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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2025-05-29 |
Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13284-2
PMID:39207499
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review | 本文综述了目前可用于改造和增强Ralstonia eutropha生物生产的不同合成生物学技术 | 开发一个合成生物学工具包,赋予Ralstonia eutropha菌株新的能力,用于新颖应用 | NA | 增强Ralstonia eutropha的生物生产能力,用于生产新型生物产品 | Ralstonia eutropha(Cupriavidus necator) | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
122 | 2025-05-29 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过工程改造大肠杆菌使其产生鸟氨酸脂质,以增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次将鸟氨酸脂质(OLs)的合成能力引入原本不具备此能力的大肠杆菌中,并证明其能增强胁迫抗性和生物量产量 | 研究仅针对特定胁迫条件(如pH变化和磷酸盐限制),未涵盖所有可能的非生物胁迫 | 通过改造大肠杆菌的膜脂组成,构建具有增强非生物胁迫抗性的宿主,用于生物技术和合成生物学应用 | 大肠杆菌(Escherichia coli)及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程(表达合成操纵子olsFC)、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程改造的大肠杆菌菌株 |
123 | 2025-05-29 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本研究旨在生产能够体外抑制IIS型限制酶BsaI、BpiI或LguI活性的重组DNA甲基化酶 | 通过克隆和表达来自I型和II型R-M系统的甲基化酶,优化其表达条件,并验证其在体外选择性抑制IIS型限制酶活性的能力 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内应用或更复杂的生物系统 | 开发新型分子和合成生物学工具,特别是用于DNA组装技术 | DNA甲基化酶及其对IIS型限制酶活性的抑制作用 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质表达与纯化、DNA甲基化分析 | NA | NA | 十种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 |
124 | 2025-05-28 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 该研究设计了一种在大肠杆菌中生产(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 结合合成生物学、生物催化和合成化学方法,设计了一个五步工程生物合成途径,用于生产复杂的吲哚生物碱 | NA | 简化对含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物的获取途径 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
125 | 2025-05-23 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定向胆固醇标记的三链DNA作为合成受体,通过H介导的构象变化实现跨膜信号转导的人工信号转导系统 | 利用三链DNA的构象变化模拟天然G蛋白偶联受体的功能动态,实现了跨膜信号转导的多功能应用 | NA | 开发合成生物学中跨膜信号转导的人工系统 | 胆固醇标记的三链DNA和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、选择性光裂解、催化信号放大 | NA | NA | NA |
126 | 2025-05-21 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的Lcm模块,实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的高效转化,并在过程中固定CO2而非释放 | 开发了一种新型的Lcm模块,首次实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的直接转化,并在过程中固定CO2,而非释放 | 目前仅进行了体外验证,尚未在体内大规模应用中验证其效果 | 开发一种新型的乙酰辅酶A同化途径,以提高碳利用效率 | 乙酰辅酶A和丙酮酸的代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
127 | 2025-05-21 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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research paper | 该研究通过设计和合成酵母染色体XIII,探索了其在衰老研究中的应用 | 成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII,并利用SCRaMbLE系统获得20个寿命延长的菌株,揭示了rRNA相关转录因子RRN9上调对寿命的积极影响 | 研究主要基于酵母模型,结果在高等生物中的适用性尚待验证 | 研究酵母衰老的分子机制 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE系统 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 |
128 | 2025-05-19 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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research paper | 介绍了一个包含6144个短合成启动子的库,用于在哺乳动物细胞中大规模并行报告分析 | 设计了一个短于250bp的合成启动子库,能够精确检测和放大转录活性,适用于多种细胞系和刺激 | 未提及具体的技术限制或样本量的局限性 | 开发可调谐的报告基因,用于药物开发、合成生物学和生命科学研究 | 哺乳动物细胞中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子 |
129 | 2025-05-17 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 该研究通过结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在GUVs中的重构,展示了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环以实现合成细胞分裂的潜力 | 结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统,实现了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环,诱导囊泡中段变形和囊泡出芽 | NA | 开发合成细胞自分裂的最小模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)和肌动蛋白环 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白环重构和MinDE蛋白系统 | NA | NA | NA |
130 | 2025-05-13 |
Molecular aspects of regeneration in insects
2024-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.12.011
PMID:38160963
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review | 本文综述了昆虫再生现象的分子机制及其在再生医学中的应用潜力 | 强调了表观遗传调控在昆虫再生过程中的关键作用,并探讨了其在合成生物学和人类健康领域的潜在应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探索昆虫再生的分子基础及其在再生医学中的潜在应用 | 昆虫的再生过程及相关信号分子 | 再生医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
131 | 2025-05-11 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.24.605010
PMID:39091764
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析,探讨了绿藻中多顺反子基因的翻译机制 | 揭示了绿藻中多顺反子转录本通过漏读核糖体扫描机制实现多ORF翻译的新机制 | 研究仅针对两种绿藻,结果在其他物种中的普适性有待验证 | 阐明绿藻中多顺反子基因的翻译调控机制 | 两种分歧绿藻(未指明具体物种)的多顺反子基因位点 | 分子生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组序列数据、荧光报告基因数据 | 两种绿藻的高置信度手动注释双顺反子位点数据集 |
132 | 2025-05-09 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 通过多队列分析肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),研究了炎症性肠病(IBD)患者与健康对照之间的差异 | 发现了一组与IBD显著相关的梭菌衍生BGCs,并通过合成生物学方法鉴定出六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能不足 | 探索肠道微生物组中小分子在IBD发病机制中的作用 | 炎症性肠病(IBD)患者和健康对照的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序、合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个肠道微生物组样本(来自2,033名IBD患者和833名健康对照) |
133 | 2025-05-09 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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review | 本文回顾了合成最小细胞系统的概念,包括信息分子、代谢途径和囊泡繁殖,并与生物细胞进行了比较 | 提出了合成最小细胞系统,展示了递归生长和分裂周期,避免了使用生物细胞的复杂分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装中产生,以及支持这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
134 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 提出了一种将蛋白质-蛋白质接近性与CRISPR-Cas9基因组编辑功能连接的新策略,增强了基因组编辑的可控性 | NA | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件(如蛋白质相互作用)与基因组编辑联系起来 | 人类细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基础编辑, 主要编辑 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
135 | 2025-05-02 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 介绍了一种基于开放硬件的微流体工作流程,用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留 | 采用开源硬件微流体工作流程,提供精确的流量控制和温度管理,增强易用性、稳健性和可访问性 | 研究以大肠杆菌为实验模型,方法的普适性有待进一步验证 | 分析质粒保留,为合成生物学提供技术支持 | 质粒和单细胞微菌落 | 合成生物学 | NA | 微流体技术、荧光显微镜 | NA | 图像数据 | 大量微滴和微菌落 |
136 | 2025-05-02 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从石栎属植物中克隆了查尔酮合成酶基因,并进行了生物信息学分析和功能表征 | 首次从石栎属植物中鉴定出两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2),并验证了其催化合成根皮素的功能 | 仅在大肠杆菌中验证了基因功能,未在植物体内进行验证 | 探索石栎属植物中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能 | 石栎属植物的CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析、生物信息学分析、大肠杆菌异源表达 | NA | 基因序列数据 | 2个CHS基因 |
137 | 2025-04-26 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 该研究利用合成模块化方法在植物中合成动物来源的氨基酸衍生物,以增强植物性饮食的营养价值 | 利用合成模块化框架在植物中成功合成通常仅存在于动物中的肌酸、肌肽和牛磺酸,展示了植物作为可持续生物工厂的潜力 | 引入牛磺酸模块意外抑制了植物半胱氨酸的生物合成,揭示了引入外源途径可能导致的复杂代谢调整 | 开发可持续且环保的方法,通过植物合成动物来源的氨基酸衍生物以增强植物性饮食的营养价值 | 植物代谢途径及动物来源的氨基酸衍生物(肌酸、肌肽和牛磺酸) | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | NA | NA |
138 | 2025-04-26 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 本文展示了一种铱催化的方法,能够直接将简单烯烃和甘氨酸衍生物转化为具有优异区域和立体选择性的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生的N-H单元的本征导向能力,促进铱催化的相邻羰基烯醇化,实现了两个连续立体中心的构建 | NA | 开发一种合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | 简单烯烃和甘氨酸衍生物 | 有机化学 | NA | 铱催化 | NA | NA | NA |
139 | 2025-04-26 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本文报道了利用生物催化聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达能力的聚合物基人工细胞 | 首次利用生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成人工细胞,并展示其蛋白质表达能力 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并探索其功能特性 | 基于聚合物的仿生人工细胞 | 合成生物学 | NA | 生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA |
140 | 2025-04-26 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本文设计了一种基于PYR1的正交化CID模块,具有可重新编程的配体结合特异性 | 开发了正交化的PYR1*/HAB1*模块,具有纳摩尔级敏感度,可用于活体生物传感器和多输入/输出遗传电路 | 未明确提及具体限制 | 扩展PYR1系统,用于植物和真核合成生物学中的多通道CID系统 | 拟南芥和酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、生化和体内分析 | NA | NA | NA |