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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-08-10 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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综述 | 本文综述了合成生物学中DNA组装技术的发展现状,特别是大片段DNA组装的最新进展 | 重点介绍了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中组装大片段DNA的方法和挑战 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 促进定制基因组的构建,修改细胞功能甚至创造人工生命 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中的大片段DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA |
2 | 2025-08-08 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-05-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 提出了一种基于mRNA结构预测的新方法,用于筛选改进的骨形态发生蛋白2(BMP2)信号肽 | 结合mRNA结构预测和氨基酸序列分析,系统筛选信号肽序列,为信号肽工程提供新工具 | mRNA结构预测的准确性有待提高,且筛选的信号肽在C2C12细胞中表现不佳 | 开发一种基于计算工具的系统方法,改进BMP2信号肽以提高其分泌效率 | 骨形态发生蛋白2(BMP2)的信号肽 | 合成生物学 | 骨再生 | SignalP, DeepLoc, MXFold2 | NA | 核苷酸序列, 氨基酸序列 | 2,611个TGF-β超家族信号肽 |
3 | 2025-08-07 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-07-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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research paper | 该研究设计了一种自组装蛋白笼Mi3,能够独立招募两种不同的目标蛋白,用于合成生物学和医学应用 | 利用SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学方法,实现了单个蛋白笼上两种不同目标蛋白的特异性附着,减少了组装间的变异性 | NA | 开发一种多功能蛋白笼平台,用于生物和生物医学应用 | 自组装蛋白笼Mi3及其与目标蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学方法 | NA | NA | NA |
4 | 2025-08-07 |
Unpaired cysteine insertions favor transmembrane dimerization and induce ligand-independent constitutive cytokine receptor signaling
2024-07-26, Biological chemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1515/hsz-2023-0344
PMID:38695485
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research paper | 研究通过插入突变的PPCL序列到细胞因子受体跨膜区,实现配体非依赖性的受体二聚化和组成性激活 | 发现PPCL插入突变可普遍适用于多种细胞因子受体,实现配体非依赖性的组成性激活 | 研究仅在Ba/F3前B细胞系中进行验证,未在更广泛的细胞类型或体内模型中测试 | 探索细胞因子受体跨膜区突变导致配体非依赖性激活的机制及其应用潜力 | IL-7Rα及其跨膜区PPCL插入突变体,以及IL-6、IL-12和干扰素家族的细胞因子受体 | 分子生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞信号转导分析、STAT5和ERK磷酸化检测 | NA | 实验数据 | 使用Ba/F3前B细胞系进行实验 |
5 | 2025-08-06 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文提出了一种基于BERT的茶植物转录因子预测工具TeaTFactor | 利用BERT架构和预训练策略进行转录因子预测,开发了专门的预测工具 | 未明确提及具体局限性 | 开发茶植物转录因子的准确预测工具 | 茶植物转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练 | BERT | 蛋白质序列数据 | 未明确提及具体样本数量 |
6 | 2025-08-06 |
Single-Cell Synchro-Subtractive-Additive Nanoscale Surgery with Femtosecond Lasers
2024-07-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c00970
PMID:38989671
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research paper | 本文介绍了一种名为飞秒激光单细胞手术(FLSS)的原位“同步减材-增材”技术,用于解决现有单细胞操作手术方法的不足 | FLSS技术通过同步纳米级三维减材和增材制造,实现了对单细胞结构的精确移除和修改,同时通过两种光聚合作用快速固化特殊设计的水凝胶 | 术后存活率为70%,仍有提升空间 | 开发一种新型单细胞手术技术,用于单细胞结构的精确操作和修改 | 单细胞 | 生物医学工程 | NA | 飞秒激光手术 | NA | NA | NA |
7 | 2025-08-06 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-07-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA折纸技术的纳米装置,用于实现器官特异性基因表达控制 | 开发了坚韧的DNA折纸结构,可在低pH条件下封装入脂质纳米颗粒,实现器官特异性基因递送 | DNA纳米结构的脆弱性和靶向能力不足仍是挑战 | 开发器官特异性基因表达的纳米递送系统 | DNA折纸纳米装置和脂质纳米颗粒 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术、冷冻电子显微镜(Cryo-EM) | NA | 实验数据 | 小鼠器官 |
8 | 2025-08-05 |
Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing
2024-11-06, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022
PMID:39442006
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research paper | 该研究展示了一种基于微米/纳米颗粒化学通讯的传感系统设计 | 结合巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒实现化学通讯,并应用于试纸条传感系统 | 实际应用验证仍需进一步开展 | 开发基于微纳颗粒通讯的传感系统 | 巨型单层囊泡(GUVs)和门控介孔纳米颗粒 | 纳米技术 | NA | 化学通讯技术 | NA | 化学信号 | 以细菌毒素α-溶血素为目标分析物的实际样品 |
9 | 2025-08-03 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨系统生物学和单细胞测序技术在识别协调植物生长和发育候选基因中的应用 | 结合系统生物学和单细胞测序技术,探索合成生物学在测试假设和定义基因型-表型关系中的潜力 | 基因网络的复杂性和多效性增加了确定特定基因和通路功能的难度 | 通过工程化植物激素信号传导,协调植物生长、发育和环境响应 | 植物基因网络和通路 | 系统生物学 | NA | CRISPR, 单细胞测序 | NA | 基因序列数据 | NA |
10 | 2025-08-03 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 通过定向进化非血红素铁酶,实现了生物催化的对映选择性C(sp3)-H氟化反应 | 首次将植物来源的非血红素酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO)重新用于催化非自然的对映选择性C(sp)-H氟化反应,并通过定向进化显著提高了其活性和选择性 | 虽然实现了对映选择性C-H氟化,但该方法的底物范围和应用潜力仍需进一步验证 | 开发新的生物催化氟化反应,解决催化不对称C(sp)-H氟化这一合成化学难题 | 非血红素铁酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶(ACCO)及其突变体 | 生物催化 | NA | 定向进化、计算研究 | NA | NA | NA |
11 | 2025-07-29 |
LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling
2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01915-z
PMID:39117617
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研究论文 | 研究发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路,提高CD8+ T细胞的干细胞样特性及抗肿瘤能力 | 首次揭示LMO4通过结合JAK1增强STAT3信号传导,促进CD8+ T细胞的干细胞样特性和抗肿瘤功能 | 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强CD8+ T细胞干细胞样特性以提升T细胞疗法效果的分子机制 | CD8+ T细胞 | 免疫治疗 | 肿瘤 | CRISPR激活筛选、合成生物学方法、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | NA |
12 | 2025-07-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法 | 提出了一种基于封装和无细胞表达反应的方法,成功在合成细胞中重构膜蛋白 | 方法仅针对细菌谷氨酸受体进行了验证,未广泛测试其他膜蛋白 | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和蛋白视紫红质信号肽 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE) | NA | NA | NA |
13 | 2025-07-24 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 本研究通过调控藻胆素代谢,对蓝藻的藻胆蛋白和藻胆体进行功能修饰,实现了对光环境的适应性调整 | 构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型7942 PEB1菌株,实现了藻胆体结构的可逆颜色变化和稳定嵌合藻胆体复合物的形成 | 未对PEB结合藻胆体复合物的具体性质进行详细表征 | 研究藻胆体在不同光环境下的适应机制及其在生物工程中的应用 | 淡水蓝藻PCC 7942及其藻胆蛋白和藻胆体 | 合成生物学 | NA | PEB合成酶(PebA和PebB)的异源表达 | NA | NA | NA |
14 | 2025-07-24 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
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综述 | 本文综述了利用酵母隔离技术研究和工程化翻译后修饰酶(PTM-enzymes)的原理和方法 | 首次详细讨论了酵母内质网隔离技术,并综述了酵母表面展示和细胞质隔离等方法的创新应用 | 不同系统的测量和控制酶催化效率的能力存在局限性 | 探索PTM-enzymes的酶学和生物学机制,开发能够探测和调控它们的分子,并赋予它们改进和新功能 | 翻译后修饰酶(PTM-enzymes) | 合成生物学 | NA | 酵母隔离技术(包括酵母表面展示、细胞质隔离和内质网隔离) | NA | NA | NA |
15 | 2025-07-24 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 该研究利用多色光遗传学工具EL222和CcaSR在大肠杆菌中调控三种糖酵解途径的流量比例 | 首次展示了通过蓝光和绿/红光调控大肠杆菌中EMP、PP和ED三种糖酵解途径的流量比例 | 研究仅在大肠杆菌中进行,未在其他生物体中验证 | 开发光遗传学工具调控代谢流量分布 | 大肠杆菌的糖酵解途径(EMP、PP和ED) | 合成生物学 | NA | 光遗传学(EL222和CcaSR系统) | NA | NA | NA |
16 | 2025-07-23 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议,使其无法进行细胞分裂并抵抗环境压力 | 提出了一种将细菌转化为单寿命设备的新方法,结合了合成材料的工程简单性和自然细胞的功能性 | 协议的实施需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识 | 开发一种新型细胞底盘,用于生物技术、生物医学工程和活体治疗 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化 | NA | NA | NA |
17 | 2025-07-23 |
Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226
PMID:39328785
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研究论文 | 本文通过使用不同结构的细胞内水凝胶,展示了控制Cyborg Bacteria物理和生化特性的多样性 | 通过调节细胞内水凝胶成分,实现对Cyborg Bacteria功能和结构的调控,开创了细胞内材料工程的新领域 | 目前仅使用了有限种类的水凝胶成分进行实验,可能未涵盖所有潜在有用的材料组合 | 探索通过细胞内材料工程控制改造细菌功能的方法 | Cyborg Bacteria(改造细菌) | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶技术 | NA | 生化数据 | 未明确说明具体样本数量 |
18 | 2025-07-23 |
Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents
2024-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00181
PMID:38733599
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的生物工程平台,通过细菌发酵高产大规模生产生物小干扰RNA(BioRNA/siRNA)制剂 | 开发了一种新的tRNA融合pre-miRNA载体,可在宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA制剂,成功率高且产量大 | 未提及在更复杂生物系统中的验证或长期效果评估 | 推进合成生物学领域,为研究和药物开发提供功能siRNA制剂的生物工程新平台 | 生物小干扰RNA(BioRNA/siRNA)制剂 | 合成生物学 | NA | 细菌发酵、tRNA融合pre-miRNA载体技术 | NA | 分子生物学数据 | 0.25 L细菌培养物中生产3-10 mg BioRNA/siRNA |
19 | 2025-07-22 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
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研究论文 | 本文探讨了标准遗传密码的稳健性如何影响蛋白质的可进化性,并通过大规模并行序列到功能实验分析了多种重连遗传密码的效果 | 首次通过实验数据构建并分析了数百万种重连遗传密码下的适应性景观,揭示了稳健遗传密码如何通过平滑适应性景观增强蛋白质可进化性 | 研究结果在一定程度上依赖于氨基酸序列与蛋白质功能之间的具体关系,可能无法完全推广到所有蛋白质系统 | 探究遗传密码的稳健性对蛋白质可进化性的影响,并为蛋白质工程和合成生物学提供设计原则 | 遗传密码和蛋白质可进化性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能实验 | NA | mRNA序列数据 | 超过1600万条mRNA序列 |
20 | 2025-07-22 |
ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799
PMID:39301026
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综述 | 本文综述了CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤治疗中的革命性进展及其在更广泛肿瘤应用中面临的挑战 | 强调了CAR T细胞工程、新型抗原靶向策略、肿瘤微环境中递送和持久性的改进,以及异体CAR T细胞作为现成疗法的发展 | 未提及具体临床试验数据或定量分析结果 | 探讨如何克服CAR T细胞疗法在实体瘤中的局限性,提高其安全性、有效性和可及性 | CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学与工程 | 血液恶性肿瘤与实体瘤 | CAR T细胞工程、抗原靶向策略 | NA | NA | NA |