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当前共找到 249 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-06 |
Biophysical and structural studies on transketolases
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.07.011
PMID:41203347
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研究论文 | 提供转酮醇酶活性、催化机制和结构分析的实验方案，涵盖稳态动力学、辅因子结合、催化中间体检测及快速动力学研究 | 整合多种生物物理和结构生物学方法，形成用于转酮醇酶基础与应用研究的综合工具集 | 未涉及具体疾病模型或临床验证，未讨论不同来源转酮醇酶间的差异 | 建立转酮醇酶功能与结构分析的标准实验方案，推动酶学、合成生物学及药物开发 | 转酮醇酶 | 结构生物学 | 癌症、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 稳态动力学、光谱学、快速动力学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物催化 |
| 2 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法，通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案，开发了低成本工程培养基，并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 4 | 2026-04-16 |
Immunomodulatory role of gut microbial metabolites: mechanistic insights and therapeutic frontiers
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1675065
PMID:41040871
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综述 | 本文综述了肠道微生物代谢物通过多种信号通路调节宿主免疫的机制，并探讨了基于这些代谢物的新兴治疗策略 | 整合了空间代谢组学、合成生物学和纳米医学的最新进展，提出了时空递送免疫调节代谢物的新治疗途径，并展望了结合多组学和AI预测模型的个性化调控方向 | NA | 阐明肠道微生物代谢物在免疫调节中的作用机制并探索其治疗应用前景 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、次级胆汁酸、色氨酸衍生吲哚等）及其对宿主免疫系统的影响 | NA | 炎症性和自身免疫性疾病 | 空间代谢组学、合成生物学、纳米医学、多组学、AI驱动预测建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2026-04-16 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
|
研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2，一种低成本、开源、基于喷墨技术的第二代DNA合成器，旨在实现实验室环境中灵活且低成本的寡核苷酸合成 | OpenIDS2通过3D打印机械组件、定制PCB集成控制电子和蠕动泵批量溶液输送系统，显著减小设备体积、提高操作稳定性和制造可及性，增强了开源硬件平台的再现性和全球可访问性 | NA | 开发一种低成本、开源的DNA合成平台，以降低实验室自动化的入门门槛 | DNA合成器（OpenIDS2）及其在寡核苷酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 喷墨技术、磷酸胺化学、尿素-PAGE、HPLC | NA | NA | 成功合成了15-mer poly(dT)序列在CPG基板上 | 3D打印、定制PCB | NA | NA | 合成生物学、分子诊断、生物技术 |
| 6 | 2026-03-14 |
Discovery of bacterial terpenoids by genome mining
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.078
PMID:40651831
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综述 | 本文概述了利用基因组挖掘方法从细菌中发现新型萜类合酶和萜类天然产物的策略 | 强调基因组挖掘作为传统天然产物发现方法的补充，专注于细菌中未开发的萜类合酶基因资源 | 未提及具体实验验证或数据限制，主要侧重于方法概述 | 探索细菌中萜类天然产物的发现潜力，以应用于药物和工业领域 | 细菌中的萜类合酶基因和萜类天然产物 | 合成生物学 | NA | 下一代测序，基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物，工业，商业 |
| 7 | 2026-03-10 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的DNA组装方法，通过修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端，用于高效精确的DNA克隆 | DAPE方法克服了传统SLIC技术对小DNA片段（如gRNA和表位标签）组装效率低的问题，能在单次反应中精确组装不同大小的DNA片段 | NA | 开发一种改进的DNA组装技术，以促进合成生物学中多基因电路的构建 | DNA片段，特别是小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | PCR，DNA组装，磷酸硫酯修饰，T5外切酶处理 | NA | NA | NA | DAPE（DNA Assembly with Phosphorothioate and T5 Exonuclease） | NA | 多基因电路 | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-02-18 |
Metagenomic analysis of metal(loid)s resistance genes and its environmental applications
2025, Advances in applied microbiology
DOI:10.1016/bs.aambs.2025.08.001
PMID:40992856
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研究论文 | 本文通过宏基因组分析探讨金属（类）抗性基因及其在环境应用中的潜力 | 利用宏基因组技术系统分析金属抗性基因的功能多样性和机制，并将其应用于生物修复和合成生物学等环境领域 | NA | 研究金属抗性基因在微生物中的机制及其环境应用 | 细菌菌株及其金属抗性基因 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 9 | 2026-02-15 |
AistSeq: An in-house easy-to-purify Tn5-based plasmid sequencing platform using a compact benchtop sequencer
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673510
PMID:41676073
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Tn5转座酶的简易纯化质粒测序平台AistSeq，利用紧凑型台式测序仪进行质粒序列验证 | 发现添加大分子可溶性标签对纯化非必需，仅需His10标签和蛋白A融合即可生产活性Tn5转座酶，并整合了基于外切酶的基因组DNA消化和iSeq100数据分析流程 | NA | 开发实验室规模的简化质粒测序工作流程 | 质粒序列验证 | 合成生物学 | NA | 下一代测序（NGS）、Tn5转座酶纯化、外切酶消化 | NA | DNA序列数据 | NA | Tn5转座酶 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2026-02-08 |
Advances in promoter engineering strategies for enhanced recombinant protein expression in plants
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1747353
PMID:41635682
|
综述 | 本文综述了针对植物系统、旨在增强重组蛋白表达的启动子工程策略的最新进展 | 重点介绍了利用CRISPR转录控制、高通量筛选和机器学习辅助启动子设计等新兴合成生物学工具，创建适用于复杂多基因表达的可调、正交启动子 | NA | 推进植物分子农业，扩展植物作为高价值重组蛋白多功能生物工厂的作用 | 用于植物系统的启动子（天然、合成、杂交、诱导型和组织特异性启动子） | 合成生物学 | NA | CRISPR转录控制，高通量筛选，机器学习辅助启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR | 植物，植物细胞培养物 | NA | 医药，工业生物技术，农业 |
| 11 | 2026-02-08 |
Engineered probiotics for inflammatory bowel disease therapy: mechanisms, delivery strategies, and precision medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1696524
PMID:41640410
|
综述 | 本文综述了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的应用，包括其作用机制、递送策略和精准医学前景 | 聚焦于工程化益生菌的设计，以克服传统益生菌在胃肠道环境中的存活、定植和靶向性不足等限制，并探讨了基于个体肠道微生物组谱的个性化干预 | 工程化益生菌在长期安全性、稳定性以及治疗反应准确预测方面仍面临关键挑战 | 探索工程化益生菌作为炎症性肠病治疗的新型替代方案 | 炎症性肠病，包括溃疡性结肠炎和克罗恩病 | NA | 炎症性肠病 | 基因工程、合成生物学、先进封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 12 | 2026-02-06 |
Precision tumor treatment utilizing bacteria: principles and future perspectives
2025-Jan-04, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13378-x
PMID:39754636
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综述 | 本文全面回顾了基于细菌的肿瘤治疗策略，包括其分类、机制、工程化方法以及临床转化挑战 | 系统整合了合成生物学与纳米医学于工程化细菌中，以增强治疗效果和可控性 | NA | 探讨利用细菌进行精准肿瘤治疗的原理和未来前景 | 工程化细菌及其与纳米材料的杂合系统 | NA | 肿瘤 | 基因工程、合成生物学、纳米医学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤靶向、肿瘤细胞杀伤、抗肿瘤免疫激活的基因回路 | 医学 |
| 13 | 2026-02-05 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
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综述 | 本文通过模块化视角，综述了类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素的生物合成途径，包括新型酶、合成生物学工具及代谢控制策略 | 采用途径模块中心视角，整合多种酶源、宿主范围及途径模块性，强调新发现和工程化酶以及合成生物学工具 | NA | 综述类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素生物合成的最新进展，为研究人员提供层次化理解以推动该领域发展 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素的生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 真菌, 藻类, 酵母, 细菌 | NA | 生物医学, 农业, 环境, 食品 |
| 14 | 2026-02-05 |
A synthetic biology toolkit for rationally designing genetic circuits in Acinetobacter baumannii
2025, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2025.1668595
PMID:41626556
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研究论文 | 本研究开发了一个用于鲍曼不动杆菌的合成生物学工具包，包括BioBrick部件库和模块化CRISPRi平台，以对抗抗菌素耐药性 | 首次在鲍曼不动杆菌中系统表征BioBrick部件并开发模块化CRISPRi平台，为理性设计基因电路提供基础 | NA | 通过合成生物学方法对抗鲍曼不动杆菌的抗菌素耐药性 | 鲍曼不动杆菌及其基因电路 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | CRISPR干扰 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 鲍曼不动杆菌 | 基因电路，包括诱导型和组成型启动子库以及CRISPRi介导的抑制系统 | 医学 |
| 15 | 2026-02-03 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 本文深入回顾了Cupriavidus necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略方面的技术进步，并探讨了其作为可持续生物制造宿主的潜力 | 系统总结了C. necator从一种Knallgas细菌演变为有前景的生物制造宿主的过程，强调了其在推动可持续生物经济中的关键作用 | NA | 探讨C. necator作为多样化微生物底盘在合成生物学和可持续生物制造中的应用潜力 | Cupriavidus necator（一种多功能的微生物） | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-02-03 |
Vibrio natriegens: Application of a Fast-Growing Halophilic Bacterium
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_271
PMID:39527262
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综述 | 本文综述了快速生长的嗜盐细菌Vibrio natriegens在生物技术应用中的潜力，包括其生理学、合成生物学工具开发及代谢工程进展 | 总结了Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主的最新研究进展，包括其快速生长特性、遗传工程工具和代谢模型的应用 | NA | 探讨Vibrio natriegens在生物技术领域的应用潜力和未来挑战 | Vibrio natriegens细菌 | NA | NA | 遗传工程、代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 17 | 2026-02-02 |
Intratumoral microbiota: synergistic reshaping of lung cancer microenvironment via inflammation and immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653727
PMID:41613126
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综述 | 本文综述了肺癌组织内微生物群的存在及其通过炎症和免疫途径重塑肿瘤微环境的机制，并探讨了其在临床预测和治疗中的应用前景 | 推翻了‘无菌肿瘤’的传统观念，系统阐述了肿瘤内微生物群主动调控肺癌进展的机制，并前瞻性地讨论了合成生物学工具（如工程菌和靶向纳米抗生素）在重塑免疫微环境中的应用潜力 | 肺癌组织微生物生物量低，测序数据易受试剂污染和批次效应影响；真菌、病毒等非细菌组分在肿瘤生态系统中的协同作用常被忽视 | 阐明肿瘤内微生物群影响肺癌细胞及肿瘤微环境的机制，探索其在肺癌进展中的作用及临床转化潜力 | 肺癌组织内的微生物群（包括细菌、真菌、病毒等）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 肺癌 | 高通量测序、多组学技术 | NA | 测序数据、多组学数据 | NA | 合成生物学（涉及工程菌、靶向纳米抗生素设计） | NA | NA | 医学（癌症精准诊断与治疗） |
| 18 | 2026-01-30 |
Microbial therapeutics for canine periodontal disease: current status and future perspectives
2025, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2025.1748968
PMID:41602620
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综述 | 本文综述了犬牙周病的微生物疗法现状，包括益生菌、后生元、噬菌体及合成生物学等策略，并讨论了其未来前景与挑战 | 从生态失调角度而非单一病原体视角分析犬牙周病，并系统评估了多种新兴微生物疗法（如噬菌体、合成生物学工具）在该领域的应用潜力 | 现有疗法存在微生物定植短暂、兽医临床证据有限、生物安全性担忧以及缺乏标准化监管路径等问题 | 探讨通过调节口腔微生物群落结构与功能来治疗犬牙周病的非抗生素策略 | 犬牙周病及其相关的口腔微生物群落 | NA | 牙周病 | 测序技术、定量分子分析 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-01-29 |
β-cell heterogeneity and molecular plasticity in type 2 diabetes: multi-omics perspectives and the role of gut microbiota
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1698296
PMID:41584842
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综述 | 本文综述了利用多组学技术揭示2型糖尿病中β细胞异质性、分子可塑性及其与肠道微生物群相互作用的研究进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等多组学视角，系统阐述了β细胞异质性、肠道微生物群调控机制及其交汇点作为潜在治疗靶点的创新框架 | 作为综述文章，主要基于现有文献进行整合分析，未提供新的原始实验数据 | 理解2型糖尿病中β细胞功能衰退的分子机制及肠道微生物群的调控作用，探索精准治疗策略 | 胰腺β细胞、肠道微生物群、胰岛内分泌细胞、免疫细胞、基质细胞 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 转录组数据、表观遗传数据、空间基因表达数据 | NA | 合成生物学方法、基因工程 | 基因工程益生菌菌株 | 用于递送生物活性分子（如GLP-1）的工程化益生菌系统 | 医学 |
| 20 | 2026-01-29 |
Pyrite as a catalyst for the emergence of multiphase primitive cells
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1747422
PMID:41586365
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研究论文 | 本研究开发了一种基于凝聚层的原始细胞模型，利用天然黄铁矿的催化活性诱导单相液滴向多相液滴转变，模拟了生命细胞的层次结构和功能 | 首次利用天然矿物的类过氧化物酶催化活性构建具有内部相分离结构的多相原始细胞，实现了寡核苷酸在亚区室中的选择性分配 | 研究在模拟前生命条件下进行，尚未验证在更复杂环境或与生物分子网络整合时的稳定性与功能性 | 探索非生命化学系统向生命系统过渡的机制，构建具有层次结构和类生命功能的原始细胞模型 | 基于单链寡核苷酸、季铵化葡聚糖和TMB的凝聚层液滴系统，以及天然黄铁矿催化剂 | 合成生物学 | NA | 凝聚层自组装、类酶催化反应 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于黄铁矿催化TMB氧化驱动的相分离结构，形成具有内部TMBox/ss-oligo相和外部Q-dextran/ss-oligo相的多区室系统 | 合成生物学、生物技术 |