合成生物学相关文章
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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-01-29 |
Delivery of Encapsulated Intelligent Engineered Probiotic for Inflammatory Bowel Disease Therapy
2025-Jan, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403704
PMID:39629555
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研究论文 | 本文开发了一种用于封装基因工程细菌的粘液微球凝胶（MM）递送系统，旨在检测和治疗肠炎 | 创新点在于开发了一种新型的MM递送系统，该系统具有外部粘液涂层和内部高度生物相容性的聚丝氨酸改性藻酸盐微球，有效保护工程细菌在胃中的恶劣环境，并显著提高益生菌的肠道粘附性 | NA | 研究目的是开发一种有效的递送系统，用于治疗炎症性肠病 | 研究对象是基因工程细菌和炎症性肠病模型 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 122 | 2025-01-28 |
Deciphering the biosynthetic pathway of triterpene saponins in Prunella vulgaris
2025-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17220
PMID:39868644
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研究论文 | 本研究通过综合筛选方法，结合系统发育分析、基因表达评估、代谢组-转录组关联和共表达分析，鉴定了参与夏枯草三萜皂苷生物合成的候选基因 | 首次精确鉴定了夏枯草中参与三萜皂苷生物合成的九个候选基因，并揭示了这些基因源于全基因组复制事件，为植物代谢研究提供了新的视角 | 研究主要基于生物信息学预测和异源表达验证，缺乏在夏枯草原生环境中的功能验证 | 解析夏枯草中三萜皂苷的生物合成途径 | 夏枯草（Prunella vulgaris）中的三萜皂苷生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、基因表达评估、代谢组-转录组关联分析、共表达分析、异源表达和功能表征 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、转录组数据 | NA |
| 123 | 2025-01-25 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Jan-23, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
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综述 | 本文探讨了植物、病毒和携带细菌内共生体的节肢动物媒介之间复杂的关系，以及内共生体在植物病毒疾病传播中的关键作用 | 提出了通过基因改造、生物技术进步和RNA干扰等技术靶向特定内共生体，以控制病毒传播和疾病进展的创新方法 | 文章未明确提及具体的研究限制 | 研究目的是开发可持续的植物疾病管理策略，特别是通过调控植物-病毒-媒介相互作用 | 研究对象包括植物、病毒、节肢动物媒介及其内共生体 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 基因改造、CRISPR/Cas9、RNA干扰、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 124 | 2025-01-25 |
Long oligos: direct chemical synthesis of genes with up to 1728 nucleotides
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06958g
PMID:39759933
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研究论文 | 本文报道了在自动化合成仪上直接合成长达800个核苷酸的绿色荧光蛋白基因和1728个核苷酸的29 DNA聚合酶基因的方法 | 通过在平滑表面而非传统多孔支持物上进行合成，以及使用捕获聚合（CBP）方法从复杂混合物中分离全长寡核苷酸，实现了长寡核苷酸直接化学合成的突破 | NA | 开发一种能够直接化学合成超长寡核苷酸的方法，以应用于合成生物学、基因编辑和蛋白质工程等领域 | 绿色荧光蛋白基因和29 DNA聚合酶基因 | 合成生物学 | NA | 直接化学合成 | NA | NA | NA |
| 125 | 2025-01-24 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
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研究论文 | 本文探讨了在设计的卷曲螺旋肽组装体中肽交换的动态特性，并开发了一种荧光报告检测方法 | 开发了一种简便的荧光报告检测方法，用于研究肽交换，并提出了两种设计策略以提高不同寡聚体的正交性 | 研究主要关注肽交换的动态特性，对其他动态特性的探讨较少 | 研究设计的卷曲螺旋肽组装体中的肽交换动态特性 | 卷曲螺旋肽组装体，包括从二聚体到七聚体的不同寡聚体 | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测 | NA | 实验数据 | NA |
| 126 | 2025-01-23 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在Chlamydomonas reinhardtii中实现了外源基因表达的快速、稳定和可逆调控 | 首次在微藻中应用DD/Shield-1系统，展示了其作为分子开关的潜力，并成功构建了基因编辑蛋白LbCas12a的诱导表达菌株 | 研究中未提及该系统在其他微藻或更广泛生物系统中的适用性 | 开发一种在Chlamydomonas reinhardtii中调控外源基因表达的新方法 | Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统 | NA | NA | NA |
| 127 | 2025-01-23 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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研究论文 | 本文讨论了在合成细胞中从头构建机械敏感信号通路的最新进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中，创建新的机械敏感信号通路 | NA | 研究机械转导的机制，并开发新的生物技术应用 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2025-01-23 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
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研究论文 | 本文介绍了一种利用平行生物反应器快速绘制特定产物形成速率、特定底物利用速率和特定生长速率之间生长耦合关系的方法，并以甲羟戊酸为例进行了研究 | 使用平行生物反应器快速评估生产力和生长速率与产物收率系数之间的生长耦合关系，并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究中形成的乙酸盐可能会减缓生长并在下游处理中引起问题 | 研究生物制造的经济可行性，特别是通过工程微生物从可再生原料生产化合物 | 甲羟戊酸的生产 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 实验数据 | 使用大肠杆菌BW25113进行实验 |
| 129 | 2025-01-22 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Jan-15, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为hDIRECT的平台，用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性，以支持基于细胞的疗法 | 开发了hDIRECT平台，利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂来控制细胞因子的活性，实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用 | 研究仍处于概念验证阶段，尚未进行大规模临床试验 | 开发一种能够控制细胞因子活性的平台，以支持基于细胞的疗法 | 细胞因子（IL-2、IL-6和IL-10）及其活性控制 | 合成生物学 | 癌症免疫疗法 | 人类蛋白酶及其抑制剂的使用 | NA | 蛋白质数据 | NA |
| 130 | 2025-01-21 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
|
研究论文 | 本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于可编程基因表达 | 通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合，进化出高活性变体，显著提高了蛋白质表达水平 | 未提及具体局限性 | 开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统，提高合成生物学应用的多样性和效率 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化技术 | NA | NA | NA |
| 131 | 2025-01-15 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
|
review | 本文综述了甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性，并利用drugCIPHER算法预测其药理活性，同时回顾了利用合成生物学方法生物制造甘草三萜类化合物的进展和策略 | 本文不仅总结了甘草三萜类化合物的整体特性，还预测了其药理活性，并提出了利用合成生物学方法进行生物制造的新策略 | 本文主要集中于甘草三萜类化合物的综述，可能未涵盖所有相关研究的最新进展 | 研究甘草三萜类化合物的结构、药理活性及其生物制造方法 | 甘草三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | drugCIPHER算法 | NA | NA |
| 132 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
|
研究论文 | 本文描述了使用模块化克隆系统MoClo组装多基因构建体的协议 | 利用MoClo系统进行多基因构建体的组装，通过一系列的一锅法组装步骤实现，提高了构建效率并促进了构建体变体库的生成 | NA | 开发一种高效的多基因构建体组装方法，以支持生物学研究和合成生物学 | 多基因构建体 | 合成生物学 | NA | MoClo系统 | NA | DNA序列 | NA |
| 133 | 2025-01-15 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于创建SBOL表示的软件工具，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个软件工具，用于创建SBOL表示的构建计划，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 未提及具体限制 | 开发一种软件工具，用于标准化Golden Gate组装元数据的表示 | 合成生物学中的DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA |
| 134 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
|
研究论文 | 本文详细介绍了使用Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件的协议 | 提供了克隆MoClo标准部件的详细步骤，包括定义部件类型、设计引物、PCR扩增、Golden Gate克隆和测序 | 对于大型标准部件，需要先克隆子部件作为中间体，增加了复杂性 | 开发高效的DNA组装方法以促进合成生物学领域的研究 | MoClo标准部件（level 0模块） | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、PCR | NA | DNA序列 | NA |
| 135 | 2025-01-15 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的方法 | 利用声波分配器在nL范围内转移液体，实现了Golden Gate克隆反应的微型化和并行化，减少了塑料废物和试剂使用 | NA | 提高Golden Gate克隆反应的效率和可持续性 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
| 136 | 2025-01-15 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的纳米孔扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了一种名为DuBA.flow的工作流程，用于从单个菌落到最终易于解读的测序报告的全过程验证 | NA | 验证Golden Gate组装的高阶组合复杂性 | Golden Gate组装的高阶组合 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 137 | 2025-01-15 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源的Python包，用于自动化Golden Gate组装，以减少复杂DNA构建的失败率、资源消耗和培训需求 | AssemblyTron提供了低成本的自动化解决方案，使用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人，扩展了Golden Gate组装的能力，包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变体库组装和模块化克隆索引质粒库组装 | NA | 提高Golden Gate组装的自动化水平，降低复杂DNA构建的失败率和资源消耗 | Golden Gate组装技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装，易错PCR | NA | NA | NA |
| 138 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并提出了辅助寡核苷酸设计的G-GArden工具 | 提出了基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并开发了辅助设计的G-GArden工具 | NA | 开发一种快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的小RNA（sRNAs） | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 139 | 2025-01-15 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种无细胞转录和翻译（TXTL）系统中快速生成线性DNA模板的Golden-Gate辅助工作流程 | 通过Golden-Gate组装和PCR扩增，无需克隆步骤，快速生成功能性DNA模板，显著加速合成生物学中的设计-构建-测试-学习周期 | 未提及具体实验样本量或数据集的详细信息 | 开发一种快速生成线性DNA模板的方法，用于无细胞转录和翻译系统中的基因调控元件和电路测试 | 线性DNA模板，包括启动子、核糖体结合位点（RBS）、编码序列和终止子等基本遗传部分 | 合成生物学 | NA | Golden-Gate组装、PCR扩增 | NA | DNA序列 | NA |
| 140 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中用于转基因表达的遗传盒的组装 | 使用Golden Gate克隆和模块化克隆（MoClo）标准化合成生物学工作流程，简化了遗传元件的组装 | NA | 开发快速高效的克隆策略，用于组装新的转录单元或整个通路 | 单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆（MoClo） | NA | NA | NA |