合成生物学相关文章
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当前共找到 135 篇文献，本页显示第 121 - 135 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-12-13 |
Network for knowledge Organization (NEKO): An AI knowledge mining workflow for synthetic biology research
2025-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.11.006
PMID:39580108
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研究论文 | 介绍了一种名为NEKO的工作流程，利用大型语言模型Qwen从科学文献中提取知识，生成知识图谱并提供全面的文献总结 | NEKO增强了大型语言模型的能力，提供更具体、可操作的知识，并支持灵活的本地部署，使科学基础模型更易于访问 | NA | 开发一种能够从科学文献中提取知识并生成知识图谱的工作流程，以增强大型语言模型的能力 | 科学文献中的知识提取和知识图谱生成 | 机器学习 | NA | 大型语言模型（LLM） | LLM Qwen | 文本 | NA |
| 122 | 2024-12-12 |
Blue-Purple evaluation: Chromoproteins facilitate the identification of BioBrick compatibility
2025-Jan, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28862
PMID:39402779
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研究论文 | 本文介绍了一种利用色蛋白（chromoproteins）在单锅反应中评估BioBrick兼容性的新方法BP（Blue/Purple, Ban/Pick） | 提出了BP评估方法，通过可视化和量化蓝紫色大肠杆菌菌落的比率来验证BioBrick构建的兼容性 | NA | 开发一种简单、快速且可靠的方法来评估BioBrick的兼容性 | BioBrick的兼容性评估 | 合成生物学 | NA | 色蛋白（chromoproteins） | NA | 菌落图像 | 使用了包含抗毒素-毒素对ccdA-ccdB、裂解蛋白E或异源蛋白sfGFP的BioBrick组装体进行验证 |
| 123 | 2024-12-12 |
Sphingomonas arvum sp. nov.: A promising microbial chassis for high-yield and sustainable zeaxanthin biomanufacturing
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127938
PMID:39509922
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研究论文 | 本研究通过基因组挖掘和液相色谱/质谱分析，鉴定了新型类胡萝卜素玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010的生物合成基因簇，并验证了其高产玉米黄质的能力 | 首次报道了Sphingomonas arvum strain BN140010这一新型菌株，其玉米黄质产量在Sphingomonas属中最高，为可持续的玉米黄质生物制造提供了新的微生物底盘 | NA | 寻找新的微生物和遗传底盘，以满足全球对高附加值玉米黄质的快速增长需求 | 新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、液相色谱/质谱分析 | NA | 基因组数据、质谱数据 | 1株新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010 |
| 124 | 2024-12-12 |
Microbial chemotaxis in degradation of xenobiotics: Current trends and opportunities
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127935
PMID:39476517
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综述 | 本文综述了微生物趋化性在降解异生物质中的作用，重点介绍了基于趋化性的细菌和微流控生物传感器在环境监测中的应用 | 本文探讨了基因组学、蛋白质组学和合成生物学在理解和控制微生物趋化性降解异生物质过程中的新趋势，并提出了开发具有定制趋化反应和降解能力的工程微生物的潜力 | 尽管在解码细菌趋化性调控机制方面取得了显著突破，但仍存在一些知识空白需要解决，以充分利用其在环境中的污染物感知和降解潜力 | 探讨微生物趋化性在降解异生物质中的作用及其在环境监测中的应用 | 微生物趋化性在降解农药、工业化学品和药品等异生物质中的作用 | NA | NA | 基因组学、蛋白质组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 125 | 2024-11-30 |
EcNikA, a versatile tool in the field of artificial metalloenzymes
2025-Jan, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2024.112740
PMID:39426332
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综述 | 本文综述了使用EcNikA（一种镍转运蛋白）在合成生物学中设计人工金属酶作为替代催化剂的多重优势 | 重点讨论了从头活性位点重建的策略，并详细介绍了蛋白质骨架对人工活性位点及其最终催化性能的影响 | NA | 探讨EcNikA在人工金属酶设计中的应用及其在合成生物学中的潜力 | EcNikA蛋白及其在人工金属酶设计中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 126 | 2024-11-20 |
Developing filamentous fungal chassis for natural product production
2025-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131703
PMID:39477163
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综述 | 本文综述了利用丝状真菌作为底盘细胞生产天然产物的发展现状 | 强调了丝状真菌作为底盘细胞的优势，包括其天然的次级代谢产物生产能力和丰富的生物合成前体 | NA | 总结丝状真菌作为底盘细胞的最新进展，并展望其未来在工程和应用中的发展 | 丝状真菌底盘细胞的开发和应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 127 | 2024-11-17 |
Z/E configuration controlled by a Taxus sesquiterpene synthase facilitating the biosynthesis of (3Z,6E)-α-farnesene
2025-Jan, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2024.114304
PMID:39424093
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研究论文 | 研究通过基因挖掘和分子动力学模拟，揭示了Taxus wallichiana中的TwSTPS1酶在合成(3Z,6E)-α-farnesene中的催化机制 | 首次鉴定出负责合成(3Z,6E)-α-farnesene的主要酶TwSTPS1，并通过分子动力学模拟和突变分析揭示了其催化机制 | NA | 揭示植物萜烯合酶在特定构型产物合成中的控制机制 | Taxus wallichiana中的TwSTPS1酶及其在(3Z,6E)-α-farnesene合成中的作用 | NA | NA | 基因挖掘、分子动力学模拟、突变分析 | NA | NA | NA |
| 128 | 2024-11-15 |
Fast acoustic droplet ejection based on annular array transducer
2025-Jan, Ultrasonics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.ultras.2024.107448
PMID:39243532
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研究论文 | 本文介绍了一种基于环形阵列换能器的高频声波液滴喷射技术，用于加速液体转移 | 提出了一种高频环形阵列换能器，无需机械移动即可实现动态轴向聚焦，从而提高液体转移效率 | NA | 开发一种新型声波液滴喷射系统，以提高液体转移的效率和精度 | 声波液滴喷射技术及其在合成生物学、基因分型和药物发现等领域的应用 | NA | NA | 声波液滴喷射技术 | NA | NA | 5个元素的环形阵列换能器，频率为10 MHz，设计焦距为26-32 mm |
| 129 | 2024-11-06 |
Development of a green Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of plant-derived sesquiterpene (-)-α-bisabolol
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.006
PMID:39493337
|
研究论文 | 研究开发了一种绿色酵母细胞工厂，用于可持续生产植物来源的倍半萜(-)-α-红没药醇 | 通过plmDCA算法设计了(-)-α-红没药醇合成酶BOS的六个突变位点，其中F324Y突变表现出优异性能，产品产量提高了73% | NA | 开发可持续生产植物来源倍半萜(-)-α-红没药醇的酵母细胞工厂 | (-)-α-红没药醇的合成酶BOS及其突变体 | 生物工程 | NA | 合成生物学策略 | NA | NA | NA |
| 130 | 2024-11-06 |
CRISPR/Cas12a-based genome editing for cyanophage of Anabeana sp
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.09.011
PMID:39493338
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a的简便方法，用于高效编辑蓝细菌噬菌体基因组 | 首次成功应用CRISPR/Cas12a技术编辑蓝细菌噬菌体基因组，并生成了具有不同抑制蓝细菌生长能力的突变体 | 研究仅限于特定蓝细菌噬菌体和基因，未涵盖所有蓝细菌噬菌体种类 | 开发一种高效的方法来编辑蓝细菌噬菌体基因组，以控制蓝细菌水华 | 蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L)的基因组 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas12a | NA | 基因组 | 两个蓝细菌噬菌体A-1(L)和A-4(L) |
| 131 | 2024-09-25 |
Toward Increasing the Credibility of RNA Design
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_9
PMID:39312141
|
研究论文 | 本文提出了一种扩展的RNA设计协议，包括序列评估和使用3D结构进行分析，以提高RNA设计的准确性 | 本文的创新点在于引入3D结构预测和分析步骤，以提高RNA设计的准确性 | NA | 提高RNA设计的可信度和准确性 | RNA序列及其二级和三级结构 | 生物信息学 | NA | RNA设计算法 | NA | RNA序列 | NA |
| 132 | 2024-09-24 |
A Computational Approach for Designing Synthetic Riboswitches for Next-Generation RNA Therapeutics
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_13
PMID:39312145
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计下一代RNA治疗药物的合成核开关的计算方法 | 本文提出了利用计算技术设计合成核开关，以实现精确的基因工程控制和靶向药物递送 | NA | 探索计算技术在设计合成核开关中的应用，以推动RNA治疗药物的发展 | 合成核开关的设计及其在RNA治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | 计算技术 | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-09-24 |
SHAPE Probing to Screen Computationally Designed RNA
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4079-1_12
PMID:39312144
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研究论文 | 本文提出了一种实验和分析工作流程，用于快速筛选大量设计的RNA序列 | 开发了shapemap tools软件套件，用于定制化分析SHAPE-MaP技术产生的大量RNA结构数据 | NA | 开发高效的RNA设计流程，支持合成生物学和基于RNA疗法的未来发展 | 设计的RNA序列及其结构特性 | 合成生物学 | NA | SHAPE-MaP | NA | RNA序列 | 数千个RNA序列 |
| 134 | 2024-09-11 |
Systematic metabolic engineering enables highly efficient production of vitamin A in Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.004
PMID:39247801
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研究论文 | 本文通过系统代谢工程在酿酒酵母中高效生产维生素A | 首次通过挖掘不同来源的β-胡萝卜素15,15'-单(双)加氧酶，并结合表达两种具有不同催化机制但催化性能相当的同工酶，显著提高了维生素A的产量 | NA | 研究在酿酒酵母中高效生产维生素A的方法 | 维生素A的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-09-05 |
Engineering artificial cross-species promoters with different transcriptional strengths
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.08.003
PMID:39224149
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research paper | 本研究通过分析和验证自然内源启动子的基本结构，并通过策略性整合和合理修改启动子基序，开发了一系列在五种菌株（原核和真核）中具有转录活性的跨物种启动子 | 本研究提出了一种新的策略，即组合使用原核和真核启动子的关键元素，为未来的启动子工程提供了新的见解和方法 | NA | 扩大合成生物学启动子工具包的通用性，确保在各种微生物底盘细胞中的适应性和定制化 | 跨物种启动子的开发和验证 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | 五种菌株（原核和真核） |