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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Intracellular protein ligation and polyprotein synthesis using an asparaginyl endopeptidase core
2025-Mar-11, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06617k
PMID:39981834
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研究论文 | 开发基于AEP1核心结构域的细胞内蛋白质连接系统,实现无需酶激活和外部连接的实时多蛋白合成 | 利用截短型AEP1核心结构域在细胞内直接连接和聚合Ig结构域,实现实时多蛋白合成 | NA | 开发新型细胞内蛋白质连接技术 | AEP1酶核心结构域和Ig结构域 | 合成生物学 | NA | 蛋白质连接技术 | NA | NA | NA | AEP1 | NA | 蛋白质连接和多聚化系统 | 生物材料,合成生物学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Use and dual use of synthetic biology
2025-03-07, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.173
PMID:40052950
|
综述 | 本文回顾了合成生物学领域的历史,并分析了其双重用途风险 | 指出合成生物学的新颖性印象源于对其创建历史的快速遗忘,并强调程序(合成DNA)而非机器(底盘)是大多数工作的焦点和风险所在 | 未提出具体的风险管理方案或解决双重用途问题的具体措施 | 分析合成生物学的历史发展和双重用途风险 | 合成生物学领域及其安全风险 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2025-10-05 |
Peptide-mediated liquid-liquid phase separation and biomolecular condensates
2025-Mar-05, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01477d
PMID:39964249
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综述 | 本文探讨肽介导的液液相分离在生物分子凝聚物形成中的分子机制及其在生物技术和医学中的应用 | 系统阐述肽介导相分离的分子机制及其可调控特性,突出肽凝聚物在生物工程领域的转化潜力 | NA | 探讨肽介导液液相分离的分子机制及其在生物技术和医学中的应用前景 | 肽介导的液液相分离过程及生物分子凝聚物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 64 | 2025-10-05 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
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综述 | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展,重点关注糖修饰在治疗应用和异源核酸开发中的作用 | 系统总结糖修饰核酸的最新进展,特别强调糖-寡核苷酸共轭策略对改善寡核苷酸药物治疗指数的作用 | NA | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的碳水化合物修饰,特别是糖实体的修饰 | 生物化学与分子生物学 | NA | 核酸化学、碳水化合物化学、蛋白质工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 65 | 2025-10-05 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
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研究论文 | 本研究开发了一种用于膀胱癌治疗的逻辑“与”门双靶点基因电路,通过整合多个信号实现对膀胱癌细胞信号通路的全面重编程 | 设计了逻辑“与”门双靶点基因电路,能够同时识别多个癌症特异性生物标志物,实现更精准的癌细胞靶向治疗 | 目前仍处于临床前研究阶段,尚未进行人体试验 | 开发针对膀胱癌的精准基因治疗策略 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析,基因电路工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成生物学方法 | 膀胱癌细胞 | 逻辑“与”门双靶点基因电路,仅在多个癌症特异性生物标志物异常表达时激活 | 医学 |
| 66 | 2025-10-05 |
Carbon cycle of polyhydroxyalkanoates (CCP): Biosynthesis and biodegradation
2025-Mar-15, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2025.120904
PMID:39842755
|
综述 | 本文介绍了聚羟基脂肪酸酯的碳循环概念,包括其生物合成途径、碳转化过程及在不同环境中的降解机制 | 首次提出聚羟基脂肪酸酯碳循环(CCP)概念,系统阐述芳香族单体生物合成途径及多环境降解过程 | PHA生产成本效益控制仍存挑战,降解产物再利用技术不成熟,对PHA合成与降解碳途径认识有限 | 深入理解PHA作为生物材料的可持续利用价值,推动绿色低碳发展 | 聚羟基脂肪酸酯(PHAs)及其降解产物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 芳香族单体生物合成途径 | 环境保护, 生物医药 |
| 67 | 2025-10-05 |
Rational multienzyme architecture design with iMARS
2025-Mar-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.12.029
PMID:39855196
|
研究论文 | 开发了一种名为iMARS的标准化框架,用于快速设计最优多酶空间结构 | 通过整合高通量活性测试和结构分析,首次实现了可预测性能的多酶结构工程 | NA | 研究多酶空间结构对催化效率的影响并开发优化设计方法 | 多酶复合物和人工融合酶 | 合成生物学 | NA | 高通量活性测试、结构分析 | NA | 酶活性数据、结构数据 | NA | iGEM | NA | 多酶级联反应系统、代谢通路 | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 68 | 2025-10-05 |
Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria
2025-Mar, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015
PMID:39848497
|
研究论文 | 本研究通过随机诱变构建了乳酸菌P23组成型启动子的突变体库,并评估了其在基因表达调控中的应用潜力 | 首次通过随机诱变构建了具有显著活性差异的P23启动子突变体库,并验证了其在乳酸菌中的特异性 | 突变体库仅包含247个突变体,可能未覆盖所有可能的突变类型 | 丰富乳酸菌启动子库资源,为代谢工程和合成生物学应用提供工具 | 乳酸菌P23组成型启动子及其突变体 | 合成生物学 | NA | 易错PCR、dNTP类似物随机诱变、高通量筛选 | NA | 荧光强度、酶活性数据 | 247个启动子突变体 | NA | Streptococcus thermophilus, Lactobacillus plantarum, Lactococcus lactis, Escherichia coli | 组成型启动子突变库 | 工业生物技术 |
| 69 | 2025-10-05 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
|
综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的创新应用,重点关注数据分析、分子建模、酶工程和代谢通路研究 | 系统评估了AI在生物化学中的新兴研究前沿,包括蛋白质结构预测工具AlphaFold的应用以及AI在个性化医疗和合成生物学中的潜力 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 探索人工智能在生物化学领域的当前和潜在应用 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用和药物发现过程 | 机器学习 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、AI分子建模 | NA | 文献数据、分子数据、生物化学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 70 | 2025-10-05 |
Recent advances in synthetic biology toolkits and metabolic engineering of Ralstonia eutropha H16 for production of value-added chemicals
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108516
PMID:39793936
|
综述 | 本文综述了针对Ralstonia eutropha H16开发的合成生物学工具及其在代谢工程中生产高附加值化学品的应用 | 整合了多组学数据与完整基因组注释,为高效重编程代谢网络提供了强大遗传框架 | NA | 开发合成生物学工具并改造Ralstonia eutropha H16代谢途径以生产高附加值化学品 | Ralstonia eutropha H16细菌及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、基因组工程 | NA | 多组学数据、基因组序列 | NA | 表达载体构建、调控元件设计、转化技术 | Ralstonia eutropha H16 | 代谢网络重编程、自养和异养生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 71 | 2025-10-05 |
Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field
2025-Mar, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380
PMID:39752811
|
研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟结合实验验证,探究了外加电场对人工设计肽孔结构动力学的影响 | 在GENESIS分子动力学模拟软件中实现了均匀外加电场功能,用于研究从头设计肽孔的构象动力学 | NA | 研究膜电位对人工设计肽孔结构稳定性和动力学的影响 | 从头设计的肽孔 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,单通道电流记录实验 | NA | 模拟数据,实验数据 | NA | NA | NA | 人工离子通道和孔设计 | 医学 |
| 72 | 2025-10-05 |
Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514
PMID:39755221
|
综述 | 本文系统评述了细菌糖蛋白工程领域的最新技术进展、挑战与未来发展方向 | 从合成生物学和代谢工程角度全面分析细菌蛋白糖基化系统,重点关注糖蛋白治疗剂和疫苗开发 | NA | 探讨利用细菌糖基化系统生产高价值糖蛋白的方法与策略 | 细菌糖基化系统及其在糖蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白糖链偶联技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 糖基化系统优化(糖基转移酶、载体蛋白、糖基供体、宿主细菌) | 医学, 诊断 |
| 73 | 2025-10-05 |
New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384
PMID:39756484
|
综述 | 本文总结了丹参中丹参酮生物活性的研究进展及提高其产量的生物技术策略 | 系统整合了丹参酮生物合成途径、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学等多维度研究进展 | NA | 开发高质量的丹参资源并提高丹参酮产量 | 丹参及其活性成分丹参酮 | 合成生物学 | 心脑血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 丹参 | 丹参酮生物合成途径 | 医药 |
| 74 | 2025-10-05 |
Generalized Orthogonal de Bruijn and Kautz Sequences
2025-Mar-30, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e27040366
PMID:40282601
|
研究论文 | 本文研究正交de Bruijn序列和Kautz序列的三种实用推广形式 | 提出了正交de Bruijn序列的三种推广形式,并给出了固定权重正交de Bruijn序列数量的上下界 | NA | 探索正交de Bruijn序列和Kautz序列的推广形式及其理论性质 | de Bruijn序列、正交de Bruijn序列、Kautz序列 | 编码理论 | NA | NA | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 75 | 2025-10-05 |
Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005
PMID:39708916
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研究论文 | 本研究开发了一种工程化的睾丸酮丛毛单胞菌菌株,可将聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)升级转化为生物塑料聚羟基丁酸酯(PHB) | 首次将睾丸酮丛毛单胞菌RW31工程化改造,使其能异源表达PET降解酶并直接将PET废物转化为PHB生物塑料 | 体外和体内PET降解效率存在差异(37.1% vs 0.83%),体内降解效率较低 | 开发PET废物的生物升级回收策略 | 睾丸酮丛毛单胞菌RW31及其工程菌株 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物降解、生物合成 | NA | 实验数据 | 工程菌株及其野生型 | CRISPR-Cas9 | Comamonas testosteroni | PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase融合表达系统 | 环境,工业生物技术 |
| 76 | 2025-10-05 |
Extracellular electron transfer-dependent bioremediation of uranium-contaminated groundwater: Advancements and challenges
2025-Mar-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2024.122957
PMID:39708382
|
综述 | 探讨利用微生物胞外电子转移过程修复铀污染地下水的潜力与挑战 | 系统评述了基于胞外电子转移的铀生物修复分子机制及结合合成生物学与机器学习的前沿策略 | NA | 铀污染地下水修复技术开发 | 异化金属还原菌(如地杆菌和希瓦氏菌)及其胞外电子转移过程 | 环境生物技术 | NA | 胞外电子转移、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 地杆菌, 希瓦氏菌 | 电子传递优化系统 | 环境 |
| 77 | 2025-10-05 |
Liquid-liquid phase separation in microorganisms: Insights into existence, functions, and applications
2025-Mar, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.128026
PMID:39705832
|
综述 | 本文系统综述了微生物中液-液相分离(LLPS)的存在机制、功能作用及应用前景 | 首次整合微生物LLPS多维度研究,揭示其与环境适应性的关联,并提出作为合成生物学和病原微生物治疗新靶点的潜力 | 微生物LLPS形成与调控机制研究尚不充分,分子调控细节和实际应用仍需深入探索 | 阐明微生物中液-液相分离的生物学功能及其在生物技术中的应用价值 | 微生物体内的生物分子凝聚物及其相分离现象 | 合成生物学 | NA | 相分离研究技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 微生物 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 78 | 2025-10-05 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度生成模型CasGen,用于设计新型CRISPR Cas蛋白 | 提出了结合分类过滤、贝叶斯优化和结构验证的Cas蛋白生成框架,首次将边界潜在空间正则化应用于Cas蛋白设计 | 生成的Cas蛋白序列与已知变体存在28%-55%的相似性,可能限制了完全新颖蛋白的发现 | 扩展基因组编辑工具包,设计更多样化的Cas蛋白变体 | Cas9和Cas12蛋白序列 | 合成生物学 | NA | Transformer深度学习,AlphaFold结构预测,BLAST序列比对 | Transformer,深度生成模型 | 蛋白质序列数据 | 3,021条Cas9序列,597条Cas12序列,597条非Cas序列 | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 79 | 2025-10-05 |
Microbial Transcription Factor-Based Biosensors: Innovations from Design to Applications in Synthetic Biology
2025-Mar-31, Biosensors
DOI:10.3390/bios15040221
PMID:40277535
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综述 | 本文探讨微生物转录因子生物传感器从设计到合成生物学应用的创新进展 | 整合计算工具Cello进行遗传电路设计,展望与人工智能和先进筛选技术的未来融合 | NA | 总结转录因子生物传感器在合成生物学和工业生物技术中的创新应用 | 微生物转录因子生物传感器系统 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | NA | NA | Cello | 微生物细胞工厂 | 转录因子生物传感器、复杂遗传电路 | 工业生物技术 |
| 80 | 2025-10-05 |
Marine Fungal Metabolites as Potential Antidiabetic Agents: A Comprehensive Review of Their Structures and Enzyme Inhibitory Activities
2025-Mar-26, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23040142
PMID:40278263
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综述 | 系统评估海洋真菌代谢产物作为潜在抗糖尿病药物的结构与酶抑制活性 | 首次系统综述66株海洋真菌来源的181种生物活性化合物对多种糖尿病相关酶的抑制活性 | 未提及具体临床研究数据,主要关注体外酶抑制活性 | 探索海洋真菌代谢产物作为新型抗糖尿病药物的开发潜力 | 海洋真菌代谢产物(聚酮、生物碱、萜类、木脂素等) | 药物发现 | 糖尿病 | 酶抑制活性检测 | NA | 化学结构与生物活性数据 | 181种化合物来自66株海洋真菌 | 基因工程, 合成生物学 | 海洋真菌 | NA | 医药 |