NA |
1845 | 2024-08-07 |
Advancing in vivo reprogramming with synthetic biology
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103109
PMID:38520824
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略重编程细胞的方法,并讨论了通过递送修饰mRNA在体内改变细胞功能的新机遇 | 结合合成生物学和体内mRNA递送的概念,为体内细胞重编程的创新提供了平台 | NA | 探讨如何通过合成生物学和mRNA递送技术推进体内细胞重编程 | 细胞重编程的策略和体内mRNA递送技术 | 合成生物学 | NA | mRNA递送 | NA | NA | NA |
1846 | 2024-08-07 |
Advances in algal lipid metabolism and their use to improve oil content
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103130
PMID:38579630
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学原理优化微藻株以提高脂质产量的最新进展 | 介绍了使用基因编辑工具提高油含量的实例 | NA | 提高微藻的脂质产量,以促进生物燃料的商业化生产 | 微藻的脂质代谢 | 生物技术 | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
1847 | 2024-08-07 |
Synthetic reprogramming of plant developmental and biochemical pathways
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103139
PMID:38691988
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综述 | 本文综述了植物合成生物学领域在重编程植物发育和生化途径方面的研究进展 | 利用新的基因表达工具包改变植物结构,以提高模型和作物系统中的性能,并在植物组织中生产有用代谢物 | 讨论了采用植物合成生物学解决农业和人类健康复杂问题的挑战和机遇 | 旨在通过操纵细胞功能和构建新型生化途径,开发具有新表型特征、产量增强的植物,并能生产天然产物和药物 | 植物发育和生化途径 | NA | NA | 基因表达工具包 | NA | NA | NA |
1848 | 2024-08-07 |
Phytosensors: harnessing plants to understand the world around us
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103134
PMID:38705091
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综述 | 本文综述了利用植物作为生物传感器(phytosensors)的现状和进展 | 介绍了新一代植物传感器在建筑环境和极端环境(如太空)中的应用潜力 | NA | 探讨植物传感器工程的当前技术水平 | 植物传感器(phytosensors)的设计和应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1849 | 2024-08-07 |
Reconstitution and optimization of complex plant natural product biosynthetic pathways in microbial expression systems
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103136
PMID:38705090
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综述 | 本文综述了在微生物表达系统中重建和优化复杂植物天然产物生物合成途径的最新进展 | 介绍了合成生物学在可持续、低成本和大规模生产植物天然产物方面的应用,并探讨了机器学习与BioFoundry结合的未来前景 | NA | 探讨提高植物天然产物生物合成效率的技术和方法 | 植物天然产物及其在微生物表达系统中的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA |
1850 | 2024-08-07 |
Sourcing DNA parts for synthetic biology applications in plants
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103140
PMID:38723389
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综述 | 本文综述了在植物合成生物学应用中选择和优化DNA部件的当前方法和基本构建设计建议 | 介绍了新的实验和计算工具的开发 | NA | 旨在为选择和优化DNA部件提供信息和基本构建设计建议 | DNA部件的选择和优化 | 合成生物学 | NA | DNA合成和组装 | NA | DNA | NA |
1851 | 2024-08-07 |
Biocomputing in plants, from proof of concept to application
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103146
PMID:38781700
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综述 | 本文综述了在植物中实现生物计算的工具和设计方法,并强调了这些电路在理解和工程化植物与环境、发育和代谢途径相互作用中的最新和潜在应用 | 介绍了在植物合成电路中集成多信号以实现可调节植物表型的创新方法 | NA | 探讨合成生物学在应对气候变化和可持续发展挑战中的应用 | 植物合成生物学中的逻辑电路 | 合成生物学 | NA | 生物计算 | NA | NA | NA |
1852 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas tools for simultaneous transcription & translation control in bacteria
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae275
PMID:38613390
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研究论文 | 本文利用CRISPR-dCas13系统在细菌中实现对基因转录和翻译的同时控制 | 通过结合dCas9的转录激活和dCas13的翻译抑制,实现了在多基因操纵子中选择性激活单个基因,并减少了极性效应 | NA | 开发能够在微生物合成生物学中精确控制基因翻译的工具 | 大肠杆菌中的基因转录和翻译控制 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13 | NA | 基因组数据 | NA |
1853 | 2024-08-07 |
Towards an Aspect-Oriented Design and Modelling Framework for Synthetic Biology
2018-Sep-15, Processes (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pr6090167
PMID:30568914
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研究论文 | 本文提出了一种基于面向方面软件工程概念的合成生物学设计框架,以解决传统基于组件的系统构建方法在处理复杂应用时的问题 | 该框架通过引入面向方面的设计理念,能够将核心关注点与系统级属性分离,从而使设计过程更加模块化 | NA | 旨在为合成生物学提供一种新的设计框架,以实现更复杂应用的开发 | 合成生物学系统的设计与建模 | 合成生物学 | NA | 面向方面的软件工程 | NA | NA | NA |
1854 | 2024-08-07 |
Tellurium: An extensible python-based modeling environment for systems and synthetic biology
2018-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2018.07.006
PMID:30053414
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research paper | 本文介绍了一个基于Python的建模环境Tellurium,用于系统生物学和合成生物学中的模型构建、模拟和分析 | Tellurium是一个模块化、跨平台、开源的模拟环境,集成了多个库、插件和专用模块,提供了一个统一但可扩展的生物建模和分析解决方案 | NA | 开发一个便于模型在系统生物学和合成生物学中可重复使用的建模环境 | 系统生物学和合成生物学中的模型构建、模拟和分析 | systems biology | NA | Python | libRoadRunner | model | NA |
1855 | 2024-08-07 |
First characterization of a biphasic, switch-like DNA amplification
2018-Apr-16, The Analyst
DOI:10.1039/c8an00130h
PMID:29577124
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研究论文 | 本文首次报道了一种具有开关特性的双相DNA扩增化学反应 | 该化学反应具有双相特性,第一阶段后会出现前所未有的高增益产品寡核苷酸爆发的第二阶段,且第二阶段产品产量是第一阶段的10到100倍 | NA | 研究一种新型的双相DNA扩增化学反应及其应用潜力 | 双相DNA扩增化学反应的机制及其在不同领域的应用 | 合成生物学 | NA | DNA扩增 | NA | DNA | 约1 pM寡核苷酸触发剂 |
1856 | 2024-08-07 |
RNA Polymerase Tags To Monitor Multidimensional Protein-Protein Interactions Reveal Pharmacological Engagement of Bcl-2 Proteins
2017-08-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.7b06152
PMID:28767232
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研究论文 | 本文报道了一种利用分裂RNA聚合酶(RNAP)标签监测活体哺乳动物细胞内多维蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的新技术 | 该技术通过分裂RNAP标签监测PPIs,提供了多维度和敏感检测,利用核酸扩增和分析技术,改进了其他蛋白质片段互补(PFC)方法 | NA | 开发和验证一种新的监测Bcl-2家族蛋白质多维PPIs的方法 | Bcl-2家族蛋白质及其在细胞凋亡中的调节作用 | 生物技术 | 癌症 | 分裂RNA聚合酶(RNAP)标签 | NA | RNA信号 | 活体哺乳动物细胞 |
1857 | 2024-08-07 |
Engineering genetic circuit interactions within and between synthetic minimal cells
2017-05, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/nchem.2644
PMID:28430194
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research paper | 本文研究了如何在合成最小细胞(synells)中通过脂质体封装实现遗传电路和反应级联的模块化控制 | 本文首次展示了通过脂质体封装实现遗传电路和反应级联的模块化控制,并证明了这些级联可以通过外部信号和脂质体间通信进行控制而不会发生串扰 | NA | 研究如何最大化遗传电路和反应级联设计的模块性,以实现不同反应网络的集成及其可扩展性和灵活性的优化 | 遗传电路和反应级联的模块化设计 | 合成生物学 | NA | 脂质体封装 | NA | NA | NA |
1858 | 2024-08-07 |
Heteroatom-Heteroatom Bond Formation in Natural Product Biosynthesis
2017-Apr-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.6b00621
PMID:28375000
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综述 | 本文综述了含有杂原子-杂原子键(X-X,其中X = N, O, S, P)的功能团在天然产物生物合成中的形成机制 | 阐明和表征生成X-X键的生物合成途径,为生物催化与合成生物学提供工具,并指导发现含有这些结构特征的新天然产物 | NA | 探讨含有X-X键的功能团在天然产物中的生物合成逻辑和酶化学 | 含有杂原子-杂原子键的天然产物及其生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1859 | 2024-08-07 |
Design of a hyperstable 60-subunit protein dodecahedron. [corrected]
2016-07-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18010
PMID:27309817
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研究论文 | 本文描述了一种计算设计的25纳米十二面体纳米笼,该纳米笼由三聚体蛋白质构建块自组装而成 | 设计了一种高度稳定且可自组装的蛋白质十二面体结构,具有高度定制化的应用潜力 | NA | 开发新型蛋白质容器,用于靶向药物递送、疫苗设计和合成生物学 | 蛋白质十二面体纳米笼的设计与性能 | 生物技术 | NA | 电子显微镜 | NA | 蛋白质结构 | 60个亚基 |
1860 | 2024-08-07 |
Controlling the Cyanobacterial Clock by Synthetically Rewiring Metabolism
2015-Dec-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2015.11.031
PMID:26686627
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法使蓝细菌能够在异源糖上生长,从而独立于光照和黑暗操纵代谢,研究代谢与生物钟的关系 | 本文首次证明代谢活动,无论其来源如何,是蓝细菌生物钟的主要驱动因素 | NA | 探讨代谢信号是否是影响生物钟的主要因素 | 蓝细菌的生物钟与代谢 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |