合成生物学相关文章
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当前共找到 101 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism
2024-Mar-07, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01740-6
PMID:38454513
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研究论文 | 本研究通过宏基因组分析揭示了大型藻类微生物组中卤素代谢的遗传资源 | 首次系统鉴定了大型藻类微生物组中与卤素代谢相关的基因功能，发现了多个先前未知与有机卤代谢相关的细菌类群 | 研究样本量相对有限，仅涉及3种大型藻类物种 | 探索大型藻类相关原核生物群落如何影响有机卤化分子的代谢命运 | 2种红藻（Sphaerococcus coronopifolius和Asparagopsis taxiformis）和1种褐藻（Halopteris scoparia）的微生物组 | 微生物生态学 | NA | 宏基因组测序，宏基因组组装基因组(MAGs) | NA | 宏基因组数据 | 98个宏基因组组装基因组(MAGs)，来自3种大型藻类 | NA | 大型藻类（红藻和褐藻） | NA | 合成生物学，生物勘探，环境生物技术 |
| 2 | 2025-10-05 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 开发了一种在合成细胞中重构细菌谷氨酸受体通道的方法 | 通过封装无细胞表达系统在巨型单层囊泡中实现膜蛋白重构，并展示信号肽替换对共翻译转运的影响 | 仅使用细菌谷氨酸受体作为模型膜蛋白进行验证 | 开发在合成细胞中重构膜蛋白的方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFE) | NA | NA | NA | NA | NA | 膜蛋白重构系统 | 合成生物学,生物传感 |
| 3 | 2025-10-05 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母细胞区室化技术研究和工程化翻译后修饰酶的方法 | 首次详细讨论了酵母内质网区室化技术，并系统比较了不同酵母区室化系统的特点 | 不同系统在测量和控制酶催化效率方面存在各自的局限性 | 开发高通量功能筛选方法以研究和改造翻译后修饰酶 | 翻译后修饰酶（蛋白酶、蛋白连接酶、氧化还原酶、激酶等转移酶） | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、酶介导的转录激活、细胞器区室化 | NA | NA | NA | 酵母表面展示 | 酿酒酵母 | 酶介导的转录激活系统 | 化学生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 4 | 2025-10-05 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 利用蓝光响应EL222和绿/红光响应CcaSR在大肠杆菌中通过多色光调控三种糖酵解途径的代谢通量比例 | 首次实现通过多色光调控三种糖酵解途径（EMP、PP和ED）的代谢通量比例 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制代谢通量分布 | 大肠杆菌中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 代谢通量数据 | NA | EL222, CcaSR | 大肠杆菌 | 光控基因表达系统，包括在启动子区域插入识别序列来调控gnd和edd基因表达 | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-10-05 |
Recent progress in stimuli-responsive DNA-based logic gates: Design, working principles and biological applications
2024-Mar, Smart molecules : open access
DOI:10.1002/smo.20230023
PMID:40625523
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综述 | 本文综述了刺激响应型DNA逻辑门的设计原理、工作机制及生物应用的最新进展 | 系统总结了由金属离子、pH、寡核苷酸、小分子、蛋白质和光等多种刺激触发的DNA逻辑门设计 | NA | 探讨刺激响应型DNA逻辑门在合成生物学和纳米技术领域的应用前景 | 基于DNA分子的刺激响应型逻辑门 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | 逻辑门 | NA | NA | NA | NA | 刺激响应型逻辑门（包括与门、或门、非门等逻辑运算单元） | 医学, 合成生物学, 纳米技术 |
| 6 | 2025-10-05 |
An RNA origami robot that traps and releases a fluorescent aptamer
2024-03-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk1250
PMID:38507482
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研究论文 | 本研究利用RNA折纸技术开发了一种名为'Traptamer'的RNA机器人装置，能够机械捕获并释放荧光适配体iSpinach | 首次将RNA折纸技术应用于创建具有传感、计算和执行功能的RNA机器人装置，实现了对RNA功能的可逆控制 | 目前仅为原型验证阶段，尚未在细胞系统中进行功能验证 | 开发能够感知、计算和执行的先进RNA机器人装置以增强对分子过程的控制 | RNA纳米机器人装置及其对荧光适配体的控制机制 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术, 冷冻电镜 | 布尔AND门逻辑电路 | 结构数据, 荧光数据 | NA | RNA折纸 | NA | 具有传感、计算和执行模块的RNA机器人装置，能够可逆控制荧光适配体功能 | 医学, 合成生物学 |
| 7 | 2025-10-05 |
Molecular aspects of regeneration in insects
2024-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.12.011
PMID:38160963
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综述 | 本文综述了昆虫再生现象的分子机制，重点关注伤口愈合和组织再生过程 | 强调了表观遗传调控在再生过程中的关键作用，并探讨了从昆虫再生研究中获得的见解对再生医学和合成生物学的潜在贡献 | NA | 探索和回顾再生的分子基础，以促进再生医学的发展 | 昆虫纲不同目的再生能力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 再生医学, 合成生物学, 人类健康 |
| 8 | 2025-10-05 |
Logic "AND Gate Circuit"-Based Gasdermin Protein Expressing Nanoplatform Induces Tumor-Specific Pyroptosis to Enhance Cancer Immunotherapy
2024-03-05, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c09405
PMID:38377037
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研究论文 | 本研究开发了一种基于逻辑“与门”电路的纳米平台，通过特异性诱导肿瘤细胞焦亡来增强癌症免疫治疗 | 采用合成生物学策略构建了基于Hif-1α和Sox4双输入信号的逻辑“与门”电路，实现肿瘤特异性焦亡诱导 | 未明确说明动物模型类型和长期毒性评估 | 开发具有肿瘤特异性的焦亡诱导系统以增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤细胞和免疫系统 | 合成生物学 | 癌症 | 纳米技术、基因工程 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学电路设计 | 哺乳动物细胞 | 逻辑“与门”电路，以Hif-1α和Sox4为输入信号，gasdermin D诱导焦亡为输出信号 | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Triblock Proteins with Weakly Dimerizing Terminal Blocks and an Intrinsically Disordered Region for Rational Design of Condensate Properties
2024-03, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202306817
PMID:37964343
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研究论文 | 本研究通过蛋白质工程构建具有可调末端二聚化能力的三嵌段蛋白质，用于理性设计生物凝聚体的性质 | 提出通过调控末端结构域的二聚化强度来调节凝聚体形成倾向的新设计原理，同时保持内在无序区域不变 | 末端结构域二聚化强度与扩散速率等物理性质无直接相关性，这些性质需从组成区块的特性和相互作用中理解 | 开发可预测和理性设计功能性生物凝聚体的蛋白质设计方法 | 三嵌段蛋白质结构（包含折叠蛋白质末端区块和内在无序中间区域） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质结构数据、解离常数测量数据 | 一组适合作为末端区块的蛋白质 | NA | NA | 三嵌段蛋白质结构设计，包含弱二聚化末端区块和内在无序区域 | 生物合成材料,合成生物学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Between Centralization and Fragmentation: The Past, Present, and Future of Phage Collections
2024-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1089/phage.2023.0043
PMID:40114810
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综述 | 回顾噬菌体保藏库的历史与现状，探讨集中化与碎片化之间的平衡及其未来发展 | 首次系统梳理噬菌体保藏库的演变历程，并提出在合成生物学和人工智能引发范式转变前建立可持续、互联、公平的噬菌体银行基础设施 | 仅提供非详尽的噬菌体保藏库概览，未涉及具体技术实施方案 | 分析噬菌体保藏库的发展困境并探索未来建设方向 | 噬菌体保藏库和微生物保藏库 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
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研究论文 | 通过结构引导的蛋白质工程将倍半萜环化酶改造为α-红没药醇合酶 | 通过双点突变(F95S-F198S)成功将epi-异缬草烯合酶重新设计为能够生成醇类产物的α-红没药醇合酶 | 产物保真度中等(65%-74%)，需要进一步优化提高特异性 | 开发可用于合成生物学应用的设计型环化酶 | 倍半萜环化酶epi-异缬草烯合酶及其突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学、生化表征 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | 定点突变 | NA | 活性位点重塑以稳定中间体并定位水分子进行羟基化反应 | 工业生物技术 |
| 12 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
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研究论文 | 本研究揭示了子囊菌门真菌中细胞孢酮类化合物的生物合成途径 | 发现了细胞孢酮生物合成基因簇，阐明了S型芳香环环化机制和结构多样性生成机制 | 仅针对特定子囊菌门真菌进行研究，未涉及其他真菌类群 | 解析细胞孢酮类聚酮化合物的生物合成途径 | 子囊菌门丝状真菌及其细胞孢酮生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、组合生物合成、体外酶重构 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 特定子囊菌门真菌 | 组合生物合成 | 子囊菌门丝状真菌 | 聚酮合酶对协作组装S型酰基二羟基苯乙酸核心结构 | 医药 |
| 13 | 2025-10-05 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
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研究论文 | 通过改进葡萄糖6-磷酸脱氢酶变体提高酵母NADPH水平以增强类异戊二烯产量 | 首次采用基因融合策略将G6PD与下游酶6PGL或HMG-CoA还原酶融合，并通过理性诱变获得活性提高的G6PD突变体 | 融合酶活性略低于野生型酶 | 提高NADPH生成效率以增强酵母类异戊二烯生物合成 | 葡萄糖6-磷酸脱氢酶(G6PD)及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因融合、理性诱变、遗传筛选 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | 多种G6PD变体和融合酶构建体 | 基因融合 | 酵母 | 戊糖磷酸途径代谢工程 | 工业生物技术 |
| 14 | 2025-10-05 |
Artificial structural proteins: Synthesis, assembly and material applications
2024-03, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107162
PMID:38308999
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综述 | 本文总结了仿生结构蛋白质的设计生产方法、化学修饰及多尺度组装策略，并探讨其功能定制与应用前景 | 系统阐述如何通过序列和构象编码机械性能，实现从仿生到超越天然结构蛋白质性能的研究视角 | 受生物合成固有局限性和复杂宏观组装模拟难度的制约 | 开发具有优异性能的定制化结构蛋白质及组装体 | 仿生结构蛋白质及其组装体 | 合成生物学 | NA | 模块化蛋白质工程、多肽修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 军事 |
| 15 | 2025-10-05 |
Technologies for studying phase-separated biomolecular condensates
2024-Mar-07, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00020-0
PMID:39883284
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综述 | 概述用于研究生物分子凝聚物（无膜细胞器）的主流技术方法 | 系统梳理了研究生物分子凝聚物这一新兴领域的技术体系，并探讨其在合成生物学等领域的应用前景 | NA | 总结生物分子凝聚物的研究技术现状与发展趋势 | 通过液-液相分离形成的生物分子凝聚物（无膜细胞器） | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术、组分鉴定技术、时空调控分析技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 16 | 2025-10-06 |
Synthetic Biology Meets Ca2+ Release-Activated Ca2+ Channel-Dependent Immunomodulation
2024-03-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060468
PMID:38534312
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综述 | 本文总结了合成生物学工具在精确调控CRAC通道及其免疫相关下游信号通路中的应用 | 首次系统整合合成生物学方法与CRAC通道免疫调节的交叉研究 | 仅涵盖现有研究工具总结，未提出新的实验方案或技术突破 | 探讨合成生物学工具对CRAC通道信号通路的精确调控 | CRAC通道分子组件(STIM/Orai)及其免疫调节功能 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 分子工程、细胞工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 免疫细胞 | CRAC通道信号通路调控 | 医学 |
| 17 | 2025-10-06 |
An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription
2024-03-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00775
PMID:38417105
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法证明基因启动子中的G-四链体结构能够增强基因转录 | 首次在染色体整合的合成启动子中直接证明G-四链体结构形成可刺激基因转录，且效应与序列组成无关 | 研究基于合成报告基因系统，在天然基因组环境中的普遍性需进一步验证 | 探究G-四链体结构对基因转录的调控作用 | 人类细胞中整合的合成报告基因启动子 | 合成生物学 | NA | 染色体整合、合成启动子工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 人类细胞 | 含G-四链体形成序列的合成启动子 | 基础研究 |
| 18 | 2024-12-06 |
Identification and application of a strong bidirectional acmN2p promoter from actinomycin D-producing streptomycetes
2024-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2023.100121
PMID:39628790
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研究论文 | 本文报道了从放线菌中发现的两个高产放线菌素D（ActD）菌株，并鉴定了一个强双向acmN2p启动子，并将其应用于异源表达三个核心基因，用于细菌生物碱bohemamine的生物合成 | 发现了两个高产ActD的放线菌菌株，并鉴定了一个强双向acmN2p启动子，应用于异源表达 | NA | 研究天然产物生物合成的合成生物学应用 | 放线菌素D（ActD）生产菌株和acmN2p启动子 | 合成生物学 | NA | 异源表达 | NA | 基因 | 两个高产ActD的放线菌菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status, developments, and tools in 2024
2024-Mar-01, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2024-0015
PMID:39026464
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-11-11 |
Trading acyls and swapping sugars: metabolic innovations in Solanum trichomes
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.542877
PMID:37333341
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研究论文 | 研究了茄科植物毛状体中特殊的代谢产物——保护性酰基糖的多样性和进化 | 发现了八种具有肌醇或肌醇糖苷核心和羟基酰基链的不寻常结构，并鉴定了一种功能上分化的AcylSugar AcylTransferase 3-Like 1酶 | 仅分析了茄科植物中一小部分物种的酰基糖多样性 | 深入了解茄科植物中酰基糖的化学多样性及其进化和功能 | 茄科植物中的酰基糖及其相关的AcylTransferase酶 | NA | NA | 液相色谱-质谱分析 | NA | 代谢物 | 31个茄科植物物种 | NA | NA | NA | NA |