合成生物学相关文章
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当前共找到 82 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-23 |
The BioRECIPE Knowledge Representation Format
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00096
PMID:39051984
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研究论文 | 介绍了一种名为BioRECIPE的知识表示格式，旨在标准化并促进创建、验证、评估、管理和扩展细胞内及细胞间信号的可执行模型时的人机交互 | BioRECIPE格式允许用户轻松预览和修改任何模型组件，同时可被机器读取并由一系列模型开发和分析工具处理 | NA | 开发一种标准化的知识表示格式，以促进生物系统模型的创建和管理 | 细胞内及细胞间信号的可执行模型 | 系统生物学 | NA | 自然语言处理 | NA | 模型 | NA |
| 42 | 2024-08-23 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 研究通过控制胆色素代谢来修饰蓝细菌中的藻蓝蛋白和藻胆体 | 开发了一种新型7942 PEB1菌株，通过精细调控PEB生物合成，实现了藻胆体颜色从绿色到棕色和粉红色的可逆变化 | 遗传不稳定，且由PEB结合的藻胆体复合物的性质尚未被充分表征 | 探索藻胆体适应不同光环境的机制，并为生物工程、合成生物学和可再生能源领域的未来研究提供基础 | 蓝细菌中的藻蓝蛋白和藻胆体 | 生物工程 | NA | 胆色素代谢控制 | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-23 |
Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00253
PMID:39033464
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研究论文 | 本文开发了一种基于病毒重组酶RecT的高效寡核苷酸重组系统，并结合Cas9反选择系统，实现了无标记基因组工程，用于乙酸菌Eubacterium limosum的精确基因组修饰。 | 本文首次开发了一种高效的重组系统，结合Cas9反选择系统，实现了无标记的基因组点突变，无需繁琐的同源臂克隆，可快速简单地应用于几乎任何基因组位点。 | NA | 开发一种新的基因组工程方法，用于乙酸菌Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程，以促进可持续的CO基生物燃料生产和人类肠道微生物群的研究。 | 乙酸菌Eubacterium limosum的基因组 | 合成生物学 | NA | 重组酶RecT，Cas9反选择系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 44 | 2024-08-23 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
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研究论文 | 本文介绍了一种从不同植物物种中提取的叶绿体无细胞基因表达系统，用于快速原型设计和基因表达分析 | 开发了一种多功能的叶绿体无细胞基因表达系统，适用于多种植物物种，并能使用传统和内源性叶绿体聚合酶进行基因表达分析 | NA | 解决气候变化对全球农业的威胁，通过叶绿体工程提供创新解决方案 | 叶绿体无细胞基因表达系统在不同植物物种中的应用 | 植物合成生物学 | NA | 叶绿体无细胞基因表达 | NA | 基因表达数据 | 分析了23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 |
| 45 | 2024-08-23 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
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研究论文 | 本研究开发了一种针对炎症性肠病（IBD）的靶向治疗系统，通过工程化改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN），构建了一个包含转录因子基传感器、I型溶血素分泌系统和治疗性纳米抗体库的模块化系统。 | 本研究首次在EcN中验证了纳米抗体库的治疗潜力，并首次在EcN中表征了分泌系统，为筛选和纯化感兴趣的蛋白质提供了一个平台。此外，提供了评估益生菌系统关键参数的数学框架。 | 尽管系统对一氧化氮（NO）的响应是浓度依赖性的，但灵敏度有所降低。 | 开发一种针对炎症性肠病（IBD）的靶向治疗系统。 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN）及其在肠道炎症疾病治疗中的应用。 | NA | 炎症性肠病 | 转录因子基传感器（NorR）、I型溶血素分泌系统、酶联免疫吸附测定 | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-20 |
TeaTFactor: a prediction tool for tea plant transcription factors based on BERT
2024-Aug-16, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT架构的茶树转录因子预测工具TeaTFactor | 利用预训练策略和BERT模型进行茶树转录因子的预测，相较于现有模型具有更高的准确性 | NA | 开发一种高效的计算方法来预测茶树转录因子 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT | BERT | 蛋白质数据 | 使用来自UniProt的蛋白质数据进行预训练，并使用收集的茶树转录因子数据进行微调 |
| 47 | 2024-08-20 |
Screening of broad-host expression promoters for shuttle expression vectors in non-conventional yeasts and bacteria
2024-Aug-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02506-x
PMID:39152436
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研究论文 | 本研究选择了五种Yarrowia lipolytica和五种Kluyveromyces marxianus的组成型启动子，构建了启动子-报告载体，并在多种微生物宿主中系统地表征了这些启动子的强度 | 发现五种K. marxianus启动子能在Y. lipolytica中表达基因，五种Y. lipolytica启动子也能在K. marxianus中表达基因，且yl.TEF1和km.TEF1启动子在多种微生物宿主中表现出适应性 | NA | 开发具有广泛宿主适用性的非传统酵母启动子，以增强目标生物产品的合成 | Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus的组成型启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达 | 涉及Y. lipolytica、K. marxianus、Pichia pastoris、Escherichia coli和Corynebacterium glutamicum等多种微生物宿主 |
| 48 | 2024-08-20 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2024-Aug-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 本文设计并构建了在酵母P. pastoris中受光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 开发了新的光调控转录和翻译系统，通过光感应元件和内源性启动子的嵌合设计，以及通过“稀有密码子刹车”设计的光抑制翻译系统 | NA | 解决传统诱导型启动子在发酵安全或表达能力上的缺陷，并优化细胞能量分布 | 酵母P. pastoris中的基因转录和蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 光感应元件设计，稀有密码子刹车设计 | NA | 基因转录和蛋白质翻译数据 | 多种配置的转录因子/光响应元件对，以及不同的光响应元件位置和拷贝数 |
| 49 | 2024-08-17 |
Towards Self-regeneration: Exploring the Limits of Protein Synthesis in the Protein Synthesis Using Recombinant Elements (PURE) Cell-free Transcription-Translation System
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00304
PMID:39066734
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研究论文 | 研究在PURE无细胞转录-翻译系统中蛋白质自再生的极限 | 成功将非核糖体PURE蛋白质浓度降低至97.3%，并提高了蛋白质合成效率 | 原文未明确提及 | 重现生命系统的自我再生功能，以创造合成细胞 | PURE无细胞转录-翻译系统中的蛋白质自再生 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录-翻译系统 | NA | 蛋白质 | 涉及36种非核糖体蛋白质 |
| 50 | 2024-08-17 |
Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00259
PMID:39002162
|
综述 | 本文综述了工程化活体材料（ELMs）的制备方法及其在医疗、环境保护和制造领域的应用潜力 | ELMs结合了合成生物学与材料科学，具有自愈、自复制和环境适应性等独特“活体”特性 | 需要进一步的研究和技术进步以提高ELMs的安全性、功能性和实际应用性 | 探讨ELMs在近年来的变革性影响，特别是在医疗保健和环境保护领域 | 工程化活体材料（ELMs）及其制备方法和应用 | 材料科学 | NA | 3D生物打印、静电纺丝 | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-17 |
ShuffleAnalyzer: A Comprehensive Tool to Visualize DNA Shuffling
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00251
PMID:38991172
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research paper | 介绍了一种名为ShuffleAnalyzer的综合性工具，用于可视化DNA重排过程 | ShuffleAnalyzer提供直接的图形输出，使得分析过程更加用户友好且高效 | NA | 开发一种工具以提高DNA重排分析的效率和可视化 | DNA重排过程及其在合成生物学中的应用 | synthetic biology | NA | DNA shuffling | NA | DNA序列 | NA |
| 52 | 2024-08-17 |
Designing a Novel Temperature- and Noncanonical Amino Acid-Controlled Biological Logic Gate in Escherichia coli
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00423
PMID:39110782
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研究论文 | 本研究探讨了外源性氨基酸tRNA合成酶（aaRS）和琥珀抑制tRNA对基因表达的影响，并利用这些效应在Escherichia coli中设计了一种新型生物逻辑门。 | 本研究发现了外源性aaRS/tRNA对细胞内腺苷三磷酸的高消耗率在高温下引起的温度敏感性，并利用这一特性构建了一种新型生物AND门。 | 本研究主要集中在DH10β Δ中F1RP/F2P双杂交系统的转化细胞，可能需要进一步研究在其他系统和条件下的适用性。 | 探索外源性aaRS/tRNA对基因表达的影响，并开发新型生物逻辑门。 | 外源性氨基酸tRNA合成酶和琥珀抑制tRNA对基因表达的影响。 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
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研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶（CYP80G6和CYP80Q5），它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物，揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外，还鉴定了两种CYP719C酶（CYP719C3和CYP719C4），它们催化形成甲基二氧桥，这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性，我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径，实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用，并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径，为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征，并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA |
| 54 | 2024-08-17 |
Synthetic Cells from Droplet-Based Microfluidics for Biosensing and Biomedical Applications
2024-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400086
PMID:38563581
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综述 | 本文综述了通过基于液滴的微流控技术制备合成细胞的最新研究进展 | 微流控技术能够替代传统的劳动密集型、昂贵且复杂的技术，实现合成细胞的微型化和批量生产 | NA | 探讨合成细胞在生物传感器和其他生物医学应用中的潜力 | 不同类型的合成细胞，包括脂质囊泡、聚合物囊泡、共沉淀微滴和胶体囊泡 | 生物医学工程 | NA | 基于液滴的微流控技术 | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-16 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本文展示了将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 利用合成生物学技术，将工程化细菌作为活体分析工具，具有更广泛的生物标志物检测范围和先进的处理及感应/响应功能 | NA | 探索将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 工程化细菌、皮肤纹身、生物标志物监测 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | RNA温度计 | 荧光读数 | NA |
| 56 | 2024-08-15 |
Engineered Bacteria for Visualization and Localization of Gastrointestinal Bleeding: A Promising Application
2024-Aug-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01699
PMID:39141424
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研究论文 | 本文开发了一种利用合成生物技术智能工程化的细菌，用于体内定位检测胃肠道出血 | 通过构建三个基因电路模块，实现了对血红素的特异性感应和实时光学信号的体内生成，克服了现有诊断方法的局限 | NA | 提高胃肠道出血的诊断准确性和治疗效果 | 胃肠道出血，特别是隐匿性胃肠道出血 | 合成生物学 | 胃肠道疾病 | 合成生物技术 | 基因电路模块 | NA | NA |
| 57 | 2024-08-14 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化条件性gRNA的dCas9调节器，用于精确控制内源基因表达 | 本研究首次实现了基于多输入逻辑处理的条件性gRNA，能够高效调节内源代谢过程 | NA | 开发一种新的方法来精确控制CRISPR-Cas系统，以调节内源基因表达 | Escherichia coli中的内源代谢基因和细胞骨架基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 涉及Escherichia coli中的多个基因，包括lacZ, malT, poxB, ftsZ和mreB |
| 58 | 2024-08-14 |
Advances in functional studies of plant MYC transcription factors
2024-Aug-05, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-024-04697-8
PMID:39103657
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综述 | 本文综述了植物MYC转录因子在调控多种生理过程中的功能研究进展 | 通过基因克隆和利用全基因组'omics'及蛋白质-蛋白质相互作用技术，深入理解了MYC的多方面调控功能 | NA | 探讨MYC作为分子开关在调控植物激素和光敏色素介导的信号转导途径中的作用 | 植物MYC转录因子及其在植物生长、发育、逆境适应和次生代谢中的作用 | NA | NA | 全基因组'omics'技术，蛋白质-蛋白质相互作用技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-13 |
Enhancing Withanolide Production in the Withania Species: Advances in In Vitro Culture and Synthetic Biology Approaches
2024-Aug-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13152171
PMID:39124289
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研究论文 | 本文探讨了通过体外培养技术和合成生物学方法提高茄科植物中甾体内酯类化合物生产的最新进展 | 利用合成生物学和机器学习技术，通过异源系统和代谢工程改造甾体内酯的生物合成途径 | 甾体内酯的生物合成途径复杂，是提高生产的主要障碍 | 提高甾体内酯的生产以满足现代医学的需求 | 茄科植物中的甾体内酯类化合物 | 合成生物学 | NA | CRISPR | 机器学习 | 生物过程数据 | NA |