合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 172 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-02-13 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以实现对活细胞中细胞器功能的动态控制 | 利用光遗传学技术动态调控细胞器功能，为细胞工程和合成生物学提供了创新范例 | 当前实验策略在调节细胞器功能方面存在局限性，主要由于细胞器在活细胞中的动态性和亚细胞分布 | 研究目的是通过光遗传学技术动态调控细胞器功能，以探索细胞工程和合成生物学的新方法 | 研究对象为活细胞中的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 102 | 2025-02-08 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
|
研究论文 | 本文介绍了一种在凝胶颗粒格式中测量XNA聚合酶保真度的新方法 | 开发了一种无需纯化的方法，通过在凝胶包覆的磁性颗粒基质中进行XNA转录和逆转录步骤，显著减少了测量XNA聚合酶保真度所需的时间和反应规模 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种更高效的方法来测量能够合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶的保真度 | XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 凝胶包覆的磁性颗粒基质中的XNA转录和逆转录 | NA | NA | NA |
| 103 | 2025-02-08 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为“foldtuning”的新方法，利用蛋白质语言模型（pLMs）探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域 | 通过foldtuning方法，利用pLMs生成和自反馈能力，探索与自然序列无同源性的蛋白质“深空”区域，并构建了一个包含700多种自然折叠的foldtuned pLMs库 | 尽管foldtuning方法展示了在蛋白质序列设计中的潜力，但其生成的蛋白质变体的功能和稳定性仍需进一步实验验证 | 探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域，推动合成生物学系统的重新设计和重构 | 蛋白质序列和结构 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质语言模型（pLMs） | pLMs | 蛋白质序列和结构数据 | 超过700种自然折叠的蛋白质 |
| 104 | 2025-02-08 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
|
综述 | 本文回顾并总结了非编码RNA（ncRNA）在细胞命运决定中的数学模型框架及其在真实生物过程中的应用 | 探讨了ncRNA与转录因子之间的正反馈环以及miRNA-mRNA相互调控的新兴特性，这些特性使得双稳态开关能够指导细胞命运决定 | ncRNA介导的双稳态开关的分子机制仍然不明确且存在争议 | 阐明ncRNA介导的细胞命运决定过程的分子机制 | 非编码RNA（ncRNA）、mRNA、miRNA和竞争性内源mRNA（ceRNA） | 系统生物学与合成生物学 | NA | 数学模型与定量实验分析 | NA | NA | NA |
| 105 | 2025-02-08 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
|
综述 | 本文探讨了微生物组工程在提高食品安全和质量方面的作用，并评估了相关的最新技术和社会伦理问题 | 本文综合评估了合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术在微生物组工程中的应用，并强调了跨学科合作的重要性 | 需要进一步研究以解决复杂食品系统中微生物动态的理解和统一监管框架的制定等关键挑战 | 探讨微生物组工程在提高食品安全和质量方面的潜力 | 微生物组及其在食品系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 106 | 2025-02-06 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
|
研究论文 | 本文通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动态及其转运机制 | 通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 尽管进行了广泛的生化表征和晶体结构解析，但对碳酸氢盐转运机制的动态理解仍然不足 | 研究蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，以增强光合作用产量 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA | 分子动力学模拟 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | 超过1毫秒的模拟数据 |
| 107 | 2025-02-06 |
Recent trends in the elucidation of complex triterpene biosynthetic pathways in horticultural trees
2025-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae254
PMID:39802733
|
综述 | 本文综述了园艺树木中三萜类化合物的化学多样性及其生物合成途径，并介绍了用于发现、表征和优化这些途径的集成设计-构建-测试-学习（DBTL）管道 | 本文强调了合成生物学在揭示三萜类化合物生物合成途径中的重要作用，并提出了跨学科合作的机会 | 园艺树木中三萜类化合物的生物功能和机制尚未完全明确，且缺乏可扩展的生产系统 | 探讨园艺树木中三萜类化合物的生物合成途径及其在可持续发展中的应用 | 园艺树木中的三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | DBTL（设计-构建-测试-学习）管道 | NA | NA | NA |
| 108 | 2025-02-06 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
|
综述 | 本文综述了人工miRNAs（amiRNAs）和靶标模拟物在作物改良中的潜在应用，探讨了其在植物基因表达调控和作物抗逆性提升中的作用 | 提出了利用人工miRNAs和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的新方法，并探讨了其在合成生物学中的应用 | 文章主要基于现有研究进行综述，未涉及具体实验验证，且对amiRNAs和STTMs的实际应用挑战分析较为有限 | 探讨人工miRNAs和靶标模拟物在作物改良中的应用，特别是其在增强作物抗逆性和抗病性方面的潜力 | 植物miRNAs及其调控机制，以及人工miRNAs和靶标模拟物的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 人工miRNAs（amiRNAs）、靶标模拟物（eTMs、STTMs） | NA | NA | NA |
| 109 | 2025-02-05 |
Metabolic engineering approaches for the biosynthesis of antibiotics
2025-Jan-31, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02628-2
PMID:39891166
|
综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在抗生素发现及其有效生产中的应用 | 探讨了代谢工程和合成生物学在开发高效酶和细胞工厂以生产现有抗生素及其衍生物和类似物方面的创新策略 | 未具体提及研究的局限性 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略振兴新抗生素的发现和开发 | 抗生素及其衍生物和类似物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 110 | 2025-02-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
|
研究论文 | 本文介绍了一种无需淬灭剂的荧光监测方法，用于监测G-四链体结构的折叠 | 提出了一种仅使用单一染料标记、无需淬灭剂的FRET类似格式来监测G-四链体DNA序列的展开转变 | 未提及具体局限性 | 开发低成本、高通量的工具以监测G-四链体结构的折叠和展开转变，加速合成生物学系统的原型设计和设计-构建-测试周期 | G-四链体DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测 | NA | DNA序列数据 | 未提及具体样本数量 |
| 111 | 2025-02-05 |
Silk Protein Gene Engineering and Its Applications: Recent Advances in Biomedicine Driven by Molecular Biotechnology
2025, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S504783
PMID:39881670
|
综述 | 本文综述了丝蛋白基因工程及其在生物医学领域的应用，重点介绍了分子生物技术在丝蛋白遗传工程中的应用 | 通过分子生物技术创新，如CRISPR-Cas9基因编辑技术、转基因表达技术和合成生物学技术，生产具有特定性能的新型丝蛋白 | NA | 探讨丝蛋白基因工程在生物医学领域的应用及其潜力 | 丝蛋白及其在药物递送系统、组织工程和再生医学中的应用 | 生物医学工程 | NA | CRISPR-Cas9, 转基因表达技术, 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 112 | 2025-02-02 |
Unravelling the aromatic symphony: redirecting bifunctional mushroom synthases towards linalool monofunctionality
2025-Jan-13, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00056-2
PMID:39883255
|
研究论文 | 本文通过修改双功能蘑菇合成酶的氨基酸序列，成功提高了其底物选择性，使其更倾向于生成芳樟醇而非橙花叔醇 | 通过修改双功能蘑菇合成酶的氨基酸序列，显著提高了其底物选择性，减少了副产物的生成 | 虽然底物选择性有所提高，但未能完全实现单功能化 | 提高酶的底物选择性，设计单功能的芳樟醇合成酶 | 双功能芳樟醇/橙花叔醇合成酶（LNS） | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接模拟、分子动力学模拟 | NA | NA | 四种双功能蘑菇LNS |
| 113 | 2025-01-31 |
Microbial biotechnology: from synthetic biology to synthetic ecology
2025-Jan-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00054-4
PMID:39883269
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2025-01-31 |
Spontaneous Emergence of Lipid Vesicles in a Coacervate-Based Compartmentalized System
2025-Jan-27, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202414372
PMID:39656166
|
研究论文 | 本文研究了在缺乏进化生物机制的情况下，脂质囊泡的自发形成，展示了凝聚微滴如何创造一个分隔环境，富集脂质分子并促进其自发组装成脂质囊泡 | 揭示了凝聚微滴与脂质分子之间复杂的相互作用，为细胞系统的出现提供了新的视角，并扩展了对地球上生命发展所需条件的理解 | NA | 探索脂质囊泡在无生物机制情况下的自发形成机制 | 脂质分子和凝聚微滴 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2025-01-31 |
Engineering Phages to Fight Multidrug-Resistant Bacteria
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00681
PMID:39680919
|
综述 | 本文综述了工程化噬菌体在对抗多重耐药细菌中的应用，包括噬菌体工程技术及其在细菌病原体检测和消除中的应用 | 通过化学修饰和基因工程技术增强噬菌体的宿主范围、提高效能，并赋予新功能，以应对多重耐药细菌的挑战 | 天然噬菌体的宿主范围狭窄、特性未明以及指数复制和进化带来的潜在风险限制了其应用 | 探索噬菌体工程技术在病原体控制中的应用，以应对全球抗生素耐药性危机 | 多重耐药细菌 | 合成生物学与纳米技术 | 细菌感染 | 化学修饰、基因工程 | NA | NA | NA |
| 116 | 2025-01-31 |
Cell-to-Cell Natural Transformation Mediated Efficient Plasmid Transfer Between Bacillus Species
2025-Jan-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26020621
PMID:39859334
|
研究论文 | 本研究描述了一种新的质粒转移方法，称为细胞间自然转化质粒转移（CTCNT-P），该方法在自然感受态菌株之间高效促进质粒转移 | 提出了一种新的质粒转移方法CTCNT-P，相比传统方法如Spizizen培养基或电穿孔介导的转化，效率显著提高 | NA | 研究细菌水平基因转移（HGT）的新方法，以提高质粒转移效率 | 芽孢杆菌属（Bacillus species）的菌株 | 微生物学 | NA | 细胞间自然转化质粒转移（CTCNT-P） | NA | NA | NA |
| 117 | 2025-01-31 |
Rapid Multi-Well Evaluation of Assorted Materials for Hydrogel-Assisted Giant Unilamellar Vesicle Production: Empowering Bottom-Up Synthetic Biology
2025-Jan-02, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels11010029
PMID:39852000
|
研究论文 | 本文介绍了一种快速评估多种水凝胶材料用于辅助生产巨型单层囊泡（GUVs）的方法，旨在推动自下而上的合成生物学研究 | 开发了一种通过控制滴铸在玻璃培养皿和聚苯乙烯多孔板中快速筛选多达96种GUV生产配方的技术，并成功封装了猪肝酯酶（PLE-GUVs），提供了一种新的GUV标记和追踪方法 | 部分水凝胶材料可能会泄漏并污染GUVs，或需要处理有毒材料或特殊化学物质，限制了新手的使用 | 探索和评估替代水凝胶材料以解决现有GUV生产方法的局限性，并开发新的GUV标记和追踪方法 | 巨型单层囊泡（GUVs） | 合成生物学 | NA | 水凝胶辅助GUV生产 | NA | 实验数据 | 多达96种GUV生产配方 |
| 118 | 2025-01-31 |
MoCloro: an extension of the Chlamydomonas reinhardtii modular cloning toolkit for microalgal chloroplast engineering
2025 Jan-Feb, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70088
PMID:39871102
|
研究论文 | 本文介绍了MoCloro，一种扩展自MoClo的工具包，用于微藻叶绿体基因组工程 | 开发了MoCloro工具包，扩展了现有的MoClo工具包，使其适用于叶绿体基因组工程，并构建了Golden Gate兼容的叶绿体转化载体pWF.K.4 | NA | 开发标准化克隆工具和设计-构建-测试-学习工作流程，以简化叶绿体基因组和代谢工程 | 微藻叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 119 | 2025-01-29 |
Modular Access to C2'-Aryl/Alkenyl Nucleosides with Electrochemical Stereoselective Cross-Coupling
2025-Jan-27, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418806
PMID:39620453
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过电化学镍催化交叉偶联反应合成高度功能化的C2'-α-芳基/烯基核苷的新方法 | 该方法在C2'-位合成修饰核苷方面具有高效性、模块化和选择性，提供了广泛的底物范围和良好的官能团兼容性 | NA | 开发一种新的合成方法，用于制备具有潜在治疗应用的功能化核苷 | C2'-α-芳基/烯基核苷 | 化学合成 | NA | 电化学镍催化交叉偶联反应 | NA | NA | NA |
| 120 | 2025-01-29 |
Synergizing CRISPR-Cas9 with Advanced Artificial Intelligence and Machine Learning for Precision Drug Delivery: Technological Nexus and Regulatory Insights
2025-Jan-06, Current gene therapy
IF:3.8Q2
|
研究论文 | 本文探讨了CRISPR-Cas9技术与先进人工智能和机器学习在精准药物递送中的协同作用，并提供了技术结合和监管见解 | 结合CRISPR-Cas9与人工智能和机器学习，优化基因编辑实验并预测结果，推动精准药物递送的发展 | 面临脱靶效应、病毒载体引发的免疫反应以及生殖系编辑的伦理问题等挑战 | 探讨CRISPR-Cas9技术在精准药物递送中的应用及其与人工智能和机器学习的协同作用 | CRISPR-Cas9系统、人工智能和机器学习模型 | 基因编辑与机器学习 | 镰状细胞病、β-地中海贫血 | CRISPR-Cas9、NHEJ、HDR、E-CRISP、Azimuth 2.0、DeepCRISPR | 深度学习模型 | 基因数据 | NA |