合成生物学相关文章
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当前共找到 122 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-08 |
Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications
2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996
PMID:40032480
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综述 | 本文综述了利用产油原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸（DHA）的当前生物技术，包括菌株改良、发酵优化、DHA油提取策略、安全评估和稳定性维护方案以及在食品中的应用 | 系统总结了影响裂殖壶菌DHA生产的因素，并提出了改进菌株、优化发酵过程、提高DHA产品氧化稳定性、掩盖DHA气味缺陷以及利用合成生物学开发DHA结构脂质的新方法 | 裂殖壶菌DHA产品的广泛应用受到菌株性能、发酵参数、产品收获和提取策略、安全性和稳定性维护以及健康和功能特性应用限制的影响 | 探索裂殖壶菌DHA的生产技术并推动其在食品和健康领域的应用发展 | 产油海洋原生生物裂殖壶菌及其生产的二十二碳六烯酸（DHA） | 生物技术 | NA | 菌株改良技术、发酵优化、纳米颗粒包装技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-06-26 |
Bacterial Autonomous Intelligent Microrobots for Biomedical Applications
2025 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.70011
PMID:40235203
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综述 | 本文综述了细菌自主智能微型机器人在生物医学领域的传感与控制机制、工程应用及未来发展方向 | 提出利用具有自主运动能力和智能特性的细菌作为微型机器人实现闭环控制，拓展了合成生物学工具箱在生物医学领域的应用 | 未提及具体临床转化面临的挑战和现有系统的性能局限 | 探讨细菌微型机器人在生物医学诊断和治疗中的应用潜力 | 具有自推进和自主智能特性的工程化细菌微型机器人 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-06-22 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
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research paper | 本文介绍了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13，其具有独特的配位中心和催化机制 | 发现了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13，具有由四个组氨酸和一个羧化赖氨酸(Kcx)组成的独特配位中心，并通过分子动力学模拟和量子化学计算揭示了其催化蒽醌C-C键断裂的非传统步骤 | NA | 研究非血红素铁依赖性双加氧酶的多样性和催化机制 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | 生物化学 | NA | 分子动力学模拟, 量子化学计算, 系统发育分析 | NA | 生化数据 | NA |
| 4 | 2025-06-06 |
[Advances in the regulation of microbial cell metabolism and environmental adaptation]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240937
PMID:40170316
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综述 | 本文从三个角度全面综述了细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 系统性地总结了细胞感知代谢和环境变化的机制及其应用，为合成生物学领域的创新提供了理论基础 | 缺乏对细胞代谢和环境适应调控机制的系统性综述 | 探讨细胞代谢和环境适应的调控机制及其在合成生物学中的应用 | 细胞的代谢和环境适应机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-05-29 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器，将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器，实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 未提及具体应用场景或体内实验验证 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液-液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA |
| 6 | 2025-05-29 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计，提高活性、特异性和免疫原性预测 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | synthetic biology | NA | AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution | machine learning models | biological sequence data | NA |
| 7 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用，包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能，使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 8 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-05-18 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 该研究展示了如何将紧凑型V-K CAST系统重新用于人类细胞基因组中的可编程DNA整合 | 利用来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统，实现了人类细胞基因组中治疗相关转基因的安全整合 | 脱靶事件虽罕见但可重复出现在特定基因组区域 | 开发一种无需双链断裂即可实现大片段DNA可编程整合的基因组编辑工具 | 人类细胞基因组 | 基因组编辑 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | type V-K CAST | DNA序列数据 | 多种人类细胞类型 |
| 10 | 2025-05-17 |
[Databases, knowledge bases, and large models for biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240653
PMID:40170304
|
综述 | 本文综述了生物制造领域数据库、知识库和大语言模型的最新研究进展 | 探讨了生物制造领域的发展方向、挑战及新兴技术方法 | 未提及具体的技术实现细节或实验验证 | 为相关领域的科学研究提供指导和启发 | 生物制造领域的信息技术整合 | 生物信息学 | NA | 人工智能、大模型、高性能计算 | 大语言模型 | 生物信息学数据 | NA |
| 11 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of nucleic acid elements in biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240599
PMID:40170308
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综述 | 本文总结了生物制造中使用的各种核酸元件、基于AI算法开发的预测和设计这些元件的工具，以及AI在生物制造中的应用案例 | 通过整合AI与合成生物学及高通量技术，展望开发更高效的核酸元件设计工具，加速AI在生物制造中的应用 | 由于生物系统的复杂性和缺乏高度量化的训练数据，AI在生物制造中的应用仍有限 | 探讨AI在生物制造中核酸元件设计与优化中的应用 | 核酸元件（如启动子、核糖体结合位点、终止子等） | 合成生物学 | NA | 高通量技术 | AI算法 | 序列数据 | NA |
| 12 | 2025-05-17 |
[Artificial intelligence-assisted design, mining, and modification of CRISPR-Cas systems]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240865
PMID:40170307
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review | 本文综述了人工智能技术在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用进展 | 利用AI技术（特别是机器学习）分析高通量测序数据，优化sgRNA设计，提高编辑效率并准确预测脱靶效应 | NA | 探讨人工智能在CRISPR-Cas系统设计、挖掘和修饰中的应用及其对基因编辑效率和精度的提升 | CRISPR-Cas系统及其相关蛋白 | synthetic biology | NA | high-throughput sequencing | machine learning | sequencing data | NA |
| 13 | 2025-05-17 |
[Machine learning-aided design of synthetic biological parts and circuits]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240605
PMID:40170311
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综述 | 本文回顾了机器学习在合成生物学部件和遗传电路设计中的常用算法及其典型应用，并讨论了主要挑战和潜在解决方案 | 探讨了机器学习如何从经验驱动的试错模式转向标准化、智能化的工程方法，以支持合成生物学部件和遗传电路的智能设计 | 未具体说明机器学习算法在复杂遗传电路设计中的实际效果和局限性 | 推动合成生物学从传统试错方法向智能化工程设计转变 | 合成生物学部件（如合成启动子、RNA调控元件和转录因子）和简单遗传电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 生物数据 | NA |
| 14 | 2025-05-17 |
[Advances in reconstruction and optimization of cellular physiological metabolic network models]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240966
PMID:40170315
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review | 本文系统介绍了细胞生理代谢网络模型的最新研究进展，包括基因组尺度代谢模型（GEMs）、动力学模型和酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs） | 总结了人工智能在动力学模型和酶约束模型开发中的应用，为细胞生理代谢网络模型的高精度构建提供了新机遇 | NA | 系统阐明基因型与生长表型之间的关系，为精确表征细胞生理代谢活动和绿色生物制造提供计算生物学工具 | 细胞生理代谢网络模型 | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢模型（GEMs）、动力学模型、酶约束基因组尺度代谢模型（ecGEMs） | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-05-17 |
[Intelligent design of transcription factor-based biosensors]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240603
PMID:40170310
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综述 | 本文全面总结了在计算模拟和人工智能辅助下，基于转录因子的生物传感器的工程和优化最新进展 | 利用计算模拟和人工智能技术，提高了生物传感器设计的准确性和速度 | NA | 优化基于转录因子的生物传感器性能 | 转录因子（TF） | 合成生物学 | NA | 计算模拟、人工智能、蛋白质结构预测、配体结合模拟、机器学习 | 机器学习模型 | 突变数据 | NA |
| 16 | 2025-05-17 |
[Optimization of fermentation processes in intelligent biomanufacturing: on online monitoring, artificial intelligence, and digital twin technologies]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250032
PMID:40170318
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综述 | 本文综述了智能生物制造中发酵过程的优化，重点探讨了在线监测技术、人工智能优化策略和数字孪生应用的最新进展 | 整合了在线监测技术、AI驱动的动态优化和数字孪生技术，为发酵过程的实时优化和规模化提供了新范式 | 未提及具体实施案例或实验验证结果 | 实现发酵过程的精确优化和高效规模化 | 发酵过程的实时传感与智能控制 | 智能生物制造 | NA | 在线监测技术、机器学习（如人工神经网络和支持向量机）、遗传算法 | 数字孪生、多尺度模型（如细胞代谢动力学和反应器流体力学） | 实时传感数据 | NA |
| 17 | 2025-05-17 |
DNA/RNA hybrids avoid channel gating that leads to the continued packaging of numerous hybrids into the phi29 protein shell
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf242
PMID:40193705
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research paper | 该研究探讨了phi29 DNA包装马达在包装双链DNA和RNA/DNA杂交体时的效率差异及其机制 | 发现RNA/DNA杂交体由于缺乏通道门控机制而比双链DNA更高效地被包装 | 通道门控的具体机制仍不明确 | 研究phi29 DNA包装马达对不同核酸结构的包装效率及其机制 | phi29 DNA包装马达及其包装的双链DNA和RNA/DNA杂交体 | 分子生物学 | NA | 单通道电生理学和蔗糖梯度超速离心 | NA | NA | NA |
| 18 | 2025-05-16 |
Advances in synthesizing plant-derived isoflavones and their precursors with multiple pharmacological activities using engineered yeasts
2025-Mar-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02692-2
PMID:40155940
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综述 | 本文综述了利用工程酵母合成植物源性异黄酮及其前体的进展，包括其药理活性、生物合成途径及生产技术策略 | 总结了合成生物学和先进生物技术策略在环境友好型生物活性异黄酮生产中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏对当前技术局限性的深入讨论 | 探讨利用工程酵母可持续高效生产异黄酮的方法 | 植物源性异黄酮及其前体，如大豆苷元和染料木素 | 合成生物学 | NA | 工程酵母生物合成 | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-05-16 |
TTLOC: A Tn5 transposase-based approach to localize T-DNA integration sites
2025-Mar-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf102
PMID:40131780
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Tn5转座酶的T-DNA整合位点定位方法TTLOC，用于高效、低成本地检测转基因植物的T-DNA整合位点 | 开发了基于Tn5转座酶的新型T-DNA整合位点定位技术，相比传统方法具有操作简便、高通量、成本低等优势 | 未明确说明该方法在复杂基因组中的定位准确率或与其他方法的直接比较数据 | 开发高效检测转基因植物T-DNA整合位点的技术，以促进作物育种和植物合成生物学研究 | 转基因拟南芥、水稻、大豆、番茄、马铃薯和小麦 | 植物分子生物学 | NA | Tn5转座酶介导的基因组DNA片段化，NGS测序 | NA | 基因组测序数据 | 65个转基因拟南芥株系和多种转基因作物（水稻、大豆等） |
| 20 | 2025-05-16 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨了利用其他物种的酶来逆转与年龄相关的代谢变化，以延缓衰老和年龄相关疾病的策略 | 提出利用非哺乳动物酶作为延缓衰老和年龄相关疾病的未开发资源 | NA | 探讨延缓衰老和年龄相关疾病的新策略 | 来自低等生物的一组酶，这些酶影响与年龄相关过程的代谢参数 | 合成生物学 | 老年病 | NA | NA | NA | NA |