合成生物学相关文章
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当前共找到 144 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-03-28 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力，特别是在ALOX5基因中外显子跳跃和异构体转换的应用 | 提出了一种新型核糖开关控制剪接的概念，能够将5-LO野生型转换为缺乏外显子13的异构体（5-LOΔ13），并通过基因特异性内含子和外显子序列的上下文适应提高了调控的动态范围 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常限于特定基因或细胞类型，且非适应性构建体的引入可能导致基因开关功能的意外结果 | 探索合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过选择性剪接调控基因表达的潜力及其优化策略 | ALOX5基因和HEK293细胞 | 合成生物学 | NA | 选择性剪接调控 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 42 | 2025-03-28 |
Outlook on Synthetic Biology-Driven Hydrogen Production: Lessons from Algal Photosynthesis Applied to Cyanobacteria
2025-Mar-20, Energy & fuels : an American Chemical Society journal
IF:5.2Q1
DOI:10.1021/acs.energyfuels.4c04772
PMID:40134520
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综述 | 本文探讨了合成生物学驱动的氢生产前景，借鉴了藻类光合作用的经验应用于蓝藻 | 利用合成生物学技术精确调控PSII活性，避免传统营养剥夺方法的副作用，优化氢生产效率 | NA | 开发可持续的清洁能源生产方法，推动碳中和未来 | 蓝藻（特别是PCC 6803菌株） | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 43 | 2025-03-28 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Mar-06, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 本文开发并验证了一种RT-qPCR方法，用于测量依赖于环境的核酶活性，通过引入寡核苷酸抑制核酶活性来提高测量的准确性 | 提出了一种新的RT-qPCR方法，通过抑制核酶活性来准确测量依赖于环境的核酶活性 | 该方法在RNA提取和反转录过程中可能诱导核酶切割，导致活性测量不准确 | 验证新的核酶序列和基于核酶的生物技术 | 自切割核酶 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR | NA | RNA | 一组已知在体外具有环境依赖性切割的自切割RNA |
| 44 | 2025-03-27 |
Introduction: Synthetic Biology
2025-Mar-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00158
PMID:40134283
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-03-27 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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research paper | 该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 揭示了酒精依赖性半萜途径中第一个酶PhoN的广泛特异性，以及芳香族异戊二烯基转移酶的宽泛底物特异性，成功在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | NA | 拓展异戊二烯类化合物的化学空间，推动合成生物学发展 | 酒精依赖性半萜途径及其相关酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成 | NA | NA | NA |
| 46 | 2025-03-27 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Mar-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
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research paper | 该研究提出了一种控制去膜化膜化凝聚微滴的策略，以增强其功能性和动态重构能力 | 通过静电竞争触发去膜化过程，实现了凝聚微滴结构的可控重构，并开发了具有层次和非对称膜结构的凝聚微滴原细胞 | 研究未涉及该技术在复杂生物环境中的应用效果评估 | 开发具有动态和多样化结构的凝聚微滴原细胞，以扩展其在合成生物学和生物技术中的应用 | 膜化和去膜化凝聚微滴 | 合成生物学 | NA | 静电竞争触发去膜化 | NA | NA | NA |
| 47 | 2025-03-27 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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research paper | 该研究提出了一种高效的无疤痕体外组装方法，用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 开发了一种基于Gibson等温组装的迭代体外组装方法，能够无疤痕地组装复杂且高度重复的百kb级IGHV基因片段 | 未提及该方法在其他类型基因组片段组装中的适用性 | 开发大规模人类基因组片段的高效体外组装技术 | 人类免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | 百kb级的IGHV基因片段 |
| 48 | 2025-03-27 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Mar-24, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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综述 | 本文综述了聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)在废物管理中的作用及其研究进展 | 提供了关于PHBDs的全面更新，包括其胞外和胞内形式的结构、功能及其在生物降解PHB废物中的潜在应用 | 未涉及PHBDs在实际废物处理中的大规模应用案例研究 | 探讨PHBDs在生物可降解塑料废物管理中的应用潜力 | 聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)及其产生微生物 | 环境生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
| 49 | 2025-03-26 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-Mar-25, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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research paper | 该研究通过基因组测序分析了极度濒危的橙腹鹦鹉在历史和当代样本中的遗传多样性丧失情况 | 首次使用长读长参考基因组和历史样本追踪该物种的长期基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降 | 样本量相对较小（历史样本16个，当代样本19个） | 评估橙腹鹦鹉的遗传多样性丧失情况及其对物种生存的影响 | 橙腹鹦鹉（Neophema chrysogaster） | 基因组学 | 病毒/细菌/真菌感染 | 长读长基因组测序、重测序 | NA | 基因组数据 | 历史样本16个（最早1829年），当代样本19个 |
| 50 | 2025-03-26 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-Mar-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 介绍了一款名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释 | ProteoSeeker通过自动化关键步骤，降低了计算复杂性，使专业和非专业用户都能进行高效且全面的宏基因组分析 | 未提及具体的技术限制或性能瓶颈 | 加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新 | 微生物群落中的蛋白质 | 生物信息学 | NA | 宏基因组学 | NA | 宏基因组数据 | NA |
| 51 | 2025-03-26 |
Reprogramming Komagataella phaffii for a Robust Chassis toward Efficient De Novo Biosynthesis of (-)-α-Bisabolol
2025-Mar-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11904
PMID:40131269
|
研究论文 | 本研究通过优化MVA途径和融合法尼基二磷酸合酶与比沙波醇合酶，成功在Komagataella phaffii中实现了高效生产(-)-α-比沙波醇 | 通过工程化辅因子NADPH、分子伴侣和转录因子，构建了强健的(-)-α-比沙波醇生产菌株KB-30，并在5 L补料分批发酵罐中实现了32.8 g/L的最高产量 | 未明确提及研究的局限性 | 开发一种高效、可持续的微生物细胞工厂生产(-)-α-比沙波醇 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、代谢工程 | NA | NA | 5 L补料分批发酵罐 |
| 52 | 2025-03-25 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
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research paper | 提出了一种名为KD-FRET的方法，用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的解离常数（K） | 开发了KD-FRET方法，首次实现了在活细菌细胞中直接定量测量PPIs的解离常数，并解决了传统方法中因光谱串扰导致的假阳性信号问题 | 未提及该方法在其他类型细胞（如真核细胞）中的适用性 | 开发一种在活细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用强度的新方法 | 活大肠杆菌细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移（FRET） | NA | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及多种异源和同源蛋白质对 |
| 53 | 2025-03-25 |
A mediator-free sonogenetic switch for therapeutic protein expression in mammalian cells
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf191
PMID:40114374
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研究论文 | 介绍了一种名为SUPER的新型基因开关，通过超声波在哺乳动物细胞中介导无、非侵入性且直接的蛋白质表达调控 | 开发了无需介质的超声波响应基因开关SUPER，利用哺乳动物ROS感应系统实现蛋白质表达的精确控制 | 目前仅在体外和小鼠模型中验证，尚未进行人体试验 | 开发一种非侵入性、时空精确的基因表达调控工具用于细胞和基因治疗 | 哺乳动物细胞（包括人类间充质干细胞系）和1型糖尿病小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 超声波刺激技术 | KEAP1/NRF2信号通路模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型（包括hMSC-TERT细胞系）和1型糖尿病小鼠模型 |
| 54 | 2025-03-24 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-Mar-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本文展示了细菌细胞通过自然存在的生物分子活性触发原子转移自由基反应，从而启动多种丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸单体的聚合反应 | 揭示了细菌细胞作为活体催化剂用于聚合物生产的未开发潜力，并展示了基于原子转移自由基聚合引发剂的细胞内聚合作为一种生物正交工具在细胞工程和合成生物学中的应用 | NA | 研究细菌细胞内自由基聚合反应的机制及其在细胞工程和合成生物学中的应用 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱、凝胶渗透色谱、荧光显微镜、流式细胞术 | NA | 化学数据、荧光数据 | NA |
| 55 | 2025-03-23 |
Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Mar-21, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70095
PMID:40116553
|
研究论文 | 本文开发了一种在Chlamydomonas reinhardtii中操纵倍性的策略，使用非干扰性抗生素选择标记，并通过流式细胞术精确测量不同倍性菌株的基因组大小 | 开发了一种新的倍性操纵策略，适用于野外分离株，扩展了合成生物学在C. reinhardtii中的应用 | 新形成的三倍体和四倍体显示出快速非整倍体化的迹象 | 研究倍性变化对植物进化的影响 | Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 基因组数据 | 北美野外分离株 |
| 56 | 2025-03-23 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Mar-21, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展，包括生物信息学、实验和分析工具的发展，天然产物在细菌、真菌和植物中的异源表达，以及生物合成途径的工程策略 | 本文综合了合成生物学在天然产物生物合成中的多方面应用，特别是异源表达和生物合成途径工程的最新进展 | 本文主要关注合成生物学的应用，可能未涵盖传统天然产物研究的所有方面 | 探讨合成生物学在天然产物生物合成中的应用和发展 | 天然产物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、异源表达、组合生物合成 | NA | NA | NA |
| 57 | 2025-03-23 |
Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua
2025-Mar-21, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03471-4
PMID:40116969
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研究论文 | 本文通过补充缺失的酶和优化黄酮6羟化酶，成功在青蒿中实现了异源合成灯盏花素 | 首次在青蒿中通过合成生物学方法成功合成灯盏花素，并优化关键酶以提高产量 | 研究未涉及灯盏花素在青蒿中的长期稳定性和大规模生产的可行性 | 通过合成生物学方法在青蒿中生产稀缺药物 | 青蒿和灯盏花素 | 合成生物学 | 脑血管疾病, 心血管疾病 | 合成生物学, 基因工程 | NA | NA | NA |
| 58 | 2025-03-23 |
Engineering highly active nuclease enzymes with machine learning and high-throughput screening
2025-Mar-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101236
PMID:40081373
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TeleProt的机器学习框架，该框架结合进化和实验数据来设计多样化的蛋白质库，并用于提高降解慢性伤口生物膜的核酸酶的催化活性 | TeleProt框架在无需先验实验数据的情况下，能够设计出高性能的初始库，并在多轮高通量实验后，找到了比定向进化（DE）显著更好的顶级酶 | NA | 优化酶在新型化学环境中的功能，以提高其催化活性 | 核酸酶 | 机器学习 | 慢性伤口 | 高通量筛选 | 机器学习框架 | 基因型-表型酶活性数据 | 55,000种核酸酶变体 |
| 59 | 2025-03-23 |
Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery
2025-Mar-19, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01198h
PMID:40104998
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综述 | 本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用 | 探讨了无细胞合成生物学在天然产物生物合成中的创新应用，包括快速原型设计和新型抗菌剂的发现 | 讨论了无细胞合成生物学与全细胞和化学生产路线相比的优缺点 | 研究无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用 | 天然产物，包括核糖体肽、非核糖体肽、聚酮化合物和萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学 | NA | NA | NA |
| 60 | 2025-03-23 |
AI-driven high-throughput droplet screening of cell-free gene expression
2025-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58139-0
PMID:40108186
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DropAI的基于液滴和AI驱动的高通量筛选策略，用于优化无细胞基因表达系统 | DropAI结合微流控技术和荧光颜色编码系统，实现了高通量、经济高效的化学组合筛选，并通过机器学习模型进行优化预测 | 研究主要基于大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的无细胞系统，尚未验证在其他生物系统中的适用性 | 优化无细胞基因表达系统的组成，降低成本并提高产量 | 无细胞基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光颜色编码系统、机器学习 | 机器学习模型 | 化学组合数据、荧光信号数据 | 12种不同蛋白质 |