合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-01-13	Identification of novel broad host-range promoter sequences functional in diverse Pseudomonadota by a promoter-trap approach 2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s42770-024-01512-w PMID:39259478	研究论文	本研究通过启动子捕获方法，从南极微生物群落中识别出在多种假单胞菌门中具有广泛宿主范围功能的新型启动子序列	发现了13个功能启动子序列，这些序列不仅在P. putida KT2440中驱动基因表达，还在其他多种细菌中表现出功能，丰富了合成生物学的生物部件库	研究主要基于实验室条件下的基因表达，未在自然环境或更广泛的宿主中进行验证	扩展合成生物学中可用的生物部件库，特别是寻找具有广泛宿主范围功能的启动子序列	南极微生物群落中的假单胞菌门细菌	合成生物学	NA	启动子捕获方法	NA	基因序列数据	约2,000个克隆，从中识别出13个功能启动子序列
102	2025-01-12	Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents 2024-Jun-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00181 PMID:38733599	研究论文	本文介绍了一种创新的生物工程平台，通过细菌发酵高产大规模生产生物小干扰RNA（BioRNA/siRNA）制剂	开发了一种新的tRNA融合pre-miRNA载体，能够在活体宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA制剂，并实现了九种目标BioRNA/siRNA分子的高水平过表达	未提及具体的技术局限或挑战	推进合成生物学领域，为研究和药物开发提供一种新型平台，以生物工程功能性siRNA制剂	生物小干扰RNA（BioRNA/siRNA）制剂	合成生物学	NA	细菌发酵，tRNA融合pre-miRNA载体	NA	NA	每0.25升细菌培养物中生产3-10毫克BioRNA/siRNA
103	2025-01-12	Bacterial imaging in tumour diagnosis 2024-06, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.14474 PMID:38808743	研究论文	本文探讨了细菌成像在肿瘤诊断中的应用，介绍了不同成像技术及其在肿瘤相关细菌监测中的潜力	提出细菌成像作为一种新型且有前景的肿瘤诊断方法，结合合成生物学和纳米材料工程技术，提升细菌的存活率和定位能力	肿瘤内细菌丰度较低且分布不均，空间数据集的高维度性以及成像标记工具的局限性	研究细菌成像技术在肿瘤诊断中的应用，以改善肿瘤的诊断和治疗	肿瘤相关细菌，如大肠杆菌（E. coli）和鼠伤寒沙门氏菌（S. typhimurium）	数字病理学	肿瘤	光学成像、声学成像、磁共振成像（MRI）、核医学成像（PET和SPECT）	NA	图像	NA
104	2025-01-07	Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp 2024-Apr-25, Biology DOI:10.3390/biology13050292 PMID:38785776	综述	本文综述了利用Nannochloropsis spp作为绿色生物工厂的现状，特别是核基因操作技术的应用	探讨了合成生物学和基因工具在Nannochloropsis spp中的应用，以提高其作为绿色生物工厂的潜力	Nannochloropsis spp的工业应用尚未实现，仍需进一步研究	探索利用Nannochloropsis spp作为可持续绿色生物工厂的潜力	Nannochloropsis spp微藻	生物技术	NA	核基因操作技术	NA	NA	NA
105	2025-01-05	A single-plasmid-based, easily curable CRISPR/Cas9 system for rapid, iterative genome editing in Pseudomonas putida KT2440 2024-Dec-30, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02634-4 PMID:39734219	研究论文	本文开发了一种基于单质粒的CRISPR/Cas9系统，用于在Pseudomonas putida KT2440中进行快速迭代基因组编辑	开发了一种易于消除的CRISPR/Cas9系统，能够在不到1.5天内完成一次编辑，是目前最快的P. putida迭代基因组编辑系统	NA	开发一种快速、高效的基因组编辑系统，用于P. putida的基因工程	Pseudomonas putida KT2440	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	9次删除、3次替换和2次插入的实验验证
106	2025-01-05	Genetically encoded biosensors for the circular plastics bioeconomy 2024-Dec, Metabolic engineering communications IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.mec.2024.e00255 PMID:39737114	综述	本文综述了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用，包括其开发和应用	提出了基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的双重作用，即促进塑料的生产和回收/升级	文章主要集中于已有生物传感器的总结，缺乏对新技术的深入探讨	探讨基因编码生物传感器在循环塑料生物经济中的应用	塑料前体/单体的生物传感器	合成生物学	NA	基因编码生物传感器	NA	NA	NA
107	2025-01-05	R3Design: deep tertiary structure-based RNA sequence design and beyond 2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae682 PMID:39737572	研究论文	本文介绍了一种基于RNA三级结构的序列设计方法R3Design，该方法在RNA序列设计中优先考虑三级结构，显著提高了序列设计的准确性和效率	R3Design方法首次将RNA序列设计的重点从二级结构转移到三级结构，显著提升了序列恢复率和Macro-F1分数，超越了传统的二级结构设计方法	NA	开发一种基于RNA三级结构的序列设计方法，以推动RNA治疗应用和合成生物学的发展	RNA分子	生物信息学	NA	NA	NA	RNA序列数据	多个数据集
108	2025-01-05	Non-small-molecule therapeutics for drug addiction: From pharmaco-kinetics modulating to synthetic biology 2024-Nov, Fundamental research IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.fmre.2022.09.027 PMID:39734543	研究论文	本文探讨了非小分子疗法在药物成瘾治疗中的应用，从药代动力学调节到合成生物学	提出了通过基因编辑技术进行基因治疗，构建可编程基因开关以响应非法药物，从而实现长期稳定的酶和其他效应蛋白的递送	生物大分子通常不稳定且半衰期短	开发新型有效的药物成瘾治疗方法	药物成瘾患者	合成生物学	药物成瘾	基因编辑技术	NA	NA	NA
109	2025-01-05	Inert splint-driven oligonucleotide assembly 2024, Synthetic biology (Oxford, England) DOI:10.1093/synbio/ysae019 PMID:39734808	研究论文	本文介绍了一种新的寡核苷酸片段组装方法，称为splint-driven assembly reaction	该方法使用了一种一管式的splint-driven组装反应，不同于依赖短且高度纯化的寡核苷酸的聚合酶链式组装和连接酶链式组装	NA	开发一种新的寡核苷酸片段组装方法，用于合成生物学、定向进化、功能蛋白测定等领域	寡核苷酸片段	合成生物学	NA	Oxford Nanopore测序、Sanger测序	NA	DNA序列	741-bp基因片段
110	2025-01-05	Harnessing lactic acid bacteria for nicotinamide mononucleotide biosynthesis: a review of strategies and future directions 2024, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2024.1492179 PMID:39735184	综述	本文综述了利用乳酸菌（LAB）进行烟酰胺单核苷酸（NMN）生物合成的策略和未来方向	本文深入分析了多种代谢工程策略，包括酶优化、途径重连和发酵过程增强，以提高LAB中NMN的产量，并探讨了CRISPR/Cas9和传统方法在关键生物合成途径中的应用	NA	研究目的是开发可扩展且工业相关的NMN生产工艺，以满足不断增长的市场需求	研究对象是乳酸菌（LAB）及其在NMN生物合成中的应用	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, 代谢工程, 发酵过程优化	NA	NA	NA
111	2025-01-05	Engineering Nicotiana benthamiana for chrysoeriol production using synthetic biology approaches 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1458916 PMID:39741678	研究论文	本研究利用合成生物学技术在本氏烟草中生产甲基化黄酮chrysoeriol，并优化了其生物合成途径	通过合成生物学技术将chrysoeriol的生物合成途径从八步缩短至四步，并成功在本氏烟草中实现高效生产	研究仅在本氏烟草中进行，未在其他植物或系统中验证其普适性	提高黄酮类化合物的生产效率，解决其天然含量低和化学合成困难的问题	本氏烟草及chrysoeriol的生物合成途径	合成生物学	NA	合成生物学技术、农杆菌介导的瞬时表达	NA	NA	NA
112	2025-01-05	Research and application of intelligent diagnosis and treatment engineering bacteria 2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2024.1524376 PMID:39744595	研究论文	本文探讨了智能诊断和治疗工程细菌的研究与应用，包括菌株选择、生物传感系统设计和释放策略规划	利用合成生物学技术开发具有增强智能的基因工程细菌，能够自主检测环境信号并表达功能蛋白，结合人工智能、纳米材料和光学技术，拓展了临床应用	NA	研究智能诊断和治疗工程细菌的开发及其在疾病治疗中的应用	智能诊断和治疗工程细菌	合成生物学	代谢疾病、炎症疾病、肿瘤、感染疾病	合成生物学、人工智能、纳米材料、光学技术	NA	NA	NA
113	2025-01-04	Next-Generation Probiotics and Chronic Diseases: A Review of Current Research and Future Directions 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c08702 PMID:39588716	review	本文综述了下一代益生菌（NGPs）在预防和治疗慢性疾病中的当前研究和未来方向	探讨了通过合成生物学和生物信息学设计的NGPs，具有增强的稳定性和生存能力，针对特定疾病状态	传统益生菌的疗效和机制仍不明确，FMT的长期效果仍在研究中	研究NGPs在预防和治疗慢性疾病中的应用	下一代益生菌（NGPs）	微生物组研究	糖尿病、肥胖、心血管疾病	高通量测序、合成生物学、生物信息学	NA	NA	NA
114	2025-01-04	Evolution of Vitamin E Production: From Chemical Synthesis and Plant Extraction to Microbial Cell Factories 2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c08813 PMID:39644244	综述	本文回顾了维生素E生产的演变过程，从传统的化学合成和植物提取方法到尖端的微生物细胞工厂	本文强调了代谢工程和合成生物学在维生素E生物生产中的革命性进展，特别是通过工程微生物细胞工厂的应用	化学合成无法生产特定的立体异构体，且由于化学残留和生物活性有限，其应用仅限于动物饲料；植物提取受限于资源可用性和高种植成本	探讨维生素E生产的演变及其未来发展方向	维生素E的生产方法，包括化学合成、植物提取和微生物细胞工厂	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	NA	NA
115	2025-01-04	The Role of SF1 and SF2 Helicases in Biotechnological Applications 2024-Dec, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-024-05027-w PMID:39093351	review	本文综述了SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制，并探讨了它们在生物技术应用中的潜力	强调了SF1解旋酶中独特的1B和2B结构域及其对酶活性的影响，并讨论了UvrD解旋酶的活性形式及解旋后解离的争议	NA	总结SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制，并探讨其在生物技术中的应用	SF1和SF2解旋酶	生物技术	NA	纳米孔测序、蛋白质测序、等温扩增	NA	NA	NA
116	2025-01-01	Machine Learning-Driven Innovations in Microfluidics 2024-Dec-13, Biosensors DOI:10.3390/bios14120613 PMID:39727877	综述	本文探讨了机器学习在微流体生物传感器设计、制造和应用中的整合，强调了机器学习算法如何通过提高设计准确性、操作效率和管理复杂诊断数据集来增强性能	将机器学习与微流体技术结合，开发出能够自动化实验流程、实时数据分析和支持决策的智能系统	未具体提及研究的局限性	研究机器学习在微流体生物传感器中的应用，以提升其性能和效率	微流体生物传感器	机器学习	NA	机器学习	NA	复杂诊断数据集	NA
117	2024-12-30	Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s00253-024-13379-w PMID:39731599	研究论文	本文通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938的组成型和光调控启动子，并创建了该生物的模块化合成生物学部件集合	结合系统生物学和合成生物学，开发了一种从组学到部件的流程，为非传统微生物提供了有用的生物学见解和遗传工具	部分假定的调控启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性，可能影响其调控效果	研究红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938的光生物学和代谢途径调控，并开发其遗传工具	红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938	合成生物学	NA	转录组学	NA	基因表达数据	不同波长光（红、绿、蓝、紫外）和氧化应激条件下的Xanthophyllomyces dendrorhous样本
118	2024-12-29	Advanced metabolic Engineering strategies for the sustainable production of free fatty acids and their derivatives using yeast 2024-Dec-27, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00473-w PMID:39731138	综述	本文综述了利用酵母进行代谢工程策略以可持续生产游离脂肪酸及其衍生物的研究进展	探讨了酵母利用替代碳源（如CO、甲醇和乙酸）的工程策略，超越了传统的糖类	未提及具体实验数据或案例研究	推动可持续工业脂质生产技术的发展	酵母	代谢工程	NA	合成生物学和代谢工程工具	NA	NA	NA
119	2024-12-29	Enhanced Eicosapentaenoic Acid Production via Synthetic Biological Strategy in Nannochloropsis oceanica 2024-Dec-19, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md22120570 PMID:39728144	研究论文	本研究通过合成生物学策略提高海洋微藻Nannochloropsis oceanica中EPA的产量	首次在Nannochloropsis oceanica中应用合成生物学策略，通过基因过表达和敲除技术显著提高EPA产量	研究仅限于实验室环境，未进行大规模生产验证	提高Nannochloropsis oceanica中EPA的产量	海洋微藻Nannochloropsis oceanica	合成生物学	NA	基因过表达、基因敲除、转录组分析	NA	基因表达数据	NA
120	2024-12-28	Construction and Optimization of Engineered Saccharomyces cerevisiae for De Novo Synthesis of Phloretin and Its Derivatives 2024-Dec-26, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c09893 PMID:39723863	研究论文	本研究通过合理设计和合成生物学方法，构建并优化了用于从头合成根皮素及其衍生物的工程化酿酒酵母	首次在同一宿主中系统比较了三种根皮素生物合成途径，并通过优化酶筛选、菌株工程和协调异源途径与内源代谢，实现了根皮素及其衍生物的最高产量	NA	解决对二氢查耳酮日益增长的需求，并为更复杂衍生物的生物合成奠定基础	根皮素及其衍生物	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA