合成生物学相关文章
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当前共找到 77 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-07 |
Strategies in engineering sustainable biochemical synthesis through microbial systems
2024-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102493
PMID:38971129
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综述 | 本文综述了通过系统和合成生物学耦合，结合人工智能和代谢工程，实现微生物系统可持续生化合成，以替代化石燃料衍生化学品并推动绿色生物技术的发展 | 强调人工智能与代谢工程的集成，以实现数据驱动的生物合成途径精确设计，并讨论了当前限制及优化策略 | 未指明具体实验数据或案例验证，仅基于现有文献总结，可能缺乏定量评估 | 探讨战略性地工程化微生物系统，以促进可持续化学品的生产，并推动绿色生物技术领域发展 | 微生物系统及其生物合成能力 | 合成生物学、系统生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境、能源、工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-07 |
Biosynthesis and recruitment of reactive amino acids in nonribosomal peptide assembly lines
2024-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102494
PMID:38936328
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综述 | 本文综述了非核糖体肽组装线中反应性氨基酸的生物合成及招募机制，并探讨了其在药物开发中的应用 | 系统总结了反应性氨基酸的多种生物合成途径及其整合到非核糖体肽中的不同机制，并结合蛋白质工程提出了合成生物学和生物正交化学的新机遇 | 未提供实验数据或具体案例分析，主要基于已有文献总结 | 探讨非核糖体肽中反应性氨基酸的生物合成与招募机制，以促进药物候选物的开发 | 反应性氨基酸及其在非核糖体肽合成中的生物合成酶和整合机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | 蛋白质工程 | NA | 非核糖体肽合成途径 | 医学 |
| 3 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-08, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-08-24 |
Functional and structural characterization of an IclR family transcription factor for the development of dicarboxylic acid biosensors
2024-08, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17149
PMID:38696354
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研究论文 | 本文对IclR家族的PcaR转录因子进行了功能和结构表征，并在酿酒酵母中构建了生物传感器遗传电路。 | 首次报道了PcaR在无配体和与琥珀酸复合状态下的晶体结构，揭示了该转录因子识别二羧酸的机制，并展示了其在真核生物酿酒酵母中的体内生物传感器应用。 | 摘要中未提及研究的局限性。 | 为开发二羧酸生物传感器提供关键的结构和功能见解，并深化对IclR调控因子家族的理解。 | IclR家族的PcaR转录因子及其配体琥珀酸。 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、体外功能分析、基因电路构建 | NA | 晶体结构数据、基因表达数据 | NA | 基因电路构建（未具体指明，如CRISPR等） | 酿酒酵母 | PcaR作为体内生物传感器的遗传电路 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 5 | 2026-08-20 |
The art of designed coiled-coils for the regulation of mammalian cells
2024-08-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.06.001
PMID:38971158
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综述 | 本文综述了卷曲螺旋（CC）二聚体模块在哺乳动物细胞合成生物学中的应用，涵盖合成生物回路设计、转录和变构调控、细胞组装、CAR-T细胞调控及基因编辑等方面 | 强调CC模块作为模块化构建块在精确控制和可调性方面的潜力，并展示其在创新治疗和生物医学应用中的最新进展 | 未提及具体局限性，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 探讨CC在哺乳动物细胞中的多样化应用，以推动对细胞过程的理解和调控 | 卷曲螺旋（CC）二聚体模块及其在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 合成生物回路设计，包括转录调控、变构调控、细胞组装、CAR-T细胞调控和基因编辑 | 医学、生物医学 |
| 6 | 2026-05-30 |
Thermo-responsive aqueous two-phase system for two-level compartmentalization
2024-08-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51043-z
PMID:39117632
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研究论文 | 提出一种基于热响应性双水相系统的两级区室化方法 | 首次实现基于热响应性双水相系统的两级区室化，模拟真核细胞的层级区室化结构，并通过温度触发产生类似于胶体体的第二级区室 | 未明确提及 | 开发一种模拟活细胞层级区室化的合成系统 | 热响应性双水相系统（包括PNIPAM和DEX） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物化学工程 |
| 7 | 2026-05-11 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-08-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
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研究论文 | 利用MuMi分析解读GB1蛋白单点突变景观及其对IgG-Fc结合的影响 | 提出MuMi（Mutation and Minimization）作为一种可靠且计算高效的蛋白质适应度景观预测工具，相比传统方法具有显著优势 | NA | 揭示GB1蛋白单点突变影响其与IgG-Fc结合亲和力的分子基础 | 链球菌蛋白G的C2片段（GB1）及其与人类IgG Fc域的结合 | 计算生物学 | NA | MuMi分析，分子动力学模拟（MD） | NA | 蛋白质序列与结构数据 | 所有可能的单点突变（数量未明确）及野生型GB1的2微秒分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 药物设计，合成生物学 |
| 8 | 2026-05-09 |
Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51511-6
PMID:39187482
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研究论文 | 介绍了一种名为EasIFA的多模态深度学习算法，用于高效准确地注释酶活性位点 | 通过融合蛋白质语言模型和3D结构编码器的潜在酶表示，并使用多模态交叉注意力框架对齐蛋白质信息与酶反应知识，实现速度与精度的双重提升 | 未明确提及，但可能涉及对稀疏高质量数据库的建模能力依赖或泛化性验证不足 | 开发快速准确的酶活性位点注释方法，解决现有算法在速度和精度之间的权衡问题 | 酶的活性位点注释及其在药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 多模态深度学习模型（包含蛋白质语言模型和3D结构编码器） | 序列和3D结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 9 | 2026-04-10 |
Identification, Design, and Application of Noncoding Cis-Regulatory Elements
2024-08-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080945
PMID:39199333
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综述 | 本文综述了非编码顺式调控元件的识别、设计与应用，强调了其在生物功能调控中的核心作用及技术进展 | 整合了ENCODE项目、高通量检测技术（如大规模并行报告基因分析）和深度学习算法（特别是大型语言模型），用于顺式调控元件的预测与从头设计 | NA | 探讨顺式调控元件的识别、功能解析及其在基因治疗、育种和合成生物学中的应用 | 顺式调控元件及其与转录因子、RNA结合蛋白和非编码RNA的相互作用 | 计算生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析、深度学习算法、大型语言模型 | 大型语言模型 | 功能基因组数据、核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-19 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文通过单分子力谱技术结合微流控增强光阱和粗粒度模拟，研究了toehold介导的链置换过程的单分子动力学 | 首次在单分子水平上实时观察TMSD过程，实现了微秒和纳米级分辨率，并揭示了序列效应在链置换中的重要性 | NA | 探究toehold介导的链置换在单分子层面的动力学特性 | DNA和RNA链的toehold介导链置换过程 | NA | NA | 单分子力谱、微流控增强光阱、粗粒度模拟 | NA | 力谱数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 核酸纳米技术、合成生物学 |
| 11 | 2026-03-03 |
Intestinal Delivery of Probiotics: Materials, Strategies, and Applications
2024-08, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202310174
PMID:38245861
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综述 | 本文综述了用于肠道递送的益生菌类型、不同的益生菌封装策略（化学、物理、遗传策略及其组合）以及使用纳米涂层方法的新兴单细胞封装策略的最新进展 | 讨论了纳米技术如何提高益生菌在肠道递送中的存活率和抗逆性，并强调了合成生物学为高效、有目的地设计和操控益生菌创造的新机遇 | NA | 探讨益生菌的肠道递送材料、策略及其应用，以应对益生菌在加工、口服摄入和肠道递送过程中的存活与定植难题 | 用于肠道递送的益生菌 | NA | NA | 纳米技术，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 12 | 2026-01-17 |
Reduction-to-synthesis: the dominant approach to genome-scale synthetic biology
2024-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.008
PMID:38423803
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综述 | 本文综述了基因组规模合成生物学中自上而下缩减和自下而上合成的双轨方法，重点讨论了基于工业菌株构建缩减基因组及其在生物技术应用中的潜力 | 提出了缩减至合成的主导方法，并整合了自上而下缩减和自下而上合成的双轨策略，以构建合成表型用于生物技术应用 | NA | 探讨缩减基因组的构建方法及其在生物技术中的应用前景 | 细菌基因组，特别是工业常用菌株的缩减基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组缩减与合成技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌，包括工业菌株 | NA | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-01-13 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本研究展示了将工程细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 首次将工程细菌作为活体生物传感器集成到皮肤纹身中，实现了对生化线索和生物物理线索的双重检测 | 研究仅在皮肤模型中进行验证，尚未进行活体动物或人体试验 | 开发基于工程细菌的活体纹身生物传感器平台 | 工程细菌、水凝胶微珠、皮肤模型 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、RNA温度计 | NA | 荧光信号 | NA | 遗传电路 | 细菌 | 生物传感器、感应/响应功能 | 医学 |
| 14 | 2025-11-08 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
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研究论文 | 本研究探索了从头设计的微型结合蛋白在合成生物学传感工具中的广泛应用潜力 | 首次系统验证微型结合蛋白可适配多种细胞工程工具，相比传统抗体具有独特表位靶向能力和更快生产周期 | 研究主要聚焦于SARS-CoV-2 Spike蛋白和EGFR靶点，尚未验证对其他抗原的普适性 | 拓展合成生物学中抗原传感工具的种类和性能 | 微型结合蛋白及其在合成受体中的应用 | 合成生物学 | COVID-19, 癌症 | 蛋白质从头设计, 细胞工程 | NA | 实验数据 | NA | synNotch, SNIPR, CAR | 哺乳动物细胞, T细胞 | 合成受体, 抗原传感器, 嵌合抗原受体 | 医学, 治疗性细胞工程 |
| 15 | 2025-10-30 |
Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176
PMID:39079313
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综述 | 回顾酵母合成生物学在推动G蛋白偶联受体（GPCR）研究和药物开发方面的最新进展 | 利用酵母合成生物学技术为GPCR研究提供新的概念突破和技术创新 | NA | 解决GPCR信号传导、药理学和结构生物学研究中的挑战 | 人类G蛋白偶联受体（GPCRs） | 合成生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学, 生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Computational tools for plant genomics and breeding
2024-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2578-6
PMID:38676814
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综述 | 本文综述了植物基因组学和作物育种领域的计算工具及其应用进展 | 整合高通量测序与数据科学技术，在基因组组装、注释和表观遗传分析等方面取得突破，并推动作物复杂性状遗传解析、比较基因组学及深度学习生物序列设计三大发展方向 | NA | 探讨计算工具在植物基因组学与育种中的应用与发展方向 | 植物基因组与作物育种技术 | 生物信息学 | NA | 高通量测序, 深度学习 | 深度学习 | 基因组数据, 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 17 | 2025-10-05 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨如何利用系统生物学和合成生物学方法协调植物激素信号传导以优化植物生长、发育与环境响应 | 整合系统生物学、单细胞测序与合成生物学方法解析基因多效性现象 | NA | 开发协调植物生长、发育与环境响应的基因工程策略 | 植物激素信号传导网络与基因多效性现象 | 合成生物学 | NA | 单细胞测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR | 植物 | 激素信号传导通路模块 | 农业 |
| 18 | 2025-10-05 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 通过定向进化改造非血红素铁酶实现生物催化的对映选择性C(sp3)-H氟化反应 | 首次成功将植物来源的非血红素酶ACCO重新设计为氟化酶，实现了天然酶不具备的C-F键形成功能 | NA | 开发新型生物催化氟化反应，解决不对称C-H氟化的合成难题 | 非血红素铁酶ACCO及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化，计算研究 | NA | 酶活性数据，计算化学数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药，工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
LIM-domain-only 4 (LMO4) enhances CD8+ T-cell stemness and tumor rejection by boosting IL-21-STAT3 signaling
2024-08-09, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01915-z
PMID:39117617
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR激活筛选发现LMO4能增强CD8+ T细胞的干性特征和抗肿瘤能力，并通过合成生物学方法验证其作用机制 | 首次发现LMO4通过增强IL-21-STAT3信号通路来促进CD8+ T细胞干性，并开发了新的合成生物学工具 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强CD8+ T细胞干性特征以改善T细胞免疫疗法效果的策略 | CD8+ T细胞及其干细胞样记忆T细胞亚群 | 合成生物学 | 肿瘤 | CRISPR激活筛选, CRISPR/Cas9基因编辑, 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | LMO4过表达系统 | 医学 |
| 20 | 2025-10-05 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 通过调控藻胆素代谢对蓝藻藻胆蛋白和藻胆体进行功能改造 | 构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型蓝藻菌株PEB1，首次实现可逆的PCB-to-PEB替换并形成稳定的嵌合藻胆体复合物 | 未详细评估工程菌株在自然环境中长期遗传稳定性 | 研究藻胆体在光适应中的结构功能关系及其在合成生物学中的应用 | 淡水蓝藻PCC 7942及其工程改造菌株PEB1 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白表达调控 | NA | 光谱数据、蛋白复合物分析 | 工程菌株PEB1及其对照 | 异源基因表达 | 蓝藻 | PEB生物合成通路（PebA和PebB酶的可控表达） | 可再生能源, 生物工程 |