合成生物学相关文章
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当前共找到 73 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-02 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-11-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA折纸技术的模块化系统，能够实现复杂三维纳米结构的快速高效重构 | 开发了具有可编程三维连接的DNA折纸'体素'模块化系统，实现了多种形状的组装和快速可逆的全局结构重构 | 当前合成系统在分层组装中的产量较低，且在多样结构间的快速高效重构方面仍面临挑战 | 开发可重构的纳米材料，为纳米机器人系统的组装提供模块化组件 | DNA折纸体素 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | 50种结构原型 |
| 2 | 2025-06-26 |
Advanced Antibacterial Strategies for Combatting Biomaterial-Associated Infections: A Comprehensive Review
2024 Nov-Dec, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.2018
PMID:39654369
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综述 | 本文全面回顾了生物材料相关感染（BAIs）的机制及当前抗菌策略，探讨了多功能抗菌生物材料的最新进展 | 探讨了合成生物学作为对抗抗菌素耐药性的新方法，并强调了从实验室研究到临床应用的潜在设计路线 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于文献综述 | 指导高效且生物相容性抗菌生物材料的设计与开发 | 生物材料相关感染（BAIs）及其抗菌策略 | 生物医学工程 | 生物材料相关感染 | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-06-03 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
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research paper | 研究报道了通过工程化细菌孢子组装形成的宏观材料 | 利用合成生物学设计宏观材料，并揭示了卷曲螺旋相互作用在不同长度尺度上的影响 | 机械性能在pH变化时保持恒定，但侵蚀稳定性与工程化表面蛋白的pH依赖性相互作用一致 | 设计宏观材料并研究卷曲螺旋相互作用的影响 | 工程化细菌孢子 | 合成生物学 | NA | T7驱动表达系统 | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-06-03 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
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研究论文 | 该研究通过细胞内水凝胶化技术，将非复制但代谢活跃的Cyborg细菌方法扩展到病原菌，探索其在生物医学应用中的潜力 | 将Cyborg细胞方法从实验室菌株扩展到病原菌，并验证其在巨噬细胞中的摄取和表型响应 | 仅研究了特定菌株的病原菌，未涵盖所有可能的病原菌类型 | 探索病原菌通过细胞内水凝胶化技术改造后的生物医学应用潜力 | 不同菌株的病原菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化技术、共聚焦显微镜、实时PCR | NA | 实验数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及多种病原菌菌株 |
| 5 | 2025-06-03 |
Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00140
PMID:39418641
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research paper | 介绍了一种使用双质粒mini-Tn5系统在大肠杆菌中稳定整合多拷贝目标基因的方法 | 开发了一种新型双质粒mini-Tn5系统，实现了目标基因在大肠杆菌染色体中的稳定多拷贝整合 | 未提及具体的应用限制或潜在问题 | 开发一种稳定且可控的基因表达方法，以提高工程微生物中有价值代谢物的生产效率 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 双质粒mini-Tn5系统 | NA | NA | 使用了大肠杆菌MG1655和XL1-Blue MRF'菌株进行实验 |
| 6 | 2025-06-03 |
Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00445
PMID:39444231
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和实验室进化技术，首次在Yarrowia lipolytica中成功生产L-苹果酸 | 首次在Yarrowia lipolytica中结合代谢工程和实验室进化技术生产L-苹果酸，并通过优化培养基和扩大生产规模显著提高了产量 | 研究未涉及生产成本和工业化生产的可行性分析 | 探索Yarrowia lipolytica生产L-苹果酸的潜力，并优化其生产流程 | Yarrowia lipolytica真菌 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 代谢工程、实验室进化、生物反应器放大 | NA | NA | 实验涉及摇瓶和5L生物反应器规模的培养 |
| 7 | 2025-06-03 |
Application of a Cell-Free Synthetic Biology Platform for the Reconstitution of Teleocidin B and UK-2A Precursor Biosynthetic Pathways
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00560
PMID:39469830
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研究论文 | 本文报道了利用无细胞合成生物学平台成功重构了两种不同复杂度和结构类别的天然产物生物合成途径 | 首次在无细胞系统中重构了teleocidin B和UK-2A前体的生物合成途径，并发现TleA与MbtH之间的直接相互作用 | NA | 探索植物无细胞蛋白合成系统在天然产物生物合成途径重构中的应用 | teleocidin B和UK-2A前体的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统(CFPS) | NA | 生物化学数据 | NA |
| 8 | 2025-06-03 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
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research paper | 该研究探讨了平衡训练集对基于深度学习的CRISPR sgRNA活性预测的影响 | 通过比较平衡与不平衡数据集对CNN和LLM模型预测性能的影响，并测试了合成sgRNAs对不平衡数据集的增强效果 | 研究仅针对CRISPR-Cas12a和CRISPR-Cas9系统，未涵盖其他CRISPR系统 | 提高CRISPR sgRNA活性预测的准确性 | CRISPR sgRNA | machine learning | NA | CRISPR-Cas12a和CRISPR-Cas9筛选 | CNN, LLM | 序列数据 | 酵母CRISPR-Cas12a筛选数据及CRISPR-Cas9数据集 |
| 9 | 2025-05-23 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
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研究论文 | 本文介绍了一种使用定向胆固醇标记的三链DNA作为合成受体，通过H介导的构象变化实现跨膜信号转导的人工信号转导系统 | 利用三链DNA的构象变化模拟天然G蛋白偶联受体的功能动态，实现了跨膜信号转导的多功能应用 | NA | 开发合成生物学中跨膜信号转导的人工系统 | 胆固醇标记的三链DNA和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、选择性光裂解、催化信号放大 | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-05-21 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本研究开发了一种新型的Lcm模块，实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的高效转化，并在过程中固定CO2而非释放 | 开发了一种新型的Lcm模块，首次实现了乙酰辅酶A到丙酮酸的直接转化，并在过程中固定CO2，而非释放 | 目前仅进行了体外验证，尚未在体内大规模应用中验证其效果 | 开发一种新型的乙酰辅酶A同化途径，以提高碳利用效率 | 乙酰辅酶A和丙酮酸的代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-05-21 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
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research paper | 该研究通过设计和合成酵母染色体XIII，探索了其在衰老研究中的应用 | 成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统获得20个寿命延长的菌株，揭示了rRNA相关转录因子RRN9上调对寿命的积极影响 | 研究主要基于酵母模型，结果在高等生物中的适用性尚待验证 | 研究酵母衰老的分子机制 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE系统 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 |
| 12 | 2025-05-19 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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research paper | 介绍了一个包含6144个短合成启动子的库，用于在哺乳动物细胞中大规模并行报告分析 | 设计了一个短于250bp的合成启动子库，能够精确检测和放大转录活性，适用于多种细胞系和刺激 | 未提及具体的技术限制或样本量的局限性 | 开发可调谐的报告基因，用于药物开发、合成生物学和生命科学研究 | 哺乳动物细胞中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子 |
| 13 | 2025-05-17 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 该研究通过结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在GUVs中的重构，展示了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环以实现合成细胞分裂的潜力 | 结合肌动蛋白环和细菌MinDE蛋白系统，实现了自组织空间靶向收缩肌动蛋白环，诱导囊泡中段变形和囊泡出芽 | NA | 开发合成细胞自分裂的最小模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)和肌动蛋白环 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白环重构和MinDE蛋白系统 | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-04-25 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT架构的预测工具TeaTFactor，用于识别茶树转录因子 | 利用预训练策略和BERT架构，首次应用于茶树转录因子的预测，开发了在线服务器 | 未明确提及模型在跨物种应用中的泛化能力 | 开发高效准确的茶树转录因子预测工具 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练模型 | BERT | 蛋白质序列数据 | 使用UniProt数据库的蛋白质数据和收集的茶树转录因子数据进行训练 |
| 15 | 2025-04-24 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
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研究论文 | 本文提出了一种结合合成生物学和系统生物学的方法，用于在体内测量酶学参数 | 开发了一种通用的体内酶学参数测量方法，克服了传统体外实验条件与生理条件不符的局限性 | 目前仅应用于酵母合成类胡萝卜素途径中的特定酶类 | 开发一种在真实细胞条件下测量酶动力学参数的新方法 | 酿酒酵母中的合成类胡萝卜素途径（重点关注植烯合酶和三种植烯去饱和酶） | 合成生物学 | NA | 代谢组学、通量组学和蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | 一组经过基因改造的酵母菌株（通过操纵GGPP合酶表达来模拟底物浓度变化） |
| 16 | 2025-03-20 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
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研究论文 | 本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐（HExxH）结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能 | 首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合，并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能 | NA | 研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能 | 包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶 | 酶学 | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 17 | 2025-03-11 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 本文总结了基于智能荧光团的纳米结构在特定细胞器中的制备，用于高效的生物成像和癌症治疗应用 | 提出了在特定细胞器中通过刺激响应形成超分子纳米结构的方法，用于生物成像和治疗 | 讨论了细胞内自组装在治疗应用中的挑战和前景 | 研究智能超分子材料在生物成像和治疗中的应用 | 细胞器中的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 荧光成像 | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-03-06 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本文报道了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构，并通过结构比较和系统定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 通过晶体结构和定点突变揭示了BcmA酶活性和底物选择性的关键残基，特别是非保守残基D161和K165在P2口袋中的作用 | 未提及具体的研究局限性 | 研究BcmA酶的结构基础及其对酶活性和底物选择性的影响 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA | 结构生物学 | NA | 晶体结构分析、定点突变 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 19 | 2025-01-05 |
R3Design: deep tertiary structure-based RNA sequence design and beyond
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae682
PMID:39737572
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研究论文 | 本文介绍了一种基于RNA三级结构的序列设计方法R3Design，该方法在RNA序列设计中优先考虑三级结构，显著提高了序列设计的准确性和效率 | R3Design方法首次将RNA序列设计的重点从二级结构转移到三级结构，显著提升了序列恢复率和Macro-F1分数，超越了传统的二级结构设计方法 | NA | 开发一种基于RNA三级结构的序列设计方法，以推动RNA治疗应用和合成生物学的发展 | RNA分子 | 生物信息学 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 多个数据集 |
| 20 | 2025-01-05 |
Non-small-molecule therapeutics for drug addiction: From pharmaco-kinetics modulating to synthetic biology
2024-Nov, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.09.027
PMID:39734543
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研究论文 | 本文探讨了非小分子疗法在药物成瘾治疗中的应用，从药代动力学调节到合成生物学 | 提出了通过基因编辑技术进行基因治疗，构建可编程基因开关以响应非法药物，从而实现长期稳定的酶和其他效应蛋白的递送 | 生物大分子通常不稳定且半衰期短 | 开发新型有效的药物成瘾治疗方法 | 药物成瘾患者 | 合成生物学 | 药物成瘾 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |