本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价5元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2025-07-11 |
Genomically integrated cassettes swapping: bringing modularity to the strain level in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf032
PMID:40577080
|
研究论文 | 该研究描述了一种在酿酒酵母中实现基因组整合表达盒交换或移除的系统,将模块化原则扩展到菌株水平 | 开发了一种基于CRISPR的系统,允许对已整合到基因组中的表达盒进行标准化交换或移除,突破了现有工具的限制 | 目前仅在酿酒酵母中进行了验证,尚未在其他微生物系统中测试 | 提高微生物细胞工厂构建的灵活性和效率 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | CRISPR (Cas9和Cas12a核酸酶) | NA | 基因组数据 | 使用荧光蛋白表达盒进行测试 |
2 | 2025-07-11 |
Molecular mechanisms and applications of natural transformation in bacteria
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1578813
PMID:40630188
|
综述 | 本文详细概述了细菌自然转化的过程,从启动到完成,并探讨了其在基因编辑中的应用 | 聚焦于革兰氏阳性和阴性细菌中自然转化的分子机制,并分析了影响自然转化激活的因素 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 增强对自然转化基本原理的理解,以提升其生物技术应用 | 细菌的自然转化过程 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
3 | 2025-07-11 |
High-yield bioproduction of virus-free virus-like P4-EKORhE multi-lysin transducing particles as an antimicrobial gene therapeutic
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1561443
PMID:40636261
|
研究论文 | 本文描述了生物工程P4-EKORhE的构建及一种高产病毒样颗粒的综合方法,用于通过合成生物学和优化的上下游处理传递基因编码的抗菌剂 | 利用P4和P2噬菌体的病毒学特性建立高产转导颗粒的生物过程,同时避免天然病毒污染并保持最终产品的抗菌效果 | NA | 开发高产病毒样颗粒作为抗菌基因治疗剂 | P4-EKORhE病毒样颗粒及其抗菌活性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、优化的上下游处理 | NA | NA | 纯细菌培养物和与A549永生化人类上皮组织细胞共培养的噬菌体感染模型 |
4 | 2025-07-06 |
Minimal shuttle vectors for Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf010
PMID:40612073
|
研究论文 | 本文描述了一组用于酿酒酵母的最小整合或着丝粒穿梭载体的设计和验证 | 这些载体是目前已知最小的酵母穿梭载体,大小在2.6至3.5 kb之间,移除了质粒中常见的限制性酶切位点,释放了约30个切割位点 | NA | 解决合成生物学中复杂遗传工程任务因缺乏合适载体骨架而受阻的问题 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 基因合成 | NA | NA | 六种最小穿梭载体(pLS400, pLS410, pLS403, pLS413, pLS404, pLS414, pLS405, pLS415, pLS406, pLS416, pLS408, pLS418) |
5 | 2025-07-04 |
Advancing sustainable practices with Paenibacillus polymyxa: From soil health to medical applications and molecular engineering
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025016
PMID:40600215
|
综述 | 本文全面分析了多粘类芽孢杆菌在农业、环境管理、医学和工业中的多功能应用及其在可持续实践中的潜力 | 强调多粘类芽孢杆菌作为蛋白质表达、代谢工程和合成生物学的多功能平台的潜力,并探讨了其遗传资源和代谢能力 | 天然多粘类芽孢杆菌生物资源的广泛利用受到遗传操作能力和工具的限制 | 推动可持续实践,特别是在农业、环境管理、医学和工业领域的应用 | 多粘类芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传编辑技术 | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-26 |
Review on Advancement of AI in Cell Engineering and Molecular Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_10
PMID:40553333
|
综述 | 本文综述了人工智能在细胞工程和分子生物学领域的进展及其潜在应用 | 探讨了AI如何通过自动化识别组织级模式和设计原则,为组织工程研究提供全新范式 | NA | 展示AI在分子生物学和细胞工程中的基本潜力及其应用 | 分子生物学和细胞工程领域 | 分子生物学 | NA | AI和机器学习工具 | NA | 分子数据和生物医学图像 | NA |
7 | 2025-06-26 |
Artificial Intelligence in CRISPR-Cas Systems: A Review of Tool Applications
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_14
PMID:40553337
|
review | 本文综述了人工智能在CRISPR-Cas系统工具应用中的研究进展 | 整合CRISPR-Cas系统与人工智能,为基因工程研究及其应用提供新视角 | 未提及具体实验验证或实际应用案例 | 探索人工智能在基因编辑领域的应用潜力 | CRISPR-Cas系统及其在基因编辑中的应用 | synthetic biology | NA | CRISPR-Cas9, deep learning, machine learning | NA | genomic data | NA |
8 | 2025-06-26 |
Review on Advancement of AI in Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_26
PMID:40553349
|
review | 本文综述了人工智能在合成生物学中的进展及其应用 | 探讨了AI在基因组编辑、代谢途径优化和生物电路设计等方面的创新应用 | 存在高质量生物数据集整理和计算与实验科学家之间跨学科协作的挑战 | 研究人工智能如何推动合成生物学的发展 | 合成生物学中的基因组编辑、代谢途径优化和生物电路设计等 | synthetic biology | NA | deep learning, machine learning | NA | biological datasets | NA |
9 | 2025-06-23 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
|
review | 本文综述了非编码RNA(ncRNA)的结构预测及其在基因表达、细胞信号传导和多种生物过程中的作用 | 强调了ncRNA结构预测的重要性及其在治疗策略开发中的应用,并探讨了计算方法和实验技术的进展 | 在准确建模复杂RNA结构及理解RNA折叠动态性方面仍存在挑战 | 探索ncRNA的结构特征及其功能意义,以促进其在生物医学研究中的应用 | 非编码RNA(包括microRNA、小干扰RNA和长链非编码RNA) | 生物医学研究 | NA | 计算方法和实验技术 | NA | NA | NA |
10 | 2025-06-21 |
Viral vector-based transient expression systems for plant biotechnology research at PUIs
2025, Frontiers in education
IF:1.9Q2
DOI:10.3389/feduc.2025.1598673
PMID:40520985
|
mini-review | 该文探讨了病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用及其优势 | 提出病毒载体瞬时表达系统作为传统稳定遗传转化的高效替代方案,特别适合本科院校的教学与研究 | 未提及该系统的具体技术限制或潜在问题 | 推广病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究和教学中的应用 | 本科院校的植物生物技术研究与教学 | 植物生物技术 | NA | 病毒载体瞬时表达系统(如TMV或Geminivirus) | NA | NA | NA |
11 | 2025-06-21 |
"Open science" meets commercial realities: a qualitative study of factors influencing sharing in synthetic biology research in Australia
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1604509
PMID:40529177
|
研究论文 | 本文研究了合成生物学研究中数据和材料的共享行为,以及知识产权法规和商业化需求对其的影响 | 通过社会法律视角分析合成生物学领域的共享驱动因素和障碍,探讨学术与商业双重需求下的研究者行为模式 | 研究仅基于澳大利亚的案例,可能无法完全反映其他地区的实际情况 | 探讨合成生物学研究中数据/材料共享的影响因素及其与知识产权保护、商业化需求的关系 | 大学和商业环境中的合成生物学家以及商业化专业人士 | 合成生物学 | NA | 定性研究方法 | NA | 访谈数据 | 未明确说明具体样本量(涉及大学/商业机构的研究者及商业化专业人士) |
12 | 2025-06-21 |
Emerging technologies transforming the future of global biosecurity
2025, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2025.1622123
PMID:40534823
|
research paper | 探讨人工智能与合成生物学的融合如何改变全球生物安全 | 综合分析AI在生物安全中的应用及合成生物学在疫苗开发中的创新,同时探讨相关伦理和安全挑战 | 未提及具体技术实施的详细案例或数据支持 | 批判性地评估AI和合成生物学在提升全球生物安全方面的进展与风险 | 全球生物安全、公共健康准备系统 | machine learning | NA | AI、合成生物学 | NA | NA | NA |
13 | 2025-06-19 |
Editorial: Immune responses at barrier tissues: insights from synthetic biology in therapeutics, diagnostics, mechanisms, and beyond
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621688
PMID:40529376
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
14 | 2025-06-18 |
A tunable affinity fusion tag for protein self-assembly
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633037
PMID:39868245
|
research paper | 该研究介绍了一种基于可调淀粉样蛋白的基因编码工具,用于精确控制细胞内蛋白质浓度阈值 | 通过系统筛选二肽重复序列,发现聚苏氨酸丙氨酸(poly-TA)因其在任意选定浓度阈值下形成淀粉样蛋白样组装体的独特能力而被选为理想候选物 | 未提及具体局限性 | 研究蛋白质浓度与活性之间的关系,并开发工具以操纵蛋白质溶解度 | 蛋白质浓度阈值及其对细胞功能的影响 | 合成生物学 | NA | 基因编码工具、系统筛选二肽重复序列 | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-18 |
Multi-strategy ugt mining, modification and glycosyl donor synthesis facilitate the production of triterpenoid saponins
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1586295
PMID:40519597
|
综述 | 本文综述了三萜皂苷糖基化的研究进展,重点介绍了多组学方法在UGT挖掘中的应用以及UGT修饰和糖基供体合成的最新研究 | 结合多组学方法(基因组学、转录组学和代谢组学)进行UGT筛选,提高了UGT鉴定的效率和准确性;应用合成生物学平台进行UGT的高通量筛选和功能验证;讨论了UGT修饰的最新研究进展,包括定向进化和合理设计 | NA | 促进三萜皂苷的生产和应用,提升其工业潜力 | 三萜皂苷及其糖基化过程中的关键酶UGT | 合成生物学 | NA | 多组学方法(基因组学、转录组学、代谢组学)、合成生物学平台 | NA | NA | NA |
16 | 2025-06-18 |
Microbial electrosynthesis meets synthetic biology: Bioproduction from waste feedstocks
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.05.001
PMID:40519649
|
综述 | 本文综述了合成生物学在微生物电合成(MES)中的最新进展,重点介绍了利用废物原料和碳捕获进行电力介导的生物生产 | 结合电化学和生物学,通过合成生物学改进微生物细胞外电子传递和代谢途径效率,优化氧化还原平衡,扩展底物多样性和增强生物生产 | 关键挑战限制了MES的可扩展性,需要未来研究以实现工业规模部署 | 可持续化学生产和脱碳 | 微生物电合成(MES)和合成生物学 | 生物技术 | NA | 微生物电合成(MES) | NA | NA | NA |
17 | 2025-06-16 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
|
研究论文 | 该文章综述了水泡性口炎病毒(VSV)在调节细胞死亡和抗肿瘤免疫中的工程应用 | 文章介绍了通过分子生物学技术,特别是反向遗传学和合成生物学,精确改造VSV基因组,以增强其在癌症治疗中的应用,特别是通过引入促凋亡基因XAF1来提高抗肿瘤效果 | 文章未提及具体的实验数据或临床结果,可能缺乏实际应用效果的验证 | 提高VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水泡性口炎病毒(VSV)及其工程改造 | 分子生物学 | 肿瘤 | 反向遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
18 | 2025-06-16 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
|
研究论文 | 本文描述了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法,并详细探讨了其在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | 利用反向遗传学和合成生物学技术对流感病毒进行基因工程改造,以更有效地控制病毒复制并增强疫苗安全性和宿主免疫反应,同时探索其在肿瘤免疫治疗中的应用 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 研究基因工程改造流感病毒在抗病毒和抗肿瘤免疫中的应用 | H1N1毒株WSN | 合成生物学 | 流感 | 反向遗传学 | NA | NA | NA |
19 | 2025-06-15 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
|
研究论文 | 介绍了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用微生物进行安全信息存储和传输 | 结合DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态性,提供数据加密和存储的创新平台 | NA | 开发一种安全可控的信息存储和传输系统 | 利用合成生物学改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | DNA编码信息 | NA |
20 | 2025-06-15 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
|
综述 | 本文全面综述了类黄酮生物合成的代谢工程策略及其应用前景 | 整合植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和AI驱动的代谢工程,提出可持续高产类黄酮的新路线图 | 未提及具体实验验证数据或案例研究 | 探索提高类黄酮产量的综合代谢工程策略 | 植物类黄酮生物合成途径及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、AI驱动的代谢工程 | NA | 代谢组学数据 | NA |