合成生物学相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-02-23 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究探索了在微藻细胞壁上锚定和释放重组蛋白质的方法，为合成生物学、工业生物技术和药物递送领域提供了创新工具 | 通过使用GP1糖蛋白的截短变体与塑料降解酶PHL7融合，确定了PPSPX基序在蛋白质锚定中的关键作用，并开发了一种基于pH敏感的内含肽的受控释放系统 | 研究主要基于微藻细胞，未在其他生物系统中验证其通用性 | 优化蛋白质在细胞壁上的定位和释放，以应用于药物递送、生物催化和环境监测 | 微藻细胞壁上的重组蛋白质 | 合成生物学 | NA | 蛋白质融合技术、pH敏感内含肽技术 | NA | 蛋白质数据、荧光数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多个构建体和实验条件 |
| 22 | 2025-02-23 |
On Emergence of Spontaneous Oscillations in Kombucha and Proteinoids
2025, BioNanoScience
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s12668-024-01678-5
PMID:39980746
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研究论文 | 本研究探讨了康普茶和类蛋白体中的自发振荡现象，及其与生命起源的潜在联系 | 通过研究康普茶和类蛋白体中的自发振荡，揭示了从混沌到有序转变的基本原理，为合成生物学和生物技术中的自组织网络提供了新思路 | 研究主要基于理论分析和实验证据，尚未涉及具体的应用场景或大规模实验验证 | 探讨自发振荡在生命起源中的作用，并揭示从非生命物质到生命物质的转变机制 | 康普茶和类蛋白体 | 生物化学 | NA | NA | NA | 实验数据 | NA |
| 23 | 2025-02-22 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法，通过使用修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端 | DAPE方法能够在DNA片段的两端生成精确长度的3'突出端，克服了传统SLIC技术在克隆小于50bp的DNA片段时的局限性 | NA | 开发一种更高效的DNA克隆和合成生物学工具 | DNA片段 | 合成生物学 | NA | PCR, DNA克隆 | NA | DNA序列 | NA |
| 24 | 2025-02-21 |
Applied photosynthesis: An idea whose time has come
2025-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics
DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525
PMID:39571881
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研究论文 | 本文介绍了生物混合能源系统的最新研究，利用光合作用机制开发环保、高效的太阳能技术替代方案 | 通过合成生物学和纳米材料工程的结合，优化了蛋白质功能和设备稳定性，探索了独特的光活性色素 | NA | 开发可持续能源技术，利用光合作用机制提高能源转换效率 | 生物混合设备，包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物 | 可再生能源技术 | NA | 合成生物学、纳米材料工程 | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-02-16 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路，用于基因调控 | 通过将RNA核糖开关和TetR适配体整合到必需基因外显子中，意外获得了具有完全相反调控功能的'开-关'开关CTM和C2ITetR>4A，并创建了内含子剪接的双开关RNA级联系统 | NA | 开发一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路，用于基因调控 | 肿瘤细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | RNA剪接调控 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26 | 2025-02-16 |
Colored Proteins Act as Biocolorants in Escherichia coli
2025-Jan-21, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30030432
PMID:39942539
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研究论文 | 本文探讨了彩色蛋白质在大肠杆菌中作为生物着色剂的应用，特别是GfasPurple在不同条件下的稳定性 | 研究发现GfasPurple在高温、乙醇、酸碱等恶劣条件下具有优异的耐受性，并通过突变扩展了色蛋白的颜色库 | 研究主要集中在大肠杆菌中，未涉及其他生物体或更广泛的应用场景 | 研究彩色蛋白质作为生物着色剂的潜力及其在不同条件下的稳定性 | 大肠杆菌及多种彩色蛋白质（如eGFP、sfGFP、mKate2、GfasPurple等） | 合成生物学 | NA | 突变技术、吸收光谱分析 | NA | 实验数据、光谱数据 | 多种彩色蛋白质及其突变体 |
| 27 | 2025-02-16 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文提出了一种主动学习方法，用于训练能够区分增强子和沉默子的模型，这些增强子和沉默子由光感受器转录因子CRX的结合位点组成 | 通过结合合成生物学和不确定性采样，生成多轮大规模并行报告实验数据，迭代训练模型，使其能够区分具有相同序列但功能相反的CRX位点 | 模型训练依赖于CRX结合位点的基因组数据，可能无法推广到其他转录因子或不同的细胞环境 | 开发一种能够区分增强子和沉默子的模型，以解释转录因子在不同环境下的激活或抑制功能 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 主动学习、合成生物学、大规模并行报告实验 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | 几乎所有的CRX结合位点 |
| 28 | 2025-02-16 |
Enhancing active ingredient biosynthesis in Chinese herbal medicine: biotechnological strategies and molecular mechanisms
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18914
PMID:39950047
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综述 | 本文探讨了现代生物技术在中草药活性成分生物合成增强中的潜力，包括其化学组成、生物合成途径、分子调控机制以及提取和合成生产策略 | 整合了生物合成、分子调控、提取方法和合成生物学的见解，提出了增强中草药活性成分生产的理论和实践指导 | 未提及具体实验数据或案例研究，主要基于现有文献和理论分析 | 增强中草药活性成分的生物合成，促进其在现代医学中的广泛应用 | 中草药的活性成分 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-02-16 |
Synthetic biology in Mexico: Brief history, current landscape, and perspectives towards a bio-based economy
2025 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12037
PMID:39950160
|
综述 | 本文综述了合成生物学在墨西哥的发展历史、现状及向生物经济转型的展望 | 强调了iGEM竞赛在推动墨西哥合成生物学发展中的重要作用，并概述了当前的教育、公民科学倡议以及研究和工业景观 | 未具体提及研究方法的局限性 | 探讨合成生物学在墨西哥的发展及其对生物经济的潜在贡献 | 墨西哥的合成生物学发展 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2025-02-14 |
Challenges and limitations in using bacterial metabolites as immunomodulators
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1535394
PMID:39944722
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review | 本文探讨了利用细菌代谢物作为免疫调节剂在治疗免疫相关疾病中的潜力和挑战 | 强调了细菌代谢物在免疫调节中的潜力，并探讨了其在发现、生产、表征、稳定性、配方、安全性和个体差异方面的挑战 | 许多代谢物的生物利用度有限，存在脱靶效应的可能性，且需要精确靶向 | 探讨细菌代谢物作为免疫调节剂的临床转化潜力 | 细菌代谢物及其在免疫调节中的应用 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-02-14 |
Challenges in observing transcription-translation for bottom-up synthetic biology
2025, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2024.27
PMID:39944880
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review | 本文详细讨论了如何使用PURE系统和细胞裂解液在体外重建转录-翻译过程，并探讨了将这些系统封装在GUVs中的现有方法 | 本文创新性地评估了使用多种荧光显微镜技术和探针来成像转录和翻译的方法，并提出了解决PURE系统中两个系统解耦挑战的方案 | 本文主要讨论了体外系统的挑战，未涉及体内系统的复杂性和实际应用中的限制 | 本文的研究目标是探讨如何重建和观察转录-翻译系统，以实现合成生物学的目标 | 本文的研究对象是转录和翻译系统，特别是PURE系统和细胞裂解液 | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜技术 | NA | 图像 | NA |
| 32 | 2025-02-13 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以实现对活细胞中细胞器功能的动态控制 | 利用光遗传学技术动态调控细胞器功能，为细胞工程和合成生物学提供了创新范例 | 当前实验策略在调节细胞器功能方面存在局限性，主要由于细胞器在活细胞中的动态性和亚细胞分布 | 研究目的是通过光遗传学技术动态调控细胞器功能，以探索细胞工程和合成生物学的新方法 | 研究对象为活细胞中的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-02-12 |
Recent Advances in Biocatalytic and Chemoenzymatic Synthesis of Oligonucleotides
2025-Jan-24, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400987
PMID:39854143
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综述 | 本文综述了生物催化和化学酶法合成寡核苷酸的最新进展，强调了酶工程、底物和反应条件优化方面的创新 | 介绍了生物催化和化学酶法作为传统固相合成和聚合酶方法的替代方案，提供了更高的选择性和效率 | 尽管生物催化和化学酶法具有优势，但仍存在一些局限性，如反应条件的优化和酶工程的技术挑战 | 探讨生物催化和化学酶法在寡核苷酸合成中的应用，以克服传统方法的局限性 | 寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | 生物催化、化学酶法 | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-02-12 |
[Function of flavoprotein monooxygenases in natural product biosynthesis]
2025-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文全面回顾了黄素蛋白单加氧酶（FPMOs）在天然产物生物合成中的最新研究进展 | 系统分析了FPMOs的分类、催化反应和催化机制，特别是植物中Class B FPMOs的三个亚家族（FMO、BVMO和NMO）的催化特性 | NA | 探讨FPMOs在天然产物生物合成中的作用及其应用潜力 | 黄素蛋白单加氧酶（FPMOs） | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2025-02-08 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 本文介绍了一种在凝胶颗粒格式中测量XNA聚合酶保真度的新方法 | 开发了一种无需纯化的方法，通过在凝胶包覆的磁性颗粒基质中进行XNA转录和逆转录步骤，显著减少了测量XNA聚合酶保真度所需的时间和反应规模 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种更高效的方法来测量能够合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶的保真度 | XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 凝胶包覆的磁性颗粒基质中的XNA转录和逆转录 | NA | NA | NA |
| 36 | 2025-02-08 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“foldtuning”的新方法，利用蛋白质语言模型（pLMs）探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域 | 通过foldtuning方法，利用pLMs生成和自反馈能力，探索与自然序列无同源性的蛋白质“深空”区域，并构建了一个包含700多种自然折叠的foldtuned pLMs库 | 尽管foldtuning方法展示了在蛋白质序列设计中的潜力，但其生成的蛋白质变体的功能和稳定性仍需进一步实验验证 | 探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域，推动合成生物学系统的重新设计和重构 | 蛋白质序列和结构 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质语言模型（pLMs） | pLMs | 蛋白质序列和结构数据 | 超过700种自然折叠的蛋白质 |
| 37 | 2025-02-08 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
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综述 | 本文回顾并总结了非编码RNA（ncRNA）在细胞命运决定中的数学模型框架及其在真实生物过程中的应用 | 探讨了ncRNA与转录因子之间的正反馈环以及miRNA-mRNA相互调控的新兴特性，这些特性使得双稳态开关能够指导细胞命运决定 | ncRNA介导的双稳态开关的分子机制仍然不明确且存在争议 | 阐明ncRNA介导的细胞命运决定过程的分子机制 | 非编码RNA（ncRNA）、mRNA、miRNA和竞争性内源mRNA（ceRNA） | 系统生物学与合成生物学 | NA | 数学模型与定量实验分析 | NA | NA | NA |
| 38 | 2025-02-08 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
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综述 | 本文探讨了微生物组工程在提高食品安全和质量方面的作用，并评估了相关的最新技术和社会伦理问题 | 本文综合评估了合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术在微生物组工程中的应用，并强调了跨学科合作的重要性 | 需要进一步研究以解决复杂食品系统中微生物动态的理解和统一监管框架的制定等关键挑战 | 探讨微生物组工程在提高食品安全和质量方面的潜力 | 微生物组及其在食品系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-02-06 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
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研究论文 | 本文通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动态及其转运机制 | 通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 尽管进行了广泛的生化表征和晶体结构解析，但对碳酸氢盐转运机制的动态理解仍然不足 | 研究蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，以增强光合作用产量 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA | 分子动力学模拟 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | 超过1毫秒的模拟数据 |
| 40 | 2025-02-06 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
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研究论文 | 本研究设计并展示了一种跨物种诱导系统的开发工作流程，用于增强蛋白质表达和多路代谢途径的精细调控 | 开发了一种跨物种诱导系统，适用于多种模型微生物，并成功应用于蛋白质表达和基因表达的同步激活与抑制 | NA | 开发一种跨物种诱导系统，用于增强蛋白质表达和多路代谢途径的精细调控 | 三种模型微生物（大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种模型微生物 |