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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field
2025-Mar, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380
PMID:39752811
|
研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟结合实验验证,探究了外加电场对人工设计肽孔结构动力学的影响 | 在GENESIS分子动力学模拟软件中实现了均匀外加电场功能,用于研究从头设计肽孔的构象动力学 | NA | 研究膜电位对人工设计肽孔结构稳定性和动力学的影响 | 从头设计的肽孔 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟,单通道电流记录实验 | NA | 模拟数据,实验数据 | NA | NA | NA | 人工离子通道和孔设计 | 医学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
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研究论文 | 开发了一种在哺乳动物细胞中进行定向进化的正交RNA复制系统 | 创建了正交甲病毒RNA复制系统,实现RNA复制酶辅助的连续进化,克服了现有方法的宿主基因组干扰、文库规模小和不可控突变等瓶颈 | NA | 推进哺乳动物合成生物学和细胞工程应用 | RNA基器件、荧光蛋白、转录因子 | 合成生物学 | NA | 正交RNA复制系统、定向进化 | NA | NA | NA | 正交甲病毒RNA复制系统 | 哺乳动物细胞 | RNA复制酶辅助连续进化系统,通过复制酶限制模式和诱导突变实现RNA多样性 | 医学, 工业生物技术 |
| 63 | 2025-10-05 |
Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514
PMID:39755221
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综述 | 本文系统评述了细菌糖蛋白工程领域的最新技术进展、挑战与未来发展方向 | 从合成生物学和代谢工程角度全面分析细菌蛋白糖基化系统,重点关注糖蛋白治疗剂和疫苗开发 | NA | 探讨利用细菌糖基化系统生产高价值糖蛋白的方法与策略 | 细菌糖基化系统及其在糖蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白糖链偶联技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 糖基化系统优化(糖基转移酶、载体蛋白、糖基供体、宿主细菌) | 医学, 诊断 |
| 64 | 2025-10-05 |
New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384
PMID:39756484
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综述 | 本文总结了丹参中丹参酮生物活性的研究进展及提高其产量的生物技术策略 | 系统整合了丹参酮生物合成途径、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学等多维度研究进展 | NA | 开发高质量的丹参资源并提高丹参酮产量 | 丹参及其活性成分丹参酮 | 合成生物学 | 心脑血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 丹参 | 丹参酮生物合成途径 | 医药 |
| 65 | 2025-10-05 |
Generalized Orthogonal de Bruijn and Kautz Sequences
2025-Mar-30, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e27040366
PMID:40282601
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研究论文 | 本文研究正交de Bruijn序列和Kautz序列的三种实用推广形式 | 提出了正交de Bruijn序列的三种推广形式,并给出了固定权重正交de Bruijn序列数量的上下界 | NA | 探索正交de Bruijn序列和Kautz序列的推广形式及其理论性质 | de Bruijn序列、正交de Bruijn序列、Kautz序列 | 编码理论 | NA | NA | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 66 | 2025-10-05 |
Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005
PMID:39708916
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研究论文 | 本研究开发了一种工程化的睾丸酮丛毛单胞菌菌株,可将聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)升级转化为生物塑料聚羟基丁酸酯(PHB) | 首次将睾丸酮丛毛单胞菌RW31工程化改造,使其能异源表达PET降解酶并直接将PET废物转化为PHB生物塑料 | 体外和体内PET降解效率存在差异(37.1% vs 0.83%),体内降解效率较低 | 开发PET废物的生物升级回收策略 | 睾丸酮丛毛单胞菌RW31及其工程菌株 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物降解、生物合成 | NA | 实验数据 | 工程菌株及其野生型 | CRISPR-Cas9 | Comamonas testosteroni | PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase融合表达系统 | 环境,工业生物技术 |
| 67 | 2025-10-05 |
Extracellular electron transfer-dependent bioremediation of uranium-contaminated groundwater: Advancements and challenges
2025-Mar-15, Water research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.watres.2024.122957
PMID:39708382
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综述 | 探讨利用微生物胞外电子转移过程修复铀污染地下水的潜力与挑战 | 系统评述了基于胞外电子转移的铀生物修复分子机制及结合合成生物学与机器学习的前沿策略 | NA | 铀污染地下水修复技术开发 | 异化金属还原菌(如地杆菌和希瓦氏菌)及其胞外电子转移过程 | 环境生物技术 | NA | 胞外电子转移、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 地杆菌, 希瓦氏菌 | 电子传递优化系统 | 环境 |
| 68 | 2025-10-05 |
Liquid-liquid phase separation in microorganisms: Insights into existence, functions, and applications
2025-Mar, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.128026
PMID:39705832
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综述 | 本文系统综述了微生物中液-液相分离(LLPS)的存在机制、功能作用及应用前景 | 首次整合微生物LLPS多维度研究,揭示其与环境适应性的关联,并提出作为合成生物学和病原微生物治疗新靶点的潜力 | 微生物LLPS形成与调控机制研究尚不充分,分子调控细节和实际应用仍需深入探索 | 阐明微生物中液-液相分离的生物学功能及其在生物技术中的应用价值 | 微生物体内的生物分子凝聚物及其相分离现象 | 合成生物学 | NA | 相分离研究技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 微生物 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 69 | 2025-10-05 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度生成模型CasGen,用于设计新型CRISPR Cas蛋白 | 提出了结合分类过滤、贝叶斯优化和结构验证的Cas蛋白生成框架,首次将边界潜在空间正则化应用于Cas蛋白设计 | 生成的Cas蛋白序列与已知变体存在28%-55%的相似性,可能限制了完全新颖蛋白的发现 | 扩展基因组编辑工具包,设计更多样化的Cas蛋白变体 | Cas9和Cas12蛋白序列 | 合成生物学 | NA | Transformer深度学习,AlphaFold结构预测,BLAST序列比对 | Transformer,深度生成模型 | 蛋白质序列数据 | 3,021条Cas9序列,597条Cas12序列,597条非Cas序列 | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 70 | 2025-10-05 |
Microbial Transcription Factor-Based Biosensors: Innovations from Design to Applications in Synthetic Biology
2025-Mar-31, Biosensors
DOI:10.3390/bios15040221
PMID:40277535
|
综述 | 本文探讨微生物转录因子生物传感器从设计到合成生物学应用的创新进展 | 整合计算工具Cello进行遗传电路设计,展望与人工智能和先进筛选技术的未来融合 | NA | 总结转录因子生物传感器在合成生物学和工业生物技术中的创新应用 | 微生物转录因子生物传感器系统 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | NA | NA | Cello | 微生物细胞工厂 | 转录因子生物传感器、复杂遗传电路 | 工业生物技术 |
| 71 | 2025-10-05 |
Marine Fungal Metabolites as Potential Antidiabetic Agents: A Comprehensive Review of Their Structures and Enzyme Inhibitory Activities
2025-Mar-26, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23040142
PMID:40278263
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综述 | 系统评估海洋真菌代谢产物作为潜在抗糖尿病药物的结构与酶抑制活性 | 首次系统综述66株海洋真菌来源的181种生物活性化合物对多种糖尿病相关酶的抑制活性 | 未提及具体临床研究数据,主要关注体外酶抑制活性 | 探索海洋真菌代谢产物作为新型抗糖尿病药物的开发潜力 | 海洋真菌代谢产物(聚酮、生物碱、萜类、木脂素等) | 药物发现 | 糖尿病 | 酶抑制活性检测 | NA | 化学结构与生物活性数据 | 181种化合物来自66株海洋真菌 | 基因工程, 合成生物学 | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 72 | 2025-10-05 |
Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005
PMID:39613152
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研究论文 | 本研究通过共过表达细胞器间锚定蛋白和脂肪酶开发了一种提高酿酒酵母脂肪酸积累的新工程策略 | 首次通过调控脂滴生物合成与降解的平衡来增强脂肪酸积累,实现了10.7倍的总脂肪酸产量提升 | NA | 提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达 | NA | NA | NA | 基因过表达 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 脂滴代谢调控系统:通过过表达Mdm1蛋白增加脂滴生物合成,同时上调脂肪酶加速脂滴降解 | 工业生物技术 |
| 73 | 2025-10-05 |
A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.001
PMID:39638031
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研究论文 | 本文开发了针对红藻Cyanidioschyzon merolae 10D的快速转化方法和核转基因表达工具包,用于代谢工程应用 | 优化了转化筛选流程(两周内获得氯霉素抗性转化株),开发了模块化质粒工具包和新型荧光报告基因,建立了高通量筛选方法 | NA | 促进C. merolae作为代谢工程和可持续生物技术生产的藻类系统 | 真核红藻Cyanidioschyzon merolae 10D | 合成生物学 | NA | 荧光成像、多端口顶空分析、平行光生物反应器 | NA | 荧光图像、挥发性异戊二烯生产数据 | NA | 模块化质粒工具包、同源重组 | Cyanidioschyzon merolae 10D | 代谢途径工程(异戊二烯合成酶过表达) | 能源, 工业生物技术 |
| 74 | 2025-10-05 |
Engineering microbial cell factories by multiplexed spatiotemporal control of cellular metabolism: Advances, challenges, and future perspectives
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108497
PMID:39645209
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综述 | 全面总结微生物细胞工厂中时空控制系统的最新进展及其在代谢工程中的应用 | 系统阐述合成生物学中可编程时空控制系统在微生物代谢调控中的创新应用 | NA | 开发高性能微生物细胞工厂的时空调控策略 | 微生物细胞工厂及其代谢网络 | 合成生物学 | NA | 时空控制系统、合成区室化 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 多种微生物物种 | 基因调控网络、代谢通路工程 | 工业生物技术 |
| 75 | 2025-10-05 |
Principles for introducing new genes and species for conservation
2025-Mar, Trends in ecology & evolution
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.tree.2024.11.011
PMID:39667987
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研究论文 | 本文提出了一套综合原则,用于指导保护管理者在生态系统中引入新基因和新物种的决策 | 首次将生物、法律、社会、文化和伦理考量整合为统一原则框架,用于指导保护生物学中的新基因和新物种引入决策 | NA | 为保护管理者提供应对新兴技术和保护引入决策的全面指导原则 | 生态系统保护决策和新兴生物技术应用 | 保护生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 76 | 2025-10-05 |
Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate)
2025-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018
PMID:39581772
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研究论文 | 开发罗尔斯顿菌RPET菌株的基因工具,实现从废弃PET塑料生物升级回收生产多种化学品 | 开发了针对非模式微生物RPET的可诱导可滴定表达系统和基于丝氨酸整合酶的重组编辑工具,建立了从消费后PET废瓶生产番茄红素、脂质和琥珀酸的微生物供应链 | 非模式微生物合成生物学工具稀缺限制了生物产品范围的扩展 | 开发塑料生物升级回收技术,实现可持续化学生产 | 罗尔斯顿菌RPET菌株和消费后PET废弃塑料 | 合成生物学 | NA | 基因工程、微生物代谢工程 | NA | 实验数据 | NA | 丝氨酸整合酶重组工具 | Rhodococcus jostii RPET | 代谢通路工程、微生物供应链 | 环境,工业生物技术 |
| 77 | 2025-10-05 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-Mar, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文系统综述了玉米氮素吸收、同化和再利用的遗传与分子调控机制 | 整合了根系发育、微生物互作和氮信号转导等多维度机制,提出利用遗传多样性和合成生物学的综合研究策略 | NA | 提高玉米氮素利用效率以实现可持续农业 | 玉米 | 植物遗传学 | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 78 | 2025-10-05 |
Chloroplast Functionality at the Interface of Growth, Defense, and Genetic Innovation: A Multi-Omics and Technological Perspective
2025-Mar-20, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14060978
PMID:40265935
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综述 | 本文从多组学和技术视角全面探讨叶绿体在植物生长、防御和遗传创新中的多功能作用 | 独特整合叶绿体基因组学、转录调控和合成生物学最新进展,提出通过组学数据与纳米技术、合成生物学结合优化植物生长和胁迫耐受性的新视角 | NA | 探索叶绿体在协调植物生长与防御平衡中的核心作用,推动可持续农业发展 | 叶绿体及其在植物生长、防御机制中的功能 | 植物生物学 | NA | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学)、合成生物学、纳米技术 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 79 | 2025-10-05 |
Treatment of neurological pathology and inflammation in Machado-Joseph disease through in vivo self-assembled siRNA
2025-Mar-06, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae304
PMID:39315766
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研究论文 | 本研究开发了一种通过体内自组装siRNA治疗马查多-约瑟夫病神经病理和炎症的新方法 | 利用合成生物学策略将宿主肝脏重编程为组织底盘,实现siRNA的体内自组装和靶向递送 | 研究仅在YACMJD84.2转基因小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对SCA3疾病的有效治疗方法 | YACMJD84.2转基因小鼠模型 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | siRNA技术、合成生物学 | NA | NA | YACMJD84.2转基因小鼠 | 合成生物学方法 | 小鼠 | 由巨细胞病毒启动子引导的合成构建体,编码神经元靶向的狂犬病毒糖蛋白标签和mATXN3-siRNA | 医学 |
| 80 | 2025-10-05 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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综述 | 本文聚焦CRISPR平台系统中非DSB编辑器BE和PE的发展与创新,探讨了改进策略及其在基因编辑技术中的应用前景 | 系统阐述了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等创新策略在BE和PE开发中的应用,并总结了CRISPR技术创新的思维突破 | NA | 推动CRISPR碱基编辑技术的发展,实现理想化编辑器的开发 | CRISPR平台系统中的非DSB编辑器(BE和PE) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |