合成生物学相关文章
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当前共找到 1152 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-12-28 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae018
PMID:39722801
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具，用于减少细菌中非预期基因表达 | CryptKeeper是一个新的软件管道，能够可视化基因表达信号的预测并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 减少细菌中非预期基因表达，以解决克隆挑战和避免实验失败 | 细菌中的非预期基因表达 | 合成生物学 | NA | 计算工具 | NA | DNA序列 | NA |
| 122 | 2024-12-26 |
Bacterial Metallostasis: Metal Sensing, Metalloproteome Remodeling, and Metal Trafficking
2024-Dec-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00264
PMID:39658019
|
综述 | 本文综述了细菌金属稳态的机制，包括金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输 | 提供了金属调节蛋白和金属感应核糖开关的多样性视角，并讨论了其在合成生物学和生物技术中的应用 | 文章指出在金属稳态理解方面仍存在一些空白，需要进一步研究 | 探讨细菌如何通过金属感知、金属蛋白质组重塑和金属运输来维持金属稳态 | 细菌 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 123 | 2024-12-26 |
Intron RPS25Ai, a Novel DNA Element, Has Global Effects on Synthetic Pathway Engineering by Empowering Protein Synthesis
2024-Dec-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11278
PMID:39660479
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研究论文 | 本研究探讨了内含子作为多功能新型生物DNA元件在合成生物学中的潜力，展示了其在转录和翻译层面的时空调控模式，并应用于工程酵母中的异源代谢途径，显著提高了β-胡萝卜素的产量 | 首次将内含子RPS25Ai作为多级调控遗传元件应用于合成生物学，展示了其在转录前和成熟RNA水平的表达增强效果，并实现了基因组规模的调控 | 研究主要局限于酵母细胞，未在其他生物系统中验证其广泛适用性 | 探索内含子作为新型生物DNA元件在合成生物学中的应用潜力 | 内含子RPS25Ai及其在工程酵母中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢途径工程 | NA | 基因表达数据 | 工程酵母细胞 |
| 124 | 2024-12-25 |
Designed to breathe: synthetic biology applications in plant hypoxia
2024-Dec-23, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae623
PMID:39673416
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综述 | 本文综述了近年来在植物低氧响应监测工具方面的进展，特别是通过合成生物学方法设计的新型遗传电路 | 本文介绍了从细菌和动物研究中改编或专为植物设计的氧气响应报告器、染料和纳米探针，并强调了合成生物学视角在设计植物氧气依赖响应遗传电路中的应用 | 本文讨论了在植物低氧生物学领域实施合成生物学解决方案的当前限制和挑战 | 总结植物低氧响应监测工具的最新进展，并探讨合成生物学在植物低氧生物学中的应用 | 植物低氧响应监测工具和合成生物学方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-12-25 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
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综述 | 本文综述了细菌无细胞系统中天然和工程化调控组件及其应用 | 本文系统性地总结了在无细胞系统中实现复杂调控网络的进展，并探讨了其在合成生物学中的应用 | NA | 探讨无细胞系统中调控组件的发展及其在合成生物学中的应用 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-12-25 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学如何推动细菌纤维素（BC）基生物材料的发展，并强调了其在工程化活性材料（ELMs）中的潜力 | 本文创新性地将合成生物学与材料科学结合，探索了细菌纤维素在工程化活性材料中的应用，并讨论了3D生物打印在这一领域的潜力 | 本文主要讨论了合成生物学在细菌纤维素中的应用前景，但未详细探讨具体的技术挑战和实施细节 | 研究合成生物学如何推动细菌纤维素基材料的发展，并探索其在工程化活性材料中的应用 | 细菌纤维素基生物材料及其在工程化活性材料中的应用 | 材料科学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-12-25 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 本文设计并实现了一种在Escherichia coli中合成(+)-Brevianamides A和B的生物合成途径 | 通过结合合成生物学、生物催化与合成化学方法，设计了一条五步的生物合成途径，简化了复杂吲哚生物碱的合成 | NA | 开发一种高效合成(+)-Brevianamides A和B的生物合成途径 | (+)-Brevianamides A和B的生物合成 | NA | NA | 生物合成 | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-12-21 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
|
研究论文 | 本文开发了一种新型αCD206-synNotch受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞之间的相互作用 | 本文首次开发了针对CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch受体，为研究癌细胞与巨噬细胞的相互作用提供了新的工具 | 本文讨论了该受体在应用中的一些意外问题，表明其在实际应用中可能存在局限性 | 开发一种新型合成受体，用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | CD206巨噬细胞和癌细胞 | NA | NA | 合成生物学 | synNotch受体 | NA | 小鼠转移模型 |
| 129 | 2024-12-21 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
|
研究论文 | 本文介绍了一种红光响应的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP，用于细菌的光遗传学研究 | 该系统利用植物光受体PhyA和FHY1以及Cre重组酶的分裂版本，实现了对基因表达和DNA切除的精确控制，并展示了红光在多色控制和穿透性方面的优势 | NA | 开发一种红光响应的Cre重组酶系统，以实现细菌中基因表达和DNA切除的精确控制 | 红光响应的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP及其在细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-12-21 |
Effect of Translation-Enhancing Nascent SKIK Peptide on the Arrest Peptides Containing Consecutive Proline
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00221
PMID:39573840
|
研究论文 | 本文研究了SKIK肽标签对含有连续脯氨酸的终止肽的翻译抑制效应的缓解作用 | 首次展示了SKIK肽标签能够有效缓解WPPP引起的翻译停滞，并揭示了SKIK肽标签与翻译延伸因子P（EF-P）协同促进富含连续脯氨酸蛋白的翻译 | NA | 研究SKIK肽标签对终止肽翻译抑制效应的缓解作用及其机制 | 含有连续脯氨酸的终止肽（如SecM AP和WPPP） | NA | NA | 体外翻译反应 | NA | 蛋白质 | NA |
| 131 | 2024-12-21 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
|
研究论文 | 研究通过改变弹性蛋白样多肽（ELP）长度来调控宏观活体材料的蛋白质基质结构和流变学特性 | 揭示了序列-结构-性质关系，并展示了通过微调基因序列显著改变流变学特性的新设计原则 | 尚未完全阐明序列、结构和流变学特性之间的复杂关系 | 探索如何通过改变弹性蛋白样多肽（ELP）长度来影响活体材料的微结构和粘弹性行为 | 宏观活体材料及其蛋白质基质中的弹性蛋白样多肽（ELP） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2024-12-21 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
|
研究论文 | 本文展示了通过理性设计和定向进化改造的T7 RNA聚合酶，能够在吲哚的生理相关浓度下被激活 | 开发了一种新的化学诱导“停止和启动”平台，称为LARPs，可立即用于合成生物学应用 | NA | 模拟天然酶的特性，开发一种可控的RNA聚合酶用于合成生物学应用 | T7 RNA聚合酶及其在不同细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | 理性设计 定向进化 | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-12-21 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
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研究论文 | 本研究通过在Escherichia coli中利用组合生物合成途径，合成了含有鸟氨酸的乳酸素481类似物 | 本研究首次展示了SyncM酶能够通过识别设计的混合前导肽，催化生成含有鸟氨酸和（甲基）羊毛硫氨酸的活性乳酸素481类似物 | 本研究未详细探讨鸟氨酸在乳酸素481特定位点上的结合限制机制 | 研究旨在通过合成生物学途径，探索OspR和SyncM的底物偏好，并为未来的乳酸素生物工程提供指导 | 乳酸素481及其含有鸟氨酸的类似物的合成与抗菌活性 | NA | NA | 组合生物合成 | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-12-21 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
|
研究论文 | 本研究通过在Komagataella phaffii中使用膜结合的香豆酸特异性二戊烯转移酶AcPT1，实现了生物活性酚丙烷类化合物Artepillin C的从头合成 | 通过增强戊基二磷酸供应途径，显著提高了Artepillin C的产量，并实现了在批次培养条件下创纪录的合成量 | 研究中仍存在香豆酸供应的瓶颈，限制了Artepillin C的进一步产量提升 | 开发一种稳定的合成生物学方法，用于生产具有多种药理益处的Artepillin C | Komagataella phaffii细胞中的Artepillin C合成 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-12-21 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2024-Dec-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
|
研究论文 | 本文报道了一种名为EPDA的合成受体平台，通过理性设计实现基于肽配体识别的可逆细胞反应 | 开发了一种新的计算算法PETEI用于构建候选单体，并设计了EPDA受体平台，能够实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信 | 实验中仅测试了30个单体，可能未涵盖所有潜在的有效配体 | 旨在设计一种能够实现可逆和空间剂量控制的3D细胞-材料通信的合成受体 | 研究对象为基于肽配体识别的合成受体EPDA及其在细胞反应中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 超过2000个候选单体，最终测试了30个单体 |
| 136 | 2024-12-21 |
Strategies and tools to construct stable and efficient artificial coculture systems as biosynthetic platforms for biomass conversion
2024-Dec-19, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02594-2
PMID:39702246
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具构建稳定高效的人工共培养系统作为生物质转化生物合成平台的策略和方法 | 本文重点介绍了近期在生物质转化方面的进展，并提供了未来研究方向的见解 | 维持系统长期的最优种群比例和平衡合成代谢与分解代谢仍然存在挑战 | 探讨如何改进人工共培养系统的稳定性和生产力，以促进生物质转化 | 人工共培养系统及其在生物质转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-12-21 |
Development of a base editor for convenient and multiplex genome editing in cyanobacteria
2024-08-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06696-3
PMID:39143188
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研究论文 | 本文开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，用于在蓝藻中进行快速、精确的C→T点突变和基因失活 | 开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，能够实现快速、精确的C→T点突变和基因失活，并支持多重编辑 | NA | 开发高效的基因编辑工具，以促进蓝藻的遗传解剖和代谢工程研究 | 蓝藻中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 基因组 | 涉及Synechocystis和Anabaena两种蓝藻 |
| 138 | 2024-12-20 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本文通过基因工程改造细菌，抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应，用于癌症免疫治疗 | 开发了一种高色氨酸表达的细菌菌株L-Trp CB，能够在系统给药后严格定植于肿瘤，通过产生丁酸抑制IDO活性，并释放大量色氨酸支持CD8+ T细胞的激活和能量代谢 | NA | 开发一种增强肿瘤免疫治疗的新策略 | IDO抑制剂在癌症治疗中的应用及CD8+ T细胞反应的重编程 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔子的多种肿瘤模型 |
| 139 | 2024-12-20 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-Dec-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本文综述了近年来对天然产物生物合成中异戊烯侧链修饰的酶学机制及其在天然产物多样性和复杂性中的作用 | 本文总结了几种新颖的生物合成机制，如环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、不寻常的C-C键断裂和氧化环化 | NA | 揭示异戊烯侧链修饰在天然产物生物合成中的化学和酶学机制，指导未来在发现、表征和应用这些修饰方面的努力 | 天然产物生物合成中的异戊烯侧链修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-12-20 |
Constructing High-Yielding Serratia marcescens for (-)-α-Bisabolol Production Based on the Exogenous Haloarchaeal MVA Pathway and Endogenous Molecular Chaperones
2024-Dec-19, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c10135
PMID:39699554
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和代谢工程策略，构建了一种高产(-)-α-Bisabolol的Serratia marcescens菌株 | 引入了Haloarchaea类型的甲羟戊酸(MVA)途径和(-)-α-Bisabolol生物合成途径，并成功构建了能够生产(-)-α-Bisabolol的菌株，同时通过敲除基因减少了副产物法尼醇(FOH)的生成，最终在5 L生物反应器中实现了30.2 g/L的(-)-α-Bisabolol产量，创下了最高纪录 | NA | 提高(-)-α-Bisabolol的微生物生产效率 | (-)-α-Bisabolol的生物合成 | 代谢工程 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |