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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-05-04 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7内切酶Ⅰ介导的纠错方法,用于高效组装约10 kb的病毒基因组 | 通过合理设计寡核苷酸序列、两步PCR和高保真聚合酶合成3.0 kb DNA片段,并利用T7内切酶Ⅰ进行纠错,显著降低了错误率并简化了合成步骤 | NA | 优化基因合成过程,降低错误率并简化病毒基因组的合成与组装步骤 | 约10 kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | T7内切酶Ⅰ介导的纠错、两步PCR、高保真聚合酶 | NA | DNA序列 | 约10 kb的病毒基因组 |
62 | 2025-05-04 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了非天然微生物在聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)生产中的工程化进展 | 总结了代谢工程和合成生物学在非天然微生物中生产PHB的最新策略,包括CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物更适合大规模PHB生产 | 探讨非天然微生物作为PHB生产宿主的潜力和优化策略 | 非天然微生物,特别是大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
63 | 2025-05-04 |
BAC-browser: the tool for synthetic biology
2025-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06049-9
PMID:39849360
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研究论文 | 介绍了一个名为BAC-browser v.2.1的图形界面程序,用于合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 开发了一个集成了多种工具的图形界面程序,使非生物信息学背景的研究者也能进行合成基因组学的任务 | 未提及程序的性能评估或与其他工具的对比 | 为合成基因组学领域提供易用的软件工具 | 合成基因组学中的序列设计和DNA组装 | 合成生物学 | NA | DNA序列设计和组装 | NA | 核苷酸序列 | NA |
64 | 2025-05-04 |
Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges
2025-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02643-x
PMID:39844200
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综述 | 本文综述了在生物制造中利用Cupriavidus necator的生理学进展与挑战 | 讨论了C. necator作为生物制造底盘的最新进展,特别是在利用二氧化碳和氢气或甲酸盐作为碳和能源来源方面的应用 | 现有工具和应用常因未充分考虑C. necator独特的生理和代谢特征而受限 | 探讨如何更好地理解和利用C. necator的生理机制以优化其在生物制造中的应用 | Cupriavidus necator细菌及其在生物制造中的应用 | 生物制造 | NA | 合成生物学工具和建模 | NA | NA | NA |
65 | 2025-05-04 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
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研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii细胞工厂可持续生产(+)-valencene的方法 | 首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-valencene合成酶,并通过多种优化策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵生产测试 | 开发可持续生产(+)-valencene的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii微生物细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
66 | 2025-05-04 |
Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1526578
PMID:40313723
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综述 | 本文综述了叶绿体工程和转化方法的最新趋势和进展 | 讨论了合成生物学在叶绿体工程中的应用以及现代转化载体的构建要素 | 该技术目前主要局限于学术实验室的模式物种,尚未商业化 | 提高作物产量、营养品质、抗逆性以及工业酶和治疗蛋白的生产 | 叶绿体基因组和转基因植物 | 合成生物学 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | NA |
67 | 2025-05-04 |
Enhancing the physiological characteristics of chimeric antigen receptor natural killer cells by synthetic biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592121
PMID:40313937
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review | 探讨合成生物学在增强嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK)生理特性方面的最新进展 | 通过合成生物学工具包与NK细胞的协同作用,为开发下一代CAR-NK疗法提供路线图 | 临床转化仍受限于在免疫抑制性肿瘤微环境中的持久性和功能耗竭问题 | 提升CAR-NK细胞的生理特性以应对实体瘤挑战 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞(CAR-NK) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工具包 | NA | NA | NA |
68 | 2025-05-03 |
Rational Design of Dual-Targeted Nanomedicines for Enhanced Vascular Permeability in Low-Permeability Tumors
2025-01-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c12808
PMID:39797815
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,设计双靶向纳米药物以增强低渗透性肿瘤中的血管通透性 | 利用基因工程逻辑门控策略,构建了具有可调比例RGD靶向和固有TfR1靶向配体的双靶向铁蛋白纳米笼(Dt-FTn),并通过机器学习单血管分析揭示了双受体表达谱在低渗透性肿瘤中的关键作用 | 研究仅针对低渗透性肿瘤,未涉及其他类型肿瘤的验证 | 提高双靶向纳米药物在低渗透性肿瘤中的递送效率 | 双靶向铁蛋白纳米笼(Dt-FTn)及其在低渗透性肿瘤中的血管通透性 | 纳米医学 | 结肠癌 | 合成生物学、基因工程、机器学习 | 逻辑门控策略 | 实验数据、单血管分析数据 | 患者来源的结肠癌模型 |
69 | 2025-05-03 |
S-layers: from a serendipitous discovery to a toolkit for nanobiotechnology
2025-Jan-17, Quarterly reviews of biophysics
IF:7.2Q1
DOI:10.1017/S0033583524000106
PMID:39819733
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综述 | 本文回顾了S层(表面层)研究的早期科学探索,特别关注了'维也纳S层研究组'的贡献,并探讨了S层在生物技术和纳米技术中的应用潜力 | 详细介绍了S层作为最简单的生物膜在进化中的发展及其多功能性,以及在生物技术、纳米技术等领域的应用潜力 | 文章主要基于历史回顾和个人观点,可能缺乏最新的实验数据和应用案例 | 探讨S层的结构、功能及其在生物技术和纳米技术中的应用 | 原核微生物的S层结构 | 纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
70 | 2025-05-03 |
Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400712
PMID:39834096
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research paper | 本文主要关注在酿酒酵母中异源表达萜类化合物的研究 | 利用合成生物学和代谢工程技术构建高效的微生物细胞工厂,用于大规模生产萜类化合物 | 当前挑战包括如何进一步优化酵母底盘以提高萜类化合物的生产效率 | 研究萜类化合物的异源生物合成方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
71 | 2025-05-03 |
SynNotch CAR-T cell, when synthetic biology and immunology meet again
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1545270
PMID:40308611
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综述 | 本文探讨了合成Notch(synNotch)受体与CAR-T细胞疗法的革命性结合,旨在克服传统方法在实体瘤治疗中的固有局限性 | 引入synNotch受体作为分子逻辑门,实现T细胞活化的精确、多抗原调控,提高特异性和控制性 | 虽然synNotch CAR-T细胞在实体瘤治疗中展现出潜力,但其临床应用仍面临免疫逃避、肿瘤异质性和脱靶效应等挑战 | 探索synNotch系统与CAR-T细胞疗法的整合,以提升靶向癌症治疗的效果和安全性 | CAR-T细胞和synNotch受体 | 合成生物学与免疫学 | 实体瘤 | synNotch受体设计 | NA | NA | NA |
72 | 2025-05-02 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-Jan-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本文研究了利用量子隧道传输和机器学习技术对八种人工合成DNA碱基进行电学识别 | 结合量子隧道纳米间隙结和机器学习技术,实现了对人工合成DNA碱基的高精度电学识别,预测准确率高达100% | 研究仅针对八种特定的人工合成DNA碱基,未涉及更复杂的DNA序列或自然DNA | 开发一种高灵敏度、高精度的电学识别方法,用于人工合成DNA碱基的快速准确识别 | 八种人工合成的DNA碱基 | 机器学习 | NA | 量子隧道传输 | 机器学习模型 | 电传输信号 | 八种人工合成DNA碱基的数据集 |
73 | 2025-05-02 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 本文综述了遗传工程技术在提高曲霉属真菌有机酸产量方面的最新进展和未来方向 | 重点介绍了CRISPR生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用和挑战 | 未提及具体实验数据或样本量 | 提高曲霉属真菌在工业有机酸生产中的效率 | 曲霉属真菌 | 合成生物学 | NA | 遗传工程技术、CRISPR | NA | NA | NA |
74 | 2025-05-02 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
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研究论文 | 本研究设计并展示了一个跨物种诱导系统的稳健工作流程,用于增强蛋白质表达和多路代谢途径的精细调控 | 开发了两种重建的诱导系统(PphlF3R1和Ptet2R2*),并在三种模型微生物中验证其功能,进一步用于开发单输入遗传电路 | NA | 开发跨物种诱导系统,用于蛋白质表达和代谢途径控制 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种模型微生物 |
75 | 2025-05-02 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的研究现状 | 利用合成生物学技术改造细菌,使其能够作为微生物联合体提高诊断准确性和治疗效果 | 细菌的长期存活和安全性、非模型菌株的底盘微生物和基因编辑技术开发、潜在毒性最小化以及与宿主微生物群的相互作用理解仍存在挑战 | 研究工程化细菌在疾病诊断和治疗中的应用 | 工程化细菌和微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症、肠道疾病、代谢紊乱 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
76 | 2025-05-02 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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review | 该综述探讨了从极端微生物的宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶(GHs)及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从环境DNA中识别新型GH编码基因,避免实验室培养极端微生物的需求 | 极端微生物来源基因在常温宿主中的表达、活性产量低以及规模化生产仍面临挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的资源,以促进绿色工业应用 | 极端微生物及其产生的糖苷水解酶 | 合成生物学与蛋白质工程 | NA | 高通量测序与生物信息学分析 | 机器学习(用于预测功能注释) | 环境DNA序列数据 | NA |
77 | 2025-05-02 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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review | 本文综述了利用植物合成生物学优化黄酮类化合物生产所需的分子部件和酶 | 总结了不同植物来源的天然和工程化分子部件的酶动力学,为黄酮类化合物的可持续生产提供了分子部件选择、设备设计和途径重构的见解 | 未提及具体的实验验证或生产量数据 | 通过植物合成生物学优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的生物合成途径及其分子部件 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 文献数据 | NA |
78 | 2025-05-01 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
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review | 本文综述了遗传密码扩展(GCE)技术在化学和合成生物学领域的最新发展和应用 | 详细介绍了GCE技术的优化和进展,包括aaRS/tRNA系统的优化、筛选方法的改进以及非经典氨基酸的生物合成 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或样本分析 | 探讨GCE技术在生物学和医学研究中的应用潜力 | 遗传密码扩展技术及其在合成生物学和医学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE)技术 | NA | NA | NA |
79 | 2025-04-29 |
Two highly specific growth-coupled biosensor for glycolaldehyde detection across micromolar and millimolar concentrations
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf004
PMID:40292364
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research paper | 该研究介绍了两种用于工程化乙醛酸(GA)生物传感器的代谢方案 | 通过创建GA依赖的营养缺陷型,将菌株生长与GA依赖的必需维生素吡哆醛-5-磷酸和2-酮戊二酸的生物合成联系起来 | NA | 开发高特异性生长耦合的生物传感器,用于检测微摩尔至毫摩尔浓度的乙醛酸 | 乙醛酸(GA)及其在不同代谢途径中的产生 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
80 | 2025-04-27 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2025-Jan, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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research paper | 该研究揭示了丹参根皮层细胞中ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮类化合物输出的机制 | 首次发现ABC转运蛋白SmABCG1参与丹参酮IIA和丹参酮I的外排,并揭示了其与二萜生物合成基因簇的基因组位置关系 | 研究主要基于丹参毛状根系统,尚未在完整植株中验证转运机制 | 探究植物次生代谢产物丹参酮的转运机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根皮层细胞及其产生的丹参酮类化合物 | 植物分子生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、异源表达(非洲爪蟾卵母细胞系统) | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 丹参毛状根培养系统 |