合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-31 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-02-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
|
研究论文 | 全面表征了一种快速生长的酵母新菌株XP，并为其遗传操作开发了工具箱 | 发现了一种生长速度快于常用研究和工业菌株的酵母新分离株XP，并在基因组、转录组和代谢组层面解析了其快速生长的机制，开发了包括基因插入、删除和倍性转换在内的遗传操作工具箱 | 未明确提及菌株XP在长期工业应用中的稳定性及潜在风险 | 开发快速生长的酵母底盘以促进合成生物学和生物技术应用 | 酵母新分离株XP及其与常用菌株的比较 | 机器学习 | NA | 基因组测序, 转录组测序, 代谢组分析, 基因编辑 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae） | L-乳酸生产途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 22 | 2026-05-31 |
Genomic imprints of unparalleled growth
2024-02, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19444
PMID:38072860
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研究论文 | 比较了快速生长的沙漠微藻Chlorella ohadii与其他绿藻的基因组，揭示其无与伦比生长速率和抗逆性的基因组印记 | 首次对最快生长藻类C. ohadii进行基因组比较分析，发现其核糖体基因数量多、内含子丰富、密码子偏好性强及特有基因与代谢灵活性和抗光损伤相关 | 未明确讨论基因组特征与生长速率的直接因果关系，且研究仅限于两种绿藻比较 | 探究C. ohadii快速生长和抗逆性的基因组基础及其进化意义 | C. ohadii及其近缘种C. sorokiniana UTEX 1663的基因组 | 基因组学 | NA | 基因组比较分析 | NA | 基因组序列数据 | 两种绿藻基因组 | NA | Chlorella ohadii, Chlorella sorokiniana | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 23 | 2026-05-30 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-10-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
|
研究论文 | 开发了一种智能向导RNA，通过双toehold开关在触发RNA存在时调节荧光素酶表达 | 设计了cis抑制的gRNA合成回路，包含双toehold开关和抑制型CrRNA序列，实现高效特异识别触发RNA并释放CrRNA调控靶基因 | NA | 通过合成生物学平台实现RNA响应性CRISPR/Cas9功能调控 | 智能向导RNA双toehold开关回路 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 双toehold开关回路，cis抑制型gRNA，逻辑门 | 医学 |
| 24 | 2026-05-30 |
Thermo-responsive aqueous two-phase system for two-level compartmentalization
2024-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51043-z
PMID:39117632
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研究论文 | 提出一种基于热响应性双水相系统的两级区室化方法 | 首次实现基于热响应性双水相系统的两级区室化，模拟真核细胞的层级区室化结构，并通过温度触发产生类似于胶体体的第二级区室 | 未明确提及 | 开发一种模拟活细胞层级区室化的合成系统 | 热响应性双水相系统（包括PNIPAM和DEX） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物化学工程 |
| 25 | 2026-05-30 |
Glutamine-derived peptides: Current progress and future directions
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13386
PMID:38847753
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综述 | 回顾谷氨酰胺衍生肽在临床、运动和肠内营养中的应用，比较其与单体的功能性效，并探讨基于人工智能的肽组学和合成生物学在新颖设计和规模化生产中的潜在应用 | 综合评估谷氨酰胺衍生肽的结构相关生物活性，并创新性地提出结合人工智能肽组学和合成生物学进行从头设计和规模化生产 | 对谷氨酰胺衍生肽结构-功能关系的理解仍处于探索阶段 | 为谷氨酰胺衍生肽在食品科学中的发现、功能验证和生物制造提供参考 | 谷氨酰胺衍生肽 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品科学, 功能性食品 |
| 26 | 2026-05-30 |
A comprehensive review on novel synthetic foods: Potential risk factors, detection strategies, and processing technologies
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13371
PMID:38853463
|
综述 | 本文全面综述了新型合成食品的潜在风险因素、检测策略及加工技术 | 首次系统性地整合了四种新型合成食品（植物基食品、培养肉、发酵食品和微藻基食品）在风险因素、检测与加工技术方面的最新进展 | 未来需继续创新和发展新的检测与加工技术，以有效评估这些新型合成食品的安全性 | 为食品行业中新型合成食品的开发和管理提供见解 | 植物基食品、培养肉、发酵食品和微藻基食品 | NA | NA | 酶联免疫吸附测定、生物传感器、色谱法、聚合酶链式反应、等温扩增、微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 27 | 2026-05-30 |
The pAblo·pCasso self-curing vector toolset for unconstrained cytidine and adenine base-editing in Gram-negative bacteria
2024-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1236
PMID:38180826
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研究论文 | 开发了一套用于革兰氏阴性菌中无限制胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑的自消除载体工具集 | 开发了无需同源重组的自消除载体系统，可在单次培养步骤中去除碱基编辑平台，获得无质粒修饰菌株 | NA | 为革兰氏阴性菌的基因组工程提供精确的单核苷酸修饰工具 | 革兰氏阴性菌，如恶臭假单胞菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9碱基编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌及其他革兰氏阴性菌 | 自消除碱基编辑平台 | 工业生物技术 |
| 28 | 2026-05-30 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 评估共转录折叠模拟质量，开发用户友好的BarMap-QA流程以简化RNA共转录折叠动力学分析 | 提出BarMap-QA流程，克服原始BarMap软件在特定共转录折叠场景下的使用困难，通过迭代工作流和多种质量指标监测实现可靠模拟 | 模拟仍基于二级结构粗粒度表示，无法捕捉RNA三级结构细节；案例仅验证合成核糖开关，普适性需进一步测试 | 提升共转录RNA折叠模拟的实用性和可靠性，验证合成生物电路设计 | 共转录折叠过程中的RNA二级结构动态变化 | 计算生物学, 合成生物学 | NA | 马尔可夫过程模拟, BarMap方法, Docker部署 | 马尔可夫模型 | RNA二级结构数据 | 一个合成转录调控型核糖开关作为案例 | BarMap-QA流程 | NA | 合成转录调控核糖开关 | 合成生物学, 计算模拟 |
| 29 | 2026-05-29 |
Enhancing circuit stability under growth feedback with supplementary repressive regulation
2024-02-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1233
PMID:38164993
|
研究论文 | 提出在生长反馈下通过添加抑制性调控节点增强双稳态电路稳定性的策略 | 首次提出通过引入一个抑制性调控边缘来使双稳态电路对生长反馈去敏感化的简单控制策略 | 仅进行了仿真和体外实验，缺乏在复杂生物系统中的体内验证 | 研究如何通过额外抑制性调控增强基因电路在生长反馈下的鲁棒性 | 受生长反馈影响的双稳态基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | 双稳态电路模型 | NA | NA | NA | NA | 双稳态电路（含抑制性调控边缘） | 合成生物学 |
| 30 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
|
研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统，用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统，无需外源供应荧光素酶底物，并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明，但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统，以优化合成基因回路 | 本氏烟草（N. benthamiana）和拟南芥（推测） | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路，包括植物激素传感器和光遗传传感器等，具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草（N. benthamiana） | 自发光报告回路（NeoLuc/eGFP系统），包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 31 | 2026-05-27 |
The effect of pseudoknot base pairing on cotranscriptional structural switching of the fluoride riboswitch
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae231
PMID:38567721
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研究论文 | 本研究通过实验和模拟揭示假结碱基配对对氟化物核糖开关共转录结构转换的影响 | 首次系统阐明单一摆动碱基对在氟化物核糖开关功能中的关键作用，并利用全原子分子动力学模拟可视化结构转换过程 | 未具体说明其他离子或环境条件对核糖开关功能的影响，且仅限于两种温度变体 | 探究RNA序列变化如何影响共转录折叠过程中的动态构象变化 | 中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体 | 机器学习 | NA | 体外转录, 细胞基因表达分析, 全原子分子动力学模拟 | NA | DNA序列, RNA结构数据, 实验数据 | 多种中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体, 具体数量未提供 | NA | 大肠杆菌, 水生栖热菌 | 氟化物核糖开关（含假结适体域和下游终止子表达平台） | 医学, 工业生物技术 |
| 32 | 2026-05-27 |
A pilot oral history of plant synthetic biology
2024-04-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad585
PMID:38163646
|
综述 | 通过采访8位植物合成生物学领域的创始人，回顾该领域的起源和早期发展 | 首次通过口述历史的方式记录植物合成生物学的起源和早期发展，为未来的历史研究提供原始资料 | 仅采访了8位创始人，可能无法全面覆盖领域内所有关键人物和事件；作为综述而非系统性分析，可能存在主观性 | 记录植物合成生物学的起源和早期发展历程 | 植物合成生物学领域的8位创始人（来自5个国家和3个大洲） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 访谈记录和事件时间线 | 8位创始人 | NA | NA | NA | 环境科学、能源、农业 |
| 33 | 2026-05-27 |
Novel strategies for drug repurposing
2024, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2024.03.021
PMID:38789188
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评论 | 本文从合成生物学、精准医学和纳米生物技术角度，探讨了药物重定位在癌症精准医学中的新策略，并报告了一种优化的伤口愈合实验方法用于验证药物敏感性和重定位 | 提出了一个优化的伤口愈合实验方法，可用于验证药物敏感性和药物重定位，并以HeLa细胞为基准展示了该方法在限制细胞增殖药物筛选中的应用 | 该方法目前仅在HeLa细胞上验证，未来扩展至实体瘤二维培养和白血病三维培养仍需进一步研究 | 探讨药物重定位在癌症精准医学中的新策略，并提供一种实验方法用于药物筛选和验证 | 药物重定位策略、伤口愈合实验方法、HeLa细胞 | 精准医学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | HeLa细胞 | NA | 医学 |
| 34 | 2026-05-26 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-10-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 利用微生物平台高效生产植物源抗真菌倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建高效微生物细胞工厂可持续生产该抗真菌倍半萜，通过蛋白质工程优化关键酶TPS18提升催化活性和稳定性 | 研究未评估大规模发酵的经济可行性和实际农业应用效果 | 构建微生物平台实现植物源抗真菌倍半萜的高水平生产 | 5-epi-jinkoheremol及其合成酶TPS18 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程，蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸和甾醇生物合成途径优化，转录因子Hac1和mA写入因子Ime4代谢工程策略 | 农业 |
| 35 | 2026-05-26 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-04, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 综述基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在模拟人类神经疾病中的应用 | 利用光遗传学和化学遗传学等合成生物学方法，在细胞层面精准诱导病理状态，模拟多种人类神经疾病，提供传统模型无法实现的新机遇 | 未明确说明具体局限性 | 总结基于光遗传学和化学遗传学的神经疾病动物模型及其未来发展方向 | 光遗传学和化学遗传学动物模型 | NA | 神经疾病, 阿尔茨海默病, 帕金森病, 肌萎缩侧索硬化, 癫痫, 共济失调 | 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学, 化学遗传学 | 动物（未指定具体物种） | 光遗传和化学遗传调控通路 | 医学 |
| 36 | 2026-05-26 |
Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome
2024-03-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad670
PMID:38114089
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研究论文 | 展示两种方法克隆三角褐指藻117-kb叶绿体基因组，并通过酵母组装实现高效克隆和工程改造 | 首次实现了高效克隆117-kb藻类叶绿体基因组，并设计了可线性化和整合表达盒的SapI位点，为叶绿体合成生物学底盘开发提供了新方法 | 该方法可能仅适用于类似基因组大小和结构的物种（如假微型海链藻），且尚未验证在藻类叶绿体中的实际递送和表达效果 | 开发高效克隆和工程改造叶绿体基因组的技术，拓展光合真核生物的合成生物学底盘 | 三角褐指藻的叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 酵母组装, 金门克隆, PCR扩增 | NA | DNA序列 | 10个酵母菌落 | 酵母组装, 金门克隆 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术, 农业 |
| 37 | 2026-05-22 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 提出使用线性混合效应模型评估合成基因电路性能，并验证固定效应β作为布尔逻辑门行为的统计描述符 | 首次将线性混合效应模型系统应用于合成基因电路的统计分析，引入固定效应β作为量化布尔逻辑门性能的通用指标，并结合蒙特卡洛模拟推荐实验样本量 | 未提及 | 标准化合成基因电路性能评估的统计方法，建立可预测的布尔逻辑门性能指标 | 已发表的144个布尔逻辑门及设计的嵌套抑制子OR门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型，无监督机器学习（k-means聚类），蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 基因表达数据 | 144个布尔逻辑门数据及模拟样本量 | NA | NA | 合成基因电路，布尔逻辑门（OR门等） | 计算、生物传感、人类健康 |
| 38 | 2026-05-21 |
A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells
2024-11-12, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4
PMID:39467389
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研究论文 | 设计了一种基于合成生物学的细胞生物传感器，将细菌感染信号转化为免疫细胞趋化因子 | 系统具有通用性，可感知多种感染类型并通过增强内源性免疫系统发挥作用，同时实现超敏检测和治疗蛋白输出 | NA | 开发一种通用的细胞基生物传感器/执行器，用于检测和对抗细菌感染 | 基因工程化的传感器/执行细胞 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 感应I型干扰素的合成电路，包含正反馈环路 | 医学 |
| 39 | 2026-05-20 |
Single-round QuikChange PCR for engineering multiple site-directed mutations in plasmid DNA
2024-11, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2024.115621
PMID:39019205
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研究论文 | 开发了一种简单省时的QuikChange PCR方法，用于在质粒DNA中引入多个位点的定向突变 | 在单轮PCR中同时实现多个位点的核苷酸插入、缺失和替换，最长插入28 bp、缺失16 bp，最多可在4个离散位点同时进行小规模替换，且通常筛选5个菌落即可获得成功克隆 | 未提及大规模位点突变或多轮PCR积累突变时的效率限制 | 开发高效的多位点定向诱变方法，以促进蛋白质生物化学、正向遗传学和合成生物学研究 | 质粒DNA和互补寡核苷酸引物 | 分子生物学 | NA | QuikChange PCR | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质生物化学、正向遗传学、合成生物学 |
| 40 | 2026-05-11 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-08-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
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研究论文 | 利用MuMi分析解读GB1蛋白单点突变景观及其对IgG-Fc结合的影响 | 提出MuMi（Mutation and Minimization）作为一种可靠且计算高效的蛋白质适应度景观预测工具，相比传统方法具有显著优势 | NA | 揭示GB1蛋白单点突变影响其与IgG-Fc结合亲和力的分子基础 | 链球菌蛋白G的C2片段（GB1）及其与人类IgG Fc域的结合 | 计算生物学 | NA | MuMi分析，分子动力学模拟（MD） | NA | 蛋白质序列与结构数据 | 所有可能的单点突变（数量未明确）及野生型GB1的2微秒分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 药物设计，合成生物学 |