合成生物学相关文章
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当前共找到 144 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-04-04 |
Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation
2025-Mar-31, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712
PMID:40174852
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research paper | 该研究通过合理设计末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）的引物识别位点，实现了RNA引物的高效延伸 | 通过工程化改造TdT酶的引物识别位点，将RNA延伸活性从20%提升至90%以上，并开发了两种可行的微量microRNA检测方法 | NA | 开发能够高效延伸RNA引物的工程化TdT酶，用于核酸的从头合成和合成生物学应用 | 末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）及其RNA引物延伸能力 | 合成生物学 | NA | 酶工程化改造 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-04-04 |
TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites
2025-Mar-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf102
PMID:40131780
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研究论文 | 介绍了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC，用于快速鉴定转基因植物的T-DNA整合位点 | 开发了一种低成本、高通量的T-DNA整合位点定位技术，相比传统方法更快速高效 | 未提及该方法在不同植物物种中的适用性限制 | 开发一种快速鉴定转基因植物T-DNA整合位点的方法，以促进作物育种和植物合成生物学 | 转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦 | 植物分子生物学 | NA | Tn5转座酶介导的片段化、NGS测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 65个转基因拟南芥株系和多个其他作物转基因株系 |
| 3 | 2025-04-04 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-Mar-21, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
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research paper | 该论文探讨了通过合成生物学方法生产新型和已灭绝天然产物的途径 | 利用基因敲除和基因交换技术，成功分离出多种新型代谢产物，并优化了生产菌株以提高特定代谢物的产量和稳定性 | 研究主要集中在细菌和真菌的代谢途径，可能不适用于其他生物系统 | 探索和优化天然产物的生物合成途径，以生产新型和改良的代谢产物 | 细菌和真菌的代谢途径及其产物 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因交换、异源表达 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | 多种细菌和真菌菌株 |
| 4 | 2025-04-04 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
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评论 | 探讨合成生物学领域的历史、现状及其潜在的双重用途风险 | 回顾合成生物学的发展历史，指出当前对其新颖性的认知实际上是记忆快速丧失的结果，并强调该领域在病原体重构和功能增益实验中的潜在风险 | 未提出具体的解决方案或政策建议来应对合成生物学的双重用途风险 | 分析合成生物学的历史发展及其潜在的双重用途风险，特别是病原体重构和功能增益实验的危险 | 合成生物学领域，特别是合成DNA和病原体的基因组序列 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | 基因组序列数据 | NA |
| 5 | 2025-04-04 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升 | 探讨了人工智能在生物化学中的新兴研究前沿，包括数据分析和分子建模等 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 评估人工智能在生物化学中的应用及其潜力 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用和药物发现 | 生物化学 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、基于AI的分子建模 | AlphaFold | 复杂数据集 | NA |
| 6 | 2025-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Mar-25, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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研究论文 | 本文探讨了利用高通量突变筛选技术理解、抑制和设计膜转运蛋白的方法 | 提出了高通量筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力，特别是在理解多特异性转运的分子基础和设计抑制剂方面的创新 | 高通量筛选方法在膜转运蛋白领域的应用仍不广泛，影响力有限 | 研究膜转运蛋白的功能和多特异性转运的分子基础，以及如何利用这些知识设计抑制剂和工程化转运蛋白 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学与生物技术 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA |
| 7 | 2025-04-03 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
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综述 | 本文综述了生物制造领域中数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域与人工智能、大模型和高性能计算等信息技术融合的发展方向与新兴技术方法 | 未具体说明所涵盖研究的样本量或数据规模 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术应用 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
| 8 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文综述了人工智能在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用及其进展 | 总结了AI在生物制造中核酸元件设计方面的最新工具和应用案例 | 生物系统的复杂性及缺乏高度量化的训练数据限制了AI在生物制造中的应用 | 探讨AI如何加速生物制造中核酸元件的设计与优化 | 生物制造中的核酸元件（如启动子、核糖体结合位点、终止子等） | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
| 9 | 2025-04-03 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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综述 | 本文全面总结了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 人工智能技术，尤其是机器学习，通过分析高通量测序数据，革新了sgRNA设计，提高了编辑效率并高精度预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用 | CRISPR-Cas系统 | 合成生物学 | NA | 高通量测序 | 机器学习 | 测序数据 | NA |
| 10 | 2025-04-03 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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review | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的应用，并讨论了当前挑战及未来趋势 | 探讨了机器学习如何从传统试错方法转向标准化、智能化的工程设计，为合成生物学提供创新支持 | 未具体说明机器学习模型在复杂遗传电路设计中的实际效果及数据需求 | 推动合成生物学从经验驱动向智能工程设计的范式转变 | 合成生物学部件（如启动子、RNA调控元件、转录因子）及简单遗传电路 | machine learning | NA | 机器学习算法 | NA | 生物数据 | NA |
| 11 | 2025-04-03 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
|
review | 本文全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 首次从跨膜蛋白和传感器蛋白、自然细胞的适应调控机制以及应用场景三个方面系统性地综述了细胞代谢和环境适应的调控 | 缺乏对具体实验数据和案例的深入分析 | 探讨细胞感知代谢和环境变化的机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-04-03 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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综述 | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型重建与优化的最新研究进展 | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用，为高精度构建细胞生理代谢网络模型提供了新机遇 | 未提及具体模型在实际应用中的性能局限或验证不足 | 为定量合成生物学和系统生物学研究提供计算生物学工具支持 | 细胞生理代谢网络模型（包括GEMs、动力学模型和ecGEMs） | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型构建技术、人工智能技术 | GEMs、动力学模型、ecGEMs | 代谢网络数据 | NA |
| 13 | 2025-04-03 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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review | 本文综述了转录因子(TF)基生物传感器在计算模拟和人工智能辅助下的工程与优化最新进展 | 结合计算模拟和人工智能技术优化转录因子基生物传感器，相比传统工具更准确快速 | NA | 总结转录因子基生物传感器的工程与优化方法，促进新型生物传感器的发展 | 转录因子基生物传感器 | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
| 14 | 2025-04-03 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的实时监测、人工智能优化策略和数字孪生技术的进展 | 整合了在线监测技术、人工智能驱动的动态优化和数字孪生技术，为发酵过程的精确优化和高效放大提供了新范式 | 未提及具体实验验证或案例研究的局限性 | 实现发酵过程的精确优化和高效放大，推动生物制造向更高效率、智能化和可持续发展方向发展 | 发酵过程的实时监测、智能控制和优化策略 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、人工智能、数字孪生 | 人工神经网络、支持向量机、遗传算法 | 实时传感数据 | NA |
| 15 | 2025-04-03 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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评论 | 本期特刊探讨了人工智能驱动的生物制造的机遇、挑战和发展现状 | 综述了人工智能在生物制造领域的创新应用，包括智能设计、构建生物部件、电路和人工细胞，以及智能生物过程控制与优化 | NA | 把握人工智能驱动的生物制造的创新与发展 | 生物制造领域的技术创新和产业发展 | 生物制造 | NA | 人工智能 | NA | 生物大数据 | NA |
| 16 | 2025-04-03 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
|
研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 该方法在早期指数生长期观察到最高转化效率，转化效率高达每细胞每微克质粒DNA 4.4×10转化体，并开发了使用少量培养物和质粒DNA获得大量转化体的方法 | NA | 开发一种高效且稳健的最小细胞转化方法，以促进最小细胞的遗传工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 少于0.2 mL培养物，约1×10-10细胞和10 ng质粒DNA |
| 17 | 2025-04-02 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-Mar-31, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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research paper | 本研究开发了一种自动化方法，用于大规模生产具有治疗应用潜力的合成细胞（SCs），并通过机器学习和机器人技术优化了生产过程 | 结合机器人液体处理系统和自动化组织解离器，显著提高了合成细胞的生产效率和规模，同时利用AI图像分析实现了高质量、高通量的SC表征 | 研究主要聚焦于蛋白质表达的SCs，可能不适用于其他类型的合成细胞 | 开发自动化方法以提高合成细胞的生产效率和规模，用于治疗应用 | 合成细胞（SCs） | synthetic biology | NA | robotic liquid handling system, automated tissue dissociator, AI-based image analysis | AI-based image analysis | image | mice administered with large-scale luciferase-expressing SCs |
| 18 | 2025-04-02 |
Unraveling the potential of bioengineered microbiome-based strategies to enhance cancer immunotherapy
2025-Mar-28, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128156
PMID:40158322
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综述 | 本文综述了生物工程微生物组策略在增强癌症免疫治疗中的潜力 | 探讨了通过合成生物学方法改造微生物以增强抗肿瘤活性和免疫治疗效果的创新策略 | 存在遗传稳定性、有效肿瘤定植和潜在安全性问题等挑战 | 探索微生物组在癌症免疫治疗中的作用及其工程化应用的潜力 | 胃肠道和肿瘤内的微生物群落 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-04-02 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
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research paper | 该研究探讨了不同来源的PARPs（聚ADP-核糖聚合酶）的调节域（REG）和催化域（CAT）是否可以交叉互补组装成功能性嵌合体，并研究了这些嵌合体的酶活性和结合特性 | 首次展示了不同PARPs的REG和CAT可以跨物种交叉互补组装成功能性嵌合体，并揭示了atPARP2的CAT具有独特的互补能力 | 研究仅限于体外实验，尚未在活细胞中验证这些嵌合体的功能 | 探究PARPs调节域和催化域的交叉互补性及其分子机制 | 来自哺乳动物（hPARP1和hPARP2）、植物（atPARP2）和细菌（haPARP）的PARPs蛋白 | 分子生物学 | NA | 酶活性测定、结合研究 | NA | 生化实验数据 | 多种PARP蛋白的REG和CAT结构域 |
| 20 | 2025-04-01 |
Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts
2025-Mar-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02692-2
PMID:40155940
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综述 | 本文总结了特定异黄酮的药理特性、其生物合成途径以及在工程酵母中生产异黄酮的技术策略 | 利用合成生物学和先进的生物技术策略，实现生物活性异黄酮的环保生产 | NA | 探讨异黄酮及其前体的生物合成及其在食品、制药和化妆品工业中的应用 | 植物源性异黄酮及其前体 | 合成生物学 | NA | 工程酵母生物合成 | NA | NA | NA |