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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1861 | 2024-08-07 |
Synthetic analog and digital circuits for cellular computation and memory
2014-Oct, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2014.04.009
PMID:24794536
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综述 | 本文综述了当前计算遗传电路的状态,描述了执行数字和模拟计算的人工基因电路,并讨论了设计展示记忆功能的基因网络的最新进展,以及如何将记忆和计算集成以产生更复杂的系统,既能处理信息又能记录信息 | 提出了新的生物电路工程方向,这些电路能够进行计算 | NA | 探讨生物计算领域的发展,特别是基因电路在细胞计算和记忆中的应用 | 计算遗传电路和展示记忆功能的基因网络 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1862 | 2024-08-07 |
Using the population-shift mechanism to rationally introduce "Hill-type" cooperativity into a normally non-cooperative receptor
2014-Sep-01, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201403777
PMID:25044647
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研究论文 | 本文展示了如何利用人口转移机制合理地将“Hill型”协同性引入通常非协同的受体中 | 提出了一种可推广的人口转移方法,通过设计在低亲和态和高亲和态之间平衡的受体,实现了接近理想行为的协同性 | NA | 旨在提高人工生物系统的响应能力 | 协同性分子信标,一种广泛使用的DNA传感器 | 合成生物学 | NA | 人口转移机制 | NA | NA | NA |
1863 | 2024-08-07 |
Upgrading protein synthesis for synthetic biology
2013-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1339
PMID:24045798
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1864 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach to the development of transcriptional regulatory models and custom enhancer design
2013-Jul-15, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2013.05.014
PMID:23732772
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研究论文 | 本文讨论了两种新颖的计算方法,用于定制设计增强子,利用经验验证的转录模型、优化算法和合成生物学 | 提出了两种新颖的计算方法,一种使用模拟退火探索合成增强子的序列空间,另一种使用新的优化算法寻找两个增强子序列之间的功能可达路径 | NA | 阐明转录调控机制和增强子逻辑,改进现有的调控模型并解决进化问题 | 转录调控模型和定制增强子的设计 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 数学框架 | 序列 | NA |
1865 | 2024-08-07 |
Synthetic biology: an RNP switch raises a roadblock
2010-Jan, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.287
PMID:20016492
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1866 | 2024-08-07 |
Expanding the structural diversity of terpenes by synthetic biology approaches
2024-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.12.006
PMID:38233232
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法扩展萜类化合物结构多样性的新途径 | 介绍了通过组合生物合成非典型构建块的方法,包括共表达规范的甲羟戊酸(MVA)途径和C-甲基转移酶(C-MTs),或使用鳞翅目甲羟戊酸(LMVA)途径,以及通过化学生物合成和人工金属酶(ArMs)进行的萜类环丙烷化 | NA | 增加有价值萜类化合物及其衍生物的多样性,并扩展其潜在应用 | 萜类化合物的结构多样性 | NA | NA | 组合生物合成 | NA | NA | NA |
1867 | 2024-08-07 |
Synthetic biology for Taxol biosynthesis and sustainable production
2024-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.04.001
PMID:38609783
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法促进抗癌化合物紫杉醇的生物合成和可持续生产 | 文章报道了紫杉醇生物合成途径中缺失步骤的发现,特别是氧杂环丁烷环的形成 | NA | 旨在通过合成生物学方法促进紫杉醇的可持续生产 | 紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1868 | 2024-08-07 |
Engineering a carbon source-responsive promoter for improved biosynthesis in the non-conventional yeast Kluyveromyces marxianus
2024-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00238
PMID:38845682
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研究论文 | 本文开发了一种新型合成碳源响应启动子,用于提高非传统酵母Kluyveromyces marxianus的生物合成能力 | 通过融合碳源响应元件和强启动子核心,实现了在不同碳源条件下的启动子强度调节,从而优化了有毒代谢物的生产 | NA | 开发碳源响应启动子,以提高有毒代谢物的生产效率 | Kluyveromyces marxianus酵母中的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
1869 | 2024-08-07 |
Synonymous but not the same: the causes and consequences of codon bias
2011-Jan, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg2899
PMID:21102527
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研究论文 | 本文探讨了同义突变对细胞过程的影响及其在分子进化和生物技术领域的重要性 | 利用最新的测序和合成生物学技术,揭示了关于密码子偏倚的新模式,并提出了关于蛋白质合成的新假设 | NA | 理解密码子偏倚及其在自然同义变异和应用背景下的转基因设计中的作用 | 同义突变和密码子偏倚 | 分子进化 | NA | 测序技术,合成生物学 | NA | NA | NA |
1870 | 2024-08-07 |
Non-natural nucleic acids for synthetic biology
2009-Dec, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2009.09.030
PMID:19879178
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review | 本文综述了非天然核苷酸在合成生物学中的应用及其与聚合酶的兼容性 | 探讨了非天然核苷酸如何赋予基因对核酸酶的抗性并促进表达 | NA | 评估非天然核苷酸在合成生物学中的应用潜力 | 非天然核苷酸及其与聚合酶的兼容性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1871 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of two O-methyltransferases involved in biosynthesis of methylated 2-(2-phenethyl)chromones in agarwood
2024-Jun-07, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae130
PMID:38497815
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了两种O-甲基转移酶,这些酶参与了沉香木中甲基化2-(2-苯乙基)色酮的生物合成 | 首次在沉香木中鉴定出29个O-甲基转移酶基因,并通过体外酶活性和功能分析证实了AsOMT11和AsOMT16在甲基化2-(2-苯乙基)色酮生物合成中的作用 | NA | 旨在鉴定和表征参与沉香木中甲基化2-(2-苯乙基)色酮生物合成的O-甲基转移酶 | 沉香木中的O-甲基转移酶及其在甲基化2-(2-苯乙基)色酮生物合成中的作用 | NA | NA | 基因表达分析、体外酶活性测定、功能分析 | NA | 基因组数据 | 29个O-甲基转移酶基因 |
1872 | 2024-08-07 |
Structural Basis for the Interaction of Redβ Single-Strand Annealing Protein with Escherichia coli Single-Stranded DNA-Binding Protein
2024-Jun-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168590
PMID:38663547
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研究论文 | 研究了Redβ单链连接蛋白与大肠杆菌单链DNA结合蛋白之间的相互作用结构基础 | 确定了Redβ CTD与SSB末端九个残基肽段的晶体结构,揭示了两者间的主要相互作用机制 | NA | 阐明Redβ与大肠杆菌单链DNA结合蛋白的相互作用机制,以扩展其在合成生物学中的应用 | Redβ蛋白与大肠杆菌单链DNA结合蛋白的相互作用 | 分子生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | NA |
1873 | 2024-08-07 |
Sjögren's Syndrome Treatments in the Microbiome Era
2023, Advances in geriatric medicine and research
DOI:10.20900/agmr20230004
PMID:37323129
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研究论文 | 本文探讨了在微生物组时代下,Sjögren综合征(SS)的治疗新策略 | 文章提出了利用微生物组作为治疗SS的新策略,包括天然益生菌和合成生物学应用 | 目前没有提及具体的局限性 | 探索Sjögren综合征的新治疗方法 | Sjögren综合征及其相关微生物组 | NA | 自身免疫疾病 | NA | NA | NA | NA |
1874 | 2024-08-07 |
The living interface between synthetic biology and biomaterial design
2022-04, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-022-01231-3
PMID:35361951
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综述 | 本文综述了合成生物学与生物材料设计领域的最新进展,并提出了两个领域间合作的路线图 | 强调了合成生物学与生物材料设计领域间的潜在合作,以开发具有层次结构的新型生物材料 | 目前这两个领域的发展主要还是各自独立 | 探讨合成生物学与生物材料设计领域的交叉合作,以应对健康、生物技术和可持续发展领域的重大挑战 | 合成生物学与生物材料设计的新工具和基础理解 | 生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA |
1875 | 2024-08-07 |
Mechanogenetics: harnessing mechanobiology for cellular engineering
2022-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2021.09.011
PMID:34735987
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research paper | 本文探讨了机械遗传学这一新兴领域,该领域结合了机械生物学和合成生物学,通过利用机械信号转导途径来控制基因表达,以治疗、修复或恢复病变细胞和组织 | 本文提出了一个创新的治疗策略,通过识别特定的机械传感器和下游信号通路,结合合成生物学工具来整合和响应这些输入,以开发新的治疗疾病的方法 | NA | 探索机械遗传学在治疗疾病中的应用 | 病变细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 机械信号转导 | NA | NA | NA |
1876 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools to Engineer Microbial Communities for Biotechnology
2019-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2018.11.002
PMID:30497870
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综述 | 本文综述了合成生物学工具和方法在工程化微生物群落中的最新进展 | 讨论了利用微生物群落进行各种生物技术应用的持续和新兴努力,并提出了未来的应用方向 | NA | 探讨合成生物学工具在微生物群落工程中的应用及其未来潜力 | 微生物群落及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
1877 | 2024-08-07 |
Utilising datasheets for the informed automated design and build of a synthetic metabolic pathway
2019, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-019-0141-z
PMID:30675181
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程,用于设计和构建异源代谢途径,并展示了电子数据表在设计实验软件中的应用。 | 本文开发了软件工具,能够将数据表中的部件信息传输到设计实验软件JMP中,实现了信息在已表征信息和DoE软件之间的有效传递。 | NA | 旨在通过使用标准化和表征的生物部件,推动面向设计的合成生物学,实现异源表达系统的前向工程。 | 异源代谢途径的设计和构建。 | 合成生物学 | NA | 自动化工作流程 | NA | 数据表 | 随机样本来自番茄红素途径的设计空间 |
1878 | 2024-08-07 |
Dissipative structures in biological systems: bistability, oscillations, spatial patterns and waves
2018-Jul-28, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2017.0376
PMID:29891498
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综述 | 本文综述了耗散结构概念在理解生物系统非平衡自组织动态基础中的相关性及其在过去五十年中的应用 | NA | NA | 评估耗散结构概念在理解生物系统非平衡自组织动态基础中的相关性及其应用 | 生物系统中的耗散结构,包括多稳态、振荡、空间模式和波 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1879 | 2024-08-07 |
Antithetic proportional-integral feedback for reduced variance and improved control performance of stochastic reaction networks
2018-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0079
PMID:29899158
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研究论文 | 本文探讨了通过结合反向积分反馈(AIF)和负反馈策略来减少随机反应网络的方差并提高控制性能的方法。 | 提出了一种结合AIF和负反馈策略的方法,以减少细胞间异质性或方差,并提高控制性能。 | 存在一个权衡,即较小的方差与较大的平均轨迹稳定时间相关。 | 展示通过结合AIF和负反馈策略来改善性能恶化的方法。 | 随机生物分子反应网络中的分子物种。 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1880 | 2024-08-07 |
Model reduction enables Turing instability analysis of large reaction-diffusion models
2018-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2017.0805
PMID:29540540
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研究论文 | 本文提出了一种通过移除非扩散物种来简化大型生化系统模型的方法,以促进图灵不稳定性的分析 | 本文提出的模型简化方法能够有效地减少生化系统的复杂性,使得分析大型反应扩散模型成为可能 | 该方法主要适用于包含多个不可移动物种的大型系统,对于其他类型的生化系统可能不适用 | 研究如何通过模型简化来分析大型反应扩散模型中的图灵不稳定性 | 生化系统中的图灵模式生成 | 合成生物学 | NA | 反应扩散模型 | NA | NA | 17个物种的生化模式系统 |