合成生物学相关文章
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当前共找到 98 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Advancing the scale of synthetic biology via cross-species transfer of cellular functions enabled by iModulon engraftment
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46486-3
PMID:38490991
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析大量转录组数据，识别出独立调节的基因集（iModulons），并展示了通过iModulon移植实现跨物种细胞功能的转移 | 首次通过iModulon移植实现了跨物种细胞功能的精确转移，包括生物转化和抗菌抵抗等复杂功能 | NA | 探索通过iModulon移植实现跨物种细胞功能转移的方法，并优化合成生物学中的菌株设计 | 细菌转录组数据和细胞功能转移 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 转录组数据 | 涉及多种Pseudomonas物种和Escherichia coli |
| 62 | 2024-08-07 |
Creating new-to-nature carbon fixation: A guide
2024-Mar, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2023.12.012
PMID:38160747
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综述 | 本文提供了一种关于设计和实现新型自然碳固定途径的实用指南 | 介绍了合成CO固定途径，这些途径比自然途径（如CBB循环）更有效地捕获和转化CO | NA | 旨在设计新的生物功能并扩展自然解决方案空间 | 新型自然碳固定途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Engineering mammalian cell growth dynamics for biomanufacturing
2024-Mar, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.01.006
PMID:38325641
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研究论文 | 本文介绍了一种多层次的细胞工程策略，用于可调节的哺乳动物细胞生长阶段的控制 | 开发了一种结合“油门”和“刹车”系统的双可控系统，实现了哺乳动物细胞生长动态的动态和精确协调 | NA | 精确控制哺乳动物细胞生长动态，以提高生物制药制造 | 哺乳动物细胞 | 生物工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-07 |
Transitions in development - an interview with Nika Shakiba
2024-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202748
PMID:38421607
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访谈 | 本文是对加拿大不列颠哥伦比亚大学Nika Shakiba的采访，她运用合成生物学技术研究干细胞竞争的基础 | NA | NA | 探讨Nika Shakiba的职业生涯及其如何将工程背景应用于干细胞研究 | 干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-07 |
Edible mycelium bioengineered for enhanced nutritional value and sensory appeal using a modular synthetic biology toolkit
2024-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46314-8
PMID:38485948
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研究论文 | 开发了一种用于Aspergillus oryzae的可食用真菌的模块化合成生物学工具包，以提高其营养价值和感官吸引力 | 首次开发了用于可食用真菌Aspergillus oryzae的模块化合成生物学工具包，并成功提高了其内部营养素和风味分子的含量 | NA | 通过合成生物学技术增强真菌食品的营养价值和感官吸引力 | Aspergillus oryzae真菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-07 |
Deep generative design of RNA family sequences
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02148-8
PMID:38238559
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研究论文 | 提出了一种名为RfamGen的深度生成模型，用于高效地设计功能性RNA家族序列 | RfamGen通过整合对齐和共识二级结构信息，能够生成新颖且功能性的RNA家族序列 | NA | 开发一种自动化设计功能性RNA的平台 | RNA家族序列 | 机器学习 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 序列数据 | 使用了多种RNA家族进行实验验证 |
| 67 | 2024-08-07 |
Synthetic biological neural networks: From current implementations to future perspectives
2024-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105164
PMID:38402944
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综述 | 本文综述了合成生物神经网络（SYNBIONNs）的当前实现和模型，并探讨了其未来的发展前景和挑战 | SYNBIONNs在医学、生物传感器、生物技术等领域的应用显示出巨大潜力 | 目前SYNBIONN的实现较为稀少，且主要依赖于在硅中预训练的神经网络和大量人工输入 | 探讨如何成功实现一个可扩展的、能够在线学习的体内生物神经网络 | 合成生物神经网络（SYNBIONNs）及其在不同领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA |
| 68 | 2024-08-07 |
Towards overcoming obstacles of type II photodynamic therapy: Endogenous production of light, photosensitizer, and oxygen
2024-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.007
PMID:38486983
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综述 | 本文综述了通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服传统光动力疗法（PDT）障碍的方法 | 利用合成生物学的进展，通过基因工程细胞内源性生产光、光敏剂和氧气，以提高PDT的效果 | NA | 探讨如何通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服PDT的障碍 | 光动力疗法中的光渗透限制、肿瘤对光敏剂的低摄取以及肿瘤微环境中氧气的缺乏 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-07 |
Multifunctional 5-hydroxyconiferaldehyde O-methyltransferases (CAldOMTs) in plant metabolism
2024-Mar-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae011
PMID:38198655
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综述 | 本文综述了多功能5-羟基松柏醛O-甲基转移酶（CAldOMT）在植物代谢中的作用及其相关蛋白质，并讨论了其在生物炼制、农业和合成生物学中的进化、分子机制和作用。 | CAldOMTs在进化过程中发生了多次新功能化，产生了具有新颖催化活性和/或接受新底物的独特O-甲基转移酶（OMTs）。 | NA | 总结CAldOMTs及其相关蛋白质在植物代谢中的多方面作用，并探讨其在不同领域的应用。 | CAldOMT酶及其在植物代谢中的作用。 | 植物代谢 | NA | O-甲基转移酶（OMT） | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-07 |
Aggregation-Induced Emission Luminogens: A New Possibility for Efficient Visualization of RNA in Plants
2024-Mar-06, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13050743
PMID:38475589
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研究论文 | 本文探讨了利用聚集诱导发光分子（AIEgens）在植物中高效可视化RNA的新技术 | 首次将AIEgens技术应用于植物RNA成像，并结合点击化学和CRISPR/Cas13a系统进行精确RNA修饰 | 需要寻找一种特定的酶，该酶能以AIEgens为底物并通过点击化学反应将其修饰到目标RNA上 | 开发新的技术以提高植物RNA成像的效率和精确性 | 植物中的RNA | 生物技术 | NA | 聚集诱导发光（AIE） | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Promoter screening and identification for metabolic regulation in Acremonium chrysogenum
2024-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300683
PMID:38479986
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研究论文 | 本研究通过分析转录组数据，筛选并验证了27个候选启动子，用于提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产 | 开发了一种快速筛选潜在双向启动子的方法，并利用Golden Gate方法将启动子模块与目标基因结合，成功提高了头孢菌素C的产量 | NA | 提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产效率 | Acremonium chrysogenum中的启动子筛选与代谢调控 | 合成生物学 | NA | Golden Gate方法 | NA | 转录组数据 | 27个候选启动子 |
| 72 | 2024-08-07 |
Tuning capsid formation dynamics in recombinant adeno-associated virus producing synthetic cell lines to enhance full particle productivity
2024-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400051
PMID:38479988
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研究论文 | 本文开发了一种合成生物学平台，用于构建整合了关键病毒基因的细胞系，这些细胞系可以被诱导产生重组腺相关病毒（rAAV），无需质粒转染或病毒转导 | 通过调节基因组扩增和衣壳蛋白合成的动态，显著提高了全颗粒含量，同时保持了高生产力 | NA | 提高重组腺相关病毒的生产效率和全颗粒含量 | 重组腺相关病毒的生产细胞系 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 生物数据 | NA |
| 73 | 2024-08-07 |
Applications of designer phage encoding recombinant gene payloads
2024-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.09.008
PMID:37833198
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研究论文 | 本文讨论了通过基因工程将重组基因有效载荷编码到噬菌体基因组中，以在细菌宿主中表达，从而影响噬菌体与细菌相互作用的潜在结果 | 本文探讨了在噬菌体疗法中使用合成生物学和DNA测序技术的新应用，特别是在多药耐药感染的治疗方面 | 文中指出，异源基因有效载荷的识别及其在转化相关应用中对细菌或人类细胞的影响仍未得到充分探索 | 研究目的是探索和分类重组基因有效载荷在噬菌体基因工程中的潜在应用 | 研究对象包括噬菌体、细菌以及通过基因工程引入的重组基因有效载荷 | 合成生物学 | NA | DNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 74 | 2024-08-07 |
Intellectual property and funding: fueling Chinese synbio
2024-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.012
PMID:37980185
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研究论文 | 本文探讨了中国合成生物学领域中知识产权与资金支持的相互作用及其对创新和商业化的推动作用 | 强调知识产权与资金支持在中国合成生物学发展中的关键作用 | NA | 分析中国合成生物学领域的知识产权与资金支持的现状及其政策影响 | 中国合成生物学领域的知识产权与资金支持 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-07 |
Machine Learning and Deep Learning in Synthetic Biology: Key Architectures, Applications, and Challenges
2024-Mar-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.3c05913
PMID:38463314
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综述 | 本文综述了机器学习（ML）和深度学习（DL）在合成生物学中的关键架构、应用和挑战 | 探讨了ML和DL在合成生物学中的协同作用，如利用DNA合成生成大数据集训练模型，以及利用ML/DL模型指导设计 | 描述了ML/DL和合成生物学发展中遇到的挑战及其解决方案 | 旨在探讨机器学习和深度学习在合成生物学中的应用及其面临的挑战 | 主要研究对象包括生物系统中的途径、酶和整个细胞 | 合成生物学 | NA | 机器学习（ML），深度学习（DL） | 人工神经网络（ANNs） | DNA数据，显微镜数据，蛋白质结构数据 | NA |
| 76 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approach revealed enhancement in haeme oxygenase-1 gene expression by codon pair optimization while reduction by codon deoptimization
2024-Mar, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000001465
PMID:38463112
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研究论文 | 本研究通过操纵密码子和密码子对偏倚，重新编码血红素氧合酶-1（HO-1）基因，以减少和增强HO-1基因表达，并评估了这些构建体在不同组织中的基因表达效果。 | 本研究首次通过密码子对优化和密码子去优化策略，有效调节HO-1基因表达，为基因治疗提供了新的方法。 | 本研究仅在实验室条件下评估了HO-1基因表达的调节效果，尚未进行临床试验验证其治疗效果。 | 研究旨在通过密码子使用偏倚和密码子对偏倚的操纵，调节HO-1基因表达，以治疗与HO-1表达失调相关的疾病。 | 研究对象为血红素氧合酶-1（HO-1）基因及其在脑、心、胰腺和肝脏中的表达。 | 合成生物学 | NA | 密码子使用分析 | NA | 基因序列 | 四个组织（脑、心、胰腺和肝脏） |
| 77 | 2024-08-07 |
Sustainable production of natural products using synthetic biology: Ginsenosides
2024-Mar, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2023.12.006
PMID:38465212
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法在微生物中生产人参皂苷的最新进展 | 合成生物学为大规模可持续生产具有生物活性的天然产物提供了新途径 | NA | 探讨合成生物学在生产具有增强治疗特性的人参皂苷中的应用 | 人参皂苷及其在医药领域的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-07 |
Cas9-assisted biological containment of a genetically engineered human commensal bacterium and genetic elements
2024-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45893-w
PMID:38453913
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Cas9辅助的生化抑制系统，用于控制遗传工程改造的人类共生细菌的生物安全 | 开发了一种结合胸苷营养缺陷、工程化核糖调节器（ER）和CRISPR装置（CD）的Cas9辅助生化抑制系统，有效防止了遗传元素的横向转移和转基因的扩散 | NA | 旨在为遗传工程改造的细菌提供强大的生物抑制，确保其在生物医学中的安全应用 | 人类肠道共生细菌Bacteroides thetaiotaomicron | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-07 |
Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism
2024-Mar-07, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01740-6
PMID:38454513
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研究论文 | 本研究通过分析红藻和褐藻的微生物组，揭示了与卤素代谢相关的遗传资源 | 发现了多种与脱卤作用相关的基因，特别是具有水解功能的基因，以及一些以前未与有机卤素代谢联系的细菌群，如Caulobacterales, Geminicoccales, Granulosicoccales和Microtrichales | NA | 探索与藻类相关的原核生物群落的遗传信息如何影响有机卤化合物的命运 | 红藻和褐藻的微生物组 | 生物技术 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因数据 | 2种红藻（Sphaerococcus coronopifolius和Asparagopsis taxiformis）和1种褐藻（Halopteris scoparia）的微生物组 |
| 80 | 2024-08-07 |
Affinity-assisted covalent self-assembly of PduQ-SpyTag and Nox-SpyCatcher to construct multi-enzyme complexes on the surface of magnetic microsphere modified with chelated Ni2
2024-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.129365
PMID:38218263
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research paper | 研究了PduQ-SpyTag和Nox-SpyCatcher在磁性微球表面通过亲和力和共价键自组装形成多酶复合体的特性 | 提出了一种在磁性珠表面自组装SpyTag/SpyCatcher融合蛋白的简单有效策略，为体外快速构建固定化多酶复合体提供了新方法 | NA | 设计并构建用于体外合成生物学的固定化多酶复合体系统 | PduQ-SpyTag和Nox-SpyCatcher在磁性微球表面的自组装特性及多酶复合体的共催化特性 | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher共价结合 | NA | 磁性微球 | NA |