合成生物学相关文章
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当前共找到 1153 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-03-23 |
Synthetic-biology approach for plant lignocellulose engineering
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了植物木质纤维素工程中的合成生物学方法，旨在减少木质纤维素的顽固性并提高其工业利用价值 | 提出了八种重新设计木质素和结构聚糖途径的策略，以减少木质纤维素的顽固性，同时缓解与产量损失相关的生长惩罚 | 植物基系统在工业应用中的采用仍受到已建立的哺乳动物和其他细胞培养体系的阻碍 | 提高植物基系统在工业应用中的竞争力，促进可持续植物衍生产品的开发 | 植物木质纤维素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 22 | 2025-03-23 |
Distribution, biosynthesis, and synthetic biology of phenylethanoid glycosides in the order Lamiales
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了苯乙醇苷类化合物（PhGs）在植物中的积累与分布、生物合成途径及其生物生产的最新研究 | 本文综合了苯乙醇苷类化合物的最新研究进展，特别是在生物合成途径和生物生产方面的创新点 | 本文未涉及苯乙醇苷类化合物的具体药物开发应用 | 研究苯乙醇苷类化合物的积累、分布、生物合成途径及其生物生产 | 苯乙醇苷类化合物 | 植物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2025-03-23 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 本文通过结合理性蛋白质设计、多位点定向诱变和定向进化技术，成功改变了雌激素受体α的配体偏好，使其对乳腺癌治疗药物他莫昔芬产生响应 | 开发了一种名为TERRA的雌激素受体变体，该变体失去了对雌激素的响应性，转而被他莫昔芬激活，这一特性在哺乳动物细胞和小鼠中得以保持 | 未明确提及具体局限性 | 改变雌激素受体α的配体偏好，以扩展哺乳动物合成生物学工具箱 | 雌激素受体α | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多位点定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-03-23 |
Between Centralization and Fragmentation: The Past, Present, and Future of Phage Collections
2024-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1089/phage.2023.0043
PMID:40114810
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综述 | 本文回顾了噬菌体收集的历史和现状，探讨了集中化治疗相关噬菌体收集的挑战和潜力 | 提出了创建可持续、互联和公平的噬菌体银行基础设施的必要性，并考虑了合成生物学和人工智能可能带来的范式转变 | 未提供具体的解决方案或实施细节，仅进行了概述和反思 | 探讨噬菌体收集的集中化和标准化问题，以应对当前知识碎片化和缺乏协调的挑战 | 噬菌体收集和噬菌体银行基础设施 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-03-21 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
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研究论文 | 本文通过结构基础的工程改造，将一种倍半萜环化酶转化为α-红没药醇合酶，展示了其作为合成生物学应用平台的潜力 | 通过突变活性位点轮廓，重新设计EIZS以生成倍半萜醇产物，而非倍半萜烃产物，扩展了EIZS作为设计环化酶平台的潜力 | 突变后的酶在生成α-红没药醇时的保真度仅为65%至74%，表明仍有改进空间 | 研究目的是通过结构基础的工程改造，将EIZS转化为α-红没药醇合酶，以扩展其在合成生物学中的应用 | 研究对象是EIZS酶及其突变体，特别是F95S-F198S双突变体 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化表征 | NA | 晶体结构数据、生化数据 | NA |
| 27 | 2025-03-20 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
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研究论文 | 本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐（HExxH）结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能 | 首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合，并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能 | NA | 研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能 | 包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶 | 酶学 | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 28 | 2025-03-20 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的Tn7转座子载体，用于控制染色体基因的表达 | 通过添加诱导型和组成型启动子，增强了mini-Tn插入载体的功能，实现了染色体上基因的差异转录控制 | 研究主要针对革兰氏阴性菌，未涉及其他类型细菌或真核生物 | 开发一种更灵活的染色体基因表达控制系统，以替代质粒在基因互补中的应用 | K-12菌株MG1655的染色体 | 合成生物学 | NA | 染色体整合技术 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-03-19 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感信号放大电路，通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入 | 开发了PSR电路，扩展了无细胞生物传感的能力，实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感 | NA | 扩展无细胞电路的能力，通过PSR实现信号放大，用于生物技术中的多种应用 | RNA目标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路 | 双平衡模型 | 核酸 | NA |
| 30 | 2025-03-18 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 本研究构建了一个微生物平台，用于高效生产具有强杀菌活性的植物源倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建了用于可持续生产这种抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂 | 关键酶TPS18的催化活性限制了5-epi-jinkoheremol的进一步产量 | 开发一种可持续的生物杀菌剂生产方法 | 5-epi-jinkoheremol | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-03-15 |
Towards the first synthetic eukaryotic cell
2024-Dec, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.11.001
PMID:40078978
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综述 | 本文全面回顾了合成生物学和合成基因组学领域在实现首个合成真核细胞方面的进展 | 强调了Sc2.0项目在提供关键工具和工程细胞平台方面的贡献，这些工具和平台显著加速了研究和工业进展 | 讨论了合成真核生命带来的伦理和法律问题，但未提出具体解决方案 | 探讨合成真核细胞的设计原则和构建策略，以及其在医学、工业、农业和研究中的潜在应用 | 真核细胞 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-03-15 |
Cyberbiosecurity: Advancements in DNA-based information security
2024-Aug, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.06.002
PMID:40078663
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在信息安全和生物安全领域的新应用，特别是DNA作为信息存储和读取媒介的潜力及其带来的网络生物安全威胁 | 提出了DNA作为信息存储媒介的新应用，并探讨了由此引发的网络生物安全问题 | 主要集中于理论探讨，缺乏具体的实验数据或案例研究 | 为网络生物安全研究提供理论支持，并提高对信息安全、生物安全和国家安全风险的认识 | DNA作为信息存储和读取媒介的应用及其安全威胁 | 合成生物学 | NA | DNA合成与测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 33 | 2025-03-11 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 本文总结了基于智能荧光团的纳米结构在特定细胞器中的制备，用于高效的生物成像和癌症治疗应用 | 提出了在特定细胞器中通过刺激响应形成超分子纳米结构的方法，用于生物成像和治疗 | 讨论了细胞内自组装在治疗应用中的挑战和前景 | 研究智能超分子材料在生物成像和治疗中的应用 | 细胞器中的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 荧光成像 | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-03-10 |
Prospects for synthetic biology in 21st Century agriculture
2024-Dec-30, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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研究论文 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景，强调了其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 通过整合先进的遗传工具、计算建模和系统生物学，研究人员能够精确修改植物基因组，以增强产量、抗逆性和养分利用效率等特性 | 尽管植物合成生物学在农业中具有巨大潜力，但仍面临监管批准和公众接受度方面的挑战 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用，以应对全球粮食安全挑战并实现环境可持续性 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 35 | 2025-03-09 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本文研究了水通道蛋白Aqp1在多种细胞类型中作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 研究表明Aqp1过表达不会对细胞活力或形态产生不利影响，且不会引起ER应激，这为Aqp1作为遗传报告基因的广泛应用提供了安全依据 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系，未涉及体内实验 | 评估Aqp1作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞生理数据 | 多种小鼠和人类细胞系 |
| 36 | 2025-03-08 |
DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae409
PMID:39162313
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepEnzyme的深度学习模型，该模型结合了Transformer和图卷积网络（GCN），通过利用蛋白质的序列和3D结构信息来提高酶周转数（kcat）的预测准确性 | DeepEnzyme模型首次结合了Transformer和GCN，利用蛋白质的序列和3D结构信息进行kcat预测，显著提高了预测的准确性和鲁棒性，特别是在处理与训练数据集序列相似性低的酶时 | 尽管DeepEnzyme在kcat预测上取得了显著进展，但其在处理与训练数据集序列相似性极低的酶时，可能仍存在一定的预测误差 | 提高酶周转数（kcat）的预测准确性，以支持蛋白质工程和合成生物学等领域的研究 | 酶的周转数（kcat） | 机器学习 | NA | 深度学习 | Transformer, GCN | 蛋白质序列和3D结构数据 | NA |
| 37 | 2025-03-08 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
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研究论文 | 本文研究了Leotiomycetous丝状真菌中细胞孢菌素的生物合成机制 | 揭示了细胞孢菌素结构多样性和生物活性生成的机制，并发现了新的聚酮类生物合成酶 | 研究主要集中在特定真菌中的基因簇，可能不适用于其他真菌 | 探索细胞孢菌素的生物合成途径及其在药物发现中的应用 | Leotiomycetous丝状真菌 | 生物合成 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、体外酶反应 | NA | 基因数据、酶反应数据 | 特定Leotiomycetous丝状真菌 |
| 38 | 2025-03-06 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本文报道了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构，并通过结构比较和系统定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 通过晶体结构和定点突变揭示了BcmA酶活性和底物选择性的关键残基，特别是非保守残基D161和K165在P2口袋中的作用 | 未提及具体的研究局限性 | 研究BcmA酶的结构基础及其对酶活性和底物选择性的影响 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA | 结构生物学 | NA | 晶体结构分析、定点突变 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 39 | 2025-03-05 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT架构的预测工具TeaTFactor，用于预测茶树转录因子 | 利用BERT架构进行预训练，并针对茶树转录因子数据进行微调，提出了一种新的识别算法 | 未提及具体局限性 | 开发一种高效预测茶树转录因子的计算工具 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练 | BERT | 蛋白质序列数据 | 未提及具体样本数量 |
| 40 | 2025-03-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
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研究论文 | 本研究探讨了将生物素的四氢噻吩环替换为氧杂环或（甲基）吡咯烷基团对其分子相互作用的影响，旨在寻找适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 通过分子动力学模拟和荧光滴定实验，发现氧杂生物素与链霉亲和素的结合行为与生物素相似，而氨基类似物则表现出较低的结合能力，特别是氮杂生物素在酸性条件下表现出增强的结合能力 | 研究仅关注了少数几种硫替代物，未全面评估所有可能的替代物及其在不同条件下的结合行为 | 研究硫替代对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响，以寻找适用于合成生物学的替代亲和配体 | 生物素及其硫替代物与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟（MD）、荧光滴定实验 | NA | 分子相互作用数据 | NA |