合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-07	A Biosynthetic Hybrid Spidroin-Amyloid-Mussel Foot Protein for Underwater Adhesion on Diverse Surfaces 2021-Oct-20, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.1c14182 PMID:34633172	research paper	本文通过合成生物学方法设计并合成了一种新型混合蛋白，该蛋白由淀粉样蛋白的拉链形成域、灵活的蜘蛛丝序列和含有二羟基苯丙氨酸（DOPA）的贻贝足蛋白（Mfp）组成，用于水下粘附	该混合蛋白能够自组装成半结晶水凝胶，具有高强度和韧性以及强大的水下粘附力，适用于多种表面，包括难以粘附的塑料、肌腱和皮肤	NA	开发一种新型水下粘附材料，用于生物医学愈合和水下修复	新型混合蛋白及其在水下粘附中的应用	生物材料	NA	合成生物学	NA	蛋白质	NA
42	2024-08-07	Building protein networks in synthetic systems from the bottom-up 2021 Jul-Aug, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2021.107753 PMID:33857631	综述	本文综述了从底层构建脂质体、水油滴和生物材料中的蛋白质网络的底层技术及其在生物转导途径、能量自供给系统、细胞环境传感器和无细胞蛋白质支架中的最新应用	介绍了新的蛋白质网络组装技术，包括多蛋白质纯化方法、高通量筛选平台和脂质体可控融合	目前构建的蛋白质网络在复杂性和动态响应方面仍难以与自然系统相媲美	探讨合成和自然蛋白质网络的理解差距，并展望开发智能和弹性蛋白质网络以应用于各种生物医学领域	蛋白质网络的组装及其在生物医学中的应用	合成生物学	NA	蛋白质网络组装技术	NA	NA	NA
43	2024-08-07	Synthesis as an Expanding Resource in Human Milk Science 2021-08-04, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.1c05599 PMID:34296874	研究论文	本文讨论了合成化学在人乳寡糖科学中的应用，特别是合成均质人乳寡糖（HMOs）及其在动物研究中的应用	本文提出了一种化学、化学酶学和合成生物学方法来合成和表征HMOs及其机制探针	NA	探索合成化学在人乳寡糖科学中的应用，特别是合成均质HMOs及其在动物研究中的应用	人乳寡糖（HMOs）及其合成方法	NA	NA	合成化学、化学酶学、合成生物学	NA	NA	NA
44	2024-08-07	A suppressor tRNA-mediated feedforward loop eliminates leaky gene expression in bacteria 2021-03-18, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaa1179 PMID:33290521	研究论文	本文开发了一种泄漏抑制工具，通过抑制tRNA介导的前馈环路，显著减少了诱导型遗传系统在无诱导剂时的泄漏表达，同时保持信号在Escherichia coli中的传递。	该系统利用抑制tRNA实现对调控基因中静默无义突变的条件性读通，可应用于任何配体诱导的转录因子，提供了一种模块化工具来减少泄漏并提高遗传电路中的诱导倍数。	NA	开发一种工具，用于减少细菌中诱导型遗传系统的泄漏表达并提高诱导倍数。	Escherichia coli中的诱导型遗传系统和两种生物传感器（乳酸传感器LldR和阿拉伯糖传感器AraC）。	合成生物学	NA	抑制tRNA介导的前馈环路	NA	生物传感器输出	涉及两种生物传感器和一种诱导型突变质粒
45	2024-08-07	Interfacing non-enzymatic catalysis with living microorganisms 2021-Aug-05, RSC chemical biology IF:4.2Q2 DOI:10.1039/d1cb00072a PMID:34458824	综述	本文综述了非酶催化与细胞代谢界面的新兴方法，用于生产高价值小分子和聚合物	该领域结合了合成化学和合成生物学，为可持续化学工业提供了广阔潜力	NA	探讨非酶催化与微生物代谢的界面，以及其在高价值分子生产中的应用	非酶催化与细胞代谢的界面，以及其在生物聚合物和分子生产中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
46	2024-08-07	Metabolic engineering strategies for de novo biosynthesis of sterols and steroids in yeast 2021-Nov-05, Bioresources and bioprocessing IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s40643-021-00460-9 PMID:38650187	综述	本文综述了基于调控机制的代谢工程策略，用于提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成	介绍了酵母中一些典型甾醇和甾体化合物的最新从头合成进展	讨论了当前面临的挑战和未来展望	提高酵母中甾醇和甾体化合物的从头生物合成效率	甾醇和甾体化合物	代谢工程	NA	代谢工程	NA	NA	NA
47	2024-08-07	Advances in the design and development of SARS-CoV-2 vaccines 2021-12-16, Military Medical Research IF:16.7Q1 DOI:10.1186/s40779-021-00360-1 PMID:34911569	综述	本文综述了针对COVID-19的预防性和治疗性疫苗设计的最新进展	介绍了基于病毒载体、纳米科学和合成生物学的新型疫苗	临床试验中仍存在许多挑战	探讨SARS-CoV-2疫苗的设计与开发	COVID-19疫苗	NA	冠状病毒病	NA	NA	NA	NA
48	2024-08-07	Artificial nucleic acid backbones and their applications in therapeutics, synthetic biology and biotechnology 2021-11-12, Emerging topics in life sciences IF:3.4Q1 DOI:10.1042/ETLS20210169 PMID:34297063	研究论文	本文探讨了人工核酸骨架的改良技术及其在治疗药物、合成生物学和生物技术中的应用	提出了多种易于合成的人工核酸骨架及其引入寡核苷酸的稳健方法	目前人工核酸骨架的合成可及性有限，限制了其在更广泛领域的应用	开发新型人工核酸骨架，以充分利用其在治疗药物、合成生物学和生物技术中的潜力	人工核酸骨架及其在寡核苷酸中的应用	生物技术	NA	核酸骨架改良技术	NA	NA	NA
49	2024-08-07	Synthetic biomarkers: a twenty-first century path to early cancer detection 2021-10, Nature reviews. Cancer DOI:10.1038/s41568-021-00389-3 PMID:34489588	综述	本文综述了合成生物标志物在早期癌症检测中的应用和发展	介绍了利用生物工程传感器在体内查询早期肿瘤并放大疾病信号的合成生物标志物	强调了合成生物标志物在临床前开发和临床转化中存在的挑战	探讨开发基于体液的合成生物标志物的合理性及其在早期癌症检测中的应用	合成生物标志物及其在早期癌症检测中的应用	NA	癌症	生物工程	NA	体液	NA
50	2024-08-07	Bioinspired Networks of Communicating Synthetic Protocells 2021, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2021.804717 PMID:35004855	综述	本文讨论了从无生命分子和材料中自下而上合成类似细胞实体的挑战，并介绍了三种新出现的生物启发式通信合成原细胞网络	本文介绍了多原细胞系统的设计可能性，这些系统能够发送和接收化学信号，触发个体或集体的编程细胞样行为，或与活细胞和组织通信	NA	探讨自下而上合成生物学中新出现的领域，并介绍新型的生物启发式通信合成原细胞网络	合成原细胞及其在生物技术、组织工程和再生医学中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
51	2024-08-07	The Future Potential of Biosensors to Investigate the Gut-Brain Axis 2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2021.826479 PMID:35096802	综述	本文综述了利用生物传感器检测肠道代谢物以量化微生物组对抑郁症贡献的潜力，并探讨了合成生物学策略在检测肠道-大脑轴失调中的应用	提出利用生物传感器检测肠道代谢物，以量化微生物组对抑郁症的贡献，并探讨了合成生物学策略在检测肠道-大脑轴失调中的应用	强调了开发影响抑郁症的微生物组状况的活体诊断所面临的未来挑战	探讨生物传感器在研究肠道-大脑轴中的未来潜力	肠道微生物组及其与神经系统功能的相互作用	NA	抑郁症	生物传感器	NA	代谢物	NA
52	2024-08-07	Biological factors in the synthetic construction of overlapping genes 2021-Dec-11, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-021-08181-1 PMID:34895142	研究论文	研究探讨了重叠基因（OLGs）的生物学因素及其在不同生物中的分布和形成机制	发现病毒域在设计重叠基因方面不如细菌或真核生物域适合，与之前的研究结果相反	研究未考虑影响蛋白质折叠的基因内相互作用等重要因素	探索重叠基因的生物学基础及其在进化和生物技术中的应用	重叠基因及其在不同生物中的分布和形成机制	生物技术	NA	隐马尔可夫模型（HMM）	隐马尔可夫模型	蛋白质序列	使用了Pfam域对进行分析
53	2024-08-07	Rapid conversion of replicating and integrating Saccharomyces cerevisiae plasmid vectors via Cre recombinase 2021-12-08, G3 (Bethesda, Md.) DOI:10.1093/g3journal/jkab336 PMID:34599813	研究论文	本文介绍了一种通过Cre重组酶快速转换复制和整合的酿酒酵母质粒载体的方法	开发了一系列优化的酵母穿梭质粒，能够高效插入、移除和替换质粒酵母复制位点，生成一套完整的整合型、低拷贝和高拷贝质粒	NA	优化质粒载体，支持酵母作为遗传学研究和合成生物学的主要系统	酿酒酵母质粒载体	合成生物学	NA	Cre重组酶	NA	质粒	NA
54	2024-08-07	DeepCME: A deep learning framework for computing solution statistics of the chemical master equation 2021-12, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1009623 PMID:34879062	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的方法DeepCME，用于计算化学主方程（CME）解的统计量	利用深度神经网络（DNNs）的优越近似性质，通过重新构建使用Kolmogorov后向方程的随机动力学，可靠地估计CME解下用户定义状态向量函数的期望	NA	开发一种新的深度学习方法，用于计算高维CME解的统计量	化学主方程（CME）的解及其对反应网络参数（如速率常数）的敏感性	机器学习	NA	深度神经网络（DNNs）	DNN	NA	NA
55	2024-08-07	Independent control of mean and noise by convolution of gene expression distributions 2021-11-29, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-021-27070-5 PMID:34845228	研究论文	本文通过理论证明和实验验证，展示了通过在同一细胞中从两个可诱导启动子表达两个基因拷贝，可以独立控制基因表达的均值和噪声	提出了一种新的方法，通过在同一细胞中使用两个可诱导启动子表达两个基因拷贝，实现对基因表达均值和噪声的独立控制	NA	研究基因表达噪声对细胞适应性和生物过程的影响	基因表达的均值和噪声控制	合成生物学	NA	NA	NA	基因表达数据	使用大肠杆菌进行实验验证
56	2024-08-07	Bioremediation of Per- and Poly-Fluoroalkyl Substances (PFAS) by Synechocystis sp. PCC 6803: A Chassis for a Synthetic Biology Approach 2021-Nov-26, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life11121300 PMID:34947832	研究论文	本文评估了Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的生物修复潜力，并探讨了其在PFAS去除中的作用机制	首次报道了Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS富集水体中的应用，并揭示了其在PFAS去除中的潜在机制	研究仅初步探讨了PFAS的去除机制，仍需进一步的代谢工程研究以优化其应用	评估Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的生物修复潜力	Synechocystis sp. PCC 6803在PFAS污染水体中的应用及其去除机制	生物技术	NA	呼吸测量法	NA	生物数据	未具体说明样本数量
57	2024-08-07	Capsid Structure of Anabaena Cyanophage A-1(L) 2021-11-23, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/JVI.01356-21 PMID:34549983	研究论文	本文报道了淡水蓝藻病毒A-1(L)的3.35 Å冷冻电镜结构，这是首个接近原子分辨率的T数为9的病毒衣壳结构	A-1(L)病毒衣壳采用了一种独特的非共价链甲结构，通过两种榫卯式衣壳间相互作用稳定，这种结构使得A-1(L)具有仅由主要衣壳蛋白组成的刚性衣壳	NA	揭示蓝藻病毒A-1(L)衣壳的结构，以更好地理解其组装过程，并为未来的研究与应用提供结构平台	淡水蓝藻病毒A-1(L)的衣壳结构	NA	NA	冷冻电镜	NA	结构	NA
58	2024-08-07	LoxTnSeq: random transposon insertions combined with cre/lox recombination and counterselection to generate large random genome reductions 2021-11, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13714 PMID:33325626	research paper	本文介绍了一种名为LoxTnSeq的新方法，用于生成和编录基因组减少突变体库	LoxTnSeq结合了通过转座子突变随机整合lox位点，以及通过Cre重组酶生成突变体，并通过深度测序进行编录	LoxTnSeq方法在删除基因后可能由于上位相互作用导致基因必需性的意外变化，导致这些必需性图谱的冗余	开发一种新的方法来生成和编录基因组减少突变体库，以去除不需要的遗传物质	自然基因组减少的细菌Mycoplasma pneumoniae	synthetic biology	NA	deep sequencing	NA	genomic data	285个独特的删除突变体，删除范围从50bp到28Kb，占基因组总量的21%
59	2024-08-07	High-efficiency production of bisabolene from waste cooking oil by metabolically engineered Yarrowia lipolytica 2021-11, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13768 PMID:33605546	研究论文	本研究首次通过合成生物学和代谢工程策略，将油脂酵母Yarrowia lipolytica工程化，以从废食用油中高效生产α-bisabolene、β-bisabolene和γ-bisabolene	首次报道了利用代谢工程策略在Y. lipolytica中生产bisabolene，并探索了从废食用油中生产bisabolene的潜力	NA	开发一种竞争性和环境可持续的方法，用于工业生产bisabolene	α-bisabolene、β-bisabolene和γ-bisabolene的生产	代谢工程	NA	代谢工程	NA	NA	NA
60	2024-08-07	Metabolic engineering of microorganisms for the production of multifunctional non-protein amino acids: γ-aminobutyric acid and δ-aminolevulinic acid 2021-11, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.13783 PMID:33675575	研究论文	本文探讨了通过代谢工程策略在微生物中合成γ-氨基丁酸（GABA）和δ-氨基乙酸（ALA）的效率	文章分析并比较了多种代谢策略的效率，并提供了实现工业竞争性菌株的见解	NA	研究如何通过代谢工程提高微生物合成GABA和ALA的产量	γ-氨基丁酸（GABA）和δ-氨基乙酸（ALA）的微生物合成	代谢工程	NA	代谢工程	NA	NA	NA