合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-12-20	Two-stage continuous cultivation of microalgae overexpressing cytochrome P450 improves nitrogen and antibiotics removal from livestock and poultry wastewater 2024-Dec-16, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2024.131994 PMID:39694106	研究论文	研究通过两阶段连续培养过表达细胞色素P450的微藻，提高畜禽废水中氮和抗生素的去除效率	首次发现并鉴定了一种新的细胞色素P450酶，对氮和抗生素的去除具有重要作用，并通过合成生物学将氮去除率提高到470 mg/L/d，为目前微藻去除氮的最高记录	NA	研究微藻在畜禽废水处理中的应用，特别是氮和抗生素的去除机制，以实现营养物和水循环的生物经济	过表达细胞色素P450的普通小球藻，用于去除畜禽废水中的氨氮和抗生素	环境工程	NA	合成生物学	NA	NA	NA
22	2024-12-20	Post-genomic illumination of paclitaxel biosynthesis 2024-12, Nature plants IF:15.8Q1 DOI:10.1038/s41477-024-01869-8 PMID:39604636	综述	本文总结了紫杉醇生物合成研究的关键里程碑，并强调了通过基因组水平分析潜在关键基因所取得的最新进展	通过基因组测序和组装揭示了紫杉醇生物合成所需的最小基因集，为合成生物学方法促进紫杉醇的工业化生产铺平了道路	紫杉醇生物合成途径的完整阐明仍面临重大挑战，许多中间产物尚未通过实验确定	总结紫杉醇生物合成研究进展，探讨通过合成生物学方法实现紫杉醇工业化生产的可能性	紫杉醇的生物合成途径及其关键基因	NA	NA	基因组测序和组装	NA	基因组数据	三种红豆杉（Taxus）基因组
23	2024-12-20	Research Progress and Application of Miniature CRISPR-Cas12 System in Gene Editing 2024-Nov-26, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms252312686 PMID:39684395	综述	本文综述了微型CRISPR-Cas12系统的研究进展及其在基因编辑中的应用	微型CRISPR-Cas12系统相比常用的CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a具有丰富的PAM位点、更高的特异性、更小的体积和较低的细胞毒性	微型Cas12蛋白的应用及其编辑效率的改进方法尚未得到系统总结	旨在为深入理解微型CRISPR-Cas12系统的功能机制和工程化改造提供参考	微型CRISPR-Cas12系统在动物、植物和微生物基因编辑中的应用及其编辑效率的改进策略	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统	NA	NA	NA
24	2024-12-20	Diverting organic waste from landfills via insect biomanufacturing using engineered black soldier flies (Hermetia illucens) 2024-07-24, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-06516-8 PMID:39048665	研究论文	本文探讨了利用工程化黑水虻（Hermetia illucens）进行昆虫生物制造，以减少有机废物进入垃圾填埋场，并将其转化为高价值产品	利用合成生物学开发黑水虻作为可持续的生物制造平台，将多种有机废物转化为增强的动物饲料、高价值生物分子和改良肥料	NA	实现循环经济，减少有机废物处理问题	黑水虻（Hermetia illucens）及其在有机废物转化中的应用	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
25	2024-12-20	Broadening the application of Yarrowia lipolytica synthetic biology tools to explore the potential of Yarrowia clade diversity 2024-06, Microbiology (Reading, England) DOI:10.1099/mic.0.001472 PMID:38913407	研究论文	本研究展示了将Yarrowia lipolytica合成生物学工具应用于Yarrowia分支其他酵母菌株的潜力	首次将Yarrowia lipolytica的合成生物学工具应用于Yarrowia分支的其他酵母菌株，展示了这些工具的多功能性	研究仅限于表达荧光蛋白和类胡萝卜素途径，尚未全面评估其他潜在应用	探索Yarrowia分支多样性在工业应用中的潜力	Yarrowia分支的其他酵母菌株	合成生物学	NA	Golden Gate工具包	NA	NA	至少五个Yarrowia分支的成员
26	2024-12-20	A vector system for single and tandem expression of cloned genes and multi-colour fluorescent tagging in Haloferax volcanii 2024-05, Microbiology (Reading, England) DOI:10.1099/mic.0.001461 PMID:38787390	研究论文	本文开发了一种在嗜盐古菌中进行单基因和串联表达的质粒载体系统，并实现了多色荧光标记	本文创新性地设计了包含多种密码子优化荧光蛋白的质粒载体，用于蛋白质的N端或C端标记，并展示了其在细胞骨架蛋白融合中的应用	本文未详细讨论该系统在其他古菌物种中的适用性及其在大规模应用中的潜在限制	开发用于古菌分子和细胞生物学及生物技术研究的新工具	嗜盐古菌中的蛋白质表达、定位及功能研究	合成生物学	NA	荧光蛋白标记	NA	蛋白质	NA
27	2024-12-20	Advancing microbiota therapeutics: the role of synthetic biology in engineering microbial communities for precision medicine 2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2024.1511149 PMID:39698189	综述	本文综述了合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的变革潜力，探讨了其在精准医学中的应用	本文整合了计算机科学、工程学和生物学，利用CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程和合成寡核苷酸合成等前沿技术，为个性化益生菌和工程微生物等靶向治疗铺平道路	本文讨论了遗传稳定性、环境安全性和健全的监管框架等挑战，强调了持续研究以确保安全有效的微生物组干预的重要性	探讨合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的作用，特别是其在精准医学中的应用	微生物组、合成生物学技术、肠道微生物在疾病中的作用	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程、合成寡核苷酸合成	NA	NA	NA
28	2024-12-19	Next-Generation Probiotics and Chronic Diseases: A Review of Current Research and Future Directions 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c08702 PMID:39588716	综述	本文综述了下一代益生菌（NGPs）在慢性疾病中的应用现状及未来发展方向	本文介绍了通过合成生物学和生物信息学工程化的下一代益生菌，旨在针对特定疾病状态，具有增强的稳定性和生存能力	本文讨论了NGPs在稳定性和递送方面的挑战，并强调了进一步研究以优化其疗效和确保安全性的必要性	探讨下一代益生菌在预防和治疗慢性疾病中的应用及其未来发展方向	下一代益生菌的稳定性、递送挑战及其在糖尿病、肥胖和心血管疾病等慢性疾病中的应用	NA	慢性疾病	高通量测序	NA	NA	NA
29	2024-12-19	Evolution of Vitamin E Production: From Chemical Synthesis and Plant Extraction to Microbial Cell Factories 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c08813 PMID:39644244	综述	本文回顾了维生素E生产从传统的化学合成和植物提取到前沿的微生物细胞工厂的演变过程	本文介绍了通过代谢工程和合成生物学在微生物细胞工厂中生产维生素E的最新进展	本文讨论了当前面临的挑战，包括技术难题和未来发展方向	探讨维生素E生产技术的演变及其未来发展	维生素E的生产方法及其在植物和微生物中的生物合成	NA	NA	代谢工程和合成生物学	NA	NA	NA
30	2024-12-19	Discovery and Functional Identification of 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Cytochrome P450s in Triterpenoid Metabolic Pathways of Actinidia eriantha 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c06937 PMID:39648448	研究论文	本研究通过转录组测序分析结合合成生物学方法，在酵母中异源表达，鉴定了参与猕猴桃三萜代谢途径的关键酶基因	首次鉴定了两个2,3-氧化角鲨烯环化酶（AeOSC2和AeOSC3）和两个细胞色素P450（AeCYP716A8和AeCYP716A9），并成功重建了猕猴桃中乌索烷型和齐墩果烷型三萜的生物合成途径	NA	探索猕猴桃中三萜代谢途径的关键酶基因及其功能	猕猴桃中的三萜化合物及其生物合成途径	代谢组学	NA	转录组测序分析，合成生物学	NA	基因序列	NA
31	2024-12-19	All Roads Lead to Rome: Pathways to Engineering Disease Resistance in Plants 2024-Dec-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202412223 PMID:39691979	综述	本文综述了植物病害抗性的基本机制和不同策略，并探讨了未来培育持久和广谱抗病植物的前景	本文结合了基因工程、基因编辑和合成生物学等最新进展，提供了开发植物病害抗性的全面策略	本文讨论了现有策略的局限性及其可能的解决方案	探讨开发植物病害抗性的新策略，以减少全球作物因病害而损失的风险	植物病害抗性的机制和策略，以及用于抗病育种的关键基因	NA	NA	基因工程、基因编辑、合成生物学	NA	NA	NA
32	2024-12-19	Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading 2024-Dec-18, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202400483 PMID:39692631	研究论文	本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装（bioPISA）生成的人工细胞囊泡的形成和特性，包括尺寸分布和后组装加载	首次展示了通过bioPISA方法生成具有均匀尺寸和可控内部结构的囊泡，并成功演示了将大分子加载到预形成的囊泡中的可行性	研究主要集中在实验室规模，尚未在大规模应用中验证	开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡，用于合成生物学等应用	通过bioPISA生成的囊泡的尺寸分布、形态和内部结构，以及后组装加载大分子的可行性	合成生物学	NA	生物催化聚合诱导自组装（bioPISA），荧光相关光谱（FCS），电穿孔	NA	囊泡	未明确提及具体样本数量
33	2024-12-19	Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders 2024-Dec-17, Expert opinion on drug delivery IF:5.0Q1 DOI:10.1080/17425247.2024.2444364 PMID:39688950	综述	本文综述了基于细菌及其衍生物的药物递送系统在治疗中枢神经系统疾病中的最新研究进展	提出了利用细菌及其衍生物作为药物递送系统的创新方法，能够跨越血脑屏障，实现精确药物递送	需要解决生物安全性、免疫排斥和规模化生产等挑战	探讨细菌载体在治疗中枢神经系统疾病中的应用潜力	细菌载体在治疗缺血性脑损伤、神经退行性疾病和胶质瘤中的应用	NA	神经退行性疾病	基因工程、合成生物学、纳米技术	NA	NA	NA
34	2024-12-19	Multi-enzyme assemblies both in the cell membrane and cytoplasm boost intracellular lycopene production 2024-Dec-15, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138654 PMID:39689805	研究论文	本研究利用新型二十面体蛋白笼Mi3作为蛋白质支架，结合基于酯键的肽标签系统ReverseTag/ReverseCatcher，在体外和体内提高酶催化效率，特别是在番茄红素生物合成中的应用	首次将ReverseTag/ReverseCatcher/Mi3系统应用于细胞膜和细胞质中的多酶组装，显著提高了番茄红素的产量	NA	提高酶催化效率，特别是在番茄红素生物合成中的应用	多酶组装系统在细胞膜和细胞质中的应用	合成生物学	NA	多酶组装系统	NA	蛋白质	NA
35	2024-12-19	Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy 2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England) DOI:10.1007/s12032-024-02578-0 PMID:39666238	综述	本文综述了基于沙门氏菌的癌症免疫治疗策略，重点探讨了其对肿瘤微环境的调控作用及优化工程策略	本文介绍了沙门氏菌在癌症免疫治疗中的多重优势，包括广谱抗肿瘤活性、肿瘤靶向能力、免疫调节作用、溶瘤特性、遗传可编程性和工程灵活性	本文讨论了开发更安全有效的基于沙门氏菌的癌症免疫治疗所面临的挑战	探讨如何通过沙门氏菌调控肿瘤微环境，提升癌症免疫治疗效果	沙门氏菌在癌症免疫治疗中的应用及其对肿瘤微环境的调控作用	NA	癌症	NA	NA	NA	NA
36	2024-12-19	Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products 2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202407195 PMID:39467708	研究论文	本文利用微流控平台结合数学模型，在单细胞水平上精确表征了与真菌次级代谢相关的基因调控回路	首次将微流控平台与数学模型结合，用于单细胞水平上精确表征真菌基因调控回路，并成功重构了生物活性分子的生物合成途径	研究仅限于两种代表性真菌基因调控回路，样本量较小	探索真菌基因调控回路在次级代谢中的作用，发现新的天然产物	真菌基因调控回路及其在次级代谢中的表达强度和时序	合成生物学	NA	微流控平台	数学模型	基因表达数据	30个转录因子-启动子组合，来自两种代表性真菌基因调控回路，使用模式真菌Aspergillus nidulans
37	2024-12-19	Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach 2024-Dec, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02487-0 PMID:39572716	研究论文	本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确预测RNA的三维结构	RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道，并在多个评估中表现优于现有方法	NA	开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法，以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发	单链RNA的三维结构	机器学习	NA	深度学习	语言模型	序列	约2370万条RNA序列
38	2024-12-19	Advanced Antibacterial Strategies for Combatting Biomaterial-Associated Infections: A Comprehensive Review 2024 Nov-Dec, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology DOI:10.1002/wnan.2018 PMID:39654369	综述	本文综述了生物材料相关感染的挑战及其预防策略，重点探讨了抗菌涂层和多功能抗菌生物材料的应用	本文讨论了多功能抗菌生物材料的最新进展，并提出了合成生物学作为应对抗菌耐药性的新方法	本文主要为综述性质，未提供具体的实验数据或模型	旨在指导高效且生物相容的抗菌生物材料的设计与开发	生物材料相关感染及其预防策略	NA	NA	NA	NA	NA	NA
39	2024-12-19	Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus 2024-07-02, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-06487-w PMID:38956406	研究论文	本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因	使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合	NA	开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用	非传统酵母Kluyveromyces marxianus	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	NA	基因组	NA
40	2024-12-18	All-in-One CO2 Capture and Transformation: Lessons from Formylmethanofuran Dehydrogenases 2024-Dec-17, Accounts of chemical research IF:16.4Q1 DOI:10.1021/acs.accounts.4c00623 PMID:39584476	研究论文	本文讨论了formylmethanofuran脱氢酶（FMD）在CO2捕获和转化中的潜力，并探讨了其在生物系统和人工系统中的应用	FMD酶通过不同的操作模式节省细胞能量，并且可以在生物系统和人工系统中进行CO的电还原，生成有机化合物合成中的中间体	NA	探讨FMD酶在CO2捕获和转化中的应用，并研究其在生物系统和人工系统中的潜力	formylmethanofuran脱氢酶（FMD）及其在CO2转化中的作用	生物化学	NA	酶催化	NA	NA	NA