合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-06 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍OpenCell，一种低成本、开源、三合一的DNA提取设备，集珠磨均质器、微型离心机和涡旋混合器功能于一体 | 设计了一种模块化附件磁性连接中央无刷电机的紧凑设备，结合周转齿轮机构实现多功能操作，成本低于50美元，便携且性能可靠 | 未提及 | 为预算有限的实验室提供经济实惠的DNA提取替代方案，促进合成生物学研究的普及 | 菠菜DNA样本 | 合成生物学 | NA | DNA提取、PCR扩增 | NA | DNA样本 | 菠菜样本，平均产量2.3 μg | 3D打印、开源硬件 | 菠菜（Spinacia oleracea） | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 2 | 2026-08-06 |
OpenCell: A low-cost, open-source, 3-in-1 device for DNA extraction
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298857
PMID:38696375
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell，用于DNA提取 | 将珠磨匀浆器、微型离心机和涡旋混合器集成到一个紧凑单元中，利用模块化附件和行星齿轮机构，成本低于50美元 | 未提及具体局限性 | 为预算有限的实验室提供经济实惠的DNA提取设备 | 菠菜（Spinacia oleracea） | 合成生物学 | NA | DNA提取 | NA | NA | 菠菜样本，具体数量未提及 | 3D打印 | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 3 | 2026-08-05 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，探究高尔基体上的大小过滤器在上皮细胞顶端膜蛋白分选中的作用。 | 首次发现高尔基体存在大小过滤器，通过限制胞质域大小来调节顶端蛋白的分选，并揭示了Pals1蛋白的及时解离对Crb3正常分选的重要性。 | 尚未明确大小过滤器的具体分子机制，且实验结果可能受细胞类型和蛋白特异性的影响。 | 阐明高尔基体大小过滤器在顶端膜蛋白分选中的作用及其潜在生物学意义。 | 上皮细胞中的顶端蛋白（Crb3、Ace2、Muc1）及其与大胞质域相关的突变体。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 蛋白质成像数据 | 涉及多种上皮细胞系，具体数量未提及。 | NA | 上皮细胞系 | 使用链霉亲和素结合肽和生物素合成系统，控制蛋白质从内质网到高尔基体的同步释放。 | 医学 |
| 4 | 2026-08-04 |
Turn-on protein switches for controlling actin binding in cells
2024-07-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49934-2
PMID:38992021
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研究论文 | 本文介绍了一组名为可控肌动蛋白结合开关工具（CASTs）的蛋白质设计，可通过外部刺激调控其肌动蛋白结合行为，用于合成生物学和细胞形状控制。 | 开发了蛋白质开关工具，能够通过外部刺激调控肌动蛋白结合，具有开启动力学可调、正交性和多重性的特点，并可插入天然蛋白序列以局部控制F-肌动蛋白结合，或构建结构以控制细胞和组织形态。 | 未在摘要中明确提及具体局限性。 | 开发可控的肌动蛋白结合蛋白开关，以研究单个肌动蛋白结合蛋白的功能，并推动合成生物学在细胞骨架操控中的应用。 | 肌动蛋白结合蛋白开关工具（CASTs）及其在细胞中的功能。 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 受控肌动蛋白结合开关 | 合成生物学, 医学 |
| 5 | 2026-07-30 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
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研究论文 | 利用工程化细菌表达趋化因子CXCL13，增强膀胱癌免疫治疗效果 | 首次将工程化益生菌用于表达人类趋化因子CXCL13，通过诱发生发中心反应增强抗肿瘤体液免疫，并与PD-1阻断联合提高疗效 | NA | 探究工程化细菌表达CXCL13能否增强膀胱癌免疫治疗的效果 | 膀胱癌原位小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学，肿瘤免疫治疗 | 膀胱癌 | 合成生物学，细菌工程改造 | NA | NA | NA | 合成生物学工程细菌 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 表达CXCL13的基因电路 | 医药 |
| 6 | 2026-07-28 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-07-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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research paper | 利用光合定向内共生方法在酵母中引入碳同化能力 | 首次通过定向内共生方法将光合蓝细菌作为内共生体引入酵母细胞，构建可进行光合自养的酵母/蓝细菌嵌合体，减少对外源碳源的依赖 | NA | 将异养酵母转化为部分或完全自养生物，以促进可持续生物技术 | 酿酒酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向共培养和工程化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 光合内共生系统，包括蓝细菌碳同化和糖分泌通路 | 可持续生物技术, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 7 | 2025-10-05 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-11, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
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研究论文 | 本研究揭示了一种融合了自由基SAM结构域和αKG-HExxH结构域的新型蛋白质，具有独特的结构折叠并催化环芳烃形成和β-羟基化反应 | 发现了一种新型融合蛋白结构，将自由基SAM酶结构域与α-酮戊二酸非血红素铁酶结构域结合，并定义了新的αKG-HExxH酶家族 | NA | 研究含有融合结构域的新型金属蛋白的结构与功能特性 | 含有N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-组氨酸-1-羧酸盐结构域的融合蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、酶学 |
| 8 | 2026-07-24 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-09-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科植物在基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学方面的研究进展，并探讨了基因组学在药用植物研究中的应用前景 | 将新兴的“药用植物基因组学”学科引入罂粟科研究，系统整合多组学数据揭示药用植物遗传基础和次生代谢途径，并探讨CRISPR/Cas9等现代基因操作技术的应用潜力 | 仅简要概述了组学视角在制药和农业生物技术领域的潜在应用，未深入讨论具体技术实现细节或案例研究 | 综合回顾罂粟科植物在基因组、转录组、蛋白质组和代谢组学方面的研究进展，并探索药用植物组学研究在制药工业和农业生物技术中的应用机会 | 罂粟科植物，特别是罂粟和白屈菜等产胶植物 | 药用植物基因组学 | NA | 高通量测序, CRISPR/Cas9, RNA干扰 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 制药工业, 农业生物技术 |
| 9 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-12-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 利用合成生物学方法，工程化细菌自组装生物玻璃聚硅酸盐包壳，并展示增强的光聚焦能力 | 首次利用合成生物学将海绵硅酸酶表达于细菌表面，实现微生物自组装聚硅酸盐“生物玻璃”外壳，并将细菌转化为可产生强纳米射流的活体微透镜，显著提升光聚焦性能 | 未明确讨论聚硅酸盐包壳的长期稳定性和大规模生产成本，且仅基于单一酶（硅酸酶）表达，可能限制光学性能调控的灵活性 | 开发廉价、耐用、可调控环境响应性的生物光子组件 | 表达硅酸酶的大肠杆菌 | 合成生物学、光子学 | NA | 合成生物学、生物矿化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 硅酸酶表达回路 | 光子学、材料科学、环境传感 |
| 10 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble "bioglass" polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597164
PMID:38895271
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研究论文 | 利用工程化细菌自组装聚硅酸盐“生物玻璃”涂层，实现增强的光聚焦功能 | 首次利用合成生物学方法，使细菌表达海绵来源的硅酸盐酶（silicatein），自组装形成聚硅酸盐“生物玻璃”外壳，并发现该涂层能显著增强细菌的光聚焦能力，产生比未修饰细菌亮近一个数量级的纳米射流 | 未提及长期稳定性和在实际光学器件中的集成应用挑战 | 开发环境友好、可调控的光学材料，通过工程化细菌实现活体微透镜的构建 | 表达硅酸盐酶（silicatein）的工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 自组装聚硅酸盐“生物玻璃”涂层 | 光学、光子学 |
| 11 | 2026-07-22 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-12-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
|
研究论文 | 通过基因工程改造细菌，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应，增强肿瘤免疫治疗 | 工程化高色氨酸表达细菌菌株L-Trp CB，通过丁酸抑制IDO活性并释放色氨酸激活CD8+ T细胞，实现肿瘤靶向免疫治疗 | 研究仅在小鼠和兔模型中进行，需进一步验证临床安全性和有效性 | 开发合成生物学策略用于肿瘤免疫治疗 | 工程化细菌菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞的影响 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达回路 | 医学 |
| 12 | 2026-07-19 |
Biosynthetic pathway of prescription cucurbitacin IIa and high-level production of key triterpenoid intermediates in engineered yeast and tobacco
2024-06-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100835
PMID:38425040
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研究论文 | 本研究表征了雪胆中葫芦素IIa生物合成途径的关键基因，并在工程酵母和烟草中实现了关键三萜中间体的高产 | 首次揭示了处方药葫芦素IIa完整的生物合成途径，并通过模块化工程和P450表达优化，在酵母中实现了迄今最高产量的三萜中间体 | 未提及葫芦素IIa的最终完整合成，且烟草中产量相对较低（1.28 mg/g干重） | 解析葫芦素IIa的生物合成途径并实现关键三萜中间体的异源高产 | 雪胆属植物中的葫芦素IIa生物合成相关基因（HcSE1-2、HcOSC1-6、HcCYP87D20、HcCYP81Q59和HcAT1） | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢工程 | NA | 基因序列、代谢物产量数据 | 多个基因在酵母和烟草中的表达系统 | NA | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae), 本氏烟草 (Nicotiana benthamiana) | 甲羟戊酸途径的模块化工程和P450表达优化，以生产11-羰基-20β-羟基-葫芦醇 | 医药 |
| 13 | 2026-07-19 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-05-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
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研究论文 | 构建了一个植物合成生物数据库并提供在线工具，用于支撑植物合成生物学研究 | 首次整合了1677个催化生物元件和384个调控元件，提供本地BLAST、化学相似性、系统发育分析和可视强度等在线工具，并验证了数据库在烟草中量化调控紫杉二烯合酶2及表达黄病毒非结构蛋白1的应用 | 数据库的元件数量和物种覆盖有限，未涵盖所有已知植物元件 | 开发一个综合性平台，为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物元件（催化元件和调控元件）及烟草叶片 | 数字生物学 | NA | NA | NA | 生物数据 | 包含1677个催化元件、384个调控元件、309个物种和850种化学品的信息 | NA | 烟草 | 基因表达定量调控回路、转录信号放大装置 | 农业、医药 |
| 14 | 2026-07-19 |
Bringing CAM photosynthesis to the table: Paving the way for resilient and productive agricultural systems in a changing climate
2024-03-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100772
PMID:37990498
|
评论文章 | 探讨将景天酸代谢光合作用引入农作物，以应对气候变化和水资源短缺挑战的研究路线 | 提出通过多组学、合成生物学和计算生物学方法，系统揭示引入CAM路径的最小遗传工具包，为培育抗旱作物提供新思路 | 未提供实际实验验证或成功引入CAM路径的案例报告 | 开发能够适应气候变化和水资源短缺的韧性农作物系统 | 景天酸代谢植物（CAM植物）的基因组、转录组和代谢机制 | 机器学习和系统生物学 | NA | 基因组学、单细胞组学、高通量数据生成与挖掘、功能基因组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 农作物 | CAM路径工程化引入 | 农业 |
| 15 | 2026-07-14 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 通过结合培养优化和合成生物学，提高黄色粘球菌中次生代谢物（如myxoprincomide）的产量与检测能力 | 提出名为2PRIM-BOOST的新策略，结合底盘菌株工程与两步生长培养基优化，增强非核糖体肽合成酶（NRPS）/聚酮合酶（PKS）次生代谢物的生产，并促进医学相关生物活性筛选 | 该方法目前仅针对myxoprincomide进行验证，尚需应用于更多隐性代谢物以全面验证其有效性 | 提高粘细菌次生代谢物的实验室产量，以发现新药物前体 | 黄色粘球菌DZ2菌株及其产生的次生代谢物myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 合成生物学、启动子工程、培养基优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9或相关基因组工程工具（未明确指定） | 黄色粘球菌（Myxococcus xanthus） | 组成型强启动子插入至生物合成基因簇上游 | 医学 |
| 16 | 2026-07-13 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究Methanosarcina acetivorans在抑制能量保守性甲烷苯并蒽醌：CoM-CoB异二硫化物还原酶HdrED时的转录响应 | 揭示细胞通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性将甲烷生成与基因调控耦合的未知机制，并发现甲基营养型甲烷生成调节因子MsrC参与异二硫化物感应 | NA | 了解产甲烷古菌如何感知和响应末端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans | 机器学习 | NA | 转录组分析 | NA | 转录本丰度数据 | NA | NA | Methanosarcina acetivorans | NA | 可再生能源生产, 可持续化学品生产, 工业生物技术 |
| 17 | 2026-07-10 |
Neonatal bioethics, AI, and genomics
2024-11, Early human development
IF:2.2Q2
DOI:10.1016/j.earlhumdev.2024.106130
PMID:39405800
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评论文章 | 探讨人工智能与合成生物学对医学实践、人类技能以及人性本质的深远影响 | 提出AI和合成生物学将迫使人类重新审视人文技能的本质、医生工作的价值评估以及何为人类独特价值 | 仅限于推测性讨论，缺乏具体数据或实验支持，未深入技术实现细节 | 探讨AI、基因组学和合成生物学在医学中的伦理与哲学影响 | 医学AI技术、基因组学与合成生物学的发展及其对医学实践的潜在影响 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-07-10 |
The fusion of physics and biology in early mammalian embryogenesis
2024, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2024.05.001
PMID:38937030
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综述 | 本文综述了生物力学在哺乳动物早期胚胎发生中的作用，探讨了物理力与生物学过程的融合 | 系统整合了生物物理机制在囊胚形成、胚胎着床和早期原肠胚形成中的关键功能，并强调了合成生物学与先进生物材料相结合的潜力 | 未详细讨论具体实验数据或量化结果，可能缺乏对特定机制的深入验证 | 探索哺乳动物早期胚胎发生中生物物理机制的作用，并展望利用这些见解推动再生医学发展 | 哺乳动物胚胎（如小鼠和人类胚胎），以及体外模型（如blastoids、gastruloids等类胚胎结构） | NA | NA | CRISPR介导的基因组扰动、活体成像 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 小鼠、人类 | NA | 医学、再生医学 |
| 19 | 2026-07-05 |
YF17D-based vaccines - standing on the shoulders of a giant
2024-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250133
PMID:38571392
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综述 | 综述基于YF17D的黄热病疫苗平台的研究进展及其在预防和治疗多种疾病中的应用 | 系统总结了YF17D作为疫苗平台的独特免疫原性机制，并展示了其在开发新型重组活疫苗（包括已获批的日本脑炎和登革热疫苗）以及针对新兴病毒感染、寄生虫病、慢性感染和癌症的临床前候选疫苗中的广泛应用 | 历史安全担忧和制造挑战仍需克服，且YF17D疫苗的广泛使用仍需进一步研究 | 综述YF17D作为疫苗平台的最新见解，并探讨其在满足未满足的医疗需求和应对大流行准备中的作用 | 基于YF17D的疫苗及其在预防和治疗疾病中的应用 | NA | 黄热病、日本脑炎、登革热、拉沙热、寨卡病毒病、COVID-19、疟疾、HIV、慢性肝炎、癌症 | 分子病毒学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 20 | 2026-07-03 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-12-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
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综述 | 系统回顾21世纪中国在植物病毒抗病毒剂方面的化学与生物学研究进展 | 整合化学、化学生物学、合成生物学等多学科方法，深入分析植物病毒靶标生物学特征及药物-靶标互作机制 | 未明确指出具体研究局限，可能缺乏对现有药剂抗性问题的讨论 | 综述植物病毒抗病毒剂研发的生物学基础、靶标特性及未来药物开发方向 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 植物病毒学 | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |