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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2024-10-05 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的Nanopore扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了使用Nanopore测序平台进行高度多重化的双条码扩增子测序,以验证Golden Gate组装 | NA | 验证Golden Gate组装的正确性 | Golden Gate组装 | 合成生物学 | NA | Nanopore测序 | NA | 序列数据 | 单个菌落 |
22 | 2024-10-05 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了一种使用AssemblyTron自动化Golden Gate克隆的方法 | AssemblyTron是一个开源的Python包,利用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人提供了一种经济实惠的自动化解决方案 | NA | 提高Golden Gate克隆的自动化程度,减少错误率和资源消耗 | Golden Gate克隆技术及其自动化实现 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
23 | 2024-10-05 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装技术快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法,并提供了一个名为G-GArden的工具来辅助设计寡脱氧核苷酸和无痕组装策略 | 提出了基于Golden Gate组装技术的合成小RNA表达质粒构建方法,并开发了G-GArden工具来辅助设计 | NA | 开发一种快速高效的合成小RNA表达质粒构建方法,并提供设计工具 | 大肠杆菌中的合成小RNA表达质粒 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装技术 | NA | NA | NA |
24 | 2024-10-05 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 描述了一种利用Golden Gate技术快速生成线性DNA模板用于细胞外原型设计的方法 | 提出了一种无需克隆的Golden Gate辅助工作流程,用于快速生成用于TXTL反应的线性DNA模板 | 未提及 | 加速合成生物学中新功能的设计-构建-测试-学习循环 | 线性DNA模板、启动子、核糖体结合位点(RBS)、编码序列和终止子 | 合成生物学 | NA | Golden Gate技术、PCR扩增 | NA | DNA | 未提及具体数量 |
25 | 2024-10-05 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中使用Golden Gate克隆进行模块化克隆的标准化基因元件组装 | 本文介绍了在Chlamydomonas reinhardtii中使用Golden Gate克隆进行模块化克隆的标准化基因元件组装方法 | NA | 开发快速高效的克隆策略,用于组装新的转录单元或整个途径 | Chlamydomonas reinhardtii中的基因元件组装 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
26 | 2024-09-25 |
Toward Increasing the Credibility of RNA Design
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_9
PMID:39312141
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的RNA设计协议,包括序列评估和使用3D结构进行分析,以提高RNA设计的准确性 | 本文的创新点在于引入3D结构预测和分析步骤,以提高RNA设计的准确性 | NA | 提高RNA设计的可信度和准确性 | RNA序列及其二级和三级结构 | 生物信息学 | NA | RNA设计算法 | NA | RNA序列 | NA |
27 | 2024-09-24 |
A Computational Approach for Designing Synthetic Riboswitches for Next-Generation RNA Therapeutics
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_13
PMID:39312145
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计下一代RNA治疗药物的合成核开关的计算方法 | 本文提出了利用计算技术设计合成核开关,以实现精确的基因工程控制和靶向药物递送 | NA | 探索计算技术在设计合成核开关中的应用,以推动RNA治疗药物的发展 | 合成核开关的设计及其在RNA治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | 计算技术 | NA | NA | NA |
28 | 2024-09-24 |
SHAPE Probing to Screen Computationally Designed RNA
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_12
PMID:39312144
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研究论文 | 本文提出了一种实验和分析工作流程,用于快速筛选大量设计的RNA序列 | 开发了shapemap tools软件套件,用于定制化分析SHAPE-MaP技术产生的大量RNA结构数据 | NA | 开发高效的RNA设计流程,支持合成生物学和基于RNA疗法的未来发展 | 设计的RNA序列及其结构特性 | 合成生物学 | NA | SHAPE-MaP | NA | RNA序列 | 数千个RNA序列 |
29 | 2024-09-11 |
Systematic metabolic engineering enables highly efficient production of vitamin A in Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.004
PMID:39247801
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研究论文 | 本文通过系统代谢工程在酿酒酵母中高效生产维生素A | 首次通过挖掘不同来源的β-胡萝卜素15,15'-单(双)加氧酶,并结合表达两种具有不同催化机制但催化性能相当的同工酶,显著提高了维生素A的产量 | NA | 研究在酿酒酵母中高效生产维生素A的方法 | 维生素A的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
30 | 2024-09-05 |
Engineering artificial cross-species promoters with different transcriptional strengths
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.003
PMID:39224149
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research paper | 本研究通过分析和验证自然内源启动子的基本结构,并通过策略性整合和合理修改启动子基序,开发了一系列在五种菌株(原核和真核)中具有转录活性的跨物种启动子 | 本研究提出了一种新的策略,即组合使用原核和真核启动子的关键元素,为未来的启动子工程提供了新的见解和方法 | NA | 扩大合成生物学启动子工具包的通用性,确保在各种微生物底盘细胞中的适应性和定制化 | 跨物种启动子的开发和验证 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | 五种菌株(原核和真核) |