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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-11-22 |
Superior Photostability of the Unnatural Base 6-Amino-5-nitropyridin-2-ol: A Case Study Using Ultrafast Broadband Fluorescence, Transient Absorption, and Theoretical Computation
2024-Nov-21, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.4c02751
PMID:39526600
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研究论文 | 研究了非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z)在不同溶剂中的激发态动力学 | 首次全面研究了Z的激发态动力学,发现其具有优越的光稳定性 | NA | 探讨非天然碱基Z的光稳定性及其在生物和环境应用中的潜力 | 非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z) | NA | NA | 超快宽带时间分辨荧光光谱和瞬态吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-11-22 |
Reconstructing Early Microbial Life
2024-Nov, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
|
综述 | 本文综述了早期微生物生命的研究进展,重点介绍了古代代谢途径及其在生物创新重建中的应用 | 本文整合了微生物学、古生物学和进化合成生物学,形成了一个新兴的跨学科领域,用于重建古代生物创新 | 将分子遗传学、群体生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物研究仍然是一个重大挑战 | 探讨早期微生物生命的进化及其对地球生态系统的影响 | 早期微生物生命及其代谢途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-11-21 |
High-throughput development and characterization of new functional nanobodies for gene regulation and epigenetic control in human cells
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.01.621523
PMID:39554150
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研究论文 | 开发并表征用于基因调控和表观遗传控制的新型功能性纳米抗体 | 开发了一种新方法,通过酵母展示和高通量筛选,生成针对人类染色质调节因子的小型纳米抗体,用于基因表达的抑制或激活 | NA | 开发新的纳米抗体用于基因表达和染色质状态的调控 | 人类细胞中的基因表达和染色质状态 | NA | NA | 酵母展示 | NA | NA | 数十个功能性纳米抗体 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-11-20 |
The Enigma of Transcriptional Activation Domains
2024-Nov-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168766
PMID:39214280
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review | 本文综述了真核基因激活域(ADs)的机制模型,提出了一种基于表面活性剂样近随机交互作用的新模型 | 提出了基于表面活性剂样近随机交互作用的新机制模型,与传统生物化学原理不同 | NA | 重新思考和解释真核基因激活域的功能机制 | 真核基因激活域及其与基因启动子核小体的交互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-11-20 |
Ogataea polymorpha as a next-generation chassis for industrial biotechnology
2024-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.007
PMID:38622041
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综述 | 本文综述了Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在合成生物学工具开发、化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha具有快速生长、耐热性和广泛的底物谱等独特特性,通过合成生物学改造,可用于生产高附加值化学品 | NA | 探讨Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha及其在化学品生产和系统生物学中的应用 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-11-19 |
Calcium-Dependent Lipopeptide Antibiotics against Drug-Resistant Pathogens Discovered via Host-Dependent Heterologous Expression of a Cloned Biosynthetic Gene Cluster
2024-Nov-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202410286
PMID:39175099
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研究论文 | 通过宿主依赖的异源表达克隆的生物合成基因簇,发现了一种钙依赖性脂肽抗生素,用于对抗耐药性病原体 | 发现了一种新的钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A,其通过与Lipid II的不同结合位点抑制细胞壁合成,且在肺表面活性剂存在下仍保持强大的抗菌活性 | 异源宿主的选择对生物活性化合物的产生至关重要,不当的选择会导致非活性衍生物的异常产生 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法,发现新的抗耐药性病原体的抗生素 | 钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A和B,以及其对耐药性革兰氏阳性病原体的活性 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | 多个链霉菌宿主菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-11-19 |
Co-transcriptional production of programmable RNA condensates and synthetic organelles
2024-Nov, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01726-x
PMID:39080489
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化平台,用于从定制的分支RNA纳米结构中工程化合成RNA凝聚物和合成细胞器 | 本文引入了可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的共转录生产方法,通过嵌入的荧光亮起适配体实现荧光染料的选择性积累,并展示了捕获蛋白质的能力 | NA | 开发一种可编程的RNA凝聚物和合成细胞器的工程化平台,以在合成生物学和合成细胞科学中实现细胞功能的编程 | RNA凝聚物和合成细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米结构设计与合成 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-11-17 |
Efficient DNA-free co-targeting of nuclear genes in Chlamydomonas reinhardtii
2024-Nov-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00545-3
PMID:39529073
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研究论文 | 本文开发了一种高效的无需DNA标记的基因破坏策略,用于在莱茵衣藻中进行基因编辑 | 提出了无需抗生素抗性标记的基因编辑方法,显著提高了基因编辑效率,并实现了多基因同时破坏 | 主要限制在于DNA整合问题 | 开发一种高效的基因编辑工具,用于莱茵衣藻的基因插入、删除或编辑 | 莱茵衣藻中的基因编辑效率和多基因同时破坏 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-11-17 |
Abstraction-based segmental simulation of reaction networks using adaptive memoization
2024-Nov-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05966-5
PMID:39516723
|
研究论文 | 本文提出了一种基于抽象和自适应记忆化的反应网络分段模拟技术 | 利用基于种群的抽象和先前生成的模拟片段组合,提出了一种新的记忆化技术,以更高效地生成新模拟 | NA | 加速复杂随机系统的轨迹生成并准确预测其瞬态行为 | 反应网络的随机模型 | 系统生物学 | NA | 自适应记忆化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-11-15 |
A dual program for CRP-mediated regulation in bacterial alarmone (p)ppGpp
2024-Nov-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02430-24
PMID:39365062
|
研究论文 | 本文研究了cAMP受体蛋白(CRP)在细菌警报素(p)ppGpp稳态中的双重调控作用 | 发现了CRP作为(p)ppGpp稳态的主调控因子,并通过YfiQ依赖的翻译调控机制增强了RelA、SpoT和CRP自身的翻译 | NA | 揭示CRP在基因表达和细胞功能调控中的作用 | cAMP受体蛋白(CRP)、(p)ppGpp、RelA、SpoT | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-11-13 |
A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells
2024-Nov-12, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4
PMID:39467389
|
研究论文 | 设计并探索了一种基于合成生物学的细胞基生物传感器/执行器,用于检测和对抗细菌感染 | 该系统能够感知多种类型的感染,并通过增强内源性免疫系统进行反应,具有通用性和超敏感性 | NA | 开发一种通用的细胞基生物传感器,用于早期检测和对抗细菌感染 | 细菌感染及其对免疫系统的影响 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因工程 | NA | 细胞培养 | 多种革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-11-15 |
SUPREM: an engineered non-site-specific m6A RNA methyltransferase with highly improved efficiency
2024-Nov-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae887
PMID:39417589
|
研究论文 | 通过祖先序列重建技术,研究细菌DNA甲基转移酶EcoGII的序列空间,成功设计出一种高效的非特异性RNA甲基转移酶SUPREM | SUPREM表现出比M.EcoGII更高的表达水平、热稳定性和m6A RNA甲基化活性,且能够甲基化更多的RNA甲基化位点 | NA | 开发一种高效的非特异性RNA甲基转移酶,以改善RNA甲基化的研究工具 | 细菌DNA甲基转移酶EcoGII及其RNA甲基化活性 | 生物工程 | NA | 祖先序列重建 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-11-15 |
Multiphase coacervates: mimicking complex cellular structures through liquid-liquid phase separation
2024-Nov-07, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc04533e
PMID:39439431
|
综述 | 本文综述了多相共凝聚物在模拟复杂细胞结构方面的最新进展 | 多相共凝聚物提供了一个强大的框架来复制层次复杂的细胞结构,为细胞组织和功能提供了有价值的见解 | NA | 探讨多相共凝聚物在生物模拟中的应用 | 多相共凝聚物的研究进展 | 材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-11-15 |
Potential approaches to create ultimate genotypes in crops and livestock
2024-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01942-0
PMID:39402155
|
研究论文 | 本文探讨了在作物和家畜中创建终极基因型的潜在方法 | 提出了三种未来快速实现终极基因型的途径:加速重组与基因编辑、直接编辑全基因组单倍型序列和合成生物学 | 目前通过传统杂交策略组装终极基因型需要许多代 | 探讨快速实现作物和家畜终极基因型的未来途径 | 作物和家畜的终极基因型 | NA | NA | 基因编辑 | NA | 基因型和表型数据 | 数千至数百万个主要作物和家畜物种的个体 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-11-15 |
Neonatal bioethics, AI, and genomics
2024-Nov, Early human development
IF:2.2Q2
DOI:10.1016/j.earlhumdev.2024.106130
PMID:39405800
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研究论文 | 探讨人工智能、合成生物学和基因组学在医学实践中的影响 | 提出人工智能和合成生物学将彻底改变我们对健康、疾病、医学和人类本质的理解 | 主要基于推测,缺乏具体实验数据支持 | 探讨人工智能和合成生物学对医学实践和人类本质的影响 | 人工智能、合成生物学和基因组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-11-14 |
Engineering peroxisomal surface display for enhanced biosynthesis in the emerging yeast Kluyveromyces marxianus
2024-Nov-01, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.10.014
PMID:39489214
|
研究论文 | 本文研究了在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中通过工程化过氧化物酶体表面展示来增强生物合成 | 开发了一种新的酶共定位技术,通过过氧化物酶体表面展示来提高非天然产品的合成效率 | NA | 探索在Kluyveromyces marxianus中通过过氧化物酶体表面展示技术提高非天然产品的生物合成 | Kluyveromyces marxianus酵母中的过氧化物酶体表面展示技术 | 合成生物学 | NA | 过氧化物酶体表面展示 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-11-07 |
Photodynamic therapy: An emerging therapeutic modality in dentistry
2024-Nov-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2024.117962
PMID:39442490
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综述 | 本文综述了光动力疗法(PDT)在牙科中的应用及其原理 | PDT具有选择性靶向、广谱抗菌效果、无耐药性发展及其与其他治疗方法的协同效应等独特优势 | PDT面临光敏剂输送、光穿透、氧气可用性及标准化协议需求等挑战 | 探讨PDT在牙科中的应用及其未来发展前景 | 牙周病、根管治疗、口腔癌、牙种植和龋齿等牙科疾病 | NA | 口腔癌 | 光动力疗法(PDT) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-11-06 |
A novel Affi-Cova magnetic nanoparticles for one-step covalent immobilization of His-tagged enzyme directly from crude cell lysate
2024-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.135811
PMID:39322145
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研究论文 | 开发了一种新型磁性纳米颗粒MNP@Affi-Cova,用于一步法直接从粗细胞裂解液中共价固定His标签酶 | 创新的磁性纳米颗粒MNP@Affi-Cova结合了亲和力和共价双功能,能够在温和条件下直接从粗细胞裂解液中固定重组酶 | NA | 开发一种新型功能载体,能够在温和条件下直接从粗细胞裂解液中共价固定目标蛋白质 | His标签的重组酶r-birA | NA | NA | SEM, FT-IR光谱, zeta电位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-11-06 |
Variable orthogonality of serine integrase interactions within the ϕC31 family
2024-11-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77570-9
PMID:39487291
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研究论文 | 研究了三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF)在整合和切除反应中的正交性 | 发现不同整合酶-RDF对的正交性存在差异,TG1整合酶在attP x attB和attR x attL反应中表现出最高的活性 | 整合酶/RDF对的正交性较弱,需要进一步鉴定和表征更多的整合酶-RDF对 | 研究整合酶及其重组方向性因子在基因组修饰应用中的正交性 | 三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF) | NA | NA | AlphaFold-Multimer | NA | NA | 三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF) | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-10-28 |
Multicellular artificial neural network-type architectures demonstrate computational problem solving
2024-Nov, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01711-4
PMID:39285005
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研究论文 | 本文报道了一种通过混合和匹配离散工程细菌细胞创建的模块化多细胞系统,该系统能够设计解决多种计算决策问题 | 首次构建了一种基于工程细菌的模块化多细胞系统,模拟人工神经网络架构,能够执行计算任务 | NA | 开发一种能够解决多种计算决策问题的模块化多细胞系统 | 工程细菌细胞及其在计算任务中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |