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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-10 |
GenoChemetic Strategy for Derivatization of the Violacein Natural Product Scaffold
2021-11-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.1c00483
PMID:34648268
|
研究论文 | 通过将合成生物学与合成化学相结合,快速衍生化天然产物骨架violacein,产生多种类似物和新衍生物 | 首次展示了一种灵活快速的方法,通过饲喂卤代前体并结合Suzuki-Miyaura交叉偶联反应,直接从粗提物中生成多样化的violacein衍生物,无需纯化 | NA | 开发一种结合合成生物学和合成化学的策略,以快速获取天然产物骨架的多样化化学空间,加速新治疗药物的发现 | violacein生物合成途径及衍生物 | 合成生物学 | NA | Suzuki-Miyaura交叉偶联反应, 卤代酶(RebH) | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | violacein生物合成途径 | 药物发现 |
| 2 | 2026-07-10 |
De novo peptide grafting to a self-assembling nanocapsule yields a hepatocyte growth factor receptor agonist
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103302
PMID:34805784
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研究论文 | 通过将抗MET肽药效团移植到自组装纳米胶囊的表面,生成了一种能激活肝细胞生长因子受体MET的新型生物制剂 | 首次将Lasso-grafting技术应用于自组装蛋白质纳米胶囊,通过多药效团展示诱导MET受体二聚化并激活信号通路 | 未明确讨论体内稳定性和免疫原性等潜在限制 | 开发一种基于合成生物学的胶囊型生物制剂,以激活信号受体 | 肝细胞生长因子受体MET及自组装纳米胶囊AaLS | 合成生物学 | NA | Lasso-grafting技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 通过Lasso-grafting将抗MET肽药效团植入lumazine synthase变体的环中,形成多药效团展示的纳米胶囊 | 医学 |
| 3 | 2026-07-07 |
Cut the noise or couple up: Coordinating circadian and synthetic clocks
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103051
PMID:34568785
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综述 | 本文综述了生物钟与合成生物钟之间的协调机制,强调了耦合与异质性在昼夜节律钟中的重要作用,并整合了时间生物学与合成生物学领域,探讨其振荡器的关键设计原理 | 揭示了昼夜节律钟之间耦合与异质性的有趣二分法,并首次将合成生物学振荡器与昼夜节律振荡器进行平行比较,整合两个领域的设计原则 | NA | 探讨生物钟与合成生物钟的协调机制,并整合时间生物学与合成生物学的设计原则 | 昼夜节律钟和合成生物钟振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 振荡器 | 农业,生态学,发育生物学,医学 |
| 4 | 2026-06-19 |
Optimization-based Eukaryotic Genetic Circuit Design (EuGeneCiD) and modeling (EuGeneCiM) tools: Computational approach to synthetic biology
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103000
PMID:34622181
|
研究论文 | 开发基于优化的真核遗传电路设计与建模工具,用于合成生物学应用 | 首次将优化概念应用于真核生物遗传电路设计,并开发了EuGeneCiD和EuGeneCiM两种工具,可有效避免问题设计,加速合成生物学应用开发 | 标题和摘要未明确说明限制 | 开发基于优化的真核遗传电路设计与建模工具,支持合成生物学应用开发 | 30种基本逻辑门遗传电路概念化设计,以及抑制子振荡器电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 30种逻辑门电路概念化,每种数百个设计方案 | NA | 真核生物 | 逻辑门、抑制子振荡器 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-06-15 |
Generation of hypoxia-sensing chimeric antigen receptor T cells
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100723
PMID:34401788
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研究论文 | 生成缺氧感应嵌合抗原受体T细胞的协议 | 利用实体瘤中的缺氧条件限制CAR表达于肿瘤微环境,减少脱靶毒性和紧张信号 | NA | 开发用于实体瘤治疗的缺氧感应CAR-T细胞 | 缺氧感应嵌合抗原受体T细胞 | 数字病理学 | 实体瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 缺氧感应嵌合抗原受体 | 医学 |
| 6 | 2026-05-23 |
Amorpha-4,11-diene synthase: a key enzyme in artemisinin biosynthesis and engineering
2021-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-021-00058-x
PMID:36303880
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综述 | 综述了青蒿素生物合成中关键酶Amorpha-4,11-diene synthase (ADS)的发现、催化机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用 | 系统总结了ADS在青蒿素生物合成途径中的关键作用及其底物杂泛性在新化学酶法生产青蒿素中的应用 | 未提及具体实验数据或模型验证,可能缺乏对ADS工程化最新技术的深度定量分析 | 综述ADS在青蒿素生物合成与工程化中的研究进展 | Amorpha-4,11-diene synthase (ADS) 酶 | 合成生物学 | 疟疾 | NA | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 微生物 | 青蒿素生物合成途径 | 医药 |
| 7 | 2026-05-22 |
New Set of Yeast Vectors for Shuttle Expression in Escherichia coli
2021-Mar-16, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.1c00339
PMID:33748631
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研究论文 | 该研究发现了酿酒酵母的GAL1/10双向启动子可用于大肠杆菌中的穿梭表达,并开发了一套用于原核和真核宿主间穿梭表达的Golden Gate组装载体 | 首次发现GAL1/10双向启动子在大肠杆菌中具有穿梭表达能力,并构建了适用于原核和真核宿主间快速表型分析的穿梭载体系统 | 未提及启动子在不同宿主间的表达效率差异及长期稳定性 | 开发具有广泛宿主特性的启动子以实现不同宿主间的遗传构建快速表型分析 | 酿酒酵母GAL1/10双向启动子及大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序, Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate组装 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 穿梭表达载体系统 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-05-16 |
Microdroplet Operations in Polymeric Microtubes
2021-02-02, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c04360
PMID:33449620
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研究论文 | 展示如何利用简单、廉价的聚合物微管模块实现微滴捕获、合并、稀释和分割等操作 | 提出了一种低成本、无需专业微加工设备的聚合物微管模块方法,通过创建角度管接口实现多种微滴操作 | NA | 开发一种替代昂贵微加工方法的微滴微流控技术方案 | 聚合物微管模块中水包油微滴的操作行为 | 微流控技术 | NA | 微滴微流控 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 化学分析、生物学、合成生物学 |
| 9 | 2026-05-11 |
Plasmid Vectors for in Vivo Selection-Free Use with the Probiotic E. coli Nissle 1917
2021-01-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00466
PMID:33301298
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研究论文 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体系统 | 将天然质粒pMUT1和pMUT2改造为稳健的工程平台,结合CRISPR-Cas9系统移除天然质粒,实现无抗生素选择下的稳定维持和功能性蛋白分泌 | 未提及 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其天然质粒pMUT1和pMUT2 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 小鼠胃肠道实验 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 质粒载体含选择标记、荧光标记、温度敏感表达和curli分泌系统 | 医学 |
| 10 | 2026-04-10 |
Utilizing Plant Synthetic Biology to Improve Human Health and Wellness
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.691462
PMID:34504505
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在改善人类健康和福祉方面的潜力,包括生产药物、营养素和营养保健品,并讨论了相关技术挑战 | 利用植物合成生物学工具将代谢途径转移到更易培养的植物中,以增强复杂药物的生产能力,并强化作物的营养和营养保健品含量 | 存在技术挑战,阻碍了植物生产促进健康的小分子化合物的能力 | 探讨植物合成生物学如何通过生成生产药物、营养素和营养保健品的植物来改善人类健康 | 植物及其代谢途径,用于生产生物活性化学品 | 合成生物学 | NA | 植物合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径转移 | 医学, 农业 |
| 11 | 2026-03-22 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
|
研究论文 | 本文通过计算分析比较了天然和人工碳固定途径的性能,包括特定活性和产率 | 提出了两个全新的碳固定循环(还原性柠檬酰辅酶A循环和2-羟基戊二酸反向三羧酸循环),并采用综合动力学数据集和参数平衡算法进行预测 | 计算模型可能受限于数据可用性和假设,实际应用需实验验证 | 评估和比较天然与人工碳固定途径的性能,以优化工业生物技术和合成生物学应用 | 碳固定途径,包括天然和人工循环,如CBB循环、CETCH循环等 | NA | NA | 计算分析、参数平衡算法、酶成本最小化算法 | NA | 动力学和热力学数据 | NA | NA | NA | 碳固定代谢途径,包括还原性甘氨酸途径、CETCH循环等 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 12 | 2026-03-20 |
Microbial Systems Ecology to Understand Cross-Feeding in Microbiomes
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.780469
PMID:34987488
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综述 | 本文是一篇关于微生物系统生态学(MSE)框架如何帮助理解微生物组中交叉喂养的迷你综述 | 提出了一个结合自上而下和自下而上方法的微生物系统生态学框架,用于解析微生物群落组装的确定性过程,特别适用于合成生物学和微生物组工程 | NA | 探讨微生物系统生态学框架在理解微生物交叉喂养和群落组装机制方面的应用 | 微生物群落及其交叉喂养相互作用 | 微生物生态学 | NA | 基因组尺度代谢网络重建、整合组学数据 | 代谢建模 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物组工程 |
| 13 | 2026-03-06 |
Orthogonal translation enables heterologous ribosome engineering in E. coli
2021-01-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20759-z
PMID:33500394
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研究论文 | 本研究通过正交翻译系统在E. coli中实现了异源核糖体工程,为合成生物学提供了新的核糖体改造框架 | 采用正交核糖体结合位点(RBS)与反RBS配对系统,首次实现了对难改造核糖体的定向工程化 | 目前仅适用于16S rRNA与E. coli相似度≥76.1%的微生物来源核糖体 | 开发活细胞中异源核糖体工程化的通用方法 | 由不同微生物rRNA和核糖体蛋白组成的异源核糖体 | 合成生物学 | NA | 正交翻译系统、核糖体工程 | NA | NA | NA | 正交RBS:antiRBS配对系统 | E. coli | 正交翻译系统、异源核糖体组装 | 工业生物技术 |
| 14 | 2026-02-26 |
Synthetic biology: at the crossroads of genetic engineering and human therapeutics-a Keystone Symposia report
2021-12, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.14710
PMID:34786712
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会议报告 | 本文总结了2021年5月3日至4日举行的Keystone eSymposium,探讨了合成生物学在细胞和基因疗法中的潜在应用 | 强调合成生物学在人类治疗中的临床应用,而非技术细节,并讨论了多种疗法(如T细胞、基因、病毒疗法和益生菌)的工程化改进 | NA | 探索合成生物学如何转化细胞和基因疗法以治疗多种疾病 | 真核和原核细胞,包括T细胞、基因疗法、病毒疗法和益生菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 真核细胞, 原核细胞 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢途径 | 医学 |
| 15 | 2025-12-13 |
In conversation with Nigel Scrutton
2021-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.15632
PMID:33373117
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访谈 | 本文是对分子酶学和生物物理化学专家Nigel Scrutton教授的访谈,探讨了他在酶工程、合成生物学和生物制造领域的贡献及职业发展历程 | NA | NA | 分享酶催化机制基础研究如何推动生物技术和生物制造的关键进展,并探讨学术生涯发展经验 | 酶催化机制、合成生物学应用、生物制造技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物制造 |
| 16 | 2025-10-05 |
Words Are Essential, but Underexamined, Research Tools for Microbes and Microbiomes
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00769-21
PMID:34463574
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研究论文 | 本文探讨语言和隐喻在微生物及微生物组研究中作为科学建构工具的作用 | 首次系统分析隐喻如何塑造合成生物学和微生物组研究中与微生物工作的可能性 | NA | 研究语言工具如何构建科学观察和期望,确保所选工具适合研究目标 | 微生物研究中的语言和隐喻工具 | NA | NA | NA | NA | 文本分析 | NA | NA | 酵母, 细菌 | NA | 合成生物学, 微生物组研究 |
| 17 | 2025-10-05 |
Retooling Microbiome Engineering for a Sustainable Future
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00925-21
PMID:34463582
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评论 | 讨论如何利用系统生物学和合成生物学工具重新设计微生物组工程方法以应对未来可持续发展挑战 | 提出将系统生物学、合成生物学、自动化和机器学习相结合的新工程范式,实现对微生物组的精确操控 | NA | 探讨如何改进微生物组工程方法以更好地应对可持续发展需求 | 微生物群落及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 非模式微生物、微生物组 | 代谢网络 | 环境,工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
Synthetic Circuit-Driven Expression of Heterologous Enzymes for Disease Detection
2021-09-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00133
PMID:34464083
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研究论文 | 本研究开发了一种合成基因电路与纳米技术结合的疾病检测系统,通过癌细胞特异性表达异源酶并利用纳米传感器实现信号放大检测 | 首次将合成生物学基因电路与纳米技术传感器整合,创建了能够对癌症状态产生放大检测信号的工程化生物传感器系统 | 目前仅在卵巢癌小鼠模型中验证,尚未在人类临床试验中测试 | 开发新型工程化生物传感器用于疾病检测 | 卵巢癌细胞、小鼠模型 | 合成生物学、纳米技术 | 卵巢癌 | 基因电路设计、纳米传感器技术 | AND逻辑门基因电路 | 酶活性检测信号 | NA | 合成生物学基因电路设计 | 哺乳动物细胞 | AND逻辑门基因电路,整合两个卵巢癌特异性合成启动子驱动TEV蛋白酶表达 | 医学诊断 |
| 19 | 2025-10-05 |
The Future of Virology is Synthetic
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00770-21
PMID:34463577
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评论 | 本文探讨合成生物学在病毒学研究中的应用前景及其对改善人类健康和可持续农业的潜在贡献 | 提出合成生物学可作为解锁全球病毒基因库的关键工具,并探讨合成病毒在理解微生物生态系统和应对耐药微生物威胁中的创新应用 | NA | 讨论当前合成操纵病毒的技术及其在人类健康和农业可持续发展中的应用 | 病毒圈(全球病毒组)和合成病毒 | 合成生物学 | 耐药微生物感染 | 合成生物学工程原理 | NA | NA | NA | NA | 微生物生态系统 | NA | 医学, 农业 |
| 20 | 2025-10-05 |
Protein manipulation using single copies of short peptide tags in cultured cells and in Drosophila melanogaster
2021-03-16, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.191700
PMID:33593816
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研究论文 | 本研究开发了一种利用短肽标签在活细胞和果蝇体内直接操纵目标蛋白的方法 | 使用单拷贝短肽标签实现活细胞内目标蛋白的高效结合与操作 | NA | 开发直接操纵目标蛋白的新方法以研究动态细胞过程 | 培养细胞和黑腹果蝇中的目标蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结合剂技术 | NA | NA | NA | NA | 黑腹果蝇, 培养细胞 | NA | 医学研究 |