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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1921 | 2024-08-07 |
pyBrick-DNA: A Python-Based Environment for Automated Genetic Component Assembly
2023-12, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2023.0008
PMID:38010519
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Python的软件环境pyBrick-DNA,用于自动化基因组件组装,加速遗传电路的原型设计 | pyBrick-DNA提供了一个用户友好的环境,允许科学家选择基因序列或输入自定义序列来构建基因组件,所有组件模块化融合生成一个即用型单DNA片段 | NA | 开发自动化工具以加速遗传电路的模拟和实现 | 基因组件的自动化组装 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | DNA序列 | NA |
1922 | 2024-08-07 |
Impact of donor-recipient phylogenetic distance on bacterial genome transplantation
2016-09-30, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw688
PMID:27488189
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研究论文 | 研究了供体与受体之间的系统发育距离对细菌基因组移植效率的影响 | 首次探讨了不同系统发育距离的细菌物种间基因组移植的效率,并发现了除系统发育距离外的其他物种特异性障碍 | 研究仅限于特定的细菌种类,且未完全阐明影响基因组移植的所有因素 | 探究影响基因组移植效率的细胞因素,以扩展现有的基因组兼容性限制 | Mycoplasma capricolum subsp. capricolum作为受体细胞,以及来自Spiroplasma系统发育组的六种细菌作为供体 | 合成生物学 | NA | 基因组移植 | NA | 基因组数据 | 六种细菌的基因组被移植到Mycoplasma capricolum subsp. capricolum中 |
1923 | 2024-08-07 |
Mechanically activated artificial cell by using microfluidics
2016-09-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep32912
PMID:27610921
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研究论文 | 本文通过微流控技术开发了一种新型机械激活人工细胞的方法 | 开发了一种新型微流控装置,能够捕获双乳液滴并进行压缩和吸引,从而实现人工细胞的机械感应 | NA | 通过体外自下而上的重建工程机械敏感人工细胞,理解大分子混合物如何组装和组织成响应力的复杂系统 | 机械敏感人工细胞 | 生物工程 | NA | 微流控技术 | NA | 乳液滴 | NA |
1924 | 2024-08-07 |
Bringing next-generation diagnostics to the clinic through synthetic biology
2016-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.201606541
PMID:27402339
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1925 | 2024-08-07 |
Standardization for natural product synthetic biology
2016-Aug-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/c6np00030d
PMID:27313083
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研究论文 | 本文讨论了标准化在天然产物合成生物学中的作用,特别是生物合成途径和基因簇数据的标准化,以及标准化在生物合成基因簇工程过程中的作用 | 强调了标准化部件和流程在区分合成生物学与传统遗传工程中的关键作用 | NA | 探讨标准化在天然产物合成生物学中的应用 | 生物合成途径、基因簇数据以及生物合成基因簇工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因簇数据 | NA |
1926 | 2024-08-07 |
Coupling protein scaffold and biosilicification: A sustainable and recyclable approach for d-mannitol production via one-step purification and immobilization of multienzymes
2024-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.132196
PMID:38723818
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研究论文 | 本文介绍了一种结合蛋白质支架和生物硅化的系统,用于一步法纯化和固定化多酶,以生产d-甘露醇。 | 引入了一种新的蛋白质支架和生物硅化结合系统,实现了多酶的一步法纯化和固定化,提高了d-甘露醇的产量和酶的稳定性。 | 文章未明确提及该方法的局限性。 | 开发一种可持续且可回收的方法,用于通过一步法纯化和固定化多酶来生产d-甘露醇。 | 研究对象包括蛋白质支架、生物硅化过程以及d-甘露醇的酶法合成。 | NA | NA | 蛋白质支架和生物硅化技术 | NA | NA | 酶与支架的比例为1:8,进行了6个周期的反应。 |
1927 | 2024-08-07 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了如何从非生命分子组装中产生生命系统,并通过人工重构最小合成细胞系统展示了递归生长和分裂周期 | 作者开发了基于囊泡系统的合成最小细胞,避免了使用生物细胞复杂的分子机制,并尝试以最简单的形式重新设计细胞 | NA | 探讨生物细胞与合成最小细胞在细胞概念上的异同,为合成生物学、人工细胞和原细胞研究领域的读者提供分子组装的见解 | 生物细胞与合成最小细胞的比较 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1928 | 2024-08-07 |
Advancing Engineered Plant Living Materials through Tobacco BY-2 Cell Growth and Transfection within Tailored Granular Hydrogel Scaffolds
2024-May-22, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c00338
PMID:38799669
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研究论文 | 本研究介绍了一种创新的方法,利用合成生物学和工程学的复杂相互作用,在定制的颗粒水凝胶支架内精确空间图案化和遗传转化烟草BY-2细胞系 | 本研究开发了一种3D生物打印技术,能够在定制的颗粒水凝胶支架内同时促进烟草BY-2细胞的生长和遗传转化,展示了EPLMs的独特结构和功能特性 | NA | 推动工程化植物活体材料的发展 | 烟草BY-2细胞系及其在定制水凝胶支架内的生长和转化 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA |
1929 | 2024-08-07 |
Bottom-up assembly of viral replication cycles
2022-11-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33661-7
PMID:36323671
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review | 本文总结了通过自下而上的合成生物学方法构建病毒复制周期的途径及其伦理考量 | NA | NA | 探讨如何通过自下而上的合成生物学方法研究传染病 | 病毒复制周期 | 合成生物学 | 传染病 | NA | NA | NA | NA |
1930 | 2024-08-07 |
Design Automation in Synthetic Biology
2017-Apr-03, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a023978
PMID:28246188
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综述 | 本文综述了合成生物学中的生物设计自动化(BDA)工具,涵盖设计、构建、测试和学习等领域的软件工具,并详细介绍了这些工具的功能及其在合成遗传调控网络中的应用 | NA | NA | 探讨合成生物学中生物设计自动化工具的应用 | 生物设计自动化工具及其在合成遗传调控网络中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1931 | 2024-08-07 |
A de novo protein confers copper resistance in Escherichia coli
2016-07, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.2871
PMID:26748884
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法设计了一种全新的蛋白质,该蛋白质能够使大肠杆菌在铜浓度较高的环境中生存 | 首次证明生物系统能够利用非自然来源的全新蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | NA | 探讨生物系统是否能利用非生物来源的蛋白质来增强在压力环境下的适应性 | 大肠杆菌及一种名为Construct K (ConK)的全新蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计 | NA | DNA序列 | 约1.5 × 10(6)个二元模式的新蛋白质编码DNA序列 |
1932 | 2024-08-07 |
The fed-batch principle for the molecular biology lab: controlled nutrient diets in ready-made media improve production of recombinant proteins in Escherichia coli
2016-Jun-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-016-0513-8
PMID:27317421
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综述 | 本文综述了在分子生物学和生物化学实验室中应用分批补料原理,通过预制的培养基实现对营养物质的控制,从而提高大肠杆菌中重组蛋白产量的最新进展和应用 | 介绍了新的预制生长培养基,通过生物催化释放葡萄糖从聚合物中,为摇瓶和摇板培养提供了一种简单的分批补料解决方案 | NA | 探讨分批补料技术在实验室规模重组蛋白生产中的应用及其对细胞密度和蛋白产量的影响 | 大肠杆菌中的重组蛋白生产 | 分子生物学 | NA | 分批补料技术 | NA | NA | NA |
1933 | 2024-08-07 |
ssDNA and the Argonautes: The Quest for the Next Golden Editor
2016-06, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2016.071
PMID:27230540
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研究论文 | 本文探讨了基于单链DNA(ssDNA)的Argonaute(NgAgo)在基因编辑中的应用 | NgAgo作为一种新的基因编辑工具,使用24碱基的5'磷酸化ssDNA进行DNA靶向,具有高特异性和潜在的更易获取的基因编辑系统 | NA | 探索和开发新的基因编辑工具 | Argonaute(NgAgo)及其在基因编辑中的应用 | 基因编辑 | NA | 基因编辑技术 | NA | DNA | NA |
1934 | 2024-08-07 |
Identification and use of an alkane transporter plug-in for applications in biocatalysis and whole-cell biosensing of alkanes
2014-Jul-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep05844
PMID:25068650
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研究论文 | 本文展示了Pseudomonas putida GPo1中的AlkL蛋白作为烷烃转运蛋白,在工业相关速率下摄取C7-C16正烷烃的能力,并通过共表达AlkL作为转运插件,显著提高了生物氧化和烷烃生物传感器的特定产量。 | 首次展示了AlkL蛋白直接促进C10-C16烷烃的增强摄取,并实现了由此带来的最高报告产品产量增益。 | AlkL蛋白在过量表达时对宿主有毒性,需要通过可控诱导的载体来表达以避免负面影响。 | 探索和优化全细胞设备在合成生物学和生物催化中的应用,特别是分子摄取过程。 | AlkL蛋白作为烷烃转运蛋白的功能及其在生物转化和生物传感器激活中的应用。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1935 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted high throughput sequencing of an expanded genetic alphabet at single base resolution
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48408-9
PMID:38744910
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研究论文 | 本文报道了一种酶辅助的扩展遗传字母序列(ESEGA)方法,用于在单碱基分辨率下测序六字母的AEGIS DNA | 开发了一种新的酶辅助序列方法ESEGA,用于测序扩展的遗传字母DNA,并展示了其在优化条件下的六核苷酸PCR中的应用 | NA | 开发适用于扩展DNA的分析工具,以支持其在生物技术中的进一步应用 | 扩展的遗传字母DNA(AEGIS DNA)及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶辅助序列方法(ESEGA) | NA | DNA序列 | 涉及六核苷酸PCR的优化条件及多种DNA聚合酶的保真性评估 |
1936 | 2024-08-07 |
N-Terminal Amino Acid Affects the Translation Efficiency at Lower Temperatures in a Reconstituted Protein Synthesis System
2024-May-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105264
PMID:38791303
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研究论文 | 研究了N端氨基酸序列对基于PURE系统的蛋白质合成效率的影响,特别是在低温条件下 | 发现N端单个氨基酸替换显著改变了PURE系统中的翻译效率,尤其是在低温条件下 | NA | 探讨N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白质合成系统 | NA | 氨基酸序列 | NA |
1937 | 2024-08-07 |
Is Life Binary or Gradual?
2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14050564
PMID:38792586
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研究论文 | 本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念,特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中,中间实体对生命与非生命简单分类的挑战 | 提出生命可能是一个渐进的光谱,而非简单的二元区分 | 目前科学状态下,是否存在一个明确的界限仍未确定 | 探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用 | 生命的本质及其分类 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1938 | 2024-08-07 |
Characterizing Strain Variation in Engineered E. coli Using a Multi-Omics-Based Workflow
2016-05-25, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.04.004
PMID:27211860
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研究论文 | 本文介绍了一种整合代谢组学、蛋白质组学和基因组规模模型的流程,用于研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 该流程结合了计算系统生物学、代谢工程和合成生物学的互补方法,提供了宿主微环境因途径工程而变化的分子见解,并展示了如何利用与菌株变异相关的生物机制作为提高产品产量的工程策略 | NA | 理解异源和原生生化途径之间的复杂相互作用 | 研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 代谢工程 | NA | 代谢组学、蛋白质组学 | 基因组规模模型 | 代谢组学数据、蛋白质组学数据 | 分析了八种工程菌株,生产三种生物燃料:异戊二醇、柠檬烯和双环烯 |
1939 | 2024-08-07 |
CRISPR-mediated control of the bacterial initiation of replication
2016-05-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw214
PMID:27036863
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR/dCas9结合复制起始位点来控制细菌细胞周期的新系统 | 首次展示了CRISPR/dCas9结合复制起始位点可以精确控制细菌染色体的复制起始,并发现提高温度可以解除这种抑制作用 | NA | 开发一种简单且稳健的方法来控制细菌细胞周期,为合成生物学和DNA复制研究提供工具 | 细菌细胞周期和DNA复制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9 | NA | NA | NA |
1940 | 2024-08-07 |
Towards self-assembled hybrid artificial cells: novel bottom-up approaches to functional synthetic membranes
2015-Sep-01, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.201501229
PMID:26149747
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研究论文 | 本文探讨了利用自下而上的方法开发合成细胞,特别是通过功能化合成膜与生物系统的整合来构建“混合”人工细胞的最新进展和现状 | 研究通过控制高度有序的膜结构的自组装,精确模拟活细胞的结构和/或功能,为合成生物学提供了新的合成底盘 | NA | 深入理解生命系统的本质,探索细胞生命的起源,并为合成生物学的发展提供新的合成底盘 | 混合人工细胞及其合成膜的构建和功能 | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 膜结构 | NA |