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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
Multi-strategy ugt mining, modification and glycosyl donor synthesis facilitate the production of triterpenoid saponins
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1586295
PMID:40519597
|
综述 | 本文综述了三萜皂苷糖基化研究进展,重点探讨了UGT酶的挖掘、改造及糖基供体合成策略 | 整合多组学技术与合成生物学平台进行UGT高通量筛选,结合定向进化与理性设计进行酶功能改造 | NA | 提高三萜皂苷的生产效率和应用潜力 | UDP-糖基转移酶(UGTs)和三萜皂苷 | 合成生物学 | NA | 多组学方法(基因组学、转录组学、代谢组学)、系统发育分析、PSPG基序分析 | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 工程微生物 | 代谢途径优化 | 医药、营养补充剂 |
| 102 | 2025-10-05 |
Microbial electrosynthesis meets synthetic biology: Bioproduction from waste feedstocks
2025, Biotechnology notes (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.biotno.2025.05.001
PMID:40519649
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综述 | 本文探讨合成生物学如何促进微生物电合成技术发展,实现利用废弃物原料进行生物生产 | 将微生物电合成与合成生物学相结合,通过工程化改造微生物提升电子传递效率和代谢通路性能 | NA | 推动可持续化学品生产和脱碳技术发展 | 电活性微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 微生物电合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 电活性微生物 | 电子传递通路, 代谢通路 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 103 | 2025-10-05 |
Engineering of Vesicular Stomatitis Virus (VSV) for Modulating Cell Death and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_15
PMID:40515910
|
综述 | 本章全面概述了水疱性口炎病毒(VSV)的工程技术,重点关注通过整合促凋亡基因XAF1增强抗肿瘤免疫效果的策略 | 利用合成生物学技术将促凋亡基因XAF1精准整合到VSV基因组中,增强其诱导肿瘤细胞死亡的能力 | NA | 通过病毒工程技术增强VSV在抗肿瘤免疫和其他治疗领域的疗效 | 水疱性口炎病毒(VSV)基因组和肿瘤细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传学 | NA | 促凋亡基因XAF1整合到VSV基因组 | 医学 |
| 104 | 2025-10-05 |
Engineering of the WSN Strain for Investigating Antiviral and Antitumor Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4615-1_18
PMID:40515913
|
研究论文 | 本文介绍了基于甲型流感病毒反向遗传系统对H1N1毒株WSN进行基因工程改造的方法及其应用前景 | 开发了WSN毒株的基因工程方法,为研究抗病毒和抗肿瘤免疫提供了新工具 | NA | 研究基因工程流感病毒在抗病毒免疫和肿瘤免疫治疗中的应用 | H1N1流感病毒WSN毒株 | 合成生物学 | 流感 | 反向遗传学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 反向遗传系统 | NA | 条件控制遗传元件 | 医学 |
| 105 | 2025-10-05 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
|
研究论文 | 开发了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用合成生物学技术在大肠杆菌中实现安全信息存储和传输 | 将DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态相结合,通过咖啡因浓度和温度调控信息传输,并具备温度敏感的自毁机制 | 多次传输后菌株存活率快速下降,可能影响长期传输稳定性 | 开发安全可控的微生物信息存储和传输系统 | 工程化大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、DNA存储技术 | NA | DNA编码信息 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 咖啡因降解通路、温度敏感自毁机制、条件生长控制系统 | 信息安全、数据存储 |
| 106 | 2025-10-05 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
|
综述 | 本文全面综述了黄酮类化合物的生物合成、调控机制及产量提升策略,并提出了整合合成生物学与人工智能的可持续生产新路径 | 首次将植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和人工智能驱动的代谢工程进行系统性整合,为黄酮类化合物生产提出创新路线图 | NA | 探索黄酮类化合物生物合成的潜力及产量提升策略 | 黄酮类化合物的生物合成途径、调控机制和运输过程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、人工智能 | NA | 代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 黄酮类化合物生物合成途径 | 医药,营养,化妆品 |
| 107 | 2025-10-05 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
|
研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行封装 | 首次通过无细胞表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并实现300 µg/mL的特定产量 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构,传统表达系统无法充分表达该蛋白 | 开发跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达方法 | FGFR3-TACC3融合蛋白(受体酪氨酸激酶疾病变异体) | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE),SMA共聚物封装 | NA | 蛋白功能数据 | NA | 无细胞表达系统 | 无细胞系统 | NA | 医学 |
| 108 | 2025-10-05 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
|
研究论文 | 通过随机矩阵理论分析较大网络的雅可比矩阵,揭示图灵模式在生物系统中出现的概率及其最优网络规模 | 发现图灵模式的出现概率高于预期,且最稳健的图灵网络存在仅包含少量分子物种的最优规模 | NA | 分析复杂基因调控通路中图灵模式的形成机制 | 基因调控网络和图灵模式 | 系统生物学 | NA | 随机矩阵理论 | 图灵激活-抑制模型 | NA | NA | NA | NA | 图灵网络 | 合成生物学 |
| 109 | 2025-10-05 |
Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857
PMID:40496019
|
综述 | 探讨人工智能如何优化噬菌体疗法以应对抗菌素耐药性威胁 | 将人工智能与合成生物学相结合,推动下一代合成噬菌体的遗传优化设计 | NA | 通过人工智能方法改进噬菌体疗法的开发流程 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用机制 | 机器学习 | 抗菌素耐药性感染 | 人工智能方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌 | NA | 医学 |
| 110 | 2025-10-05 |
Application of bifidobacterium in tumor therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1551924
PMID:40469191
|
综述 | 总结双歧杆菌在肿瘤成像和治疗中的最新进展,探讨其作用机制、工程策略和临床应用 | 利用双歧杆菌的厌氧特性实现肿瘤靶向,并通过合成生物学技术改造为具有治疗功能的微机器人 | NA | 探索双歧杆菌在肿瘤治疗中的应用潜力 | 双歧杆菌及其工程化改造 | 合成生物学 | 肿瘤 | 细菌工程、分子成像 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 双歧杆菌 | 药物或基因递送系统、肿瘤微环境调节 | 医学 |
| 111 | 2025-10-05 |
Plant-based secondary metabolites as natural remedies: a comprehensive review on terpenes and their therapeutic applications
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587215
PMID:40458805
|
综述 | 本文全面综述了植物来源的萜类化合物及其治疗应用 | 系统阐述萜类化合物的生物化学特性、植物化学性质及其在代谢疾病中的药理活性 | 对特定生物活性物质的作用机制理解尚不完整 | 阐明萜类化合物在代谢疾病中的生物化学特性和药理活性 | 植物来源的萜类化合物 | 天然产物研究 | 代谢疾病 | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、化妆品、营养保健品 |
| 112 | 2025-10-05 |
Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S507322
PMID:40433121
|
综述 | 本文综述了基于合成生物学的超声控制系统在声遗传学和气囊泡技术中的最新进展与应用 | 系统总结了超声热效应和机械效应作为主要触发源,实现工程化细胞在靶向组织中进行声热或声机械遗传修饰的新策略 | NA | 深入理解超声效应与工程化细胞技术设计、组成和应用之间的关系 | 声遗传学技术和气囊泡技术 | 生物医学工程 | 癌症 | 超声控制技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程化细胞 | 声热启动子开关、声热瞬时受体电位通道、声机械激活 | 医学 |
| 113 | 2025-10-05 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
|
研究论文 | 开发了一个包含生物合成关键经济指标(滴度、速率和产量)的综合知识库BioTRY | 首个专门收集生物合成TRY原始研究数据的数据库 | NA | 评估发酵过程的经济可行性 | 生物合成过程中的滴度、速率和产量数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物合成数据 | >5,000种生化物质、>3,800个菌株和52,000个TRY条目 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 114 | 2025-10-05 |
CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00632
PMID:39680738
|
综述 | 本文全面综述了过去五年开发的大片段DNA整合方法,特别关注新兴的CRISPR相关技术 | 重点关注新兴的CRISPR转座酶和CRISPR重组酶策略,及其革新复杂疾病基因疗法的潜力 | 现有大片段基因整合技术面临效率低、脱靶效应和高成本等挑战 | 开发能够精确插入千碱基大小DNA片段的高效工具,支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用 | 大DNA片段的整合技术 | 合成生物学 | 遗传疾病 | CRISPR基因编辑, HDR, CRISPR转座酶, CRISPR重组酶 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 哺乳动物细胞 | 大片段DNA整合 | 医学, 工业生物技术 |
| 115 | 2025-10-05 |
Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00551
PMID:39754601
|
研究论文 | 本研究通过调控核糖体结合位点和宿主环境来优化遗传开关电路性能 | 将宿主生物重新概念化为合成生物学工具箱中的重要组成部分,系统探索了底盘设计空间作为工程变量的价值 | 仅测试了9种RBS组合和3种宿主环境,设计空间探索仍有限 | 研究如何通过宿主环境和RBS调控来精细调节遗传电路特性 | 遗传开关电路及其在三种不同宿主环境中的表现 | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | 性能指标数据 | 27个电路变体(9种RBS组合×3种宿主环境) | NA | 三种不同的宿主生物(具体未指明) | 遗传开关电路,具有可调节的信号强度、诱导剂敏感性和耐受性 | 工业生物技术 |
| 116 | 2025-10-05 |
ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00697
PMID:39754602
|
研究论文 | 本研究通过在PURE系统中整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统,扩展了无细胞蛋白质合成的能力 | 开发了基于丙酮酸的新ATP再生途径,可与现有肌酸系统协同工作,将mCherry蛋白产量提高78% | 需要高初始磷酸盐缓冲液浓度(约10 mM),但未明确说明对其他蛋白质合成的影响 | 工程化改造PURE系统以增强ATP再生能力和蛋白质合成效率 | PURE无细胞蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成,ATP再生系统 | NA | 生化实验数据 | 多批次自制PURE系统和商业PURExpress系统 | Gibson Assembly | NA | 基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生代谢途径 | 合成生物学,合成细胞构建 |
| 117 | 2025-10-05 |
Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00618
PMID:39757539
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研究论文 | 本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统,用于延长无细胞系统中蛋白质合成的反应寿命和提高产量 | 使用商业组件构建简单易组装的中尺度透析系统,在PURE无细胞系统中实现了长达12.5天的连续蛋白质合成 | 未明确说明系统的可扩展性和成本效益分析 | 解决无细胞系统反应寿命短和产量低的问题 | PURE无细胞系统和绿色荧光蛋白(GFP) | 合成生物学 | NA | 透析技术、周期性补料交换 | NA | 蛋白质产量数据 | NA | PURE无细胞系统 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 118 | 2025-10-05 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法揭示了CYP722A在独脚金内酯生物合成进化中的关键作用 | 发现CYP722A是CYP722C的进化前体,能将CLA转化为非经典独脚金内酯16-OH-CLA,并证明其植物激素功能 | NA | 探究种子植物中独脚金内酯生物合成的进化机制 | 独脚金内酯生物合成途径中的细胞色素P450酶CYP722A和CYP722C | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 独脚金内酯生物合成途径 | 农业 |
| 119 | 2025-10-05 |
Synthetic biology design principles enable efficient bioproduction of Heparosan with low molecular weight and low polydispersion index for the biomedical industry
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf006
PMID:40396182
|
研究论文 | 利用合成生物学原理设计生物分子控制器,在细菌中精确调控肝素糖的生物合成 | 开发了基于生物传感器的生物分子控制器,能够检测肝素糖前体并精细调控聚合过程 | NA | 实现低分子量和低多分散指数的肝素糖的精确生物合成 | 肝素糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物传感器技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 生物分子控制器,包含前体检测生物传感器和基因表达调控系统 | 医药 |
| 120 | 2025-10-05 |
Transforming non-conventional yeasts into key players in biotechnology: advances in synthetic biology applications
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1600187
PMID:40384783
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综述 | 本文综述了合成生物学技术在开发非常规酵母生物技术应用方面的最新进展 | 系统总结了非常规酵母合成生物学工具开发的最新突破,包括新型遗传元件、基因组编辑工具和代谢通路工程 | NA | 探讨如何利用合成生物学技术开发非常规酵母在生物制造领域的应用潜力 | 非常规酵母菌种 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢通路工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非常规酵母 | 代谢通路工程、遗传回路设计 | 工业生物技术,能源,环境 |