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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
|
研究论文 | 本研究揭示了水包油乳液中脂滴在酶促反应触发下表现出的内吞样行为及其功能应用 | 首次发现脂肪酶触发的人工脂滴内吞样行为,并阐明其由界面张力降低和膜压缩力增加驱动的机制 | NA | 探索人工脂滴的生物物理动态行为及其在合成生物学中的应用 | 水包油乳液脂滴 | 合成生物学 | NA | 酶促反应分析 | NA | 生物物理数据 | NA | NA | NA | 人工脂滴系统 | 工业生物技术,材料 |
| 122 | 2025-10-05 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程菌,展示了增强的光聚焦能力 | 首次利用工程细菌自组装形成聚硅酸盐外壳,创造出具有可调结构特性的活体微透镜 | NA | 开发环境友好型活体微透镜,用于光子器件的光聚焦和操控 | 工程改造的细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、硅酸盐生物矿化技术 | NA | 光学性能数据 | NA | 基因工程 | 细菌 | 硅酸盐酶表达系统,使细菌能够自组装聚硅酸盐外壳 | 光子器件、光学材料 |
| 123 | 2025-10-05 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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综述 | 本文探讨了铁硫酶在合成生物学应用中面临的三大核心挑战及相应解决方案 | 系统归纳了铁硫酶在工程化代谢途径中的三大瓶颈问题,并提出蛋白质结构预测与设计技术有望突破这些难题 | 主要基于文献综述,缺乏实验验证数据 | 开发铁硫酶在合成生物学中的可靠工具包,加速工业级生物合成路径的开发 | 铁硫酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测与设计 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 铁硫酶依赖的生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 124 | 2025-10-05 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-10-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文全面探讨了蛇毒研究领域的最新技术进展,重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 整合合成生物学与多组学方法(统称为毒液组学),深入揭示毒液功能及其治疗潜力 | 毒素功能表征和低成本抗蛇毒血清开发仍面临挑战 | 探索蛇毒分析技术及其生物医学应用 | 蛇毒及其毒素 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 冷冻电镜, mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 125 | 2025-10-05 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
|
研究论文 | 本研究系统分析了生长反馈对适应性基因电路的影响,揭示了电路失效的动力学机制 | 发现了生长反馈下电路失效的三种动力学机制,并识别出对生长反馈具有鲁棒性的电路拓扑结构 | 研究主要基于计算模拟,需要实验验证 | 理解生长反馈对合成基因电路的影响机制,识别鲁棒性电路拓扑 | 转录调控适应性基因电路 | 合成生物学 | NA | 计算模拟,系统拓扑分析 | 动力学模型 | 模拟数据 | 400多种电路拓扑结构 | NA | NA | 适应性基因电路,转录调控网络 | 工业生物技术 |
| 126 | 2025-10-05 |
Protocol for in vitro phospholipid synthesis combining fatty acid synthesis and cell-free gene expression
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103051
PMID:38700978
|
研究论文 | 本文提出了一种在体外结合脂肪酸合成和无细胞基因表达合成磷脂的完整实验方案 | 开发了整合脂肪酸合成与无细胞基因表达系统的体外磷脂合成方法,可在一天内完成反应并通过LC-MS进行定量分析 | NA | 建立体外磷脂合成和定量分析的标准化实验流程 | 磷脂生物分子 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS), 无细胞基因表达 | NA | 质谱数据 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 脂肪酸合成与酰基转移酶表达系统 | 合成生物学, 生物燃料 |
| 127 | 2025-10-05 |
Highly flexible cell membranes are the key to efficient production of lipophilic compounds
2024-08, Journal of lipid research
IF:5.0Q1
DOI:10.1016/j.jlr.2024.100597
PMID:39029799
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综述 | 本文总结了通过细胞膜工程策略构建高柔性细胞膜以促进脂溶性化合物高效生产的研究进展 | 系统归纳了通过构建人工储存区室和改造细胞膜结构两种主要策略增强细胞膜柔性的创新方法 | NA | 探索通过细胞膜工程突破脂溶性化合物生产上限的有效策略 | 微生物细胞工厂中的细胞膜工程 | 合成生物学 | NA | 膜工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 128 | 2025-10-05 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
|
研究论文 | 通过重编程大肠杆菌碳储存调控网络,开发了可实现复杂转录后控制的多层遗传电路 | 利用天然Csr网络相互作用构建转录后逻辑门,实现了在三种工业相关细菌中的跨物种移植 | NA | 开发可编程的转录后调控工具以实现复杂细菌调控 | 大肠杆菌碳储存调控网络及其在工业细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 缓冲门、非门、双向调节器、布尔逻辑门(或门、或非门、与门、与非门)和脉冲发生电路 | 工业生物技术 |
| 129 | 2025-10-05 |
Regulatory Components for Bacterial Cell-Free Systems Engineering
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00574
PMID:39509282
|
综述 | 本文全面概述了细菌无细胞系统中使用的天然和工程化调控组件及其应用 | 系统总结了无细胞系统中调控组件的功能复杂性增长需求,涵盖天然和工程化两类调控组件 | NA | 为细菌无细胞系统工程提供调控组件的全面概述 | 细菌无细胞系统中的调控组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 调控网络、基因电路 | 诊断工具开发、代谢工程 |
| 130 | 2025-10-05 |
Modulating Microbial Materials - Engineering Bacterial Cellulose with Synthetic Biology
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00615
PMID:39509658
|
综述 | 探讨合成生物学如何推动细菌纤维素基生物材料的发展及其在工程活性材料中的应用 | 将合成生物学与细菌纤维素材料相结合,开发具有编程生物功能的新型工程活性材料 | NA | 研究合成生物学在细菌纤维素材料工程化中的应用潜力 | 细菌纤维素及其衍生的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 生物传感器、响应系统 | 生物医学, 材料科学, 工业生物技术 |
| 131 | 2025-10-05 |
Engineering an αCD206-synNotch Receptor: Insights into the Development of Novel Synthetic Receptors
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00149
PMID:39555579
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向CD206巨噬细胞的αCD206-synNotch合成受体,用于研究肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞的相互作用 | 首次开发了专门靶向CD206巨噬细胞的synNotch合成受体,为研究肿瘤转移过程中的细胞间相互作用提供了新工具 | 研究中发现了该受体应用中的意外限制和注意事项 | 开发新型合成受体以研究巨噬细胞与癌细胞在肿瘤转移过程中的相互作用机制 | CD206巨噬细胞、癌细胞、小鼠转移模型 | 合成生物学 | 肿瘤转移 | synNotch受体工程、哺乳动物合成生物学 | NA | NA | NA | synNotch | 哺乳动物细胞 | 合成受体、生物传感器 | 医学 |
| 132 | 2025-10-05 |
Red Light Responsive Cre Recombinase for Bacterial Optogenetics
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00388
PMID:39558834
|
研究论文 | 开发了一种红光诱导的Cre重组酶系统OptoCre-REDMAP,用于细菌光遗传学应用 | 首次将植物光感受器PhyA和FHY1与分裂Cre重组酶结合,创建红光响应系统,实现与蓝光系统的正交控制 | NA | 开发红光响应的光遗传学工具,改善光控基因表达的波长选择性和组织穿透性 | 细菌基因表达控制系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学,基因工程 | NA | NA | NA | Cre重组酶,分裂蛋白系统 | 细菌 | 红光诱导基因表达系统,DNA切除控制 | 工业生物技术 |
| 133 | 2025-10-05 |
Genetically Modifying the Protein Matrix of Macroscopic Living Materials to Control Their Structure and Rheological Properties
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00336
PMID:39601053
|
研究论文 | 本研究通过改变工程活材料中弹性蛋白样多肽的长度,探索其对材料微观结构和粘弹性行为的影响 | 首次系统研究弹性蛋白样多肽长度变化对工程活材料序列-结构-性能关系的影响,揭示了基因序列微调可显著改变材料流变特性的新设计原理 | 研究结果与其他生物复合材料模型缺乏可比性,序列-结构-性能关系较为复杂 | 阐明工程活材料的序列-结构-性能关系,探索基因序列调控对材料性能的影响 | 基于工程菌的厘米级工程活材料及其蛋白基质 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 材料性能数据、显微结构数据 | 三种不同ELP长度的工程活材料变体 | 合成生物学方法 | 工程菌 | 弹性蛋白样多肽(ELP)蛋白基质工程 | 材料 |
| 134 | 2025-10-05 |
Engineered Stop and Go T7 RNA Polymerases
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00627
PMID:39610115
|
研究论文 | 本研究开发了可通过吲哚调控的T7 RNA聚合酶变体,实现精确的转录控制 | 首次实现了全长单亚基T7 RNA聚合酶通过内源性代谢物吲哚的严格调控,创建了新型化学诱导'停走'平台 | NA | 开发受内源性代谢物调控的精确酶活性控制系统 | T7 RNA聚合酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 细菌 | 配体激活核酸聚合酶(LARPs),化学诱导停走平台 | 工业生物技术 |
| 135 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Antimicrobial Ornithine-Containing Lacticin 481 Analogues by Use of a Combinatorial Biosynthetic Pathway in Escherichia coli
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00650
PMID:39660664
|
研究论文 | 本研究在大肠杆菌中构建组合生物合成途径,成功生产含鸟氨酸的乳酸素481类似物并评估其抗菌活性 | 利用具有宽松底物特异性的SyncM修饰酶和新型肽精氨酸酶OspR,首次在乳酸素481中同时引入鸟氨酸和(甲基)羊毛硫氨酸修饰 | 特定位点的羊毛硫氨酸和甲基羊毛硫氨酸形成可能会阻碍鸟氨酸的掺入 | 开发合成生物学策略以增强抗菌肽的化学和功能多样性 | 乳酸素481及其含鸟氨酸的类似物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 组合生物合成、酶催化修饰 | NA | 生物活性数据 | 使用单指示菌株进行抗菌活性评估 | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 组合生物合成途径,包含杂交前导肽设计、酶催化修饰系统 | 医药 |
| 136 | 2025-10-05 |
De Novo Production of the Bioactive Phenylpropanoid Artepillin C Using Membrane-Bound Prenyltransferase in Komagataella phaffii
2024-12-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00472
PMID:39530514
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研究论文 | 本研究利用膜结合异戊烯基转移酶在Komagataella phaffii中实现了生物活性苯丙素类化合物Artepillin C的从头合成 | 首次在Komagataella phaffii中实现Artepillin C的从头合成,通过增强异戊二烯底物途径和优化对香豆酸供应,产量达到目前报道的最高水平 | 对香豆酸供应在工程菌株中仍构成生产瓶颈 | 通过合成生物学方法实现Artepillin C的稳定供应 | Artepillin C生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、分批培养、补料分批培养 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 代谢工程 | Komagataella phaffii | Artepillin C生物合成途径,包含对香豆酸特异性双异戊烯基转移酶AcPT1、异戊烯基二磷酸异构酶和截短型HMG-CoA还原酶 | 医药 |
| 137 | 2025-10-05 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
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研究论文 | 通过工程化细菌孢子的卷曲螺旋相互作用实现宏观材料的组装 | 利用合成生物学方法在孢子表面展示pH响应型自组装蛋白,实现蛋白水平的pH依赖性结合和宏观材料组装 | NA | 设计基于工程化细菌孢子的宏观组装材料 | 工程化细菌孢子及其组装材料 | 合成生物学 | NA | T7驱动表达系统 | NA | NA | NA | T7表达系统 | 细菌孢子 | 表面展示pH响应型自组装蛋白的工程化系统 | 材料 |
| 138 | 2025-10-05 |
Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00140
PMID:39418641
|
研究论文 | 开发了一种使用双质粒mini-Tn5系统在大肠杆菌中稳定整合多拷贝目标基因的方法 | 首次采用双质粒mini-Tn5系统实现目标基因的多拷贝稳定整合,并设计了可移除抗生素抗性基因的标记系统 | 在不同菌株中整合拷贝数存在差异(RecA+菌株19拷贝,RecA-菌株5拷贝) | 开发稳定高效的多拷贝基因整合方法以提高工程微生物代谢产物产量 | 大肠杆菌菌株(MG1655和XL1-Blue MRF') | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 分子生物学数据 | 多种大肠杆菌菌株 | mini-Tn5转座子系统, 双质粒系统 | 大肠杆菌 | 多拷贝基因整合系统,包含可移除抗生素抗性基因标记 | 工业生物技术 |
| 139 | 2025-10-05 |
Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00445
PMID:39444231
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程和实验室进化改造耶氏酵母,使其能够利用甘油高效生产L-苹果酸 | 首次在耶氏酵母中实现L-苹果酸生产,通过过表达内源基因和异源转运蛋白,结合适应性实验室进化提高产量和耐酸性 | NA | 开发耶氏酵母作为L-苹果酸生产的微生物细胞工厂 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 代谢工程,适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 基因过表达,适应性进化 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | L-苹果酸生物合成途径,包括乙醛酸循环途径(异柠檬酸裂解酶、苹果酸合酶、苹果酸脱氢酶)和苹果酸转运蛋白 | 食品工业,化学工业,制药工业 |
| 140 | 2025-10-05 |
Application of a Cell-Free Synthetic Biology Platform for the Reconstitution of Teleocidin B and UK-2A Precursor Biosynthetic Pathways
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00560
PMID:39469830
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研究论文 | 本研究利用植物细胞无蛋白合成系统成功重构了teleocidin B和UK-2A前体两种天然产物的生物合成途径 | 首次在无细胞系统中成功重构了结构复杂程度不同的两种天然产物生物合成途径,并发现TleA与MbtH的直接相互作用 | 未明确说明系统产量与体内系统的比较优势以及规模化应用的可行性 | 开发植物细胞无蛋白合成平台用于天然产物生物合成途径的重构与优化 | teleocidin B-3和UK-2二醇两种天然产物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 细胞无蛋白合成系统 | NA | NA | NA | BY-2系统, 小麦胚芽CFPS系统 | 烟草BY-2细胞, 小麦胚芽 | teleocidin生物合成途径, UK-2A前体生物合成途径(包含10个蛋白质的复杂途径) | 工业生物技术 |