合成生物学相关文章
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当前共找到 244 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-03 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 本文深入回顾了Cupriavidus necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略方面的技术进步，并探讨了其作为可持续生物制造宿主的潜力 | 系统总结了C. necator从一种Knallgas细菌演变为有前景的生物制造宿主的过程，强调了其在推动可持续生物经济中的关键作用 | NA | 探讨C. necator作为多样化微生物底盘在合成生物学和可持续生物制造中的应用潜力 | Cupriavidus necator（一种多功能的微生物） | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
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综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力，包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展，包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-02-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 本文综述了肺癌组织内微生物群的存在及其通过炎症和免疫途径重塑肿瘤微环境的机制，并探讨了其在临床预测和治疗中的应用前景 | 推翻了‘无菌肿瘤’的传统观念，系统阐述了肿瘤内微生物群主动调控肺癌进展的机制，并前瞻性地讨论了合成生物学工具（如工程菌和靶向纳米抗生素）在重塑免疫微环境中的应用潜力 | 肺癌组织微生物生物量低，测序数据易受试剂污染和批次效应影响；真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明肿瘤内微生物群影响肺癌细胞及肿瘤微环境的机制，探索其在肺癌进展中的作用及临床转化潜力 | 肺癌组织内的微生物群（包括细菌、真菌、病毒等）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序、多组学技术 | NA | 测序数据、多组学数据 | NA | 合成生物学（涉及工程菌、靶向纳米抗生素设计） | NA | NA | 医学（癌症精准诊断与治疗） |
| 4 | 2026-01-30 |
Microbial therapeutics for canine periodontal disease: current status and future perspectives
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1748968
PMID:41602620
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综述 | 本文综述了犬牙周病的微生物疗法现状，包括益生菌、后生元、噬菌体及合成生物学等策略，并讨论了其未来前景与挑战 | 从生态失调角度而非单一病原体视角分析犬牙周病，并系统评估了多种新兴微生物疗法（如噬菌体、合成生物学工具）在该领域的应用潜力 | 现有疗法存在微生物定植短暂、兽医临床证据有限、生物安全性担忧以及缺乏标准化监管路径等问题 | 探讨通过调节口腔微生物群落结构与功能来治疗犬牙周病的非抗生素策略 | 犬牙周病及其相关的口腔微生物群落 | NA | 牙周病 | 测序技术、定量分子分析 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角，系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章，主要基于现有文献进行整合分析，未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用，探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子（如GLP-1）的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 6 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
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研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型，利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变，模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞，实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行，尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制，构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统，以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构，形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |
| 7 | 2026-01-24 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动力学和转运机制 | 首次通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证来确认预测的突变效果 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，为工程化改造提供原子层面的见解 | 蓝藻的碳酸氢盐转运蛋白BicA | 结构生物学与计算生物学 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | BicA二聚体的模拟数据（超过1毫秒） | NA | 蓝藻 | NA | 能源、粮食生产、气候变化应对 |
| 8 | 2026-01-23 |
Editorial: Synthetic biology and metabolomics: novel insight in oncology research
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1768397
PMID:41568228
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2026-01-20 |
Editorial: Synthetic biology approaches for biocatalytic production of value-added chemicals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1755163
PMID:41550373
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-01-17 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 结合合成生物学和不确定性采样，通过多轮大规模平行报告基因检测迭代训练模型，解决了传统模型无法解释同一转录因子在不同背景下激活或抑制转录的问题 | NA | 开发能够区分具有相同序列但相反功能的CRX结合位点的调控DNA模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 大规模平行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 基因组中几乎所有结合的CRX位点 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 11 | 2026-01-15 |
Engineered bacteria as living therapeutics: Next-generation precision tools for health, industry, environment, and agriculture
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025042
PMID:41522435
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌作为活体疗法方面的最新进展，探讨了其在医疗、工业、环境和农业领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统、合成基因电路和模块化质粒架构，结合计算建模与机器学习，实现了对微生物行为的精细调控 | 存在遗传稳定性、生物安全性、临床与工业环境可重复性等挑战，伦理与监管框架仍需完善 | 探讨工程化细菌作为下一代精准工具在健康、工业、环境和农业领域的应用潜力 | 工程化细菌（活体疗法） | NA | NA | CRISPR-Cas系统、合成基因电路、模块化质粒架构 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 合成基因电路（如生物传感器、逻辑门等） | 医学, 工业, 环境, 农业 |
| 12 | 2026-01-10 |
Cnidarian toxins: omics approaches and recombinant proteins
2025, The journal of venomous animals and toxins including tropical diseases
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了利用组学技术和重组蛋白方法研究刺胞动物毒素的最新进展、局限性与未来前景 | 整合了组学技术、重组表达系统、合成生物学及人工智能计算工具在刺胞动物毒素研究中的协同应用，并展望了其在生物活性化合物开发中的潜力 | 复杂毒素的功能验证与生产仍具挑战性，尤其是需要复杂折叠或翻译后修饰的毒素；细胞游离蛋白合成系统等新技术的工业可扩展性仍有限 | 探索刺胞动物毒素的分子多样性、药理潜力及其作为生物活性化合物的来源 | 刺胞动物（如水母、海葵等）产生的毒素 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、重组蛋白表达、细胞游离蛋白合成系统 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据、代谢物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 13 | 2026-01-09 |
Recent advances in the transformation of maleimides via annulation
2025-Jan-02, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d4ob01632g
PMID:39545834
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综述 | 本文综述了2019年至2024年间马来酰亚胺通过环化反应转化的最新研究进展，重点介绍了其在环化、苯环化、环加成和螺环化等反应中的应用 | 总结了光催化和电化学等新兴方法在马来酰亚胺环化反应中的应用，拓展了其合成复杂分子的可持续性和选择性途径 | 某些反应如基于环加成的环化、光环化和电化学转化在制药和化学工业中潜力巨大但尚未被充分探索 | 系统梳理马来酰亚胺环化策略的研究进展，探讨其在合成生物学和材料科学中的新应用方向 | 马来酰亚胺骨架及其环化反应 | 有机化学 | NA | 光催化、电化学方法、C-H活化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物化学、药物发现、材料科学 |
| 14 | 2026-01-09 |
Harnessing mass spectrometry-based proteomics for continuous directed evolution
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf017
PMID:41492657
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研究论文 | 本文探讨了如何利用基于质谱的蛋白质组学技术来支持连续定向进化过程，以AtMS1和AtMS2甲硫氨酸合酶的连续进化为例 | 首次将基于质谱的蛋白质组学（包括全蛋白质组分析和靶向蛋白质组学）系统性地应用于连续定向进化过程中，以监测目标酶丰度、识别群体构建缺陷、测量代谢适应并指导进化策略决策 | NA | 开发并展示一种利用蛋白质组学技术来增强连续定向进化效率和理解进化机制的方法 | 甲硫氨酸合酶AtMS1和AtMS2的连续定向进化过程 | 合成生物学 | NA | 基于质谱的蛋白质组学（全蛋白质组分析、靶向蛋白质组学） | NA | 蛋白质组数据 | NA | 连续定向进化 | 平台细胞（具体未指明） | NA | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-01-09 |
Emerging trends in genome integration tools for precision engineering of diverse bacterial species
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf019
PMID:41492658
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综述 | 本文综述了用于多种细菌物种精确基因编辑的基因组整合工具的新兴趋势，重点关注自包含、便携式系统 | 强调CRISPR引导系统与整合酶结合的最新进展，以及面向非模式生物的工程化趋势 | 依赖宿主DNA修复机制的传统技术限制了在缺乏这些能力的生物中的应用 | 探索和推动细菌基因组精确整合工具的发展，以实现细胞表型的全面工程化和新生物技术的创建 | 细菌物种，特别是非模式生物 | 合成生物学 | NA | 同源重组、CRISPR引导系统、整合酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 重组工程技术 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 16 | 2026-01-04 |
Bioengineering hybrid artificial life
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1676359
PMID:41477590
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综述 | 本文探讨了生物工程与人工生命（ALife）的融合，旨在通过标准化生物部件设计适应性、进化性的人工生命系统，以解决实际问题 | 提出了一种混合合成人工生命设计方法论，结合数字和生物进化设计方法，以克服当前合成人工生命在进化适应性和任务适应性方面的限制 | 当前合成人工生命在定向进化、适应度景观映射和适应度近似方面存在显著不足，导致其无法持续进化并适应变化的任务和环境 | 旨在解决合成人工生命在定向进化中的开放挑战，推动生物工程化问题解决型人工生命的实现 | 人工生命系统，特别是通过生物工程和合成生物学方法设计的适应性、进化性系统 | 合成生物学 | NA | 定向进化、遗传多样性生成、适应度映射、适应度估计 | NA | NA | NA | 标准化生物部件（如启动子、核糖体） | 微生物（如用于环境清理或抗体生产的工程微生物） | 问题解决型人工生命系统，可能涉及逻辑门、生物传感器或代谢途径 | 环境、医学、工业生物技术 |
| 17 | 2026-01-03 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以动态控制细胞器功能 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控，为细胞工程和合成生物学提供创新范式 | NA | 开发一种光遗传学方法来调控细胞器功能，特别是线粒体-溶酶体接触 | 真核细胞中的细胞器，特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 光遗传学调控的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 医学 |
| 18 | 2026-01-03 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNA和靶标模拟物作为作物改良潜在工具的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学方法设计人工miRNA和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的生物技术策略 | NA | 探讨人工miRNA和靶标模拟物在作物改良中的应用潜力 | 植物中的microRNA及其人工调控工具 | NA | NA | 人工miRNA设计、靶标模拟物技术、短串联靶标模拟物 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 利用miRNA生物合成途径编程合成回路 | 农业 |
| 19 | 2026-01-02 |
Matrine and Its Derivatives: Multi-Pathway Regulation in Cancer Therapy
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S563211
PMID:41467103
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综述 | 本文综述了苦参碱及其衍生物通过多通路调控在癌症治疗中的作用、挑战及未来发展方向 | 系统阐述了第三代衍生物（如MT-26, YF-18）通过靶向双重抑制和激活NLRP3/caspase-1细胞焦亡通路，在胰腺癌和肝癌模型中实现60-78%的抑瘤率，并克服化疗耐药性 | 临床转化面临生物利用度低、脱靶毒性（如通过激活导致的肝毒性）以及肿瘤异质性驱动的耐药机制（如介导的铁死亡逃逸）等挑战，且迄今为止尚无针对苦参碱或其衍生物在癌症治疗中的I/II期临床试验注册 | 探讨苦参碱及其衍生物作为多靶点天然生物碱在癌症治疗中的协同抗肿瘤效应及其转化前景 | 苦参碱及其衍生物 | NA | 癌症 | 多组学（空间代谢组学、单细胞表观药物组学）、合成生物学、器官芯片技术 | NA | NA | NA | DNA折纸纳米机器人、磁性引导微/纳米游泳器、AI辅助晶体筛选 | NA | NA | 医学 |
| 20 | 2026-01-01 |
Deep learning-based investigation of chloroplast translation regulatory sequences
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1698951
PMID:41459449
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研究论文 | 本研究开发了一种结合CNN、LSTM、Attention和Residual架构的混合深度学习模型，用于分类和分析植物与藻类叶绿体翻译调控序列，特别是5'非翻译区序列及SD基序的存在与否 | 首次应用深度学习模型分析叶绿体翻译调控序列，并提出了在藻类质体工程中引入异源前导序列的两种潜在策略 | 模型性能虽强，但存在一小部分植物和藻类序列表现出跨组模式，可能影响分类准确性 | 研究叶绿体翻译调控序列的架构，以促进合成生物学和基因工程的发展 | 植物和藻类的叶绿体5'非翻译区序列，包括含与不含SD基序的序列 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, Attention, Residual | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 |