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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-24 |
Bioactive compounds from deep-sea extremophiles: emerging potential in cosmeceuticals and nutraceuticals
2025-Jan-10, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnaf102
PMID:40996452
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综述 | 系统探讨深海极端微生物生物活性化合物在化妆品和营养保健品领域的应用潜力 | 聚焦深海极端微生物这一未充分开发的生物资源,阐明其活性成分在抗衰老和健康促进方面的独特作用机制 | 规模化生物加工存在技术瓶颈,商业化应用面临法规合规性挑战 | 评估深海极端微生物在化妆品和营养保健品领域的生物技术应用潜力 | 深海极端微生物产生的生物活性化合物(极端酶、胞外多糖、微生物色素等) | 生物技术 | NA | 宏基因组学、高通量筛选、合成生物学、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 化妆品 |
| 2 | 2025-10-21 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 深入探讨了Cupriavidus necator从克纳尔加斯细菌发展为有前景的生物制造宿主的演化历程 | 系统总结了C. necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略领域取得的显著技术进步 | NA | 推动从化石燃料经济向可持续生物经济的转型,促进可持续生物加工和生物产品开发的未来发展 | Cupriavidus necator微生物及其在生物制造中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 3 | 2025-10-11 |
Dimensions, stability, and deformability of DOPC-cholesterol giant unilamellar vesicles formed by droplet transfer
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19149.3
PMID:40771874
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研究论文 | 本研究通过液滴转移法制备不同胆固醇比例的DOPC巨单层囊泡,并系统分析其尺寸分布、时间稳定性和变形能力 | 首次系统研究胆固醇含量对液滴转移法制备的GUVs物理性质的影响,并采用磁性变形实验评估膜机械性能 | 仅研究了DOPC-胆固醇体系,未涉及其他磷脂组成;变形性测试仅使用磁性方法 | 探究胆固醇对合成磷脂膜模型物理性质的影响机制 | DOPC-胆固醇巨单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 相衬显微镜、磁性变形实验、图像分析 | NA | 图像数据 | 4种不同DOPC-胆固醇比例(100:0, 85:15, 71:29, 60:40)的GUVs样本 | 液滴转移法 | NA | NA | 合成生物学, 微机器人技术 |
| 4 | 2025-10-06 |
Sustainable production of microalgal nanoparticles through green synthesis towards cancer treatment
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1621876
PMID:41040414
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综述 | 本文综述了微藻纳米颗粒的绿色合成方法及其在癌症治疗中的应用机制 | 提出将合成生物学和基因工程微藻技术整合到微藻纳米颗粒的绿色合成中 | NA | 探讨微藻纳米颗粒的绿色合成及其在癌症治疗中的应用前景 | 微藻纳米颗粒 | 生物技术 | 癌症 | 绿色合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | NA | 医药 |
| 5 | 2025-10-06 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
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综述 | 本文系统阐述肠道微生物代谢物通过信号分子调控宿主免疫的机制及治疗前景 | 整合空间代谢组学、合成生物学和纳米医学技术,提出靶向代谢物-免疫轴的新型治疗策略 | 实现个性化微生物组-免疫调控仍面临挑战,需进一步解决个体差异和时空特异性问题 | 解析肠道微生物代谢物的免疫调节机制并探索相关治疗应用 | 肠道微生物代谢物(短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生物等)及其免疫调节功能 | 微生物免疫学 | 炎症性和自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、多组学整合分析、AI预测建模 | NA | 代谢组学数据、免疫学数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2025-10-06 |
Structural and functional insights into cellulosomes: masters of plant cell wall degradation
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1638551
PMID:41040872
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综述 | 本文系统探讨了纤维素小体的结构和功能机制及其在植物细胞壁降解中的应用潜力 | 全面重估纤维素小体的模块化架构、动态组装机制及合成生物学驱动的生物技术应用潜力 | NA | 解析纤维素小体在植物生物质降解中的结构与功能机制 | 厌氧细菌和真菌中的纤维素小体复合酶系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 厌氧细菌, 真菌 | 碳水化合物结合模块, 黏连蛋白-对接蛋白相互作用机制 | 工业生物技术, 能源 |
| 7 | 2025-10-06 |
The role of Food Science and Foodomics in the implementation of One-Health
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1662767
PMID:41041135
|
综述 | 探讨食品科学与食品组学在实现'同一健康'理念中的潜在应用 | 首次系统讨论食品科学与食品组学在推动'同一健康'发展中的多重可能性,并探索合成生物学在食品科学中的新兴潜力 | NA | 探索食品科学与食品组学如何帮助实现'同一健康'目标 | 同一健康理念、食品科学、食品组学、合成生物学 | NA | 人畜共患疾病 | 食品组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 环境, 医学 |
| 8 | 2025-10-05 |
Technological and industrial trends in China's pharmaceutical sector
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1579037
PMID:41035909
|
综述 | 本文综合分析中国医药行业的关键趋势,重点关注新兴技术对药物开发的影响及产业转型驱动因素 | 系统分析中国作为全球第二大医药市场的独特发展路径,整合政策环境、资本周期与技术创新的多维视角 | 未提供具体实证数据支持趋势分析,主要基于宏观观察和理论推演 | 探讨中国医药行业的技术创新与产业升级路径 | 中国医药行业的政策环境、技术发展、市场需求和产业转型 | 医药产业研究 | 慢性病、罕见病 | 精准医疗、合成生物学 | NA | 行业分析报告 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 9 | 2025-10-05 |
Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis
2025-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85266-x
PMID:39775135
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研究论文 | 通过比较猫须草不同组织的转录组分析,揭示与黄酮类化合物生物合成相关的差异表达基因 | 首次对猫须草所有组织进行黄酮类化合物合成生物学的比较转录组分析,发现根部黄酮含量更高并鉴定出212个与根部黄酮积累强相关的差异表达基因 | 研究仅限于猫须草单一物种,未进行功能验证实验 | 探究猫须草不同组织中黄酮类化合物生物合成的分子机制 | 猫须草(Orthosiphon aristatus)的根、茎、叶等不同组织 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | 高效液相色谱分析, 转录组分析, 实时定量PCR | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 猫须草不同组织样本 | NA | 猫须草(Orthosiphon aristatus) | 黄酮类化合物生物合成通路 | 医药 |
| 10 | 2025-10-05 |
From nonexistence to novel applications: Nullomers and related k-mer based concepts in bioinformatics
2025, Advances in clinical chemistry
DOI:10.1016/bs.acc.2025.06.009
PMID:41033729
|
综述 | 本章节系统阐述了生物信息学中未被充分代表的k-mer序列(包括空位体和相关概念)的研究进展与应用前景 | 提出了基于缺失序列(空位体和新位体)的创新研究框架,为癌症检测、组织溯源和进化研究提供了新方法 | 讨论了分析缺失序列时面临的计算挑战 | 探索k-mer序列在基因组学和蛋白质组学中的基础与应用研究价值 | 空位体、新位体和准素数等未被充分代表的k-mer序列 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer分析,液体活检 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | 医学诊断,药物发现,合成生物学 |
| 11 | 2025-10-05 |
Targeting the gut-liver axis in cholangiocarcinoma: mechanisms, therapeutic advances, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1646897
PMID:41018102
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综述 | 探讨肠道-肝脏轴在胆管癌发病机制中的作用及靶向该轴线的治疗进展 | 系统阐述肠道微生物失调、胆汁酸代谢紊乱与免疫微环境重塑在胆管癌中的协同作用机制 | 微生物群异质性和受体信号双重性等挑战尚未解决,临床转化需更深入机制研究和标准化方案 | 研究肠道-肝脏轴在胆管癌发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 胆管癌患者肠道/胆道微生物组、胆汁酸代谢通路及肿瘤免疫微环境 | 医学肿瘤学 | 胆管癌 | 多组学分析、人工智能 | NA | 临床数据、微生物组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 工程化微生物群 | NA | 医学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Therapeutic potential of the gut commensal bacterium Parabacteroides goldsteinii in human health and disease treatment
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1618892
PMID:41019532
|
综述 | 系统探讨肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的潜在应用价值 | 首次系统综述该菌株通过短链脂肪酸分泌、胆汁酸转化和免疫调节等多重机制对抗多种疾病的治疗潜力 | 面临培养条件优化、剂量效应表征和遗传工具开发等转化挑战 | 评估Parabacteroides goldsteinii作为益生菌在疾病治疗和健康促进中的应用前景 | 肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii及其与宿主互作机制 | 微生物组研究 | 代谢紊乱、神经系统疾病、炎症性疾病、恶性肿瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
|
研究论文 | 通过宏基因组分析探讨金属(类)抗性基因及其在环境修复中的应用 | 采用宏基因组方法系统探索微生物金属抗性基因的功能多样性和作用机制 | NA | 研究微生物金属抗性基因的机制及其环境应用价值 | 微生物金属抗性基因及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 环境 |
| 14 | 2025-10-05 |
Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210
PMID:40821789
|
综述 | 探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用与优化 | 提出整合数学模型与计算技术的综合框架,以提升CAR-T疗法设计并预测临床效果 | 现有模型时空分辨率有限,影响疗法安全性及成本效益,尤其针对实体瘤 | 通过计算手段优化CAR-T疗法设计并预测治疗效果 | CAR-T细胞动力学及抗原结合机制 | 计算生物学 | 癌症 | 数学模型与计算模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | CAR(嵌合抗原受体)工程化改造 | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
|
综述 | 本文综述了利用代谢模型研究植物-微生物相互作用的最新进展 | 系统整合基因组尺度代谢模型应用于植物-微生物互作研究,并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢网络建模理解植物-微生物相互作用的机制 | 植物宿主及其相关微生物组成的全生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型数据 | NA | NA | 植物、微生物 | NA | 农业 |
| 16 | 2025-10-05 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 提出通过微生物组工程构建合成微生物群落以增强农业气候韧性的综合框架 | 提出可编程全息生物体概念,整合微生物生态学、合成生物学和计算建模构建具有动态反馈和生态记忆的植物-微生物共生系统 | NA | 开发气候韧性农业的工程化微生物组解决方案 | 植物全息生物体(植物宿主及其微生物组) | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物、微生物 | 生物传感器电路、群体感应模块、可编程微生物功能 | 农业 |
| 17 | 2025-10-05 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
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综述 | 本文综述了先天淋巴样细胞(ILCs)在免疫调节和疾病中的作用,并探讨了其作为生物标志物和免疫治疗新策略的潜力 | 系统阐述了ILCs作为新型免疫治疗蓝图的转化潜力,包括CAR-ILC工程、细胞扩增技术和多组学方法的应用 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床应用的障碍 | 探讨ILCs在自身免疫疾病和癌症中作为预测、诊断和治疗靶点的作用 | 先天淋巴样细胞(ILCs)及其亚群(ILC1s、ILC2s、ILC3s、LTi细胞) | 免疫学 | 自身免疫疾病,癌症 | 多组学技术、单细胞图谱、合成生物学方法 | NA | NA | NA | CAR工程 | 脐带血、多能干细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)工程 | 医学 |
| 18 | 2025-10-05 |
Revolutionizing structural biology: AI-driven protein structure prediction from AlphaFold to next-generation innovations
2025, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.04.002
PMID:40973394
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综述 | 本文回顾了蛋白质结构预测技术的发展历程,重点分析了AlphaFold的创新贡献及其对结构生物学领域的革命性影响 | 系统梳理了从传统方法到以AlphaFold为代表的AI驱动蛋白质结构预测技术的演进,并展望了下一代AI和量子计算在结构生物学中的应用前景 | 现有方法在蛋白质复合物预测、动态构象变化模拟等方面仍存在局限 | 探讨人工智能在蛋白质结构预测领域的发展历程、现状和未来方向 | 蛋白质结构预测技术及其应用 | 结构生物学 | NA | AI驱动预测、同源建模、穿线法、从头预测 | AlphaFold、RoseTTAFold、OmegaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 19 | 2025-10-05 |
Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899
PMID:40207161
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综述 | 系统回顾沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性和抗菌潜力 | 聚焦沙特独特生态系统(极端环境等)中放线菌的抗菌潜力,结合基因组挖掘、AI生物信息学等前沿技术 | 稀有菌株培养困难、基因组表征有限、生产成本高 | 探索新型抗菌剂以应对抗菌素耐药性 | 沙特阿拉伯不同环境来源的放线菌 | 微生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 基因组挖掘、宏基因组学、AI生物信息学、CRISPR基因激活、质谱分析、液相色谱、核磁共振波谱 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 放线菌 | NA | 医学, 农业 |
| 20 | 2025-10-05 |
Yarrowia lipolytica as a promising cell factory for microbial production of value-added nutraceuticals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673169
PMID:40948964
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综述 | 总结解脂耶氏酵母作为细胞工厂生产高附加值营养保健品的工程策略与进展 | 系统整合代谢工程与合成生物学工具,重点突出细胞器区室化工程和生物传感器驱动筛选等先进策略 | NA | 开发解脂耶氏酵母作为可持续生产营养保健品的微生物平台 | 解脂耶氏酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学、多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 生物传感器 | 解脂耶氏酵母 | 代谢通路工程、异源基因表达优化、前体供应增强、竞争途径重定向 | 食品, 工业生物技术 |