合成生物学相关文章
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当前共找到 79 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-09-01 |
Cultivation optimization promotes ginsenoside and universal triterpenoid production by engineered yeast
2024-Aug-22, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.08.505
PMID:39181198
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research paper | 本文通过实验设计优化发酵条件，提高了工程酵母生产人参皂苷和通用三萜类化合物的产量 | 利用合成生物学、微生物工程和配方研究，实现了可持续生产高价值化合物，如三萜类合成 | NA | 优化发酵条件以提高工程酵母生产人参皂苷和三萜类化合物的产量 | 人参皂苷和三萜类化合物 | NA | NA | 发酵 | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-30 |
Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites
2024-Aug-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51511-6
PMID:39187482
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研究论文 | 介绍了一种名为EasIFA的酶活性位点注释算法，该算法结合了蛋白质语言模型和3D结构编码器的潜在酶表示，并通过多模态交叉注意力框架将蛋白质级信息与酶反应知识对齐 | EasIFA算法在速度和准确性上均优于现有算法，实现了10倍的加速和显著的性能提升 | NA | 开发一种高效且准确的酶活性位点注释算法，以推动药物发现、疾病研究、酶工程和合成生物学等多个领域的发展 | 酶活性位点的自动注释 | 机器学习 | NA | 多模态深度学习 | 多模态交叉注意力框架 | 蛋白质结构数据 | NA |
| 43 | 2024-08-29 |
A Self-Assembling γPFD-SpyCatcher Hydrogel Scaffold for the Coimmobilization of SpyTag-Enzymes to Facilitate the Catalysis of Regulated Enzymes
2024-Aug-28, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c03403
PMID:39194331
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研究论文 | 本研究建立了一种能够自发组装的γPFD-SpyCatcher水凝胶支架，用于共固定化SpyTag-酶，以促进受调控酶的催化作用 | 该研究展示了γPFD-SpyCatcher水凝胶在提高酶的热稳定性和pH稳定性的同时，还能快速提供纯酶，并在体外实验中显著提高了酶的活性 | NA | 探索γPFD-SpyCatcher水凝胶在共固定化酶中的应用，以提高酶的稳定性和活性 | γPFD-SpyCatcher水凝胶、SpyTag-酶（如SpyTag-己糖激酶、SpyTag-磷酸果糖激酶和SpyTag-丙酮酸激酶） | 生物技术 | NA | 水凝胶技术 | NA | 酶活性数据 | NA |
| 44 | 2024-08-26 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2024-Aug-23, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台，用于快速生成遗传修饰的人类多能干细胞系 | STRAIGHT-IN平台通过精确插入或替换特定基因组区域，并利用Bxb1整合酶和Cre重组酶，实现了大DNA载体的靶向整合，提高了整合效率并减少了克隆变异性 | NA | 开发一种新的技术平台，用于快速生成遗传修饰的人类多能干细胞系，以应用于合成生物学、疾病模型和药物发现等领域 | 人类多能干细胞 | 生物技术 | NA | 基因编辑技术 | NA | 细胞系 | 多个遗传修饰的人类多能干细胞系 |
| 45 | 2024-08-26 |
Design of a self-regulating mRNA gene circuit
2024-08-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70363-0
PMID:39169208
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研究论文 | 本文设计了一种基于噬菌体MS2的自我调节mRNA基因电路，通过计算工具模拟核糖体动力学和mRNA共翻译折叠，优化了下游基因的翻译和抑制效率 | 提出了一种新的自我调节mRNA设计方法，可用于疫苗和其他合成生物学应用，实现细胞内蛋白质水平的精确控制 | NA | 探索设计自我调节mRNA基因电路的可能性，以实现细胞内蛋白质合成的自我调节 | 自我调节mRNA的设计及其在蛋白质表达控制中的应用 | 合成生物学 | NA | 计算模拟 | NA | mRNA | NA |
| 46 | 2024-08-24 |
[Biomanufacturing of propionic acid]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240097
PMID:39174476
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综述 | 本文综述了丙酸的生物制造过程，包括代谢工程和途径重构在异源宿主中的研究，以及通过合成生物学设计改良途径从L-苏氨酸或生物基1,2-丙二醇合成高纯度丙酸的最新进展 | 利用微生物转化可再生资源生产丙酸，减少环境污染并提高可持续性 | NA | 探讨丙酸的生物制造方法及其在食品、医药和化工领域的应用 | 丙酸的生物制造过程及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-24 |
[Construction of microbial cell factories for synthesizing value-added chemicals with xylose]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240161
PMID:39174477
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研究论文 | 本文介绍了利用木糖合成高价值化学品的微生物细胞工厂的构建策略 | 深入理解微生物代谢机制和合成生物学的进步提高了微生物代谢木糖的效率并扩展了木糖衍生产品的范围 | 木糖的代谢效率低于葡萄糖，限制了其在大多数微生物中的应用 | 实现对木质纤维素的全利用，构建能高效代谢木糖的微生物细胞工厂 | 木质纤维素中的木糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-24 |
The art of designed coiled-coils for the regulation of mammalian cells
2024-Aug-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.06.001
PMID:38971158
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综述 | 本文综述了卷曲螺旋（CC）二聚体形成模块在哺乳动物细胞调控中的应用及其设计规则 | 卷曲螺旋模块提供了高度特异性和正交的蛋白质-蛋白质相互作用，设计规则使其能够精确控制和调节这些相互作用 | NA | 探讨卷曲螺旋在哺乳动物细胞中的多样化应用及其在推进细胞过程理解和调控中的作用 | 卷曲螺旋模块在哺乳动物细胞中的应用，包括合成生物电路设计、转录和变构调控、细胞组装、嵌合抗原受体（CAR）T细胞调控和基因组编辑 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-24 |
Design, modeling and in silico simulation of bacterial biosensors for detecting heavy metals in irrigation water for precision agriculture
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35050
PMID:39170417
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研究论文 | 本文提出了一种新的工作流程，用于设计、建模和模拟可重编程微生物，作为检测灌溉水中重金属的生物传感器 | 该工作流程基于合成生物学的两种技术：合成遗传电路设计和合成工程，允许使用软件和硬件开发理论模型，预测复杂生物系统的行为 | NA | 设计新型生物设备以替代目前用于精准农业中检测灌溉水重金属的传感器 | 设计、建模和模拟用于检测灌溉水中重金属（砷、汞和铅）的微生物生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路设计、合成工程 | NA | 基因组数据（SBOL、GenBank和FASTA格式） | 三种全细胞重金属生物传感器 |
| 50 | 2024-08-23 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-Aug-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
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研究论文 | 本研究通过计算机模拟突变扫描和分子动力学模拟，探讨了GB1与IgG-Fc结合的分子基础 | 本研究展示了MuMi作为一种可靠且计算高效的工具，用于预测蛋白质适应性景观，相较于传统方法具有显著优势 | NA | 研究GB1与IgG-Fc结合的分子机制，并评估MuMi在预测蛋白质适应性景观中的应用 | GB1蛋白与IgG-Fc的结合 | 生物信息学 | NA | 深度突变扫描（DMS），分子动力学（MD） | NA | 蛋白质结构 | 所有可能的单突变 |
| 51 | 2024-08-23 |
Degradable living plastics programmed by engineered spores
2024-Aug-21, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01713-2
PMID:39169270
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研究论文 | 本文报道了一种利用合成生物学和聚合物工程技术制备的可生物降解的活体塑料 | 通过工程化的枯草芽孢杆菌孢子携带木糖诱导分泌表达的伯克霍尔德菌脂酶（BC-脂酶）基因回路，实现了塑料的生物降解 | NA | 开发一种环境友好的塑料材料，能够在孢子休眠时保持功能，在孢子激活时进行降解 | 工程化的枯草芽孢杆菌孢子和聚己内酯 | 生物工程 | NA | 合成生物学和聚合物工程 | NA | 材料 | NA |
| 52 | 2024-08-20 |
Screening of broad-host expression promoters for shuttle expression vectors in non-conventional yeasts and bacteria
2024-Aug-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02506-x
PMID:39152436
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研究论文 | 本研究选择了五种Yarrowia lipolytica和五种Kluyveromyces marxianus的组成型启动子，构建了启动子-报告载体，并在多种微生物宿主中系统地表征了这些启动子的强度 | 发现五种K. marxianus启动子能在Y. lipolytica中表达基因，五种Y. lipolytica启动子也能在K. marxianus中表达基因，且yl.TEF1和km.TEF1启动子在多种微生物宿主中表现出适应性 | NA | 开发具有广泛宿主适用性的非传统酵母启动子，以增强目标生物产品的合成 | Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus的组成型启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达 | 涉及Y. lipolytica、K. marxianus、Pichia pastoris、Escherichia coli和Corynebacterium glutamicum等多种微生物宿主 |
| 53 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
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研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶（CYP80G6和CYP80Q5），它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物，揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外，还鉴定了两种CYP719C酶（CYP719C3和CYP719C4），它们催化形成甲基二氧桥，这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性，我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径，实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用，并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径，为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征，并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA |
| 54 | 2024-08-16 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本文展示了将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 利用合成生物学技术，将工程化细菌作为活体分析工具，具有更广泛的生物标志物检测范围和先进的处理及感应/响应功能 | NA | 探索将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 工程化细菌、皮肤纹身、生物标志物监测 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | RNA温度计 | 荧光读数 | NA |
| 55 | 2024-08-15 |
Engineered Bacteria for Visualization and Localization of Gastrointestinal Bleeding: A Promising Application
2024-Aug-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01699
PMID:39141424
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研究论文 | 本文开发了一种利用合成生物技术智能工程化的细菌，用于体内定位检测胃肠道出血 | 通过构建三个基因电路模块，实现了对血红素的特异性感应和实时光学信号的体内生成，克服了现有诊断方法的局限 | NA | 提高胃肠道出血的诊断准确性和治疗效果 | 胃肠道出血，特别是隐匿性胃肠道出血 | 合成生物学 | 胃肠道疾病 | 合成生物技术 | 基因电路模块 | NA | NA |
| 56 | 2024-08-14 |
Advances in functional studies of plant MYC transcription factors
2024-Aug-05, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-024-04697-8
PMID:39103657
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综述 | 本文综述了植物MYC转录因子在调控多种生理过程中的功能研究进展 | 通过基因克隆和利用全基因组'omics'及蛋白质-蛋白质相互作用技术，深入理解了MYC的多方面调控功能 | NA | 探讨MYC作为分子开关在调控植物激素和光敏色素介导的信号转导途径中的作用 | 植物MYC转录因子及其在植物生长、发育、逆境适应和次生代谢中的作用 | NA | NA | 全基因组'omics'技术，蛋白质-蛋白质相互作用技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-13 |
Enhancing Withanolide Production in the Withania Species: Advances in In Vitro Culture and Synthetic Biology Approaches
2024-Aug-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13152171
PMID:39124289
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研究论文 | 本文探讨了通过体外培养技术和合成生物学方法提高茄科植物中甾体内酯类化合物生产的最新进展 | 利用合成生物学和机器学习技术，通过异源系统和代谢工程改造甾体内酯的生物合成途径 | 甾体内酯的生物合成途径复杂，是提高生产的主要障碍 | 提高甾体内酯的生产以满足现代医学的需求 | 茄科植物中的甾体内酯类化合物 | 合成生物学 | NA | CRISPR | 机器学习 | 生物过程数据 | NA |
| 59 | 2024-08-13 |
Strategies in engineering sustainable biochemical synthesis through microbial systems
2024-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102493
PMID:38971129
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综述 | 本文综述了利用微生物系统进行可持续生物化学合成的策略 | 结合系统生物学和合成生物学，以及将人工智能与代谢工程整合，以精确和数据驱动的方式设计生物合成途径 | 讨论了当前的限制并提出了优化生物系统的策略 | 开发可持续替代品以替代化石燃料和化学品，并推动绿色生物技术的发展 | 微生物系统的生物合成能力 | 生物技术 | NA | 代谢工程 | 人工智能 | 数据 | NA |
| 60 | 2024-08-13 |
Biosynthesis and recruitment of reactive amino acids in nonribosomal peptide assembly lines
2024-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102494
PMID:38936328
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研究论文 | 本文探讨了非核糖体肽装配线上反应性氨基酸侧链的生物合成及其招募机制 | 本文揭示了多种反应性氨基酸在非核糖体肽中的生物合成途径及其在药物开发中的应用潜力 | NA | 研究反应性氨基酸在非核糖体肽合成中的作用及其在制药领域的应用 | 反应性氨基酸及其在非核糖体肽中的生物合成和功能 | 生物化学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA |