合成生物学相关文章
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当前共找到 111 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-22 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-03, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米氮素吸收、同化和再动员的遗传与分子调控机制，旨在提高氮素利用效率 | 整合了根际微生物组对氮素利用效率的影响以及植物-微生物互作机制，并倡导利用遗传多样性和合成生物学进行综合研究 | NA | 提高玉米氮素利用效率，促进可持续农业发展 | 玉米 | NA | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 2 | 2026-02-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调控基因表达的潜力，特别是在ALOX5基因中的应用 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应来优化核糖开关功能，并开发了能够切换5-LO野生型与缺失外显子13的异构体表达的新型核糖开关剪接概念 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型 | 研究合成核糖开关在调控哺乳动物细胞中基因表达和异构体切换的潜力与优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因（ALOX5）在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控、核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | 使用HEK293细胞系 | 合成核糖开关、基因编辑 | 哺乳动物细胞（HEK293） | 四环素核糖开关控制的盒式外显子系统，用于调控选择性剪接和异构体切换 | 医学、合成生物学 |
| 3 | 2026-02-24 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-03, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 本研究通过构建合成转录因子，系统表征了Komagataella phaffii中Mxr1转录因子的九个氨基酸反式激活结构域（9aaTADs）的功能与机制 | 首次在K. phaffii锌指转录因子中全面鉴定21个推测的9aaTADs，发现其中10个具有功能，并揭示其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化机制激活转录 | 研究主要基于Δmxr1突变株的体外功能验证，体内生理环境下的调控网络及与其他转录因子的相互作用尚未完全阐明 | 探究K. phaffii中Mxr1转录因子的9aaTADs结构域的功能特性与分子机制 | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母）的Mxr1转录因子及其9aaTADs结构域 | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因敲除株功能互补、靶基因转录激活分析 | NA | 分子生物学实验数据 | 21个推测的9aaTADs结构域（包括TAD A-V） | 合成生物学设计（合成转录因子构建） | Komagataella phaffii（巴斯德毕赤酵母） | 由Mxr1ZF DNA结合域与串联9aaTADs组成的合成转录因子系统 | 工业生物技术 |
| 4 | 2026-02-21 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 本文展示了如何将细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚物界面结合，以控制液-液相分离隔室的性质 | 首次将细菌微区室壳蛋白与由内在无序域形成的蛋白质凝聚物界面结合，开发出可完全编码的涂层系统，用于控制凝聚物的表面性质和稳定性 | 涂层形成依赖于pH和蛋白质浓度，且一旦形成后不与稀相交换，可能限制了动态调控的灵活性 | 开发用于合成细胞和细胞器的可控液-液相分离隔室系统 | 细菌微区室壳蛋白（来自Haliangium ochraceum的BMC-H）与工程化RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、液-液相分离技术 | NA | NA | NA | 基因融合、蛋白质工程 | NA | 蛋白质涂层系统（BMC-H-T2变体在液滴表面形成稳定涂层，防止液滴合并） | 合成生物学、生物医学工程 |
| 5 | 2026-02-06 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
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综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、靶向甲基化或去甲基化的主要技术，以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 系统总结了利用融合蛋白（如锌指蛋白、TALE或CRISPR/dCas9与甲基化酶结合）实现靶向甲基化的新兴技术，并展望了通过鉴定更多细菌甲基化酶特性来开发新工具的潜力 | NA | 探讨细菌DNA甲基化酶作为分子和合成生物学工具的最新发展与应用 | 细菌DNA甲基化酶及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 靶向甲基化技术、DNA组装技术 | NA | NA | NA | CRISPR/dCas9, TALEN, 锌指蛋白 | 细菌, 作物植物 | NA | 遗传工程, 细菌学, 生物技术, 农业 |
| 6 | 2025-12-22 |
Towards sustainable freshwater systems through plant synthetic biology engineering plants for sustainability
2025-Mar, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100009
PMID:41415721
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研究论文 | 本文探讨利用植物合成生物学工程化植物，以过滤海水和储存淡水，应对气候变化和淡水需求 | 提出结合自然设计原则和先进合成生物学工具（如计算蛋白质设计和定向进化），工程化植物平台以可持续方式提供淡水 | NA | 通过植物合成生物学开发可持续淡水系统，减少气候变化影响 | 植物作为合成生物学平台 | NA | NA | 计算蛋白质设计，定向进化 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 植物 | 工程化植物以过滤海水和储存淡水，结合自然组件和适应性特性 | 环境 |
| 7 | 2025-10-05 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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综述 | 本文系统综述了细胞感知代谢与环境变化及适应性调控的机制与应用前景 | 首次从跨膜/传感器蛋白、适应性调控机制和应用场景三个维度对细胞代谢与环境适应调控进行系统梳理 | NA | 探讨细胞感知代谢变化和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 微生物细胞的代谢调控与环境适应机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 8 | 2025-10-05 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨利用非哺乳动物酶类作为延缓衰老和年龄相关疾病的潜在工具 | 提出利用异源物种酶类逆转年龄相关代谢变化的新策略，而非直接靶向自身基因 | NA | 探索通过代谢调控延缓衰老和年龄相关疾病的替代策略 | 来自低等生物的影响年龄相关代谢过程的酶类 | 合成生物学 | 老年疾病 | 酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996
PMID:40032480
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综述 | 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸(DHA)的当前生物技术，涵盖菌株改良、发酵优化、产品提取和安全应用等方面 | 系统总结了裂殖壶菌DHA生产的多方面技术挑战，并提出整合多种育种技术、人工智能优化发酵、纳米颗粒包装改善稳定性等创新解决方案 | NA | 探索提高裂殖壶菌DHA生产效率和产品质量的技术方法，推动其在食品和健康领域的应用发展 | 产油海洋原生生物裂殖壶菌及其生产的二十二碳六烯酸(DHA) | 工业生物技术 | NA | 发酵技术、合成生物学、纳米颗粒包装技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 裂殖壶菌 | DHA合成途径、结构化脂质构建 | 食品,医药 |
| 10 | 2025-10-05 |
Bacterial Autonomous Intelligent Microrobots for Biomedical Applications
2025 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.70011
PMID:40235203
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综述 | 本文综述了细菌自主智能微机器人在生物医学领域的传感控制机制、工程设计与应用前景 | 提出利用合成生物学技术将具有自主运动智能的细菌改造为可实现闭环控制的微机器人 | NA | 探讨细菌微机器人在生物医学领域的闭环控制机制与应用发展 | 细菌微机器人的传感控制系统与生物医学应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 细菌 | 输入传感器、信号响应与记忆系统 | 医学 |
| 11 | 2025-10-05 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
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研究论文 | 本文报道了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13，其具有独特的四组氨酸和羧化赖氨酸配位中心及非典型催化机制 | 发现具有独特四组氨酸-羧化赖氨酸配位中心的非典型非血红素铁双加氧酶，揭示了修饰Kcx在促进C-C键断裂中的关键作用 | NA | 研究BTG13相关金属酶的配位模式和催化机制及其在合成生物学中的应用潜力 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | NA | NA | 分子动力学模拟、量子化学计算、系统发育分析 | NA | NA | NA | NA | 多种生物体 | NA | 合成生物学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 开发了一种基于液液相分离的合成细胞器，能够将代谢信号转化为基因转录调控 | 首次将液液相分离原理应用于构建代谢物响应型合成细胞器，实现了代谢信号与转录调控的可逆连接 | NA | 构建具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液液相分离技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | 代谢物响应型转录调控回路，基于丙酮酸依赖性阻遏蛋白PdhR的相分离行为 | 传感器材料, 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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综述 | 本文探讨如何整合合成生物学与人工智能技术开发新一代基因编辑器 | 将人工智能和机器学习技术应用于基因编辑酶的发现与设计，通过计算策略优化传统蛋白质工程方法 | 未提及具体实验验证数据和应用案例 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | 基因编辑酶（如CRISPR-Cas系统） | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas技术、理性设计、诱变筛选、定向进化 | AI/ML模型 | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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综述 | 本文综述了CRISPR基因工具包在提升枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能方面的最新进展 | 系统总结了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中基因编辑、转录调控和酶活性调节等方面的关键工具设计进展 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 提升枯草芽孢杆菌作为工业生物底盘的生产性能 | 枯草芽孢杆菌及其CRISPR基因编辑工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑技术 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 基因编辑工具、转录调控系统、酶活性调节模块 | 工业生物技术 |
| 15 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略高效生产天然色素及其非天然衍生物的最新进展 | 开发了多样化天然色素以生产具有增强特性和扩展色谱的非天然衍生物的策略 | 未明确说明具体技术实施中的技术瓶颈或具体产量数据 | 通过合成生物学方法提高天然色素及其衍生物的生产效率和性能 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品,化妆品,医药,材料 |
| 16 | 2025-10-05 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 本研究开发了基于V-K型CRISPR相关转座酶(CAST)的系统，实现治疗性基因在人类细胞基因组中的可编程整合 | 首次将来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统重新用于人类细胞基因组编辑，相比传统Cascade系统仅需单个Cas12k效应蛋白 | 脱靶事件虽罕见但可在特定基因组区域重复出现 | 开发更简化的CRISPR基因编辑工具用于治疗应用 | 人类细胞基因组 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | 基因组数据 | 多种人类细胞类型 | CRISPR-Cas | 人类细胞 | 基因整合系统 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 17 | 2025-10-05 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造与人工智能、大模型等信息技术融合的发展方向和新兴技术方法 | NA | 为生物制造相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造相关的数据库、知识库和大语言模型 | 生物信息学 | NA | 系统生物学、合成生物学、人工智能、大语言模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件智能设计方面的应用与进展 | 整合人工智能与合成生物学、高通量技术，开发更高效的核酸元件设计工具 | 生物系统复杂性高且缺乏高度量化的训练数据，限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨人工智能在生物制造中核酸元件设计优化的应用 | 生物制造中的核酸功能元件 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法、高通量技术 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | 启动子、核糖体结合位点、终止子及其组合设计 | 工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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综述 | 本文全面总结了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 首次系统阐述AI技术如何通过分析高通量测序数据革新sgRNA设计，并拓展至CRISPR阵列注释和Cas蛋白修饰领域 | NA | 探讨人工智能技术在CRISPR-Cas系统优化中的应用价值 | CRISPR-Cas系统及其相关组件（sgRNA、Cas蛋白等） | 机器学习 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 测序数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 20 | 2025-10-05 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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综述 | 本文综述了机器学习在合成生物学元件和遗传电路设计中的应用现状与挑战 | 系统分析机器学习算法在合成生物学元件设计中的典型应用，并提出解决当前挑战的潜在方案 | NA | 探讨机器学习如何支持合成生物学元件和遗传电路的智能化设计 | 合成生物学元件（合成启动子、RNA调控元件、转录因子）和简单遗传电路 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |