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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Comparative transcriptome analyses of different orthosiphon aristatus tissues reveal differentially expressed genes associated with flavonoid biosynthesis
2025-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85266-x
PMID:39775135
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研究论文 | 通过比较猫须草不同组织的转录组分析,揭示与黄酮类化合物生物合成相关的差异表达基因 | 首次对猫须草所有组织进行黄酮类化合物合成生物学的比较转录组分析,发现根部黄酮含量更高并鉴定出212个与根部黄酮积累强相关的差异表达基因 | 研究仅限于猫须草单一物种,未进行功能验证实验 | 探究猫须草不同组织中黄酮类化合物生物合成的分子机制 | 猫须草(Orthosiphon aristatus)的根、茎、叶等不同组织 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | 高效液相色谱分析, 转录组分析, 实时定量PCR | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 猫须草不同组织样本 | NA | 猫须草(Orthosiphon aristatus) | 黄酮类化合物生物合成通路 | 医药 |
| 82 | 2025-10-05 |
From nonexistence to novel applications: Nullomers and related k-mer based concepts in bioinformatics
2025, Advances in clinical chemistry
DOI:10.1016/bs.acc.2025.06.009
PMID:41033729
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综述 | 本章节系统阐述了生物信息学中未被充分代表的k-mer序列(包括空位体和相关概念)的研究进展与应用前景 | 提出了基于缺失序列(空位体和新位体)的创新研究框架,为癌症检测、组织溯源和进化研究提供了新方法 | 讨论了分析缺失序列时面临的计算挑战 | 探索k-mer序列在基因组学和蛋白质组学中的基础与应用研究价值 | 空位体、新位体和准素数等未被充分代表的k-mer序列 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer分析,液体活检 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | 医学诊断,药物发现,合成生物学 |
| 83 | 2025-10-05 |
Targeting the gut-liver axis in cholangiocarcinoma: mechanisms, therapeutic advances, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1646897
PMID:41018102
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综述 | 探讨肠道-肝脏轴在胆管癌发病机制中的作用及靶向该轴线的治疗进展 | 系统阐述肠道微生物失调、胆汁酸代谢紊乱与免疫微环境重塑在胆管癌中的协同作用机制 | 微生物群异质性和受体信号双重性等挑战尚未解决,临床转化需更深入机制研究和标准化方案 | 研究肠道-肝脏轴在胆管癌发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 胆管癌患者肠道/胆道微生物组、胆汁酸代谢通路及肿瘤免疫微环境 | 医学肿瘤学 | 胆管癌 | 多组学分析、人工智能 | NA | 临床数据、微生物组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 工程化微生物群 | NA | 医学 |
| 84 | 2025-10-05 |
Therapeutic potential of the gut commensal bacterium Parabacteroides goldsteinii in human health and disease treatment
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1618892
PMID:41019532
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综述 | 系统探讨肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii在人类健康和疾病治疗中的潜在应用价值 | 首次系统综述该菌株通过短链脂肪酸分泌、胆汁酸转化和免疫调节等多重机制对抗多种疾病的治疗潜力 | 面临培养条件优化、剂量效应表征和遗传工具开发等转化挑战 | 评估Parabacteroides goldsteinii作为益生菌在疾病治疗和健康促进中的应用前景 | 肠道共生菌Parabacteroides goldsteinii及其与宿主互作机制 | 微生物组研究 | 代谢紊乱、神经系统疾病、炎症性疾病、恶性肿瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 85 | 2025-10-05 |
Mathematical models and computational approaches in CAR-T therapeutics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581210
PMID:40821789
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综述 | 探讨数学模型和计算方法在CAR-T细胞疗法中的应用与优化 | 提出整合数学模型与计算技术的综合框架,以提升CAR-T疗法设计并预测临床效果 | 现有模型时空分辨率有限,影响疗法安全性及成本效益,尤其针对实体瘤 | 通过计算手段优化CAR-T疗法设计并预测治疗效果 | CAR-T细胞动力学及抗原结合机制 | 计算生物学 | 癌症 | 数学模型与计算模拟 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | CAR(嵌合抗原受体)工程化改造 | 医学 |
| 86 | 2025-10-05 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用代谢模型研究植物-微生物相互作用的最新进展 | 系统整合基因组尺度代谢模型应用于植物-微生物互作研究,并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢网络建模理解植物-微生物相互作用的机制 | 植物宿主及其相关微生物组成的全生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模 | 代谢网络模型 | 基因组、宏基因组、表型数据 | NA | NA | 植物、微生物 | NA | 农业 |
| 87 | 2025-10-05 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 提出通过微生物组工程构建合成微生物群落以增强农业气候韧性的综合框架 | 提出可编程全息生物体概念,整合微生物生态学、合成生物学和计算建模构建具有动态反馈和生态记忆的植物-微生物共生系统 | NA | 开发气候韧性农业的工程化微生物组解决方案 | 植物全息生物体(植物宿主及其微生物组) | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物、微生物 | 生物传感器电路、群体感应模块、可编程微生物功能 | 农业 |
| 88 | 2025-10-05 |
Innate lymphoid cells in the spotlight: from biomarkers to blueprint for innovative immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1655730
PMID:40963622
|
综述 | 本文综述了先天淋巴样细胞(ILCs)在免疫调节和疾病中的作用,并探讨了其作为生物标志物和免疫治疗新策略的潜力 | 系统阐述了ILCs作为新型免疫治疗蓝图的转化潜力,包括CAR-ILC工程、细胞扩增技术和多组学方法的应用 | ILC亚群异质性、可塑性、组织限制性驻留和有限的可扩展性仍是临床应用的障碍 | 探讨ILCs在自身免疫疾病和癌症中作为预测、诊断和治疗靶点的作用 | 先天淋巴样细胞(ILCs)及其亚群(ILC1s、ILC2s、ILC3s、LTi细胞) | 免疫学 | 自身免疫疾病,癌症 | 多组学技术、单细胞图谱、合成生物学方法 | NA | NA | NA | CAR工程 | 脐带血、多能干细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)工程 | 医学 |
| 89 | 2025-10-05 |
Exploring the diversity and antimicrobial potential of actinomycetes isolated from different environments in Saudi Arabia: a systematic review
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1568899
PMID:40207161
|
综述 | 系统回顾沙特阿拉伯不同环境中放线菌的多样性和抗菌潜力 | 聚焦沙特独特生态系统(极端环境等)中放线菌的抗菌潜力,结合基因组挖掘、AI生物信息学等前沿技术 | 稀有菌株培养困难、基因组表征有限、生产成本高 | 探索新型抗菌剂以应对抗菌素耐药性 | 沙特阿拉伯不同环境来源的放线菌 | 微生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 基因组挖掘、宏基因组学、AI生物信息学、CRISPR基因激活、质谱分析、液相色谱、核磁共振波谱 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR, 合成生物学 | 放线菌 | NA | 医学, 农业 |
| 90 | 2025-10-05 |
Yarrowia lipolytica as a promising cell factory for microbial production of value-added nutraceuticals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1673169
PMID:40948964
|
综述 | 总结解脂耶氏酵母作为细胞工厂生产高附加值营养保健品的工程策略与进展 | 系统整合代谢工程与合成生物学工具,重点突出细胞器区室化工程和生物传感器驱动筛选等先进策略 | NA | 开发解脂耶氏酵母作为可持续生产营养保健品的微生物平台 | 解脂耶氏酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学、多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, 生物传感器 | 解脂耶氏酵母 | 代谢通路工程、异源基因表达优化、前体供应增强、竞争途径重定向 | 食品, 工业生物技术 |
| 91 | 2025-10-05 |
Reprogramming cancer immunity with next-generation combination therapies
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1652047
PMID:40950404
|
综述 | 本文全面分析新一代癌症免疫联合疗法的机制基础与临床整合策略 | 系统整合多模态免疫治疗策略,结合纳米技术、免疫工程和人工智能建模等前沿技术 | 存在免疫相关不良事件和治疗反应异质性等挑战 | 探讨通过新一代联合疗法重编程癌症免疫应答 | 癌症免疫治疗策略及其临床应用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 多组学分析、纳米技术、人工智能建模 | NA | NA | NA | 免疫工程 | NA | NA | 医学 |
| 92 | 2025-10-05 |
Yeasts in traditional Baijiu fermentation: diversity, functions, microbial interactions and applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1652173
PMID:40901081
|
综述 | 系统总结中国传统白酒发酵过程中酵母菌的多样性、功能、微生物互作及应用研究进展 | 整合多组学技术揭示非酿酒酵母功能特性及微生物互作机制,提出合成生物学指导菌株开发的新方向 | 主要基于现有文献总结,缺乏原始实验数据验证 | 深入理解白酒发酵过程中酵母菌的生态功能并推动优质智能化白酒生产 | 白酒发酵过程中的酵母菌群落 | 微生物生态学 | NA | 高通量测序,宏基因组学,多组学技术 | NA | 基因组数据,代谢组数据 | NA | 合成生物学 | 酵母菌 | NA | 食品,工业生物技术 |
| 93 | 2025-10-05 |
Mapping variation in dual use risk assessments of synthetic biology projects
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1620678
PMID:40895722
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研究论文 | 本研究通过评估合成生物学项目的双重用途风险,揭示了专家和学生评审员在风险评估和管理策略上的显著差异 | 首次对现实世界合成生物学项目进行双重用途风险评估的实证研究,揭示了评审员间风险评估和管理策略的显著不一致性 | 样本量相对有限(18名专家和49名学生),仅评估了四个合成生物学项目 | 研究合成生物学项目双重用途风险评估的一致性和准确性 | 四个现实世界合成生物学项目的风险评估和管理策略 | 生物安全与风险管理 | NA | 风险评估框架 | NA | 专家评审数据 | 18名经验丰富的DURC评审员和49名合成生物学学生 | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 94 | 2025-10-05 |
Harnessing synthetic biology to empower a circular plastics economy
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0053
PMID:40638940
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综述 | 本文概述了利用合成生物学和微生物群落工程技术降解和升级回收塑料废物的策略 | 整合合成生物学与微生物群落工程,提出增强塑料生物处理效率的互补策略 | NA | 探讨生物技术如何支持循环塑料经济发展 | 塑料废物处理与升级回收 | 合成生物学 | NA | 微生物群落工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 生物降解与升级回收通路 | 环境, 工业生物技术 |
| 95 | 2025-10-05 |
Synergizing CRISPR-Cas9 with Advanced Artificial Intelligence and Machine Learning for Precision Drug Delivery: Technological Nexus and Regulatory Insights
2025, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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综述 | 探讨CRISPR-Cas9基因编辑技术与人工智能和机器学习在精准药物递送中的协同应用及监管框架 | 首次系统整合CRISPR-Cas9技术与深度学习模型(如DeepCRISPR)在精准医疗中的协同应用,并提出技术融合的监管路径 | 未涉及具体临床实验数据,主要聚焦技术原理和理论框架层面的讨论 | 探索基因编辑技术与人工智能在精准药物递送领域的交叉应用及监管策略 | CRISPR-Cas9基因编辑系统及其计算辅助工具 | 机器学习 | 镰状细胞病,β-地中海贫血 | CRISPR-Cas9, 深度学习, NGS | DeepCRISPR | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 96 | 2025-10-05 |
Tracing the development of CAR-T cell design: from concept to next-generation platforms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615212
PMID:40771804
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综述 | 本文系统回顾了CAR-T细胞设计从概念到下一代平台的发展历程 | 全面梳理了CAR架构从早期原型到包含共刺激域、细胞因子信号、安全开关等先进设计的演进过程 | CAR-T细胞疗法仍面临严重副作用、治疗反应不一致和生产成本高等挑战 | 指导未来CAR疗法向更多癌症类型和其他疾病扩展应用 | CAR-T细胞及其相关技术平台 | 免疫治疗 | 血液恶性肿瘤 | CRISPR、碱基编辑、先导编辑、RNA编辑、表观基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞 | 逻辑门控CAR系统、生物传感器 | 医学 |
| 97 | 2025-10-05 |
The gut-bone axis in osteoporosis: a multifaceted interaction with implications for bone health
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1569152
PMID:40741168
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综述 | 系统阐述肠道-骨骼轴在骨质疏松中的作用机制及干预策略 | 创新性提出肠道-骨骼轴+X概念框架,支持纳米生物材料、细菌合成生物学等新技术在抗骨质疏松中的应用 | NA | 探讨肠道微生态通过免疫和内分泌途径影响骨骼健康的机制 | 肠道微生态与骨骼组织的相互作用 | 骨科与微生物组学交叉研究 | 骨质疏松 | 粪便微生物移植、益生菌/益生元补充、饮食模式调整 | NA | 文献综述数据 | NA | 细菌合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 98 | 2025-10-05 |
Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X2550051X
PMID:40626404
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综述 | 本文综述了2019-2024年间具有降压潜力的植物源天然产物及其通过信号通路改善高血压的作用机制 | 系统评估了70种具有降压活性的天然产物,并按黄酮类、萜类、生物碱和植物提取物进行分类,提出未来应优先研究兼具抗氧化/抗炎双重特性的天然产物 | 仅涵盖2019-2024年间的文献,未包括更早期的研究,且为综述性分析而非原始实验研究 | 评估植物源天然产物通过信号通路改善高血压的治疗潜力 | 70种植物源天然产物,包括20种黄酮类、24种萜类、17种生物碱和9种植物提取物 | 药理学 | 心血管疾病 | 文献检索分析 | NA | 文献数据 | 70种天然产物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 99 | 2025-10-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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研究论文 | 开发了一种无需淬灭剂的单染料标记方法用于监测G-四链体DNA的折叠与解折叠过程 | 首次实现了仅使用单染料标记(无需淬灭剂)的FRET类似格式来监测G-四链体结构转变 | NA | 开发低成本高通量监测G-四链体结构折叠转变的技术 | G-四链体形成DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | NA | NA | G-四链体结构 | 合成生物学 |
| 100 | 2025-10-05 |
Next-generation probiotics and engineered BEVs for precision therapeutics in osteoporosis
2025, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2025.1581971
PMID:40667443
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综述 | 探讨工程化益生菌和细菌胞外囊泡在骨质疏松精准治疗中的新兴策略 | 提出结合下一代益生菌与工程化BEVs通过靶向肠-骨轴实现骨质疏松精准治疗的新范式 | 存在标准化和安全性挑战,临床转化仍需进一步验证 | 开发基于微生物组的骨质疏松治疗新方法 | 骨质疏松患者及肠-骨轴调控机制 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 合成生物学工程化技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 益生菌 | 免疫调节、代谢物生产和神经内分泌调控通路 | 医学 |