合成生物学相关文章
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当前共找到 69 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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研究论文 | 开发了一个包含6144个短合成启动子的文库，用于在哺乳动物细胞中高通量筛选细胞刺激响应 | 构建了大规模并行报告分析文库，能够系统开发可调报告基因并捕获药物靶点介导的信号 | NA | 开发合成启动子文库用于检测细胞对刺激的转录响应 | 6144个短合成启动子在哺乳动物细胞中的功能特性 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子，在多种细胞系中测试 | NA | 哺乳动物细胞 | 合成启动子，转录报告系统 | 药物开发, 合成生物学, 细胞工程, 配体探索 |
| 22 | 2025-10-05 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本研究通过将肌动球蛋白环与细菌MinDE蛋白系统在GUVs中结合重构，实现了合成细胞自组织分裂的空间靶向控制 | 首次将细菌MinDE空间定位系统与真核细胞肌动球蛋白收缩系统相结合，实现了自组织的赤道面肌动球蛋白环组装 | 目前仅观察到囊泡中部变形和出泡现象，尚未实现完整的囊泡分裂 | 开发合成细胞自分裂的最小功能模块 | 巨型单层囊泡(GUVs)中的肌动球蛋白环和MinDE蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构技术 | NA | 显微镜图像 | NA | NA | NA | 肌动球蛋白收缩环与MinDE空间振荡系统组合 | 合成生物学, 基础研究 |
| 23 | 2025-10-05 |
Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology
2024-Nov, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00251-w
PMID:39322757
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研究论文 | 开发了一种结合系统生物学和合成生物学的通用方法，用于在活体细胞内测量酶动力学参数 | 首次在酿酒酵母中通过合成类胡萝卜素途径，在真实细胞条件下测量酶动力学参数，揭示了体内外参数的差异 | 仅针对类胡萝卜素途径中的特定酶进行研究，方法在其他酶系统中的应用仍需验证 | 开发在真实细胞环境中测量酶动力学参数的方法 | 八氢番茄红素合成酶和三种八氢番茄红素去饱和酶 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、通量组学、蛋白质组学 | NA | 代谢物浓度、通量、蛋白质表达数据 | 一系列经过工程改造的酿酒酵母菌株 | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 合成类胡萝卜素途径，通过调控香叶基香叶基焦磷酸合酶表达来模拟底物浓度变化 | 基础研究 |
| 24 | 2025-10-05 |
Fused radical SAM and αKG-HExxH domain proteins contain a distinct structural fold and catalyse cyclophane formation and β-hydroxylation
2024-Nov, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01596-9
PMID:39294420
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研究论文 | 本研究揭示了一种融合了自由基SAM结构域和αKG-HExxH结构域的新型蛋白质，具有独特的结构折叠并催化环芳烃形成和β-羟基化反应 | 发现了一种新型融合蛋白结构，将自由基SAM酶结构域与α-酮戊二酸非血红素铁酶结构域结合，并定义了新的αKG-HExxH酶家族 | NA | 研究含有融合结构域的新型金属蛋白的结构与功能特性 | 含有N端自由基S-腺苷甲硫氨酸结构域和C端2-组氨酸-1-羧酸盐结构域的融合蛋白 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、酶学 |
| 25 | 2025-10-05 |
Organelle-Specific Smart Supramolecular Materials for Bioimaging and Theranostics Application
2024-Nov-28, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00483-8
PMID:39607460
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综述 | 总结基于智能荧光团的有序纳米结构在特定细胞器中的制备方法，用于高效生物成像和癌症诊疗应用 | 利用刺激响应机制在亚细胞器原位生成分子前体并形成超分子纳米结构，实现精准生物成像 | 未提及具体实验数据验证，主要聚焦于概念总结与展望 | 开发细胞器特异性智能超分子材料用于生物成像和诊疗应用 | 亚细胞器内的超分子纳米结构 | 合成生物学 | 癌症 | 超分子自组装 | NA | 荧光成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 26 | 2025-10-05 |
Crystal Structure and Mutagenesis of an XYP Subfamily Cyclodipeptide Synthase Reveal Key Determinants of Enzyme Activity and Substrate Specificity
2024-11-19, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00505
PMID:39475147
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研究论文 | 本研究解析了XYP亚家族环二肽合成酶BcmA的晶体结构并通过定点突变揭示了影响酶活性和底物选择性的关键残基 | 首次报道BcmA的晶体结构，并通过结构比较和系统定点突变鉴定了控制酶活性和底物选择性的关键决定因素 | NA | 阐明BcmA酶活性和底物选择性的结构基础和决定因素 | XYP亚家族环二肽合成酶BcmA及其底物特异性 | 结构生物学 | NA | 晶体结构解析、定点突变 | NA | 结构数据、突变分析数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 合成生物学 |
| 27 | 2025-01-05 |
R3Design: deep tertiary structure-based RNA sequence design and beyond
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae682
PMID:39737572
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研究论文 | 本文介绍了一种基于RNA三级结构的序列设计方法R3Design，该方法在RNA序列设计中优先考虑三级结构，显著提高了序列设计的准确性和效率 | R3Design方法首次将RNA序列设计的重点从二级结构转移到三级结构，显著提升了序列恢复率和Macro-F1分数，超越了传统的二级结构设计方法 | NA | 开发一种基于RNA三级结构的序列设计方法，以推动RNA治疗应用和合成生物学的发展 | RNA分子 | 生物信息学 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 多个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-01-05 |
Non-small-molecule therapeutics for drug addiction: From pharmaco-kinetics modulating to synthetic biology
2024-Nov, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2022.09.027
PMID:39734543
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研究论文 | 本文探讨了非小分子疗法在药物成瘾治疗中的应用，从药代动力学调节到合成生物学 | 提出了通过基因编辑技术进行基因治疗，构建可编程基因开关以响应非法药物，从而实现长期稳定的酶和其他效应蛋白的递送 | 生物大分子通常不稳定且半衰期短 | 开发新型有效的药物成瘾治疗方法 | 药物成瘾患者 | 合成生物学 | 药物成瘾 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-12-20 |
Research Progress and Application of Miniature CRISPR-Cas12 System in Gene Editing
2024-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312686
PMID:39684395
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综述 | 本文综述了微型CRISPR-Cas12系统的研究进展及其在基因编辑中的应用 | 微型CRISPR-Cas12系统相比常用的CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a具有丰富的PAM位点、更高的特异性、更小的体积和较低的细胞毒性 | 微型Cas12蛋白的应用及其编辑效率的改进方法尚未得到系统总结 | 旨在为深入理解微型CRISPR-Cas12系统的功能机制和工程化改造提供参考 | 微型CRISPR-Cas12系统在动物、植物和微生物基因编辑中的应用及其编辑效率的改进策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-12-16 |
Reconstitution of the Mevalonate Pathway for Improvement of Isoprenoid Production and Industrial Applicability in Escherichia coli
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2408.08053
PMID:39467704
|
研究论文 | 本文通过在Escherichia coli中重构甲羟戊酸（MVA）途径，提高了异戊二烯类化合物的生产及其工业应用性 | 引入了来自生物安全等级1（BSL 1）生物体的新基因组合，重构了MVA途径，并显著提高了类胡萝卜素和番茄红素的产量及细胞特异性生产力 | 未提及具体的局限性 | 通过代谢工程和合成生物学策略，提高微生物生产高附加值异戊二烯类化合物的能力 | Escherichia coli中的异戊二烯类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展，并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品，以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中，并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验，未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-12-02 |
Genetic engineering of Nannochloropsis oceanica to produce canthaxanthin and ketocarotenoids
2024-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02599-4
PMID:39609835
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研究论文 | 通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产角黄素和酮类胡萝卜素 | 通过基因重设计和异源转化，显著增加了酮类胡萝卜素和角黄素的含量 | 在较高光照强度下，bkt品系的生长速度较慢 | 开发可持续的生产生物分子的过程，利用Nannochloropsis oceanica的光合作用和碳同化特性 | Nannochloropsis oceanica | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-12-01 |
An efficient and easily obtainable butelase variant for chemoenzymatic ligation and modification of peptides and proteins
2024-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02598-5
PMID:39614317
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研究论文 | 本文介绍了一种新型Butelase 1变体Butelase AY，通过突变提高其稳定性和产量，适用于多种蛋白质和肽的工程化任务 | 通过突变Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基，成功开发出一种高效且易于获得的Butelase AY变体，适用于生物正交应用 | NA | 开发一种高效且易于获得的Butelase 1变体，用于蛋白质和肽的化学酶法连接和修饰 | Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基突变，以及其在肽和蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质和肽 | 肽GLGKY、球状蛋白质GFP和内在无序蛋白质α-synuclein | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-12-01 |
Deep learning revealed the distribution and evolution patterns for invertible promoters across bacterial lineages
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae966
PMID:39460615
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepInverton的深度学习模型，用于识别细菌中的可逆启动子（invertons），并分析了其在不同细菌谱系中的分布和进化模式 | 首次使用深度学习模型DeepInverton在不需要测序读取的情况下识别细菌中的可逆启动子，并揭示了其在病原体中的普遍性和在环境适应中的作用 | NA | 研究可逆启动子在细菌中的分布和进化模式 | 细菌基因组和宏基因组中的可逆启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组和宏基因组数据 | 分析了68,733个细菌基因组和9,382个宏基因组，识别出超过200,000个非冗余的可逆启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-12-01 |
Synthetic translational coupling element for multiplexed signal processing and cellular control
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae980
PMID:39526390
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化的合成翻译耦合元件（synTCE），并将其与从头设计的核糖调节器和脚趾开关集成，用于多路信号处理和细胞控制 | 引入了一种新的合成翻译耦合元件（synTCE），并展示了其在逻辑计算和信号传导中的应用 | NA | 开发定制化的生物系统功能，增强核糖调节器的计算能力和应用性 | 合成翻译耦合元件（synTCE）及其在生物系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-12-01 |
Cinnamaldehyde in Focus: Antimicrobial Properties, Biosynthetic Pathway, and Industrial Applications
2024-Nov-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13111095
PMID:39596788
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综述 | 本文综述了肉桂醛（TCA）的抗菌特性、生物合成途径及其在工业中的应用 | 本文探讨了肉桂醛在破坏微生物膜、抑制生物膜形成和调节病原体关键代谢途径中的作用，并介绍了其在化妆品中的应用 | NA | 综述肉桂醛的抗菌潜力及其在工业中的应用 | 肉桂醛的抗菌机制、生物合成途径及其市场和工业应用 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-11-29 |
Regioselectivity switches between anthraquinone precursor fissions involved in bioactive xanthone biosynthesis
2024-Nov-27, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06369d
PMID:39568878
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研究论文 | 研究了生物活性黄酮类化合物的生物合成途径，特别是如何切换蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性 | 首次揭示了通过BruN和BruM酶的协同作用，实现蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性切换 | NA | 探讨生物活性黄酮类化合物的生物合成机制，特别是蒽醌前体在不同键断裂之间的选择性 | 蒽醌前体在生物活性黄酮类化合物生物合成中的键断裂选择性 | 生物化学 | NA | 多蛋白序列比对、定向蛋白质进化、理论模拟、化学捕获、O追踪、X射线晶体结构分析 | NA | 蛋白质序列、化学结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-11-29 |
Construction of engineered probiotic that adhere and display nanobody to neutralize porcine reproductive and respiratory syndrome virus
2024-Nov-14, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04198-8
PMID:39540965
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研究论文 | 研究构建了一种工程益生菌，能够在表面粘附并展示纳米抗体以中和猪繁殖与呼吸综合征病毒 | 首次提出了一种结合粘附蛋白和纳米抗体的工程益生菌构建策略，具有粘附和中和病毒的双重效果 | NA | 开发一种新型工程益生菌，用于预防和治疗猪繁殖与呼吸综合征病毒感染 | 猪繁殖与呼吸综合征病毒、益生菌L. plantarum和E. coli | 合成生物学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 合成生物学技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-11-29 |
Different transcriptomic and metabolomic analysis of Saccharomyces cerevisiae BY4742 and CEN.PK2-1C strains
2024-Nov-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04178-y
PMID:39508902
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研究论文 | 研究了两种酵母菌株Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C的转录组和代谢组差异 | 首次系统分析了这两种酵母菌株在代谢和转录水平上的差异 | 研究仅限于两种特定的酵母菌株，结果可能不适用于其他酵母菌株 | 探讨不同酵母菌株间的转录和代谢变化，为高效酵母细胞工厂的建立提供基础 | Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C菌株 | NA | NA | 转录组分析和代谢组分析 | NA | 转录组数据和代谢组数据 | 两种酵母菌株 | NA | NA | NA | NA |