合成生物学相关文章
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当前共找到 249 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-14 |
Discovery of bacterial terpenoids by genome mining
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.078
PMID:40651831
|
综述 | 本文概述了利用基因组挖掘方法从细菌中发现新型萜类合酶和萜类天然产物的策略 | 强调基因组挖掘作为传统天然产物发现方法的补充，专注于细菌中未开发的萜类合酶基因资源 | 未提及具体实验验证或数据限制，主要侧重于方法概述 | 探索细菌中萜类天然产物的发现潜力，以应用于药物和工业领域 | 细菌中的萜类合酶基因和萜类天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序，基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物，工业，商业 |
| 2 | 2026-03-10 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的DNA组装方法，通过修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端，用于高效精确的DNA克隆 | DAPE方法克服了传统SLIC技术对小DNA片段（如gRNA和表位标签）组装效率低的问题，能在单次反应中精确组装不同大小的DNA片段 | NA | 开发一种改进的DNA组装技术，以促进合成生物学中多基因电路的构建 | DNA片段，特别是小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | PCR，DNA组装，磷酸硫酯修饰，T5外切酶处理 | NA | NA | NA | DAPE（DNA Assembly with Phosphorothioate and T5 Exonuclease） | NA | 多基因电路 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属（类）抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制，并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 4 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq，利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需，仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶，并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序（NGS）、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-08 |
Advances in promoter engineering strategies for enhanced recombinant protein expression in plants
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1747353
PMID:41635682
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综述 | 本文综述了针对植物系统、旨在增强重组蛋白表达的启动子工程策略的最新进展 | 重点介绍了利用CRISPR转录控制、高通量筛选和机器学习辅助启动子设计等新兴合成生物学工具，创建适用于复杂多基因表达的可调、正交启动子 | NA | 推进植物分子农业，扩展植物作为高价值重组蛋白多功能生物工厂的作用 | 用于植物系统的启动子（天然、合成、杂交、诱导型和组织特异性启动子） | 合成生物学 | NA | CRISPR转录控制，高通量筛选，机器学习辅助启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR | 植物，植物细胞培养物 | NA | 医药，工业生物技术，农业 |
| 6 | 2026-02-08 |
Engineered probiotics for inflammatory bowel disease therapy: mechanisms, delivery strategies, and precision medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1696524
PMID:41640410
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的应用，包括其作用机制、递送策略和精准医学前景 | 聚焦于工程化益生菌的设计，以克服传统益生菌在胃肠道环境中的存活、定植和靶向性不足等限制，并探讨了基于个体肠道微生物组谱的个性化干预 | 工程化益生菌在长期安全性、稳定性以及治疗反应准确预测方面仍面临关键挑战 | 探索工程化益生菌作为炎症性肠病治疗的新型替代方案 | 炎症性肠病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病 | NA | 炎症性肠病 | 基因工程、合成生物学、先进封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 7 | 2026-02-06 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文全面回顾了基于细菌的肿瘤治疗策略，包括其分类、机制、工程化方法以及临床转化挑战 | 系统整合了合成生物学与纳米医学于工程化细菌中，以增强治疗效果和可控性 | NA | 探讨利用细菌进行精准肿瘤治疗的原理和未来前景 | 工程化细菌及其与纳米材料的杂合系统 | NA | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤细胞杀伤、抗肿瘤免疫激活的基因回路 | 医学 |
| 8 | 2026-02-05 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
|
综述 | 本文通过模块化视角，综述了类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素的生物合成途径，包括新型酶、合成生物学工具及代谢控制策略 | 采用途径模块中心视角，整合多种酶源、宿主范围及途径模块性，强调新发现和工程化酶以及合成生物学工具 | NA | 综述类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素生物合成的最新进展，为研究人员提供层次化理解以推动该领域发展 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 真菌, 藻类, 酵母, 细菌 | NA | 生物医学, 农业, 环境, 食品 |
| 9 | 2026-02-05 |
A synthetic biology toolkit for rationally designing genetic circuits in Acinetobacter baumannii
2025, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2025.1668595
PMID:41626556
|
研究论文 | 本研究开发了一个用于鲍曼不动杆菌的合成生物学工具包，包括BioBrick部件库和模块化CRISPRi平台，以对抗抗菌素耐药性 | 首次在鲍曼不动杆菌中系统表征BioBrick部件并开发模块化CRISPRi平台，为理性设计基因电路提供基础 | NA | 通过合成生物学方法对抗鲍曼不动杆菌的抗菌素耐药性 | 鲍曼不动杆菌及其基因电路 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | CRISPR干扰 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 鲍曼不动杆菌 | 基因电路，包括诱导型和组成型启动子库以及CRISPRi介导的抑制系统 | 医学 |
| 10 | 2026-02-03 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
|
综述 | 本文深入回顾了Cupriavidus necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略方面的技术进步，并探讨了其作为可持续生物制造宿主的潜力 | 系统总结了C. necator从一种Knallgas细菌演变为有前景的生物制造宿主的过程，强调了其在推动可持续生物经济中的关键作用 | NA | 探讨C. necator作为多样化微生物底盘在合成生物学和可持续生物制造中的应用潜力 | Cupriavidus necator（一种多功能的微生物） | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
|
综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力，包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展，包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-02-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 本文综述了肺癌组织内微生物群的存在及其通过炎症和免疫途径重塑肿瘤微环境的机制，并探讨了其在临床预测和治疗中的应用前景 | 推翻了‘无菌肿瘤’的传统观念，系统阐述了肿瘤内微生物群主动调控肺癌进展的机制，并前瞻性地讨论了合成生物学工具（如工程菌和靶向纳米抗生素）在重塑免疫微环境中的应用潜力 | 肺癌组织微生物生物量低，测序数据易受试剂污染和批次效应影响；真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明肿瘤内微生物群影响肺癌细胞及肿瘤微环境的机制，探索其在肺癌进展中的作用及临床转化潜力 | 肺癌组织内的微生物群（包括细菌、真菌、病毒等）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序、多组学技术 | NA | 测序数据、多组学数据 | NA | 合成生物学（涉及工程菌、靶向纳米抗生素设计） | NA | NA | 医学（癌症精准诊断与治疗） |
| 13 | 2026-01-30 |
Microbial therapeutics for canine periodontal disease: current status and future perspectives
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1748968
PMID:41602620
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综述 | 本文综述了犬牙周病的微生物疗法现状，包括益生菌、后生元、噬菌体及合成生物学等策略，并讨论了其未来前景与挑战 | 从生态失调角度而非单一病原体视角分析犬牙周病，并系统评估了多种新兴微生物疗法（如噬菌体、合成生物学工具）在该领域的应用潜力 | 现有疗法存在微生物定植短暂、兽医临床证据有限、生物安全性担忧以及缺乏标准化监管路径等问题 | 探讨通过调节口腔微生物群落结构与功能来治疗犬牙周病的非抗生素策略 | 犬牙周病及其相关的口腔微生物群落 | NA | 牙周病 | 测序技术、定量分子分析 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角，系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章，主要基于现有文献进行整合分析，未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用，探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子（如GLP-1）的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 15 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
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研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型，利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变，模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞，实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行，尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制，构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统，以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构，形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 16 | 2026-01-24 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动力学和转运机制 | 首次通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证来确认预测的突变效果 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，为工程化改造提供原子层面的见解 | 蓝藻的碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学与计算生物学 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | BicA二聚体的模拟数据（超过1毫秒） | NA | 蓝藻 | NA | 能源、粮食生产、气候变化应对 |
| 17 | 2026-01-23 |
Editorial: Synthetic biology and metabolomics: novel insight in oncology research
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1768397
PMID:41568228
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2026-01-20 |
Editorial: Synthetic biology approaches for biocatalytic production of value-added chemicals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1755163
PMID:41550373
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-01-17 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 结合合成生物学和不确定性采样，通过多轮大规模平行报告基因检测迭代训练模型，解决了传统模型无法解释同一转录因子在不同背景下激活或抑制转录的问题 | NA | 开发能够区分具有相同序列但相反功能的CRX结合位点的调控DNA模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 大规模平行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 基因组中几乎所有结合的CRX位点 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-01-15 |
Engineered bacteria as living therapeutics: Next-generation precision tools for health, industry, environment, and agriculture
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025042
PMID:41522435
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌作为活体疗法方面的最新进展，探讨了其在医疗、工业、环境和农业领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统、合成基因电路和模块化质粒架构，结合计算建模与机器学习，实现了对微生物行为的精细调控 | 存在遗传稳定性、生物安全性、临床与工业环境可重复性等挑战，伦理与监管框架仍需完善 | 探讨工程化细菌作为下一代精准工具在健康、工业、环境和农业领域的应用潜力 | 工程化细菌（活体疗法） | NA | NA | CRISPR-Cas系统、合成基因电路、模块化质粒架构 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 合成基因电路（如生物传感器、逻辑门等） | 医学, 工业, 环境, 农业 |