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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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121 | 2024-12-01 |
Deep learning revealed the distribution and evolution patterns for invertible promoters across bacterial lineages
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae966
PMID:39460615
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepInverton的深度学习模型,用于识别细菌中的可逆启动子(invertons),并分析了其在不同细菌谱系中的分布和进化模式 | 首次使用深度学习模型DeepInverton在不需要测序读取的情况下识别细菌中的可逆启动子,并揭示了其在病原体中的普遍性和在环境适应中的作用 | NA | 研究可逆启动子在细菌中的分布和进化模式 | 细菌基因组和宏基因组中的可逆启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组和宏基因组数据 | 分析了68,733个细菌基因组和9,382个宏基因组,识别出超过200,000个非冗余的可逆启动子 |
122 | 2024-12-01 |
Synthetic translational coupling element for multiplexed signal processing and cellular control
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae980
PMID:39526390
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化的合成翻译耦合元件(synTCE),并将其与从头设计的核糖调节器和脚趾开关集成,用于多路信号处理和细胞控制 | 引入了一种新的合成翻译耦合元件(synTCE),并展示了其在逻辑计算和信号传导中的应用 | NA | 开发定制化的生物系统功能,增强核糖调节器的计算能力和应用性 | 合成翻译耦合元件(synTCE)及其在生物系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
123 | 2024-12-01 |
Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases
2024-Nov-27, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005
PMID:39613152
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研究论文 | 本文通过共表达细胞器间连接蛋白和脂酶,提高了工程化酿酒酵母中脂肪酸的积累 | 开发了一种新的工程策略,通过调控脂滴相关因子和脂酶,显著提高了酿酒酵母中脂肪酸的产量 | NA | 提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力 | 酿酒酵母中的脂肪酸积累 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
124 | 2024-12-01 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-Nov-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本文开发了一种新的自然界不存在的新途径,通过工程化的B12依赖性酰基-CoA变位酶实现CO2依赖的乙酰-CoA同化 | 本文首次提出了一种新的自然界不存在的新途径,称为Lcm模块,该模块直接连接乙酰-CoA和丙酮酸,并且能够固定CO2而不是释放它 | 本文主要在体外证明了Lcm模块的功能,尚未在体内环境中进行全面验证 | 开发一种新的CO2依赖的乙酰-CoA同化途径,以提高生物量产量并减少碳损失 | 乙酰-CoA和丙酮酸的代谢途径 | 代谢工程 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
125 | 2024-12-01 |
Cinnamaldehyde in Focus: Antimicrobial Properties, Biosynthetic Pathway, and Industrial Applications
2024-Nov-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13111095
PMID:39596788
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综述 | 本文综述了肉桂醛(TCA)的抗菌特性、生物合成途径及其在工业中的应用 | 本文探讨了肉桂醛在破坏微生物膜、抑制生物膜形成和调节病原体关键代谢途径中的作用,并介绍了其在化妆品中的应用 | NA | 综述肉桂醛的抗菌潜力及其在工业中的应用 | 肉桂醛的抗菌机制、生物合成途径及其市场和工业应用 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
126 | 2024-11-28 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-Oct-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法来确定生物纳米结构自组装机制的关键参数 | 首次实现了对自组装过程中自催化与自抑制参数的精确计算 | NA | 深入理解生物纳米结构的自组装机制 | 生物纳米结构的自组装过程 | 纳米技术 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
127 | 2024-12-01 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-Oct-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文综述了蛇毒研究领域的最新进展,重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 本文介绍了合成生物学和多组学方法(统称为venomics)在蛇毒研究中的革命性影响,提供了对蛇毒功能及其治疗潜力的更深入理解 | 尽管取得了显著进展,但毒素的功能表征和成本效益型抗蛇毒血清的开发仍然是挑战 | 探讨蛇毒研究的最新技术和应用,强调跨学科合作和新技术的必要性 | 蛇毒及其毒素的分子组成、进化机制和治疗潜力 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学、基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
128 | 2024-12-01 |
The Importance of Biosecurity in Emerging Biotechnologies and Synthetic Biology
2024 Oct-Dec, Avicenna journal of medical biotechnology
DOI:10.18502/ajmb.v16i4.16738
PMID:39606684
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的生物安全、生物安保和网络生物安保问题 | 探讨了合成生物学在设计和开发病原性生物武器方面的潜在风险,并提出了标准化和监管的必要性 | 未提供具体的解决方案或技术细节,主要集中在问题识别和政策建议上 | 评估新兴生物技术和合成生物学中的生物安全风险,并提出标准化和监管的建议 | 合成生物学技术及其在生物安全、生物安保和网络生物安保方面的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
129 | 2024-08-07 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status, developments, and tools in 2024
2024-Mar-01, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2024-0015
PMID:39026464
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
130 | 2024-12-01 |
Development of modular expression across phylogenetically distinct diazotrophs
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae033
PMID:39257030
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研究论文 | 本文报道了优化协议和质粒,用于操纵系统发育多样的固氮菌,以实现合成生物学和基因工程 | 开发了三种广宿主范围的质粒,其中一种特定质粒在测试的细菌中表现出最高的兼容性,并展示了模块化表达和基因组编辑 | 仅在少数固氮菌中进行了测试,尚未广泛应用于农业应用 | 开发用于固氮菌的基因操作工具,以减少对合成肥料的需求 | 系统发育多样的固氮菌 | NA | NA | 基因组编辑 | NA | NA | 测试了三种固氮菌和一种Klebsiella michiganensis M5al |
131 | 2024-11-30 |
Pathway to industrial application of heterotrophic organisms in critical metals recycling from e-waste
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108438
PMID:39218325
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综述 | 本文综述了异养生物在电子废弃物中回收关键金属的工业应用途径 | 讨论了如何通过简单的优化方法和先进的生物技术克服当前的障碍,并展示了新兴技术在生物浸出溶液中进行低成本、低影响、选择性和高级金属回收的潜力 | NA | 探讨异养生物在生物采矿中的应用及其在工业应用中的障碍和解决方案 | 异养微生物及其分泌的金属结合生物分子 | NA | NA | 生物浸出 | NA | NA | NA |
132 | 2024-11-30 |
The biosynthesis of L-phenylalanine-derived compounds by engineered microbes
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108448
PMID:39260779
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综述 | 本文综述了通过工程微生物合成L-苯丙氨酸衍生物的研究进展 | 本文总结了提高L-苯丙氨酸衍生物产量的主要策略,并展望了通过微生物方法合成L-苯丙氨酸衍生物的发展趋势 | 本文主要讨论了L-苯丙氨酸衍生物合成的挑战,如低产量和生产率 | 探讨通过工程微生物合成L-苯丙氨酸衍生物的研究进展及其应用前景 | L-苯丙氨酸及其衍生物,包括苯基丙酮酸衍生物、反式肉桂酸衍生物、对香豆酸衍生物和其他L-苯丙氨酸衍生物(如黄酮类化合物) | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
133 | 2024-11-30 |
Advances in multi-enzyme co-localization strategies for the construction of microbial cell factory
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108453
PMID:39278372
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综述 | 本文综述了多酶共定位策略在构建微生物细胞工厂中的最新进展和应用 | 探讨了酶共定位策略在提高天然产物产量中的应用,并展望了未来结合多种策略与先进技术的研究方向 | 未提及具体实验数据或模型验证 | 探讨多酶共定位策略在生物制造中的应用及其未来发展方向 | 微生物细胞工厂及天然产物生产 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
134 | 2024-11-30 |
Bioengineered heparin: Advances in production technology
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108456
PMID:39326809
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综述 | 本文综述了肝素生物工程生产技术的最新进展 | 介绍了通过代谢工程和合成生物学在原核和真核系统中生产生物工程肝素的新方法 | 生物工程肝素生产中控制分子量和硫酸化模式的挑战 | 探讨肝素生物工程生产技术的最新进展及其在医学研究中的潜力 | 肝素的生产技术及其在治疗炎症、癌症和传染病中的应用 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
135 | 2024-11-30 |
The new chassis in the flask: Advances in Vibrio natriegens biotechnology research
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108464
PMID:39389280
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综述 | 本文综述了近年来在Vibrio natriegens生物技术研究中的进展 | 介绍了Vibrio natriegens作为生物工程工具的新兴潜力,并使用大型语言模型(LLM)和知识图谱加速文献调查过程 | 未具体提及 | 探讨Vibrio natriegens作为生物技术平台的潜力及其在生物工程应用中的影响 | Vibrio natriegens的基本代谢特性、合成生物学工具的开发与表征、系统生物学分析与代谢建模、生物生产与代谢工程以及微生物生态学 | 生物技术 | NA | 大型语言模型(LLM)、知识图谱 | NA | NA | NA |
136 | 2024-11-30 |
Editorial: Recent advances in application of synthetic biology for production of bioactive compounds, volume II
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1517610
PMID:39610939
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
137 | 2024-11-29 |
Regioselectivity switches between anthraquinone precursor fissions involved in bioactive xanthone biosynthesis
2024-Nov-27, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06369d
PMID:39568878
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研究论文 | 研究了生物活性黄酮类化合物的生物合成途径,特别是如何切换蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性 | 首次揭示了通过BruN和BruM酶的协同作用,实现蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性切换 | NA | 探讨生物活性黄酮类化合物的生物合成机制,特别是蒽醌前体在不同键断裂之间的选择性 | 蒽醌前体在生物活性黄酮类化合物生物合成中的键断裂选择性 | 生物化学 | NA | 多蛋白序列比对、定向蛋白质进化、理论模拟、化学捕获、O追踪、X射线晶体结构分析 | NA | 蛋白质序列、化学结构 | NA |
138 | 2024-11-29 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-Nov-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
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研究论文 | 本文开发了一种由DNA折纸体素组成的可编程3D连接模块化系统,展示了多功能的DNA折纸体素池,并实现了快速可逆的结构重构 | 提出了一种新的DNA折纸体素模块化系统,能够实现快速和可逆的3D结构重构,并通过多步装配路径提高了产量 | 当前合成系统在分级装配中的产量较低,且在快速和高效重构不同结构方面存在挑战 | 开发一种能够实现复杂3D纳米结构和设备快速自组装的生物启发式自组装方法 | DNA折纸体素及其在纳米材料和纳米机器人系统中的应用 | 纳米技术 | NA | DNA折纸 | NA | NA | 最多12种独特的DNA折纸体素,组装成50种结构 |
139 | 2024-11-29 |
Advances in biosynthesis of 7-Dehydrocholesterol through de novo cell factory strategies
2024-Nov-25, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131888
PMID:39603472
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综述 | 本文综述了通过从头细胞工厂策略合成7-脱氢胆固醇(7-DHC)的最新进展 | 讨论了优化限速酶、代谢通量、氧化还原平衡和亚细胞定位等合成策略,以及组学技术和基因编辑技术在设计重要蛋白质和菌株改造中的作用 | 尽管讨论了多种策略,但实现更高产量的7-DHC合成仍然是一个重大挑战 | 提供关于7-DHC生物合成当前状态的全面概述 | 7-脱氢胆固醇(7-DHC)的生物合成 | NA | NA | 组学技术、基因编辑技术 | NA | NA | NA |
140 | 2024-11-29 |
Construction of engineered probiotic that adhere and display nanobody to neutralize porcine reproductive and respiratory syndrome virus
2024-Nov-14, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04198-8
PMID:39540965
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研究论文 | 研究构建了一种工程益生菌,能够在表面粘附并展示纳米抗体以中和猪繁殖与呼吸综合征病毒 | 首次提出了一种结合粘附蛋白和纳米抗体的工程益生菌构建策略,具有粘附和中和病毒的双重效果 | NA | 开发一种新型工程益生菌,用于预防和治疗猪繁殖与呼吸综合征病毒感染 | 猪繁殖与呼吸综合征病毒、益生菌L. plantarum和E. coli | 合成生物学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 合成生物学技术 | NA | 基因组数据 | NA |