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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-11-24 |
Rewiring gene circuitry for plant improvement
2024-Aug, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01806-7
PMID:39075207
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综述 | 本文综述了在特定细胞中,随着发育和响应时间的推移,基因调控活动的最新进展及其对植物表型变异的影响 | 介绍了新的合成生物学工具和基因编辑技术,这些技术允许对转基因进行可调节的时空调控,并能够操纵内源基因的调控 | NA | 探讨如何通过重新布线基因电路来解决农业、能源和环境中的最大挑战 | 植物基因调控活动及其对表型的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-10-18 |
Exploring the secrets of marine microorganisms: Unveiling secondary metabolites through metagenomics
2024-08, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14533
PMID:39075735
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综述 | 本文综述了通过宏基因组技术揭示海洋微生物次级代谢产物的研究进展 | 强调了宏基因组学在揭示次级代谢产物中的关键作用,并探讨了长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现带来的新可能性 | 讨论了通过宏基因组学研究这些代谢产物时存在的当前限制,并指出长读长测序技术和计算生物学工具的发展为BGC发现提供了更多可能性 | 揭示海洋微生物次级代谢产物的秘密 | 海洋微生物及其次级代谢产物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-10-01 |
Integrated Review of Transcriptomic and Proteomic Studies to Understand Molecular Mechanisms of Rice's Response to Environmental Stresses
2024-Aug-25, Biology
DOI:10.3390/biology13090659
PMID:39336087
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综述 | 本文综述了转录组学和蛋白质组学研究在理解水稻对环境胁迫响应的分子机制中的应用 | 本文整合了转录组学和蛋白质组学的最新进展,提供了水稻对环境胁迫响应的分子细节 | NA | 解码水稻对环境胁迫响应的复杂机制,培育高产、高质量和抗逆品种 | 水稻对环境胁迫的响应机制 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-09-24 |
[Biological and chemical synthesis of high-value active ingredients in traditional Chinese medicine]
2024-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了中药中高价值活性成分的生物和化学合成研究进展 | 提出了结合生物和化学合成的研究范式,包括化学酶介导的结构修饰、生物合成半合成生产以及仿生合成 | 未提及具体实验数据或结果,仅综述了现有研究进展 | 探讨中药中高价值活性成分的合成策略 | 中药中的高价值活性成分,如青蒿素、紫杉醇、长春碱和长春新碱 | NA | NA | 生物合成、化学合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-09-23 |
A frugal CRISPR kit for equitable and accessible education in gene editing and synthetic biology
2024-Aug-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50767-2
PMID:39095367
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研究论文 | 开发了一种名为CRISPRkit的经济实惠工具包,用于高中基因编辑和合成生物学教育 | CRISPRkit消除了对专业设备的需求,优先考虑生物安全,并使用成本效益高的试剂,提供了一种廉价且用户友好的CRISPR实验方法 | NA | 促进生命科学、生物工程和合成生物学领域的公平和可及教育 | 高中生在课堂环境中进行基因编辑和调控实验 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-09-17 |
Genome Mining and Biological Engineering of Type III Borosins from Bacteria
2024-Aug-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179350
PMID:39273298
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研究论文 | 本文研究了细菌中III型硼素的基因挖掘和生物工程 | 首次在细菌中发现III型硼素,并验证了KchMA的自甲基化活性,展示了其在合成生物学中的巨大潜力 | NA | 探索III型硼素的来源和潜力 | III型硼素及其在细菌中的生物合成途径 | 生物工程 | NA | 基因挖掘、生物化学实验、商业蛋白酶和AI辅助的合理设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-09-17 |
Foods of the Future: Challenges, Opportunities, Trends, and Expectations
2024-Aug-23, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods13172663
PMID:39272427
|
综述 | 本文综述了未来食品的挑战、机遇、趋势和期望 | 本文提出了未来食品安全的策略,并讨论了功能性食品、新型食品、合成生物学和3D食品打印等有前景的食品系统 | 本文主要基于现有科学证据和数据进行综述,未涉及具体实验或模型 | 探讨未来食品系统的可持续性,提出解决食品安全、健康和环境问题的策略 | 未来可持续食品、替代蛋白质来源和新型高效的食品系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-09-13 |
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae488
PMID:39073885
|
研究论文 | 介绍了一种名为PhysioFit的开源软件,用于量化细胞生长参数和胞外通量 | PhysioFit可以与任何生长模型兼容,并且设计为可互操作,支持多种常见生长模型,并允许高级用户实现额外的模型 | NA | 开发一种能够量化生长参数和胞外通量的通用工具 | 细胞生长参数和胞外通量 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
|
研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性,提出了新的形式化定义和相应的度量方法,并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法,比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外,本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法,并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性,以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
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综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-09-04 |
Wuhan Sequence-Based Recombinant Antigens Expressed in E. coli Elicit Antibodies Capable of Binding with Omicron S-Protein
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169016
PMID:39201702
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研究论文 | 本文研究了基于武汉序列的重组抗原在E. coli中表达,并能引发与Omicron S蛋白结合的抗体 | 首次证明这些重组抗原能诱导产生与Omicron变种S蛋白相互作用的抗体,并展示了合成生物学方法在开发高度交叉反应疫苗中的潜力 | NA | 开发交叉反应疫苗,以应对SARS-CoV-2的持续变异和新变种的出现 | 重组冠状病毒抗原及其免疫原性 | 疫苗学 | 冠状病毒感染 | 细菌表达系统 | NA | 蛋白质 | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-09-04 |
Photosynthesis: Genetic Strategies Adopted to Gain Higher Efficiency
2024-Aug-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25168933
PMID:39201620
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综述 | 本文综述了通过遗传策略提高光合作用效率的方法 | 讨论了CRISPR-Cas9和合成生物学等基因编辑工具在精确调整光合作用途径中的最新成功案例 | 文章未明确指出具体的局限性 | 旨在识别光合作用的优化机会,讨论近期进展,并解决提高这一关键过程的挑战 | 光合作用的遗传方面及其在提高作物产量中的应用 | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-09-04 |
The chromosome-scale assembly of the Notopterygium incisum genome provides insight into the structural diversity of coumarins
2024-Aug, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2024.04.005
PMID:39220882
|
研究论文 | 本文报道了Notopterygium incisum的染色体级别基因组组装,大小为1.64 Gb,包含60,021个注释的蛋白质编码基因,并鉴定了关键酶在香豆素结构多样性中的作用 | 首次鉴定了两种双功能酶,能够催化demethylsuberosin和osthenol,并提出了复杂香豆素生物合成途径的平行进化场景 | NA | 探究香豆素结构多样性的机制 | Notopterygium incisum的基因组及其香豆素生物合成途径 | NA | NA | 基因组组装 | NA | 基因组数据 | Notopterygium incisum的基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-09-02 |
Comprehensive Analysis of Allulose Production: A Review and Update
2024-Aug-17, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods13162572
PMID:39200499
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综述 | 本文综述了近年来D-阿洛酮糖生产技术的进展,重点介绍了酶转化方法的关键发展 | 包括传统固定化技术、新型酶的发现、定向进化研究以及通过代谢途径修饰的生物合成 | NA | 旨在提高D-阿洛酮糖的生产效率和成本效益,同时遵循可持续和经济可行的制造实践 | D-阿洛酮糖的生产技术 | 生物技术 | NA | 酶转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-09-01 |
Cultivation optimization promotes ginsenoside and universal triterpenoid production by engineered yeast
2024-Aug-22, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.08.505
PMID:39181198
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research paper | 本文通过实验设计优化发酵条件,提高了工程酵母生产人参皂苷和通用三萜类化合物的产量 | 利用合成生物学、微生物工程和配方研究,实现了可持续生产高价值化合物,如三萜类合成 | NA | 优化发酵条件以提高工程酵母生产人参皂苷和三萜类化合物的产量 | 人参皂苷和三萜类化合物 | NA | NA | 发酵 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-29 |
A Self-Assembling γPFD-SpyCatcher Hydrogel Scaffold for the Coimmobilization of SpyTag-Enzymes to Facilitate the Catalysis of Regulated Enzymes
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c03403
PMID:39194331
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研究论文 | 本研究建立了一种能够自发组装的γPFD-SpyCatcher水凝胶支架,用于共固定化SpyTag-酶,以促进受调控酶的催化作用 | 该研究展示了γPFD-SpyCatcher水凝胶在提高酶的热稳定性和pH稳定性的同时,还能快速提供纯酶,并在体外实验中显著提高了酶的活性 | NA | 探索γPFD-SpyCatcher水凝胶在共固定化酶中的应用,以提高酶的稳定性和活性 | γPFD-SpyCatcher水凝胶、SpyTag-酶(如SpyTag-己糖激酶、SpyTag-磷酸果糖激酶和SpyTag-丙酮酸激酶) | 生物技术 | NA | 水凝胶技术 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-26 |
Design of a self-regulating mRNA gene circuit
2024-08-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70363-0
PMID:39169208
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研究论文 | 本文设计了一种基于噬菌体MS2的自我调节mRNA基因电路,通过计算工具模拟核糖体动力学和mRNA共翻译折叠,优化了下游基因的翻译和抑制效率 | 提出了一种新的自我调节mRNA设计方法,可用于疫苗和其他合成生物学应用,实现细胞内蛋白质水平的精确控制 | NA | 探索设计自我调节mRNA基因电路的可能性,以实现细胞内蛋白质合成的自我调节 | 自我调节mRNA的设计及其在蛋白质表达控制中的应用 | 合成生物学 | NA | 计算模拟 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-24 |
[Biomanufacturing of propionic acid]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240097
PMID:39174476
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综述 | 本文综述了丙酸的生物制造过程,包括代谢工程和途径重构在异源宿主中的研究,以及通过合成生物学设计改良途径从L-苏氨酸或生物基1,2-丙二醇合成高纯度丙酸的最新进展 | 利用微生物转化可再生资源生产丙酸,减少环境污染并提高可持续性 | NA | 探讨丙酸的生物制造方法及其在食品、医药和化工领域的应用 | 丙酸的生物制造过程及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-24 |
[Construction of microbial cell factories for synthesizing value-added chemicals with xylose]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240161
PMID:39174477
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研究论文 | 本文介绍了利用木糖合成高价值化学品的微生物细胞工厂的构建策略 | 深入理解微生物代谢机制和合成生物学的进步提高了微生物代谢木糖的效率并扩展了木糖衍生产品的范围 | 木糖的代谢效率低于葡萄糖,限制了其在大多数微生物中的应用 | 实现对木质纤维素的全利用,构建能高效代谢木糖的微生物细胞工厂 | 木质纤维素中的木糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-24 |
Design, modeling and in silico simulation of bacterial biosensors for detecting heavy metals in irrigation water for precision agriculture
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35050
PMID:39170417
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研究论文 | 本文提出了一种新的工作流程,用于设计、建模和模拟可重编程微生物,作为检测灌溉水中重金属的生物传感器 | 该工作流程基于合成生物学的两种技术:合成遗传电路设计和合成工程,允许使用软件和硬件开发理论模型,预测复杂生物系统的行为 | NA | 设计新型生物设备以替代目前用于精准农业中检测灌溉水重金属的传感器 | 设计、建模和模拟用于检测灌溉水中重金属(砷、汞和铅)的微生物生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路设计、合成工程 | NA | 基因组数据(SBOL、GenBank和FASTA格式) | 三种全细胞重金属生物传感器 | NA | NA | NA | NA |