合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-06-21	A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign 2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.08.617227 PMID:39416180	研究论文	本文设计并验证了一个名为pXpressome的质粒工具包，用于稳健表达和纯化功能性α-羧酶体，并探索了通过基因突变调控羧酶体结构和性能的方法	开发了pXpressome工具包，实现了羧酶体的稳健表达和纯化，并通过基因突变调控其形态，提高了表达均匀性和细胞健康状态	NA	推进羧酶体的研究和重新设计，以增强碳固定能力或作为其他纳米封装目标的平台	α-羧酶体	合成生物学	NA	质粒构建、基因突变、荧光标记	NA	NA	NA
42	2025-06-20	Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response 2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2412070121 PMID:39693352	研究论文	本文通过基因工程改造高色氨酸表达的细菌株，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应，以增强肿瘤免疫治疗效果	开发了一种能严格定植于肿瘤的高色氨酸表达细菌株，其产生的丁酸盐能抑制IDO活性，同时释放大量色氨酸支持CD8+ T细胞激活和能量代谢	目前仅在鼠和兔的多肿瘤模型中验证效果，临床应用的可行性和安全性尚需进一步研究	开发一种增强肿瘤免疫治疗的合成生物学策略	基因工程改造的细菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞反应的影响	合成生物学	癌症	基因工程	NA	NA	鼠和兔的多肿瘤模型
43	2025-06-18	Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis 2024-Oct, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01677-3 PMID:38977789	research paper	该研究利用邻近触发的蛋白质反式剪接技术，实现了目标蛋白质的时间分辨合成，并应用于多种蛋白质的动态调控	开发了一种模块化的蛋白质反式剪接技术，能够时间分辨地合成目标蛋白质，并调控其细胞定位和活性状态	NA	开发合成生物学工具，用于调控蛋白质功能并研究细胞信号传导	多种蛋白质，包括激酶融合蛋白BCR-ABL和DNAJ-PKAc	合成生物学	癌症	邻近触发的蛋白质反式剪接技术	NA	蛋白质合成与调控数据	多种蛋白质样本，包括BCR-ABL和DNAJ-PKAc
44	2025-06-18	Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures 2024-09-18, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52533-w PMID:39294165	研究论文	提出了一种基于几何图学习的酶功能预测方法GraphEC，利用ESMFold预测的结构和预训练的蛋白质语言模型来预测酶的活性位点、EC编号和最适pH	首次将几何图学习应用于酶功能预测，结合活性位点预测和同源信息扩散算法，显著提高了预测性能	NA	开发更准确的酶功能预测方法	酶蛋白	生物信息学	NA	几何图学习、蛋白质语言模型	GraphEC	蛋白质结构数据	NA
45	2025-06-18	Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching 2024-09-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52282-w PMID:39289346	研究论文	本研究介绍了一种合成生物学方法，通过重编程酵母交配型转换机制实现可调谐的细胞分化，促进合成微生物群落的形成和协作	将酵母交配型转换机制工程化为遗传逻辑门，可在单倍体酵母群体中诱导不对称性分化，形成具有交配型异质性和可调谐群体组成的群落	NA	开发合成生物学方法以促进微生物群落的协作和生物技术应用	酵母细胞	合成生物学	NA	遗传工程	遗传逻辑门	NA	NA
46	2025-06-18	Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence 2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.12.603336 PMID:39026737	research paper	该研究探讨了生物能量应激如何通过增加ATP利用影响抗生素治疗效果，并揭示了其通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复促进抗菌素耐药性（AMR）进化的机制	首次利用合成生物学方法构建了组成性水解ATP或NADH的遗传系统，直接研究生物能量应激对抗生素效果的影响，并提出了统一的模型解释抗生素诱导的抗菌素耐药性和持久性	研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他细菌中验证	理解生物能量应激对抗生素治疗效果的影响机制	大肠杆菌	合成生物学	细菌感染	合成生物学方法	遗传工程系统	NA	NA
47	2025-06-18	An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer 2024-03-22, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adk1250 PMID:38507482	研究论文	本文介绍了一种名为'Traptamer'的RNA折纸机器人，能够机械捕获和释放荧光适配体iSpinach	利用RNA折纸方法开发了一种能够感知、计算和驱动的RNA机器人设备，实现了对RNA功能的精确控制	研究仍处于原型阶段，尚未在真实细胞环境中验证其功能	开发先进的RNA纳米机器人设备以增强对分子过程的控制	RNA折纸机器人Traptamer及其与荧光适配体iSpinach的相互作用	RNA纳米技术	NA	RNA折纸方法、冷冻电子显微镜	布尔AND门	分子结构数据、荧光信号	NA
48	2025-06-18	Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy 2024-02-14, International immunology IF:4.8Q2 DOI:10.1093/intimm/dxad033 PMID:37591521	综述	本文综述了细胞因子信号在嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）疗法中的作用及其调控策略	探讨了通过基因工程调控细胞因子信号以增强CAR-T细胞功能的新策略，并提出了减轻相关毒性的治疗方法	未涉及具体临床试验数据，主要基于理论和小规模实验研究	提高CAR-T细胞疗法的疗效并减少其副作用	嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）及其细胞因子信号通路	免疫治疗	血液系统恶性肿瘤	基因工程、合成生物学方法	NA	NA	NA
49	2025-06-17	Enhancing the safety of CAR-T cell therapy: Synthetic genetic switch for spatiotemporal control 2024-02-23, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adj6251 PMID:38394207	综述	本文总结了合成生物学方法在时间和空间维度上解决CAR-T细胞疗法主要副作用的最新进展	提出基于合成生物学的遗传工程方法构建CAR-T细胞控制模块，以增强其可控性和安全性	NA	增强CAR-T细胞疗法的可控性和安全性	CAR-T细胞疗法	合成生物学	癌症	遗传工程技术	NA	NA	NA
50	2025-06-15	Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design 2024-01-19, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adi3621 PMID:38241375	research paper	提出了一种开放式的合成生物学设计方法，强调设计的新颖性与实现目标同等重要	提出将新颖性作为生物设计的重要考量，而不仅仅是优化单一最佳设计，以突破工程生物学中性能提升的瓶颈	未具体说明开放式设计方法在实际应用中的具体操作步骤或验证案例	探索合成生物学中更具创造性的设计方法，以克服当前系统复杂性瓶颈和实验室到实际应用的转化难题	合成生物学设计方法	synthetic biology	NA	NA	NA	NA	NA
51	2025-06-13	Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion 2024-10-02, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52802-8 PMID:39353937	research paper	该研究揭示了水包油乳液中脂滴的酶促反应触发的内吞样行为	首次展示了脂肪酶在乳滴膜上的热力学有利招募及其触发的内吞样行为	对人工脂滴的生物物理动态行为的理解仍不全面	探索水包油乳液中人工脂滴的动态行为并开发其功能化应用	水包油乳液中的脂滴	生物物理学	NA	酶促反应	NA	NA	NA
52	2025-06-12	Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing 2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2409335121 PMID:39656206	research paper	该研究利用合成生物学方法开发了一种能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程细菌，这种细菌能够增强光的聚焦	通过工程化细菌表达硅酸盐生物矿化酶，使其能够自组装聚硅酸盐外壳，形成具有可调结构特性的活体微透镜，其光聚焦能力比未修饰细菌强近一个数量级	NA	开发一种环境友好、具有可调结构特性的活体微透镜，用于光聚焦和操纵	工程化细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
53	2025-06-11	Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology 2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718 PMID:38574823	综述	本文探讨了利用铁硫（Fe-S）酶进行合成生物学的核心挑战及解决方案	总结了Fe-S酶在工程代谢途径中的三个核心挑战，并提出了克服这些挑战的方法	尚未实现工业规模应用，仍处于研究阶段	开发工业级Fe-S酶依赖的生物合成途径	铁硫（Fe-S）酶及其在生物合成途径中的应用	合成生物学	NA	蛋白结构预测与设计	NA	NA	NA
54	2025-06-10	Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications 2024-10-25, Toxins IF:3.9Q1 DOI:10.3390/toxins16110458 PMID:39591213	review	本文全面综述了蛇毒研究中的尖端技术进展，重点关注蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用	介绍了合成生物学和多组学方法（统称为毒液组学）在蛇毒研究中的革命性应用，为毒液功能及其治疗潜力提供了更深入的见解	毒素功能表征和成本效益抗蛇毒血清开发等挑战仍然存在	探索蛇毒的分子组成、进化驱动力及其生物医学应用潜力	蛇毒及其毒素	生物医学研究	NA	蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 多组学方法, 冷冻电子显微镜	NA	分子数据	NA
55	2025-06-10	Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding 2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.06.06.543915 PMID:37333159	research paper	研究工程基因回路在宿主细胞中整合时，由于回路与宿主相互作用（如生长反馈）导致的动态失败机制及其拓扑结构的韧性	系统地研究了四百多种拓扑结构，识别了三类回路失败的动态机制，并发现了一种回路稳健性度量与生长反馈强度之间的比例关系	仅关注了转录调控回路中的适应性问题，未涉及其他类型的基因回路或更复杂的宿主环境	理解工程基因回路在宿主细胞中整合时的动态行为，识别对生长反馈具有韧性的拓扑结构	工程基因回路及其在宿主细胞中的整合	synthetic biology	NA	transcriptional regulation circuits	NA	NA	over four hundred topological structures
56	2025-06-10	Protocol for in vitro phospholipid synthesis combining fatty acid synthesis and cell-free gene expression 2024-06-21, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2024.103051 PMID:38700978	研究论文	本文提出了一种体外合成和定量磷脂的协议	结合脂肪酸合成和无细胞基因表达系统在体外合成磷脂	未提及该协议在不同条件下的适用性或效率问题	开发一种体外合成和定量磷脂的方法	磷脂	合成生物学	NA	液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)	NA	NA	NA
57	2025-06-07	Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds 2024-08, Journal of lipid research IF:5.0Q1 DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597 PMID:39029799	综述	本文综述了利用膜工程技术构建高柔性细胞膜以高效生产脂溶性化合物的策略	总结了两种主要的细胞膜修饰方法：构建脂溶性化合物的人工储存区室和改造细胞膜结构以促进产物外流	未提及具体实验数据或案例研究	实现脂溶性化合物的高效生产	微生物细胞工厂	合成生物学	NA	膜工程技术	NA	NA	NA
58	2025-06-07	Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design 2024-Jul, Annual review of chemical and biomolecular engineering IF:7.6Q1 DOI:10.1146/annurev-chembioeng-100722-121610 PMID:38594944	综述	本文综述了通过基因工程改造原代细胞和干细胞以加速多样化细胞治疗的进展	整合合成生物学工具和先进基因组编写技术，提出加速创新细胞治疗转化的愿景	未提及具体临床试验数据或治疗效果验证	探讨规模化设计加速多样化细胞治疗的潜力	原代细胞和干细胞	合成生物学	NA	转基因方法、基因组编写技术	NA	NA	NA
59	2025-06-06	Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits 2024-10-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52976-1 PMID:39384772	研究论文	本文开发了一种通过重编程大肠杆菌的碳储存调控网络（Csr Network）来实现复杂转录后控制的方法	利用Csr Network的天然相互作用建立转录后逻辑门，实现复杂的细菌调控，并构建了12种BUFFER Gates和Csr调控的NOT Gate	NA	开发可编程的转录后调控工具，用于合成生物学	大肠杆菌的碳储存调控网络（Csr Network）	合成生物学	NA	RNA-蛋白质相互作用工程	BUFFER Gates, NOT Gate	NA	NA
60	2025-06-03	Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering 2024-12-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00574 PMID:39509282	review	本文综述了细菌无细胞系统中的天然和工程调控组件及其应用	全面概述了无细胞系统中调控组件的使用，包括天然和工程化的组件	NA	探讨无细胞系统中调控组件的应用及其在合成生物学中的重要性	细菌无细胞系统中的调控组件	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA