合成生物学相关文章
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当前共找到 73 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-03-20 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
|
研究论文 | 本文揭示了一种包含N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-His-1-羧酸盐（HExxH）结构域的单一翻译后修饰酶的结构和功能 | 首次展示了自由基SAM结构域和HExxH结构域在单一酶中的融合，并揭示了这种酶催化三残基环芳烃形成和β-羟基化的功能 | NA | 研究一种新型翻译后修饰酶的结构和功能 | 包含N端自由基SAM结构域和C端HExxH结构域的酶 | 酶学 | NA | 晶体结构分析 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 2 | 2025-03-11 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 本文总结了基于智能荧光团的纳米结构在特定细胞器中的制备，用于高效的生物成像和癌症治疗应用 | 提出了在特定细胞器中通过刺激响应形成超分子纳米结构的方法，用于生物成像和治疗 | 讨论了细胞内自组装在治疗应用中的挑战和前景 | 研究智能超分子材料在生物成像和治疗中的应用 | 细胞器中的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 荧光成像 | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-03-06 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本文报道了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构，并通过结构比较和系统定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 通过晶体结构和定点突变揭示了BcmA酶活性和底物选择性的关键残基，特别是非保守残基D161和K165在P2口袋中的作用 | 未提及具体的研究局限性 | 研究BcmA酶的结构基础及其对酶活性和底物选择性的影响 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA | 结构生物学 | NA | 晶体结构分析、定点突变 | NA | 晶体结构数据 | NA |
| 4 | 2025-03-05 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT架构的预测工具TeaTFactor，用于预测茶树转录因子 | 利用BERT架构进行预训练，并针对茶树转录因子数据进行微调，提出了一种新的识别算法 | 未提及具体局限性 | 开发一种高效预测茶树转录因子的计算工具 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练 | BERT | 蛋白质序列数据 | 未提及具体样本数量 |
| 5 | 2025-02-28 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
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研究论文 | 本文报道了通过工程化细菌孢子组装形成的宏观材料 | 利用T7驱动的表达系统在孢子表面展示高密度的pH响应自结合蛋白，实现了pH依赖的蛋白质水平结合和颗粒材料的组装 | 机械性能在pH变化时基本保持不变，但侵蚀稳定性与工程化表面蛋白之间的pH依赖相互作用一致，存在pH依赖性 | 设计宏观材料并研究卷曲螺旋相互作用在不同长度尺度上的影响 | 工程化细菌孢子 | 合成生物学 | NA | T7驱动的表达系统 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-01-23 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
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研究论文 | 本文通过细胞内水凝胶化技术，将非复制但代谢活跃的Cyborg细菌扩展到病原菌，探索其在生物医学应用中的潜力 | 将细胞内水凝胶化技术从实验室菌株扩展到病原菌，并验证其在巨噬细胞中的摄取和表型响应 | 仅研究了特定病原菌株，未涵盖所有可能的病原菌类型 | 探索通过细胞内水凝胶化技术改造病原菌，以应用于生物医学领域 | 不同菌株的病原菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化技术 | NA | 实验数据 | 多种病原菌株 |
| 7 | 2025-01-05 |
R3Design: deep tertiary structure-based RNA sequence design and beyond
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae682
PMID:39737572
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研究论文 | 本文介绍了一种基于RNA三级结构的序列设计方法R3Design，该方法在RNA序列设计中优先考虑三级结构，显著提高了序列设计的准确性和效率 | R3Design方法首次将RNA序列设计的重点从二级结构转移到三级结构，显著提升了序列恢复率和Macro-F1分数，超越了传统的二级结构设计方法 | NA | 开发一种基于RNA三级结构的序列设计方法，以推动RNA治疗应用和合成生物学的发展 | RNA分子 | 生物信息学 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 多个数据集 |
| 8 | 2025-01-05 |
Non-small-molecule therapeutics for drug addiction: From pharmaco-kinetics modulating to synthetic biology
2024-Nov, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.09.027
PMID:39734543
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研究论文 | 本文探讨了非小分子疗法在药物成瘾治疗中的应用，从药代动力学调节到合成生物学 | 提出了通过基因编辑技术进行基因治疗，构建可编程基因开关以响应非法药物，从而实现长期稳定的酶和其他效应蛋白的递送 | 生物大分子通常不稳定且半衰期短 | 开发新型有效的药物成瘾治疗方法 | 药物成瘾患者 | 合成生物学 | 药物成瘾 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-12-20 |
Research Progress and Application of Miniature CRISPR-Cas12 System in Gene Editing
2024-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312686
PMID:39684395
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综述 | 本文综述了微型CRISPR-Cas12系统的研究进展及其在基因编辑中的应用 | 微型CRISPR-Cas12系统相比常用的CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a具有丰富的PAM位点、更高的特异性、更小的体积和较低的细胞毒性 | 微型Cas12蛋白的应用及其编辑效率的改进方法尚未得到系统总结 | 旨在为深入理解微型CRISPR-Cas12系统的功能机制和工程化改造提供参考 | 微型CRISPR-Cas12系统在动物、植物和微生物基因编辑中的应用及其编辑效率的改进策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-12-19 |
Advanced Antibacterial Strategies for Combatting Biomaterial-Associated Infections: A Comprehensive Review
2024 Nov-Dec, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.2018
PMID:39654369
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综述 | 本文综述了生物材料相关感染的挑战及其预防策略，重点探讨了抗菌涂层和多功能抗菌生物材料的应用 | 本文讨论了多功能抗菌生物材料的最新进展，并提出了合成生物学作为应对抗菌耐药性的新方法 | 本文主要为综述性质，未提供具体的实验数据或模型 | 旨在指导高效且生物相容的抗菌生物材料的设计与开发 | 生物材料相关感染及其预防策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-12-16 |
Reconstitution of the Mevalonate Pathway for Improvement of Isoprenoid Production and Industrial Applicability in Escherichia coli
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2408.08053
PMID:39467704
|
研究论文 | 本文通过在Escherichia coli中重构甲羟戊酸（MVA）途径，提高了异戊二烯类化合物的生产及其工业应用性 | 引入了来自生物安全等级1（BSL 1）生物体的新基因组合，重构了MVA途径，并显著提高了类胡萝卜素和番茄红素的产量及细胞特异性生产力 | 未提及具体的局限性 | 通过代谢工程和合成生物学策略，提高微生物生产高附加值异戊二烯类化合物的能力 | Escherichia coli中的异戊二烯类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-12-16 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-Nov-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法从头构建功能性微生物生态系统的策略 | 提出了一个更全面的设计-构建-测试-学习流程，用于设计和优化微生物生态系统 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 总结和推进基于不同调控电路的微生物生态系统构建策略 | 微生物生态系统中的种内和种间相互作用及正交调控模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展，并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品，以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中，并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验，未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 |
| 15 | 2024-12-06 |
Genetic Engineering Approaches for the Microbial Production of Vanillin
2024-Nov-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111413
PMID:39595589
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综述 | 本文综述了利用遗传工程和合成生物学方法提高微生物生产香草醛的最新进展 | 本文介绍了通过基因工程和合成生物学方法，在天然生产香草醛的微生物中增加香草醛产量，或在微生物底盘中实现新的香草醛生物合成途径的创新方法 | NA | 探讨如何利用遗传工程和合成生物学方法提高微生物生产香草醛的效率 | 香草醛的微生物生产 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-12-02 |
Genetic engineering of Nannochloropsis oceanica to produce canthaxanthin and ketocarotenoids
2024-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02599-4
PMID:39609835
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研究论文 | 通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产角黄素和酮类胡萝卜素 | 通过基因重设计和异源转化，显著增加了酮类胡萝卜素和角黄素的含量 | 在较高光照强度下，bkt品系的生长速度较慢 | 开发可持续的生产生物分子的过程，利用Nannochloropsis oceanica的光合作用和碳同化特性 | Nannochloropsis oceanica | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-12-02 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-Nov-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
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研究论文 | 本文通过计算方法重新设计了一种非核糖体肽合成酶（NRPS）样羧酸还原酶的“守门员”腺苷化域，显著提高了其催化效率和底物特异性 | 通过近似机制的几何标准和Rosetta能量评分，成功重新设计了NRPS样酶的腺苷化域，显著提高了催化效率和底物特异性 | NA | 通过计算方法重新设计NRPS样酶的腺苷化域，以提高其催化效率和底物特异性 | 非核糖体肽合成酶（NRPS）样羧酸还原酶的腺苷化域 | 合成生物学 | NA | 计算设计 | NA | NA | 涉及CAR3突变体ACA-1和ACA-4，以及G418K |
| 18 | 2024-12-02 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-Nov-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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研究论文 | 介绍了一种包含6144个合成启动子的文库，用于在哺乳动物细胞中筛选短合成启动子 | 开发了一种大规模并行报告基因分析文库，能够精确检测和放大转录活性，适用于多种细胞系和刺激响应 | NA | 开发一种工具，用于在哺乳动物细胞中筛选和分析合成启动子的转录活性 | 合成启动子及其在不同细胞系和刺激响应中的功能 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子，适用于多种细胞系和刺激响应 |
| 19 | 2024-12-01 |
An efficient and easily obtainable butelase variant for chemoenzymatic ligation and modification of peptides and proteins
2024-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02598-5
PMID:39614317
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研究论文 | 本文介绍了一种新型Butelase 1变体Butelase AY，通过突变提高其稳定性和产量，适用于多种蛋白质和肽的工程化任务 | 通过突变Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基，成功开发出一种高效且易于获得的Butelase AY变体，适用于生物正交应用 | NA | 开发一种高效且易于获得的Butelase 1变体，用于蛋白质和肽的化学酶法连接和修饰 | Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基突变，以及其在肽和蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质和肽 | 肽GLGKY、球状蛋白质GFP和内在无序蛋白质α-synuclein |
| 20 | 2024-12-01 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本文展示了在巨型单层脂质体（GUVs）中重组肌动蛋白-肌球蛋白环和细菌MinDE蛋白系统的结合，实现了肌动蛋白环的自组织赤道组装和脂质体的变形 | 通过结合肌动蛋白-肌球蛋白环和MinDE蛋白系统，实现了肌动蛋白环在脂质体中的自组织定位和变形，展示了不同生物功能机制在体外结合的可能性 | NA | 工程化合成细胞的自分裂最小模块 | 肌动蛋白-肌球蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在巨型单层脂质体（GUVs）中的重组 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白-肌球蛋白环和MinDE蛋白系统的重组 | NA | NA | NA |