合成生物学相关文章
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当前共找到 250 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-18 |
Engineering biology and chemical approaches to the construction of vitamin B12 analogues and antivitamins B12 as probes and therapeutic agents
2025, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2025.07.003
PMID:40846392
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综述 | 综述利用工程生物学和化学方法构建维生素B12类似物及抗维生素B12作为探针和治疗剂的研究进展 | 通过合成生物学在E. coli中异源表达有氧B12生物合成途径，高产生物合成中间体和无钴B12前体，并用于生成含铑、镍、锌等过渡金属的金属取代类似物及有机抗代谢物和荧光标记衍生物，用于探针B12依赖酶、追踪维生素运输和选择性破坏微生物或疾病相关代谢 | 文中未明确论述局限性，可能包括合成类似物的体内稳定性、特异性及临床转化的挑战 | 探索合成维生素B12类似物和抗维生素B12在生物研究和治疗中的应用 | 维生素B12类似物、抗维生素B12、金属取代类似物、荧光标记衍生物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | E. coli | 维生素B12生物合成途径 | 医学, 农业, 环境 |
| 2 | 2026-06-04 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 探讨瘤内微生物群通过炎症和免疫机制重塑肺癌微环境，并展望基于合成生物学的工程菌和纳米抗生素在免疫治疗中的应用 | 首次系统阐述瘤内微生物群在肺癌微环境中通过分泌代谢物、激活信号通路、招募免疫抑制细胞及上调免疫检查点分子表达来主动诱导慢性炎症并促进肿瘤进展，并评估了基于合成生物学的工程菌和靶向纳米抗生素重塑免疫微环境的潜力 | 肺组织低生物量导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响，且常忽视真菌和病毒等非细菌成分在肿瘤生态系统中的协同作用 | 阐明瘤内微生物群影响肺癌细胞和肿瘤微环境的机制，并探索其临床转化潜力 | 瘤内微生物群及其在肺癌微环境中的作用 | 微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序, 多组学技术 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-06-01 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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研究论文 | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具，用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列，发现聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）能够形成具有可忽略成核屏障的淀粉样组装体，在任意选择的浓度阈值下实现蛋白质自组装，并通过调整TA重复长度精细调节饱和浓度 | 论文未明确讨论该工具在体内应用时的潜在毒性或脱靶效应，也未涉及在复杂生物环境中的长期稳定性 | 开发一种可调亲和融合标签，用于控制蛋白质自组装和研究蛋白质浓度与细胞功能的关系 | 聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）二肽重复序列 | 合成生物学 | NA | 遗传编码工具、二肽重复序列筛选 | NA | 蛋白质组装数据 | NA | NA | 细胞（未具体说明） | 可调淀粉样蛋白融合标签 | 细胞生物学、发育生物学、合成生物学 |
| 4 | 2026-05-30 |
Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0319337
PMID:40014593
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研究论文 | 通过来自13个欧洲国家的全国代表性样本调查，探究公众对合成细胞潜在应用（如抗癌治疗、CO2转化、工业废物回收）的态度 | 首次在大规模跨国样本中系统评估公众对自下而上构建的合成细胞技术的态度，并利用数据驱动决策树模型分析影响态度的因素 | NA | 绘制公众对新兴合成细胞技术的初步态度，以促进社会讨论和利益相关者参与 | 来自13个欧洲国家的8382名公众 | NA | 癌症 | NA | 决策树 | 调查问卷数据 | 13个欧洲国家，8382名参与者 | NA | NA | 合成细胞 | 医疗、环境、能源 |
| 5 | 2026-05-27 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
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综述 | 探讨非编码RNA的结构预测及其在生物学和医学中的重要性 | 融合计算方法和实验技术，提升RNA结构预测准确度，并探讨多组学数据整合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模和RNA折叠动态特性理解仍存在挑战 | 提高非编码RNA结构预测能力，推动其在诊断和治疗中的应用 | 非编码RNA，包括microRNA、siRNA和长链非编码RNA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 药物发现, 生物标志物, 合成生物学 |
| 6 | 2026-05-25 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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评论 | CTGCT卓越中心旨在将科学发现转化为针对神经系统罕见遗传病和癌症的先进基因与细胞疗法 | 斯洛文尼亚首个此类中心，整合合成生物学工具、基因编辑、RNA技术、免疫调控工程及新型递送系统，建立GMP设施推动临床转化 | 尚未提供具体实验数据或临床结果评估 | 推动基因与细胞疗法从基础研究向临床应用转化 | 神经系统罕见遗传病和癌症 | 数字病理学 | 神经系统罕见遗传病, 癌症 | 基因编辑, 剪接技术, RNA技术, 免疫调控工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 7 | 2026-05-15 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
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研究论文 | 开发了一种黏液包封微球凝胶递送系统，用于封装基因工程益生菌，实现对炎症性肠病的诊断和治疗 | 设计了外部黏膜涂层（透明质酸和表没食子儿茶素没食子酸酯）与内部高生物相容性聚丝氨酸改性藻酸盐微球结合的双层递送系统，有效保护工程菌免受胃部恶劣环境影响并延长肠道定殖时间至24小时 | 实验仅基于炎症性肠病模型，未提及在人类患者中的验证结果 | 解决工程菌递送至病变部位并实现持续定殖的挑战，推动活体生物治疗产品的临床转化 | 基因工程益生菌（用于检测和治疗肠炎） | 合成生物学, 生物医学工程 | 炎症性肠病 | 合成生物学, 微球凝胶封装 | NA | 体内动物模型数据 | NA | 基因工程 | 益生菌（具体种类未说明） | 生物标志物检测与Avcystatin释放回路 | 医学 |
| 8 | 2026-05-15 |
Revolutionizing structural biology: AI-driven protein structure prediction from AlphaFold to next-generation innovations
2025, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.04.002
PMID:40973394
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综述 | 探讨从AlphaFold到下一代创新中人工智能驱动的蛋白质结构预测如何革命化结构生物学 | 系统回顾蛋白质结构预测从传统方法到AlphaFold及后续模型（如RoseTTAFold和OmegaFold）的演变，并重点分析AlphaFold的设计、方法论和性能，同时指出其局限性及未来方向 | 模型在预测蛋白质复合体和动态变化方面存在不足，且对计算资源要求较高 | 综述人工智能在蛋白质结构预测中的进展与应用，并展望未来发展方向 | 蛋白质结构预测方法及其在生物医学中的应用 | 机器学习, 结构生物学 | NA | AlphaFold, RoseTTAFold, OmegaFold, 同源建模, 从头预测 | 人工智能模型（如AlphaFold） | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 药物发现 |
| 9 | 2026-05-10 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
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综述 | 探讨类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径的工程化策略，涵盖酶工程、合成生物学工具及宿主范围，并展望未来研究方向 | 采用通路模块化视角，系统梳理从前体供应到氧化裂解的每个酶促步骤，重点突出新发现酶变体、诱变研究、融合策略及区室化方法对代谢调控的贡献 | 仅聚焦近期文献，未对工业放大和具体产量指标进行量化比较，缺乏对经济性与规模化瓶颈的深入分析 | 为推进类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素生物合成提供层次化路径理解与工程策略整合 | 类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径中的酶、宿主（植物、真菌、藻类、酵母、细菌）及合成生物学工具 | NA | NA | NGS、RNA-seq、CRISPR-Cas9、Golden Gate Assembly | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 植物、真菌、藻类、酵母、细菌 | 类胡萝卜素生物合成通路（前体供应→GGPP→八氢番茄红素→脱饱和/异构化→环化→羟基化→酮基化→环氧化→氧化裂解） | 医学、农业、食品、工业生物技术 |
| 10 | 2026-05-08 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-01-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本研究利用量子隧穿纳米间隙结和机器学习技术，对八种人工合成DNA碱基进行了电识别研究 | 首次将量子隧穿传输与机器学习结合用于人工DNA碱基的高精度电识别，实现了高达100%的碱基识别准确率 | 未提及实际生物样本中的验证或系统级应用限制 | 实现人工合成DNA碱基的快速精确电识别，推动遗传研究、DNA数据存储和合成生物学发展 | 八种人工合成DNA碱基（DNA和DNA碱基） | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输 | 机器学习模型 | 序列 | 八种人工合成DNA碱基数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 遗传学, DNA数据存储, 诊断 |
| 11 | 2026-05-06 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 提供转酮醇酶活性、催化机制和结构分析的实验方案，涵盖稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测及快速动力学研究 | 整合多种生物物理和结构生物学方法，形成用于转酮醇酶基础与应用研究的综合工具集 | 未涉及具体疾病模型或临床验证，未讨论不同来源转酮醇酶间的差异 | 建立转酮醇酶功能与结构分析的标准实验方案，推动酶学、合成生物学及药物开发 | 转酮醇酶 | 结构生物学 | 癌症、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、光谱学、快速动力学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物催化 |
| 12 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法，通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案，开发了低成本工程培养基，并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 14 | 2026-04-16 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
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综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物通过多种信号通路调节宿主免疫的机制，并探讨了基于这些代谢物的新兴治疗策略 | 整合了空间代谢组学、合成生物学和纳米医学的最新进展，提出了时空递送免疫调节代谢物的新治疗途径，并展望了结合多组学和AI预测模型的个性化调控方向 | NA | 阐明肠道微生物代谢物在免疫调节中的作用机制并探索其治疗应用前景 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生吲哚等）及其对宿主免疫系统的影响 | NA | 炎症性和自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、合成生物学、纳米医学、多组学、AI驱动预测建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-04-16 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
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研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一种低成本、开源、基于喷墨技术的第二代DNA合成器，旨在实现实验室环境中灵活且低成本的寡核苷酸合成 | OpenIDS2通过3D打印机械组件、定制PCB集成控制电子和蠕动泵批量溶液输送系统，显著减小设备体积、提高操作稳定性和制造可及性，增强了开源硬件平台的再现性和全球可访问性 | NA | 开发一种低成本、开源的DNA合成平台，以降低实验室自动化的入门门槛 | DNA合成器（OpenIDS2）及其在寡核苷酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 喷墨技术、磷酸胺化学、尿素-PAGE、HPLC | NA | NA | 成功合成了15-mer poly(dT)序列在CPG基板上 | 3D打印、定制PCB | NA | NA | 合成生物学、分子诊断、生物技术 |
| 16 | 2026-03-14 |
Discovery of bacterial terpenoids by genome mining
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.078
PMID:40651831
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综述 | 本文概述了利用基因组挖掘方法从细菌中发现新型萜类合酶和萜类天然产物的策略 | 强调基因组挖掘作为传统天然产物发现方法的补充，专注于细菌中未开发的萜类合酶基因资源 | 未提及具体实验验证或数据限制，主要侧重于方法概述 | 探索细菌中萜类天然产物的发现潜力，以应用于药物和工业领域 | 细菌中的萜类合酶基因和萜类天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序，基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物，工业，商业 |
| 17 | 2026-03-10 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的DNA组装方法，通过修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端，用于高效精确的DNA克隆 | DAPE方法克服了传统SLIC技术对小DNA片段（如gRNA和表位标签）组装效率低的问题，能在单次反应中精确组装不同大小的DNA片段 | NA | 开发一种改进的DNA组装技术，以促进合成生物学中多基因电路的构建 | DNA片段，特别是小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | PCR，DNA组装，磷酸硫酯修饰，T5外切酶处理 | NA | NA | NA | DAPE（DNA Assembly with Phosphorothioate and T5 Exonuclease） | NA | 多基因电路 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属（类）抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制，并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 19 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq，利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需，仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶，并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序（NGS）、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-02-08 |
Advances in promoter engineering strategies for enhanced recombinant protein expression in plants
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1747353
PMID:41635682
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综述 | 本文综述了针对植物系统、旨在增强重组蛋白表达的启动子工程策略的最新进展 | 重点介绍了利用CRISPR转录控制、高通量筛选和机器学习辅助启动子设计等新兴合成生物学工具，创建适用于复杂多基因表达的可调、正交启动子 | NA | 推进植物分子农业，扩展植物作为高价值重组蛋白多功能生物工厂的作用 | 用于植物系统的启动子（天然、合成、杂交、诱导型和组织特异性启动子） | 合成生物学 | NA | CRISPR转录控制，高通量筛选，机器学习辅助启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR | 植物，植物细胞培养物 | NA | 医药，工业生物技术，农业 |