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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-06-02 |
Self-Assembly of Heterogeneous Ferritin Nanocages for Tumor Uptake and Penetration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309271
PMID:38368258
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研究论文 | 利用合成生物学策略在埃希氏大肠杆菌中构建铁蛋白装配工具箱系统,实现异质铁蛋白纳米笼的可控自组装,并研究其肿瘤摄取和穿透能力 | 首次采用合成生物学方法制造均匀可重复的蛋白质纳米颗粒,通过铁蛋白亚基/变体的胞内组装实现异质组分精准调控,揭示了纳米颗粒配体密度与肿瘤靶向/穿透之间的关系 | NA | 探究纳米颗粒异质性在决定其在生物系统中命运的重要性,特别是配体密度对肿瘤靶向和穿透的影响 | 异质铁蛋白纳米笼(FHn),由人铁蛋白重链(FH)和轻链组成,在埃希氏大肠杆菌中组装 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学装配、铁蛋白亚基组装、体内组装系统 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 埃希氏大肠杆菌 | 铁蛋白装配工具箱系统,用于异质纳米笼的自组装 | 医学 |
| 122 | 2026-06-02 |
Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16
PMID:38066374
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研究论文 | 本文详细介绍了在L型细菌中通过基因工程改造和重启噬菌体的方法 | 提出利用细胞壁缺陷的L型细菌作为宿主,以激活感染革兰氏阳性菌的合成噬菌体基因组,克服了传统转化革兰氏阳性菌的困难 | NA | 开发新型无标记基因组编辑方法,促进治疗性噬菌体的工程化改造 | 噬菌体的基因工程改造和重启技术 | 合成生物学 | 感染性疾病 | 基因工程、噬菌体基因组合成与重启 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | L型细菌(细胞壁缺陷)、革兰氏阳性菌 | NA | 医学(噬菌体疗法) |
| 123 | 2026-06-02 |
Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17
PMID:38066375
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研究论文 | 本文综述了合成生物学领域中用于工程化噬菌体基因组的两种主要策略:噬菌体电穿孔重组工程和酵母为基础的噬菌体工程平台 | 系统比较了两种成功用于遗传改造噬菌体基因组的新技术,突出了合成生物学在开发具有新功能的专用噬菌体方面的进展 | 未说明 | 介绍并比较用于基因工程噬菌体基因组的技术策略 | 噬菌体基因组 | 合成生物学 | NA | BRED、酵母为基础的噬菌体工程 | NA | NA | NA | BRED、酵母工程平台 | 噬菌体、酵母 | NA | 病原体控制与检测、靶向药物递送、新材料组装 |
| 124 | 2026-06-01 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-04-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
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研究论文 | 利用γ修饰肽核酸引导T7核酸内切酶I在特定DNA位点产生双链断裂的新型基因编辑技术 | 首次利用γPNA介导的DNA入侵与T7EI的特异性切割相结合,实现无PAM限制、蛋白尺寸紧凑的可编程核酸酶系统 | 仅完成体外实验验证,未展示体内应用效果 | 开发一种新型基因编辑工具,克服现有技术在PAM依赖性和蛋白大小方面的局限 | γ修饰肽核酸与T7核酸内切酶I组成的复合系统 | 基因编辑 | NA | PNA辅助DNA链入侵技术 | NA | NA | NA | T7核酸内切酶I | NA | PNA导向的T7EI核酸酶系统 | 生物技术, 医学, 农业, 合成生物学 |
| 125 | 2026-05-31 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-04-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 综述了一种通过计算设计代谢网络遗传电路的方法,以优化蛋白质投资下的代谢通量 | 提出了一种基于最大化每单位投资蛋白质通量的方法来推断和设计遗传电路,并用于解释大肠杆菌的天然调控策略 | 仅以大肠杆菌为模型系统进行验证,未涉及真核生物或更复杂的代谢网络 | 理解并计算设计代谢网络的遗传电路,以实现动态条件下的最优代谢适应度 | 大肠杆菌的核糖体表达调控和氨基酸生物合成酶的基因表达控制电路 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 通量优化模型 | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通量调控电路 | 工业生物技术 |
| 126 | 2026-05-31 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-02-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
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研究论文 | 全面表征了一种快速生长的酵母新菌株XP,并为其遗传操作开发了工具箱 | 发现了一种生长速度快于常用研究和工业菌株的酵母新分离株XP,并在基因组、转录组和代谢组层面解析了其快速生长的机制,开发了包括基因插入、删除和倍性转换在内的遗传操作工具箱 | 未明确提及菌株XP在长期工业应用中的稳定性及潜在风险 | 开发快速生长的酵母底盘以促进合成生物学和生物技术应用 | 酵母新分离株XP及其与常用菌株的比较 | 机器学习 | NA | 基因组测序, 转录组测序, 代谢组分析, 基因编辑 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母(Saccharomyces cerevisiae) | L-乳酸生产途径 | 工业生物技术, 材料 |
| 127 | 2026-05-31 |
Genomic imprints of unparalleled growth
2024-02, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19444
PMID:38072860
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研究论文 | 比较了快速生长的沙漠微藻Chlorella ohadii与其他绿藻的基因组,揭示其无与伦比生长速率和抗逆性的基因组印记 | 首次对最快生长藻类C. ohadii进行基因组比较分析,发现其核糖体基因数量多、内含子丰富、密码子偏好性强及特有基因与代谢灵活性和抗光损伤相关 | 未明确讨论基因组特征与生长速率的直接因果关系,且研究仅限于两种绿藻比较 | 探究C. ohadii快速生长和抗逆性的基因组基础及其进化意义 | C. ohadii及其近缘种C. sorokiniana UTEX 1663的基因组 | 基因组学 | NA | 基因组比较分析 | NA | 基因组序列数据 | 两种绿藻基因组 | NA | Chlorella ohadii, Chlorella sorokiniana | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 128 | 2026-05-30 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-10-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
|
研究论文 | 开发了一种智能向导RNA,通过双toehold开关在触发RNA存在时调节荧光素酶表达 | 设计了cis抑制的gRNA合成回路,包含双toehold开关和抑制型CrRNA序列,实现高效特异识别触发RNA并释放CrRNA调控靶基因 | NA | 通过合成生物学平台实现RNA响应性CRISPR/Cas9功能调控 | 智能向导RNA双toehold开关回路 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 双toehold开关回路,cis抑制型gRNA,逻辑门 | 医学 |
| 129 | 2026-05-30 |
Thermo-responsive aqueous two-phase system for two-level compartmentalization
2024-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51043-z
PMID:39117632
|
研究论文 | 提出一种基于热响应性双水相系统的两级区室化方法 | 首次实现基于热响应性双水相系统的两级区室化,模拟真核细胞的层级区室化结构,并通过温度触发产生类似于胶体体的第二级区室 | 未明确提及 | 开发一种模拟活细胞层级区室化的合成系统 | 热响应性双水相系统(包括PNIPAM和DEX) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物化学工程 |
| 130 | 2026-05-30 |
Glutamine-derived peptides: Current progress and future directions
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13386
PMID:38847753
|
综述 | 回顾谷氨酰胺衍生肽在临床、运动和肠内营养中的应用,比较其与单体的功能性效,并探讨基于人工智能的肽组学和合成生物学在新颖设计和规模化生产中的潜在应用 | 综合评估谷氨酰胺衍生肽的结构相关生物活性,并创新性地提出结合人工智能肽组学和合成生物学进行从头设计和规模化生产 | 对谷氨酰胺衍生肽结构-功能关系的理解仍处于探索阶段 | 为谷氨酰胺衍生肽在食品科学中的发现、功能验证和生物制造提供参考 | 谷氨酰胺衍生肽 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品科学, 功能性食品 |
| 131 | 2026-05-30 |
A comprehensive review on novel synthetic foods: Potential risk factors, detection strategies, and processing technologies
2024-07, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13371
PMID:38853463
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综述 | 本文全面综述了新型合成食品的潜在风险因素、检测策略及加工技术 | 首次系统性地整合了四种新型合成食品(植物基食品、培养肉、发酵食品和微藻基食品)在风险因素、检测与加工技术方面的最新进展 | 未来需继续创新和发展新的检测与加工技术,以有效评估这些新型合成食品的安全性 | 为食品行业中新型合成食品的开发和管理提供见解 | 植物基食品、培养肉、发酵食品和微藻基食品 | NA | NA | 酶联免疫吸附测定、生物传感器、色谱法、聚合酶链式反应、等温扩增、微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 132 | 2026-05-30 |
The pAblo·pCasso self-curing vector toolset for unconstrained cytidine and adenine base-editing in Gram-negative bacteria
2024-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1236
PMID:38180826
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研究论文 | 开发了一套用于革兰氏阴性菌中无限制胞嘧啶和腺嘌呤碱基编辑的自消除载体工具集 | 开发了无需同源重组的自消除载体系统,可在单次培养步骤中去除碱基编辑平台,获得无质粒修饰菌株 | NA | 为革兰氏阴性菌的基因组工程提供精确的单核苷酸修饰工具 | 革兰氏阴性菌,如恶臭假单胞菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9碱基编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌及其他革兰氏阴性菌 | 自消除碱基编辑平台 | 工业生物技术 |
| 133 | 2026-05-30 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 评估共转录折叠模拟质量,开发用户友好的BarMap-QA流程以简化RNA共转录折叠动力学分析 | 提出BarMap-QA流程,克服原始BarMap软件在特定共转录折叠场景下的使用困难,通过迭代工作流和多种质量指标监测实现可靠模拟 | 模拟仍基于二级结构粗粒度表示,无法捕捉RNA三级结构细节;案例仅验证合成核糖开关,普适性需进一步测试 | 提升共转录RNA折叠模拟的实用性和可靠性,验证合成生物电路设计 | 共转录折叠过程中的RNA二级结构动态变化 | 计算生物学, 合成生物学 | NA | 马尔可夫过程模拟, BarMap方法, Docker部署 | 马尔可夫模型 | RNA二级结构数据 | 一个合成转录调控型核糖开关作为案例 | BarMap-QA流程 | NA | 合成转录调控核糖开关 | 合成生物学, 计算模拟 |
| 134 | 2026-05-29 |
Enhancing circuit stability under growth feedback with supplementary repressive regulation
2024-02-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1233
PMID:38164993
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研究论文 | 提出在生长反馈下通过添加抑制性调控节点增强双稳态电路稳定性的策略 | 首次提出通过引入一个抑制性调控边缘来使双稳态电路对生长反馈去敏感化的简单控制策略 | 仅进行了仿真和体外实验,缺乏在复杂生物系统中的体内验证 | 研究如何通过额外抑制性调控增强基因电路在生长反馈下的鲁棒性 | 受生长反馈影响的双稳态基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | 双稳态电路模型 | NA | NA | NA | NA | 双稳态电路(含抑制性调控边缘) | 合成生物学 |
| 135 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
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研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统,用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统,无需外源供应荧光素酶底物,并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明,但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统,以优化合成基因回路 | 本氏烟草(N. benthamiana)和拟南芥(推测) | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路,包括植物激素传感器和光遗传传感器等,具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草(N. benthamiana) | 自发光报告回路(NeoLuc/eGFP系统),包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 136 | 2026-05-27 |
The effect of pseudoknot base pairing on cotranscriptional structural switching of the fluoride riboswitch
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae231
PMID:38567721
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研究论文 | 本研究通过实验和模拟揭示假结碱基配对对氟化物核糖开关共转录结构转换的影响 | 首次系统阐明单一摆动碱基对在氟化物核糖开关功能中的关键作用,并利用全原子分子动力学模拟可视化结构转换过程 | 未具体说明其他离子或环境条件对核糖开关功能的影响,且仅限于两种温度变体 | 探究RNA序列变化如何影响共转录折叠过程中的动态构象变化 | 中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体 | 机器学习 | NA | 体外转录, 细胞基因表达分析, 全原子分子动力学模拟 | NA | DNA序列, RNA结构数据, 实验数据 | 多种中温性和嗜热性氟化物核糖开关变体, 具体数量未提供 | NA | 大肠杆菌, 水生栖热菌 | 氟化物核糖开关(含假结适体域和下游终止子表达平台) | 医学, 工业生物技术 |
| 137 | 2026-05-27 |
A pilot oral history of plant synthetic biology
2024-04-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad585
PMID:38163646
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综述 | 通过采访8位植物合成生物学领域的创始人,回顾该领域的起源和早期发展 | 首次通过口述历史的方式记录植物合成生物学的起源和早期发展,为未来的历史研究提供原始资料 | 仅采访了8位创始人,可能无法全面覆盖领域内所有关键人物和事件;作为综述而非系统性分析,可能存在主观性 | 记录植物合成生物学的起源和早期发展历程 | 植物合成生物学领域的8位创始人(来自5个国家和3个大洲) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 访谈记录和事件时间线 | 8位创始人 | NA | NA | NA | 环境科学、能源、农业 |
| 138 | 2026-05-27 |
Novel strategies for drug repurposing
2024, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2024.03.021
PMID:38789188
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评论 | 本文从合成生物学、精准医学和纳米生物技术角度,探讨了药物重定位在癌症精准医学中的新策略,并报告了一种优化的伤口愈合实验方法用于验证药物敏感性和重定位 | 提出了一个优化的伤口愈合实验方法,可用于验证药物敏感性和药物重定位,并以HeLa细胞为基准展示了该方法在限制细胞增殖药物筛选中的应用 | 该方法目前仅在HeLa细胞上验证,未来扩展至实体瘤二维培养和白血病三维培养仍需进一步研究 | 探讨药物重定位在癌症精准医学中的新策略,并提供一种实验方法用于药物筛选和验证 | 药物重定位策略、伤口愈合实验方法、HeLa细胞 | 精准医学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | HeLa细胞 | NA | 医学 |
| 139 | 2026-05-26 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-10-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 利用微生物平台高效生产植物源抗真菌倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建高效微生物细胞工厂可持续生产该抗真菌倍半萜,通过蛋白质工程优化关键酶TPS18提升催化活性和稳定性 | 研究未评估大规模发酵的经济可行性和实际农业应用效果 | 构建微生物平台实现植物源抗真菌倍半萜的高水平生产 | 5-epi-jinkoheremol及其合成酶TPS18 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程,蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸和甾醇生物合成途径优化,转录因子Hac1和mA写入因子Ime4代谢工程策略 | 农业 |
| 140 | 2026-05-26 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-04, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 综述基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在模拟人类神经疾病中的应用 | 利用光遗传学和化学遗传学等合成生物学方法,在细胞层面精准诱导病理状态,模拟多种人类神经疾病,提供传统模型无法实现的新机遇 | 未明确说明具体局限性 | 总结基于光遗传学和化学遗传学的神经疾病动物模型及其未来发展方向 | 光遗传学和化学遗传学动物模型 | NA | 神经疾病, 阿尔茨海默病, 帕金森病, 肌萎缩侧索硬化, 癫痫, 共济失调 | 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学, 化学遗传学 | 动物(未指定具体物种) | 光遗传和化学遗传调控通路 | 医学 |