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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1941 | 2024-08-07 |
N-Terminal Amino Acid Affects the Translation Efficiency at Lower Temperatures in a Reconstituted Protein Synthesis System
2024-May-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105264
PMID:38791303
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研究论文 | 研究了N端氨基酸序列对基于PURE系统的蛋白质合成效率的影响,特别是在低温条件下 | 发现N端单个氨基酸替换显著改变了PURE系统中的翻译效率,尤其是在低温条件下 | NA | 探讨N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白质合成系统 | NA | 氨基酸序列 | NA |
1942 | 2024-08-07 |
Is Life Binary or Gradual?
2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14050564
PMID:38792586
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研究论文 | 本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念,特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中,中间实体对生命与非生命简单分类的挑战 | 提出生命可能是一个渐进的光谱,而非简单的二元区分 | 目前科学状态下,是否存在一个明确的界限仍未确定 | 探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用 | 生命的本质及其分类 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1943 | 2024-08-07 |
Characterizing Strain Variation in Engineered E. coli Using a Multi-Omics-Based Workflow
2016-05-25, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.04.004
PMID:27211860
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研究论文 | 本文介绍了一种整合代谢组学、蛋白质组学和基因组规模模型的流程,用于研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 该流程结合了计算系统生物学、代谢工程和合成生物学的互补方法,提供了宿主微环境因途径工程而变化的分子见解,并展示了如何利用与菌株变异相关的生物机制作为提高产品产量的工程策略 | NA | 理解异源和原生生化途径之间的复杂相互作用 | 研究异源途径引入微生物宿主后的影响 | 代谢工程 | NA | 代谢组学、蛋白质组学 | 基因组规模模型 | 代谢组学数据、蛋白质组学数据 | 分析了八种工程菌株,生产三种生物燃料:异戊二醇、柠檬烯和双环烯 |
1944 | 2024-08-07 |
CRISPR-mediated control of the bacterial initiation of replication
2016-05-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw214
PMID:27036863
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR/dCas9结合复制起始位点来控制细菌细胞周期的新系统 | 首次展示了CRISPR/dCas9结合复制起始位点可以精确控制细菌染色体的复制起始,并发现提高温度可以解除这种抑制作用 | NA | 开发一种简单且稳健的方法来控制细菌细胞周期,为合成生物学和DNA复制研究提供工具 | 细菌细胞周期和DNA复制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9 | NA | NA | NA |
1945 | 2024-08-07 |
Towards self-assembled hybrid artificial cells: novel bottom-up approaches to functional synthetic membranes
2015-Sep-01, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.201501229
PMID:26149747
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研究论文 | 本文探讨了利用自下而上的方法开发合成细胞,特别是通过功能化合成膜与生物系统的整合来构建“混合”人工细胞的最新进展和现状 | 研究通过控制高度有序的膜结构的自组装,精确模拟活细胞的结构和/或功能,为合成生物学提供了新的合成底盘 | NA | 深入理解生命系统的本质,探索细胞生命的起源,并为合成生物学的发展提供新的合成底盘 | 混合人工细胞及其合成膜的构建和功能 | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 膜结构 | NA |
1946 | 2024-08-07 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-May-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
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研究论文 | 构建了一个基于网络的植物合成生物学数据库(PSBD),用于分类和提供植物合成生物学研究中的生物部件和化学物质信息 | PSBD数据库整合了1677个催化生物部件和384个调控元件,并提供了在线生物信息学工具,以辅助植物基因表达的合理设计 | NA | 开发一个集成且用户为中心的平台,为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物部件和化学物质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 1677个催化生物部件,384个调控元件,309个物种,850种化学物质 |
1947 | 2024-08-07 |
Integrated (Meta) Genomic and Synthetic Biology Approaches to Develop New Biocatalysts
2016-Mar-21, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md14030062
PMID:27007381
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综述 | 本文综述了利用(元)基因组学和合成生物学方法开发新型生物催化剂的研究进展 | 结合基因组学序列分析和合成分子生物学的发展,加速发现和改进新一代海洋生物催化剂 | NA | 探讨如何利用基因组学和合成生物学技术加速新型海洋生物催化剂的发现和改进 | 海洋环境中的生物活性化合物和生物催化剂 | 生物技术 | NA | 基因组学, 合成生物学 | NA | 序列数据 | NA |
1948 | 2024-08-07 |
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology
2016-Feb, Journal of laboratory automation
DOI:10.1177/2211068215593754
PMID:26163567
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研究论文 | 本文首次将声波喷射技术应用于合成生物学领域,用于纳米级规模的DNA合成和组装 | 成功将PCR和流行的Golden Gate及Gibson组装方法从微升级别缩小到纳米级别,显著降低了试剂成本 | NA | 探索声波喷射技术在合成生物学中的应用,特别是在DNA合成和组装方面 | 声波喷射技术在DNA合成和组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 声波喷射技术 | NA | NA | NA |
1949 | 2024-08-07 |
Predicting complex phenotype-genotype interactions to enable yeast engineering: Saccharomyces cerevisiae as a model organism and a cell factory
2013-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201300138
PMID:24031036
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综述 | 本文综述了利用系统生物学、合成生物学和进化工程工具来解释基因型与表型之间复杂关系的研究进展,并探讨了其在酵母工程和药物筛选中的应用 | 本文提出通过改进对复杂基因型-表型相互作用的理解和预测,可以更有效地进行酵母工程和药物筛选 | 环境因素对基因型-表型关系的影响增加了研究的复杂性,目前仍存在理解细胞机制的挑战 | 旨在通过揭示基因型与表型之间的复杂关系,促进生物医学和生物技术领域的应用 | 研究对象为酵母Saccharomyces cerevisiae,作为模型生物和生产生物 | 生物技术 | NA | 系统生物学、合成生物学、进化工程 | NA | NA | NA |
1950 | 2024-08-07 |
Advances and perspectives in genetic expression and operation for the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.05.003
PMID:38784195
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综述 | 本文综述了油脂酵母Yarrowia lipolytica在遗传表达和操作方面的最新进展,特别是基因表达、染色体操作、基于CRISPR的工具和动态生物传感器 | 介绍了合成生物学在开发新型细胞工厂方面的新机遇 | NA | 为开发微生物工厂提供有价值的参考 | 油脂酵母Yarrowia lipolytica的遗传表达和操作 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
1951 | 2024-08-07 |
Special issue: Manipulation/regulation of secondary metabolites in medicinal plants
2024-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108549
PMID:38538457
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特刊 | 本特刊汇集了多篇原创研究文章和综述,旨在揭示药用植物中次生代谢物生物合成的复杂调控机制 | 利用基因组学、代谢组学和微生物组表征等尖端技术,探索药用植物中次生代谢物的生物合成、调控和操纵 | NA | 揭示药用植物中次生代谢物生物合成的调控机制,并探索优化其生产的方法 | 药用植物中的次生代谢物 | NA | NA | 基因组学、代谢组学、微生物组表征 | NA | NA | NA |
1952 | 2024-08-07 |
Light-Controlled Mammalian Cells and Their Therapeutic Applications in Synthetic Biology
2019-Jan-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201800952
PMID:30643713
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综述 | 本文综述了光控哺乳动物细胞及其在合成生物学中的治疗应用 | 结合光遗传学和治疗性合成生物学,实现了对设计细胞行为的精确非侵入性调控 | 讨论了当前光遗传学在合成生物学中的瓶颈和可能的解决方案 | 探讨光控治疗基因表达在哺乳动物细胞中的应用,以治疗疾病 | 光遗传学系统和其在哺乳动物细胞遗传编程中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
1953 | 2024-08-07 |
Yeast-based assays for screening 11β-HSD1 inhibitors
2016-Mar-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-016-0450-6
PMID:26980090
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研究论文 | 本文介绍了基于酵母细胞的两种筛选11β-HSD1抑制剂的检测方法 | 开发了两种基于酵母细胞的检测方法,用于筛选新的11β-HSD1抑制剂,这些方法成本效益高且易于操作 | NA | 开发新的检测方法以筛选11β-HSD1抑制剂,用于治疗代谢综合征和抗皮肤老化 | 11β-HSD1酶的抑制剂 | NA | 代谢综合征 | 酵母细胞表达系统 | NA | 荧光信号 | NA |
1954 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae: a key cell factory platform for future biorefineries
2012-Aug, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-012-0945-1
PMID:22388689
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综述 | 本文综述了利用代谢工程改造酵母Saccharomyces cerevisiae作为细胞工厂,生产生物燃料、化学品、药物和食品添加剂的研究进展 | 探讨了如何利用系统生物学和合成生物学技术推动酵母代谢工程的发展 | NA | 旨在提高酵母对生物质水解物中糖的摄取能力,并利用酵母生产燃料和化学品 | 酵母Saccharomyces cerevisiae的代谢工程 | 生物工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1955 | 2024-08-07 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了Amaryllidaceae生物碱(AAs)的结构多样性、生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的潜在应用 | 本文强调了合成和手性选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用,并探讨了AAs作为抗病毒药物先导化合物的潜力 | AAs的生物合成过程尚未完全定义,需要进一步的跨学科努力以完全理解其生物合成途径及其结构-活性关系 | 探讨Amaryllidaceae生物碱的生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的应用 | Amaryllidaceae生物碱及其生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1956 | 2024-08-07 |
Ethics and engagement: steering China's synbio future
2024-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.013
PMID:37968158
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研究论文 | 本文探讨了公众参与和伦理指导在塑造中国合成生物学未来发展轨迹中的关键作用 | NA | NA | 探讨公众参与和伦理指导在合成生物学领域中的重要性 | 合成生物学在中国的发展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1957 | 2024-08-07 |
Regulatory microRNAs and phasiRNAs of paclitaxel biosynthesis in Taxus chinensis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1403060
PMID:38779066
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研究论文 | 本文系统地鉴定了990个转录因子(TFs)、460个微小RNAs(miRNAs)和160个相位小干扰RNAs(phasiRNAs),并探讨了它们在紫杉醇合成中的相互作用和潜在调控作用。 | 本文通过共表达网络分析推断调控TFs,并构建了包括酶基因、TFs、miRNAs和phasiRNAs的调控网络,揭示了紫杉醇生产在转录后水平的层级调控。 | NA | 研究紫杉醇合成的转录和转录后调控机制,以促进通过组织/细胞培养方法提高紫杉醇产量。 | 紫杉醇的生物合成机制及其调控因子。 | NA | 抗癌活性 | NA | NA | 基因表达数据 | 990个转录因子,460个微小RNAs,160个相位小干扰RNAs |
1958 | 2024-08-07 |
The hope, hype and obstacles surrounding cell therapy
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18359
PMID:38770886
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研究论文 | 本文探讨了细胞疗法在医学领域的希望与挑战 | 介绍了合成生物学在细胞疗法中的潜在解决方案 | 细胞疗法在治疗某些疾病如遗传性疾病和纤毛病方面的局限性 | 分析细胞疗法的潜力及其在不同疾病治疗中的应用 | 干细胞及其衍生品在疾病治疗中的应用 | NA | 糖尿病, 帕金森病, 镰状细胞病, 遗传性疾病, 纤毛病 | 细胞疗法, 合成生物学 | NA | NA | NA |
1959 | 2024-08-07 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 本文介绍了BarMap-QA管道的开发,用于评估共转录折叠模拟的质量,并通过一个详细的例子展示了其应用。 | 开发了用户友好的BarMap-QA管道,用于克服原始BarMap软件在特定场景如共转录折叠中的使用难度。 | 原始的BarMap软件在特定场景如共转录折叠中使用困难。 | 验证设计构造的功能性,避免昂贵的实验室实验。 | 共转录RNA折叠模拟的质量评估。 | NA | NA | BarMap方法 | Markov过程 | RNA二级结构 | 一个合成转录调控的riboswitch |
1960 | 2024-08-07 |
Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00030c
PMID:38047390
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research paper | 本文聚焦于细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs,这些RiPPs由自由基SAM/SPASM酶产生,通过在 precursor peptide 的两个氨基酸残基的芳香环和侧链之间形成交联。 | 本文介绍了近年来含环状聚酰胺的RiPP天然产物及其生物合成途径的发现,并讨论了这些途径和产品的发现方法。 | NA | 探讨细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶,作为药物发现和合成生物学工具的未开发资源。 | 细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶。 | NA | NA | 自由基SAM/SPASM酶 | NA | NA | NA |