合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-11-20	Ogataea polymorpha as a next-generation chassis for industrial biotechnology 2024-Nov, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.007 PMID:38622041	综述	本文综述了Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在合成生物学工具开发、化学品生产和系统生物学方面的进展	Ogataea polymorpha具有快速生长、耐热性和广泛的底物谱等独特特性，通过合成生物学改造，可用于生产高附加值化学品	NA	探讨Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在化学品生产和系统生物学方面的进展	Ogataea polymorpha及其在化学品生产和系统生物学中的应用	工业生物技术	NA	合成生物学	NA	NA	NA
42	2024-11-19	Calcium-Dependent Lipopeptide Antibiotics against Drug-Resistant Pathogens Discovered via Host-Dependent Heterologous Expression of a Cloned Biosynthetic Gene Cluster 2024-Nov-25, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202410286 PMID:39175099	研究论文	通过宿主依赖的异源表达克隆的生物合成基因簇，发现了一种钙依赖性脂肽抗生素，用于对抗耐药性病原体	发现了一种新的钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A，其通过与Lipid II的不同结合位点抑制细胞壁合成，且在肺表面活性剂存在下仍保持强大的抗菌活性	异源宿主的选择对生物活性化合物的产生至关重要，不当的选择会导致非活性衍生物的异常产生	通过基因组挖掘和合成生物学方法，发现新的抗耐药性病原体的抗生素	钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A和B，以及其对耐药性革兰氏阳性病原体的活性	生物化学	NA	基因组挖掘、合成生物学	NA	NA	多个链霉菌宿主菌株
43	2024-11-19	A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM 2024-Nov-17, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis IF:3.0Q1 DOI:10.1111/risa.17678 PMID:39552172	研究论文	本文通过攻击树模型对iGEM项目在低至中等风险场景下的生物安全和生物安保进行定量分析	本文首次将攻击树模型应用于合成生物学领域的生物安全和生物安保风险评估，并提供了定量分析框架	本文主要关注iGEM项目的风险点，未涵盖所有合成生物学领域的风险	评估iGEM项目在低至中等风险场景下的生物安全和生物安保风险	2022年iGEM项目的潜在风险点	合成生物学	NA	攻击树模型	攻击树	文本	2022年iGEM项目的潜在风险点
44	2024-11-19	Co-transcriptional production of programmable RNA condensates and synthetic organelles 2024-Nov, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-024-01726-x PMID:39080489	研究论文	本文介绍了一种模块化平台，用于从定制的分支RNA纳米结构中工程化合成RNA凝聚物和合成细胞器	本文引入了可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的共转录生产方法，通过嵌入的荧光亮起适配体实现荧光染料的选择性积累，并展示了捕获蛋白质的能力	NA	开发一种可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的工程化平台，以在合成生物学和合成细胞科学中实现细胞功能的编程	RNA凝聚物和合成细胞器	合成生物学	NA	RNA纳米结构设计与合成	NA	RNA	NA
45	2024-11-18	Oriented triplex DNA as a synthetic receptor for transmembrane signal transduction 2024-Nov-12, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53960-5 PMID:39532841	研究论文	本文介绍了一种使用定向胆固醇标记的三链DNA（TD）作为合成受体，通过H介导的TD构象转变从双链到三链，实现跨脂双层膜信号转导的人工信号转导系统	首次使用定向胆固醇标记的三链DNA作为合成受体，模拟天然G蛋白偶联受体（GPCRs）的功能动态，实现跨膜信号转导和放大	NA	开发一种人工信号转导系统，模拟细胞对化学或物理信号的检测和响应	定向胆固醇标记的三链DNA（TD）作为合成受体，用于跨脂双层膜的信号转导	合成生物学	NA	荧光共振能量转移（FRET），光裂解，催化信号放大，逻辑门调制	NA	NA	NA
46	2024-11-17	Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli 2024-Nov-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00140 PMID:39418641	研究论文	本文介绍了一种利用双质粒mini-Tn5系统在Escherichia coli中稳定整合多拷贝目标基因的方法	提出了一种新的双质粒mini-Tn5系统，能够在宿主基因组中实现稳定的多拷贝基因整合，并优化了整合效率	未提及具体的局限性	开发一种稳定且可控的基因表达方法，以提高工程微生物生产有价值代谢物的效率	Escherichia coli中的目标基因整合	合成生物学	NA	双质粒mini-Tn5系统	NA	NA	涉及多种Escherichia coli菌株，包括RecA strain MG1655和RecA strain XL1-Blue MRF'
47	2024-11-17	Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol 2024-Nov-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00445 PMID:39444231	研究论文	研究通过代谢工程和实验室进化技术，成功在Yarrowia lipolytica中生产l-苹果酸	首次在Yarrowia lipolytica中成功生产l-苹果酸，并通过代谢工程和实验室进化技术优化了生产过程	NA	探索Yarrowia lipolytica生产l-苹果酸的潜力，并优化其生产过程	Yarrowia lipolytica菌株和l-苹果酸的生产	代谢工程	NA	代谢工程和实验室进化	NA	NA	NA
48	2024-11-17	Application of a Cell-Free Synthetic Biology Platform for the Reconstitution of Teleocidin B and UK-2A Precursor Biosynthetic Pathways 2024-Nov-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00560 PMID:39469830	研究论文	本文报道了在无细胞合成生物学平台上成功重建两种不同复杂性和结构类别的天然产物生物合成途径	首次成功在无细胞系统中合成UK-2二醇，并展示了植物无细胞蛋白合成系统在重建生物合成途径和鉴定未表征基因功能方面的潜力	NA	研究无细胞合成生物学平台在重建复杂生物合成途径中的应用	teleocidin B和UK-2A前体生物合成途径	合成生物学	NA	无细胞蛋白合成（CFPS）	NA	NA	NA
49	2024-11-17	Ion-Selective Mobility Differential Amplifier: Enhancing Pressure-Induced Voltage Response in Hydrogels 2024-Nov-15, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202415000 PMID:39545315	研究论文	本文介绍了一种使用冠醚作为离子选择性迁移差分放大器来增强离子聚乙烯醇（PVA）水凝胶中压力诱导电压响应的策略	首次提出使用冠醚作为离子选择性迁移差分放大器，显著增强了PVA水凝胶的压力诱导电压响应	NA	开发一种增强压电离子器件刺激响应的合理设计方法	离子聚乙烯醇（PVA）水凝胶及其冠醚修饰的PVA-CE水凝胶	软机器人	NA	压电离子学	NA	NA	NA
50	2024-11-17	Efficient DNA-free co-targeting of nuclear genes in Chlamydomonas reinhardtii 2024-Nov-11, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-024-00545-3 PMID:39529073	研究论文	本文开发了一种高效的无需DNA标记的基因破坏策略，用于在莱茵衣藻中进行基因编辑	提出了无需抗生素抗性标记的基因编辑方法，显著提高了基因编辑效率，并实现了多基因同时破坏	主要限制在于DNA整合问题	开发一种高效的基因编辑工具，用于莱茵衣藻的基因插入、删除或编辑	莱茵衣藻中的基因编辑效率和多基因同时破坏	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA
51	2024-11-17	Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization 2024-Nov-08, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-024-05966-5 PMID:39516723	研究论文	本文提出了一种基于抽象和自适应记忆化的反应网络分段模拟技术	利用基于种群的抽象和先前生成的模拟片段组合，提出了一种新的记忆化技术，以更高效地生成新模拟	NA	加速复杂随机系统的轨迹生成并准确预测其瞬态行为	反应网络的随机模型	系统生物学	NA	自适应记忆化	NA	NA	NA
52	2024-11-15	A dual program for CRP-mediated regulation in bacterial alarmone (p)ppGpp 2024-Nov-13, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.02430-24 PMID:39365062	研究论文	本文研究了cAMP受体蛋白（CRP）在细菌警报素（p）ppGpp稳态中的双重调控作用	发现了CRP作为（p）ppGpp稳态的主调控因子，并通过YfiQ依赖的翻译调控机制增强了RelA、SpoT和CRP自身的翻译	NA	揭示CRP在基因表达和细胞功能调控中的作用	cAMP受体蛋白（CRP）、（p）ppGpp、RelA、SpoT	生物技术	NA	NA	NA	NA	NA
53	2024-11-13	A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells 2024-Nov-12, Biofabrication IF:8.2Q1 DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4 PMID:39467389	研究论文	设计并探索了一种基于合成生物学的细胞基生物传感器/执行器，用于检测和对抗细菌感染	该系统能够感知多种类型的感染，并通过增强内源性免疫系统进行反应，具有通用性和超敏感性	NA	开发一种通用的细胞基生物传感器，用于早期检测和对抗细菌感染	细菌感染及其对免疫系统的影响	合成生物学	细菌感染	基因工程	NA	细胞培养	多种革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌
54	2024-11-15	SUPREM: an engineered non-site-specific m6A RNA methyltransferase with highly improved efficiency 2024-Nov-11, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae887 PMID:39417589	研究论文	通过祖先序列重建技术，研究细菌DNA甲基转移酶EcoGII的序列空间，成功设计出一种高效的非特异性RNA甲基转移酶SUPREM	SUPREM表现出比M.EcoGII更高的表达水平、热稳定性和m6A RNA甲基化活性，且能够甲基化更多的RNA甲基化位点	NA	开发一种高效的非特异性RNA甲基转移酶，以改善RNA甲基化的研究工具	细菌DNA甲基转移酶EcoGII及其RNA甲基化活性	生物工程	NA	祖先序列重建	NA	RNA	NA
55	2024-11-15	Multiphase coacervates: mimicking complex cellular structures through liquid-liquid phase separation 2024-Nov-07, Chemical communications (Cambridge, England) DOI:10.1039/d4cc04533e PMID:39439431	综述	本文综述了多相共凝聚物在模拟复杂细胞结构方面的最新进展	多相共凝聚物提供了一个强大的框架来复制层次复杂的细胞结构，为细胞组织和功能提供了有价值的见解	NA	探讨多相共凝聚物在生物模拟中的应用	多相共凝聚物的研究进展	材料科学	NA	NA	NA	NA	NA
56	2024-11-15	Potential approaches to create ultimate genotypes in crops and livestock 2024-Nov, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-01942-0 PMID:39402155	研究论文	本文探讨了在作物和家畜中创建终极基因型的潜在方法	提出了三种未来快速实现终极基因型的途径：加速重组与基因编辑、直接编辑全基因组单倍型序列和合成生物学	目前通过传统杂交策略组装终极基因型需要许多代	探讨快速实现作物和家畜终极基因型的未来途径	作物和家畜的终极基因型	NA	NA	基因编辑	NA	基因型和表型数据	数千至数百万个主要作物和家畜物种的个体
57	2024-11-15	Neonatal bioethics, AI, and genomics 2024-Nov, Early human development IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.earlhumdev.2024.106130 PMID:39405800	研究论文	探讨人工智能、合成生物学和基因组学在医学实践中的影响	提出人工智能和合成生物学将彻底改变我们对健康、疾病、医学和人类本质的理解	主要基于推测，缺乏具体实验数据支持	探讨人工智能和合成生物学对医学实践和人类本质的影响	人工智能、合成生物学和基因组学	NA	NA	NA	NA	NA	NA
58	2024-11-14	Engineering peroxisomal surface display for enhanced biosynthesis in the emerging yeast Kluyveromyces marxianus 2024-Nov-01, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.10.014 PMID:39489214	研究论文	本文研究了在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中通过工程化过氧化物酶体表面展示来增强生物合成	开发了一种新的酶共定位技术，通过过氧化物酶体表面展示来提高非天然产品的合成效率	NA	探索在Kluyveromyces marxianus中通过过氧化物酶体表面展示技术提高非天然产品的生物合成	Kluyveromyces marxianus酵母中的过氧化物酶体表面展示技术	合成生物学	NA	过氧化物酶体表面展示	NA	NA	NA
59	2024-11-11	Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing 2024-Nov-06, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022 PMID:39442006	研究论文	本文展示了如何利用微纳米颗粒之间的化学通信来设计传感系统	首次将巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒结合，用于基于试纸条的传感系统，并展示了信号放大和在实际样本中的应用	NA	开发基于微纳米颗粒化学通信的传感系统	巨型单层囊泡和门控介孔纳米颗粒	纳米技术	NA	NA	NA	NA	NA
60	2024-11-08	Combining systems and synthetic biology for in vivo enzymology 2024-Nov, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00251-w PMID:39322757	研究论文	本文开发了一种结合合成生物学和系统生物学工具的通用方法，用于在体内测量酶学参数	首次在体内测量了酶的Michaelis-Menten参数，并比较了体内外参数的差异	NA	评估酶在真实细胞条件下的动力学特性	酵母中的类胡萝卜素合成途径中的酶	合成生物学	NA	代谢组学、通量组学和蛋白质组学	NA	代谢物、通量和蛋白质数据	多种酵母菌株