合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1881	2024-08-07	Synthetic biology of proteins: tuning GFPs folding and stability with fluoroproline 2008-Feb-27, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0001680 PMID:18301757	研究论文	本文研究了通过氟代脯氨酸替换增强型绿色荧光蛋白（EGFP）中的脯氨酸残基，以调整其折叠和稳定性	首次展示了通过氟代脯氨酸替换来改善蛋白质折叠速率和稳定性的方法	NA	探索通过合成氨基酸和详细结构知识来设计具有优越性能的定制蛋白质和细胞结构	增强型绿色荧光蛋白（EGFP）及其氟代脯氨酸变体	生物化学	NA	X射线晶体学	NA	蛋白质结构	两种蛋白质变体：(4R)-FPro-EGFP 和 (4S)-FPro-EGFP
1882	2024-08-07	Simulation and experimental study of a cold atmospheric pressure plasma and comparison of efficiency in boosting recombinant Endoglucanase II production in Pichia pastoris 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0303795 PMID:38771745	研究论文	本研究探讨了冷大气压等离子体（CAP）处理对Pichia pastoris中重组内切葡聚糖酶II（EgII）生产效率的影响	本研究首次比较了两种不同点火模式（正弦交流电AC和脉冲直流电DC）对蛋白分泌效率的影响，并使用COMSOL软件模拟了等离子体功能	细胞工程改善分泌通常是一种试错方法，且改进至少部分特定于所生产的蛋白质	研究冷大气压等离子体处理对重组内切葡聚糖酶II生产效率的影响	重组内切葡聚糖酶II（EgII）在Pichia pastoris中的生产效率	生物工程	NA	冷大气压等离子体（CAP）	NA	光学光谱	NA
1883	2024-08-07	Chasing bacterial chassis for metabolic engineering: a perspective review from classical to non-traditional microorganisms 2019-01, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13292 PMID:29926529	综述	本文综述了从传统到非传统微生物在代谢工程中作为底盘细胞的应用现状和发展前景	讨论了合成生物学在弥补细菌底盘基因工程工具缺乏方面的显著作用	目前仅有少数细菌被广泛应用于工业生物生产，且仅限于合成结构简单的化合物	探讨如何通过理性设计和构建稳健的细菌底盘细胞以促进代谢工程的发展	细菌底盘细胞及其在代谢工程中的应用	代谢工程	NA	合成生物学	NA	NA	NA
1884	2024-08-07	Mobius Assembly: A versatile Golden-Gate framework towards universal DNA assembly 2018, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0189892 PMID:29293531	研究论文	本文介绍了一种名为Mobius Assembly的新型Golden Gate Assembly框架，结合了向量工具包的简单性和高克隆容量	Mobius Assembly采用两级分层方法和低频切割器，减少了驯化需求，并实现了无成本的可视化克隆筛选	NA	开发一种通用的DNA组装框架，提高生物分子工程的预测性和设计构造的普适性	Golden Gate Assembly技术及其在DNA组装中的应用	合成生物学	NA	Golden Gate Assembly技术	NA	DNA片段	成功组装了多达16个转录单元的各种色素基因
1885	2024-08-07	Triazole-linked Nucleic Acids: Synthesis, Therapeutics and Synthetic Biology Applications 2024, Current organic synthesis IF:1.7Q3 DOI:10.2174/1570179420666230502123950 PMID:37138439	研究论文	本文探讨了三氮唑连接的核酸，其中三氮唑连接（TL）取代了天然的磷酸骨架，并详细讨论了两种三氮唑连接（TL1和TL2）及其在治疗和合成生物学中的广泛应用。	介绍了三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的新应用，如在反义寡核苷酸（ASO）、小干扰RNA（siRNA）和CRISPR-Cas9技术中的应用。	NA	探索三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的应用潜力。	三氮唑连接的核酸及其在治疗和合成生物学中的应用。	合成生物学	NA	三氮唑连接技术	NA	核酸	功能性300-mer DNA和335碱基对基因的变体
1886	2024-08-07	Manipulation of encapsulated artificial phospholipid membranes using sub-micellar lysolipid concentrations 2024-Jun-01, Communications chemistry IF:5.9Q1 DOI:10.1038/s42004-024-01209-z PMID:38824266	研究论文	本文研究了通过亚微米级溶血磷脂浓度操纵封装的人工磷脂膜，特别是通过暴露于不同浓度的溶血磷脂酰胆碱（LPC）来研究其对三维DIB网络的结构影响。	首次展示了在亚毫米级水凝胶封装的液滴界面双层（eDIBs）中进行原位双层操纵，并研究了溶血磷脂与三维DIB网络的相互作用。	实验主要集中在溶血磷脂酰胆碱（LPC）对封装液滴网络的影响，可能需要进一步研究其他因素的影响。	探索通过化学介导的操纵封装的三维协调膜模拟物，以研究易于访问的隔室化人工细胞机制。	研究对象包括封装的人工磷脂膜和溶血磷脂酰胆碱（LPC）对其结构的影响。	合成生物学	NA	高阶乳化	NA	微流控设备	NA
1887	2024-08-07	A new era of cancer immunotherapy: combining revolutionary technologies for enhanced CAR-M therapy 2024-Jun-01, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02032-9 PMID:38824567	研究论文	本文详细探讨了CAR-M疗法的最新进展，包括基础科学研究和临床试验，并提出了克服其发展障碍的可能策略	结合革命性技术如原位遗传修饰、合成生物学技术和生物材料支持的基因转移，以提高CAR-M疗法的效能、安全性和可及性	CAR-M疗法在实现其全部潜力方面仍面临主要障碍	探索和优化针对实体瘤的CAR-M免疫疗法	CAR-M疗法在实体瘤治疗中的应用	生物技术	实体瘤	CAR-M疗法	NA	NA	NA
1888	2024-08-07	Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa 2024-May, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.16669 PMID:38323895	研究论文	本文研究了Nudix水解酶WvNUDX24在Wurfbainia villosa中参与龙脑生物合成的作用	首次报道了负责将龙脑二磷酸（BPP）水解生成龙脑的酶	NA	鉴定并功能性表征参与龙脑生物合成的Nudix水解酶WvNUDX24	Nudix水解酶WvNUDX24及其在龙脑生物合成中的作用	NA	NA	定点突变实验	NA	NA	NA
1889	2024-08-07	Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications 2024-02, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2023.102404 PMID:38039932	综述	本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用	光遗传学通过光动态操纵细胞行为，实现了其他方法无法达到的高时空精度	光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品	探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用	微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用	NA	NA	光遗传学	NA	NA	NA
1890	2024-08-07	Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches 2024-02, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2023.102419 PMID:38271748	研究论文	本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观	本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒，以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程	NA	研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制	噬菌体与宿主细菌的相互作用	NA	NA	高通量测序	NA	转录组数据	NA
1891	2024-08-07	Evolution and synthetic biology 2023-12, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2023.102394 PMID:37801925	综述	本文综述了进化观察如何启发合成生物学的三个广泛领域：细胞为基础的生物分子进化组合方法、建立微生物共生体的工程相互依赖性以及合成免疫学	NA	NA	探讨进化观察如何影响合成生物学的设计	合成生物学的三个主要领域	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1892	2024-08-07	The Biosynthetic Pathways of Tanshinones and Phenolic Acids in Salvia miltiorrhiza 2015-Sep-08, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules200916235 PMID:26370949	综述	本文综述了丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径及其在合成生物学和代谢工程中的应用	系统总结了丹参酮和酚酸生物合成途径的最新进展，并探讨了这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用	NA	旨在阐明丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径，并探讨这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用	丹参中的丹参酮和酚酸的生物合成途径及其相关基因	NA	心血管疾病	高通量测序	NA	基因	NA
1893	2024-08-07	Developed and emerging 1,4-butanediol commercial production strategies: forecasting the current status and future possibility 2024-Jun, Critical reviews in biotechnology IF:8.1Q1 DOI:10.1080/07388551.2023.2176740 PMID:37286203	研究论文	本文讨论了1,4-丁二醇（1,4-BDO）的商业生产策略，包括化学和生物技术方法的现状及未来发展前景	文章介绍了通过微生物利用重组菌株、代谢工程、合成生物学等技术进行可持续生物生产的新方法	文章指出环境友好和生物基商业生产策略面临的困难	探讨1,4-BDO的当前生产技术和未来可能的发展方向	1,4-BDO及其在化学反应中的应用，如聚氨酯、斯潘德克斯中间体和聚乙烯吡咯烷酮（PVP）	NA	NA	代谢工程、合成生物学、酶工程、生物信息学、人工智能引导算法	NA	NA	NA
1894	2024-08-07	Bacterial genome reduction for optimal chassis of synthetic biology: a review 2024-Jun, Critical reviews in biotechnology IF:8.1Q1 DOI:10.1080/07388551.2023.2208285 PMID:37380345	综述	本文综述了通过细菌基因组简化构建合成生物学最优底盘的进展	介绍了通过识别必需基因集和多种基因组删除技术来促进细菌基因组简化的方法	一些基因组简化菌株的生长减少和生理表型扰动可能限制其作为优化细胞工厂的应用	评估细菌基因组简化在构建合成生物学最优底盘方面的进展	细菌基因组简化的方法、特性及其在工业应用中的潜力	合成生物学	NA	基因组删除技术	NA	基因组数据	多种细菌
1895	2024-08-07	Circular single-stranded DNA as a programmable vector for gene regulation in cell-free protein expression systems 2024-May-31, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49021-6 PMID:38821953	研究论文	本文介绍了一种可编程的载体——环状单链DNA（CssDNA），用于在基于酵母的无细胞蛋白表达系统中进行基因表达调控	CssDNA不仅可用于通过正义CssDNA和反义CssDNA的不同途径进行基因调控，还可构建为无细胞蛋白表达系统中的几种基因调控逻辑门	NA	探索CssDNA在基因表达和基因调控中的应用，丰富合成生物学工具箱	环状单链DNA（CssDNA）在无细胞蛋白表达系统中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
1896	2024-08-07	A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2 2024-May-23, BMC biotechnology IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12896-024-00858-1 PMID:38783306	研究论文	本文提出了一种基于mRNA结构预测的新方法，用于系统筛选候选信号肽序列，以改进骨形态发生蛋白2（BMP2）的生产	首次将mRNA结构预测应用于信号肽选择，结合多种计算工具进行信号肽活性、定位目标和mRNA结构的预测	mRNA结构预测的准确性有待提高，且实验结果显示在不同细胞系中信号肽活性的表现不一	开发一种系统筛选候选信号肽序列的方法，以提高BMP2的生产效率和降低成本	骨形态发生蛋白2（BMP2）的信号肽	生物信息学	NA	计算工具（SignalP, DeepLoc, MXFold2）	NA	氨基酸序列, mRNA结构	2,611个来自TGF-β超家族的信号肽序列
1897	2024-08-07	ORBIT for E. coli: kilobase-scale oligonucleotide recombineering at high throughput and high efficiency 2024-May-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae227 PMID:38587185	研究论文	本文介绍了一种名为ORBIT的高效高通量方法，用于在E. coli中进行千碱基规模的基因组修饰	ORBIT方法使用DNA寡核苷酸指导非复制性质粒的整合，显著提高了效率并支持高吞吐量操作	NA	开发一种新的基因组修饰方法，以克服现有方法的低效率和难以规模化的问题	E. coli的基因组	合成生物学	NA	DNA寡核苷酸重组技术	NA	基因组数据	数千个独特的基因组条码（>30k）
1898	2024-08-07	Instructional materials that control cellular activity through synthetic Notch receptors 2023-06, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2023.122099 PMID:37023529	研究论文	本文介绍了一种名为MATRIX的平台，通过结合工程化材料和表达相应合成生物学控制模块的细胞，实现对生物材料细胞反应的定制化定义	该平台通过激活合成Notch受体，能够调控多种细胞活动，如转录组工程、炎症抑制和多能干细胞分化，并且这些反应仅限于编程的生物材料表面	NA	开发一种新的方法来可靠地调控治疗细胞的行为，以支持细胞疗法和组织替代	工程化生物材料和表达合成Notch受体的细胞	再生工程	NA	合成生物学	合成Notch受体	生物材料	NA
1899	2024-08-07	A systematic comparison of error correction enzymes by next-generation sequencing 2017-Sep-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkx691 PMID:28911123	研究论文	本文通过下一代测序技术对合成DNA中的错误进行量化，并系统比较了六种不同的错误校正酶在11种条件下的效果	开发了一种新的实验和计算流程，用于快速、可扩展和可扩展地分析基因组装中的错误，并评估错误校正方法	NA	量化合成DNA中的错误并比较不同错误校正酶的效果	六种不同的错误校正酶在基因组装中的效果	分子生物学	NA	下一代测序	NA	DNA序列	11种条件下的模型基因组装
1900	2024-08-07	Engineering Therapeutic T Cells: From Synthetic Biology to Clinical Trials 2017-Jan-24, Annual review of pathology DOI:10.1146/annurev-pathol-052016-100304 PMID:27959633	综述	本文综述了工程化T细胞疗法在治疗癌症、器官移植和自身免疫疾病中的临床试验现状及面临的挑战	NA	工程化T细胞疗法的设计和制造尚未标准化，且主要在学术环境中进行；需要开发可靠的方法来定义剂量和药代动力学	探讨工程化T细胞疗法的进一步发展所需的免疫学、合成生物学、制造过程和政府监管方面的进展	工程化T细胞疗法在临床应用中的挑战和病理学家在此领域的贡献	NA	癌症, 器官移植, 自身免疫疾病	NA	NA	NA	NA