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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2024-08-07 |
Interfacing Living and Synthetic Cells as an Emerging Frontier in Synthetic Biology
2021-Mar-08, Angewandte Chemie (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/ange.202006941
PMID:38505493
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研究论文 | 本文讨论了将生物细胞与人工细胞结合以创建混合系统的可能性,并介绍了该领域的现状及三种通用的混合模式 | 提出了一种新的细胞仿生学方法,通过结合自上而下和自下而上的合成生物学,模糊了生物与非生物之间的界限 | 目前人工细胞无法与生物细胞的强大功能和行为复杂性相匹配 | 探讨生物细胞与人工细胞结合的可能性,以利用两者的优势 | 生物细胞与人工细胞的混合系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
122 | 2024-08-07 |
Halogenases: a palette of emerging opportunities for synthetic biology-synthetic chemistry and C-H functionalisation
2021-Sep-07, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d0cs01551b
PMID:34368824
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综述 | 本文综述了卤化酶在合成生物学和C-H功能化中的应用 | 介绍了卤化酶在芳香和低活化脂肪族底物中安装卤素原子的选择性,这些选择性通常难以通过合成方法实现 | NA | 探讨卤化酶在生物转化、合成生物学和化学催化中的应用 | 卤化酶及其在C-H功能化和多样化中的机制 | 合成生物学 | NA | 卤化酶 | NA | NA | NA |
123 | 2024-08-07 |
Flapjack: Data Management and Analysis for Genetic Circuit Characterization
2021-01-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00554
PMID:33382586
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研究论文 | 介绍了一个名为Flapjack的系统,用于管理和分析遗传电路表征的数据 | Flapjack系统通过一个带有后端数据注册和分析引擎的网络应用程序,提供了强大的查询、绘图和分析工具,并支持与外部构建和学习软件的完全集成 | NA | 开发一个工具,用于存储、组织、共享和分析大量测量和元数据,以连接测试阶段与构建和学习阶段,完成DBTL循环 | 遗传电路的表征数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 测量数据和元数据 | 数千个电路,数百种条件,多种实验 |
124 | 2024-08-07 |
Acoustically triggered mechanotherapy using genetically encoded gas vesicles
2021-12, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-021-00971-8
PMID:34580468
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research paper | 本文展示了通过超声诱导的惯性空化,生物分子和细胞可以被工程化以在体内特定位置传递强大的机械效应 | 利用遗传编码的气泡体,通过低频超声将这些生物分子转化为微米尺度的空化气泡,释放强大的局部机械效应 | NA | 探索生物分子和细胞在体内特定位置传递机械效应的新方法 | 生物分子和细胞的工程化应用 | NA | NA | 超声诱导的惯性空化 | NA | NA | 包括体外、细胞内和体内实验,以及小鼠肿瘤归巢益生菌治疗模型 |
125 | 2024-08-07 |
Constructing a Smartphone-Controlled Semiautomatic Theranostic System for Glucose Homeostasis in Diabetic Mice
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1441-9_9
PMID:34228289
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研究论文 | 研究者开发了一种智能手机控制的半自动治疗诊断系统,用于调节糖尿病小鼠的血糖稳态 | 该研究结合了多学科设计原则,包括电气工程、软件开发、合成生物学和光遗传学,创造了一种新型的智能手机控制的治疗诊断系统 | NA | 开发一种新型的智能手机控制的治疗诊断系统,用于远程调节糖尿病小鼠的血糖稳态 | 糖尿病小鼠的血糖稳态 | 生物医学工程 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | 生物信号 | 糖尿病小鼠 |
126 | 2024-08-07 |
Versatile Microfluidic Platform for Automated Live-Cell Hyperspectral Imaging Applied to Cold Climate Cyanobacterial Biofilms
2021-Jun-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c05446
PMID:34133116
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研究论文 | 本文介绍了一种多功能微流控平台,用于冷气候条件下蓝藻生物膜的自动活细胞高光谱成像和物种检测 | 结合微流控技术、多模态成像和计算机视觉系统,提供了一个多功能平台,用于研究蓝藻生物膜的因果关系 | NA | 开发一种用于冷气候环境中蓝藻生物膜的活细胞成像和自动物种检测的微流控平台 | 冷气候环境中的蓝藻生物膜 | 计算机视觉 | NA | 高光谱成像 | 机器学习算法 | 图像 | 六个平行生长通道的生物膜样本 |
127 | 2024-08-07 |
The Future of Virology is Synthetic
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00770-21
PMID:34463577
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评论 | 文章讨论了合成生物学在病毒学中的应用及其对未来人类健康和可持续农业的潜在贡献 | 提出合成病毒作为理解微生物生态系统中生命规则的工具,并可能提供针对多药耐药微生物的未来治疗策略 | NA | 探讨合成生物学在病毒学中的应用及其对生态系统稳定性和人类健康的潜在影响 | 全球病毒组及其在微生物生态系统中的作用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
128 | 2024-08-07 |
Words Are Essential, but Underexamined, Research Tools for Microbes and Microbiomes
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00769-21
PMID:34463574
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研究论文 | 本文探讨了语言工具(尤其是隐喻)在微生物和微生物组研究中的重要性和未被充分重视的问题 | 研究揭示了隐喻在微生物学研究中的潜在影响,并强调了对其进行审查的必要性 | 文章未明确指出具体的研究限制 | 旨在探讨和揭示隐喻在微生物学研究中的作用及其对研究方向的影响 | 研究对象包括酵母、细菌以及合成生物学和微生物组研究等领域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
129 | 2024-08-07 |
Retooling Microbiome Engineering for a Sustainable Future
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00925-21
PMID:34463582
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评论 | 本文讨论了系统生物学方法在微生物组工程中的应用,以及如何通过整合合成生物学、自动化和机器学习来加速微生物组工程以应对未来的可持续性挑战 | 本文提出了通过系统生物学方法和整合合成生物学、自动化及机器学习来精确操纵和控制微生物组,以释放其全部潜力 | NA | 探讨如何利用系统生物学方法和新兴的遗传工程工具来优化微生物组工程,以应对未来的可持续性挑战 | 微生物组及其在生物技术应用中的功能 | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、自动化、机器学习 | NA | NA | NA |
130 | 2024-08-07 |
Hydrophobic Interactions between DNA Duplexes and Synthetic and Biological Membranes
2021-06-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.0c13235
PMID:34015219
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研究论文 | 研究通过实验和原子分子动力学模拟,探讨了带有疏水锚定的DNA与合成和细胞膜的相互作用 | 首次详细研究了不同疏水修饰的DNA与脂质双层的相互作用,并揭示了其结构和能量学特性 | 研究主要集中在疏水修饰的DNA与脂质膜的相互作用,未涉及其他类型的DNA修饰 | 理解DNA与膜的相互作用,为合理设计功能性DNA提供指导 | 疏水修饰的DNA与合成和细胞膜的相互作用 | 生物物理学 | NA | 原子分子动力学模拟 | MD模拟 | NA | 不同脂质组成和电荷的脂质囊泡,以及不同疏水修饰的DNA |
131 | 2024-08-07 |
A genome-engineered bioartificial implant for autoregulated anticytokine drug delivery
2021-Sep-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj1414
PMID:34516920
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研究论文 | 本文利用CRISPR-Cas9基因编辑技术在诱导多能干细胞(iPSCs)中构建了一种感知内源性炎症细胞因子水平的合成基因电路,用于创建自动调节的抗细胞因子药物递送的生物人工植入物。 | 通过结合组织工程和合成生物学,开发了一种新型生物人工植入物,能够根据炎症水平动态调整药物释放,有效减轻炎症性关节炎的症状,这是现有临床可用药物无法实现的。 | NA | 开发一种新型生物人工植入物,用于自动调节的抗细胞因子药物递送,以治疗炎症性疾病。 | 诱导多能干细胞(iPSCs)、合成基因电路、生物人工植入物、炎症性关节炎模型。 | 生物工程 | 炎症性关节炎 | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 细胞 | NA |
132 | 2024-08-07 |
Multiomics Analysis Provides Insight into the Laboratory Evolution of Escherichia coli toward the Metabolic Usage of Fluorinated Indoles
2021-Jan-27, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.0c00679
PMID:33532571
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研究论文 | 本文报道了长期在人工氟化环境中培养的两种自然适应氟化氨基酸的大肠杆菌菌株,并探讨了它们适应氟化色氨酸类似物的分子机制 | 首次详细描述了大肠杆菌适应氟化氨基酸的遗传和代谢变化,为合成生物学和生物技术中的新型微生物菌株的生物工程提供了分子基础 | NA | 研究大肠杆菌在长期暴露于氟化氨基酸后的代谢适应机制 | 大肠杆菌对氟化色氨酸类似物的适应性 | 生物技术 | NA | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 两种适应氟化氨基酸的大肠杆菌菌株 |
133 | 2024-08-07 |
Biofoundries are a nucleating hub for industrial translation
2021, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysab013
PMID:34712838
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研究论文 | 本文探讨了生物制造厂在合成生物学领域中的关键作用,特别是在推动生物系统设计和工程标准化的基础设施方面 | 生物制造厂通过提供独特的可访问基础设施,推动生物系统设计和工程的标准化,从而在合成生物学领域中发挥核心作用 | NA | 研究生物制造厂如何通过其基础设施和战略合作,促进工业转化和生物经济的发展 | 生物制造厂在合成生物学中的作用及其对工业转化和生物经济的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
134 | 2024-08-07 |
USE OF ARTIFICIAL CELLS AS DRUG CARRIERS
2021-Sep-21, Materials chemistry frontiers
IF:6.0Q1
DOI:10.1039/d1qm00717c
PMID:38344270
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综述 | 本文综述了基于细胞膜的药物输送系统(DDSs),即“人工细胞”或原细胞的最新进展 | 人工细胞技术的发展使得药物载体能够有效且可控地释放多种治疗药物,且随着复杂性的增加,对治疗设计的影响将更大 | NA | 开发新的治疗策略,模仿细胞的大小、功能和复杂性 | 人工细胞作为药物载体的设计和应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学、材料科学 | NA | NA | NA |
135 | 2024-08-07 |
PlasmidHawk improves lab of origin prediction of engineered plasmids using sequence alignment
2021-02-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21180-w
PMID:33637701
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PlasmidHawk的新工具,用于提高工程质粒实验室来源预测的准确性,通过序列比对方法实现 | PlasmidHawk相比机器学习方法具有更高的预测准确性,并能精确指出用于实验室来源检测的特征子序列 | NA | 开发一种可解释且准确的工具,用于预测合成质粒序列的实验室来源 | 工程质粒的实验室来源 | 合成生物学 | NA | 序列比对 | NA | DNA序列 | NA |
136 | 2024-08-07 |
Increasing cellulosic ethanol production by enhancing phenolic tolerance of Zymomonas mobilis in adaptive evolution
2021-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2021.124926
PMID:33684841
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研究论文 | 本研究通过实验室适应性进化方法,提高了Zymomonas mobilis 8b在玉米秸秆水解液中的酚醛耐受性和乙醇发酵能力 | 通过198天的适应性进化,获得了显著提高的酚醛耐受性和乙醇发酵能力的Zymomonas mobilis Z198,并发现ZMO3_RS07160基因的过表达是关键因素 | NA | 提高Zymomonas mobilis的酚醛耐受性和纤维素乙醇生产能力 | Zymomonas mobilis 8b在玉米秸秆水解液中的酚醛耐受性和乙醇发酵能力 | 生物技术 | NA | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 198天的适应性进化实验 |
137 | 2024-08-07 |
A Novel and Efficient Genome Editing Tool Assisted by CRISPR-Cas12a/Cpf1 for Pichia pastoris
2021-Nov-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00172
PMID:34644057
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cpf1系统的新型高效基因编辑工具,用于Pichia pastoris的基因组编辑 | 首次实现了使用CRISPR-Cpf1系统删除20kb的大DNA片段和一步整合多个基因 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具,用于Pichia pastoris的代谢工程和基因组进化 | Pichia pastoris | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cpf1 | NA | DNA | NA |
138 | 2024-08-07 |
Fine-Tuning Cas9 Activity with a Cognate Inhibitor AcrIIA4 to Improve Genome Editing in Streptomyces
2021-Nov-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00141
PMID:34734710
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研究论文 | 本文通过引入Cas9同源抑制剂AcrIIA4来微调Cas9活性,以提高链霉菌中的基因组编辑效率 | 引入Cas9同源抑制剂AcrIIA4,显著提高了基因组编辑的效率和特异性 | 未提及具体限制 | 提高链霉菌中基因组编辑的效率 | 链霉菌中的基因组编辑 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas9系统 | NA | 基因组数据 | 实验室和工业物种 |
139 | 2024-08-07 |
Type II anti-CRISPR proteins as a new tool for synthetic biology
2021-Aug, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2020.1827803
PMID:32991234
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research paper | 本文讨论了II型反CRISPR蛋白的发现、抑制机制及其在基因编辑和基因转录调控中的应用 | 介绍了II型反CRISPR蛋白作为合成生物学新工具的潜力 | NA | 探讨II型反CRISPR蛋白的发现、机制及应用 | II型反CRISPR蛋白及其在基因编辑和转录调控中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
140 | 2024-08-07 |
GTR 2.0: gRNA-tRNA Array and Cas9-NG Based Genome Disruption and Single-Nucleotide Conversion in Saccharomyces cerevisiae
2021-Jun-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00560
PMID:34015926
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研究论文 | 本文介绍了GTR 2.0工具,该工具结合gRNA-tRNA阵列和SpCas9-NG,用于高效基因组破坏和单核苷酸转换 | GTR 2.0扩展了目标范围,提高了多重化能力,增强了突变效率和特异性,并优化了PAMs的需求 | NA | 开发一种高效的基因组破坏和单核苷酸转换工具,以促进基因疗法、基础生物学研究和合成生物学的发展 | 酵母细胞中的基因破坏和单核苷酸转换 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | 覆盖所有16种可能的NGN PAMs和所有12种可能的单核苷酸转换 |