合成生物学相关文章
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当前共找到 80 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-04-04 |
Polymerase-Based Signal Delay for Temporally Regulating DNA Involved Reactions, Programming Dynamic Molecular Systems, and Biomimetic Sensing
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400142
PMID:38676334
|
研究论文 | 本研究通过DNA聚合酶（DNAP）的信号延迟技术，实现了对DNA参与反应的时空调控，编程动态分子系统及仿生传感 | 首次通过分子动力学模拟分析和荧光测定表征DNAP的催化活性，并开发了包括引入引物悬垂、使用抑制试剂和改变DNA模板长度等新策略，实现了信号链释放的延迟 | 研究主要局限于体外实验，尚未在活体系统中验证其应用效果 | 探索DNAP催化反应在时空调控DNA参与反应、动态分子信号建立及目标基因多重检测中的应用 | DNA聚合酶（DNAP）及其催化的DNA链置换反应 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟分析、荧光测定 | NA | 分子信号数据 | NA |
| 2 | 2025-04-04 |
Synthetic Cells from Droplet-Based Microfluidics for Biosensing and Biomedical Applications
2024-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400086
PMID:38563581
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综述 | 本文综述了基于液滴微流控技术制备合成细胞的最新研究进展及其在生物传感和生物医学应用中的潜力 | 结合微流控技术与自下而上的合成生物学，实现了从简单结构到更高层次结构的批量合成细胞模型的可重复和可调构建 | 合成细胞研究的挑战和未来发展仍需进一步探讨 | 探讨合成细胞的制备及其在生物传感和生物医学领域的应用 | 合成细胞，包括脂质囊泡（脂质体）、聚合物囊泡（聚合物体）、凝聚微滴和胶体体 | 生物医学工程 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-03-15 |
Cyberbiosecurity: Advancements in DNA-based information security
2024-Aug, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.06.002
PMID:40078663
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综述 | 本文探讨了合成生物学在信息安全和生物安全领域的新应用，特别是DNA作为信息存储和读取媒介的潜力及其带来的网络生物安全威胁 | 提出了DNA作为信息存储媒介的新应用，并探讨了由此引发的网络生物安全问题 | 主要集中于理论探讨，缺乏具体的实验数据或案例研究 | 为网络生物安全研究提供理论支持，并提高对信息安全、生物安全和国家安全风险的认识 | DNA作为信息存储和读取媒介的应用及其安全威胁 | 合成生物学 | NA | DNA合成与测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 4 | 2025-03-01 |
De novo-designed minibinders expand the synthetic biology sensing repertoire
2024-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.12.575267
PMID:38293112
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研究论文 | 本文探讨了设计的新型小型结合蛋白（minibinders）在细胞工程工具中的应用潜力 | 展示了小型结合蛋白LCB1在下一代蛋白水解受体SNIPR和嵌合抗原受体（CAR）中的广泛应用，相比传统抗体具有更快的生产周期和独特的靶向特性 | 研究主要集中于SARS-CoV-2 Spike蛋白和表皮生长因子受体，未广泛测试其他抗原 | 探索小型结合蛋白在细胞工程工具中的通用性和应用潜力 | SARS-CoV-2 Spike蛋白和表皮生长因子受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 蛋白质设计 | NA | 蛋白质序列和功能数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 5 | 2025-02-14 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 本文介绍了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器，称为“P3编辑”，它将蛋白质-蛋白质邻近性与功能性CRISPR-Cas9双组分引导RNA的形成联系起来 | 通过工程化crRNA:tracrRNA的相互作用，展示了已知蛋白质-蛋白质相互作用以及化学诱导的蛋白质结构域二聚化如何激活人类细胞中的prime编辑或碱基编辑，并探索了P3编辑如何整合基于ADAR的RNA传感器的输出 | NA | 增强CRISPR基因组编辑的可控性，促进其在活细胞中部署的合成分子电路中的应用 | 人类细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, prime编辑, 碱基编辑 | NA | 分子数据 | NA |
| 6 | 2025-02-13 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 本文通过定向进化改造植物来源的非血红素酶1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶（ACCO），实现了非天然的立体选择性C(sp)-H氟化反应 | 首次成功将非血红素Fe卤化酶转化为氟化酶，并通过定向进化显著提高了酶的活性、化学选择性和立体选择性 | 研究中几乎所有有益突变都远离Fe中心，强调了底物通道工程在非血红素Fe生物催化中的重要性 | 开发新的生物催化氟化反应，以解决自然界中C-F键形成酶活性稀缺的问题 | 非血红素Fe酶ACCO及其定向进化产物 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-02-02 |
A modular toolkit for environmental Rhodococcus, Gordonia, and Nocardia enables complex metabolic manipulation
2024-08-21, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00340-24
PMID:39082821
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研究论文 | 本文开发了一个模块化的质粒组装框架和一系列遗传控制元件，用于之前难以进行遗传操作的革兰氏阳性环境分离株C208，并在11个额外的环境分离株中展示了其保守功能 | 开发了一个适用于环境分枝杆菌的模块化遗传工具包，包括五个分枝杆菌复制起点、五个广宿主抗生素抗性标记、转录和翻译控制元件、荧光报告基因、四环素诱导系统和反选择标记 | 该工具包仅在有限的分离株中进行了测试，尚未在所有相关物种中验证其广泛适用性 | 开发适用于环境分枝杆菌的遗传工具包，以支持这些物种中复杂遗传电路的设计 | 环境分离株C208及其他11个环境分离株 | 合成生物学 | NA | 模块化质粒组装框架、遗传控制元件 | NA | 遗传数据 | 12个环境分离株 |
| 8 | 2024-12-21 |
Development of a base editor for convenient and multiplex genome editing in cyanobacteria
2024-08-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06696-3
PMID:39143188
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研究论文 | 本文开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，用于在蓝藻中进行快速、精确的C→T点突变和基因失活 | 开发了一种高效的胞嘧啶碱基编辑系统，能够实现快速、精确的C→T点突变和基因失活，并支持多重编辑 | NA | 开发高效的基因编辑工具，以促进蓝藻的遗传解剖和代谢工程研究 | 蓝藻中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 基因组 | 涉及Synechocystis和Anabaena两种蓝藻 |
| 9 | 2024-12-06 |
Steroidal scaffold decorations in Solanum alkaloid biosynthesis
2024-08-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2024.06.013
PMID:38937971
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研究论文 | 研究报告了通过比较代谢组学-转录组学引导的方法，发现12种酶将胆固醇前体转化为solasodine苷元，以及下游的α-solasonine、α-solamargine和malonyl-solamargine SGA产物 | 首次揭示了植物如何合成这些具有生物活性的类固醇分子，并提供了基因工具箱和平台，用于在异源宿主中通过合成生物学生产高价值的类固醇生物活性分子 | NA | 揭示Solanum植物中类固醇糖苷生物合成的机制 | Solanum植物中的类固醇糖苷及其生物合成酶 | NA | 癌症 | 比较代谢组学-转录组学 | NA | 代谢物 | 数百种Solanum物种，包括番茄、土豆和茄子等重要蔬菜作物 |
| 10 | 2024-11-24 |
Rewiring gene circuitry for plant improvement
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01806-7
PMID:39075207
|
综述 | 本文综述了在特定细胞中，随着发育和响应时间的推移，基因调控活动的最新进展及其对植物表型变异的影响 | 介绍了新的合成生物学工具和基因编辑技术，这些技术允许对转基因进行可调节的时空调控，并能够操纵内源基因的调控 | NA | 探讨如何通过重新布线基因电路来解决农业、能源和环境中的最大挑战 | 植物基因调控活动及其对表型的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-10-18 |
Exploring the secrets of marine microorganisms: Unveiling secondary metabolites through metagenomics
2024-08, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14533
PMID:39075735
|
综述 | 本文综述了通过宏基因组技术揭示海洋微生物次级代谢产物的研究进展 | 强调了宏基因组学在揭示次级代谢产物中的关键作用，并探讨了长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现带来的新可能性 | 讨论了通过宏基因组学研究这些代谢产物时存在的当前限制，并指出长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现提供了更多可能性 | 揭示海洋微生物次级代谢产物的秘密 | 海洋微生物及其次级代谢产物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 12 | 2024-10-01 |
Integrated Review of Transcriptomic and Proteomic Studies to Understand Molecular Mechanisms of Rice's Response to Environmental Stresses
2024-Aug-25, Biology
DOI:10.3390/biology13090659
PMID:39336087
|
综述 | 本文综述了转录组学和蛋白质组学研究在理解水稻对环境胁迫响应的分子机制中的应用 | 本文整合了转录组学和蛋白质组学的最新进展，提供了水稻对环境胁迫响应的分子细节 | NA | 解码水稻对环境胁迫响应的复杂机制，培育高产、高质量和抗逆品种 | 水稻对环境胁迫的响应机制 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-09-24 |
[Biological and chemical synthesis of high-value active ingredients in traditional Chinese medicine]
2024-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了中药中高价值活性成分的生物和化学合成研究进展 | 提出了结合生物和化学合成的研究范式，包括化学酶介导的结构修饰、生物合成半合成生产以及仿生合成 | 未提及具体实验数据或结果，仅综述了现有研究进展 | 探讨中药中高价值活性成分的合成策略 | 中药中的高价值活性成分，如青蒿素、紫杉醇、长春碱和长春新碱 | NA | NA | 生物合成、化学合成 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-09-23 |
A frugal CRISPR kit for equitable and accessible education in gene editing and synthetic biology
2024-Aug-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50767-2
PMID:39095367
|
研究论文 | 开发了一种名为CRISPRkit的经济实惠工具包，用于高中基因编辑和合成生物学教育 | CRISPRkit消除了对专业设备的需求，优先考虑生物安全，并使用成本效益高的试剂，提供了一种廉价且用户友好的CRISPR实验方法 | NA | 促进生命科学、生物工程和合成生物学领域的公平和可及教育 | 高中生在课堂环境中进行基因编辑和调控实验 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-09-17 |
Genome Mining and Biological Engineering of Type III Borosins from Bacteria
2024-Aug-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179350
PMID:39273298
|
研究论文 | 本文研究了细菌中III型硼素的基因挖掘和生物工程 | 首次在细菌中发现III型硼素，并验证了KchMA的自甲基化活性，展示了其在合成生物学中的巨大潜力 | NA | 探索III型硼素的来源和潜力 | III型硼素及其在细菌中的生物合成途径 | 生物工程 | NA | 基因挖掘、生物化学实验、商业蛋白酶和AI辅助的合理设计 | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-09-17 |
Foods of the Future: Challenges, Opportunities, Trends, and Expectations
2024-Aug-23, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods13172663
PMID:39272427
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综述 | 本文综述了未来食品的挑战、机遇、趋势和期望 | 本文提出了未来食品安全的策略，并讨论了功能性食品、新型食品、合成生物学和3D食品打印等有前景的食品系统 | 本文主要基于现有科学证据和数据进行综述，未涉及具体实验或模型 | 探讨未来食品系统的可持续性，提出解决食品安全、健康和环境问题的策略 | 未来可持续食品、替代蛋白质来源和新型高效的食品系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-09-13 |
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae488
PMID:39073885
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研究论文 | 介绍了一种名为PhysioFit的开源软件，用于量化细胞生长参数和胞外通量 | PhysioFit可以与任何生长模型兼容，并且设计为可互操作，支持多种常见生长模型，并允许高级用户实现额外的模型 | NA | 开发一种能够量化生长参数和胞外通量的通用工具 | 细胞生长参数和胞外通量 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 18 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
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研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性，提出了新的形式化定义和相应的度量方法，并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法，比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外，本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法，并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性，以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA |
| 19 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
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综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-09-05 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-Aug-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文利用单分子力谱技术结合微流控增强的光阱和粗粒度模拟，研究了基于脚手架介导的链置换（TMSD）的动态DNA纳米技术中的单分子水平动力学。 | 首次在单分子水平上实时观察和调控TMSD过程，并分析了DNA和RNA入侵的动力学差异。 | NA | 探索脚手架介导的链置换过程在单分子水平上的动力学特性。 | DNA和RNA的链置换过程。 | DNA纳米技术 | NA | 单分子力谱技术 | NA | NA | 数千次正反入侵事件 |