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当前共找到 251 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-08-26 |
Blue-Purple evaluation: Chromoproteins facilitate the identification of BioBrick compatibility
2025-01, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28862
PMID:39402779
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research paper | 本文提出了一种利用色素蛋白（chromoproteins）评估BioBrick兼容性的方法，命名为BP评估，通过观察和量化大肠杆菌菌落的蓝紫比例来验证构建的兼容性。 | 首次采用色素蛋白作为可视化和量化工具，在一锅反应中快速、简便地评估BioBrick兼容性，无需复杂设备。 | 该方法依赖于LB-agar板上菌落颜色的可视化和量化，可能受限于菌落计数的主观性，且尚未广泛验证于多种宿主或复杂构建。 | 开发一种简单、快速且可靠的方法来评估合成BioBrick的兼容性，以避免组装DNA片段在宿主细胞中引起负面影响。 | 大肠杆菌（E. coli）中的BioBrick组装，包括抗毒素-毒素对ccdA-ccdB、裂解蛋白E和异源蛋白sfGFP。 | synthetic biology | NA | NA | NA | image | NA | BioBrick | E. coli | NA | industrial biotechnology |
| 2 | 2026-08-25 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-01-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 该研究通过全原子分子动力学模拟，揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的电梯式转运机制。 | 首次通过超过1毫秒的分子动力学模拟数据，动态解析BicA二聚体的结构重排和底物转运过程，并识别出降低构象转变自由能垒的潜在突变。 | 研究主要基于计算模拟，缺乏实验验证；模拟结果可能受限于力场参数和采样时间。 | 阐明蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，并为工程化改造以提高光合作用产量提供原子级见解。 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA二聚体。 | 分子动力学模拟 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 模拟轨迹数据 | 超过1毫秒的模拟数据 | NA | 蓝藻 | NA | 生物技术、能源、环境 |
| 3 | 2026-08-12 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-01-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
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综述 | 本文综述了通过化学修饰和基因工程等手段改造噬菌体以对抗多重耐药细菌的研究进展，并讨论了其在病原体检测和杀灭中的应用 | 结合合成生物学和纳米技术的跨学科方法，系统总结了噬菌体工程在扩大宿主范围、赋予新功能方面的创新策略 | 天然噬菌体的窄宿主范围、未表征特性以及指数复制和进化带来的潜在风险仍限制其应用 | 探索噬菌体工程在病原体控制和多重耐药细菌治疗中的应用潜力 | 多重耐药细菌及其噬菌体工程改造策略 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因工程、化学修饰 | NA | 文献资料 | NA | 基因工程工具 | 噬菌体宿主细菌（未特指） | 噬菌体工程改造（增强宿主范围、赋予新功能） | 医学 |
| 4 | 2026-08-12 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-01-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术的最新进展及其在化学生物学、合成生物学和医学等领域的应用 | 系统总结了GCE技术中aaRS/tRNA优化、翻译系统工程和筛选方法等关键突破，并展望了其在基因编辑和疫苗生产等新兴领域的应用前景 | 未详细讨论GCE技术的具体局限性和潜在风险，如脱靶效应和体内递送效率等问题 | 全面概述GCE技术的现状，包括原理、发展和应用，并展望其未来方向 | 非规范氨基酸及其位点特异性掺入蛋白质系统，涉及氨基酸tRNA合成酶/tRNA系统 | 化学生物学, 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展, 氨基酸tRNA合成酶/tRNA系统优化, 翻译系统工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-08-12 |
Meeting report: 400 synthetic biology projects promote sustainable development
2025, Sustainable microbiology
DOI:10.1093/sumbio/qvaf018
PMID:42576861
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会议报告 | 本文报道了2024年iGEM Grand Jamboree会议，总结了超过400个合成生物学项目在促进可持续发展方面的努力和成果 | 强调通过基础合成生物学原理应用于多样化问题来解决可持续发展挑战，并突出展示了四个典型项目 | 未提供具体项目结果的详细评估或数据支持 | 展示合成生物学在应对和解决广泛可持续发展挑战中的应用前景 | 会议中展示的合成生物学项目，特别是四个代表性项目（斯德哥尔摩、色萨利、鲁汶、哥本哈根） | 合成生物学 | NA | 分子克隆、微生物工程 | NA | 文本 | 超过400个来自高中和大学的学生团队项目 | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物 | 代谢通路、生物传感器、逻辑门等（根据项目特性） | 医疗保健, 人类进步, 环境 |
| 6 | 2026-07-10 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-01-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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research paper | 利用合成生物学研究种子植物中独脚金内酯物种间生物合成的进化 | 发现CYP722A酶将香豆酸转化为16-羟基香豆酸（非经典SL），并证明其在进化上是经典独脚金内酯生物合成的前体 | NA | 阐明种子植物中独脚金内酯生物合成的进化机制 | 独脚金内酯生物合成途径中的CYP722A和CYP722C酶 | 植物生物学, 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NB | NA | 合成生物学 | NA | 独脚金内酯生物合成途径 | 农业 |
| 7 | 2026-07-04 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 综述了酿酒酵母在医学应用中的工程化进展，包括药物生产、生物传感器和活体生物治疗产品 | 系统总结了酿酒酵母在医学领域的三类主要应用（药物与疫苗生产、诊断生物传感器、肠道疾病活体治疗）及其学术与商业发展 | 该领域仍面临挑战，但未具体说明主要障碍 | 综述酿酒酵母工程化在医学领域的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 医学 |
| 8 | 2026-07-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 综述了瘤内微生物群通过炎症和免疫协同重塑肺癌微环境的机制 | 颠覆了传统“无菌肿瘤”观念，揭示了瘤内微生物群通过代谢物分泌、信号通路激活、免疫抑制细胞募集和免疫检查点分子表达上调主动促进肿瘤进展的机制 | 肺组织低生物量特性导致测序数据易受试剂污染和批次效应影响，且真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明瘤内微生物群在肺癌进展中的作用机制并探索其临床应用潜力 | 肺癌组织和肿瘤微环境中的瘤内微生物群 | 数字病理学 | 肺癌 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2026-06-26 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种基于水凝胶颗粒的无纯化方法，用于测量合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶保真度 | 通过在磁性水凝胶颗粒基质内进行XNA转录和逆转录步骤，避免了传统方法中耗时的聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化步骤 | NA | 简化XNA聚合酶保真度测量流程 | XNA聚合酶 | NA | NA | 水凝胶颗粒技术, DNA/RNA合成 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 10 | 2026-06-18 |
Engineering biology and chemical approaches to the construction of vitamin B12 analogues and antivitamins B12 as probes and therapeutic agents
2025, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2025.07.003
PMID:40846392
|
综述 | 综述利用工程生物学和化学方法构建维生素B12类似物及抗维生素B12作为探针和治疗剂的研究进展 | 通过合成生物学在E. coli中异源表达有氧B12生物合成途径，高产生物合成中间体和无钴B12前体，并用于生成含铑、镍、锌等过渡金属的金属取代类似物及有机抗代谢物和荧光标记衍生物，用于探针B12依赖酶、追踪维生素运输和选择性破坏微生物或疾病相关代谢 | 文中未明确论述局限性，可能包括合成类似物的体内稳定性、特异性及临床转化的挑战 | 探索合成维生素B12类似物和抗维生素B12在生物研究和治疗中的应用 | 维生素B12类似物、抗维生素B12、金属取代类似物、荧光标记衍生物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | E. coli | 维生素B12生物合成途径 | 医学, 农业, 环境 |
| 11 | 2026-06-01 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
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研究论文 | 介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的遗传编码工具，用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列，发现聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）能够形成具有可忽略成核屏障的淀粉样组装体，在任意选择的浓度阈值下实现蛋白质自组装，并通过调整TA重复长度精细调节饱和浓度 | 论文未明确讨论该工具在体内应用时的潜在毒性或脱靶效应，也未涉及在复杂生物环境中的长期稳定性 | 开发一种可调亲和融合标签，用于控制蛋白质自组装和研究蛋白质浓度与细胞功能的关系 | 聚苏氨酸-丙氨酸（poly-TA）二肽重复序列 | 合成生物学 | NA | 遗传编码工具、二肽重复序列筛选 | NA | 蛋白质组装数据 | NA | NA | 细胞（未具体说明） | 可调淀粉样蛋白融合标签 | 细胞生物学、发育生物学、合成生物学 |
| 12 | 2026-05-30 |
Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0319337
PMID:40014593
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研究论文 | 通过来自13个欧洲国家的全国代表性样本调查，探究公众对合成细胞潜在应用（如抗癌治疗、CO2转化、工业废物回收）的态度 | 首次在大规模跨国样本中系统评估公众对自下而上构建的合成细胞技术的态度，并利用数据驱动决策树模型分析影响态度的因素 | NA | 绘制公众对新兴合成细胞技术的初步态度，以促进社会讨论和利益相关者参与 | 来自13个欧洲国家的8382名公众 | NA | 癌症 | NA | 决策树 | 调查问卷数据 | 13个欧洲国家，8382名参与者 | NA | NA | 合成细胞 | 医疗、环境、能源 |
| 13 | 2026-05-27 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
|
综述 | 探讨非编码RNA的结构预测及其在生物学和医学中的重要性 | 融合计算方法和实验技术，提升RNA结构预测准确度，并探讨多组学数据整合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模和RNA折叠动态特性理解仍存在挑战 | 提高非编码RNA结构预测能力，推动其在诊断和治疗中的应用 | 非编码RNA，包括microRNA、siRNA和长链非编码RNA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 药物发现, 生物标志物, 合成生物学 |
| 14 | 2026-05-25 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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评论 | CTGCT卓越中心旨在将科学发现转化为针对神经系统罕见遗传病和癌症的先进基因与细胞疗法 | 斯洛文尼亚首个此类中心，整合合成生物学工具、基因编辑、RNA技术、免疫调控工程及新型递送系统，建立GMP设施推动临床转化 | 尚未提供具体实验数据或临床结果评估 | 推动基因与细胞疗法从基础研究向临床应用转化 | 神经系统罕见遗传病和癌症 | 数字病理学 | 神经系统罕见遗传病, 癌症 | 基因编辑, 剪接技术, RNA技术, 免疫调控工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 15 | 2026-05-15 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
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研究论文 | 开发了一种黏液包封微球凝胶递送系统，用于封装基因工程益生菌，实现对炎症性肠病的诊断和治疗 | 设计了外部黏膜涂层（透明质酸和表没食子儿茶素没食子酸酯）与内部高生物相容性聚丝氨酸改性藻酸盐微球结合的双层递送系统，有效保护工程菌免受胃部恶劣环境影响并延长肠道定殖时间至24小时 | 实验仅基于炎症性肠病模型，未提及在人类患者中的验证结果 | 解决工程菌递送至病变部位并实现持续定殖的挑战，推动活体生物治疗产品的临床转化 | 基因工程益生菌（用于检测和治疗肠炎） | 合成生物学, 生物医学工程 | 炎症性肠病 | 合成生物学, 微球凝胶封装 | NA | 体内动物模型数据 | NA | 基因工程 | 益生菌（具体种类未说明） | 生物标志物检测与Avcystatin释放回路 | 医学 |
| 16 | 2026-05-15 |
Revolutionizing structural biology: AI-driven protein structure prediction from AlphaFold to next-generation innovations
2025, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.04.002
PMID:40973394
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综述 | 探讨从AlphaFold到下一代创新中人工智能驱动的蛋白质结构预测如何革命化结构生物学 | 系统回顾蛋白质结构预测从传统方法到AlphaFold及后续模型（如RoseTTAFold和OmegaFold）的演变，并重点分析AlphaFold的设计、方法论和性能，同时指出其局限性及未来方向 | 模型在预测蛋白质复合体和动态变化方面存在不足，且对计算资源要求较高 | 综述人工智能在蛋白质结构预测中的进展与应用，并展望未来发展方向 | 蛋白质结构预测方法及其在生物医学中的应用 | 机器学习, 结构生物学 | NA | AlphaFold, RoseTTAFold, OmegaFold, 同源建模, 从头预测 | 人工智能模型（如AlphaFold） | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 药物发现 |
| 17 | 2026-05-10 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
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综述 | 探讨类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径的工程化策略，涵盖酶工程、合成生物学工具及宿主范围，并展望未来研究方向 | 采用通路模块化视角，系统梳理从前体供应到氧化裂解的每个酶促步骤，重点突出新发现酶变体、诱变研究、融合策略及区室化方法对代谢调控的贡献 | 仅聚焦近期文献，未对工业放大和具体产量指标进行量化比较，缺乏对经济性与规模化瓶颈的深入分析 | 为推进类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素生物合成提供层次化路径理解与工程策略整合 | 类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径中的酶、宿主（植物、真菌、藻类、酵母、细菌）及合成生物学工具 | NA | NA | NGS、RNA-seq、CRISPR-Cas9、Golden Gate Assembly | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 植物、真菌、藻类、酵母、细菌 | 类胡萝卜素生物合成通路（前体供应→GGPP→八氢番茄红素→脱饱和/异构化→环化→羟基化→酮基化→环氧化→氧化裂解） | 医学、农业、食品、工业生物技术 |
| 18 | 2026-05-08 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-01-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本研究利用量子隧穿纳米间隙结和机器学习技术，对八种人工合成DNA碱基进行了电识别研究 | 首次将量子隧穿传输与机器学习结合用于人工DNA碱基的高精度电识别，实现了高达100%的碱基识别准确率 | 未提及实际生物样本中的验证或系统级应用限制 | 实现人工合成DNA碱基的快速精确电识别，推动遗传研究、DNA数据存储和合成生物学发展 | 八种人工合成DNA碱基（DNA和DNA碱基） | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输 | 机器学习模型 | 序列 | 八种人工合成DNA碱基数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 遗传学, DNA数据存储, 诊断 |
| 19 | 2026-05-06 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 提供转酮醇酶活性、催化机制和结构分析的实验方案，涵盖稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测及快速动力学研究 | 整合多种生物物理和结构生物学方法，形成用于转酮醇酶基础与应用研究的综合工具集 | 未涉及具体疾病模型或临床验证，未讨论不同来源转酮醇酶间的差异 | 建立转酮醇酶功能与结构分析的标准实验方案，推动酶学、合成生物学及药物开发 | 转酮醇酶 | 结构生物学 | 癌症、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、光谱学、快速动力学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物催化 |
| 20 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |