合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
|
研究论文 | 通过定向进化改造非血红素铁酶实现生物催化的对映选择性C(sp3)-H氟化反应 | 首次成功将植物来源的非血红素酶ACCO重新设计为氟化酶，实现了天然酶不具备的C-F键形成功能 | NA | 开发新型生物催化氟化反应，解决不对称C-H氟化的合成难题 | 非血红素铁酶ACCO及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化，计算研究 | NA | 酶活性数据，计算化学数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药，工业生物技术 |
| 102 | 2025-10-05 |
Inteins: A Swiss army knife for synthetic biology
2024 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108349
PMID:38552727
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综述 | 本文综述了内含肽在合成生物学中的多功能应用及其解决复杂生物挑战的潜力 | 系统阐述分裂内含肽的独特优势（紧凑性、可靠性、正交性等）及其在逻辑运算和遗传电路构建中的创新应用 | NA | 探讨内含肽在合成生物学领域的应用潜力及解决方案 | 内含肽（特别是分裂内含肽）及其蛋白质剪接机制 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质剪接技术 | NA | NA | NA | 内含肽工程 | NA | 逻辑运算电路、遗传计算电路、反馈控制电路 | 医学, 生物技术, 生物医学 |
| 103 | 2025-10-05 |
Rational construction of synthetic consortia: Key considerations and model-based methods for guiding the development of a novel biosynthesis platform
2024 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108348
PMID:38531490
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综述 | 本文系统比较了单培养系统与合成菌群的优缺点，总结了构建合成菌群的关键考量因素，并讨论了指导合成菌群发展的模拟与计算工具 | 提出了结合人工智能和机器学习等新兴技术开发更高效、更具成本效益的合成菌群的新方向 | 合成菌群研究仍处于起步阶段，在稳定合成菌群的设计和构建方面存在诸多挑战 | 指导新型生物合成平台的开发 | 合成菌群（由两个或多个具有互补功能的微生物物种或菌株组成） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、人工智能、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 微生物物种或菌株 | 合成菌群系统 | 工业生物技术 |
| 104 | 2025-10-05 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的单倍体化方法HAnDy，用于高效组装和传递大片段DNA，并成功构建了1.024 Mb的合成辅助染色体 | 开发了绕过自然减数分裂过程的CRISPR/Cas9介导单倍体化方法，建立了无需体外操作的大片段DNA组装传递技术 | NA | 解决大尺度遗传信息重建的挑战，扩展宿主的生物合成能力 | 酵母菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 六种系统发育多样的酵母菌 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 合成辅助染色体，编码542个外源基因的代谢网络 | 工业生物技术 |
| 105 | 2025-10-05 |
Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism
2024-Mar-07, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01740-6
PMID:38454513
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研究论文 | 本研究通过宏基因组分析揭示了大型藻类微生物组中卤素代谢的遗传资源 | 首次系统鉴定了大型藻类微生物组中与卤素代谢相关的基因功能，发现了多个先前未知与有机卤代谢相关的细菌类群 | 研究样本量相对有限，仅涉及3种大型藻类物种 | 探索大型藻类相关原核生物群落如何影响有机卤化分子的代谢命运 | 2种红藻（Sphaerococcus coronopifolius和Asparagopsis taxiformis）和1种褐藻（Halopteris scoparia）的微生物组 | 微生物生态学 | NA | 宏基因组测序，宏基因组组装基因组(MAGs) | NA | 宏基因组数据 | 98个宏基因组组装基因组(MAGs)，来自3种大型藻类 | NA | 大型藻类（红藻和褐藻） | NA | 合成生物学，生物勘探，环境生物技术 |
| 106 | 2025-10-05 |
Genetic Transformation of Plasmid DNA into Escherichia coli Using High Frequency Electromagnetic Energy
2024-01-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c03464
PMID:38194429
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研究论文 | 本文介绍了一种利用高频电磁能介导细菌细胞遗传转化的新技术 | 开发了基于高频电磁能的独特遗传转化方法，具有高效、成本低且生理条件温和的优势 | NA | 开发新型细菌遗传转化技术 | 大肠杆菌JM109细胞和pGLO质粒DNA | 合成生物学 | NA | 高频电磁能转化、共聚焦扫描显微镜、流式细胞术、冷冻透射电子显微镜 | NA | 显微镜图像、流式细胞数据 | NA | 质粒转化 | 大肠杆菌 | GFP报告基因系统 | 医学, 合成生物学 |
| 107 | 2025-10-05 |
Organization of an Artificial Multicellular System with a Tunable DNA Patch on a Membrane Surface
2024-01-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c04249
PMID:38112415
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研究论文 | 开发了一种基于DNA贴片的策略，通过调控膜表面DNA杂交链式反应构建具有高阶结构的人工多细胞系统 | 利用膜表面DNA杂交链式反应开发DNA贴片策略，首次实现通过调控异质性粘附直接构建高阶结构人工多细胞系统 | NA | 开发构建具有可控排列的人工多细胞系统的简便策略 | 人工囊泡和活细胞组成的混合系统 | 合成生物学 | NA | DNA杂交链式反应 | NA | NA | NA | DNA杂交链式反应 | 人工囊泡, 活细胞 | 基于DNA贴片的异质性粘附系统，用于调控囊泡间连接和高阶结构组装 | 合成生物学, 细胞工程 |
| 108 | 2025-10-05 |
LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling
2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01915-z
PMID:39117617
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR激活筛选发现LMO4能增强CD8+ T细胞的干性特征和抗肿瘤能力，并通过合成生物学方法验证其作用机制 | 首次发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路来促进CD8+ T细胞干性，并开发了新的合成生物学工具 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强CD8+ T细胞干性特征以改善T细胞免疫疗法效果的策略 | CD8+ T细胞及其干细胞样记忆T细胞亚群 | 合成生物学 | 肿瘤 | CRISPR激活筛选, CRISPR/Cas9基因编辑, 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | LMO4过表达系统 | 医学 |
| 109 | 2025-10-05 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
|
研究论文 | 开发了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法 | 通过封装无细胞表达系统在巨型单层囊泡中实现膜蛋白重构，并展示信号肽替换对共翻译转运的影响 | 仅使用细菌谷氨酸受体作为模型膜蛋白进行验证 | 开发在合成细胞中重构膜蛋白的方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE) | NA | NA | NA | NA | NA | 膜蛋白重构系统 | 合成生物学,生物传感 |
| 110 | 2025-10-05 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
|
研究论文 | 通过调控藻胆素代谢对蓝藻藻胆蛋白和藻胆体进行功能改造 | 构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型蓝藻菌株PEB1，首次实现可逆的PCB-to-PEB替换并形成稳定的嵌合藻胆体复合物 | 未详细评估工程菌株在自然环境中长期遗传稳定性 | 研究藻胆体在光适应中的结构功能关系及其在合成生物学中的应用 | 淡水蓝藻PCC 7942及其工程改造菌株PEB1 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白表达调控 | NA | 光谱数据、蛋白复合物分析 | 工程菌株PEB1及其对照 | 异源基因表达 | 蓝藻 | PEB生物合成通路（PebA和PebB酶的可控表达） | 可再生能源, 生物工程 |
| 111 | 2025-10-05 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
|
综述 | 本文综述了利用酿酒酵母细胞区室化技术研究和工程化翻译后修饰酶的方法 | 首次详细讨论了酵母内质网区室化技术，并系统比较了不同酵母区室化系统的特点 | 不同系统在测量和控制酶催化效率方面存在各自的局限性 | 开发高通量功能筛选方法以研究和改造翻译后修饰酶 | 翻译后修饰酶（蛋白酶、蛋白连接酶、氧化还原酶、激酶等转移酶） | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、酶介导的转录激活、细胞器区室化 | NA | NA | NA | 酵母表面展示 | 酿酒酵母 | 酶介导的转录激活系统 | 化学生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 112 | 2025-10-05 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
|
研究论文 | 利用蓝光响应EL222和绿/红光响应CcaSR在大肠杆菌中通过多色光调控三种糖酵解途径的代谢通量比例 | 首次实现通过多色光调控三种糖酵解途径（EMP、PP和ED）的代谢通量比例 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制代谢通量分布 | 大肠杆菌中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 代谢通量数据 | NA | EL222, CcaSR | 大肠杆菌 | 光控基因表达系统，包括在启动子区域插入识别序列来调控gnd和edd基因表达 | 工业生物技术 |
| 113 | 2025-10-05 |
Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226
PMID:39328785
|
研究论文 | 本研究通过调控不同结构的水凝胶实现半机械细菌的物理和生化特性控制 | 首次展示了通过调控细胞内水凝胶组分（不同光引发剂、分子量PEG-DA、4臂PEG-DA和dsDNA-PEG）来调控半机械细菌功能与结构的新策略 | NA | 探索通过细胞内材料工程控制半机械细菌功能的新方法 | 半机械细菌（Cyborg Bacteria） | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细胞内PEG基水凝胶架构 | 工业生物技术 |
| 114 | 2025-10-05 |
Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents
2024-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00181
PMID:38733599
|
研究论文 | 开发了一种通过细菌发酵高产率大规模生产功能性siRNA药物的创新生物工程平台 | 采用新型tRNA融合pre-miRNA载体在活宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA药物，实现100%成功率的九种目标分子高水平过表达 | NA | 推进合成生物学领域，为研究和药物开发提供新型功能性siRNA药物生物工程平台 | 小干扰RNA（siRNA）药物 | 合成生物学 | NA | 细菌发酵，分子工程 | NA | NA | 九种目标BioRNA/siRNA分子，每0.25升细菌培养物产量3-10毫克 | NA | 细菌 | tRNA融合pre-miRNA载体系统 | 医学，药物开发 |
| 115 | 2025-10-05 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
|
研究论文 | 通过大规模并行实验分析数百种重编程遗传密码对蛋白质进化能力的影响 | 首次系统证明稳健遗传密码通过创造平滑的适应性景观来增强蛋白质进化能力，并发现标准遗传密码在进化能力方面并非最优 | 进化能力最优化的遗传密码在一定程度上取决于氨基酸序列与蛋白质功能的具体关系 | 探究遗传密码的稳健性对蛋白质进化能力的影响机制 | mRNA序列和蛋白质功能关系 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能分析 | 适应性景观模型 | 序列数据 | 每个景观包含超过1600万条mRNA序列 | 遗传密码重编程 | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 116 | 2025-10-05 |
Deconstructing synthetic biology across scales: a conceptual approach for training synthetic biologists
2024-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49626-x
PMID:38926339
|
研究论文 | 提出一个跨尺度的合成生物学培训框架，用于培养合成生物学人才 | 开发了从分子到社会层面的多尺度解构方法，提供跨学科概念整合工具 | NA | 建立合成生物学教育培训框架 | 合成生物学学生和教育工作者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 117 | 2025-10-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因，在多种细胞类型中产生磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激，且不影响多种天然生物活性，解决了其作为深层组织报告基因的安全性问题 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系，尚未在活体动物模型中进行验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 成像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 小鼠细胞, 人类细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 118 | 2025-10-05 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本研究开发了从天然微生物筛选到异源宿主中实现持续几丁质酶活性的完整流程 | 建立了从天然微生物发现到异源宿主稳定表达的系统性方法，并发现了在胶体几丁质存在时能上调表达的感应响应型启动子 | 未明确说明在非标准宿主中实现长期活性的具体挑战和解决方案细节 | 实现异源宿主中持续几丁质酶活性的稳定表达 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及异源宿主系统 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 海洋水样筛选的微生物 | Gibson Assembly, iGEM | 标准宿主, 非标准宿主 | 感应响应型生物传感器、代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 119 | 2025-10-05 |
Characterization of intracellular membrane structures derived from a massive expansion of endoplasmic reticulum (ER) membrane due to synthetic ER-membrane-resident polyproteins
2024-01-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad364
PMID:37715992
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研究论文 | 本研究通过合成内质网膜驻留多蛋白诱导内质网大规模扩张，系统表征了由此形成的膜结构及其特性 | 首次详细表征了由合成多蛋白诱导的内质网衍生膜区室，揭示了胞质面寡聚化结构域的关键作用及区室与内质网间的扩散屏障 | 研究主要局限于烟草和拟南芥两种模式植物，尚未在其他植物物种中验证 | 探索合成生物学方法改造植物内质网膜结构的可行性及其应用潜力 | 烟草和拟南芥植物细胞中的内质网衍生膜区室 | 合成生物学 | NA | 荧光漂白恢复技术、定量图像分析 | NA | 荧光显微镜图像 | 转基因烟草和拟南芥植株 | 重组蛋白表达 | 烟草, 拟南芥 | 内质网膜驻留多蛋白系统，包含胞质面寡聚化结构域 | 农业, 工业生物技术 |
| 120 | 2025-10-05 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计在两种人类细胞系间具有强差异活性的合成增强子 | 首次将迭代深度学习应用于合成增强子设计，通过实验验证与模型重新优化的循环策略实现细胞类型特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行验证，尚未在更广泛的细胞类型中测试 | 解决合成生物学中基因表达细胞类型特异性靶向的重要问题 | 人类合成增强子序列 | 机器学习 | NA | 深度学习，染色质可及性分析，转录因子结合位点分析，单细胞水平表达分析 | 深度学习模型 | 基因组序列数据，增强子活性数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 人类细胞系 | 合成增强子设计，包含浓缩序列语法和选择性转录因子结合位点词汇 | 医学，合成生物学 |