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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-04-19 |
Untranslated region engineering strategies for gene overexpression, fine-tuning, and dynamic regulation
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2501033
PMID:40195839
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综述 | 本文综述了非翻译区(UTR)工程策略在细菌基因表达优化中的最新进展 | 探讨了通过AU富集元件、RG4结构和合成双UTR增强蛋白表达的方法,以及利用UTR文库和合成终止子精细调控基因表达的策略 | 主要关注细菌系统,可能不直接适用于其他生物体 | 优化细菌基因表达以促进生物技术应用 | mRNA的非翻译区(UTR) | 合成生物学 | NA | UTR工程、核糖开关、立足点开关 | NA | NA | NA |
82 | 2025-04-16 |
New avenues in photosynthesis: from light harvesting to global modeling
2025 Mar-Apr, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70198
PMID:40231858
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综述 | 本文综述了第二届欧洲光合作用研究大会上提出的最新研究进展,重点关注提高光合作用效率和跨尺度建模 | 探讨了优化光捕获和碳固定的策略,以及利用极端环境适应植物的独特见解来同时提高光合作用效率和抗逆性 | 作为一篇小型综述,可能未涵盖光合作用研究的所有最新进展 | 提高光合作用效率、优化建模方法,以应对全球粮食安全和环境可持续性等挑战 | 光合作用过程及其在不同尺度上的建模 | 植物生理学 | NA | 合成生物学、动态代谢过程建模 | 跨尺度光合作用模型 | NA | NA |
83 | 2025-04-15 |
Toward Sustainable Polyhydroxyalkanoates: A Next-Gen Biotechnology Approach
2025-Mar-22, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17070853
PMID:40219244
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research paper | 本文探讨了利用极端微生物生产聚羟基脂肪酸酯(PHAs)作为可持续生物聚合物的新一代生物技术方法 | 利用极端微生物(特别是嗜盐菌)进行PHA生产,结合代谢工程、合成生物学和CRISPR基因组编辑技术提高产量,并采用AI驱动的发酵和环保下游处理技术 | 虽然展示了工业化生产的潜力,但商业化规模的经济可行性和技术优化仍需进一步验证 | 开发可持续的PHA生产方法以减少塑料污染 | 极端微生物(如嗜盐菌)及其在PHA生产中的应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、CRISPR基因组编辑、AI驱动的发酵 | NA | NA | NA |
84 | 2025-04-10 |
Regulatory and Catalytic Domains of Poly(ADP-ribose) Polymerases Cross-Complement for DNA-Break-Dependent Allosteric Stimulation of Catalytic Activity
2025-03-21, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00582
PMID:39935093
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研究论文 | 研究探讨了不同来源的PARPs蛋白的调控域(REG)和催化域(CAT)能否相互组装形成功能性嵌合体 | 揭示了PARPs蛋白的REG和CAT域可以独立于变构配体相互作用,并且可以在DNA存在下组装成功能活性构象 | 研究仅限于体外实验,尚未在活细胞中验证 | 探究PARPs蛋白的调控域和催化域的交叉互补性及其功能活性 | 哺乳动物(hPARP1和hPARP2)、植物(atPARP2)和细菌(haPARP)的PARPs蛋白 | 分子生物学 | NA | 定性和定量酶活性测定及结合研究 | NA | NA | NA |
85 | 2025-04-09 |
Synthetic transcription factors establish the function of nine amino acid transactivation domains of Komagataella phaffii Mxr1
2025-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108211
PMID:39855340
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研究论文 | 该研究通过合成转录因子验证了Komagataella phaffii Mxr1中九个氨基酸转录激活域(9aaTADs)的功能 | 首次全面表征了K. phaffii锌指转录因子中的9aaTADs,并揭示了其通过Gcn5介导的组蛋白乙酰化激活转录的机制 | 研究仅针对K. phaffii中的Mxr1转录因子,其他物种或转录因子中的9aaTADs功能尚未验证 | 探究K. phaffii Mxr1转录因子中多个9aaTADs的功能及其转录激活机制 | Komagataella phaffii Mxr1转录因子及其9aaTADs | 合成生物学 | NA | 合成转录因子构建、基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 21个推定的9aaTADs(TAD B-V)及1个已知的TAD A |
86 | 2025-04-09 |
Advancing microbial engineering through synthetic biology
2025-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2503100
PMID:40195840
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
87 | 2025-04-03 |
[Preface for special issue on AI-driven biomanufacturing]
2025-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250197
PMID:40170303
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评论 | 本期特刊探讨了人工智能驱动的生物制造的机遇、挑战和发展现状 | 综述了人工智能在生物制造领域的创新应用,包括智能设计、构建生物部件、电路和人工细胞,以及智能生物过程控制与优化 | NA | 把握人工智能驱动的生物制造的创新与发展 | 生物制造领域的技术创新和产业发展 | 生物制造 | NA | 人工智能 | NA | 生物大数据 | NA |
88 | 2025-04-01 |
Scaling-up molecular logic to meso-systems via self-assembly
2025-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58379-0
PMID:40148329
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research paper | 该研究展示了通过自组装系统实现分子逻辑计算向介观系统的扩展 | 首次展示了自组装系统(由环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂组成)能够执行逻辑操作,其中膜本身表现为一个Reset-Set Flip-Flop,并集成了7个以上的逻辑元件 | 人工分子基介观系统在逻辑操作方面的应用仍然非常罕见 | 探索分子逻辑计算在介观系统中的应用 | 自组装系统(环芳烃八羧酸酯和阳离子表面活性剂) | 合成生物学 | NA | 自组装技术 | NA | NA | NA |
89 | 2025-04-01 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith I: Its Narrowing and Potential for the Creation of Novel Microorganisms
2025-Mar-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12030324
PMID:40150788
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research paper | 本文探讨了弗雷德里克·格里菲斯的转化实验的局限性及其在创造新型微生物中的潜力 | 揭示了经典转化实验在创造新型微生物中的局限性,并探讨了其潜在应用 | 转化实验依赖于非常相近的微生物,限制了其创造潜力 | 研究转化实验在合成生物学中的应用及其局限性 | 微生物的基因组转移和转化实验 | 合成生物学 | NA | 基因组转移 | NA | NA | NA |
90 | 2025-03-30 |
Anti-Cancer Strategies Using Anaerobic Spore-Forming Bacteria Clostridium: Advances and Synergistic Approaches
2025-Mar-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15030465
PMID:40141809
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综述 | 本文综述了利用厌氧孢子形成细菌梭菌(Clostridium)进行抗癌策略的最新进展及协同治疗方法 | 探讨了梭菌在癌症治疗中的直接肿瘤溶解、免疫调节及与现有癌症疗法的协同效应,并介绍了通过合成生物学进行的基因改造 | 尽管临床前和临床研究表明梭菌疗法与其他疗法结合具有潜力,但仍存在挑战 | 研究梭菌在癌症治疗中的应用及其与其他疗法的协同效应 | 厌氧孢子形成细菌梭菌(Clostridium) | 癌症治疗 | 癌症 | 合成生物学、基因改造 | NA | NA | NA |
91 | 2025-03-30 |
Engineering Useful Microbial Species for Pharmaceutical Applications
2025-Mar-05, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030599
PMID:40142492
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综述 | 本文综述了微生物工程在制药生物技术中的最新进展,包括基因工程、合成生物学和自适应进化在优化微生物菌株中的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统、合成生物学方法以及AI和ML技术来优化微生物工程,加速新药开发 | 代谢途径的高效优化、可持续的工业规模生产以及满足国际监管要求仍是关键挑战 | 探讨微生物工程在制药领域的应用及其技术进展 | 微生物菌株及其在制药中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、合成生物学、AI和ML | NA | NA | NA |
92 | 2025-03-30 |
Where Biology Meets Engineering: Scaling Up Microbial Nutraceuticals to Bridge Nutrition, Therapeutics, and Global Impact
2025-Mar-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030566
PMID:40142459
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综述 | 本文探讨了微生物平台在营养保健品生产中的变革性作用,强调了先进的发酵技术、合成生物学和代谢工程 | 微生物生物技术作为一种可持续替代方案,利用微生物细胞作为生物工厂,高效合成生物活性化合物 | 优化微生物菌株、确保产品质量和规模化生产仍面临挑战 | 探讨微生物平台在营养保健品生产中的应用及其全球健康影响 | 微生物细胞及其合成的生物活性化合物 | 生物技术 | 肥胖、糖尿病、心血管疾病、癌症 | CRISPR/Cas9基因组编辑、适应性进化、生物反应器创新 | NA | NA | NA |
93 | 2025-03-28 |
Outlook on Synthetic Biology-Driven Hydrogen Production: Lessons from Algal Photosynthesis Applied to Cyanobacteria
2025-Mar-20, Energy & fuels : an American Chemical Society journal
IF:5.2Q1
DOI:10.1021/acs.energyfuels.4c04772
PMID:40134520
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综述 | 本文探讨了合成生物学驱动的氢生产前景,借鉴了藻类光合作用的经验应用于蓝藻 | 利用合成生物学技术精确调控PSII活性,避免传统营养剥夺方法的副作用,优化氢生产效率 | NA | 开发可持续的清洁能源生产方法,推动碳中和未来 | 蓝藻(特别是PCC 6803菌株) | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
94 | 2025-03-27 |
Introduction: Synthetic Biology
2025-Mar-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00158
PMID:40134283
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
95 | 2025-03-27 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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research paper | 该研究提出了一种高效的无疤痕体外组装方法,用于构建功能性人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 开发了一种基于Gibson等温组装的迭代体外组装方法,能够无疤痕地组装复杂且高度重复的百kb级IGHV基因片段 | 未提及该方法在其他类型基因组片段组装中的适用性 | 开发大规模人类基因组片段的高效体外组装技术 | 人类免疫球蛋白重链可变区(IGHV)基因片段 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | 百kb级的IGHV基因片段 |
96 | 2025-03-26 |
Reprogramming Komagataella phaffii for a Robust Chassis toward Efficient De Novo Biosynthesis of (-)-α-Bisabolol
2025-Mar-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c11904
PMID:40131269
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研究论文 | 本研究通过优化MVA途径和融合法尼基二磷酸合酶与比沙波醇合酶,成功在Komagataella phaffii中实现了高效生产(-)-α-比沙波醇 | 通过工程化辅因子NADPH、分子伴侣和转录因子,构建了强健的(-)-α-比沙波醇生产菌株KB-30,并在5 L补料分批发酵罐中实现了32.8 g/L的最高产量 | 未明确提及研究的局限性 | 开发一种高效、可持续的微生物细胞工厂生产(-)-α-比沙波醇 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、代谢工程 | NA | NA | 5 L补料分批发酵罐 |
97 | 2025-03-22 |
Biosynthesis and metabolic engineering of natural sweeteners
2025-Mar-18, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01864-y
PMID:40100508
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综述 | 本文综述了天然甜味剂的生物合成途径及相关酶,并重点介绍了利用合成生物学方法通过微生物细胞工厂生产这些甜味剂的研究 | 总结了多种天然甜味剂的生物合成途径,并探讨了利用合成生物学技术进行微生物生产的进展 | 未提及具体实验数据或生产规模,主要为基础性综述 | 探讨天然甜味剂的生物合成途径及其微生物生产方法 | 天然甜味剂,如罗汉果苷、甜菊糖苷、甘草酸等 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
98 | 2025-03-21 |
Recent advances in biological synthesis of food additive succinate
2025-Mar-19, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2472636
PMID:40107767
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综述 | 本文综述了生物合成食品添加剂琥珀酸的最新进展,重点介绍了代谢工程策略在增强琥珀酸生物合成中的应用 | 本文通过先进的合成生物学技术,强调了开发强大的微生物细胞工厂的潜力,并塑造了微生物在工业应用中整合的未来方向 | 尽管在优化发酵过程和下游操作方面做出了大量努力,但仍需提高成本效益和竞争力,同时考虑环境问题 | 提高琥珀酸生物合成的效率和经济效益,同时考虑环境问题 | 琥珀酸 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略,包括发酵调控、代谢调控、细胞调控和模型指导 | NA | NA | NA |
99 | 2025-03-19 |
Magnetizing Biotech-Advances in (In Vivo) Magnetic Enzyme Immobilization
2025-Mar, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/elsc.70000
PMID:40083857
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综述 | 本文综述了磁性酶固定化的现有和新兴方法,特别关注体内固定化解决方案 | 结合合成生物学和多功能材料(如磁性纳米材料)的发展,提出了新的酶固定化方法,提高了分离和纯化过程的效率 | NA | 提高工业生物催化中酶的稳定性和活性,改善酶的使用效率 | 酶固定化方法,特别是磁性蛋白固定化 | 生物技术 | NA | 磁性纳米材料 | NA | NA | NA |
100 | 2025-03-18 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
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研究论文 | 本文提出了一种名为CasGen的新型生成模型,用于设计CRISPR Cas蛋白,通过分类和基于边缘的优化来提高新生成Cas9和Cas12蛋白的质量 | CasGen是一种基于Transformer的深度生成模型,结合了分类、贝叶斯优化和AlphaFold结构验证,以增强新生成Cas蛋白的功能性和结构相似性 | 研究依赖于现有的Cas9和Cas12蛋白序列数据,可能限制了生成蛋白的多样性 | 扩展基因组编辑工具包,设计更多样化的Cas蛋白,以应用于合成生物学和治疗领域 | Cas9和Cas12蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold结构预测、BLAST序列比对 | Transformer | 蛋白质序列 | 3,021个Cas9、597个Cas12和597个非Cas蛋白序列 |