合成生物学相关文章
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当前共找到 105 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-19 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究方法论文 | 该方案描述了通过敲除minD基因并利用差异离心、过滤和药物处理从植物乳杆菌中生成和纯化无核小细胞的方法 | 首次在益生菌植物乳杆菌中建立小细胞生产平台，拓展了小细胞技术 beyond 传统模型细菌 | 仅通过显微镜和流式细胞术验证了小细胞的纯度，未进行体内递送实验验证其功能 | 建立从植物乳杆菌中生成和纯化小细胞的标准化方案，为治疗剂递送提供新平台 | 植物乳杆菌（Lactiplantibacillus plantarum）小细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心、过滤、DAPI染色、显微镜、流式细胞术 | NA | 图像、流式细胞数据 | NA | 质粒介导的同源重组 | 植物乳杆菌 | NA | 医学 |
| 2 | 2026-09-05 |
A pectin acetyl-transferase facilitates secondary plasmodesmata formation and RNA silencing movement between plant cells
2025-05, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70194
PMID:40353833
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研究论文 | 本研究通过正向遗传筛选发现果胶乙酰转移酶突变影响拟南芥叶片次级胞间连丝的形成，进而调控小RNA和病毒在细胞间的移动 | 首次明确果胶乙酰转移酶在调控次级胞间连丝形成和小RNA移动中的功能，并揭示了果胶酯化修饰影响胞间连丝数量及小RNA移动的机制 | 研究主要在拟南芥中进行，尚需在其他植物物种中验证；此外对于小RNA移动的调控机制仍需进一步阐明 | 阐明植物细胞间小RNA移动的调控机制，特别是次级胞间连丝的形成和功能 | 拟南芥叶片表皮到叶肉组织的小RNA移动，涉及果胶乙酰转移酶突变体 | 植物生物学 | NA | 正向遗传筛选，抗体检测，原子力显微镜 | NA | 基因型数据、表型数据、显微图像 | 拟南芥突变体筛选和相关实验样本 | NA | 拟南芥 | NA | 农业 |
| 3 | 2026-09-04 |
Comparative genomics of three medicinal Glycyrrhiza species unveiled novel candidates for the production of important bioactive compounds
2025-05, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70223
PMID:40384636
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研究论文 | 该研究通过比较基因组学分析了三种药用甘草属植物的基因组，揭示了其生物活性化合物产生的遗传基础 | 首次对三种药用甘草进行了高质量基因组组装，并通过比较分析鉴定了关键转录因子和生物合成途径中的候选基因 | 未提及 | 阐明三种药用甘草中甘草酸等生物活性化合物的生物合成调控机制，为合成生物学和分子育种提供基因资源 | 三种药用甘草属植物（Glycyrrhiza uralensis、G. inflata 和 G. glabra） | 基因组学 | NA | 基因组测序、转录组测序、比较基因组学 | NA | 基因组序列数据、转录组数据 | 三种甘草的基因组分别约为425、447和423 Mb | NA | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 4 | 2026-08-20 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-05-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母细胞中的转化相关重组（TAR）方法成功组装了来自昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段（>44.6 Kb），并通过测序验证了组装质量 | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的合成，实现了超过44.6 Kb的DNA片段高效组装 | 未明确提及局限性，但可能包括突变和缺失的检测以及组装过程对特定序列的依赖性 | 评估TAR方法在昆虫病毒基因组工程研究中的适用性，以实现长DNA片段的合成 | 斜纹夜蛾囊泡病毒3h（HvAV-3h）的dsDNA基因组 | 合成生物学 | NA | 转化相关重组（TAR）、PCR、下一代测序（NGS）、Sanger测序 | NA | DNA序列数据 | 15个PCR片段，3个中型片段，1个长DNA片段（约44.6 Kb） | TAR | 酵母细胞 | NA | 农业 |
| 5 | 2026-08-20 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-05-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了通过代谢工程微生物生产糖酸的不同方法，包括酶法转化、全细胞生物转化和发酵，并强调了代谢工程和合成生物学工具在优化菌株中的应用 | 系统总结了C5和C6糖酸的不同生物合成途径，并突出了CRISPR-Cas和动态调控电路等合成生物学工具在菌株开发中的最新进展 | 未提供具体实验数据或比较不同策略的效率，可能缺乏定量分析 | 回顾和总结微生物生产糖酸的代谢工程策略及其应用 | 微生物菌株（如细菌和酵母）以及C5和C6糖酸 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、发酵 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas、动态调控电路 | 微生物（如细菌和酵母） | 代谢途径工程，包括关键酶过表达、竞争途径删除、辅因子平衡和转运体工程 | 食品、建筑、医疗、纺织、聚合物工业 |
| 6 | 2026-08-20 |
Extracellular Bacterial Production of DNA Hydrogels-Toward Engineered Living Materials
2025-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502199
PMID:40143682
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研究论文 | 本研究首次利用外电活性细菌Shewanella oneidensis生产DNA水凝胶，开发出可复制、自修复和响应外部刺激的工程活材料。 | 首次在活细菌环境中原位生产DNA水凝胶，利用SpyCatcher/SpyTag技术开发诱导型细胞表面锚点，实现生物杂化材料的动态和导电特性。 | 研究尚未充分探讨材料的长期稳定性和规模化生产可行性。 | 建立基于DNA水凝胶的工程活材料的生产方法，并验证其在生物电化学系统中的电流生成能力。 | Shewanella oneidensis菌株和DNA水凝胶。 | 合成生物学 | NA | DNA水凝胶合成、SpyCatcher/SpyTag技术、生物电化学系统 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量。 | SpyCatcher/SpyTag系统 | Shewanella oneidensis | 诱导型细胞表面锚点、DNA水凝胶形成路径 | 生物技术、能源 |
| 7 | 2026-08-19 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本文建立了一个基于合成生物学的平台，用于开发可诱导产生重组腺相关病毒血清型8（rAAV8）的稳定生产细胞系，并通过优化提高了产量。 | 该平台能够将生产细胞系的构建流程从rAAV2扩展到rAAV8，通过修改包装模块和增加VP123基因拷贝数，显著提高rAAV8的产量，达到与三质粒转染相当的水平。 | 初始细胞系的产量低于传统三质粒转染，且Cap蛋白生产和衣壳形成是限制因素。 | 开发一种稳健的合成生物学平台，用于构建不同血清型的rAAV生产细胞系，提高基因治疗用病毒载体的生产效率。 | 重组腺相关病毒血清型8（rAAV8）及其生产细胞系。 | 合成生物学 | NA | 基因组整合、质粒转染、诱导表达 | NA | 实验数据 | 4个细胞系 | 合成生物学方法（具体工具未提及） | HEK293细胞 | 包含基因组模块、复制模块和包装模块的遗传电路，用于诱导rAAV8生产。 | 医学 |
| 8 | 2026-08-19 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
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研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自费氏弧菌的LuxRI群体感应系统，实现细胞密度依赖的蛋白质过表达，并通过启动子进化提高表达水平 | 首次在枯草芽孢杆菌中功能重构LuxRI群体感应系统，实现与细胞生长协调的蛋白质生产，无需化学诱导剂；通过两轮启动子进化获得活性增强的突变体，并结合强终止子进一步提升表达 | 摘要中未提及具体局限性 | 开发一种高效且无需诱导剂的枯草芽孢杆菌重组蛋白表达系统，实现细胞生长与生产协调 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）及源自费氏弧菌的LuxRI群体感应系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、启动子进化、群体感应系统重构 | NA | 基因序列 | 4个启动子突变体（P22, P47, P56, P58） | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | LuxRI群体感应基因电路，包含输出控制启动子P及强终止子TB5 | 工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-30 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
|
研究论文 | 本文研究了5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等修饰碱基对RNA三维折叠景观及结构-功能关系的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变关键连接处的堆积能量而非碱基配对来驱动RNA构象转变，并影响其动力学成熟 | 未涉及其他常见修饰碱基（如假尿苷、N6-甲基腺苷）的影响，且仅在两种特定RNA结构中进行验证 | 阐明碱基修饰对RNA折叠和功能的影响机制，为合成生物学和治疗方法中功能性RNA的开发提供设计原则 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学， 结构生物学 | NA | 冷冻电镜， FRET | NA | 图像 | 两种RNA结构 | RNA折纸 | NA | RNA折纸纳米结构， 核酶 | 医学， 合成生物学 |
| 10 | 2026-07-30 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
|
研究论文 | 提出一种利用激光诱导高速微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现按需、可靠且可重复地生成细胞大小脂质体 | 未提及具体局限性 | 开发一种按需生产脂质体的新方法，推动合成生物学和膜科学的发展 | 细胞大小的脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物化学研究，合成生物学 |
| 11 | 2026-07-29 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-05-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
|
研究论文 | 本研究介绍Ponceau S作为蛋白质液-液相分离的选择性调节剂，并在牛血清白蛋白和溶菌酶中监测相分离过程 | 首次发现Ponceau S可作为蛋白质液-液相分离的靶向调节剂，同时利用其荧光增强特性实现相分离的可视化监测 | 仅针对两种模型蛋白进行研究，缺乏在复杂细胞环境中的验证 | 探索小分子Ponceau S对蛋白质液-液相分离的精确调控能力 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 机器学习 | NA | 荧光光谱分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物分子工程、药物递送、合成生物学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-05-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子（特别是非天然氨基酸）的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降，且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性，为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 13 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-05-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器，用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象，并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器，用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标（miRNA-21）和非核酸靶标（卡那霉素） | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统，硫代磷酸酯修饰技术，荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量，但检测限达到100 fM（miRNA-21）和100 pM（卡那霉素） | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2026-07-19 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-05-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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研究论文 | 通过设计生物相容性前体，精确调控细胞内量子点的合成，实现细胞长期追踪 | 发现细胞适应性硒代胱氨酸可被还原为低毒硒前体，与及时添加的Ag-谷胱甘肽结合生成近红外AgSe量子点，抑制细胞毒性物质产生并显著提高细胞活力和量子点荧光强度 | NA | 实现细胞内近红外量子点的生物相容性合成，并维持细胞增殖和肿瘤发生能力以用于长期追踪 | 细胞及其合成的近红外AgSe量子点 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 图像 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生物相容性前体耦合法用于细胞内量子点合成 | 医学, 生物成像 |
| 15 | 2026-07-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 开发了一种多模块组装先导编辑系统（mPE），显著提高双子叶植物中精确多碱基插入效率 | 首次在双子叶植物中通过拆分PE系统并利用pol II策略表达pegRNA，构建mPE系统，实现高达1288.5倍的效率提升，并能在原始PE2无法编辑的位点进行编辑 | 仅在拟南芥和本氏烟草两种模式植物中验证，尚未在作物或其他双子叶植物中测试，且多碱基插入的改善机制需进一步阐明 | 解决双子叶植物中先导编辑效率低下和不一致的问题 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 数字病理学 | NA | 先导编辑（PE）、农杆菌介导转化、深度扩增子测序 | NA | 序列数据 | 0.2-0.5百万条总清晰读长的深度扩增子测序数据 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装先导编辑系统（mPE） | 农业, 植物合成生物学 |
| 16 | 2026-05-12 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-05-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 揭示了甘草素完全生物合成途径，并通过合成生物学方法在酵母中实现从简单碳源的从头重建 | 首次完整阐明甘草素生物合成途径，特别是氧化环化步骤，并鉴定出之前未表征的还原酶和五个P450酶基因 | 未提及具体局限性 | 阐明甘草素生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘草素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养实验、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草、酿酒酵母 | 甘草素从头生物合成途径 | 农业、生物学 |
| 17 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 18 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 19 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增，旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力，并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别，这是一种新的策略 | 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增，但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作，且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增，表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 | 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌） | 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP，并测试过表达限速基因GcpE | 医学 |
| 20 | 2026-03-31 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-05-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了利用微生物系统异源合成倍半萜醇的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了包括适应性倍半萜醇合酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及应对萜类化合物毒性的耐受性策略在内的多种创新方法 | NA | 推进倍半萜醇生物合成研究，以克服其工业化应用面临的产量低、成本高等挑战 | 倍半萜醇化合物及其微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇生物合成途径 | 制药, 食品, 化妆品 |