合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 144 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-03-22 |
MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00860
PMID:39976310
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MultiCRISPR-EGA的图形用户界面工具，该工具使用精英遗传算法（EGA）来设计优化的单启动子驱动的多路CRISPR引导RNA（gRNA）阵列 | MultiCRISPR-EGA工具通过使用精英遗传算法（EGA）优化多路gRNA阵列设计，显著提高了CRISPR干扰（CRISPRi）应用的效率和特异性 | 工具的性能仅在计算实验中进行了验证，尚未在实际生物实验中进行广泛测试 | 优化多路CRISPR引导RNA（gRNA）阵列设计，以提高基因组编辑的效率和成本效益 | 多路CRISPR引导RNA（gRNA）阵列 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | 精英遗传算法（EGA） | 基因目标数据 | NA |
| 62 | 2025-03-22 |
Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00840
PMID:39991792
|
研究论文 | 本文开发了在麦胚提取物中起作用的蛋白质响应性上调核糖开关（ON-核糖开关），用于创建多步基因调控级联 | 首次在真核细胞无细胞系统中构建了复杂的基因调控级联，并成功开发了高效的蛋白质响应性ON-核糖开关 | 初始设计的两种ON-核糖开关效率较低，且多步级联的切换效率受限于其中最差的一步 | 构建真核细胞无细胞系统中的复杂基因调控级联 | 蛋白质响应性ON-核糖开关及其在基因调控级联中的应用 | 合成生物学 | NA | 核糖开关技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 63 | 2025-03-22 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
|
review | 本文讨论了CRISPR基因工具包在提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能方面的应用 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的最新进展，包括基因编辑、转录调控和酶调节 | 未具体提及研究的局限性 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 64 | 2025-03-22 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
|
综述 | 本文综述了合成生物学策略在高效生产天然色素及其非天然衍生物方面的最新进展 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量和多样化生产非天然衍生物的策略 | 天然色素在市场上的商业化仍面临稳定性差、颜色谱有限和产量低等挑战 | 探索利用合成生物学方法高效生产天然色素及其非天然衍生物 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 65 | 2025-03-22 |
Semiautomated Production of Cell-Free Biosensors
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00703
PMID:40073441
|
研究论文 | 本文探讨了使用液体处理机器人技术制造无细胞生物传感器的反应，比较了手动和半自动反应组装方法 | 使用液体处理机器人技术进行无细胞生物传感器的半自动化生产，提高了生产效率和一致性 | 研究仅针对两种无细胞基因表达检测系统进行了测试，未涵盖所有可能的生物传感器类型 | 提高无细胞生物传感器的生产效率和质量控制 | 无细胞生物传感器的制造过程 | 合成生物学 | NA | 液体处理机器人技术 | NA | NA | 384孔板的氟化物感应无细胞生物传感器 |
| 66 | 2025-03-22 |
Biosynthesis and metabolic engineering of natural sweeteners
2025-Mar-18, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01864-y
PMID:40100508
|
综述 | 本文综述了天然甜味剂的生物合成途径及相关酶，并重点介绍了利用合成生物学方法通过微生物细胞工厂生产这些甜味剂的研究 | 总结了多种天然甜味剂的生物合成途径，并探讨了利用合成生物学技术进行微生物生产的进展 | 未提及具体实验数据或生产规模，主要为基础性综述 | 探讨天然甜味剂的生物合成途径及其微生物生产方法 | 天然甜味剂，如罗汉果苷、甜菊糖苷、甘草酸等 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 67 | 2025-03-22 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-Mar-18, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
|
研究论文 | 本文通过定向进化技术增强羟化酶XcP4H的活性，用于在工程化益生菌中高效生产5-HTP，以治疗抑郁症 | 使用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化，显著提高了5-HTP的产量，并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 解决5-HTP的药代动力学问题，开发一种基于益生菌的活体治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程化益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动力学模拟、基因编辑 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 68 | 2025-03-22 |
Self-pigmenting textiles grown from cellulose-producing bacteria with engineered tyrosinase expression
2025-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02194-3
PMID:38565971
|
研究论文 | 本文通过基因工程改造Komagataeibacter rhaeticus细菌，使其能够生长出自着色细菌纤维素（BC），从而开发出一种可持续的纺织品染色方法 | 通过重组酪氨酸酶表达实现细菌中的黑色素生物合成，使细菌纤维素具有自着色能力，并结合合成生物学工具进行光遗传学图案化基因表达 | NA | 开发可持续的纺织品染色方法，以替代传统的染色工艺 | Komagataeibacter rhaeticus细菌及其生产的细菌纤维素（BC） | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA |
| 69 | 2025-03-22 |
ON-OFF nanopores for optical control of transmembrane ionic communication
2025-Mar, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-024-01823-x
PMID:39838209
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过共价修饰α-溶血素蛋白孔与芳基偶氮吡唑光开关，制造出能够在正交波长照射下在离子电阻和二极管模式之间转换的'光孔' | 创新点在于开发了能够通过特定波长光照射在离子电阻和二极管模式之间转换的光孔，这种光孔能够根据单色或双波长照射调节电流输出，而不依赖于光强度 | NA | 研究目的是开发一种能够精确控制跨膜离子通信的纳米级光开关蛋白，以支持合成生物学、神经科学和生物电子学的研究 | 研究对象是α-溶血素蛋白孔与芳基偶氮吡唑光开关的共价修饰产物 | 生物电子学 | NA | 共价修饰技术 | NA | 离子电流数据 | NA |
| 70 | 2025-03-21 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for Enhanced De Novo Biosynthesis of Icaritin
2025-Mar-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00754
PMID:40106718
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学技术构建了一种微生物细胞工厂，用于从头合成具有抗癌特性的天然黄酮类化合物icaritin（ICT） | 通过优化代谢途径，包括通过甲羟戊酸途径修饰增强DMAPP供应，以及通过截断策略微调EsPT的表达和催化效率，显著提高了ICT产量至247.02 mg/L，这是迄今为止报道的最高微生物ICT滴度 | NA | 提高icaritin（ICT）的产量，以支持其大规模工业生产 | Yarrowia lipolytica酵母 | 合成生物学 | 肝癌 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 71 | 2025-03-21 |
Recent advances in biological synthesis of food additive succinate
2025-Mar-19, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2472636
PMID:40107767
|
综述 | 本文综述了生物合成食品添加剂琥珀酸的最新进展，重点介绍了代谢工程策略在增强琥珀酸生物合成中的应用 | 本文通过先进的合成生物学技术，强调了开发强大的微生物细胞工厂的潜力，并塑造了微生物在工业应用中整合的未来方向 | 尽管在优化发酵过程和下游操作方面做出了大量努力，但仍需提高成本效益和竞争力，同时考虑环境问题 | 提高琥珀酸生物合成的效率和经济效益，同时考虑环境问题 | 琥珀酸 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略，包括发酵调控、代谢调控、细胞调控和模型指导 | NA | NA | NA |
| 72 | 2025-03-20 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
|
研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型，用于增强合成启动子的设计和强度预测 | 首次将扩散模型应用于合成启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，展示了比传统方法更好的性能 | 研究主要针对模型细菌和蓝细菌，未涉及其他生物体 | 优化外源基因表达和代谢途径效率，设计性能优于天然启动子的合成启动子 | 合成启动子 | 合成生物学 | NA | 扩散模型, Transformer模型 | 扩散模型, Transformer模型, 卷积神经网络 | 启动子序列数据 | NA |
| 73 | 2025-03-20 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-Mar-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
|
研究论文 | 本文调查了四种常用质粒骨架在克隆和野生型大肠杆菌菌株中多聚体的形成情况，并提出了避免多聚体产生的单基因敲除方法 | 首次系统地调查了常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异，并提出了通过单基因敲除避免多聚体产生的方法 | 仅在大肠杆菌的两种菌株中进行了实验，未在其他宿主或质粒系统中验证 | 优化基于质粒的合成生物学电路的设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架及其在大肠杆菌菌株JM109和MG1655中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒克隆、单基因敲除 | NA | NA | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的实验 |
| 74 | 2025-03-19 |
Natural, modified and conjugated carbohydrates in nucleic acids
2025-Mar-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00799a
PMID:39936337
|
review | 本文综述了核酸中天然、修饰和共轭碳水化合物的研究进展，特别强调了在治疗应用、异源核酸（XNAs）开发以及核酸病因学探究方面的最新进展 | 强调了糖修饰在核酸中的重要性，特别是在治疗应用和异源核酸开发方面的创新 | 主要集中于糖修饰的综述，未涉及其他类型的核酸修饰 | 探讨核酸中糖修饰的主要动机及其在治疗、生物技术和合成生物学中的应用 | 核酸中的糖修饰 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2025-03-19 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-Mar-17, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
|
研究论文 | 本文介绍了在合成细胞中直接表达RNA折纸细胞骨架模拟物的方法，以替代依赖化学合成和热退火的DNA纳米结构 | 使用RNA折纸技术直接在合成细胞中表达细胞骨架模拟物，实现了在等温条件下自组装成微米级三维RNA折纸纳米管 | NA | 探索基于RNA的活性、可进化的合成细胞 | 合成细胞中的RNA折纸细胞骨架模拟物 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | 分子动力学模拟数据 | NA |
| 76 | 2025-03-19 |
Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots
2025-Mar-17, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01133-5
PMID:40097832
|
研究论文 | 本文开发了一种在活细胞中合成量子点（QDs）的方法，并验证了其在多种细胞中的可行性 | 通过耦合细胞内代谢途径，实现了在活细胞中精确时空序列下合成量子点，解决了传统有机溶剂中合成的量子点生物相容性差的问题 | 需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该过程 | 开发一种生物相容性更好的量子点合成方法，以扩展其在生物医学领域的应用 | 酵母（Saccharomyces cerevisiae）、金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）、MCF-7细胞和MDCK细胞 | 材料科学 | NA | 活细胞合成、准生物合成 | NA | NA | 多种细胞类型（酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞和MDCK细胞） |
| 77 | 2025-03-19 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-Mar-14, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
|
综述 | 本文探讨了基于共聚物的微反应器在酶促反应中的应用及其机制 | 综述了共聚物微反应器在加速酶促反应中的创新机制，包括增强底物和酶浓度、稳定中间产物和提供分子拥挤环境 | 讨论了在共聚物中监测反应的挑战，并回顾了现有技术 | 探讨共聚物微反应器在生物催化、合成生物学和纳米技术中的潜力 | 共聚物微反应器及其在酶促反应中的应用 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱法、NMR光谱 | NA | NA | NA |
| 78 | 2025-03-19 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
|
研究论文 | 本文展示了如何将来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST重新用于人类细胞基因组中的可编程DNA整合 | 使用单Cas12k效应器的V-K CAST系统进行可编程DNA整合，相比需要三个Cas蛋白的Cascade系统更为简化 | 尽管脱靶事件较少，但仍会在特定基因组区域中重复出现 | 加速基因组编辑在治疗开发、生物技术和合成生物学中的应用 | 人类细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | NA | DNA | 多种人类细胞类型 |
| 79 | 2025-03-19 |
Magnetizing Biotech-Advances in (In Vivo) Magnetic Enzyme Immobilization
2025-Mar, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.70000
PMID:40083857
|
综述 | 本文综述了磁性酶固定化的现有和新兴方法，特别关注体内固定化解决方案 | 结合合成生物学和多功能材料（如磁性纳米材料）的发展，提出了新的酶固定化方法，提高了分离和纯化过程的效率 | NA | 提高工业生物催化中酶的稳定性和活性，改善酶的使用效率 | 酶固定化方法，特别是磁性蛋白固定化 | 生物技术 | NA | 磁性纳米材料 | NA | NA | NA |
| 80 | 2025-03-18 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CasGen的新型生成模型，用于设计CRISPR Cas蛋白，通过分类和基于边缘的优化来提高新生成Cas9和Cas12蛋白的质量 | CasGen是一种基于Transformer的深度生成模型，结合了分类、贝叶斯优化和AlphaFold结构验证，以增强新生成Cas蛋白的功能性和结构相似性 | 研究依赖于现有的Cas9和Cas12蛋白序列数据，可能限制了生成蛋白的多样性 | 扩展基因组编辑工具包，设计更多样化的Cas蛋白，以应用于合成生物学和治疗领域 | Cas9和Cas12蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold结构预测、BLAST序列比对 | Transformer | 蛋白质序列 | 3,021个Cas9、597个Cas12和597个非Cas蛋白序列 |