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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
[Effects of exogenous additives on growth and high-value bioproducts accumulation of microalgae]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240335
PMID:39855687
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综述 | 综述外源添加剂对微藻生长和高价值生物产物积累的影响及其分子机制 | 系统梳理了外源添加剂在微藻生物合成中的应用类型、作用效果和分子机制,填补了该领域分类总结的空白 | 对添加剂类型、应用、靶向菌株和分子机制的分类总结不够全面 | 为研究人员利用合成生物学方法开发合适的细胞底盘和利用微藻进行工业生产提供信息 | 微藻 | 合成生物学 | NA | 表型筛选 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 能源, 食品和药物, 环境保护 |
| 82 | 2025-10-05 |
[Regulatory roles of DGAT and PDAT genes in plant oil synthesis]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240376
PMID:39855689
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综述 | 本文系统综述了DGAT和PDAT基因在植物油脂合成中的调控作用及分子机制 | 全面总结DGAT和PDAT在植物油脂合成中的生物学功能及其在合成生物学背景下的应用前景 | NA | 深入理解植物油脂合成的分子机制并提高油料作物的品质和产量 | DGAT和PDAT基因及其在植物油脂合成中的调控作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 油脂合成代谢通路 | 农业 |
| 83 | 2025-10-05 |
[Enzymatic MBH reaction catalyzed by an artificial enzyme designed with the introduction of an unnatural tertiary amine cofactor]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240223
PMID:39855701
|
研究论文 | 本研究通过将非天然辅因子DMAP引入蛋白质骨架,成功构建了能催化不对称MBH反应的人工酶 | 首次通过点击化学策略将DMAP辅因子引入蛋白质骨架构建人工酶,实现了非天然MBH反应的不对称催化 | 对映选择性较低(38%),催化效率有待进一步提升 | 开发新型人工酶并拓展非天然生物催化反应 | 人工酶催化体系 | 合成生物学 | NA | 点击化学策略 | NA | NA | NA | 点击化学 | NA | 人工酶设计,以DMAP辅因子为催化中心 | 工业生物技术 |
| 84 | 2025-10-05 |
[An efficient assembly method for a viral genome based on T7 endonuclease Ⅰ-mediated error correction]
2025-Jan-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240302
PMID:39855702
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研究论文 | 本研究开发了一种基于T7核酸内切酶Ⅰ介导纠错的高效病毒基因组组装方法 | 通过合理拆分10kb病毒基因组并利用T7核酸内切酶Ⅰ进行多阶段纠错,显著降低错误率至0.36错误/kb | NA | 优化基因合成流程,降低错误率并简化合成步骤 | 约10kb的病毒基因组 | 合成生物学 | NA | 两步PCR、T7核酸内切酶Ⅰ纠错、测序 | NA | DNA序列数据 | NA | T7核酸内切酶Ⅰ | NA | NA | 工业生物技术 |
| 85 | 2025-10-05 |
Recent advances in engineering non-native microorganisms for poly(3-hydroxybutyrate) production
2025-Jan-24, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04261-6
PMID:39849243
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综述 | 本文综述了利用代谢工程和合成生物学技术改造非天然微生物生产聚(3-羟基丁酸酯)的最新进展 | 全面总结了所有用于PHB生物合成的非天然微生物宿主,并讨论了通过辅因子工程、代谢途径重构和细胞形态工程等不同代谢工程方法增强PHB生产 | 需要进一步的基因工程方法使非天然微生物宿主更适合大规模PHB生产 | 提高非天然微生物生产聚(3-羟基丁酸酯)的能力 | 非天然微生物宿主 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | 大肠杆菌 | PHB生物合成途径 | 医药, 生物医药 |
| 86 | 2025-10-05 |
BAC-browser: the tool for synthetic biology
2025-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06049-9
PMID:39849360
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研究论文 | 开发了用于合成基因组学的图形界面程序BAC-browser v.2.1,帮助非生物信息学用户设计核酸序列和组装DNA序列 | 提供了集成多种功能的图形界面工具,包括从氨基酸序列生成核酸序列、限制性位点可视化、GC分析和DNA序列组装工具 | NA | 开发合成基因组学专用软件工具 | DNA序列设计和组装工具 | 合成生物学 | NA | DNA序列设计、寡核苷酸组装、热力学比对 | NA | 核酸序列、氨基酸序列 | NA | BAC-browser | NA | NA | 合成生物学 |
| 87 | 2025-10-05 |
Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges
2025-Jan-22, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02643-x
PMID:39844200
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综述 | 本文综述了利用贪铜菌进行生物制造的生理学基础研究进展与挑战 | 提出基于生理学特征的贪铜菌工程化策略,强调代谢专业化、自养发酵优化和专用合成生物学工具开发 | 现有工具和应用常忽视贪铜菌独特的生理学和代谢特征 | 推动基于贪铜菌的可持续生物制造技术发展 | 贪铜菌(Cupriavidus necator)及其在生物制造中的应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、发酵技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | Cupriavidus necator | 天然聚-3-羟基丁酸酯合成途径 | 工业生物技术, 环境 |
| 88 | 2025-10-05 |
Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene
2025-Jan-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02649-5
PMID:39838465
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用Komagataella phaffii微生物细胞工厂可持续生产(+)-缬草烯的方法 | 首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-缬草烯合酶,并通过多种代谢工程策略将产量提高82倍 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵优化 | 开发可持续生产(+)-缬草烯的微生物细胞工厂 | Komagataella phaffii工程菌株及其(+)-缬草烯生产能力 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 萜类化合物生物合成途径,包括MVA途径关键基因IDI1、tHMG1、ERG12、ERG19的过表达,ERG9启动子删除,法尼基焦磷酸合酶与(+)-缬草烯合酶融合蛋白 | 食品,饮料,化妆品 |
| 89 | 2025-10-05 |
Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1526578
PMID:40313723
|
综述 | 本文全面总结了叶绿体工程和转化方法的新兴技术,重点讨论了现代转化载体构建所需的合成生物学要素 | 聚焦叶绿体工程中的新兴技术和合成生物学方法,探讨多基因表达技术突破 | 该技术目前主要局限于模式物种,尚未实现商业化应用,需要扩展到更多重要农作物 | 总结叶绿体转化技术进展,探讨其在农业和医药领域的应用潜力 | 叶绿体基因组和转质体植物 | 合成生物学 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 多基因表达系统 | 农业, 医药 |
| 90 | 2025-10-05 |
Enhancing the physiological characteristics of chimeric antigen receptor natural killer cells by synthetic biology
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592121
PMID:40313937
|
综述 | 本文综述了合成生物学在增强嵌合抗原受体自然杀伤细胞生理特性方面的最新进展 | 探讨了自然杀伤细胞与合成生物学工具包的协同作用,为开发能应对实体瘤挑战的新一代CAR-NK疗法提供路线图 | NA | 通过合成生物学方法增强CAR-NK细胞的生理特性,改善其在免疫抑制肿瘤微环境中的持久性和功能 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 91 | 2025-10-05 |
Rational Design of Dual-Targeted Nanomedicines for Enhanced Vascular Permeability in Low-Permeability Tumors
2025-01-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c12808
PMID:39797815
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法设计双靶向纳米药物,以增强低渗透性肿瘤中的血管渗透性 | 采用基因工程逻辑门控策略构建可调比例的双靶向铁蛋白纳米笼,并通过机器学习单血管分析揭示双受体表达谱在血管转运中的关键作用 | 研究主要基于患者来源的结肠癌模型,尚未在其他肿瘤类型中验证 | 开发双靶向纳米药物以增强肿瘤靶向递送效率 | 双靶向铁蛋白纳米笼(Dt-FTn)及其在低渗透性肿瘤中的血管转运机制 | 合成生物学 | 结肠癌 | 基因工程、机器学习单血管分析 | 机器学习 | 生物医学数据 | 患者来源的结肠癌模型 | 合成生物学方法 | NA | 逻辑门控策略,可调比例的RGD靶向和TfR1内在靶向配体共组装 | 医学 |
| 92 | 2025-10-05 |
S-layers: from a serendipitous discovery to a toolkit for nanobiotechnology
2025-Jan-17, Quarterly reviews of biophysics
IF:7.2Q1
DOI:10.1017/S0033583524000106
PMID:39819733
|
综述 | 回顾S-layer蛋白的发现历程及其在纳米生物技术中的应用潜力 | 系统总结了S-layer蛋白从偶然发现到成为纳米生物技术工具包的发展历程,特别聚焦维也纳S-layer研究组的贡献 | NA | 探讨S-layer蛋白的结构特性及其在生物技术和纳米技术中的应用前景 | 原核微生物的表面层(S-layer)蛋白 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核微生物(细菌和古菌) | 自组装蛋白晶格结构 | 生物技术, 纳米技术, 合成生物学, 仿生学, 生物医学, 诊断学 |
| 93 | 2025-10-05 |
Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400712
PMID:39834096
|
综述 | 本文综述了在酿酒酵母中异源合成萜类化合物的策略与方法 | 系统阐述了利用细胞微区室技术、P450酶高效表达策略及宿主代谢调控来优化萜类合成途径 | NA | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 萜类化合物的生物合成途径与酿酒酵母代谢工程 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 萜类化合物生物合成途径 | 医药、保健品、香料 |
| 94 | 2025-10-05 |
SynNotch CAR-T cell, when synthetic biology and immunology meet again
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1545270
PMID:40308611
|
综述 | 探讨合成Notch受体与CAR-T细胞疗法的革命性整合,以克服传统方法在实体瘤治疗中的局限性 | 引入合成Notch(synNotch)受体作为分子逻辑门,实现T细胞活化的多抗原精准调控 | NA | 通过合成生物学方法改进CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的特异性、安全性和适应性 | 合成Notch受体工程化T细胞 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程 | 分子逻辑门 | NA | NA | synNotch | T细胞 | 基于天然受体-配体相互作用的可编程信号平台,实现时空控制基因表达 | 医学 |
| 95 | 2025-10-05 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-Jan-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本研究结合量子隧穿传输和机器学习技术,实现了对人工合成DNA碱基的高精度电识别 | 首次将量子隧穿纳米间隙结与机器学习相结合用于人工DNA序列识别,实现了接近100%的碱基识别准确率 | 仅针对八种人工合成DNA碱基进行测试,未涉及更复杂的天然DNA序列 | 开发快速精确的人工DNA电识别方法 | 八种人工合成DNA碱基 | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输,机器学习 | 机器学习模型 | 电传输信号,电流读数 | 八种人工DNA碱基的数据集 | NA | NA | NA | 遗传研究,基因数据存储,合成生物学,诊断 |
| 96 | 2025-10-05 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 综述曲霉基因工程策略在有机酸生产中的最新进展与未来方向 | 重点探讨了CRISPR生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用与挑战 | NA | 提高工业有机酸生产效率 | 曲霉(Aspergillus) | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR | 曲霉(Aspergillus) | 代谢途径重构、副产物消除、调控途径修饰、菌丝形态工程 | 工业生物技术 |
| 97 | 2025-10-05 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
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研究论文 | 本研究开发了一种跨物种诱导系统,用于增强细菌中的蛋白质表达和多通路代谢途径的精细调控 | 设计了可在三种不同模型微生物中工作的跨物种诱导系统,并开发了能够同时激活和抑制基因表达的单输入遗传电路 | NA | 开发适用于多种细菌的通用型诱导表达系统 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌三种模型微生物 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、蛋白质表达分析 | NA | NA | NA | T7 RNA聚合酶,dCas12a | 大肠杆菌,枯草芽孢杆菌,谷氨酸棒状杆菌 | 2,4-二乙酰基间苯三酚诱导系统PphlF3R1、脱水四环素诱导系统Ptet2R2*、单输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 98 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的最新进展 | 重点介绍了微生物联合体的协同作用机制及其在提高诊断准确性和治疗效果方面的创新应用 | 存在细菌长期存活与安全性保障、非模式菌株基因编辑技术缺乏、潜在毒性控制及与宿主微生物组相互作用机制不明确等挑战 | 系统总结工程化细菌在疾病诊断与治疗领域的研究现状与发展前景 | 经过合成生物学改造的工程细菌及微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症, 肠道疾病, 代谢疾病 | 合成生物学技术, 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌 | 微生物联合体协同作用系统 | 医学 |
| 99 | 2025-10-05 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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综述 | 本文综述了从极端微生物宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从极端环境样本中挖掘新型糖苷水解酶,无需实验室培养极端微生物 | 极端微生物来源基因在常温宿主中表达困难、酶活性产量低以及规模化应用挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的来源,用于工业应用 | 极端微生物宏基因组中的糖苷水解酶基因 | 宏基因组学 | NA | 高通量测序, 生物信息学分析, 蛋白质工程 | 机器学习 | 环境DNA序列数据 | NA | 合成生物学工具 | 常温宿主 | NA | 工业生物技术 |
| 100 | 2025-10-05 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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综述 | 本文系统总结了植物合成生物学中用于黄酮类化合物生产的分子元件的酶动力学特性 | 首次从不同植物物种来源系统比较天然和工程化分子元件的酶动力学特性,为黄酮类化合物生物合成途径优化提供新见解 | NA | 通过植物合成生物学方法实现黄酮类化合物的可持续生产 | 黄酮类化合物生物合成相关的分子元件和酶 | 合成生物学 | NA | 酶动力学分析、代谢工程 | NA | 酶动力学数据 | NA | NA | 植物、微生物 | 黄酮类化合物生物合成途径重构 | 制药、营养保健品、化妆品 |