合成生物学相关文章
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当前共找到 115 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production
2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04302-0
PMID:40025370
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综述 | 探讨大肠杆菌天然和工程化分泌系统在增强重组蛋白生产中的应用 | 系统比较天然一步/两步分泌系统与新型工程平台（ESETEC、BacSec），提出通过基因工程和合成生物学策略提升蛋白分泌效率 | 主要适用于非糖基化蛋白，天然分泌能力有限且易形成包涵体 | 提高大肠杆菌重组蛋白的分泌产量和效率 | 大肠杆菌分泌系统与重组蛋白 | 合成生物学 | NA | 基因工程、诱变、合成生物学、细胞壁修饰、分子伴侣共表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 分泌系统工程化改造（Type I/III、Sec/Tat途径） | 工业生物技术 |
| 42 | 2025-10-05 |
CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00757
PMID:39989320
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于Cupriavidus necator H16的高效无标记基因组编辑系统CnRed | 首次在Cupriavidus necator H16中建立lambda Red重组工程系统，并首次实现使用线性PCR产物进行基因删除 | NA | 开发高效的基因组编辑方法以改进Cupriavidus necator H16的工程化应用 | Cupriavidus necator H16细菌 | 合成生物学 | NA | lambda Red重组工程、电穿孔、PCR | NA | NA | 三个不同基因组位点 | lambda Red重组工程系统,Cre/loxP系统 | Cupriavidus necator H16 | 植酸酶基因的基因组整合 | 工业生物技术 |
| 43 | 2025-10-05 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
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研究论文 | 本研究开发了在真核无细胞系统中工作的蛋白质响应型上调核糖开关，用于构建多步基因调控级联 | 首次在真核无细胞系统中开发蛋白质响应型ON-核糖开关，并成功构建了多步基因调控级联 | 最初设计的两种ON-核糖开关效率较低，多步级联的总体开关效率受限于其中效率最差的步骤 | 构建在真核无细胞系统中工作的复杂基因调控电路 | 蛋白质响应型ON-核糖开关和基因调控级联 | 合成生物学 | NA | 核糖开关设计、锤头状核酶自切割 | NA | 基因表达数据 | NA | 核糖开关、杂交开关 | 小麦胚芽提取物（无细胞系统） | 蛋白质响应型ON-核糖开关、两步骤和三步骤基因调控级联、基于HHR的核糖开关 | 工业生物技术 |
| 44 | 2025-10-05 |
Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00731
PMID:40011207
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研究论文 | 本研究通过优化哺乳动物剪接核糖开关调控ALOX5基因的可变剪接，实现了外显子跳跃依赖性基因表达和亚型转换 | 开发了基于上下文序列适配的核糖开关优化策略，首次实现了5-LO野生型向缺失外显子13亚型(5-LOΔ13)的转换 | 在真核系统中控制基因表达的功能可能受限于特定基因或细胞类型 | 优化合成核糖开关在哺乳动物细胞中调控可变剪接的能力 | ALOX5基因和人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因在HEK293细胞中的表达调控 | 合成生物学 | NA | 可变剪接调控，核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | NA | 核糖开关 | 哺乳动物细胞，HEK293细胞 | 剪接核糖开关，外显子跳跃调控，亚型转换系统 | 医学，合成生物学 |
| 45 | 2025-10-05 |
Review of Recent Advances in Microbial Production and Applications of Nerolidol
2025-Mar-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12579
PMID:40013722
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综述 | 总结了橙花叔醇的生物活性、应用领域及微生物细胞工厂生产方法的最新研究进展 | 系统整合了代谢工程和合成生物学策略构建微生物细胞工厂生产橙花叔醇及其衍生物的最新进展 | NA | 综述橙花叔醇的生物活性、应用前景和微生物生产方法 | 橙花叔醇及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | NA | 医药, 农业, 食品工业 |
| 46 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2417695122
PMID:40009642
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻双顺反子mRNA通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机制 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是双顺反子翻译的关键机制，并展示了通过调控Kozak-like序列强度可逆调节双报告基因表达 | 研究主要聚焦于两种绿藻物种，机制在其他真核生物中的普适性仍需验证 | 探究绿藻双顺反子mRNA中多个开放阅读框的翻译机制 | 两种分歧绿藻（Chlamydomonas reinhardtii和Chlorella variabilis）的双顺反子基因座 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组序列、荧光和发光报告基因表达数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子基因座数据集 | 合成双顺反子双报告基因系统 | 绿藻 | 双顺反子表达系统，包含可调控的Kozak-like序列和双报告基因（GFP和荧光素酶） | 合成生物学 |
| 47 | 2025-10-05 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
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研究论文 | 开发基于精英遗传算法的图形界面工具MultiCRISPR-EGA，用于优化多路CRISPR引导RNA阵列设计 | 首次将精英遗传算法应用于多路gRNA阵列优化设计，通过最小自由能特征筛选更稳定的gRNA | 仅通过计算实验验证，缺乏体内实验验证 | 优化多路CRISPR引导RNA阵列设计流程，提高基因组编辑效率 | 多路引导RNA阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统，CRISPR干扰(CRISPRi) | 精英遗传算法(EGA) | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | 单启动子驱动的多路gRNA阵列 | 工业生物技术 |
| 48 | 2025-10-05 |
Intracellular protein ligation and polyprotein synthesis using an asparaginyl endopeptidase core
2025-Mar-11, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06617k
PMID:39981834
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研究论文 | 开发基于AEP1核心结构域的细胞内蛋白质连接系统，实现无需酶激活和外部连接的实时多蛋白合成 | 利用截短型AEP1核心结构域在细胞内直接连接和聚合Ig结构域，实现实时多蛋白合成 | NA | 开发新型细胞内蛋白质连接技术 | AEP1酶核心结构域和Ig结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质连接技术 | NA | NA | NA | AEP1 | NA | 蛋白质连接和多聚化系统 | 生物材料,合成生物学 |
| 49 | 2025-10-05 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
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综述 | 本文回顾了合成生物学领域的历史，并分析了其双重用途风险 | 指出合成生物学的新颖性印象源于对其创建历史的快速遗忘，并强调程序（合成DNA）而非机器（底盘）是大多数工作的焦点和风险所在 | 未提出具体的风险管理方案或解决双重用途问题的具体措施 | 分析合成生物学的历史发展和双重用途风险 | 合成生物学领域及其安全风险 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-10-05 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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综述 | 本文探讨肽介导的液液相分离在生物分子凝聚物形成中的分子机制及其在生物技术和医学中的应用 | 系统阐述肽介导相分离的分子机制及其可调控特性，突出肽凝聚物在生物工程领域的转化潜力 | NA | 探讨肽介导液液相分离的分子机制及其在生物技术和医学中的应用前景 | 肽介导的液液相分离过程及生物分子凝聚物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 51 | 2025-10-05 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
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综述 | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展，重点关注糖修饰在治疗应用和异源核酸开发中的作用 | 系统总结糖修饰核酸的最新进展，特别强调糖-寡核苷酸共轭策略对改善寡核苷酸药物治疗指数的作用 | NA | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的碳水化合物修饰，特别是糖实体的修饰 | 生物化学与分子生物学 | NA | 核酸化学、碳水化合物化学、蛋白质工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 52 | 2025-10-05 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 开发了一种针对最小支原体细胞JCVI-syn3B的稳健高效转化方法 | 首次系统研究最小细胞JCVI-syn3B的生长状态与转化效率关系，发现指数生长早期具有最高转化效率，并建立了冷冻保存转化就绪细胞的方法 | NA | 开发高效的最小支原体细胞转化方法 | 最小支原体细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 细胞转化技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | 支原体JCVI-syn3B | NA | 生物技术研究 |
| 53 | 2025-10-05 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和光遗传学技术构建人工酵母群落的最新进展 | 重点介绍了利用光遗传学在群落水平上通过光刺激调控酵母表型的新方法 | NA | 探索合成微生物群落用于研究自然系统复杂性和生物相互作用的潜力 | 人工酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 细胞通讯设计、生物传感器、逻辑运算 | 代谢工程、生物传感、模式形成 |
| 54 | 2025-10-05 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
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研究论文 | 本研究开发了一种用于膀胱癌治疗的逻辑“与”门双靶点基因电路，通过整合多个信号实现对膀胱癌细胞信号通路的全面重编程 | 设计了逻辑“与”门双靶点基因电路，能够同时识别多个癌症特异性生物标志物，实现更精准的癌细胞靶向治疗 | 目前仍处于临床前研究阶段，尚未进行人体试验 | 开发针对膀胱癌的精准基因治疗策略 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析，基因电路工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 膀胱癌细胞 | 逻辑“与”门双靶点基因电路，仅在多个癌症特异性生物标志物异常表达时激活 | 医学 |
| 55 | 2025-10-05 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
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综述 | 本文介绍了聚羟基脂肪酸酯的碳循环概念，包括其生物合成途径、碳转化过程及在不同环境中的降解机制 | 首次提出聚羟基脂肪酸酯碳循环（CCP）概念，系统阐述芳香族单体生物合成途径及多环境降解过程 | PHA生产成本效益控制仍存挑战，降解产物再利用技术不成熟，对PHA合成与降解碳途径认识有限 | 深入理解PHA作为生物材料的可持续利用价值，推动绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯（PHAs）及其降解产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 芳香族单体生物合成途径 | 环境保护, 生物医药 |
| 56 | 2025-10-05 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
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研究论文 | 开发了一种名为iMARS的标准化框架，用于快速设计最优多酶空间结构 | 通过整合高通量活性测试和结构分析，首次实现了可预测性能的多酶结构工程 | NA | 研究多酶空间结构对催化效率的影响并开发优化设计方法 | 多酶复合物和人工融合酶 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试、结构分析 | NA | 酶活性数据、结构数据 | NA | iGEM | NA | 多酶级联反应系统、代谢通路 | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 57 | 2025-10-05 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
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研究论文 | 本研究通过随机诱变构建了乳酸菌P23组成型启动子的突变体库，并评估了其在基因表达调控中的应用潜力 | 首次通过随机诱变构建了具有显著活性差异的P23启动子突变体库，并验证了其在乳酸菌中的特异性 | 突变体库仅包含247个突变体，可能未覆盖所有可能的突变类型 | 丰富乳酸菌启动子库资源，为代谢工程和合成生物学应用提供工具 | 乳酸菌P23组成型启动子及其突变体 | 合成生物学 | NA | 易错PCR、dNTP类似物随机诱变、高通量筛选 | NA | 荧光强度、酶活性数据 | 247个启动子突变体 | NA | Streptococcus thermophilus, Lactobacillus plantarum, Lactococcus lactis, Escherichia coli | 组成型启动子突变库 | 工业生物技术 |
| 58 | 2025-10-05 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的创新应用，重点关注数据分析、分子建模、酶工程和代谢通路研究 | 系统评估了AI在生物化学中的新兴研究前沿，包括蛋白质结构预测工具AlphaFold的应用以及AI在个性化医疗和合成生物学中的潜力 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 探索人工智能在生物化学领域的当前和潜在应用 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用和药物发现过程 | 机器学习 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、AI分子建模 | NA | 文献数据、分子数据、生物化学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 59 | 2025-10-05 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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综述 | 本文综述了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的作用机制与应用进展 | 阐明了C4a-氢过氧黄素形成机制并鉴定出关键催化残基His44，通过蛋白质工程和合成生物学改善了LuxAB的发光特性 | 实现红移发射、优化信号强度和阐明发光物种生成机制等挑战性问题仍有待探索 | 深入理解LuxAB反应机制并拓展其生物技术应用 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 自给自足的发光系统，lux操纵子编码的酶系统 | 生物技术，生物医学，生物成像，生物传感，代谢工程，生物燃料生产 |
| 60 | 2025-10-05 |
Recent advances in synthetic biology toolkits and metabolic engineering of Ralstonia eutropha H16 for production of value-added chemicals
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108516
PMID:39793936
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综述 | 本文综述了针对Ralstonia eutropha H16开发的合成生物学工具及其在代谢工程中生产高附加值化学品的应用 | 整合了多组学数据与完整基因组注释，为高效重编程代谢网络提供了强大遗传框架 | NA | 开发合成生物学工具并改造Ralstonia eutropha H16代谢途径以生产高附加值化学品 | Ralstonia eutropha H16细菌及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、基因组工程 | NA | 多组学数据、基因组序列 | NA | 表达载体构建、调控元件设计、转化技术 | Ralstonia eutropha H16 | 代谢网络重编程、自养和异养生物合成途径 | 工业生物技术 |