合成生物学相关文章
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当前共找到 179 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-03-19 |
Fungi: Pioneers of chemical creativity - Techniques and strategies to uncover fungal chemistry
2025, IMA fungus
IF:5.2Q1
DOI:10.3897/imafungus.16.142462
PMID:40093757
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review | 本文综述了真菌在药物开发和新型化学物质发现中的重要作用，并探讨了从过去到现在天然产物发现和药物先导物识别的分析及战略框架 | 强调了利用合成生物学系统探索真菌基因组的努力，并提出了合作与协作的必要性以充分利用真菌次级代谢物的潜力 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨真菌在药物开发和新型化学物质发现中的应用及其技术进展 | 真菌及其次级代谢物 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 102 | 2025-03-14 |
Synthetic gene circuits in plants: recent advances and challenges
2025, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2025.3
PMID:40070723
|
综述 | 本文综述了植物合成生物学领域的最新进展和挑战，特别是合成基因回路在植物基因表达控制中的应用 | 提供了对合成基因回路的全面理解，并讨论了在植物中构建高级合成基因回路以编程控制基因表达的最新进展 | 讨论了开发和有效应用合成基因回路所面临的挑战，包括定量测量、高通量测试和回路建模 | 研究植物合成生物学，特别是合成基因回路在植物基因表达控制中的应用 | 植物 | 合成生物学 | NA | 合成基因回路 | NA | NA | NA |
| 103 | 2025-03-13 |
There and turn back again: the application of phage serine integrases in eukaryotic systems
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1478413
PMID:40066361
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review | 本文综述了丝氨酸整合酶（Ints）在真核细胞中的应用及其在遗传工程中的创新用途 | 强调了Ints在真核细胞中的新应用及其在健康、农业和环境科学中的潜在用途 | NA | 综述丝氨酸整合酶在真核细胞中的应用及其在遗传工程中的创新用途 | 丝氨酸整合酶（Ints）及其在真核细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2025-03-01 |
Microbiome Engineering for Sustainable Rice Production: Strategies for Biofertilization, Stress Tolerance, and Climate Resilience
2025-Jan-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13020233
PMID:40005600
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综述 | 本文更新并批判性地讨论了水稻微生物组的多样性、功能角色以及增强生物施肥和抗逆性的微生物组工程策略 | 强调了微生物组工程从传统接种剂到合成生物学的进展，以及利用微生物组塑造基因（M基因）提高作物抗逆性的创新方法 | 需要进一步探索M基因以培育抗病性状，且商业化成功的关键因素包括土壤特性、实际环境条件和植物基因型 | 增强水稻的生物施肥、抗逆性和气候适应能力，以实现可持续水稻生产 | 水稻及其微生物组 | 农业生物技术 | NA | 微生物组工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 105 | 2025-02-28 |
Harnessing Gut Microbiota for Biomimetic Innovations in Health and Biotechnology
2025-Jan-24, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics10020073
PMID:39997096
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群在健康和生物技术中的仿生创新潜力 | 利用肠道微生物群的生物机制，开发个性化益生菌、人工微生物群、仿生生物传感器和生物修复系统等创新应用 | 在人工环境中复制微生物复杂性、基因工程微生物的伦理问题以及公平获取先进疗法的挑战 | 探索基于微生物群的仿生创新在医疗和生物技术中的潜力 | 肠道微生物群及其生物机制 | 生物技术 | NA | 人工智能、生物工程、多组学方法 | NA | NA | NA |
| 106 | 2025-02-23 |
On Emergence of Spontaneous Oscillations in Kombucha and Proteinoids
2025, BioNanoScience
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s12668-024-01678-5
PMID:39980746
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研究论文 | 本研究探讨了康普茶和类蛋白体中的自发振荡现象，及其与生命起源的潜在联系 | 通过研究康普茶和类蛋白体中的自发振荡，揭示了从混沌到有序转变的基本原理，为合成生物学和生物技术中的自组织网络提供了新思路 | 研究主要基于理论分析和实验证据，尚未涉及具体的应用场景或大规模实验验证 | 探讨自发振荡在生命起源中的作用，并揭示从非生命物质到生命物质的转变机制 | 康普茶和类蛋白体 | 生物化学 | NA | NA | NA | 实验数据 | NA |
| 107 | 2025-02-22 |
DAPE cloning with modified primers for producing designated lengths of 3' single-stranded ends in PCR products
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318015
PMID:39946422
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DAPE的新型DNA克隆方法，通过使用修饰引物在PCR产物中产生指定长度的3'单链末端 | DAPE方法能够在DNA片段的两端生成精确长度的3'突出端，克服了传统SLIC技术在克隆小于50bp的DNA片段时的局限性 | NA | 开发一种更高效的DNA克隆和合成生物学工具 | DNA片段 | 合成生物学 | NA | PCR, DNA克隆 | NA | DNA序列 | NA |
| 108 | 2025-02-16 |
Synthetic biology in Mexico: Brief history, current landscape, and perspectives towards a bio-based economy
2025 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.12037
PMID:39950160
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综述 | 本文综述了合成生物学在墨西哥的发展历史、现状及向生物经济转型的展望 | 强调了iGEM竞赛在推动墨西哥合成生物学发展中的重要作用，并概述了当前的教育、公民科学倡议以及研究和工业景观 | 未具体提及研究方法的局限性 | 探讨合成生物学在墨西哥的发展及其对生物经济的潜在贡献 | 墨西哥的合成生物学发展 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2025-02-14 |
Challenges in observing transcription-translation for bottom-up synthetic biology
2025, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2024.27
PMID:39944880
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review | 本文详细讨论了如何使用PURE系统和细胞裂解液在体外重建转录-翻译过程，并探讨了将这些系统封装在GUVs中的现有方法 | 本文创新性地评估了使用多种荧光显微镜技术和探针来成像转录和翻译的方法，并提出了解决PURE系统中两个系统解耦挑战的方案 | 本文主要讨论了体外系统的挑战，未涉及体内系统的复杂性和实际应用中的限制 | 本文的研究目标是探讨如何重建和观察转录-翻译系统，以实现合成生物学的目标 | 本文的研究对象是转录和翻译系统，特别是PURE系统和细胞裂解液 | 合成生物学 | NA | 荧光显微镜技术 | NA | 图像 | NA |
| 110 | 2025-02-13 |
Alternating Cellular Functions by Optogenetic Control of Organelles
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4047-0_13
PMID:39724352
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过光遗传学调控线粒体-溶酶体接触（MLCs）的方法，以实现对活细胞中细胞器功能的动态控制 | 利用光遗传学技术动态调控细胞器功能，为细胞工程和合成生物学提供了创新范例 | 当前实验策略在调节细胞器功能方面存在局限性，主要由于细胞器在活细胞中的动态性和亚细胞分布 | 研究目的是通过光遗传学技术动态调控细胞器功能，以探索细胞工程和合成生物学的新方法 | 研究对象为活细胞中的线粒体-溶酶体接触（MLCs） | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 111 | 2025-02-08 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 本文介绍了一种在凝胶颗粒格式中测量XNA聚合酶保真度的新方法 | 开发了一种无需纯化的方法，通过在凝胶包覆的磁性颗粒基质中进行XNA转录和逆转录步骤，显著减少了测量XNA聚合酶保真度所需的时间和反应规模 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种更高效的方法来测量能够合成人工遗传聚合物（XNA）的聚合酶的保真度 | XNA聚合酶 | 合成生物学 | NA | 凝胶包覆的磁性颗粒基质中的XNA转录和逆转录 | NA | NA | NA |
| 112 | 2025-02-08 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本文介绍了一种名为“foldtuning”的新方法，利用蛋白质语言模型（pLMs）探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域 | 通过foldtuning方法，利用pLMs生成和自反馈能力，探索与自然序列无同源性的蛋白质“深空”区域，并构建了一个包含700多种自然折叠的foldtuned pLMs库 | 尽管foldtuning方法展示了在蛋白质序列设计中的潜力，但其生成的蛋白质变体的功能和稳定性仍需进一步实验验证 | 探索蛋白质序列-结构图中未探索的区域，推动合成生物学系统的重新设计和重构 | 蛋白质序列和结构 | 自然语言处理 | NA | 蛋白质语言模型（pLMs） | pLMs | 蛋白质序列和结构数据 | 超过700种自然折叠的蛋白质 |
| 113 | 2025-02-08 |
Modeling ncRNA-Mediated Circuits in Cell Fate Decision: From Systems Biology to Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4290-0_6
PMID:39702707
|
综述 | 本文回顾并总结了非编码RNA（ncRNA）在细胞命运决定中的数学模型框架及其在真实生物过程中的应用 | 探讨了ncRNA与转录因子之间的正反馈环以及miRNA-mRNA相互调控的新兴特性，这些特性使得双稳态开关能够指导细胞命运决定 | ncRNA介导的双稳态开关的分子机制仍然不明确且存在争议 | 阐明ncRNA介导的细胞命运决定过程的分子机制 | 非编码RNA（ncRNA）、mRNA、miRNA和竞争性内源mRNA（ceRNA） | 系统生物学与合成生物学 | NA | 数学模型与定量实验分析 | NA | NA | NA |
| 114 | 2025-02-08 |
The role of Micro-biome engineering in enhancing Food safety and quality
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.01.001
PMID:39912062
|
综述 | 本文探讨了微生物组工程在提高食品安全和质量方面的作用，并评估了相关的最新技术和社会伦理问题 | 本文综合评估了合成生物学、人工智能和系统生物学等前沿技术在微生物组工程中的应用，并强调了跨学科合作的重要性 | 需要进一步研究以解决复杂食品系统中微生物动态的理解和统一监管框架的制定等关键挑战 | 探讨微生物组工程在提高食品安全和质量方面的潜力 | 微生物组及其在食品系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、人工智能、系统生物学 | NA | NA | NA |
| 115 | 2025-02-06 |
Molecular insights into the elevator-type mechanism of the cyanobacterial bicarbonate transporter BicA
2025-Jan-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.12.013
PMID:39674889
|
研究论文 | 本文通过分子动力学模拟揭示了蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的构象动态及其转运机制 | 通过超过1毫秒的全原子分子动力学模拟数据，阐明了BicA二聚体在底物转运过程中的结构重排，并研究了降低构象转变自由能垒的潜在突变 | 尽管进行了广泛的生化表征和晶体结构解析，但对碳酸氢盐转运机制的动态理解仍然不足 | 研究蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA的转运机制，以增强光合作用产量 | 蓝藻碳酸氢盐转运蛋白BicA | 分子动力学模拟 | NA | 全原子分子动力学模拟 | NA | 分子动力学模拟数据 | 超过1毫秒的模拟数据 |
| 116 | 2025-02-06 |
Recent trends in the elucidation of complex triterpene biosynthetic pathways in horticultural trees
2025-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae254
PMID:39802733
|
综述 | 本文综述了园艺树木中三萜类化合物的化学多样性及其生物合成途径，并介绍了用于发现、表征和优化这些途径的集成设计-构建-测试-学习（DBTL）管道 | 本文强调了合成生物学在揭示三萜类化合物生物合成途径中的重要作用，并提出了跨学科合作的机会 | 园艺树木中三萜类化合物的生物功能和机制尚未完全明确，且缺乏可扩展的生产系统 | 探讨园艺树木中三萜类化合物的生物合成途径及其在可持续发展中的应用 | 园艺树木中的三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | DBTL（设计-构建-测试-学习）管道 | NA | NA | NA |
| 117 | 2025-02-06 |
Artificial miRNAs and target-mimics as potential tools for crop improvement
2025-Jan, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01550-0
PMID:39901962
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综述 | 本文综述了人工miRNAs（amiRNAs）和靶标模拟物在作物改良中的潜在应用，探讨了其在植物基因表达调控和作物抗逆性提升中的作用 | 提出了利用人工miRNAs和靶标模拟物调控基因表达以增强作物抗逆性和抗病性的新方法，并探讨了其在合成生物学中的应用 | 文章主要基于现有研究进行综述，未涉及具体实验验证，且对amiRNAs和STTMs的实际应用挑战分析较为有限 | 探讨人工miRNAs和靶标模拟物在作物改良中的应用，特别是其在增强作物抗逆性和抗病性方面的潜力 | 植物miRNAs及其调控机制，以及人工miRNAs和靶标模拟物的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 人工miRNAs（amiRNAs）、靶标模拟物（eTMs、STTMs） | NA | NA | NA |
| 118 | 2025-02-05 |
Metabolic engineering approaches for the biosynthesis of antibiotics
2025-Jan-31, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02628-2
PMID:39891166
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综述 | 本文综述了代谢工程和合成生物学在抗生素发现及其有效生产中的应用 | 探讨了代谢工程和合成生物学在开发高效酶和细胞工厂以生产现有抗生素及其衍生物和类似物方面的创新策略 | 未具体提及研究的局限性 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略振兴新抗生素的发现和开发 | 抗生素及其衍生物和类似物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 119 | 2025-02-05 |
Silk Protein Gene Engineering and Its Applications: Recent Advances in Biomedicine Driven by Molecular Biotechnology
2025, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S504783
PMID:39881670
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综述 | 本文综述了丝蛋白基因工程及其在生物医学领域的应用，重点介绍了分子生物技术在丝蛋白遗传工程中的应用 | 通过分子生物技术创新，如CRISPR-Cas9基因编辑技术、转基因表达技术和合成生物学技术，生产具有特定性能的新型丝蛋白 | NA | 探讨丝蛋白基因工程在生物医学领域的应用及其潜力 | 丝蛋白及其在药物递送系统、组织工程和再生医学中的应用 | 生物医学工程 | NA | CRISPR-Cas9, 转基因表达技术, 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 120 | 2025-02-02 |
Unravelling the aromatic symphony: redirecting bifunctional mushroom synthases towards linalool monofunctionality
2025-Jan-13, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00056-2
PMID:39883255
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研究论文 | 本文通过修改双功能蘑菇合成酶的氨基酸序列，成功提高了其底物选择性，使其更倾向于生成芳樟醇而非橙花叔醇 | 通过修改双功能蘑菇合成酶的氨基酸序列，显著提高了其底物选择性，减少了副产物的生成 | 虽然底物选择性有所提高，但未能完全实现单功能化 | 提高酶的底物选择性，设计单功能的芳樟醇合成酶 | 双功能芳樟醇/橙花叔醇合成酶（LNS） | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接模拟、分子动力学模拟 | NA | NA | 四种双功能蘑菇LNS |