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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-08-10 |
Tracing the development of CAR-T cell design: from concept to next-generation platforms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615212
PMID:40771804
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综述 | 本文回顾了CAR-T细胞疗法的发展历程,从早期概念到下一代平台的设计 | 探讨了CAR-T细胞疗法在受体工程、代谢重编程和免疫信号优化方面的最新进展,以及新兴基因编辑工具的应用 | CAR-T细胞疗法仍面临严重副作用、治疗反应不一致和生产成本高等挑战 | 总结CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向,以扩大其在多种癌症和其他疾病中的应用 | CAR-T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | 血液系统恶性肿瘤 | CRISPR、碱基编辑、RNA编辑、表观基因组编辑 | NA | NA | NA |
2 | 2025-08-10 |
Dimensions, stability, and deformability of DOPC-cholesterol giant unilamellar vesicles formed by droplet transfer
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19149.2
PMID:40771874
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研究论文 | 研究了通过液滴转移法制备的DOPC-胆固醇巨型单层囊泡(GUVs)的尺寸、稳定性和可变形性 | 揭示了胆固醇对DOPC GUVs尺寸分布、时间稳定性和可变形性的影响,为人工细胞和微型机器人应用提供了定制GUV膜特性的方法 | 仅研究了DOPC-胆固醇系统,未考虑其他磷脂组合的影响 | 理解胆固醇对合成磷脂膜模型(如GUVs)特性的影响 | DOPC-胆固醇巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 液滴转移法、相差显微镜、磁致变形技术 | NA | 图像数据 | 四种不同DOPC与胆固醇比例(100:0, 85:15, 71:29, 60:40)的GUVs样本 |
3 | 2025-08-03 |
The gut-bone axis in osteoporosis: a multifaceted interaction with implications for bone health
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1569152
PMID:40741168
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综述 | 本文系统总结了肠道-骨骼轴的相互作用及其在骨质疏松症中的潜在干预策略 | 创新性地提出了肠道-骨骼轴加X的概念框架,并探讨了多学科整合在抗骨质疏松症中的前景 | 未提及具体研究样本量或实验数据支持 | 探讨肠道-骨骼轴在骨质疏松症中的作用及其干预策略 | 骨质疏松症及其与肠道微生态的相互作用 | 骨科与微生物组学 | 骨质疏松症 | 粪便微生物移植、益生菌和益生元补充、饮食模式调整 | NA | NA | NA |
4 | 2025-07-29 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文提出了一种主动学习方法来训练模型,以区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子 | 采用主动学习策略结合合成生物学和不确定性采样,迭代训练模型以区分功能相反的CRX结合位点 | 模型可能仍无法完全解释转录因子在不同背景下激活或抑制转录的具体机制 | 开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 主动学习、合成生物学、大规模并行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎所有基因组中结合的CRX位点 |
5 | 2025-07-26 |
Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X2550051X
PMID:40626404
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综述 | 本文综述了2019年至2024年间发表的具有潜在抗高血压活性的植物源天然产物,探讨了它们通过靶向氧化应激、炎症、血管重塑和神经激素途径来预防高血压发展的机制 | 系统分类了70种独特的天然产物,并强调了具有双重抗氧化/抗炎特性的天然产物在临床实验中的优先研究价值 | 未涉及天然产物在人体内的具体药效学及药代动力学研究 | 探讨植物源天然产物作为抗高血压药物的潜力及其作用机制 | 70种植物源天然产物(包括黄酮类、萜类、生物碱类和植物提取物) | 药理学 | 心血管疾病 | 文献综述 | NA | 文献数据 | 70种独特的天然产物 |
6 | 2025-07-22 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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research paper | 本文介绍了一种无需淬灭剂的荧光监测方法,用于观察G-四链体结构的折叠过程 | 提出了一种仅需单一染料标记、无需淬灭剂的FRET类似格式监测G-四链体展开过渡的新方法 | 未明确提及方法在复杂生物环境中的适用性或与其他技术的比较 | 开发低成本、高通量的工具以监测G-四链体结构的折叠与展开过渡 | 富含鸟嘌呤的DNA序列及其形成的G-四链体结构 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET)类似技术 | NA | 荧光信号数据 | 多种G-四链体形成DNA序列(具体数量未说明) |
7 | 2025-07-20 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Jan-15, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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research paper | 该研究开发了一种名为hDIRECT的平台,利用人类来源的蛋白质控制细胞因子活性,以支持基于细胞的疗法 | 使用人类来源的蛋白质构建正交化合成电路,避免了非人类来源蛋白质的免疫原性风险 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行大规模临床应用验证 | 开发能够控制细胞因子活性的合成生物学平台,支持细胞疗法 | 人类蛋白酶及其抑制剂,以及工程化细胞因子(IL-2、IL-6和IL-10) | 合成生物学 | 癌症免疫治疗、肌肉再生 | 蛋白质工程、蛋白酶调控 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
8 | 2025-07-19 |
Next-generation probiotics and engineered BEVs for precision therapeutics in osteoporosis
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1581971
PMID:40667443
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综述 | 本文综述了利用下一代益生菌和工程化细菌外膜囊泡(BEVs)进行骨质疏松精准治疗的潜力 | 提出结合工程化益生菌和BEV技术的新型治疗策略,通过靶向肠道-骨骼轴提供骨保护作用 | 标准化和安全性方面仍存在挑战 | 探索基于微生物组的干预措施在骨质疏松治疗中的应用 | 骨质疏松患者 | 精准医疗 | 骨质疏松症 | 合成生物学、工程化BEVs | NA | NA | NA |
9 | 2025-07-17 |
Integrated platform for structural and functional analysis of terpene synthases of Cannabis sativa
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19723
PMID:40656959
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研究论文 | 开发了一个集成平台,用于系统表达、纯化、酶学表征和大麻萜烯合成酶(TPS)的结晶 | 结合动力学、热稳定性和结构分析,开发了一个数据挖掘指导的结晶筛选方法,成功生产出衍射质量晶体 | 仅对大麻中的十种TPS酶进行了功能表征,样本量有限 | 优化萜烯生产,用于制药、害虫管理和合成生物学应用 | 大麻萜烯合成酶(TPS) | 合成生物学 | NA | 结晶筛选、数据挖掘、酶学表征 | NA | 酶学数据、晶体结构数据 | 十种大麻TPS酶 |
10 | 2025-07-15 |
Discovery of bacterial terpenoids by genome mining
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.078
PMID:40651831
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research paper | 本文探讨了通过基因组挖掘方法发现细菌中的萜类化合物 | 利用下一代测序和合成生物学技术,开发基因组挖掘方法以发现细菌中的新型萜类合成酶和萜类天然产物 | 未提及具体实验验证或发现的萜类化合物的数量及活性验证 | 开发基因组挖掘方法以发现细菌中的萜类天然产物 | 细菌中的萜类合成酶基因和萜类天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS), 合成生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
11 | 2025-07-12 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
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研究论文 | 本文描述了一种在酿酒酵母中通过CRISPR介导的交换或移除已整合表达盒的系统,将模块化原则扩展到菌株水平 | 开发了一种允许CRISPR介导的标准化交换或移除已整合表达盒的系统,提高了现有菌株的修改效率 | 未提及系统的广泛适用性或在不同菌株中的效率差异 | 提高酿酒酵母菌株构建的模块化和灵活性 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR (Cas9和Cas12a) | NA | NA | 未明确提及具体样本数量,但测试了荧光蛋白表达盒的交换效率 |
12 | 2025-07-12 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究探索了利用GP1 PPSPX基序和内含肽介导的融合技术来工程化微藻细胞壁锚定蛋白及其受控释放 | 发现PPSPX基序对蛋白锚定至细胞壁的关键作用,并开发了pH敏感的内含肽介导的受控释放系统 | 研究主要针对微藻系统,在其他生物系统中的适用性尚待验证 | 开发蛋白定位和受控释放的创新工具,应用于合成生物学、工业生物技术和药物递送领域 | 微藻细胞壁锚定蛋白和塑料降解酶PHL7 | 合成生物学 | NA | 蛋白融合技术、内含肽介导的蛋白剪切 | NA | 蛋白定位数据、荧光动力学数据、Western blot数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含多种构建体测试 |
13 | 2025-07-12 |
High-yield bioproduction of virus-free virus-like P4-EKORhE multi-lysin transducing particles as an antimicrobial gene therapeutic
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1561443
PMID:40636261
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research paper | 该研究描述了生物工程P4-EKORhE的构建及高产病毒样颗粒的方法,用于传递基因编码的抗菌剂 | 结合合成生物学和优化的上下游处理,实现了病毒样颗粒的高产(每毫升高达10个颗粒),并保持了抗菌剂的有效性 | 研究仅在纯细菌培养和噬菌体感染模型中测试了抗菌活性,未涉及更复杂的体内环境 | 开发高产病毒样颗粒的生物生产方法,用于传递基因编码的抗菌剂 | 生物工程P4-EKORhE病毒样颗粒及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、优化的上下游处理 | NA | NA | 纯细菌培养和A549永生化人类上皮组织细胞共培养模型 |
14 | 2025-07-11 |
Molecular mechanisms and applications of natural transformation in bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1578813
PMID:40630188
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综述 | 本文详细概述了细菌自然转化的过程,从启动到完成,并探讨了其在基因编辑中的应用 | 聚焦于革兰氏阳性和阴性细菌中自然转化的分子机制,并分析了影响自然转化激活的因素 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 增强对自然转化基本原理的理解,以提升其生物技术应用 | 细菌的自然转化过程 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
15 | 2025-07-06 |
Minimal shuttle vectors for Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf010
PMID:40612073
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研究论文 | 本文描述了一组用于酿酒酵母的最小整合或着丝粒穿梭载体的设计和验证 | 这些载体是目前已知最小的酵母穿梭载体,大小在2.6至3.5 kb之间,移除了质粒中常见的限制性酶切位点,释放了约30个切割位点 | NA | 解决合成生物学中复杂遗传工程任务因缺乏合适载体骨架而受阻的问题 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 基因合成 | NA | NA | 六种最小穿梭载体(pLS400, pLS410, pLS403, pLS413, pLS404, pLS414, pLS405, pLS415, pLS406, pLS416, pLS408, pLS418) |
16 | 2025-07-04 |
Advancing sustainable practices with Paenibacillus polymyxa: From soil health to medical applications and molecular engineering
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025016
PMID:40600215
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综述 | 本文全面分析了多粘类芽孢杆菌在农业、环境管理、医学和工业中的多功能应用及其在可持续实践中的潜力 | 强调多粘类芽孢杆菌作为蛋白质表达、代谢工程和合成生物学的多功能平台的潜力,并探讨了其遗传资源和代谢能力 | 天然多粘类芽孢杆菌生物资源的广泛利用受到遗传操作能力和工具的限制 | 推动可持续实践,特别是在农业、环境管理、医学和工业领域的应用 | 多粘类芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传编辑技术 | NA | NA | NA |
17 | 2025-06-26 |
Review on Advancement of AI in Cell Engineering and Molecular Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_10
PMID:40553333
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞工程和分子生物学领域的进展及其潜在应用 | 探讨了AI如何通过自动化识别组织级模式和设计原则,为组织工程研究提供全新范式 | NA | 展示AI在分子生物学和细胞工程中的基本潜力及其应用 | 分子生物学和细胞工程领域 | 分子生物学 | NA | AI和机器学习工具 | NA | 分子数据和生物医学图像 | NA |
18 | 2025-06-26 |
Artificial Intelligence in CRISPR-Cas Systems: A Review of Tool Applications
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_14
PMID:40553337
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review | 本文综述了人工智能在CRISPR-Cas系统工具应用中的研究进展 | 整合CRISPR-Cas系统与人工智能,为基因工程研究及其应用提供新视角 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 探索人工智能在基因编辑领域的应用潜力 | CRISPR-Cas系统及其在基因编辑中的应用 | synthetic biology | NA | CRISPR-Cas9, deep learning, machine learning | NA | genomic data | NA |
19 | 2025-06-26 |
Review on Advancement of AI in Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_26
PMID:40553349
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review | 本文综述了人工智能在合成生物学中的进展及其应用 | 探讨了AI在基因组编辑、代谢途径优化和生物电路设计等方面的创新应用 | 存在高质量生物数据集整理和计算与实验科学家之间跨学科协作的挑战 | 研究人工智能如何推动合成生物学的发展 | 合成生物学中的基因组编辑、代谢途径优化和生物电路设计等 | synthetic biology | NA | deep learning, machine learning | NA | biological datasets | NA |
20 | 2025-06-23 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
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review | 本文综述了非编码RNA(ncRNA)的结构预测及其在基因表达、细胞信号传导和多种生物过程中的作用 | 强调了ncRNA结构预测的重要性及其在治疗策略开发中的应用,并探讨了计算方法和实验技术的进展 | 在准确建模复杂RNA结构及理解RNA折叠动态性方面仍存在挑战 | 探索ncRNA的结构特征及其功能意义,以促进其在生物医学研究中的应用 | 非编码RNA(包括microRNA、小干扰RNA和长链非编码RNA) | 生物医学研究 | NA | 计算方法和实验技术 | NA | NA | NA |