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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Last Decade Insights in Exploiting Marine Microorganisms as Sources of New Bioactive Natural Products
2025-Mar-07, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23030116
PMID:40137302
|
综述 | 回顾过去十年海洋微生物作为生物活性天然产物来源的研究进展 | 总结了基因组学、代谢组学和生物信息学技术创新推动的新发现,以及通过创新分离培养方法获得的稀有海洋微生物新代谢产物 | NA | 开发利用海洋微生物来源的新型生物活性天然产物 | 海洋细菌、真菌和微藻 | 天然产物发现 | NA | 基因组学、代谢组学、生物信息学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 42 | 2025-10-05 |
Engineering scutellarin biosynthesis in Artemisia annua
2025-Mar-21, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03471-4
PMID:40116969
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研究论文 | 通过在青蒿中补充缺失酶并优化黄酮6羟化酶,成功实现了野黄芩苷的异源合成 | 首次在青蒿中鉴定出野黄芩苷的两个关键前体,并通过引入来自短葶飞蓬和黄芩的高活性酶基因实现高效异源合成 | NA | 利用合成生物学方法在青蒿中生产稀缺药物野黄芩苷 | 青蒿植物和野黄芩苷生物合成途径 | 合成生物学 | 脑血管疾病,心血管疾病 | 基因工程,异源表达 | NA | NA | NA | 基因共表达 | 青蒿 | 野黄芩苷生物合成途径,包含黄酮合酶II、黄酮-7-O-葡萄糖醛酸基转移酶和黄酮-6-羟化酶 | 医药 |
| 43 | 2025-10-05 |
A mediator-free sonogenetic switch for therapeutic protein expression in mammalian cells
2025-Mar-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf191
PMID:40114374
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研究论文 | 开发了一种名为SUPER的无介质超声基因开关,可在哺乳动物细胞中实现非侵入性、时空精确的蛋白质表达调控 | 首次实现无需介质、直接利用超声诱导活性氧激活KEAP1/NRF2通路的基因表达调控系统 | 目前仅在动物模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发非侵入性、时空精确的基因表达调控技术用于细胞和基因治疗 | 哺乳动物细胞(包括人间充质干细胞系)和1型糖尿病小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 超声刺激技术、基因工程 | KEAP1/NRF2信号通路调控系统 | 基因表达数据、血糖水平数据 | 1型糖尿病小鼠模型 | 基因电路设计 | 哺乳动物细胞 | 基于KEAP1/NRF2/ARE的超声响应基因开关,包含合成抗氧化反应元件启动子 | 医学 |
| 44 | 2025-10-05 |
AI-driven high-throughput droplet screening of cell-free gene expression
2025-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58139-0
PMID:40108186
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研究论文 | 开发了一种名为DropAI的AI驱动高通量液滴筛选方法,用于优化无细胞基因表达系统 | 结合微流控液滴技术与机器学习模型,实现了对无细胞系统组成的高通量筛选和优化,并通过迁移学习成功应用于不同宿主系统 | NA | 优化无细胞基因表达系统的组成,降低成本并提高产量 | 无细胞基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光颜色编码系统、机器学习 | 机器学习模型 | 荧光信号数据、化学组合数据 | 12种不同蛋白质 | NA | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌 | 无细胞基因表达系统 | 工业生物技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
Exploring the potential of plant astrobiology: adapting flora for extra-terrestrial habitats: a review
2025-Mar, Biologia futura
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s42977-024-00245-z
PMID:39302628
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综述 | 探讨植物在外太空环境中适应机制及其在太空任务中维持生命支持系统的潜力 | 将植物学与天体生物学结合,系统研究植物在低重力、高辐射等极端太空环境下的适应机制 | NA | 评估植物在太空环境中维持生命支持系统的可行性 | 地球植物及其在太空环境中的适应性 | 天体生物学 | NA | 基因修饰、合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 太空探索 |
| 46 | 2025-10-05 |
Orthogonal Host-Guest Interactions Enable Programming of Protocell Membranes for Cellular High-Order Assembly and Enhanced Immunogenicity
2025-Mar-26, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c20476
PMID:40067075
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研究论文 | 开发了一种基于多糖的微胶囊系统,通过主客体相互作用实现膜表面功能化编程 | 利用β-环糊精-金刚烷主客体相互作用实现微胶囊膜表面的快速功能化编程 | NA | 开发可编程的原始细胞膜系统以模拟真实细胞间相互作用 | 多糖微胶囊(P-somes)和巨噬细胞 | 合成生物学 | NA | 主客体相互作用 | NA | NA | NA | 主客体化学 | NA | 膜表面功能化编程系统 | 医学, 生物工程 |
| 47 | 2025-10-05 |
Semiautomated Production of Cell-Free Biosensors
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00703
PMID:40073441
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研究论文 | 本研究探索使用液体处理机器人技术半自动化生产无细胞生物传感器 | 首次将液体处理机器人技术应用于无细胞生物传感器的规模化生产,解决了传统手动组装的质量控制和性能变异问题 | 研究仅测试了两种无细胞基因表达检测系统(显色和荧光),尚未验证其他类型生物传感器的适用性 | 开发无细胞生物传感器的半自动化生产方法以提高制造效率和质量稳定性 | 无细胞生物传感器的反应组装过程 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达系统,液体处理机器人技术 | NA | 显色信号,荧光信号 | 384孔板的氟化物传感无细胞生物传感器 | Opentrons OT-2液体处理平台 | 无细胞系统 | 组成性产生显色(LacZ)或荧光(GFP)信号的基因表达检测系统 | 环境,医疗诊断 |
| 48 | 2025-10-05 |
A globular protein exhibits rare phase behavior and forms chemically regulated orthogonal condensates in cells
2025-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57886-4
PMID:40069234
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研究论文 | 研究发现大肠杆菌中的脂蛋白连接酶A(LplA)具有罕见的可逆相分离行为,并能在细胞中形成化学调控的正交凝聚物 | 首次发现结构完整的球状蛋白LplA具有LCST型可逆相分离特性,并能通过小分子底物特异性调控凝聚物形成 | NA | 探索具有化学调控相分离特性的蛋白质在生物分子凝聚物和合成生物学中的应用 | 大肠杆菌脂蛋白连接酶A(LplA)及其相分离行为 | 合成生物学 | NA | 相分离分析 | NA | 蛋白质相行为数据 | NA | NA | 大肠杆菌, 人类U2OS细胞 | 正交生物分子凝聚物系统 | 生物医学, 合成生物学 |
| 49 | 2025-10-05 |
Overcoming ice: cutting-edge materials and advanced strategies for effective cryopreservation of biosample
2025-Mar-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03265-6
PMID:40050919
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综述 | 本文综述了克服冰晶形成挑战的先进材料和策略,以提升生物样本冷冻保存效果 | 强调多学科协同方法,整合合成生物学、纳米技术、微流控和3D生物打印等前沿技术 | 当前冷冻保护剂存在细胞毒性问题,且冷冻保存技术尚未完全解决冰晶形成难题 | 开发高效冷冻保存方法以维持生物材料功能完整性和正常结构 | 生物样本(包括生殖质资源) | 生物医学工程 | NA | 冷冻保存技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物资源保护 |
| 50 | 2025-10-05 |
Crystal structures of monomeric BsmI restriction endonuclease reveal coordinated sequential cleavage of two DNA strands
2025-Mar-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07612-z
PMID:40055548
|
研究论文 | 通过晶体结构揭示BsmI限制性内切酶协调顺序切割两条DNA链的机制 | 首次报道单体BsmI的晶体结构,发现其通过可伸缩环控制顺序切割机制,并开发了新型Nt*.BsmI变体 | AlphaFold3预测的模型不正确,可能限制计算预测的可靠性 | 阐明BsmI限制性内切酶的结构与功能机制 | BsmI限制性内切酶及其变体(Nb.BsmI和Nt*.BsmI) | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA | 合成生物学干预 | 嗜热脂肪芽孢杆菌 | NA | 生物技术 |
| 51 | 2025-10-05 |
SynBioNanoDesign: pioneering targeted drug delivery with engineered nanomaterials
2025-Mar-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03254-9
PMID:40050980
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综述 | 本文系统阐述合成生物学在靶向药物递送工程纳米材料中的关键作用及发展前景 | 提出合成生物学与纳米技术融合的创新范式,通过遗传电路编程实现纳米材料的动态响应功能 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于理论分析和现有研究综述 | 探讨合成生物学推动靶向药物递送系统发展的机制与路径 | 工程化纳米材料及其在药物递送中的应用 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | NA | 遗传电路设计、纳米材料工程 | NA | 文献资料与理论分析 | NA | 遗传电路编程 | NA | 用于编程纳米材料响应的遗传电路 | 医药 |
| 52 | 2025-10-05 |
Logic-Gated Modulation of Cell Migration via Mesoscale Mechanical Uncaging Effects
2025-03-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c16194
PMID:39980204
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研究论文 | 本研究通过DNA折纸纳米弹簧系统实现机械笼蔽/解蔽效应,精确调控癌细胞迁移 | 利用DNA作为编程语言创建响应miRNA输入的逻辑门(布尔AND和OR门),通过机械结构变化控制RGD配体的释放 | 概念验证阶段,尚未进行大规模体内实验验证 | 开发基于DNA纳米技术的细胞机械功能调控方法 | 癌细胞迁移行为 | 合成生物学 | 癌症 | DNA折纸自组装技术 | 逻辑门电路模型 | 实验数据 | NA | DNA折纸 | 哺乳动物细胞 | 布尔逻辑门(AND和OR门),机械解蔽生物传感器 | 医学, 合成生物学 |
| 53 | 2025-10-05 |
[Biosynthesis of ganoderic acid and its derivatives]
2025-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
综述 | 本文综述灵芝三萜(包括灵芝酸及其衍生物)的生物合成途径、代谢调控机制及合成生物学优化策略 | 系统整合灵芝酸生物合成途径中关键酶基因、转录因子和信号转导机制的最新研究进展 | 灵芝三萜生物合成途径尚未完全解析,分子调控机制仍需深入研究 | 提高三萜类药理成分高效生产及灵芝资源开发利用 | 灵芝酸及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 灵芝 | 灵芝酸生物合成代谢途径 | 医药 |
| 54 | 2025-10-05 |
[Functional characterization of flavonoid glycosyltransferase AmGT90 in Astragalus membranaceus]
2025-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从黄芪中克隆并功能表征了糖基转移酶基因AmGT90,发现其能催化多种黄酮类化合物形成单糖苷和双糖苷 | 首次报道了黄芪中能够催化黄酮类化合物形成双糖苷的糖基转移酶AmGT90,并初步探索了其催化木犀草素形成双糖苷的机制 | 仅初步探索了AmGT90催化木犀草素形成双糖苷的机制,需要进一步深入研究 | 研究黄芪中黄酮类化合物糖基化修饰的分子机制 | 黄芪糖基转移酶基因AmGT90及其催化特性 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、系统发育分析、体外酶反应 | NA | 基因序列、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 55 | 2025-10-05 |
Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production
2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04302-0
PMID:40025370
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综述 | 探讨大肠杆菌天然和工程化分泌系统在增强重组蛋白生产中的应用 | 系统比较天然一步/两步分泌系统与新型工程平台(ESETEC、BacSec),提出通过基因工程和合成生物学策略提升蛋白分泌效率 | 主要适用于非糖基化蛋白,天然分泌能力有限且易形成包涵体 | 提高大肠杆菌重组蛋白的分泌产量和效率 | 大肠杆菌分泌系统与重组蛋白 | 合成生物学 | NA | 基因工程、诱变、合成生物学、细胞壁修饰、分子伴侣共表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 分泌系统工程化改造(Type I/III、Sec/Tat途径) | 工业生物技术 |
| 56 | 2025-10-05 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于Cupriavidus necator H16的高效无标记基因组编辑系统CnRed | 首次在Cupriavidus necator H16中建立lambda Red重组工程系统,并首次实现使用线性PCR产物进行基因删除 | NA | 开发高效的基因组编辑方法以改进Cupriavidus necator H16的工程化应用 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组工程、电穿孔、PCR | NA | NA | 三个不同基因组位点 | lambda Red重组工程系统,Cre/loxP系统 | Cupriavidus necator H16 | 植酸酶基因的基因组整合 | 工业生物技术 |
| 57 | 2025-10-05 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
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研究论文 | 本研究开发了在真核无细胞系统中工作的蛋白质响应型上调核糖开关,用于构建多步基因调控级联 | 首次在真核无细胞系统中开发蛋白质响应型ON-核糖开关,并成功构建了多步基因调控级联 | 最初设计的两种ON-核糖开关效率较低,多步级联的总体开关效率受限于其中效率最差的步骤 | 构建在真核无细胞系统中工作的复杂基因调控电路 | 蛋白质响应型ON-核糖开关和基因调控级联 | 合成生物学 | NA | 核糖开关设计、锤头状核酶自切割 | NA | 基因表达数据 | NA | 核糖开关、杂交开关 | 小麦胚芽提取物(无细胞系统) | 蛋白质响应型ON-核糖开关、两步骤和三步骤基因调控级联、基于HHR的核糖开关 | 工业生物技术 |
| 58 | 2025-10-05 |
Review of Recent Advances in Microbial Production and Applications of Nerolidol
2025-Mar-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12579
PMID:40013722
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综述 | 总结了橙花叔醇的生物活性、应用领域及微生物细胞工厂生产方法的最新研究进展 | 系统整合了代谢工程和合成生物学策略构建微生物细胞工厂生产橙花叔醇及其衍生物的最新进展 | NA | 综述橙花叔醇的生物活性、应用前景和微生物生产方法 | 橙花叔醇及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | NA | 医药, 农业, 食品工业 |
| 59 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417695122
PMID:40009642
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻双顺反子mRNA通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机制 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是双顺反子翻译的关键机制,并展示了通过调控Kozak-like序列强度可逆调节双报告基因表达 | 研究主要聚焦于两种绿藻物种,机制在其他真核生物中的普适性仍需验证 | 探究绿藻双顺反子mRNA中多个开放阅读框的翻译机制 | 两种分歧绿藻(Chlamydomonas reinhardtii和Chlorella variabilis)的双顺反子基因座 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组序列、荧光和发光报告基因表达数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子基因座数据集 | 合成双顺反子双报告基因系统 | 绿藻 | 双顺反子表达系统,包含可调控的Kozak-like序列和双报告基因(GFP和荧光素酶) | 合成生物学 |
| 60 | 2025-10-05 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
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研究论文 | 开发基于精英遗传算法的图形界面工具MultiCRISPR-EGA,用于优化多路CRISPR引导RNA阵列设计 | 首次将精英遗传算法应用于多路gRNA阵列优化设计,通过最小自由能特征筛选更稳定的gRNA | 仅通过计算实验验证,缺乏体内实验验证 | 优化多路CRISPR引导RNA阵列设计流程,提高基因组编辑效率 | 多路引导RNA阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,CRISPR干扰(CRISPRi) | 精英遗传算法(EGA) | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | 单启动子驱动的多路gRNA阵列 | 工业生物技术 |