合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 69 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
|
研究论文 | 开发基于BERT的茶树转录因子预测工具TeaTFactor | 首次将BERT预训练策略应用于茶树转录因子预测，并开发了在线网络服务器 | NA | 开发准确识别茶树转录因子的计算方法 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练 | BERT | 蛋白质序列数据 | NA | NA | 茶树 | NA | 农业 |
| 2 | 2025-10-05 |
Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing
2024-11-06, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022
PMID:39442006
|
研究论文 | 本文开发了一种基于巨型囊泡和门控纳米粒子化学通讯的传感系统，用于条带检测 | 首次将巨型囊泡作为发送器与门控介孔纳米粒子作为接收器结合，实现化学通讯并应用于传感系统 | 实际应用验证仍需进一步开展 | 开发基于微纳粒子化学通讯的传感系统 | 巨型单层囊泡和门控介孔纳米粒子 | 纳米技术,合成生物学 | NA | 条带传感,智能手机检测 | NA | 化学信号 | 以细菌毒素α-溶血素为目标分析物进行实际样品测试 | NA | NA | 化学通讯系统,信号放大系统 | 医学检测,环境监测 |
| 3 | 2025-10-05 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-11-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
|
研究论文 | 开发了一种基于DNA折纸体素的可重构纳米材料系统，通过可编程三维连接实现多种结构的快速重构 | 提出了模块化DNA折纸体素系统，实现了局部连接在柔性和刚性状态间的可编程切换，以及通过柔性链中间体组装提高产率的新方法 | 当前合成系统在分层组装中产率较低，在不同结构间快速高效重构仍面临挑战 | 开发可重构的DNA纳米材料组装系统 | DNA折纸体素及其组装结构 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | 12种独特体素原型构建50种结构 | DNA折纸 | NA | 可编程三维连接系统，柔性链中间体组装路径 | 合成生物学, 无机材料组装, 纳米医学 |
| 4 | 2025-10-05 |
Advanced Antibacterial Strategies for Combatting Biomaterial-Associated Infections: A Comprehensive Review
2024 Nov-Dec, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.2018
PMID:39654369
|
综述 | 全面探讨生物材料相关感染的抗菌策略及其机制 | 系统分析多功能抗菌生物材料的集成机制，并提出合成生物学作为对抗抗菌耐药性的新途径 | NA | 指导高效生物相容性抗菌生物材料的设计与开发 | 生物材料表面细菌粘附和生物膜形成机制 | 生物医学工程 | 植入物感染 | NA | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2025-10-05 |
Macroscopic Assembly of Materials with Engineered Bacterial Spores via Coiled-Coil Interaction
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00468
PMID:39393788
|
研究论文 | 通过工程化细菌孢子的卷曲螺旋相互作用实现宏观材料的组装 | 利用合成生物学方法在孢子表面展示pH响应型自组装蛋白，实现蛋白水平的pH依赖性结合和宏观材料组装 | NA | 设计基于工程化细菌孢子的宏观组装材料 | 工程化细菌孢子及其组装材料 | 合成生物学 | NA | T7驱动表达系统 | NA | NA | NA | T7表达系统 | 细菌孢子 | 表面展示pH响应型自组装蛋白的工程化系统 | 材料 |
| 6 | 2025-10-05 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
|
研究论文 | 本研究通过细胞内水凝胶化技术将非复制但代谢活跃的Cyborg细胞方法扩展到病原细菌 | 将细胞内水凝胶化方法从实验室菌株扩展到细菌病原体，创建了新型Cyborg病原体 | 仅研究了特定病原菌株，未探索更广泛的病原体种类 | 开发具有病原特性的非复制但代谢活跃的工程化病原体用于生物医学应用 | 不同菌株的病原细菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化、共聚焦显微镜、实时PCR | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 多种病原菌株 | 细胞内水凝胶化 | 病原细菌 | 细胞内水凝胶网络 | 医药 |
| 7 | 2025-10-05 |
Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00140
PMID:39418641
|
研究论文 | 开发了一种使用双质粒mini-Tn5系统在大肠杆菌中稳定整合多拷贝目标基因的方法 | 首次采用双质粒mini-Tn5系统实现目标基因的多拷贝稳定整合，并设计了可移除抗生素抗性基因的标记系统 | 在不同菌株中整合拷贝数存在差异（RecA+菌株19拷贝，RecA-菌株5拷贝） | 开发稳定高效的多拷贝基因整合方法以提高工程微生物代谢产物产量 | 大肠杆菌菌株（MG1655和XL1-Blue MRF'） | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 分子生物学数据 | 多种大肠杆菌菌株 | mini-Tn5转座子系统, 双质粒系统 | 大肠杆菌 | 多拷贝基因整合系统，包含可移除抗生素抗性基因标记 | 工业生物技术 |
| 8 | 2025-10-05 |
Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00445
PMID:39444231
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程和实验室进化改造耶氏酵母，使其能够利用甘油高效生产L-苹果酸 | 首次在耶氏酵母中实现L-苹果酸生产，通过过表达内源基因和异源转运蛋白，结合适应性实验室进化提高产量和耐酸性 | NA | 开发耶氏酵母作为L-苹果酸生产的微生物细胞工厂 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 代谢工程，适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 基因过表达，适应性进化 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | L-苹果酸生物合成途径，包括乙醛酸循环途径(异柠檬酸裂解酶、苹果酸合酶、苹果酸脱氢酶)和苹果酸转运蛋白 | 食品工业，化学工业，制药工业 |
| 9 | 2025-10-05 |
Application of a Cell-Free Synthetic Biology Platform for the Reconstitution of Teleocidin B and UK-2A Precursor Biosynthetic Pathways
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00560
PMID:39469830
|
研究论文 | 本研究利用植物细胞无蛋白合成系统成功重构了teleocidin B和UK-2A前体两种天然产物的生物合成途径 | 首次在无细胞系统中成功重构了结构复杂程度不同的两种天然产物生物合成途径，并发现TleA与MbtH的直接相互作用 | 未明确说明系统产量与体内系统的比较优势以及规模化应用的可行性 | 开发植物细胞无蛋白合成平台用于天然产物生物合成途径的重构与优化 | teleocidin B-3和UK-2二醇两种天然产物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 细胞无蛋白合成系统 | NA | NA | NA | BY-2系统, 小麦胚芽CFPS系统 | 烟草BY-2细胞, 小麦胚芽 | teleocidin生物合成途径, UK-2A前体生物合成途径（包含10个蛋白质的复杂途径） | 工业生物技术 |
| 10 | 2025-10-05 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
|
研究论文 | 本研究探讨平衡训练集对基于深度学习的CRISPR sgRNA活性预测性能的影响 | 首次系统比较平衡与不平衡数据集对CRISPR sgRNA活性预测模型性能的影响，并验证通过添加合成sgRNA改善不平衡数据集能提升预测准确度 | 研究主要基于特定CRISPR-Cas系统（Cas12a和Cas9）的数据，可能不适用于其他CRISPR系统 | 提高CRISPR sgRNA活性预测的准确性 | CRISPR系统的sgRNA序列 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas筛选 | CNN, LLM | 序列数据 | 来自酵母和人类细胞的CRISPR筛选数据 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | 酵母, 人类细胞 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction
2024-11-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53960-5
PMID:39532841
|
研究论文 | 开发了一种基于定向三链DNA的人工跨膜信号转导系统 | 首次使用胆固醇标记的定向三链DNA作为合成受体，通过pH驱动的构象变化实现跨膜信号转导 | NA | 构建模拟天然GPCR功能的人工信号转导系统 | 三链DNA合成受体和脂质双层膜 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)、光切割、信号放大 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 三链DNA构象开关、逻辑门调制、信号放大回路 | 生物传感、细胞信号调控、靶向药物递送 |
| 12 | 2025-10-05 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型的二氧化碳依赖性乙酰-CoA同化途径Lcm模块 | 创建了自然界不存在的新型CO2固定途径，利用工程化B12依赖性酰基-CoA变位酶实现乙酰-CoA向丙酮酸的直接转化 | 目前仅在体外验证了完整的Lcm模块功能，体内应用效果需进一步验证 | 开发高效的乙酰-CoA同化途径以解决碳损失问题 | 乙酰-CoA代谢途径和工程化酶系统 | 合成生物学 | NA | 定向超突变、适应性进化、体外验证 | NA | 酶活性数据、代谢途径分析数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | Lcm代谢模块，包含3-羟基丙酰-CoA向乳酰-CoA转化的新型酶促反应 | 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging
2024-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54130-3
PMID:39578428
|
研究论文 | 通过人工设计和合成酵母染色体XIII，研究其对衰老过程的影响 | 首次成功构建884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统实现可诱导的全基因组重排 | 研究仅针对酵母染色体XIII，未涉及其他染色体或更复杂的生物系统 | 探索合成染色体在衰老研究中的应用 | 酿酒酵母合成染色体XIII | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 染色体合成技术，SCRaMbLE系统，转录组分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 20个SCRaMbLEd synXIII菌株 | SCRaMbLE | 酿酒酵母 | 合成染色体设计，可诱导基因组重排系统 | 医学，基础研究 |
| 14 | 2025-10-05 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
|
研究论文 | 开发了一个包含6144个短合成启动子的文库，用于在哺乳动物细胞中高通量筛选细胞刺激响应 | 构建了大规模并行报告分析文库，能够系统开发可调报告基因并捕获药物靶点介导的信号 | NA | 开发合成启动子文库用于检测细胞对刺激的转录响应 | 6144个短合成启动子在哺乳动物细胞中的功能特性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子，在多种细胞系中测试 | NA | 哺乳动物细胞 | 合成启动子，转录报告系统 | 药物开发, 合成生物学, 细胞工程, 配体探索 |
| 15 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
|
研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构，实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合，实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象，尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |
| 16 | 2025-10-05 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
|
研究论文 | 开发了一种结合系统生物学和合成生物学的通用方法，用于在活体细胞内测量酶动力学参数 | 首次在酿酒酵母中通过合成类胡萝卜素途径，在真实细胞条件下测量酶动力学参数，揭示了体内外参数的差异 | 仅针对类胡萝卜素途径中的特定酶进行研究，方法在其他酶系统中的应用仍需验证 | 开发在真实细胞环境中测量酶动力学参数的方法 | 八氢番茄红素合成酶和三种八氢番茄红素去饱和酶 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、通量组学、蛋白质组学 | NA | 代谢物浓度、通量、蛋白质表达数据 | 一系列经过工程改造的酿酒酵母菌株 | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 合成类胡萝卜素途径，通过调控香叶基香叶基焦磷酸合酶表达来模拟底物浓度变化 | 基础研究 |
| 17 | 2025-10-05 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
|
研究论文 | 本研究揭示了一种融合了自由基SAM结构域和αKG-HExxH结构域的新型蛋白质，具有独特的结构折叠并催化环芳烃形成和β-羟基化反应 | 发现了一种新型融合蛋白结构，将自由基SAM酶结构域与α-酮戊二酸非血红素铁酶结构域结合，并定义了新的αKG-HExxH酶家族 | NA | 研究含有融合结构域的新型金属蛋白的结构与功能特性 | 含有N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-组氨酸-1-羧酸盐结构域的融合蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、酶学 |
| 18 | 2025-10-05 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
|
综述 | 总结基于智能荧光团的有序纳米结构在特定细胞器中的制备方法，用于高效生物成像和癌症诊疗应用 | 利用刺激响应机制在亚细胞器原位生成分子前体并形成超分子纳米结构，实现精准生物成像 | 未提及具体实验数据验证，主要聚焦于概念总结与展望 | 开发细胞器特异性智能超分子材料用于生物成像和诊疗应用 | 亚细胞器内的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 超分子自组装 | NA | 荧光成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2025-10-05 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
|
研究论文 | 本研究解析了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构并通过定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 首次报道BcmA的晶体结构，并通过结构比较和系统定点突变鉴定了控制酶活性和底物选择性的关键决定因素 | NA | 阐明BcmA酶活性和底物选择性的结构基础和决定因素 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA及其底物特异性 | 结构生物学 | NA | 晶体结构解析、定点突变 | NA | 结构数据、突变分析数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 合成生物学 |
| 20 | 2025-01-05 |
R3Design: deep tertiary structure-based RNA sequence design and beyond
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae682
PMID:39737572
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于RNA三级结构的序列设计方法R3Design，该方法在RNA序列设计中优先考虑三级结构，显著提高了序列设计的准确性和效率 | R3Design方法首次将RNA序列设计的重点从二级结构转移到三级结构，显著提升了序列恢复率和Macro-F1分数，超越了传统的二级结构设计方法 | NA | 开发一种基于RNA三级结构的序列设计方法，以推动RNA治疗应用和合成生物学的发展 | RNA分子 | 生物信息学 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |