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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-11-05 |
OpenIDS2: A low-cost, 3D-printed, open-source platform for reproducible construction of DNA microarray synthesizers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0338478
PMID:41411291
|
研究论文 | 本文介绍了OpenIDS2,一个低成本、3D打印、开源的第二代喷墨式DNA微阵列合成器平台,用于实验室环境的寡核苷酸合成 | 将设备体积缩小至原版OpenIDS的三分之一,通过定制PCB集成所有控制电子元件,采用蠕动泵基批量溶液输送系统提高操作稳定性和制造可及性,大部分机械部件设计为可3D打印,显著增强了作为开源硬件平台的可重复性和全球可及性 | 仅在CPG基底上成功合成了15-mer poly(dT)序列,验证的序列长度和类型有限,尚未展示更复杂或更长寡核苷酸序列的合成能力 | 开发一种低成本、开源、可重复构建的台式寡核苷酸合成平台,降低实验室自动化的入门门槛 | DNA寡核苷酸合成设备及15-mer poly(dT)序列 | 合成生物学 | NA | 喷墨式DNA合成、亚磷酰胺化学、urea-PAGE、HPLC | NA | NA | 15-mer poly(dT)序列合成样本 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 2 | 2026-11-02 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了用于聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生物合成的非天然微生物宿主及代谢工程改造策略 | 系统总结了所有用于PHB生物合成的非天然微生物宿主,并讨论了辅因子工程、代谢途径重构、细胞形态工程和CRISPR/Cas9基因组编辑等代谢工程方法 | 非天然微生物宿主仍需进一步的基因工程改造才能更适合大规模PHB生产 | 总结非天然微生物生产PHB的研究进展及代谢工程策略 | 非天然微生物宿主(如大肠杆菌) | 合成生物学, 代谢工程 | NA | 代谢工程, 合成生物学, CRISPR/Cas9 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌及其他非天然微生物宿主 | PHB生物合成途径, 代谢途径重构, 辅因子工程 | 医学, 生物医学, 材料 |
| 3 | 2026-11-02 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 综述了利用合成生物学和基因工程改造曲霉以提高有机酸产量的策略与进展 | 系统总结了代谢途径重构、副产物消除、调控途径改造和菌丝形态工程等策略,并重点讨论了基于CRISPR的生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用与挑战 | 文中未明确提及具体局限性,作为综述缺乏原始实验数据验证 | 为提升曲霉菌株在工业有机酸生产中的效率提供理论指导和创新方法 | 曲霉(Aspergillus) | 合成生物学 | NA | 基因工程、CRISPR、生物传感器 | NA | 文本 | NA | CRISPR | 曲霉 | 生物传感器 | 工业生物技术、食品、医药 |
| 4 | 2026-10-30 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
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综述 | 本章全面概述了水疱性口炎病毒(VSV)的工程化改造技术,重点介绍了将促凋亡基因XAF1整合到VSV基因组中的方法及详细实验流程 | 系统总结了利用反向遗传学和合成生物学技术对VSV进行精确工程化改造的策略,特别是整合促凋亡基因XAF1以增强抗肿瘤免疫和治疗效果 | 作为综述章节,未提供原始实验数据,可能缺乏对具体实验结果的定量分析和验证 | 提高VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水疱性口炎病毒(VSV)及其工程化改造体 | 肿瘤免疫治疗、病毒治疗 | 癌症(肿瘤) | 反向遗传学、合成生物学 | NA | 文本 | NA | 反向遗传学、合成生物学 | 哺乳动物细胞(用于病毒包装和扩增) | 整合促凋亡基因XAF1的VSV基因组 | 医学 |
| 5 | 2026-10-30 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
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研究方法论文 | 本文描述了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法,并探讨了其在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | 利用反向遗传学和合成生物学技术对流感病毒进行条件性控制改造,提高疫苗安全性并诱导强免疫反应,拓展了工程化流感病毒在肿瘤免疫治疗中的应用 | 文中未明确提及具体限制 | 开发基于反向遗传系统的流感病毒基因工程改造方法,并探索其在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | 甲型流感病毒H1N1毒株WSN | 合成生物学, 病毒学, 免疫学 | 流感, 肿瘤 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传系统 | NA | 条件控制基因元件 | 医学, 疫苗开发, 肿瘤免疫治疗 |
| 6 | 2026-10-22 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
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研究论文 | 该论文提出了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用合成生物学改造的大肠杆菌实现DNA信息的安全存储与可控传输 | 将DNA存储的高密度与合成生物学的动态调控相结合,通过咖啡因浓度和温度控制信息传递,并引入温度敏感的自毁机制确保信息不可逆销毁 | 多次转移后菌株活力快速下降可能影响长期稳定性,信息传输依赖于特定条件(咖啡因和温度)的控制 | 开发一种安全可控的微生物信息存储与传输平台 | 工程化的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | DNA存储、合成生物学 | NA | DNA编码信息 | NA | NA | 大肠杆菌 | 咖啡因降解途径、温度敏感自毁机制 | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-10-15 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法,通过修饰引物和T5核酸外切酶生成指定长度的3'单链末端,实现不依赖序列和连接的高效DNA组装 | DAPE方法利用硫代磷酸修饰引物和T5核酸外切酶,能够生成精确长度的3'突出端,克服了传统SLIC技术因外切酶活性过强而无法克隆小于50 bp DNA片段的限制 | 摘要中未提及该方法的局限性 | 开发一种通用的、不依赖序列和连接的克隆方法,能够高效精确地组装任意大小的DNA片段,包括小于50 bp的片段 | 线性化DNA片段,包括小片段如gRNA和表位标签 | 合成生物学 | NA | DNA克隆、PCR、核酸外切酶处理 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 8 | 2026-10-07 |
Anti-aging effect of low molecular weight recombinant humanized collagen on photo-aging by activating adherence junction signaling pathways
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0329460
PMID:40880343
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研究论文 | 该研究评估了低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC)的皮肤渗透性及其抗皮肤光老化的效果与分子机制 | 选用低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC),系统评估其皮肤渗透率(8小时达74.7±14.2%)及抗光老化作用,并通过转录组测序首次揭示其通过激活黏附连接信号通路维持细胞骨架结构、通过激活TGF-β信号通路促进ECM生成的抗衰老机制 | 对RHC穿透皮肤并发挥抗衰老作用的研究仍然有限,其潜在机制在很大程度上尚未被探索 | 探究低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC)的皮肤渗透能力及其抗皮肤光老化的作用与机制 | 低分子量重组人源胶原蛋白肽(LRHC)、皮肤成纤维细胞、光老化裸鼠模型 | 皮肤生物学、化妆品科学 | 皮肤老化(光老化) | 转录组测序 | 光老化裸鼠模型 | 转录组测序数据、图像 | 光老化裸鼠模型(未提及具体样本数量) | 合成生物学 | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 9 | 2026-09-26 |
Intergenerational justice, the impending sixth mass extinction, reproduction and advanced biotechnologies, and humanity's future
2025, Cambridge prisms. Extinction
DOI:10.1017/ext.2025.10005
PMID:41322091
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综述 | 探讨代际正义、第六次物种大灭绝、生殖与先进生物技术及人类未来的关系,主张通过生殖生物技术和生物样本库保护物种遗传多样性 | 提出将先进生殖生物技术(包括基因工程和合成生物学)与野生动物生物样本库相结合,通过去灭绝、恢复近期灭绝物种和维持现存物种遗传多样性来实现生物圈管理的新视野 | 先进生殖生物技术在人类利益、物种管理和生物圈可持续性方面的应用受到不断演变的伦理和法律框架的制约,特别是涉及基因工程、超人类主义和古代物种去灭绝方面 | 探讨如何通过生殖和先进生物技术最大化地球生物多样性遗产和生物圈可持续性,以造福未来世代 | 3000多种极度濒危的陆生/淡水物种,包括两栖类、小型鱼类、淡水贻贝、螯虾、爬行动物、鸟类和哺乳动物 | NA | NA | 基因工程,合成生物学,生殖生物技术,生物样本库 | NA | 文本 | 超过3000种极度濒危陆生/淡水物种 | NA | NA | NA | 医学,农业,环境 |
| 10 | 2026-09-26 |
From pandemics to preparedness: harnessing AI, CRISPR, and synthetic biology to counter biosecurity threats
2025, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2025.1711344
PMID:41383331
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综述 | 本文综述了人工智能、CRISPR和合成生物学等新兴技术在生物安全威胁防控中的应用,涵盖疫情预测、病原检测、治疗开发、防护装备及网络生物安全等方面 | 系统整合了AI流行病预测、下一代测序、CRISPR诊断、数字流行病学、mRNA/DNA疫苗平台、纳米抗体疗法、机器人技术、生物传感器和纳米技术防护装备等多种前沿技术,提出将新兴技术与国际合作、公平体系和灵活政策相结合以构建面向未来的生物安全防御体系 | 新兴技术面临伦理、法律和公平性问题,需要负责任地治理并确保所有人都能获得这些技术 | 探讨如何利用AI、CRISPR和合成生物学等新兴技术应对自然暴发、实验室事故和蓄意生物恐怖主义等生物安全威胁 | 生物安全威胁,包括自然疫情暴发、实验室事故和蓄意生物恐怖主义 | 机器学习, 数字病理学 | 传染病 | 人工智能, CRISPR诊断, 下一代测序, 数字流行病学, mRNA疫苗平台, DNA疫苗平台, 单克隆抗体, 纳米抗体疗法, 生物传感器, 纳米技术 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 环境 |
| 11 | 2026-09-26 |
Synthetic biology approaches to enhance cancer immune responses
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698158
PMID:41394856
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法增强癌症免疫应答的最新进展,涵盖基于微生物的疗法和CAR-T细胞工程 | 整合了微生物疗法和CAR-T细胞工程两大平台,通过可编程基因电路实现布尔逻辑运算,确保治疗仅在肿瘤特异性生物标志物存在时激活 | 临床转化面临重大障碍,包括安全性问题、免疫清除和制造复杂性 | 总结合成生物学在增强癌症免疫应答方面的最新进展,探讨精准工程化免疫疗法的发展方向 | 基于微生物的疗法、CAR-T细胞工程、合成基因电路 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因电路构建、CAR-T细胞工程 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 哺乳动物细胞 | 可编程基因电路、布尔逻辑门、装甲型CAR-T、逻辑门控CAR-T | 医学 |
| 12 | 2024-12-28 |
Targeted Activation of Programmed Cell Death Pathways by Optogenetics
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_5
PMID:39724344
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光遗传学技术激活三种主要程序性细胞死亡(凋亡、坏死性凋亡和焦亡)的协议 | 开发了新的合成生物学工具,通过化学或光遗传学方法在选定的细胞中特异性诱导程序性细胞死亡 | 目前难以在不影响邻近细胞的情况下,在细胞群或复杂组织中靶向和诱导选定细胞的死亡 | 研究如何利用光遗传学技术激活程序性细胞死亡 | 细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-01-03 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触(MLCs)的方法,以动态控制细胞器功能 | 利用光遗传学技术实现对活细胞中细胞器功能的动态调控,为细胞工程和合成生物学提供创新范式 | NA | 开发一种光遗传学方法来调控细胞器功能,特别是线粒体-溶酶体接触 | 真核细胞中的细胞器,特别是线粒体和溶酶体 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学 | 真核细胞 | 光遗传学调控的线粒体-溶酶体接触(MLCs) | 医学 |
| 14 | 2026-09-14 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
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综述 | 本文综述了先天淋巴细胞(ILCs)在免疫调节、组织稳态和疾病发病机制中的作用,并探讨其作为生物标志物和创新免疫治疗蓝图的潜力。 | 系统整合了ILC亚群的功能多样性、可塑性和组织驻留性,强调其作为预测、诊断和治疗靶点的作用,并提出结合多组学、单细胞图谱和合成生物学指导ILC疗法设计的新视角。 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床转化的障碍。 | 综述ILC生物学和转化研究进展,探讨其作为生物标志物和治疗靶点的潜力,并展望下一代精准免疫治疗。 | 先天淋巴细胞(ILCs),包括ILC1s、ILC2s、ILC3s和淋巴组织诱导细胞(LTi) | 免疫学,免疫治疗 | 自身免疫疾病,癌症 | NA | NA | 文本 | NA | 嵌合抗原受体(CARs) | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-09-12 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-01-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
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研究论文 | 本文描述了在酿酒酵母中利用CRISPR介导的盒交换系统,实现基因组整合盒的标准化交换或移除,将模块化提升到菌株水平 | 首次实现了对已整合到基因组中的表达盒进行标准化交换或移除,通过条形码靶向CRISPR(Cas9和Cas12a)一步完成盒的替换或野生型位点恢复,将模块化原则扩展到菌株水平 | 目前仅应用于荧光蛋白表达盒的交换,未展示在复杂代谢途径或工业相关菌株中的应用,效率约90%仍有提升空间 | 开发一种系统,能够轻松地通过CRISPR介导交换或移除先前整合的盒,从而将模块化带到菌株水平,增强修改现有菌株的可能性并减少步骤 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因组整合表达盒 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | 酿酒酵母 | 基因组整合的荧光蛋白表达盒交换系统 | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-09-12 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-01-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用基因组尺度代谢建模研究植物-微生物相互作用的研究进展 | 系统梳理了代谢建模在共生、致病和微生物群落系统中的应用,并探讨了其作为合成微生物群落设计测试平台的潜力 | 作为综述,未提供原始实验数据,且指出了该领域仍面临的挑战,如模型精度和整合多组学数据的困难 | 总结代谢建模在理解植物-微生物相互作用中的应用,并展望未来方向 | 植物-微生物相互作用,包括共生、致病和微生物群落系统 | 系统生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 基因组尺度代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型组等多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 17 | 2026-09-12 |
Strength in diversity: unlocking the full potential of engineered living materials with multistrain collaboration
2025-01-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf055
PMID:41206547
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综述 | 本文综述了多菌株协作工程活材料(ELMs)的发展潜力,探讨了通过多菌株分工突破单菌株功能限制的策略 | 提出多菌株协作是解锁工程活材料全部潜力的新方向,通过分工合作克服单菌株代谢负担和功能局限 | 多菌株ELMs仍处于早期发展阶段,面临菌株间协调、竞争和稳定共存的挑战 | 探讨多菌株协作如何拓展工程活材料的功能性和应用范围 | 工程活材料(ELMs)中的微生物系统,包括细菌、真菌、植物和藻类 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌, 真菌, 植物, 藻类 | 多菌株协作系统 | 医学, 建筑, 农业 |
| 18 | 2026-09-12 |
Engineering microorganisms for enhanced tolerance to toxic end-products and intermediates
2025-01-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf053
PMID:41137716
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综述 | 本文系统综述了通过工程化细胞包膜、细胞内组分和细胞外环境来提高微生物对有毒终产物和中间体耐受性的合成生物学策略 | 系统整合了针对细胞包膜、转录因子与修复途径等细胞内组分以及生物膜与细胞间互作等细胞外工程三个层面的微生物耐受性增强策略,并强调了对有毒终产物和中间体工业转化的促进作用 | 作为综述,未提供新的实验数据,且未对各类工程策略进行定量比较或标准化评估 | 系统概述提高微生物对有毒化学品耐受性的工程化策略,推动有毒终产物和中间体微生物生产的工业转化与商业化 | 微生物细胞工厂及其对有毒终产物和中间体的耐受性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 19 | 2026-09-12 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 综述了非编码RNA介导的细胞命运决策回路从系统生物学到合成生物学的数学建模框架与应用 | 以教学方式总结ncRNA数学建模通用框架,整合mRNA、miRNA和ceRNA互调涌现特性,并探讨合成生物学方法理解细胞命运决策设计原理 | 未提供具体实验数据或新模型,仅为综述性总结 | 阐明ncRNA介导的细胞命运决策分子机制,并探索合成生物学方法理解基本设计原理 | 非编码RNA介导的细胞命运决策回路,包括mRNA、miRNA和竞争性内源RNA | 系统生物学,合成生物学 | NA | 数学建模,定量实验分析 | 数学建模框架 | NA | NA | NA | NA | 双稳态开关,正反馈回路,miRNA-mRNA互调回路 | 医学,工业生物技术 |
| 20 | 2026-09-11 |
Metabolic engineering approaches for the biosynthesis of antibiotics
2025-Jan-31, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02628-2
PMID:39891166
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综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在抗生素发现及高效生产现有抗生素、衍生物和类似物中的最新工具与策略,并给出了代表性案例 | 系统总结了近期代谢工程与合成生物学工具和策略在抗生素发现与生产中的应用,强调其应对多重耐药菌危机的潜力 | 未涉及具体实验验证,主要基于已有研究的归纳与展望 | 探讨如何利用代谢工程和合成生物学策略促进新抗生素的发现以及现有抗生素、衍生物和类似物的高效生产 | 抗生素及其衍生物和类似物、工程酶、细胞工厂 | 代谢工程 | 传染病、多重耐药菌感染 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药 |