合成生物学相关文章
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当前共找到 122 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-05-11 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究建立了一种适用于Cupriavidus necator H16的lambda Red重组系统，用于高效的基因组编辑 | 首次在Cupriavidus necator H16中应用lambda Red重组系统，并结合电穿孔技术实现高效的基因删除和稳定基因组整合 | 研究仅验证了三个基因组位点的修改，可能需要在更多位点进行验证以证明其广泛适用性 | 开发高效的基因组编辑方法以优化Cupriavidus necator H16作为生物技术生产宿主的性能 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组系统、电穿孔、PCR | NA | 基因组数据 | 三个不同的基因组位点 |
| 42 | 2025-05-11 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
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研究论文 | 开发了在麦胚提取物中起作用的蛋白质响应性上调核糖开关（ON-riboswitches），用于构建多步基因调控级联 | 首次在真核无细胞系统中构建了复杂的基因调控级联，并成功提高了核糖开关的效率 | 初始设计的两种ON-riboswitches效率较低，且需要优化反应条件以防止表达效率降低 | 构建真核无细胞系统中的复杂基因调控电路 | 蛋白质响应性ON-riboswitches和基因调控级联 | 合成生物学 | NA | 核糖开关技术、HHR（锤头状核酶）自切割 | NA | NA | NA |
| 43 | 2025-05-11 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力及其优化方法 | 提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的适应性调整来增强核糖开关调控动态范围的新策略，并展示了将两个盒式外显子组合以增强调控效果的方法 | 合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常局限于特定基因或细胞类型 | 探索合成核糖开关通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力及其优化方法 | 人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)在HEK293细胞中的表达 | 合成生物学 | NA | 合成核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | HEK293细胞 |
| 44 | 2025-05-11 |
Review of Recent Advances in Microbial Production and Applications of Nerolidol
2025-Mar-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12579
PMID:40013722
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综述 | 本文综述了橙花叔醇（nerolidol）的生物活性、应用及其微生物生产方法的最新研究进展 | 总结了代谢工程和合成生物学策略在构建微生物细胞工厂生产橙花叔醇方面的应用 | NA | 探讨橙花叔醇在人类健康、农业和食品工业中的潜在应用及其绿色生产前景 | 橙花叔醇及其生物活性衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-05-11 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417695122
PMID:40009642
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研究论文 | 研究揭示了绿藻中双顺反子mRNA翻译的机制，通过漏核糖体扫描实现ORF2的可调翻译 | 首次在绿藻中证实漏核糖体扫描是双顺反子mRNA翻译ORF2的机制，并展示了通过调控ORF1的Kozak样序列强度可逆调节两个ORF的表达 | 研究仅针对两种绿藻，机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证 | 探究绿藻中多顺反子转录本的翻译机制 | 两种分歧绿藻（未明确命名）的双顺反子基因座 | 分子生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双荧光报告系统 | NA | 基因组数据、荧光报告数据 | 两种绿藻的高置信度手工注释双顺反子基因座数据集 |
| 46 | 2025-05-10 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
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研究论文 | 开发了一种基于Elitist Genetic Algorithm (EGA)的图形用户界面工具MultiCRISPR-EGA，用于优化多路CRISPR引导RNA阵列的设计 | 利用EGA算法优化多路gRNA阵列设计，提高了效率和特异性，并提供了实时设计进度控制的GUI界面 | 未提及实验验证结果或在实际生物系统中的性能表现 | 优化多路CRISPR引导RNA阵列设计，提高基因组编辑的效率和成本效益 | 多路CRISPR引导RNA阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | Elitist Genetic Algorithm (EGA) | 基因组数据 | NA |
| 47 | 2025-05-10 |
Intracellular protein ligation and polyprotein synthesis using an asparaginyl endopeptidase core
2025-Mar-11, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06617k
PMID:39981834
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research paper | 开发了一种利用AEP1核心片段在细胞内进行蛋白质连接和聚合的系统，实现了无需酶激活和外部连接的实时多蛋白合成 | 利用AEP1核心片段实现细胞内蛋白质连接和聚合，扩展了AEP在合成生物学和生物材料中的应用 | NA | 开发一种新型的细胞内蛋白质连接和聚合系统 | Ig结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质连接和聚合技术 | NA | NA | NA |
| 48 | 2025-05-10 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
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评论 | 本文回顾了合成生物学领域的历史，并讨论了其潜在的双重用途风险 | 指出了合成生物学领域记忆迅速丧失的现象，并强调了其潜在的双重用途风险 | 缺乏对实验室进行功能增益实验时意外风险的深入思考 | 探讨合成生物学的使用和双重用途风险 | 合成生物学领域及其相关技术 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 49 | 2025-05-10 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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review | 本文综述了肽介导的液-液相分离（LLPS）的分子机制及其在生物分子凝聚物形成中的作用 | 强调了疏水效应、静电相互作用和π-π堆积等分子间相互作用在相分离中的角色，以及环境因素如pH、温度、离子强度和分子拥挤对肽凝聚物稳定性和动态的影响 | NA | 探讨肽介导的LLPS在生物技术和医学中的潜在应用 | 肽介导的液-液相分离和生物分子凝聚物 | 生物物理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-05-10 |
Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates
2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70061
PMID:39969154
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研究论文 | 研究展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用，形成涂层以控制液-液相分离隔室的性质 | 首次展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用，形成稳定的涂层，并控制液-液相分离隔室的性质 | 涂层的形成依赖于pH和蛋白质浓度，且一旦形成后不与稀释相交换 | 探索细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相互作用，以开发合成细胞和细胞器 | 细菌微区室壳蛋白（BMC-H）和由RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体 | 合成生物学 | NA | 基因工程和蛋白质工程 | NA | 蛋白质相互作用数据 | NA |
| 51 | 2025-05-08 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
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综述 | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展，特别是在治疗应用、异源核酸（XNAs）开发及核酸病因学研究方面 | 强调了糖修饰在改善核酸性质方面的作用，特别是在治疗应用和异源核酸开发中的最新进展 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的碳水化合物修饰 | 生物化学 | NA | 核酸和碳水化合物化学、蛋白质工程、递送方法 | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-05-07 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 开发了一种高效的转化方法，显著提高了转化效率，并减少了所需的DNA和受体细胞数量 | NA | 改进最小细胞的转化方法，以促进基因工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 小于0.2 mL的培养物，约1×10^10细胞和10 ng质粒DNA |
| 53 | 2025-05-07 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略构建人工酵母群落的最新进展，特别是光遗传学在调控群落表型中的应用 | 强调了光遗传学技术在合成酵母群落中实现时空调控的创新应用 | NA | 探索合成微生物群落的构建及其在生态动力学和代谢工程中的应用 | 合成酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 54 | 2025-05-07 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
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research paper | 该研究开发了一种名为LAG-DTGC的合成基因电路，用于膀胱癌的精准治疗 | 创新性地设计了逻辑'AND'门双靶点基因电路，能够整合多个信号以实现膀胱癌细胞信号通路的全面重编程 | 目前仅进行了临床前研究，尚未进行人体试验 | 开发针对膀胱癌的精准、低毒治疗方法 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析 | 逻辑'AND'门双靶点基因电路(LAG-DTGC) | 基因表达数据 | NA |
| 55 | 2025-05-04 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
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综述 | 本文综述了聚羟基脂肪酸酯（PHAs）的碳循环过程，包括其生物合成、降解途径以及在环境和生物医学中的应用 | 提出了聚羟基脂肪酸酯碳循环（CCP）的概念，并详细描述了芳香族单体的生物合成途径、碳转化过程以及在不同环境中的降解机制 | 在实现经济高效的PHA生产和降解产物再利用方面仍存在挑战，对PHA合成和降解中的碳途径理解有限 | 探讨PHAs作为生物材料的可持续利用价值，支持全球绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯（PHAs） | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-05-04 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
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research paper | 开发了一种名为iMARS的标准化框架，用于快速设计最优的多酶结构，以提高催化效率 | iMARS框架整合了高通量活性测试和结构分析，能够预测性地设计多酶结构，显著提高催化效率 | 未明确提及框架的适用范围或潜在的生物学限制 | 提高多酶结构的催化效率，应用于绿色化学、合成生物学和生物制造 | 多酶结构及其在代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试和结构分析 | iMARS框架 | NA | NA |
| 57 | 2025-05-04 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
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研究论文 | 本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体文库，用于丰富乳酸菌启动子库并定量表征其活性 | 首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元件，为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础 | 突变体文库的特异性仅限于乳酸菌，在大肠杆菌中表现出显著差异 | 丰富乳酸菌启动子库并定量表征启动子活性，以促进代谢工程和合成生物学应用 | 乳酸菌中的P23组成型启动子 | 合成生物学 | NA | 易错PCR和dNTP类似物诱导的随机突变 | NA | 荧光强度数据 | 247个P启动子突变体 |
| 58 | 2025-05-03 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升 | 探讨了人工智能在生物化学中的当前及潜在应用，特别是在数据分析、分子建模、酶工程和代谢途径研究方面 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 评估人工智能在生物化学领域的应用及其未来潜力 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用、药物发现等 | 生物化学 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、基于AI的分子建模 | AlphaFold | 复杂数据集 | NA |
| 59 | 2025-05-03 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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review | 本文综述了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的机制和应用 | 最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制，并确定了关键催化残基如His44，这些发现有助于理解光生成过程中重要的黄素中间体的产生 | 仍存在一些挑战性问题，如实现红移发射、优化信号强度以及确定与发光物种生成相关的机制 | 深入了解LuxAB反应的机制，并探索其在生物技术和生物医学领域的应用 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 60 | 2025-05-02 |
Recent advances in synthetic biology toolkits and metabolic engineering of Ralstonia eutropha H16 for production of value-added chemicals
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108516
PMID:39793936
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综述 | 本文综述了针对Ralstonia eutropha H16的合成生物学工具包开发及其代谢工程用于高附加值化学品生产的最新进展 | 整合了最先进的遗传和基因组工程工具与高细胞密度发酵工艺，优化碳通量并扩展生物基产品组合 | NA | 开发Ralstonia eutropha H16的合成生物学工具包，并利用其代谢灵活性生产高附加值化学品 | Ralstonia eutropha H16 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因组序列、组学数据 | NA |