本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-14 |
Cyanobacteriochromes: A Rainbow of Photoreceptors
2024-11, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
|
综述 | 本文综述了蓝藻色素(CBCRs)的光谱调谐、光转换和光生物学特性,以及它们在合成生物学中的应用进展 | 探讨了CBCRs从近紫外到近红外的广泛光循环多样性,并分析了其在合成生物学中的新兴应用 | NA | 研究蓝藻色素的光感受机制及其在光生物学和合成生物学中的作用 | 蓝藻色素(CBCRs)蛋白及其相关的光感受和信号转导过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | 光感受器系统,包括光转换和信号输出域(如组氨酸激酶双域)的调控 | 合成生物学 |
| 2 | 2025-12-05 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
|
研究论文 | 本文通过数学建模研究了诱导型双稳态系统中基因调控网络对细胞命运决定的动态过程的影响 | 揭示了基因调控步骤的延迟和外部诱导时间尺度对命运决定动态轨迹的偏差作用,并提出了稳态参数决定命运决定景观而动态过程形成新的瞬态分布的观点 | NA | 研究诱导型双稳态系统中细胞命运决定的动态过程 | 基因调控网络和细胞命运决定过程 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 常微分方程 | NA | NA | NA | NA | 诱导型双稳态系统 | 合成生物学 |
| 3 | 2025-12-03 |
Perspectives on Synthetic Protein Circuits in Mammalian Cells
2024-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100555
PMID:39372446
|
综述 | 本文综述了哺乳动物细胞中合成蛋白质电路的设计原理、工具及其在生物医学领域的应用前景 | 系统梳理了基于蛋白质翻译后修饰(如蛋白水解和磷酸化)的合成生物学工具包,并提出了从工具开发到临床前应用的转化框架 | NA | 探讨合成蛋白质电路在哺乳动物细胞工程化中的应用潜力与设计策略 | 哺乳动物细胞中的合成蛋白质电路 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质工程、翻译后修饰调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | 基于蛋白水解、磷酸化或可编程结合的合成蛋白质电路,用于重编程细胞行为 | 医学 |
| 4 | 2025-11-24 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
|
研究论文 | 本研究揭示了SKIK肽标签能有效缓解由连续脯氨酸残基组成的核糖体停滞肽引起的翻译停滞现象 | 首次发现SKIK肽标签与翻译延伸因子EF-P在缓解连续脯氨酸富集蛋白的核糖体停滞中具有协同促进作用 | 研究主要关注特定类型的停滞肽(WPPP和SecM AP),对其他类型停滞肽的适用性尚需验证 | 探究SKIK肽标签对核糖体翻译停滞的缓解机制及其在蛋白质生产优化中的应用 | 含有连续脯氨酸残基的核糖体停滞肽(WPPP和SecM AP)及其对翻译过程的影响 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞蛋白质合成系统、体外翻译反应、动力学分析 | NA | 蛋白质产量数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-11-17 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
|
研究论文 | 本研究通过细胞内水凝胶化技术将非复制但代谢活跃的赛博格细胞方法扩展到病原细菌 | 将细胞内水凝胶化技术从实验室菌株推广到病原细菌,创建了具有病原特性的赛博格病原体 | 仅研究了特定病原菌株,未涉及其他类型病原体 | 开发具有病原特性的非复制但代谢活跃的赛博格病原体用于生物医学应用 | 不同菌株的病原细菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、共聚焦显微镜、实时PCR | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 多种病原细菌菌株 | 细胞内水凝胶化 | 病原细菌 | 细胞内聚合物凝胶网络 | 医学 |
| 6 | 2025-11-08 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
|
研究论文 | 本研究探索了从头设计的微型结合蛋白在合成生物学传感工具中的广泛应用潜力 | 首次系统验证微型结合蛋白可适配多种细胞工程工具,相比传统抗体具有独特表位靶向能力和更快生产周期 | 研究主要聚焦于SARS-CoV-2 Spike蛋白和EGFR靶点,尚未验证对其他抗原的普适性 | 拓展合成生物学中抗原传感工具的种类和性能 | 微型结合蛋白及其在合成受体中的应用 | 合成生物学 | COVID-19, 癌症 | 蛋白质从头设计, 细胞工程 | NA | 实验数据 | NA | synNotch, SNIPR, CAR | 哺乳动物细胞, T细胞 | 合成受体, 抗原传感器, 嵌合抗原受体 | 医学, 治疗性细胞工程 |
| 7 | 2025-10-30 |
Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176
PMID:39079313
|
综述 | 回顾酵母合成生物学在推动G蛋白偶联受体(GPCR)研究和药物开发方面的最新进展 | 利用酵母合成生物学技术为GPCR研究提供新的概念突破和技术创新 | NA | 解决GPCR信号传导、药理学和结构生物学研究中的挑战 | 人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学, 生物技术 |
| 8 | 2025-10-05 |
Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01677-3
PMID:38977789
|
研究论文 | 开发基于邻近触发蛋白质反式剪接技术的时控蛋白质合成方法,用于解析细胞信号传导的动态过程 | 利用邻近触发蛋白质反式剪接技术实现目标蛋白质的时控合成,可区分起始材料和产物的细胞定位及活性状态 | NA | 开发合成生物学工具以操纵细胞状态并解析细胞信号传导动态过程 | 多种蛋白质包括BCR-ABL和DNAJ-PKAc激酶融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 邻近触发蛋白质反式剪接技术 | NA | 蛋白质活性数据 | NA | 蛋白质反式剪接 | 哺乳动物细胞 | 蛋白质合成控制系统 | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01628-y
PMID:38783133
|
研究论文 | 本研究通过胞外电子转移机制实现了活细胞代谢与合成材料性能的可编程调控 | 首次利用微生物胞外电子转移作为桥梁,通过基因电路设计控制合成聚合物网络的力学性能 | NA | 开发可编程的工程活材料,实现生物系统与合成材料的智能整合 | 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)和合成聚合物水凝胶 | 合成生物学 | NA | 胞外电子转移(EET)、荧光参数化、基因电路设计 | 布尔逻辑门 | NA | NA | 合成生物学 | Shewanella oneidensis | 转录布尔逻辑门、基因表达调控电路 | 材料科学 |
| 10 | 2025-10-05 |
De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos
2024-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70028
PMID:39422193
|
研究论文 | 介绍无错误长寡核苷酸从头合成的完整实验方案 | 结合CBP纯化方法与克隆测序筛选,首次实现长达401-mer无错误寡核苷酸的合成 | NA | 开发高精度长链寡核苷酸合成技术 | 寡核苷酸合成与纯化 | 合成生物学 | NA | 固相合成、CBP方法、克隆、Sanger测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程,合成生物学 |
| 11 | 2025-10-05 |
ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799
PMID:39301026
|
综述 | 本文全面探讨如何通过合成生物学、工程学和经济视角解决CAR-T细胞疗法在实体瘤疗效、安全性和可及性方面的挑战 | 整合合成生物学与工程学方法开发同种异体CAR-T细胞,提出新型抗原靶向策略及联合治疗方案 | NA | 突破CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限并提升其安全性与可及性 | CAR-T细胞疗法及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 血液恶性肿瘤与实体瘤 | CAR-T细胞工程 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Dynamic Gene Expression Mitigates Mutational Escape in Lysis-Driven Bacteria Cancer Therapy
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0049
PMID:39301524
|
研究论文 | 本研究探讨了通过动态基因表达策略优化工程化细菌在癌症治疗中的疗效,防止突变逃逸 | 首次发现PFO表达会导致细菌裂解并引发突变逃逸,并提出动态诱导策略来维持治疗性细菌种群 | NA | 优化工程化细菌在肿瘤治疗中的持久定植和持续有效载荷释放 | 表达Perfringolysin O(PFO)细菌毒素的非致病性工程细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 分子动力学,数学模型,微流体系统,测序 | 种群动态数学模型 | 实验数据,测序数据,模拟数据 | NA | 合成生物学工具 | 工程细菌 | 动态基因表达系统,PFO毒素表达回路 | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Functionalized Protein Binders in Developmental Biology
2024-10, Annual review of cell and developmental biology
IF:11.4Q1
|
综述 | 本文综述了功能化蛋白结合剂在发育生物学中用于直接解析蛋白质功能的应用与前景 | 系统总结了通过融合功能域(降解、重定位、可视化、翻译后修饰)的蛋白结合剂实现前所未有的发育蛋白质组研究 | NA | 探讨功能化蛋白结合剂在发育生物学研究中的应用价值与发展方向 | 纳米抗体和合成支架衍生的蛋白结合剂 | 发育生物学 | NA | 蛋白质计算设计、支架工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 14 | 2025-10-05 |
CRISPR Tools for Engineering Prokaryotic Systems: Recent Advances and New Applications
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 回顾CRISPR-Cas系统在原核生物工程中的最新进展与应用 | 从分子工程角度系统阐述CRISPR组件设计策略及在原核系统中的新型应用方向 | NA | 总结CRISPR技术在原核生物遗传工程中的应用现状与未来发展方向 | CRISPR-Cas系统组件及其在原核生物工程中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核生物 | 基于调控gRNA表达的遗传电路 | 生物传感, 生物生产, 生物治疗 |
| 15 | 2025-10-05 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 本文探讨如何通过可扩展设计加速多样化细胞疗法的开发 | 整合合成生物学工具与先进基因组编写技术,提出加速细胞疗法转化的新愿景 | NA | 促进基于细胞的疗法转化应用 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、基因组编写技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 哺乳动物细胞 | 转基因货物设计、生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 16 | 2025-10-05 |
Fitness Landscapes and Evolution of Catalytic RNA
2024-07, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
|
综述 | 探讨RNA催化剂的适应度景观及其在进化与合成生物学中的意义 | 结合体外筛选与高通量测序技术绘制RNA完整和局部适应度景观,并提出利用机器学习进行序列空间插值和外推的新方向 | 序列空间的庞大规模限制了纯实验研究方法的有效性 | 解析基因型与表型关系(适应度景观)以推动合成生物学发展 | 催化RNA及其序列空间 | 合成生物学 | NA | 体外筛选、高通量测序 | 机器学习 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 17 | 2025-10-05 |
CRISPR/Cas Technology: The Unique Synthetic Biology Genome-Editing Tool Shifting the Paradigm in Viral Diagnostics, Defense, and Therapeutics
2024-07, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
|
综述 | 全面介绍CRISPR/Cas系统的基本原理及其在病毒检测、防御和治疗中的应用 | 系统评估了基于CRISPR/Cas的病毒诊断、疫苗开发、B细胞工程等创新技术的优势与局限 | 讨论了CRISPR/Cas系统使用中面临的挑战和生物伦理问题 | 推进生物技术方法以应对已知和未知生物威胁 | CRISPR/Cas系统及其在病毒领域的应用技术 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2025-10-05 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
|
综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术在合成生物学中实现非经典氨基酸定点掺入的方法进展与主要应用 | 系统整合了非经典氨基酸定点掺入技术的双向促进作用:既为合成生物学提供超越自然限制的工具,又受益于合成生物学发展的创新策略 | NA | 探讨遗传密码扩展技术在合成生物学中的应用与发展前景 | 非经典氨基酸的细胞定点掺入技术 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA | NA | 半自主和自主生物体 | 调控元件设计、肽类天然产物生物合成途径操纵 | 工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
Vibrational imaging of metabolites for improved microbial cell strains
2024-06, Journal of biomedical optics
IF:3.0Q2
DOI:10.1117/1.JBO.29.S2.S22711
PMID:38952688
|
综述 | 本文介绍了无标记振动光谱显微镜在微生物代谢物成像中的应用及其对生物制造的潜在影响 | 提出将无标记振动光谱显微镜作为传统分析筛选工具的替代方案,用于非破坏性高通量代谢物筛选 | NA | 改进工业微生物细胞株开发中的代谢物筛选技术 | 微生物细胞和代谢物 | 合成生物学 | NA | 拉曼散射成像、红外吸收成像、振动光谱显微镜 | NA | 化学成像数据 | NA | NA | 微生物系统 | 代谢通路 | 农业,能源,食品,材料,制药 |
| 20 | 2025-10-05 |
Construction of Whole Cell Bacterial Biosensors as an Alternative Environmental Monitoring Technology to Detect Naphthenic Acids in Oil Sands Process-Affected Water
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00260
PMID:39312753
|
研究论文 | 本研究构建了用于检测油砂工艺影响水中环烷酸的全细胞细菌生物传感器 | 首次利用合成生物学方法构建针对环烷酸检测的生物传感器,并采用尾矿池分离的细菌作为宿主 | 检测限在1.5-15 mg/L之间,灵敏度有待进一步提高 | 开发替代性环境监测技术用于油砂采矿废水中的环烷酸检测 | 环烷酸及其混合物、油砂工艺影响水样品 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、转录报告系统 | NA | 基因表达数据、环境水样 | 多种环烷酸混合物和OSPW样品 | 质粒克隆、转录报告系统 | 尾矿池分离的细菌物种 | 基于环烷酸降解操纵子、抗性基因和假设基因启动子的生物传感器 | 环境监测 |