合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-03-05	Logic-Gated Modulation of Cell Migration via Mesoscale Mechanical Uncaging Effects 2025-Mar-04, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c16194 PMID:39980204	研究论文	本文展示了通过DNA折纸纳米弹簧系统实现机械笼/解笼效应，精确控制癌细胞迁移	利用DNA作为编程语言，创建响应不同miRNA输入的逻辑门（布尔AND和OR门），通过机械和结构变化解笼RGD配体，抑制癌细胞迁移	NA	研究通过机械解笼效应控制癌细胞迁移的策略，并探索其在靶向药物递送中的应用	癌细胞	合成生物学	癌症	DNA折纸自组装	NA	NA	NA
122	2025-03-05	The bacterial symbionts of Entomopathogenic nematodes and their role in symbiosis and pathogenesis 2025-Mar-01, Journal of invertebrate pathology IF:3.6Q1 DOI:10.1016/j.jip.2025.108295 PMID:40032241	研究论文	本文总结了昆虫病原线虫（EPN）与其细菌共生体之间的共生关系，重点关注它们的适应性和成功利用昆虫宿主的能力，并回顾了天然产物研究的历史，强调了最近的发现和当前实施的合成生物学方法	本文不仅总结了EPN与其细菌共生体的共生关系，还强调了天然产物研究的最新进展和合成生物学方法的应用，以识别具有改进生物活性的非天然衍生物	本文主要关注EPN与其细菌共生体的共生关系，未涉及其他可能的共生系统或更广泛的生态学背景	研究昆虫病原线虫与其细菌共生体之间的共生关系及其在昆虫宿主中的适应性和利用能力	昆虫病原线虫（EPN）及其细菌共生体（Xenorhabdus和Photorhabdus）	生态学与进化生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
123	2025-03-05	Harnessing oleaginous protist Schizochytrium for docosahexaenoic acid: Current technologies in sustainable production and food applications 2025-Mar, Food research international (Ottawa, Ont.) DOI:10.1016/j.foodres.2025.115996 PMID:40032480	综述	本文综述了利用油性原生生物裂殖壶菌生产二十二碳六烯酸（DHA）的当前生物技术，特别关注菌株改良、发酵优化、DHA油提取策略、安全评估和稳定性维护方案，以及DHA产品在食品中的应用	提出了利用多种育种技术改良菌株、考虑人工智能和机器学习优化发酵过程、引入纳米颗粒包装技术提高DHA产品的氧化稳定性、用特色风味食品掩盖DHA气味缺陷，以及利用合成生物学构建含DHA的结构脂质以开发潜在功能的建议	裂殖壶菌DHA产品的广泛应用受到菌株性能、发酵参数、产品收获和提取策略、安全性和稳定性维护以及健康和功能特性应用限制等因素的影响	探索裂殖壶菌DHA的生产技术并推动其在食品和健康领域的应用发展	油性海洋原生生物裂殖壶菌	生物技术	NA	发酵优化、纳米颗粒包装技术、合成生物学	NA	NA	NA
124	2025-03-04	Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design 2025-Mar-03, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202401969 PMID:40025899	综述	本文介绍了合成生物学纳米医学的基本概念，并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与区别	提出了合成生物学纳米医学这一新概念，区别于传统或仿生纳米医学，采用基因工程策略进行设计	讨论了利用合成生物学开发纳米医学的潜在优势和挑战，但未具体说明具体挑战内容	探索合成生物学与纳米医学的融合，推动纳米医学在疾病诊断和治疗中的应用	合成生物学纳米医学	合成生物学	NA	基因工程	NA	NA	NA
125	2025-03-02	Producing multiple chemicals through biological upcycling of waste poly(ethylene terephthalate) 2025-Mar, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2024.10.018 PMID:39581772	研究论文	本文描述了开发用于Rhodococcus jostii RPET菌株的遗传工具，以从废弃PET瓶中生产多种化学品	开发了两种可诱导和可调节的表达系统以及基于丝氨酸整合酶的重组工具（SIRT），用于RPET菌株的基因组编辑，并成功生产了多种化学品，包括番茄红素、脂质和琥珀酸	非模式微生物的合成生物学工具稀缺，限制了微生物细胞工厂的开发	通过生物升级循环废弃PET，生产多种化学品	Rhodococcus jostii RPET菌株	合成生物学	NA	基因组编辑、可诱导和可调节的表达系统、丝氨酸整合酶重组工具（SIRT）	NA	NA	废弃PET瓶
126	2025-03-01	Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences 2025-Mar, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01733-y PMID:39266721	研究论文	本文提出了一种在不改变内源基因编码序列的情况下，将基因传感器整合到内源基因中的方法	通过将单导RNA插入到基因的终止区域，实现了在不改变内源基因编码序列的情况下激活下游电路	该方法可能对基因的终止区域功能产生影响，且需要进一步验证其在不同细胞类型和基因中的适用性	开发一种在不改变内源基因编码序列的情况下，实现基因传感和响应的方法	CHO-K1细胞	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	数学模型	基因表达数据	CHO-K1细胞
127	2025-03-01	Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells 2025-Mar, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01783-2 PMID:39753704	研究论文	本文介绍了一种在哺乳动物细胞中实现定向进化和达尔文适应的正交RNA复制系统	开发了一种正交的RNA复制系统，通过RNA复制酶辅助的连续进化（REPLACE）在增殖的哺乳动物细胞中进行定向进化	NA	推进合成生物学和细胞工程应用	哺乳动物细胞	合成生物学	NA	正交RNA复制系统	NA	RNA	NA
128	2025-02-27	Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas 2025-Mar, Science China. Life sciences DOI:10.1007/s11427-024-2699-5 PMID:39231901	研究论文	本文聚焦于CRISPR系统中非DSB编辑器BE和PE的发展与创新，探讨了改进思路在BE和PE开发中的应用，并总结了CRISPR技术创新的思维反转和飞跃	提出了通过'替代'、'组合'、'适应'和'调整'等改进思路来发展非DSB编辑器BE和PE，并总结了CRISPR技术创新的思维反转和飞跃	未提及具体的技术限制或实验数据	探讨CRISPR/Cas基因编辑技术的发展与创新，特别是非DSB编辑器BE和PE的开发	CRISPR/Cas系统中的非DSB编辑器BE和PE	基因编辑	NA	CRISPR/Cas基因编辑技术	NA	NA	NA
129	2025-02-25	Interfacing bacterial microcompartment shell proteins with genetically encoded condensates 2025-Mar, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.70061 PMID:39969154	研究论文	本文展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，形成涂层，用于合成细胞和细胞器的开发	首次展示了细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体相结合，形成稳定的涂层，并展示了其在合成生物学中的应用	涂层的形成依赖于pH和蛋白质浓度，且一旦形成后不与稀释相交换	研究细菌微区室壳蛋白与基因编码的凝聚体结合，以控制液-液相分离区室的特性	细菌微区室壳蛋白（BMC-H）和由RGG-RGG结构域形成的蛋白质凝聚体	合成生物学	NA	基因工程	NA	蛋白质数据	NA
130	2025-02-23	Engineering microbial cell factories by multiplexed spatiotemporal control of cellular metabolism: Advances, challenges, and future perspectives 2025 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108497 PMID:39645209	综述	本文全面总结了时空控制系统在构建高性能微生物细胞工厂中的最新进展，并探讨了其在不同微生物物种中的应用及未来挑战	探讨了合成生物学时代下，时空控制系统在微生物代谢工程中的创新应用，特别是设计合成隔室在构建高性能微生物细胞工厂中的潜力	文章未提及具体实验数据或案例研究，主要集中于理论探讨和未来展望	研究目的是探讨时空控制系统在微生物代谢工程中的应用，以构建高性能的微生物细胞工厂	研究对象是微生物细胞工厂及其代谢过程	合成生物学	NA	时空控制系统	NA	NA	NA
131	2025-02-23	Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions 2025 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514 PMID:39755221	综述	本文综述了细菌糖蛋白工程领域的最新进展，重点关注合成生物学和代谢工程在开发新型糖蛋白治疗和疫苗中的应用	本文从合成生物学和代谢工程的角度，详细介绍了细菌糖蛋白工程的最新进展，特别是利用原核糖基化平台生产高价值定制糖蛋白的四个关键要素	尽管细菌糖蛋白工程取得了显著进展，但仍面临一些挑战，如如何进一步提高糖基化模式的精确控制和开发更高效的微生物糖工厂和无细胞系统	研究目的是探讨细菌糖蛋白工程在合成生物学和代谢工程中的应用，特别是开发新型糖蛋白治疗和疫苗	研究对象包括糖基转移酶、载体蛋白、糖基供体和宿主细菌	合成生物学	NA	蛋白糖基化耦合技术	NA	NA	NA
132	2025-02-23	Recent advances in synthetic biology toolkits and metabolic engineering of Ralstonia eutropha H16 for production of value-added chemicals 2025 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108516 PMID:39793936	综述	本文综述了针对Ralstonia eutropha H16的合成生物学工具包的发展及其在代谢工程中的应用，以生产高附加值化学品	本文首次概述了为Ralstonia eutropha H16量身定制的合成生物学工具的发展，包括表达载体、调控元件和转化技术的构建	NA	研究目的是开发和应用合成生物学工具和策略，以工程化Ralstonia eutropha H16的代谢，生产高附加值化学品	Ralstonia eutropha H16	合成生物学	NA	转录组学、蛋白质组学、代谢组学	NA	基因组序列、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据	NA
133	2025-02-23	Cell-free systems: A synthetic biology tool for rapid prototyping in metabolic engineering 2025 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108522 PMID:39863189	review	本文综述了无细胞系统（CFS）在代谢工程中作为快速原型设计工具的应用	无细胞系统提供了减少代谢干扰、精确控制反应条件、减少劳动力和缩短设计-构建-测试-学习周期的优势，并通过体外分隔策略实现超高通量筛选	本文主要关注无细胞系统在细菌中的基因调控、酶和多酶反应方面的应用，未涉及其他生物系统的详细讨论	探讨无细胞系统在代谢工程中作为快速原型设计工具的潜力	基因电路、代谢途径和酶功能	合成生物学	NA	无细胞系统（CFS）	NA	NA	NA
134	2025-02-21	Construction and characterization of a mutant library for the P23 constitutive promoter in lactic acid bacteria 2025-Mar, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.015 PMID:39848497	研究论文	本研究构建并表征了乳酸菌中P23组成型启动子的突变体库，以丰富乳酸菌启动子库	首次提供了一组显著不同的P组成型启动子突变体元素，为乳酸菌的代谢工程和合成生物学应用奠定了基础	突变体库在乳酸菌中表现出特异性，但在大肠杆菌中表现出显著差异，可能限制了其跨物种应用的广泛性	丰富乳酸菌启动子库，为代谢工程和合成生物学应用提供基础	乳酸菌中的P23组成型启动子	合成生物学	NA	错误倾向PCR和dNTP类似物诱导的随机突变	NA	荧光强度数据	247个P启动子突变体
135	2025-02-20	Systematic molecular dissection of key intermediates in xanthones biosynthesis in Cudrania tricuspidata and establishment of a viable heterologous expression system 2025-Mar, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109524 PMID:39869995	研究论文	本研究系统解析了柘树中黄酮类化合物生物合成的关键中间体，并建立了一个可行的异源表达系统	首次克隆并表征了柘树中参与黄酮类化合物生物合成的关键酶基因，并成功在酵母和烟草中进行了异源表达	研究中仅初步建立了2,3',4,6-四羟基苯甲酮的异源合成系统，尚未实现完整黄酮类化合物的异源生产	解析柘树中黄酮类化合物的生物合成途径，并建立其异源生产系统	柘树中的黄酮类化合物及其生物合成关键酶	合成生物学	NA	基因克隆、异源表达	NA	基因序列、酶活性数据	柘树根组织、酵母和烟草作为异源表达宿主
136	2025-02-17	Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes 2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.abb.2025.110307 PMID:39824239	研究论文	本文探讨了细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶的机制和应用	最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制，并识别了关键催化残基如His44，这些残基促进了光生成中重要的黄素中间体的生成	实现红移发射、优化信号强度以及识别与发光物种生成相关的机制等挑战性问题仍有待探索	研究目的是更好地理解LuxAB反应，并探索其在生物技术和生物医学应用中的潜力	细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶	生物技术	NA	蛋白质工程和合成生物学	NA	NA	NA
137	2025-02-12	New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza 2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384 PMID:39756484	综述	本文综述了丹参中丹参酮生物合成的最新生物技术工程策略	总结了丹参酮的生物活性、生物合成途径及调控、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学的最新进展	未提及具体实验数据或样本量	提高丹参中丹参酮的产量	丹参（Salvia miltiorrhiza）	生物技术	心血管疾病	合成生物学、表观遗传修饰	NA	NA	NA
138	2025-02-09	Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases 2025-Mar-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005 PMID:39613152	研究论文	本文提出了一种通过共表达细胞器间连接蛋白和脂肪酶来增加工程化酿酒酵母中脂肪酸积累的新策略	通过比较油性和非油性酵母的脂滴形态变化，开发了一种新的工程策略，通过调控与脂滴相关的调节因子和脂肪酶来增加酿酒酵母中的脂肪酸积累	NA	提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力	酿酒酵母	合成生物学	NA	基因工程	NA	NA	NA
139	2025-02-09	A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D 2025-Mar-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.001 PMID:39638031	研究论文	本文介绍了一种针对Cyanidioschyzon merolae 10D的快速转化协议和核转基因表达工具，用于代谢工程	优化了转化和选择协议，能够在两周内获得单氯霉素抗性转化体，并开发了合成模块质粒工具包，包括新的荧光报告基因	NA	促进Cyanidioschyzon merolae作为代谢工程和未来可持续生物技术生产的藻类系统	Cyanidioschyzon merolae 10D	合成生物学	NA	荧光报告基因成像和分析技术	NA	NA	NA
140	2025-02-09	Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain 2025-Mar-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005 PMID:39708916	研究论文	本研究通过工程化改造Comamonas testosteroni RW31菌株，验证了其能够将聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）降解为单体并生产生物塑料聚羟基丁酸酯（PHB）的能力	首次验证了Comamonas testosteroni RW31菌株能够通过异源表达PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase，成功降解PET并生产PHB	研究中PET的降解率在体外和体内分别为37.1%和0.83%，体内降解效率较低	探索将PET废料转化为生物塑料PHB的合成生物学策略	Comamonas testosteroni RW31菌株	合成生物学	NA	异源表达、酶降解	NA	实验数据	NA