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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-12-20 |
Research Progress and Application of Miniature CRISPR-Cas12 System in Gene Editing
2024-Nov-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252312686
PMID:39684395
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综述 | 本文综述了微型CRISPR-Cas12系统的研究进展及其在基因编辑中的应用 | 微型CRISPR-Cas12系统相比常用的CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a具有丰富的PAM位点、更高的特异性、更小的体积和较低的细胞毒性 | 微型Cas12蛋白的应用及其编辑效率的改进方法尚未得到系统总结 | 旨在为深入理解微型CRISPR-Cas12系统的功能机制和工程化改造提供参考 | 微型CRISPR-Cas12系统在动物、植物和微生物基因编辑中的应用及其编辑效率的改进策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
22 | 2024-12-16 |
Reconstitution of the Mevalonate Pathway for Improvement of Isoprenoid Production and Industrial Applicability in Escherichia coli
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2408.08053
PMID:39467704
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研究论文 | 本文通过在Escherichia coli中重构甲羟戊酸(MVA)途径,提高了异戊二烯类化合物的生产及其工业应用性 | 引入了来自生物安全等级1(BSL 1)生物体的新基因组合,重构了MVA途径,并显著提高了类胡萝卜素和番茄红素的产量及细胞特异性生产力 | 未提及具体的局限性 | 通过代谢工程和合成生物学策略,提高微生物生产高附加值异戊二烯类化合物的能力 | Escherichia coli中的异戊二烯类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
23 | 2024-12-16 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-Nov-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法从头构建功能性微生物生态系统的策略 | 提出了一个更全面的设计-构建-测试-学习流程,用于设计和优化微生物生态系统 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 总结和推进基于不同调控电路的微生物生态系统构建策略 | 微生物生态系统中的种内和种间相互作用及正交调控模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
24 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展,并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品,以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
25 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中,并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验,未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 |
26 | 2024-12-06 |
Genetic Engineering Approaches for the Microbial Production of Vanillin
2024-Nov-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111413
PMID:39595589
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综述 | 本文综述了利用遗传工程和合成生物学方法提高微生物生产香草醛的最新进展 | 本文介绍了通过基因工程和合成生物学方法,在天然生产香草醛的微生物中增加香草醛产量,或在微生物底盘中实现新的香草醛生物合成途径的创新方法 | NA | 探讨如何利用遗传工程和合成生物学方法提高微生物生产香草醛的效率 | 香草醛的微生物生产 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
27 | 2024-12-02 |
Genetic engineering of Nannochloropsis oceanica to produce canthaxanthin and ketocarotenoids
2024-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02599-4
PMID:39609835
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研究论文 | 通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产角黄素和酮类胡萝卜素 | 通过基因重设计和异源转化,显著增加了酮类胡萝卜素和角黄素的含量 | 在较高光照强度下,bkt品系的生长速度较慢 | 开发可持续的生产生物分子的过程,利用Nannochloropsis oceanica的光合作用和碳同化特性 | Nannochloropsis oceanica | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
28 | 2024-12-02 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-Nov-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
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研究论文 | 本文通过计算方法重新设计了一种非核糖体肽合成酶(NRPS)样羧酸还原酶的“守门员”腺苷化域,显著提高了其催化效率和底物特异性 | 通过近似机制的几何标准和Rosetta能量评分,成功重新设计了NRPS样酶的腺苷化域,显著提高了催化效率和底物特异性 | NA | 通过计算方法重新设计NRPS样酶的腺苷化域,以提高其催化效率和底物特异性 | 非核糖体肽合成酶(NRPS)样羧酸还原酶的腺苷化域 | 合成生物学 | NA | 计算设计 | NA | NA | 涉及CAR3突变体ACA-1和ACA-4,以及G418K |
29 | 2024-12-01 |
An efficient and easily obtainable butelase variant for chemoenzymatic ligation and modification of peptides and proteins
2024-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02598-5
PMID:39614317
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研究论文 | 本文介绍了一种新型Butelase 1变体Butelase AY,通过突变提高其稳定性和产量,适用于多种蛋白质和肽的工程化任务 | 通过突变Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基,成功开发出一种高效且易于获得的Butelase AY变体,适用于生物正交应用 | NA | 开发一种高效且易于获得的Butelase 1变体,用于蛋白质和肽的化学酶法连接和修饰 | Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基突变,以及其在肽和蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质和肽 | 肽GLGKY、球状蛋白质GFP和内在无序蛋白质α-synuclein |
30 | 2024-12-01 |
Deep learning revealed the distribution and evolution patterns for invertible promoters across bacterial lineages
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae966
PMID:39460615
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepInverton的深度学习模型,用于识别细菌中的可逆启动子(invertons),并分析了其在不同细菌谱系中的分布和进化模式 | 首次使用深度学习模型DeepInverton在不需要测序读取的情况下识别细菌中的可逆启动子,并揭示了其在病原体中的普遍性和在环境适应中的作用 | NA | 研究可逆启动子在细菌中的分布和进化模式 | 细菌基因组和宏基因组中的可逆启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组和宏基因组数据 | 分析了68,733个细菌基因组和9,382个宏基因组,识别出超过200,000个非冗余的可逆启动子 |
31 | 2024-12-01 |
Synthetic translational coupling element for multiplexed signal processing and cellular control
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae980
PMID:39526390
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化的合成翻译耦合元件(synTCE),并将其与从头设计的核糖调节器和脚趾开关集成,用于多路信号处理和细胞控制 | 引入了一种新的合成翻译耦合元件(synTCE),并展示了其在逻辑计算和信号传导中的应用 | NA | 开发定制化的生物系统功能,增强核糖调节器的计算能力和应用性 | 合成翻译耦合元件(synTCE)及其在生物系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
32 | 2024-12-01 |
Cinnamaldehyde in Focus: Antimicrobial Properties, Biosynthetic Pathway, and Industrial Applications
2024-Nov-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13111095
PMID:39596788
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综述 | 本文综述了肉桂醛(TCA)的抗菌特性、生物合成途径及其在工业中的应用 | 本文探讨了肉桂醛在破坏微生物膜、抑制生物膜形成和调节病原体关键代谢途径中的作用,并介绍了其在化妆品中的应用 | NA | 综述肉桂醛的抗菌潜力及其在工业中的应用 | 肉桂醛的抗菌机制、生物合成途径及其市场和工业应用 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
33 | 2024-11-29 |
Regioselectivity switches between anthraquinone precursor fissions involved in bioactive xanthone biosynthesis
2024-Nov-27, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06369d
PMID:39568878
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研究论文 | 研究了生物活性黄酮类化合物的生物合成途径,特别是如何切换蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性 | 首次揭示了通过BruN和BruM酶的协同作用,实现蒽醌前体在C-C键和C-C键断裂之间的选择性切换 | NA | 探讨生物活性黄酮类化合物的生物合成机制,特别是蒽醌前体在不同键断裂之间的选择性 | 蒽醌前体在生物活性黄酮类化合物生物合成中的键断裂选择性 | 生物化学 | NA | 多蛋白序列比对、定向蛋白质进化、理论模拟、化学捕获、O追踪、X射线晶体结构分析 | NA | 蛋白质序列、化学结构 | NA |
34 | 2024-11-29 |
Construction of engineered probiotic that adhere and display nanobody to neutralize porcine reproductive and respiratory syndrome virus
2024-Nov-14, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04198-8
PMID:39540965
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研究论文 | 研究构建了一种工程益生菌,能够在表面粘附并展示纳米抗体以中和猪繁殖与呼吸综合征病毒 | 首次提出了一种结合粘附蛋白和纳米抗体的工程益生菌构建策略,具有粘附和中和病毒的双重效果 | NA | 开发一种新型工程益生菌,用于预防和治疗猪繁殖与呼吸综合征病毒感染 | 猪繁殖与呼吸综合征病毒、益生菌L. plantarum和E. coli | 合成生物学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 合成生物学技术 | NA | 基因组数据 | NA |
35 | 2024-11-29 |
Different transcriptomic and metabolomic analysis of Saccharomyces cerevisiae BY4742 and CEN.PK2-1C strains
2024-Nov-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04178-y
PMID:39508902
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研究论文 | 研究了两种酵母菌株Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C的转录组和代谢组差异 | 首次系统分析了这两种酵母菌株在代谢和转录水平上的差异 | 研究仅限于两种特定的酵母菌株,结果可能不适用于其他酵母菌株 | 探讨不同酵母菌株间的转录和代谢变化,为高效酵母细胞工厂的建立提供基础 | Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C菌株 | NA | NA | 转录组分析和代谢组分析 | NA | 转录组数据和代谢组数据 | 两种酵母菌株 |
36 | 2024-11-27 |
Cyanobacteriochromes: A Rainbow of Photoreceptors
2024-Nov, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
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综述 | 本文综述了蓝藻光敏色素(CBCR)的谱调谐、光转换和光生物学特性及其在合成生物学中的应用 | 本文介绍了CBCR在近紫外到近红外范围内的多样性光循环及其在蓝细菌光生物学中的多方面调控作用 | NA | 探讨蓝藻光敏色素的进化、光转换机制及其在合成生物学中的应用 | 蓝藻光敏色素(CBCR)及其在光生物学中的作用 | 生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
37 | 2024-11-26 |
[Removal, detection, and limits of endotoxin in the industry of recombinant proteins]
2024-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240051
PMID:39584330
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综述 | 本文综述了重组蛋白生产过程中内毒素的去除、检测及其限值设定 | 总结了不同行业中重组蛋白产品的内毒素限值,并强调了无论表达宿主是否为细菌,注射用重组蛋白的最终产品都需要进行内毒素检测 | NA | 为重组蛋白大规模生产过程中内毒素的研究提供参考 | 重组蛋白生产过程中的内毒素去除、检测及其限值设定 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
38 | 2024-11-19 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2024-Nov-16, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文综述了甘草属植物的分类、药理学、活性成分生物合成和合成生物学 | 整合了来自不同领域的知识,提供了一个全面理解甘草属植物的独特视角 | NA | 提供一个全面的视角,为未来的分子育种和合成生物学研究奠定基础 | 甘草属植物的分类、活性成分及其药理活性、甘草的组学、活性化合物的生物合成途径和代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
39 | 2024-11-24 |
Bottom-up synthetic immunology
2024-Nov, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01744-9
PMID:39187581
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研究论文 | 本文探讨了自下而上的合成免疫学作为治疗和预防传染病及癌症的新兴领域 | 提出了一种基于纳米技术的自下而上合成免疫学方法,以克服传统基因工程免疫细胞的局限性 | 目前主要限于体外应用,且受到免疫功能固有的复杂调控机制的限制 | 探索利用纳米技术进行免疫系统工程化的新方法,以改善预防和治疗策略 | 传染病和癌症的免疫机制 | 合成生物学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
40 | 2024-11-23 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 本文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制 | 提出了酶通过相分离自组织成近似最优大小和间隔的集群,并通过数学模型验证了其对代谢通量和毒性代谢物的显著改善 | 主要基于数学模型研究,缺乏实验验证 | 研究酶集群在细胞内的最优组织方式及其对代谢效率的影响 | 酶集群的形成机制及其对代谢通量和毒性代谢物的影响 | 代谢工程 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |