合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-06-14	Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3 2025-01-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86194-6 PMID:39848978	研究论文	该研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白，并利用SMA共聚物进行重构	首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白，并实现高产量重构	尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构	解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白表达困难的问题	FGFR3-TACC3融合蛋白	合成生物学	癌症	无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构	NA	蛋白功能数据	NA
22	2025-06-14	Optimal network sizes for most robust Turing patterns 2025-01-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86854-7 PMID:39849094	research paper	该研究通过随机矩阵理论分析较大网络的Jacobian矩阵，探讨了图灵模式在生物系统中的形成机制及其最优网络大小	揭示了图灵模式比以往认为的更可能偶然发生，并发现最稳健的图灵网络具有一个最优大小，仅由少数分子物种组成，从而显著提高了其在生物系统中的可识别性	研究主要基于理论分析，需要进一步的实验验证以确认在真实生物系统中的适用性	探讨图灵模式在复杂生物基因调控网络中的形成机制及其稳健性	基因调控网络及其Jacobian矩阵	systems biology	NA	random matrix theory	NA	theoretical analysis	NA
23	2025-06-14	Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective 2025, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857 PMID:40496019	综述	本文综述了人工智能在优化噬菌体疗法中的最新进展及其潜在应用	探讨了AI如何促进噬菌体-宿主相互作用的研究，以设计更有效的噬菌体治疗剂	未提及具体的AI模型或技术在实际应用中的效果验证	探索人工智能在优化噬菌体疗法中的应用	噬菌体与细菌的相互作用	人工智能	抗菌耐药性	NA	NA	NA	NA
24	2025-06-06	Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1587215 PMID:40458805	综述	本文全面综述了植物次生代谢产物萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢紊乱中的药理活性	详细阐述了萜类化合物的多样性和广泛生物活性，以及其在现代医学、制药、营养品和化妆品等领域的高价值应用	对特定生物活性物质的作用或作用模式理解不全面，且许多化合物在自然界中含量极低	阐明萜类化合物在代谢紊乱中的生物化学特性、植物化学性质和药理活性	萜类化合物	NA	代谢紊乱	代谢工程和合成生物学	NA	NA	NA
25	2025-06-06	Application of bifidobacterium in tumor therapy 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1551924 PMID:40469191	review	本文综述了双歧杆菌在肿瘤成像和治疗中的最新进展，探讨了其作用机制、工程策略和临床应用	利用双歧杆菌的厌氧特性选择性定植于肿瘤缺氧微环境，并通过合成生物学和细菌工程改造为微型机器人，用于分子成像和药物/基因递送	双歧杆菌的临床转化仍面临功能设计优化、治疗效果和安全性提升等挑战	探索双歧杆菌作为肿瘤靶向治疗载体的潜力	双歧杆菌(Bifidobacterium, BBM)	肿瘤治疗	肿瘤	合成生物学、细菌工程	NA	NA	NA
26	2025-05-31	Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review 2025, International journal of nanomedicine IF:6.6Q1 DOI:10.2147/IJN.S507322 PMID:40433121	综述	本文综述了超声波控制在声遗传学和基于气体囊泡技术中的先进策略及其应用	探讨了基于合成生物学的超声波控制系统，特别是声遗传学和气体囊泡技术，克服了传统纳米材料的功能复杂性和毒性问题	当前面临的挑战包括超声波效应的精确控制以及技术的进一步优化和验证	研究超声波控制在医学诊断和治疗中的应用，特别是在声遗传学和气体囊泡技术中的激活策略	超声波控制系统、声遗传学、气体囊泡技术	生物医学工程	癌症、神经系统疾病、视觉障碍	超声波控制、合成生物学	NA	NA	NA
27	2025-05-29	BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis 2025-01-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00347 PMID:39423319	research paper	介绍BioTRY，一个包含生物合成滴度、速率和产量(TRY)数据的综合知识库	BioTRY是首个可用的生物合成TRY原始研究数据库，包含超过52,000条TRY条目	未明确提及具体局限性	评估发酵过程的经济可行性，为研究人员和决策者提供生物合成发展现状的参考	生物合成过程中的滴度、速率和产量(TRY)数据	合成生物学	NA	NA	NA	生物合成TRY数据	>5,000种生化物质和>3,800种菌株，包含52,000条TRY条目
28	2025-05-29	CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration 2025-01-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00632 PMID:39680738	综述	本文综述了过去五年中用于整合大片段DNA的方法，特别关注新兴的CRISPR相关技术	重点讨论了同源定向修复（HDR）及新兴的CRISPR转座酶和CRISPR重组酶策略，这些技术有望革新复杂疾病的基因治疗	现有技术在整合大片段基因时面临效率低下、脱靶效应和高成本等问题	开发高效工具，以精确插入千碱基大小的DNA片段到哺乳动物基因组中，支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用	大片段DNA的整合技术	基因编辑	遗传病	CRISPR/Cas, HDR, CRISPR-transposase, CRISPR-recombinase	NA	NA	NA
29	2025-05-29	Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors 2025-01-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00689 PMID:39709556	综述	本文回顾了转录因子生物传感器的发展历程，分析了从基础研究到工程策略的关键里程碑，并探讨了未来的前景和挑战	全面梳理了转录因子生物传感器从基础研究到工程应用的发展历程，并提出了未来研究方向	未深入探讨具体技术细节和实施难点	回顾转录因子生物传感器的发展历程，分析关键里程碑，并探讨未来前景	转录因子生物传感器	合成生物学	NA	高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程	NA	NA	NA
30	2025-05-29	Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation 2025-01-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00551 PMID:39754601	research paper	该研究通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境，探索了遗传开关的设计空间，并展示了如何通过这两种方式的结合来精细调节开关的性能	首次将宿主环境作为遗传电路设计的重要变量进行系统探索，并展示了其与核糖体结合位点调制相结合在性能调节上的潜力	仅测试了9种核糖体结合位点组合和3种宿主环境，样本量相对有限	探索遗传开关设计中宿主环境和核糖体结合位点调制对性能的影响	遗传开关（toggle switch）	合成生物学	NA	遗传电路设计	NA	生物性能指标数据	27种电路变体（9种核糖体结合位点×3种宿主环境）
31	2025-05-29	ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System 2025-01-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00697 PMID:39754602	研究论文	本研究通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统，扩展了PURE系统的功能	提出了一种新的ATP再生途径，能够独立或与现有肌酸系统结合使用，显著提高蛋白质合成效率	需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液（约10 mM）	工程化改造PURE系统以提高其蛋白质合成能力	PURE系统及其ATP再生机制	合成生物学	NA	细胞游离蛋白质合成系统	NA	生化实验数据	多批次自制PURE系统及商业PURExpress系统
32	2025-05-29	Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System 2025-01-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00618 PMID:39757539	研究论文	本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统，用于延长无细胞系统中的蛋白质合成时间和提高产量	利用商业可用组件构建的中尺度透析系统，实现了PURE无细胞系统中蛋白质合成的长期稳定性和高产量	未提及系统在大规模生产中的应用效果	解决无细胞系统（特别是PURE系统）反应寿命短和产量低的问题	PURE无细胞系统和GFP蛋白质合成	合成生物学	NA	透析技术	NA	实验数据	未明确说明样本数量
33	2025-05-24	Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants 2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.adp0779 PMID:39818909	research paper	该研究探讨了种子植物中跨生物体独脚金内酯（SLs）的生物合成进化	揭示了CYP722A在非经典SLs生物合成中的关键作用，并提出了16-OH-CLA作为经典SLs进化中的代谢中间体	未涉及所有种子植物种类，可能无法全面代表SLs的进化路径	研究独脚金内酯的生物合成进化及其功能分化	种子植物中的独脚金内酯及其生物合成酶	植物分子生物学	NA	合成生物学	NA	生化数据	多种开花植物的地上部分
34	2025-05-23	Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry 2025, Synthetic biology (Oxford, England) DOI:10.1093/synbio/ysaf006 PMID:40396182	研究论文	本文提出了一种利用合成生物学原理精确控制细菌中肝素糖生物合成的新方法，旨在生产低分子量和低分散指数的肝素糖	设计了一种生物分子控制器，通过生物传感器检测肝素糖前体，精确调控肝素糖生物合成过程	NA	开发一种能够精确控制肝素糖生物合成的方法，以生产具有特定性能的肝素糖材料	肝素糖的生物合成过程	合成生物学	NA	合成生物学设计原理	NA	NA	NA
35	2025-05-21	Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina 2025-Jan-15, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004 PMID:39778579	research paper	该研究开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型	采用主动学习策略，结合合成生物学和不确定性采样，生成多轮信息性训练数据，以训练能够区分功能相反的相同序列CRX位点的模型	模型主要针对CRX结合位点，可能不适用于其他转录因子的调控元件	开发能够区分增强子和沉默子的深度学习模型，以更好地理解转录因子在不同上下文中的激活或抑制功能	光感受器转录因子CRX的结合位点	machine learning	NA	active learning, massively parallel reporter assays	deep learning	genomic sequences	几乎所有基因组中结合的CRX位点
36	2025-05-21	Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications 2025, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187 PMID:40384783	review	本文综述了非传统酵母在合成生物学应用中的最新进展，重点关注新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程的发展	利用合成生物学技术开发新的遗传构建块、基因组编辑工具和代谢途径工程，以充分挖掘非传统酵母的生物技术潜力	非传统酵母的潜力尚未被充分探索，存在技术挑战和应用限制	探讨非传统酵母在生物技术中的应用潜力及其在可持续生物制造中的角色	非传统酵母	合成生物学	NA	基因组编辑、代谢途径工程	NA	NA	NA
37	2025-05-16	Applied photosynthesis: An idea whose time has come 2025-01-01, Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics DOI:10.1016/j.bbabio.2024.149525 PMID:39571881	研究论文	本文介绍了生物混合能源系统在可持续能源生产中的前沿研究，特别是利用光合作用机制开发环保高效太阳能技术	结合合成生物学与纳米材料工程，优化生物混合设备的光吸收、能量转换和稳定性，探索独特的光活性色素	NA	开发可持续能源技术，替代传统太阳能技术	生物混合设备，包括蓝藻、藻类、紫色细菌和古菌等光合生物	可再生能源技术	NA	合成生物学、纳米材料工程	NA	NA	NA
38	2025-05-15	Cell-based immunotherapies for solid tumors: advances, challenges, and future directions 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1551583 PMID:40356763	review	本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来方向	讨论了CAR-T、CAR-NK和TCR-T等细胞疗法在实体瘤治疗中的创新应用及面临的独特挑战	面临抗原异质性、免疫抑制性肿瘤微环境、细胞浸润受限、脱靶毒性及生产可扩展性等挑战	探讨基于细胞的免疫疗法在实体瘤治疗中的潜力与限制	CAR-T、CAR-NK、TCR-T、TIL、NK和CIK细胞疗法	免疫疗法	实体瘤	基因编辑、多抗原靶向、合成生物学	NA	NA	NA
39	2025-05-15	A versatile genetic toolkit for engineering Wickerhamomyces ciferrii for tetraacetyl phytosphingosine production 2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2025.1586218 PMID:40357330	research paper	该研究开发了一个模块化遗传系统，用于工程化Wickerhamomyces ciferrii以提高四乙酰基植物鞘氨醇（TAPS）的产量	开发了一个包含多种可选择标记、复制起点和荧光报告基因的模块化遗传工具包，并首次在Wickerhamomyces ciferrii中实现了乙酰辅酶A羧化酶突变体的过表达，显著提高了TAPS产量	研究中测试的某些抗生素抗性标记（如潮霉素B）和复制起点（如panARS）在Wickerhamomyces ciferrii中无效	为Wickerhamomyces ciferrii开发一套全面的遗传工具包，以促进其工业应用	Wickerhamomyces ciferrii酵母	合成生物学与代谢工程	NA	基因工程、荧光蛋白表达分析、启动子表征	NA	基因表达数据	测试了四种抗生素抗性标记、三种复制起点和六种荧光蛋白
40	2025-05-11	Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0319337 PMID:40014593	研究论文	本文通过调查13个欧洲国家的公众态度，探讨了合成细胞技术在抗癌治疗、二氧化碳转化为生物燃料和工业废物回收等潜在应用中的公众支持度	首次在13个欧洲国家进行大规模调查，探讨公众对合成细胞技术的态度，并使用数据驱动技术构建决策树模型分析影响因素	研究仅覆盖欧洲国家，可能无法代表全球其他地区的公众态度	探索公众对合成细胞潜在应用的态度和支持程度	来自13个欧洲国家的8,382名具有全国代表性的受访者	合成生物学	癌症	NA	决策树模型	调查数据	8,382名来自13个欧洲国家的受访者