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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1881 | 2024-08-07 |
Mechanogenetics: harnessing mechanobiology for cellular engineering
2022-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2021.09.011
PMID:34735987
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research paper | 本文探讨了机械遗传学这一新兴领域,该领域结合了机械生物学和合成生物学,通过利用机械信号转导途径来控制基因表达,以治疗、修复或恢复病变细胞和组织 | 本文提出了一个创新的治疗策略,通过识别特定的机械传感器和下游信号通路,结合合成生物学工具来整合和响应这些输入,以开发新的治疗疾病的方法 | NA | 探索机械遗传学在治疗疾病中的应用 | 病变细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 机械信号转导 | NA | NA | NA |
1882 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools to Engineer Microbial Communities for Biotechnology
2019-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2018.11.002
PMID:30497870
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综述 | 本文综述了合成生物学工具和方法在工程化微生物群落中的最新进展 | 讨论了利用微生物群落进行各种生物技术应用的持续和新兴努力,并提出了未来的应用方向 | NA | 探讨合成生物学工具在微生物群落工程中的应用及其未来潜力 | 微生物群落及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
1883 | 2024-08-07 |
Utilising datasheets for the informed automated design and build of a synthetic metabolic pathway
2019, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-019-0141-z
PMID:30675181
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程,用于设计和构建异源代谢途径,并展示了电子数据表在设计实验软件中的应用。 | 本文开发了软件工具,能够将数据表中的部件信息传输到设计实验软件JMP中,实现了信息在已表征信息和DoE软件之间的有效传递。 | NA | 旨在通过使用标准化和表征的生物部件,推动面向设计的合成生物学,实现异源表达系统的前向工程。 | 异源代谢途径的设计和构建。 | 合成生物学 | NA | 自动化工作流程 | NA | 数据表 | 随机样本来自番茄红素途径的设计空间 |
1884 | 2024-08-07 |
Dissipative structures in biological systems: bistability, oscillations, spatial patterns and waves
2018-Jul-28, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2017.0376
PMID:29891498
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综述 | 本文综述了耗散结构概念在理解生物系统非平衡自组织动态基础中的相关性及其在过去五十年中的应用 | NA | NA | 评估耗散结构概念在理解生物系统非平衡自组织动态基础中的相关性及其应用 | 生物系统中的耗散结构,包括多稳态、振荡、空间模式和波 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1885 | 2024-08-07 |
Antithetic proportional-integral feedback for reduced variance and improved control performance of stochastic reaction networks
2018-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0079
PMID:29899158
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研究论文 | 本文探讨了通过结合反向积分反馈(AIF)和负反馈策略来减少随机反应网络的方差并提高控制性能的方法。 | 提出了一种结合AIF和负反馈策略的方法,以减少细胞间异质性或方差,并提高控制性能。 | 存在一个权衡,即较小的方差与较大的平均轨迹稳定时间相关。 | 展示通过结合AIF和负反馈策略来改善性能恶化的方法。 | 随机生物分子反应网络中的分子物种。 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1886 | 2024-08-07 |
Model reduction enables Turing instability analysis of large reaction-diffusion models
2018-03, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2017.0805
PMID:29540540
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研究论文 | 本文提出了一种通过移除非扩散物种来简化大型生化系统模型的方法,以促进图灵不稳定性的分析 | 本文提出的模型简化方法能够有效地减少生化系统的复杂性,使得分析大型反应扩散模型成为可能 | 该方法主要适用于包含多个不可移动物种的大型系统,对于其他类型的生化系统可能不适用 | 研究如何通过模型简化来分析大型反应扩散模型中的图灵不稳定性 | 生化系统中的图灵模式生成 | 合成生物学 | NA | 反应扩散模型 | NA | NA | 17个物种的生化模式系统 |
1887 | 2024-08-07 |
Synthetic biology of proteins: tuning GFPs folding and stability with fluoroproline
2008-Feb-27, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0001680
PMID:18301757
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研究论文 | 本文研究了通过氟代脯氨酸替换增强型绿色荧光蛋白(EGFP)中的脯氨酸残基,以调整其折叠和稳定性 | 首次展示了通过氟代脯氨酸替换来改善蛋白质折叠速率和稳定性的方法 | NA | 探索通过合成氨基酸和详细结构知识来设计具有优越性能的定制蛋白质和细胞结构 | 增强型绿色荧光蛋白(EGFP)及其氟代脯氨酸变体 | 生物化学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | 两种蛋白质变体:(4R)-FPro-EGFP 和 (4S)-FPro-EGFP |
1888 | 2024-08-07 |
Simulation and experimental study of a cold atmospheric pressure plasma and comparison of efficiency in boosting recombinant Endoglucanase II production in Pichia pastoris
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303795
PMID:38771745
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研究论文 | 本研究探讨了冷大气压等离子体(CAP)处理对Pichia pastoris中重组内切葡聚糖酶II(EgII)生产效率的影响 | 本研究首次比较了两种不同点火模式(正弦交流电AC和脉冲直流电DC)对蛋白分泌效率的影响,并使用COMSOL软件模拟了等离子体功能 | 细胞工程改善分泌通常是一种试错方法,且改进至少部分特定于所生产的蛋白质 | 研究冷大气压等离子体处理对重组内切葡聚糖酶II生产效率的影响 | 重组内切葡聚糖酶II(EgII)在Pichia pastoris中的生产效率 | 生物工程 | NA | 冷大气压等离子体(CAP) | NA | 光学光谱 | NA |
1889 | 2024-08-07 |
Chasing bacterial chassis for metabolic engineering: a perspective review from classical to non-traditional microorganisms
2019-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13292
PMID:29926529
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综述 | 本文综述了从传统到非传统微生物在代谢工程中作为底盘细胞的应用现状和发展前景 | 讨论了合成生物学在弥补细菌底盘基因工程工具缺乏方面的显著作用 | 目前仅有少数细菌被广泛应用于工业生物生产,且仅限于合成结构简单的化合物 | 探讨如何通过理性设计和构建稳健的细菌底盘细胞以促进代谢工程的发展 | 细菌底盘细胞及其在代谢工程中的应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1890 | 2024-08-07 |
Mobius Assembly: A versatile Golden-Gate framework towards universal DNA assembly
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0189892
PMID:29293531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Mobius Assembly的新型Golden Gate Assembly框架,结合了向量工具包的简单性和高克隆容量 | Mobius Assembly采用两级分层方法和低频切割器,减少了驯化需求,并实现了无成本的可视化克隆筛选 | NA | 开发一种通用的DNA组装框架,提高生物分子工程的预测性和设计构造的普适性 | Golden Gate Assembly技术及其在DNA组装中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly技术 | NA | DNA片段 | 成功组装了多达16个转录单元的各种色素基因 |
1891 | 2024-08-07 |
Triazole-linked Nucleic Acids: Synthesis, Therapeutics and Synthetic Biology Applications
2024, Current organic synthesis
IF:1.7Q3
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研究论文 | 本文探讨了三氮唑连接的核酸,其中三氮唑连接(TL)取代了天然的磷酸骨架,并详细讨论了两种三氮唑连接(TL1和TL2)及其在治疗和合成生物学中的广泛应用。 | 介绍了三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的新应用,如在反义寡核苷酸(ASO)、小干扰RNA(siRNA)和CRISPR-Cas9技术中的应用。 | NA | 探索三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的应用潜力。 | 三氮唑连接的核酸及其在治疗和合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | 三氮唑连接技术 | NA | 核酸 | 功能性300-mer DNA和335碱基对基因的变体 |
1892 | 2024-08-07 |
Manipulation of encapsulated artificial phospholipid membranes using sub-micellar lysolipid concentrations
2024-Jun-01, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01209-z
PMID:38824266
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研究论文 | 本文研究了通过亚微米级溶血磷脂浓度操纵封装的人工磷脂膜,特别是通过暴露于不同浓度的溶血磷脂酰胆碱(LPC)来研究其对三维DIB网络的结构影响。 | 首次展示了在亚毫米级水凝胶封装的液滴界面双层(eDIBs)中进行原位双层操纵,并研究了溶血磷脂与三维DIB网络的相互作用。 | 实验主要集中在溶血磷脂酰胆碱(LPC)对封装液滴网络的影响,可能需要进一步研究其他因素的影响。 | 探索通过化学介导的操纵封装的三维协调膜模拟物,以研究易于访问的隔室化人工细胞机制。 | 研究对象包括封装的人工磷脂膜和溶血磷脂酰胆碱(LPC)对其结构的影响。 | 合成生物学 | NA | 高阶乳化 | NA | 微流控设备 | NA |
1893 | 2024-08-07 |
A new era of cancer immunotherapy: combining revolutionary technologies for enhanced CAR-M therapy
2024-Jun-01, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02032-9
PMID:38824567
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研究论文 | 本文详细探讨了CAR-M疗法的最新进展,包括基础科学研究和临床试验,并提出了克服其发展障碍的可能策略 | 结合革命性技术如原位遗传修饰、合成生物学技术和生物材料支持的基因转移,以提高CAR-M疗法的效能、安全性和可及性 | CAR-M疗法在实现其全部潜力方面仍面临主要障碍 | 探索和优化针对实体瘤的CAR-M免疫疗法 | CAR-M疗法在实体瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 实体瘤 | CAR-M疗法 | NA | NA | NA |
1894 | 2024-08-07 |
Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa
2024-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16669
PMID:38323895
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研究论文 | 本文研究了Nudix水解酶WvNUDX24在Wurfbainia villosa中参与龙脑生物合成的作用 | 首次报道了负责将龙脑二磷酸(BPP)水解生成龙脑的酶 | NA | 鉴定并功能性表征参与龙脑生物合成的Nudix水解酶WvNUDX24 | Nudix水解酶WvNUDX24及其在龙脑生物合成中的作用 | NA | NA | 定点突变实验 | NA | NA | NA |
1895 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102404
PMID:38039932
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综述 | 本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | 光遗传学通过光动态操纵细胞行为,实现了其他方法无法达到的高时空精度 | 光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品 | 探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用 | 微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | NA | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
1896 | 2024-08-07 |
Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102419
PMID:38271748
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研究论文 | 本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观 | 本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒,以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程 | NA | 研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA |
1897 | 2024-08-07 |
Evolution and synthetic biology
2023-12, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102394
PMID:37801925
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综述 | 本文综述了进化观察如何启发合成生物学的三个广泛领域:细胞为基础的生物分子进化组合方法、建立微生物共生体的工程相互依赖性以及合成免疫学 | NA | NA | 探讨进化观察如何影响合成生物学的设计 | 合成生物学的三个主要领域 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1898 | 2024-08-07 |
The Biosynthetic Pathways of Tanshinones and Phenolic Acids in Salvia miltiorrhiza
2015-Sep-08, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules200916235
PMID:26370949
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综述 | 本文综述了丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 系统总结了丹参酮和酚酸生物合成途径的最新进展,并探讨了这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用 | NA | 旨在阐明丹参中丹参酮和酚酸的生物合成途径,并探讨这些途径在合成生物学和代谢工程中的应用 | 丹参中的丹参酮和酚酸的生物合成途径及其相关基因 | NA | 心血管疾病 | 高通量测序 | NA | 基因 | NA |
1899 | 2024-08-07 |
Developed and emerging 1,4-butanediol commercial production strategies: forecasting the current status and future possibility
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2176740
PMID:37286203
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研究论文 | 本文讨论了1,4-丁二醇(1,4-BDO)的商业生产策略,包括化学和生物技术方法的现状及未来发展前景 | 文章介绍了通过微生物利用重组菌株、代谢工程、合成生物学等技术进行可持续生物生产的新方法 | 文章指出环境友好和生物基商业生产策略面临的困难 | 探讨1,4-BDO的当前生产技术和未来可能的发展方向 | 1,4-BDO及其在化学反应中的应用,如聚氨酯、斯潘德克斯中间体和聚乙烯吡咯烷酮(PVP) | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、生物信息学、人工智能引导算法 | NA | NA | NA |
1900 | 2024-08-07 |
Bacterial genome reduction for optimal chassis of synthetic biology: a review
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2208285
PMID:37380345
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综述 | 本文综述了通过细菌基因组简化构建合成生物学最优底盘的进展 | 介绍了通过识别必需基因集和多种基因组删除技术来促进细菌基因组简化的方法 | 一些基因组简化菌株的生长减少和生理表型扰动可能限制其作为优化细胞工厂的应用 | 评估细菌基因组简化在构建合成生物学最优底盘方面的进展 | 细菌基因组简化的方法、特性及其在工业应用中的潜力 | 合成生物学 | NA | 基因组删除技术 | NA | 基因组数据 | 多种细菌 |