合成生物学相关文章
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当前共找到 30 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-21 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 本文综述了非编码RNA在细胞命运决定中的作用，并探讨了其在系统生物学和合成生物学中的数学建模框架 | 本文总结了非编码RNA介导的细胞命运决定过程的数学建模框架，并探讨了其在真实生物过程中的应用 | 本文主要为综述性质，未提供新的实验数据或模型 | 探讨非编码RNA在细胞命运决定中的分子机制及其在系统生物学和合成生物学中的应用 | 非编码RNA、mRNA、miRNA、竞争性内源RNA（ceRNA）及其相互作用 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-12-18 |
Carotenoids: resources, knowledge, and emerging tools to advance apocarotenoid research
2025-Jan, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112298
PMID:39442633
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综述 | 本文综述了类胡萝卜素及其衍生物阿朴类胡萝卜素的生物合成、调控及其在植物发育、应激反应和植物-有机体相互作用中的作用 | 本文强调了异源表达平台和合成生物学工具在扩展阿朴类胡萝卜素发现、知识和应用方面的价值，并提出了未来研究的新方向 | NA | 探讨类胡萝卜素生物合成的调控及其对阿朴类胡萝卜素形成和生物活性效应的影响 | 类胡萝卜素及其衍生物阿朴类胡萝卜素 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-12-18 |
Bacterial 5' UTR: A treasure-trove for post-transcriptional regulation
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108478
PMID:39551455
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综述 | 本文综述了细菌5' UTR在转录后调控中的作用及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 本文整合了当前对5' UTR调控功能的理解，展示了5' UTR元件设计和筛选的最新进展，并更新了开发的工具和调控策略 | 本文强调了未来建立可靠的生物信息学分析方法和非模式细菌底盘的挑战和必要性 | 探讨细菌5' UTR衍生的调控元件及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 细菌5' UTR及其调控元件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-12-18 |
Harnessing microbial heterogeneity for improved biosynthesis fueled by synthetic biology
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.11.004
PMID:39686977
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综述 | 本文综述了微生物异质性对生物合成的影响，并探讨了合成生物学工具和策略如何通过调控微生物异质性来提高生物合成效率 | 提出了利用微生物异质性（IHP-RHR）的工作流程，通过增加遗传异质性筛选高产菌株，并在生产过程中减少异质性以获得高稳健性菌株 | 未具体讨论实际应用中的挑战和解决方案 | 探讨如何通过合成生物学和单细胞技术调控微生物异质性，以提高微生物细胞工厂的效率和稳健性 | 微生物异质性及其对生物合成的影响 | 合成生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-12-17 |
Synthetic biology approaches to improve tolerance of inhibitors in lignocellulosic hydrolysates
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108477
PMID:39551454
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性 | 本文提出了多种合成生物学策略，包括氧化还原平衡、膜工程、组学引导技术、保护剂和转录因子的表达、非理性工程、细胞絮凝和其他新技术，以提高微生物的耐受性 | 本文未详细讨论具体的技术实现细节和实验验证结果 | 提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性，促进可持续发展和工业生产 | 木质纤维素水解液中的抑制剂和微生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分子生物学、高通量测序、人工智能 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-12-13 |
Network for knowledge Organization (NEKO): An AI knowledge mining workflow for synthetic biology research
2025-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.11.006
PMID:39580108
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研究论文 | 介绍了一种名为NEKO的工作流程，利用大型语言模型Qwen从科学文献中提取知识，生成知识图谱并提供全面的文献总结 | NEKO增强了大型语言模型的能力，提供更具体、可操作的知识，并支持灵活的本地部署，使科学基础模型更易于访问 | NA | 开发一种能够从科学文献中提取知识并生成知识图谱的工作流程，以增强大型语言模型的能力 | 科学文献中的知识提取和知识图谱生成 | 机器学习 | NA | 大型语言模型（LLM） | LLM Qwen | 文本 | NA |
| 7 | 2024-12-12 |
Blue-Purple evaluation: Chromoproteins facilitate the identification of BioBrick compatibility
2025-Jan, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28862
PMID:39402779
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研究论文 | 本文介绍了一种利用色蛋白（chromoproteins）在单锅反应中评估BioBrick兼容性的新方法BP（Blue/Purple, Ban/Pick） | 提出了BP评估方法，通过可视化和量化蓝紫色大肠杆菌菌落的比率来验证BioBrick构建的兼容性 | NA | 开发一种简单、快速且可靠的方法来评估BioBrick的兼容性 | BioBrick的兼容性评估 | 合成生物学 | NA | 色蛋白（chromoproteins） | NA | 菌落图像 | 使用了包含抗毒素-毒素对ccdA-ccdB、裂解蛋白E或异源蛋白sfGFP的BioBrick组装体进行验证 |
| 8 | 2024-12-12 |
Sphingomonas arvum sp. nov.: A promising microbial chassis for high-yield and sustainable zeaxanthin biomanufacturing
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127938
PMID:39509922
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研究论文 | 本研究通过基因组挖掘和液相色谱/质谱分析，鉴定了新型类胡萝卜素玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010的生物合成基因簇，并验证了其高产玉米黄质的能力 | 首次报道了Sphingomonas arvum strain BN140010这一新型菌株，其玉米黄质产量在Sphingomonas属中最高，为可持续的玉米黄质生物制造提供了新的微生物底盘 | NA | 寻找新的微生物和遗传底盘，以满足全球对高附加值玉米黄质的快速增长需求 | 新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、液相色谱/质谱分析 | NA | 基因组数据、质谱数据 | 1株新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010 |
| 9 | 2024-12-12 |
Microbial chemotaxis in degradation of xenobiotics: Current trends and opportunities
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127935
PMID:39476517
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综述 | 本文综述了微生物趋化性在降解异生物质中的作用，重点介绍了基于趋化性的细菌和微流控生物传感器在环境监测中的应用 | 本文探讨了基因组学、蛋白质组学和合成生物学在理解和控制微生物趋化性降解异生物质过程中的新趋势，并提出了开发具有定制趋化反应和降解能力的工程微生物的潜力 | 尽管在解码细菌趋化性调控机制方面取得了显著突破，但仍存在一些知识空白需要解决，以充分利用其在环境中的污染物感知和降解潜力 | 探讨微生物趋化性在降解异生物质中的作用及其在环境监测中的应用 | 微生物趋化性在降解农药、工业化学品和药品等异生物质中的作用 | NA | NA | 基因组学、蛋白质组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-12-10 |
Applied photosynthesis: An idea whose time has come
2025-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics
DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525
PMID:39571881
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研究论文 | 本文探讨了通过材料科学、合成生物学和纳米材料工程的进步，利用生物混合设备捕获太阳能并驱动氢气生产、光伏、催化及生物传感的新途径 | 本文提出了利用生物混合设备重新部署光合机制，开发环保、高效替代传统太阳能技术的创新方法 | NA | 探索利用光合作用机制开发可持续能源技术的新途径 | 生物混合设备、光合机制、光活性色素、蛋白质工程 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、纳米材料制造 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-11-30 |
EcNikA, a versatile tool in the field of artificial metalloenzymes
2025-Jan, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2024.112740
PMID:39426332
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综述 | 本文综述了使用EcNikA（一种镍转运蛋白）在合成生物学中设计人工金属酶作为替代催化剂的多重优势 | 重点讨论了从头活性位点重建的策略，并详细介绍了蛋白质骨架对人工活性位点及其最终催化性能的影响 | NA | 探讨EcNikA在人工金属酶设计中的应用及其在合成生物学中的潜力 | EcNikA蛋白及其在人工金属酶设计中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-11-20 |
Developing filamentous fungal chassis for natural product production
2025-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131703
PMID:39477163
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综述 | 本文综述了利用丝状真菌作为底盘细胞生产天然产物的发展现状 | 强调了丝状真菌作为底盘细胞的优势，包括其天然的次级代谢产物生产能力和丰富的生物合成前体 | NA | 总结丝状真菌作为底盘细胞的最新进展，并展望其未来在工程和应用中的发展 | 丝状真菌底盘细胞的开发和应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-11-17 |
Z/E configuration controlled by a Taxus sesquiterpene synthase facilitating the biosynthesis of (3Z,6E)-α-farnesene
2025-Jan, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2024.114304
PMID:39424093
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研究论文 | 研究通过基因挖掘和分子动力学模拟，揭示了Taxus wallichiana中的TwSTPS1酶在合成(3Z,6E)-α-farnesene中的催化机制 | 首次鉴定出负责合成(3Z,6E)-α-farnesene的主要酶TwSTPS1，并通过分子动力学模拟和突变分析揭示了其催化机制 | NA | 揭示植物萜烯合酶在特定构型产物合成中的控制机制 | Taxus wallichiana中的TwSTPS1酶及其在(3Z,6E)-α-farnesene合成中的作用 | NA | NA | 基因挖掘、分子动力学模拟、突变分析 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-11-15 |
Fast acoustic droplet ejection based on annular array transducer
2025-Jan, Ultrasonics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.ultras.2024.107448
PMID:39243532
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研究论文 | 本文介绍了一种基于环形阵列换能器的高频声波液滴喷射技术，用于加速液体转移 | 提出了一种高频环形阵列换能器，无需机械移动即可实现动态轴向聚焦，从而提高液体转移效率 | NA | 开发一种新型声波液滴喷射系统，以提高液体转移的效率和精度 | 声波液滴喷射技术及其在合成生物学、基因分型和药物发现等领域的应用 | NA | NA | 声波液滴喷射技术 | NA | NA | 5个元素的环形阵列换能器，频率为10 MHz，设计焦距为26-32 mm |
| 15 | 2024-11-06 |
Development of a green Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of plant-derived sesquiterpene (-)-α-bisabolol
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.006
PMID:39493337
|
研究论文 | 研究开发了一种绿色酵母细胞工厂，用于可持续生产植物来源的倍半萜(-)-α-红没药醇 | 通过plmDCA算法设计了(-)-α-红没药醇合成酶BOS的六个突变位点，其中F324Y突变表现出优异性能，产品产量提高了73% | NA | 开发可持续生产植物来源倍半萜(-)-α-红没药醇的酵母细胞工厂 | (-)-α-红没药醇的合成酶BOS及其突变体 | 生物工程 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-11-06 |
CRISPR/Cas12a-based genome editing for cyanophage of Anabeana sp
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.011
PMID:39493338
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a的简便方法，用于高效编辑蓝细菌噬菌体基因组 | 首次成功应用CRISPR/Cas12a技术编辑蓝细菌噬菌体基因组，并生成了具有不同抑制蓝细菌生长能力的突变体 | 研究仅限于特定蓝细菌噬菌体和基因，未涵盖所有蓝细菌噬菌体种类 | 开发一种高效的方法来编辑蓝细菌噬菌体基因组，以控制蓝细菌水华 | 蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L)的基因组 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas12a | NA | 基因组 | 两个蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L) |
| 17 | 2024-10-05 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
|
研究论文 | 本文描述了使用MoClo系统进行多基因构建体组装的协议 | 介绍了使用MoClo系统进行多基因构建体组装的详细步骤 | NA | 开发一种高效的多基因构建体组装方法 | 多基因构建体 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆系统 | NA | DNA | NA |
| 18 | 2024-10-05 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于创建SBOL表示的软件工具，以模拟IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 提出了使用SBOL表示Golden Gate组装元数据的软件工具 | NA | 开发一种工具来标准化合成生物学中Golden Gate组装的元数据表示 | 合成生物学中的DNA组装和元数据表示 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA |
| 19 | 2024-10-05 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
|
研究论文 | 本文提供了一种详细的协议，用于克隆MoClo标准部件，通过Golden Gate克隆技术进行DNA组装 | 本文详细介绍了如何通过Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件，并提供了具体的实验步骤 | NA | 研究如何通过Golden Gate克隆技术高效地组装多基因构建体 | MoClo标准部件的克隆 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | DNA序列 | NA |
| 20 | 2024-10-05 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的步骤 | 利用声波分配器实现DNA组装反应的微型化和并行化，减少塑料废物和试剂使用 | NA | 开发一种自动化和微型化的Golden Gate DNA组装方法 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | 声波分配器 | NA | NA | NA |