合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 98 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-06 |
Identification and application of a strong bidirectional acmN2p promoter from actinomycin D-producing streptomycetes
2024-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2023.100121
PMID:39628790
|
研究论文 | 本文报道了从放线菌中发现的两个高产放线菌素D（ActD）菌株，并鉴定了一个强双向acmN2p启动子，并将其应用于异源表达三个核心基因，用于细菌生物碱bohemamine的生物合成 | 发现了两个高产ActD的放线菌菌株，并鉴定了一个强双向acmN2p启动子，应用于异源表达 | NA | 研究天然产物生物合成的合成生物学应用 | 放线菌素D（ActD）生产菌株和acmN2p启动子 | 合成生物学 | NA | 异源表达 | NA | 基因 | 两个高产ActD的放线菌菌株 |
| 2 | 2024-08-07 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status, developments, and tools in 2024
2024-Mar-01, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2024-0015
PMID:39026464
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-11-11 |
Trading acyls and swapping sugars: metabolic innovations in Solanum trichomes
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.05.542877
PMID:37333341
|
研究论文 | 研究了茄科植物毛状体中特殊的代谢产物——保护性酰基糖的多样性和进化 | 发现了八种具有肌醇或肌醇糖苷核心和羟基酰基链的不寻常结构，并鉴定了一种功能上分化的AcylSugar AcylTransferase 3-Like 1酶 | 仅分析了茄科植物中一小部分物种的酰基糖多样性 | 深入了解茄科植物中酰基糖的化学多样性及其进化和功能 | 茄科植物中的酰基糖及其相关的AcylTransferase酶 | NA | NA | 液相色谱-质谱分析 | NA | 代谢物 | 31个茄科植物物种 |
| 4 | 2024-11-07 |
Whispering-Gallery Mode Optoplasmonic Microcavities: From Advanced Single-Molecule Sensors and Microlasers to Applications in Synthetic Biology
2024-Mar-20, ACS photonics
IF:6.5Q1
DOI:10.1021/acsphotonics.3c01570
PMID:38523742
|
研究论文 | 本文探讨了光子等离子体微腔在单分子传感、酶热力学和动力学研究、热光子等离子体传感以及合成生物学中的应用 | 引入等离子体纳米棒增强WGM微腔的倏逝场，实现单分子级别的检测 | NA | 探讨光子等离子体WGM传感在单分子检测和合成生物学中的应用前景 | 单分子蛋白质、构象变化和原子离子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-11-07 |
Cell reprogramming design by transfer learning of functional transcriptional networks
2024-Mar-07, ArXiv
PMID:38495570
|
研究论文 | 本文开发了一种基于转录组数据的迁移学习方法，用于控制细胞行为并设计新的疾病治疗方法 | 通过预训练的转录组数据生成功能网络动力学模型，并将其迁移到特定的重编程目标，创新性地结合了基因扰动的转录反应来最小化初始状态和目标状态之间的转录差异 | 研究主要基于已有的微阵列和RNA测序数据，未涉及实际的细胞实验 | 开发一种基于迁移学习的方法，用于理性设计基于基因扰动和药物反应的新疾病治疗方法 | 人类细胞命运相关的转录组数据和基因扰动反应 | 机器学习 | NA | 迁移学习 | NA | 转录组数据 | 超过9,000个微阵列数据和10,000个RNA测序数据，涵盖54种细胞类型和227种独特扰动 |
| 6 | 2024-11-04 |
Bringing CAM photosynthesis to the table: Paving the way for resilient and productive agricultural systems in a changing climate
2024-Mar-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100772
PMID:37990498
|
研究论文 | 本文探讨了在气候变化背景下，通过引入CAM光合作用途径提高农作物抗旱性和生产力的可能性 | 利用分子生物学、系统生物学和合成生物学的最新进展，提出了一种新的方法来揭示引入CAM特性的最小遗传工具包 | 尚未成功将CAM途径引入C3或C4植物 | 开发能够应对淡水资源减少和温度变化影响的作物 | CAM光合作用途径及其在农作物中的应用 | 分子生物学 | NA | 单细胞组学技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 7 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.582796
PMID:38562818
|
研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9和同源独立靶向整合（HITI）技术将报告基因或治疗基因整合到高表达位点的精度和效果 | 利用骨骼肌中的内源性启动子，通过HITI技术将基因整合到高表达位点，为基因替换疗法提供了新的方法 | 研究主要在老鼠肌细胞中进行，尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的基因替换技术 | 骨骼肌中的肌酸激酶（Ckm）和肌红蛋白（Mb）启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合（HITI） | NA | 基因组, 转录组 | 老鼠肌细胞 |
| 8 | 2024-10-17 |
Pseudomonas putida as a platform for medium-chain length α,ω-diol production: Opportunities and challenges
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14423
PMID:38528784
|
综述 | 本文综述了利用Pseudomonas putida生产中链长度α,ω-二醇的进展，并提出了可持续生产二醇的四模块方法 | 提出了利用Pseudomonas putida作为微生物平台生产中链长度α,ω-二醇的四模块方法 | 尽管取得了进展，但仍存在挑战，如中间产物的毒性等问题 | 探讨利用Pseudomonas putida作为微生物细胞工厂生产中链长度α,ω-二醇的机会和挑战 | Pseudomonas putida和中链长度α,ω-二醇的生产 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-10-17 |
Microbial biotechnology and beyond: A roadmap for sustainable development and climate mitigation in the transition from fossil fuels to green chemistry
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14434
PMID:38465780
|
研究论文 | 本文探讨了微生物技术在从化石燃料向绿色化学转型中的作用，以及其在可持续发展和气候缓解中的重要性 | 强调了微生物在维持生物循环和合成生物学工具在生产非化石燃料和化学品中的创新应用 | 面临非食品残渣和废物的可用性、成本效益的生物处理厂建设、发酵液中产品回收以及剩余木质素利用等挑战 | 推动从化石燃料向绿色化学的转型，实现可持续发展和气候缓解 | 微生物技术、合成生物学工具、非化石燃料和化学品生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-10-16 |
Structure-Based Engineering of a Sesquiterpene Cyclase to Generate an Alcohol Product: Conversion of epi-Isozizaene Synthase into α-Bisabolol Synthase
2024-03-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00681
PMID:38420671
|
研究论文 | 本文通过结构工程改造一种倍半萜环化酶，将其转化为生成醇类产物，即将epi-Isozizaene合成酶转化为α-Bisabolol合成酶 | 本文通过突变活性位点轮廓的残基，重新设计了倍半萜环化酶的催化路径，使其能够生成α-Bisabolol，这是一种新的倍半萜醇类产物 | 本文的研究主要集中在实验室条件下，尚未在实际应用中验证其效果 | 研究目的是通过结构工程改造倍半萜环化酶，生成新的倍半萜醇类产物，扩展其在合成生物学中的应用潜力 | 研究对象是epi-Isozizaene合成酶及其突变体，以及生成的α-Bisabolol | NA | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 涉及的样本包括F95S-F198S EIZS突变体及其复合物 |
| 11 | 2024-10-04 |
Replacing manual operation with bio-automation: A high-throughput evolution strategy to construct an integrated whole-cell biosensor for the simultaneous detection of methylmercury and mercury ions without manual sample digestion
2024-03-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.133492
PMID:38227998
|
研究论文 | 本研究设计了一种生物消化基因电路，并将其集成到汞离子全细胞生物传感器中，创建了一种新颖的现场甲基汞检测方法 | 首次开发了一种无需手动样品消化的甲基汞和汞离子同时检测的全细胞生物传感器 | NA | 开发一种用于现场检测甲基汞和汞离子的新型全细胞生物传感器 | 甲基汞和汞离子的检测 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析 | 全细胞生物传感器 | 基因数据 | 五种不同细菌基因组的烷基汞裂解酶 |
| 12 | 2024-09-30 |
Manipulating gene expression levels in mammalian cell factories: An outline of synthetic molecular toolboxes to achieve multiplexed control
2024-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2023.11.003
PMID:38040288
|
综述 | 本文综述了用于调控哺乳动物细胞基因表达水平的合成生物学工具，并讨论了其在细胞调控层级中的应用 | 强调了理性调控和微调基因表达强度的重要性，以及合成生物学工具在精细调控细胞表型中的应用 | 未提及具体实验数据或结果，主要为理论讨论 | 探讨如何通过合成生物学工具优化哺乳动物细胞系统，以提高生物制药的生产效率 | 哺乳动物细胞，如中国仓鼠卵巢细胞（CHO）和人类胚胎肾293细胞（HEK293） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-09-28 |
[mRNA vaccination, a model of transition from basic biology to medicine]
2024-03-29, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.129
PMID:38231390
|
研究论文 | 本文探讨了mRNA从基础生物学到医学应用的转变过程 | 介绍了mRNA疫苗在控制新冠疫情中的成功应用，并展望了其在应对新兴病原体方面的潜力 | NA | 探讨mRNA从基础研究到医学应用的转变及其在疫苗学中的新范式 | mRNA疫苗及其在控制新冠疫情中的应用 | 生物医学 | 新冠 | mRNA疫苗技术 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-09-26 |
Harnessing the endogenous Type I-C CRISPR-Cas system for genome editing in Bifidobacterium breve
2024-03-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02074-23
PMID:38319094
|
研究论文 | 本文研究了利用内源性I-C型CRISPR-Cas系统在双歧杆菌中进行基因编辑的可行性 | 首次利用内源性I-C型CRISPR-Cas系统在双歧杆菌中实现了基因删除、单碱基替换、基因插入和连续基因编辑 | 研究仅限于特定的双歧杆菌菌株，未涵盖所有双歧杆菌种类 | 开发新的基因编辑工具，以促进双歧杆菌的功能基因组编辑和分析 | 双歧杆菌中的I-C型CRISPR-Cas系统及其在基因编辑中的应用 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因序列 | 五种双歧杆菌菌株 |
| 15 | 2024-09-06 |
Cell reprogramming design by transfer learning of functional transcriptional networks
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2312942121
PMID:38437548
|
研究论文 | 本文开发了一种基于转录组数据的迁移学习方法，用于控制细胞行为，并生成可转移到特定重编程目标的网络动力学模型 | 通过预训练的适应性模型，创新性地改进了现有方法，能够针对特定的重编程转换进行调整 | 需要进一步验证和优化以应对复杂的细胞网络和组合干预的挑战 | 利用合成生物学、下一代测序和机器学习的最新进展，合理设计基于基因扰动和药物反应的新疾病治疗方法 | 人类细胞命运相关的转录组数据，以及微阵列和RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 下一代测序 (NGS), RNA测序 (RNA-seq) | 迁移学习模型 | 转录组数据 | 超过9,000个微阵列数据和超过10,000个RNA测序数据，涵盖54种细胞类型和227种独特扰动 |
| 16 | 2024-08-05 |
Design and Thermodynamics Principles to Program the Cooperativity of Molecular Assemblies
2024-03-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202313944
PMID:37975629
|
研究论文 | 本研究探讨了合成DNA组装体的热力学基础，以编程分子组装的协作性 | 提出了通过融合相互作用域和优化其紧凑性来有效构建可编程的分子组装体 | 关于如何在所需浓度下和适当灵敏度下编程其组装动态的知识仍然有限 | 研究分子组装的设计和热力学原理 | 合成DNA组装体 | 合成生物学 | NA | 合成DNA组装 | 双突变循环分析 | NA | NA |
| 17 | 2024-08-05 |
Synthetic Biology-based Construction of Unnatural Perylenequinones with Improved Photodynamic Anticancer Activities
2024-03-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202317726
PMID:38258338
|
研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学在真菌Cercospora中构建具有改善光动力抗癌活性的非天然苯并蒽醌的方法 | 本文首次通过合成生物学策略在Cercospora中生物合成结构复杂且多样的非天然苯并蒽醌 | 可能尚未全面验证所有合成的非天然产品的生物学特性 | 研究非天然苯并蒽醌的合成以改善其抗癌药物的有效性 | 研究真菌Cercospora及其合成的非天然苯并蒽醌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | 实验数据 | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Light-Oxygen-Voltage (LOV)-sensing Domains: Activation Mechanism and Optogenetic Stimulation
2024-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.168356
PMID:37944792
|
研究论文 | 本文探讨了光氧电压（LOV）传感域的激活机制及其在光遗传学刺激中的应用 | LOV域作为多功能的光感受器，能够非侵入性地感知和控制细胞内过程，具有高时空精度，适用于光遗传学领域 | NA | 研究LOV域的激活机制及其在光遗传学中的应用，推动生物系统研究和新型治疗策略的发展 | LOV域及其在光遗传学中的应用 | 生物技术 | NA | 结构生物学、光谱学、计算方法和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Discovery of a Fungal P450 with an Unusual Two-Step Mechanism for Constructing a Bicyclo[3.2.2]nonane Skeleton
2024-03-27, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01284
PMID:38484171
|
研究论文 | 本文发现了一种真菌P450酶BTG5，能够通过不寻常的两步机制催化形成双环[3.2.2]壬烷结构，用于生物合成beticolin 1。 | BTG5-T318不仅决定了底物选择性，还改变了催化反应，使得反应分为两个独立步骤，揭示了P450酶催化反应的新机制。 | NA | 探索和理解P450酶催化的反应机制，为通过合成生物学扩展此类天然产物多样性铺平道路。 | 真菌P450酶BTG5及其在生物合成beticolin 1中的作用。 | NA | NA | P450酶催化 | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Biosynthesis of Cytosporones in Leotiomycetous Filamentous Fungi
2024-03-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c14066
PMID:38386630
|
研究论文 | 本文通过基因组挖掘揭示了在特定丝状真菌中编码细胞孢子酮生物合成途径的保守基因簇，并通过组合生物合成和体外重建关键反应，阐明了细胞孢子酮结构和生物活性多样性的生成机制 | 本文发现了细胞孢子酮生物合成途径中的新型聚酮合成酶，为组合合成生物学提供了新的酶工具，有助于推动“非天然”天然产物在药物发现中的应用 | NA | 揭示细胞孢子酮的生物合成机制及其结构和生物活性多样性的生成 | 特定丝状真菌中的细胞孢子酮生物合成途径 | 生物化学 | NA | 组合生物合成，体外酶重建 | NA | 基因组数据 | 选择性丝状真菌样本 |