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序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
81	2025-01-25	Synthetic Cell Lines for Inducible Packaging of Influenza A Virus 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00526 PMID:38259154	研究论文	本文通过系统设计和合成生物学方法，设计了可诱导生产除血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）外所有病毒成分的细胞系，用于生产甲型流感病毒（IAV）	首次展示了创建用于生产细胞病变性负链RNA病毒的包装细胞系的可能性，并提供了制造病毒疫苗的新方法	病毒RNA合成效率低以及宿主对病毒感染反应的基因表达上调可能是限制因素	开发一种新的方法来生产甲型流感病毒疫苗	甲型流感病毒（IAV）	合成生物学	流感	RNA-Seq转录组分析	NA	RNA序列数据	NA
82	2025-01-25	A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment 2024, Mycobiology IF:1.6Q4 DOI:10.1080/12298093.2024.2416736 PMID:39845176	综述	本文全面分析了真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养品中的新兴应用	综述了基因工程、代谢途径操作和合成生物学的最新进展，以提高次级代谢产物的产量，并强调了组学技术在理解次级代谢产物调控和生物合成中的重要性	NA	探讨真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业和环境可持续性中的应用	真菌及其次级代谢产物	生物技术	NA	基因工程、代谢途径操作、合成生物学、组学技术	NA	NA	NA
83	2025-01-25	Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy 2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612 PMID:39845371	综述	本文总结了细菌载体在抗癌药物递送中的应用及其优缺点，并强调了细菌载体递送系统在临床转化中的潜力	细菌载体递送系统利用细菌的趋化性和抗肿瘤免疫反应激活能力，结合纳米医学和合成生物学技术，为克服传统癌症治疗方案的局限性提供了新的策略	细菌载体递送系统在临床应用中仍面临安全性、稳定性和规模化生产等挑战	探索细菌载体递送系统在癌症治疗中的应用潜力	细菌载体递送的抗癌药物	生物医学工程	癌症	纳米医学、合成生物学	NA	NA	NA
84	2025-01-24	Activation of Caged Functional RNAs by An Oxidative Transformation 2024-Dec-30, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202401056 PMID:39740778	研究论文	本文展示了通过氧化处理激活含有2-硫尿苷（2sU）修饰的功能性RNA（适配体和核酶）的方法	首次展示了通过氧化脱硫将2-硫尿苷转化为尿苷，从而激活功能性RNA的创新方法	未提及具体应用场景或体内实验验证	探索RNA作为环境响应功能聚合物的潜力	含有2-硫尿苷修饰的功能性RNA（适配体和核酶）	合成生物学	NA	氧化脱硫	NA	NA	NA
85	2025-01-23	Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy 2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England) DOI:10.1007/s12032-024-02578-0 PMID:39666238	综述	本文综述了沙门氏菌在癌症免疫治疗中的应用，特别是其在改善肿瘤微环境（TME）方面的潜力	沙门氏菌因其广谱抗肿瘤活性、肿瘤靶向能力、免疫调节作用、溶瘤特性、遗传可编程性和工程灵活性，成为癌症免疫治疗中的领先候选者	开发更安全、更有效的基于沙门氏菌的癌症免疫疗法仍面临挑战	探讨沙门氏菌在调节肿瘤微环境（TME）中的应用，以增强癌症免疫治疗的疗效	沙门氏菌及其在癌症免疫治疗中的应用	癌症免疫治疗	癌症	合成生物学、基因工程	NA	NA	NA
86	2025-01-23	Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation 2024-Nov-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00420 PMID:39413025	研究论文	本文通过细胞内水凝胶化技术，将非复制但代谢活跃的Cyborg细菌扩展到病原菌，探索其在生物医学应用中的潜力	将细胞内水凝胶化技术从实验室菌株扩展到病原菌，并验证其在巨噬细胞中的摄取和表型响应	仅研究了特定病原菌株，未涵盖所有可能的病原菌类型	探索通过细胞内水凝胶化技术改造病原菌，以应用于生物医学领域	不同菌株的病原菌	合成生物学	NA	细胞内水凝胶化技术	NA	实验数据	多种病原菌株
87	2025-01-22	Orthogonalized human protease control of secreted signals 2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.01.18.576308 PMID:39484520	研究论文	本文介绍了一种名为hDIRECT的平台，用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性，以支持基于细胞的治疗	开发了hDIRECT平台，利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂，通过蛋白水解切割激活和消除细胞因子的活性，实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用	未提及具体的临床实验结果或长期效果评估	开发一种能够控制细胞因子活性的人类化合成生物学平台，以支持基于细胞的治疗	人类细胞因子（IL-2, IL-6, IL-10）及其活性控制	合成生物学	癌症免疫治疗	蛋白水解切割	NA	蛋白质数据	未提及具体样本数量
88	2025-01-21	The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora 2024-Dec-29, Chemistry & biodiversity IF:2.3Q3 DOI:10.1002/cbdv.202402999 PMID:39737746	review	本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展，重点介绍了两种研究策略及其在生物合成酶发现中的应用	提出了基于天然产物优先和酶优先的两种策略，用于发现Kitasatospora来源的肽类天然产物及其生物合成酶	未提及具体的研究局限性	探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究策略及其生物合成机制	Kitasatospora来源的肽类天然产物及其生物合成酶	合成生物学	NA	基因组分析、生物信息学工具	NA	基因组数据、酶序列数据	NA
89	2025-01-21	Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes 2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.25.614978 PMID:39386662	研究论文	本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于可编程基因表达	通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合，进化出高活性的变体，显著提高了在真核系统中的蛋白表达水平	NA	开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统，提高合成生物学应用的多样性和效率	T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶	合成生物学	NA	定向进化	NA	NA	NA
90	2025-01-21	Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00353 PMID:38194520	研究论文	本文介绍了一种新的连续荧光检测方法，用于体外翻译实验，该方法与非经典氨基酸（ncAAs）兼容	开发了一种基于亲和夹蛋白的连续荧光检测方法，能够快速验证多种非经典氨基酸的掺入并测试多种tRNA的密码子读取特异性	该方法依赖于亲和夹蛋白的荧光特性变化，可能对某些特定ncAAs的检测存在局限性	开发一种适用于非经典氨基酸的体外翻译连续检测方法，以促进药物发现和合成生物学中的翻译装置工程	非经典氨基酸（ncAAs）和tRNA的密码子读取特异性	合成生物学	NA	连续荧光检测	NA	荧光数据	384孔板格式的实验
91	2025-01-16	Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century 2024-Dec-23, Genes IF:2.8Q2 DOI:10.3390/genes15121654 PMID:39766921	综述	本文详细综述了21世纪中国在植物病毒抗病毒剂的研究进展，包括抗病毒剂的生物特性、作用模式及未来药物开发的见解	本文综合了化学生物学、化学信息学、生物信息学和合成生物学的最新进展，为抗病毒药物的设计、合成、活性评估及作用机制研究提供了新的方法和工具	本文主要关注植物病毒抗病毒剂的研究，未涉及人类或动物病毒疾病的抗病毒剂开发	深入研究植物病毒抗病毒剂的研发，以应对复杂爆发的植物病毒疾病	植物病毒及其抗病毒剂	生物信息学	植物病毒疾病	化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学	NA	NA	NA
92	2025-01-16	Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review 2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/antibiotics13121228 PMID:39766618	综述	本文全面回顾了用于生物膜研究的经典和现代模型，总结了实验室生物膜模型的各种设计及其优缺点	提供了改进生物膜模型的见解，以更接近真实场景，利用增材制造、合成生物学和生物工程中的新技术	当前实验室模型存在各种局限性	研究生物膜的物理特性、抗微生物剂的抗性机制及其基因和蛋白质表达谱	生物膜	生物工程	NA	增材制造、合成生物学、生物工程	NA	NA	NA
93	2025-01-16	An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription 2024-03-15, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/acschembio.3c00775 PMID:38417105	研究论文	本文探讨了四链G-四链体（G4）DNA结构在基因启动子中如何影响转录	通过合成生物学方法，将G4形成序列稳定整合到合成报告基因的启动子中，并插入人类细胞基因组，首次在细胞基因组环境中展示了G4结构形成对转录的刺激作用	研究局限于合成报告基因和特定细胞环境，未涉及更多天然基因和细胞类型	理解G4结构如何影响基因转录	G4 DNA结构及其在基因启动子中的作用	分子生物学	NA	合成生物学方法	NA	基因组数据	人类细胞
94	2025-01-15	Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines 2024-Dec-11, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d4np00022f PMID:39129507	评论	本文回顾了诺华公司在天然产物药物发现方面的历史，并介绍了从早期研究到开发及以后的过程中所使用的工具和面临的挑战	利用90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物，结合微生物学、计算生物学、合成生物学、化学和工艺开发等多学科方法，寻找新药物	未明确提及具体的研究局限性	通过天然产物发现新药物，并利用新技术加速药物发现和可持续化合物供应	天然产物及其衍生的药物	药物发现	NA	基因组工程、数据科学、抗体药物偶联物、放射性配体疗法、xRNA药物	NA	NA	90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物
95	2025-01-15	Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production 2024-Dec-11, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d4np00024b PMID:39279757	研究论文	本文通过基因组分析和合成生物学方法，探讨了达托霉素在Streptomyces roseosporus中的生物合成调控，旨在加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产	通过比较野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株的基因组序列，发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域有两个突变，这些突变影响了多顺反子mRNA的转录	研究主要基于两种菌株的基因组分析，可能无法全面反映所有可能的调控机制	提高达托霉素的发酵产量，并促进新型脂肽类抗生素的发现和商业化	Streptomyces roseosporus菌株及其达托霉素生物合成基因簇	合成生物学	细菌感染	基因组分析、代谢工程、合成生物学、诱变	NA	基因组序列	两种Streptomyces roseosporus菌株（野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株）
96	2025-01-15	Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells 2024-Dec-11, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241 PMID:39591535	综述	本文综述了人工细胞的发展及仿生策略，重点讨论了基于仿生材料的人工细胞构建的底层策略	从仿生材料出发构建人工细胞，从简单的细胞支架到多室系统，从功能模块的构建到关键代谢行为的模拟，甚至到通信网络的仿生	对该领域的瓶颈进行了粗略分析	探讨人工细胞的构建及其在材料工程与生命科学之间的桥梁作用	人工细胞	合成生物学	NA	仿生技术	NA	NA	NA
97	2025-01-15	[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius] 2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20240911.102 PMID:39805756	研究论文	本研究从石栎的转录组数据中筛选出两个CHS基因（LlCHS1和LlCHS2），并进行了生物信息学分析和功能表征，揭示了它们在查尔酮合成中的功能	首次从石栎中克隆并鉴定了两个CHS基因，并通过合成生物学方法验证了它们在催化phloretin生成中的功能	研究仅在大肠杆菌中进行了功能验证，未在植物体内进行进一步验证	探索石栎中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能	石栎中的CHS基因（LlCHS1和LlCHS2）	合成生物学	NA	生物信息学分析、合成生物学	NA	转录组数据	两个CHS基因（LlCHS1和LlCHS2）
98	2025-01-14	A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits 2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.30.630778 PMID:39803539	研究论文	本文提出了一种线性混合效应模型，用于评估合成基因电路的性能	首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路的统计分析，提出固定效应β作为电路性能的描述符	未提及具体局限性	标准化用于评估合成基因电路性能的统计方法	合成基因电路的布尔逻辑门性能	合成生物学	NA	线性混合效应模型、k-means聚类、蒙特卡洛模拟	线性混合效应模型	实验数据	144个已发布的布尔逻辑门
99	2025-01-14	Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics 2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/67659 PMID:39803963	研究论文	本研究介绍了一种基于开源硬件的微流体工作流程，用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留	采用开源硬件实现精确的流量控制和温度管理，提高了工作流程的易用性、鲁棒性和可访问性	研究主要使用大肠杆菌作为实验模型，尽管方法具有广泛适用性，但尚未在其他生物体中验证	分析质粒保留，以支持合成生物学中无抗生素选择的功能性质粒维持	质粒和大肠杆菌	合成生物学	NA	微流体技术、荧光显微镜	NA	图像数据	大量微滴和微菌落
100	2025-01-13	Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam 2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s42770-024-01454-3 PMID:38985434	研究论文	本文研究了从印度阿萨姆邦Pobitora野生动物保护区森林根际土壤中分离出的放线菌PBR19的抗菌活性及其生物合成潜力	发现PBR19可能是一个新的分类单元，并展示了其对抗ESKAPE病原体的显著抗菌活性，以及其含有与抗生素合成相关的基因	研究局限于单一菌株的抗菌活性和基因分析，未进行大规模筛选或临床试验	探索PBR19的抗菌活性及其在药物开发和合成生物学中的潜在应用	Streptomyces sp. PBR19菌株	微生物学	细菌感染	扫描电子显微镜(SEM)、基因测序	NA	微生物样本、基因数据	单一菌株PBR19