合成生物学相关文章
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当前共找到 162 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
Plastic-Degrading Potential across the Global Microbiome Correlates with Recent Pollution Trends
2021-10-26, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02155-21
PMID:34700384
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研究论文 | 本研究利用全球环境DNA采样项目，构建隐马尔可夫模型并挖掘海洋和土壤宏基因组，评估微生物降解塑料的全球潜力 | 本研究首次编译了超过30,000种非冗余酶同源物目录，这些酶具有降解10种不同塑料类型的潜力，并发现海洋酶丰度随深度增加与塑料污染趋势相关 | 尽管研究揭示了微生物降解塑料的潜力，但自然降解过程仍然非常缓慢，且微生物群落中仍存在未探索的多样性 | 探讨全球微生物降解塑料的潜力及其与塑料污染趋势的相关性 | 全球微生物群落及其降解塑料的能力 | 环境科学 | NA | 隐马尔可夫模型 | 隐马尔可夫模型 | 宏基因组数据 | 超过30,000种非冗余酶同源物 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-07 |
Cell-free riboswitches
2021-Oct-07, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d1cb00138h
PMID:34704047
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综述 | 本文综述了在原核和真核细胞无细胞系统中起作用的合成无细胞核糖开关，以提供当前无细胞核糖开关技术及其局限性的现状 | 无细胞核糖开关能够检测化学信号并通过调控无细胞蛋白质合成系统中的蛋白质合成来响应 | 文章提到无细胞核糖开关技术存在局限性，但未具体说明 | 探讨无细胞合成生物学中构建复杂生物化学和遗传系统的可能性 | 无细胞核糖开关及其在无细胞系统中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA-配体相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-07 |
Understanding and mathematical modelling of cellular resource allocation in microorganisms: a comparative synthesis
2021-Sep-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04382-3
PMID:34583645
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综述 | 本文综述了微生物细胞资源分配的原则、假设和数学模型，旨在总结该领域的重要成就并探讨其潜在的生理根源 | 本文重新审视了资源分配现象的竞争性假设，特别是溢出代谢现象的生理根源，并分析了蛋白质组分与核糖体机器分配之间的可能联系 | 文章指出，关于溢出代谢的生理根源和‘蛋白质成本’的正确解释等几个重要问题仍然悬而未决 | 旨在更清晰地理解资源分配在解决细菌生长策略中的作用 | 微生物细胞资源分配现象及其生理根源 | NA | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-07 |
Rapid prototyping and design of cybergenetic single-cell controllers
2021-09-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25754-6
PMID:34561433
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cyberloop的测试框架，用于加速生物分子控制器的设计和实现过程 | 提出了Cyberloop框架，通过实时细胞荧光测量和计算机模拟，实现了对生物分子控制器的快速设计和测试 | NA | 旨在解决合成生物学中合成电路设计的不确定性和耗时问题 | 研究了不同生物分子控制器在酵母细胞中的应用及其性能 | 合成生物学 | NA | optogenetic tools | NA | 细胞荧光测量 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-07 |
A toolbox for digitally enhanced teaching in synthetic biology
2021-09-14, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnab115
PMID:34472608
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综述 | 本文综述了在合成生物学领域中，利用数字工具进行远程教育的方法和资源 | 介绍了多种远程教育工具和方法，以应对疫情期间的教育挑战 | 主要关注合成生物学领域的远程教育，可能不适用于其他学科 | 探讨如何在合成生物学教育中有效利用数字工具进行远程教学 | 合成生物学领域的教育者和学生 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-07 |
In situ activation of therapeutics through bioorthogonal catalysis
2021-09, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2021.113893
PMID:34333074
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综述 | 本文综述了生物正交纳米催化剂的最新进展及其在治疗和诊断中的应用 | 开发了基于合成金属催化剂的生物正交反应，扩展了生物正交化学在药物化学和合成生物学中的应用 | 直接应用裸露的过渡金属催化剂在复杂生物介质中存在水溶性差、毒性和催化剂失活等问题 | 探讨生物正交纳米催化剂的制备及其在生物医学领域的应用 | 生物正交纳米催化剂及其在治疗和诊断中的应用 | NA | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-07 |
TALENs-an indispensable tool in the era of CRISPR: a mini review
2021-Aug-21, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1186/s43141-021-00225-z
PMID:34420096
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综述 | 本文综述了TALENs和CRISPR/Cas9基因编辑系统的结构和功能角色，以及TALENs的独特特性和CRISPR的局限性 | TALENs在治疗领域提供了新的机会，具有高度的特异性和对DNA修饰的敏感性 | CRISPR在临床应用中通常不被首选，且gRNA难以导入线粒体DNA | 探讨TALENs在合成生物学领域的不可或缺性，并为通过基因编辑进行性状改良的研究者提供指导 | TALENs和CRISPR/Cas9基因编辑工具 | 基因编辑 | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-07 |
Modular dynamic biomolecular modelling with bond graphs: the unification of stoichiometry, thermodynamics, kinetics and data
2021-08, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2021.0478
PMID:34428949
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研究论文 | 本文提出了一种基于能量基础的键图方法，用于整合化学计量模型与热力学原理和动力学建模，以开发全细胞模型 | 键图方法能够内在地执行热力学约束，提供模块化建模方法，并为生物分子系统的动态模型提供参数估计的基础 | NA | 开发新的建模方法以适应基因组规模的细胞代谢模型，特别是超越稳态的动态模拟 | 生物分子系统的动态模拟模型 | 生物技术 | NA | 键图方法 | 键图模型 | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-07 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Biosynthesis of Flavonoids: A Review
2021-Jul-27, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26154522
PMID:34361675
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综述 | 本文综述了黄酮类化合物的生物合成途径以及微生物表达系统在黄酮类化合物生产中的发展 | 强调了共培养系统在黄酮类化合物生物合成中的应用 | NA | 为黄酮类化合物的合成代谢工程进一步研究提供有用的参考 | 黄酮类化合物的生物合成途径和微生物表达系统 | 合成生物学 | NA | 合成代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-07 |
Recent Advances in the Synthetic Biology of Natural Drugs
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.691152
PMID:34395399
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综述 | 本文综述了天然药物合成生物学的最新进展，特别关注了通过优化合成系统可能大规模生产的药物研究 | 提出了通过重建和优化生物合成途径来大规模制备一些稀有天然植物代谢物和高度生物活性微生物化合物的新策略 | 一些提出的合成方法仍处于初步探索阶段 | 探讨利用合成生物学生产天然药物的方法及其应用潜力 | 九种药物，包括七种来自植物和两种来自微生物的药物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 九种药物 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-07 |
Designed Artificial Protein Heterodimers With Coupled Functions Constructed Using Bio-Orthogonal Chemistry
2021, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2021.733550
PMID:34422774
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研究论文 | 本文展示了如何将两种不同的蛋白质——血红素结合螺旋束蛋白细胞色素和β桶绿色荧光蛋白通过非天然的三唑连接形成异二聚体 | 通过计算对接方法预测两种蛋白质的兼容界面，并使用遗传密码扩展技术将两种蛋白质通过三唑共价键连接，形成具有新功能特性的异二聚体 | NA | 设计并构建能够结合结构和功能上不同的蛋白质形成具有新功能特性的异二聚体 | 血红素结合螺旋束蛋白细胞色素和β桶绿色荧光蛋白 | 生物技术 | NA | 遗传密码扩展技术 | 计算对接方法 | 蛋白质结构 | 两种蛋白质 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-07 |
Design and assembly of DNA molecules using multi-objective optimization
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab026
PMID:34676304
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研究论文 | 本文开发了一种新的开源算法，用于DNA工程的多目标优化设计与组装 | 提出了一种新的多目标优化算法，用于DNA设计和组装，能够平衡设计要求和制造约束 | NA | 解决生物系统工程中制造约束与设计过程整合不足的问题 | DNA分子从基因到基因组的设计与组装 | 合成生物学 | NA | 多目标优化算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-07 |
paraSBOLv: a foundation for standard-compliant genetic design visualization tools
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab022
PMID:34712845
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研究论文 | 本文介绍了一个名为paraSBOLv的Python包，该包通过使用机器可读的参数化符号定义，使SBOLv符号的完整套件可访问，从而简化了图形的渲染过程并允许对生成的图形进行广泛的自定义 | paraSBOLv通过使用机器可读的参数化符号定义，简化了符号渲染过程，并支持高度专业化的生物设计可视化工具的开发 | NA | 加速高度专业化的生物设计可视化工具的开发，并为更复杂的软件提供基础 | 开发支持SBOLv标准的遗传设计可视化工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Optimized cDICE for Efficient Reconstitution of Biological Systems in Giant Unilamellar Vesicles
2021-07-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00068
PMID:34185516
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研究论文 | 本文展示了通过优化连续液滴界面交叉封装（cDICE）方法，生成含有复杂生物化学系统的无缺陷巨型单层囊泡（GUVs） | 通过严格控制环境条件和调整脂质-油分散体，显著提高了高质量GUV形成的可重复性和封装效率 | NA | 提高巨型单层囊泡中生物系统的封装效率和质量 | 巨型单层囊泡及其在生物系统中的应用 | 生物物理学 | NA | 连续液滴界面交叉封装（cDICE） | NA | 囊泡 | 多种生物系统，包括最小肌动蛋白细胞骨架、膜锚定DNA纳米结构和功能性PURE系统 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-07 |
Integrating Systems and Synthetic Biology to Understand and Engineer Microbiomes
2021-07-13, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了利用系统生物学和合成生物学理解及工程化微生物组的方法 | 讨论了多组学和建模方法的集成，以解决微生物组工程中的关键知识和技术的空白 | NA | 探讨如何利用系统生物学和合成生物学工具理解微生物组并设计工程化微生物组 | 微生物组的组成和功能及其在农业、医学和生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 多组学技术 | 计算模型 | 微生物组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-07 |
Present and future prospects for wheat improvement through genome editing and advanced technologies
2021-07-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2021.100211
PMID:34327324
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综述 | 本文综述了通过基因编辑和其他先进技术改善小麦的研究现状和未来前景 | 介绍了基因编辑技术在小麦功能基因组学和遗传改良中的应用，并讨论了其他技术如GWAS、高通量基因型和表型分析、快速育种和合成生物学在小麦研究中的应用 | 小麦的六倍体基因组和基因冗余复杂化了遗传研究和精确基因修饰的进展 | 探讨如何通过尖端技术提高小麦生产的韧性，同时减少环境污染，确保全球粮食和生态系统安全 | 小麦 | NA | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-07 |
Realities and hopes in the application of microbial tools in agriculture
2021-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.13866
PMID:34156754
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研究论文 | 本文探讨了微生物工具在农业中的应用现状与前景 | 提出了通过现场微生物群落操作方法，如使用含有合成微生物群落和新型益生元的产品，来克服当前限制的潜力 | 微生物工具在田间条件下的低效力和性能不一致是需要解决的主要限制 | 探讨微生物工具在可持续提高农业生产中的应用及其对其他可持续发展目标的贡献 | 微生物工具在农业中的应用及其市场发展 | NA | NA | 合成生物学和纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-07 |
Increasing MinD's Membrane Affinity Yields Standing Wave Oscillations and Functional Gradients on Flat Membranes
2021-05-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00604
PMID:33881306
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研究论文 | 本文通过调节MinD蛋白的膜亲和性，实现了在平坦脂质膜上的驻波振荡和功能梯度的形成 | 通过理性引导的突变延长MinD的膜定位序列，实现了不同于常见的行波或静态模式的驻波振荡 | NA | 探索通过分子自组织形成大规模模式的基本原理，并应用于合成生物学中的蛋白质模式和梯度的工程化 | 细菌MinDE蛋白系统中的MinD和MinE蛋白在脂质膜上的自组织行为 | 合成生物学 | NA | 理性引导的突变 | NA | 蛋白质模式 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-07 |
Synthetic living machines: A new window on life
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102505
PMID:34041452
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综述 | 本文综述了合成形态发生领域的最新进展，重点介绍了通过生物工程创造新型多细胞生物体的研究 | 该研究通过创建新型合成生物形式，扩展了现有的模型系统，超越了进化的植物和动物谱系 | NA | 旨在通过工程方法解决我们对形态发生中尺度规则理解上的空白，并推动合成生物学的发展 | 合成生物学中的新型多细胞生物体及其在医学和生物学基础问题理解上的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of Nature-Inspired Unnatural Cannabinoids
2021-May-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26102914
PMID:34068935
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综述 | 本文综述了天然大麻素的生物合成途径及其在异源宿主中的合成生物学研究 | 通过合成生物学和代谢工程，可以在异源宿主中高效合成低产量的稀有大麻素，并探索新型衍生化合物的生物活性 | NA | 探讨大麻素的生物合成途径及其作为治疗剂的潜力 | 大麻素及其衍生物的生物合成和生物活性 | NA | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |