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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-07-11 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
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综述 | 本文综述了麦角硫因的微生物合成研究进展及其发展前景 | 系统探讨了合成生物学和基因工程技术在提高麦角硫因生物合成效率中的应用 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨麦角硫因的微生物合成方法及其在食品、医药和化妆品行业的应用潜力 | 麦角硫因及其微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、发酵工艺优化 | NA | NA | NA |
2 | 2025-07-01 |
Next-Generation Vaccine Platforms: Integrating Synthetic Biology, Nanotechnology, and Systems Immunology for Improved Immunogenicity
2025-May-30, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13060588
PMID:40573919
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综述 | 本文探讨了下一代疫苗平台的变革潜力,重点关注合成生物学、纳米技术和系统免疫学的结合应用 | 整合合成生物学、纳米技术和系统免疫学,设计具有改进免疫原性的抗原成分,并通过纳米技术实现精确的抗原递送和免疫激活 | 面临可扩展性、安全性评估以及数据驱动疫苗设计的伦理问题等挑战 | 开发下一代疫苗平台,以应对复杂和快速演变的病原体 | SARS-CoV-2、Epstein-Barr病毒等病原体 | 系统免疫学 | 传染病 | 合成生物学、纳米技术、系统免疫学、多组学数据分析、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA |
3 | 2025-06-30 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-May-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 研究2'-脱氧鸟苷感应mRNA元件在基因开关调控中的关键作用 | 揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录中间体阶段的调控机制,而非简单的二元开关 | 研究仅针对2'-脱氧鸟苷感应核糖开关,其他核糖开关的机制可能不同 | 探究核糖开关在基因表达调控中的分子机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关(dGsw) | 分子生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 生化实验数据 | NA |
4 | 2025-06-29 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-May-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
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研究论文 | 本研究在大肠杆菌W3110细胞中同时引入了Wzy/Wzx依赖和ABC转运体依赖的抗原多糖生物合成途径,实现了两种结构不同的多糖在单一宿主中的同时生物合成,为疫苗开发提供了一种简化且可扩展的策略 | 在单一宿主细胞中同时实现两种不同生物合成途径的多糖生产,并成功进行体内生物共轭生成糖蛋白,简化了复杂糖蛋白疫苗的生产流程 | 共表达水平有所降低,初期诱导阶段存在微弱的竞争性相互作用 | 开发针对耐药病原体的多价结合疫苗的合成生物学平台 | 大肠杆菌W3110细胞 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | Wzy/Wzx依赖途径和ABC转运体依赖途径的基因工程 | NA | 蛋白质组学数据 | 工程菌株 |
5 | 2025-06-27 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
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研究论文 | 探讨碱基修饰如何影响RNA的折叠和功能,以及这些修饰对RNA三维结构的影响 | 揭示了碱基修饰通过稳定非规范堆积排列来改变RNA的折叠拓扑结构,而非通过改变碱基配对 | 研究仅针对工程化的RNA origami纳米结构和天然核酶,可能不适用于所有类型的RNA | 理解碱基修饰对RNA三维结构的影响,为合成生物学和治疗应用中的功能化RNA设计提供原则 | 工程化的RNA origami纳米结构和天然核酶 | 合成生物学 | NA | Cryo-EM, FRET | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-26 |
Cyanobacterial Peptides in Anticancer Therapy: A Comprehensive Review of Mechanisms, Clinical Advances, and Biotechnological Innovation
2025-May-29, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23060233
PMID:40559642
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综述 | 本文全面回顾了蓝藻肽在抗癌治疗中的机制、临床进展和生物技术创新 | 总结了蓝藻肽的结构多样性和强效生物活性,探讨了靶向递送技术、合成生物学和基因组挖掘等新兴解决方案 | 肿瘤选择性有限、全身毒性和生产可扩展性等问题仍是广泛应用的障碍 | 探讨蓝藻肽在抗癌治疗中的潜力及其未来发展方向 | 蓝藻肽及其分子作用机制、临床转化进展和生物技术方法 | 生物医学 | 癌症 | 靶向递送技术、合成生物学、基因组挖掘 | NA | NA | NA |
7 | 2025-06-26 |
Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production
2025-May-28, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-01914-3
PMID:40437134
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研究论文 | 该研究通过代谢工程策略在烟草叶片中实现了异黄酮前体大豆苷元的高产,并鉴定了六种细胞色素P450单加氧酶作为glyceollin合成酶,完成了glyceollins的15步生物合成途径 | 成功在植物底盘工程中重写代谢流,实现了glyceollins的高产,并鉴定了关键的glyceollin合成酶 | 研究仅在体外验证了glyceollins的抗微生物活性,未进行体内实验验证 | 解析glyceollins的生物合成途径并实现其合成生物学生产 | 大豆中的glyceollins及其生物合成途径 | 合成生物学 | 植物病原体感染 | 代谢工程、细胞色素P450单加氧酶鉴定 | NA | 生化数据 | 烟草叶片作为生产底盘 |
8 | 2025-06-24 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
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综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程方法及其应用 | 强调了代谢工程和合成生物学工具在优化微生物菌株高效生产糖酸中的关键作用 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨微生物生产糖酸的代谢工程策略及其工业应用 | C5和C6糖酸 | 微生物生物技术 | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas、动态调控回路 | NA | NA | NA |
9 | 2025-06-20 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本研究建立了一个基于合成生物学的平台,用于构建稳定的重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 将rAAV2细胞系构建流程扩展到rAAV8,并优化了包装模块,提高了病毒滴度 | 初始生产率低于传统三质粒转染方法,衣壳蛋白生产和衣壳形成是潜在限制因素 | 开发适用于不同AAV血清型的稳定生产细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 基因治疗 | NA | 合成生物学、细胞系构建 | NA | NA | 四种rAAV8生产细胞系(VH1-4) |
10 | 2025-06-18 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-May-22, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
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research paper | 该研究通过改造来自粪肠球菌的NADH氧化酶(EfNOX),使其偏好氧化非天然辅因子NCDH,从而为氧化反应提供NCD | 首次成功改造NADH氧化酶以高效氧化非天然辅因子NCDH,并展示了其在合成生物学中的应用潜力 | 研究仅针对特定酶进行改造,可能不适用于其他酶或系统 | 开发能够氧化非天然辅因子NCDH的工具,以扩展其在氧化代谢反应中的应用 | NADH氧化酶(EfNOX)及其突变体 | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 生化数据 | NA |
11 | 2025-06-18 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
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研究论文 | 本研究通过重构LuxRI群体感应系统,在枯草芽孢杆菌中实现了细胞密度依赖的重组蛋白高效表达 | 利用来自Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统,实现了重组蛋白表达与细胞生长的协调,并通过启动子工程和强终止子的引入显著提高了表达水平 | NA | 开发一种在枯草芽孢杆菌中高效表达重组蛋白的新方法 | 枯草芽孢杆菌和重组蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、启动子工程 | NA | NA | 四种突变启动子(P22, P47, P56, P58) |
12 | 2025-06-13 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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research paper | 该研究描述了一种通过RNA-DNA三链体调控转录速率的机制,并展示了其在设计的大肠杆菌启动子架构中的应用 | 揭示了RNA-DNA三链体通过引起双链DNA结构扭曲来增强或抑制转录的新机制 | 研究主要基于大肠杆菌系统,尚未在更复杂的生物体如哺乳动物中验证 | 探索非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | RNA-DNA三链体及其对转录速率的影响 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征 | NA | NA | 细菌启动子文库 |
13 | 2025-06-13 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过基于知识的筛选和重新设计σ54中的RpoN盒及其配对的启动子,开发了三组基于σ54-R456H、R456Y和R456L的正交表达系统 | 开发了三组具有不同启动子偏好和理想相互正交性的σ54突变体,这些正交性可转移到三种非模式细菌中,并能与不同的bEBPs结合以响应环境或化学信号 | NA | 扩展合成生物学工具包,提供可靠且多样化的基因表达 | σ54因子及其配对的启动子 | 合成生物学 | NA | 知识筛选和重新设计 | NA | NA | NA |
14 | 2025-06-13 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
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综述 | 本文综述了植物光感受器在调节农艺重要性状中的作用,以及光感受器工程、光遗传学和合成生物学在作物改良中的应用现状和前景 | 探讨了通过光感受器工程和光遗传学技术精确调控植物生长和发育的新方法,为作物育种提供了创新思路 | NA | 提高植物生产力,优化作物育种方法 | 植物光感受器及其调控的农艺重要性状 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
15 | 2025-06-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文综述了微流控系统中软物质和多相系统(如液滴和囊泡)在电场调控下的传输动力学 | 系统地研究了电场强度、流体特性和膜特性对软物质传输动力学的耦合影响,并探讨了囊泡与简单液滴在电动力学行为上的独特差异 | 存在稳定性、可扩展性和可重复性等挑战 | 研究电场调控下软物质和多相系统在微流控系统中的传输行为 | 液滴和囊泡 | 微流控 | NA | 高精度成像、微操作和复杂计算建模 | NA | NA | NA |
16 | 2025-06-10 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-May-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 本文揭示了Burkholderia pseudomallei病原体毒力因子malleicyprol中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 首次阐明通过两个聚酮链的头对头融合和还原环化构建丁烯内酯核心的非经典生物合成途径 | NA | 解析malleicyprol毒力因子中丁烯内酯核心的生物合成机制 | Burkholderia pseudomallei病原体的毒力因子malleicyprol | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学合成、体外生物转化重构、突变分析、生化测定 | NA | 实验数据 | NA |
17 | 2025-06-09 |
Bioinformatics analysis and molecular cloning of squalene synthase from Simaroubaceae
2025-May-30, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2025.106751
PMID:40451315
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术,研究了苦木科植物中角鲨烯合酶(SQS)的功能及其在苦木素生物合成中的作用 | 首次从苦木科植物的转录组数据中筛选并分析了多种SQS,揭示了其与甘草SQS的高序列相似性,并通过克隆和功能分析验证了AaSQS的催化功能及其关键氨基酸残基 | 研究仅针对苦木科植物中的SQS,未涉及其他植物家族,且功能验证主要在体外进行,未在植物体内验证 | 研究苦木科植物中角鲨烯合酶的功能及其在苦木素生物合成中的作用 | 苦木科植物中的角鲨烯合酶(SQS) | 生物信息学 | NA | 转录组分析、分子克隆、生物信息学分析、分子对接、突变分析 | NA | 序列数据、蛋白质结构数据 | 6种苦木科植物的SQS(AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS) |
18 | 2025-06-07 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique cas9 targets in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA biological design
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 本文评估了近50万个独特gRNA在E. coli K12 MG1655基因组中的活性,揭示了大多数gRNA具有功能,并提出了细菌gRNA设计的简单规则 | 研究发现绝大多数独特gRNA具有功能(至少93%),而仅有0.3%无功能,并提出了基于间隔区自相互作用的gRNA设计规则 | 研究仅针对E. coli K12 MG1655基因组,未涵盖其他细菌或更复杂的生物系统 | 评估Cas9 nuclease在E. coli中的gRNA活性,解决关于gRNA特异性的争议 | E. coli K12 MG1655基因组中的近50万个独特gRNA | 合成生物学 | NA | Cas9 nuclease和gRNA设计 | NA | 基因组数据 | 近50万个独特gRNA |
19 | 2025-06-06 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究论文 | 本文介绍了一种从植物乳杆菌中生成和纯化微型细胞的方案 | 开发了在植物乳杆菌中生成微型细胞的新方法,扩展了微型细胞平台的应用范围 | 目前仅在植物乳杆菌中进行了验证,尚未在其他益生菌中测试 | 开发一种安全有效的微型细胞生产平台用于生物技术应用 | 植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)及其微型细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心和过滤、DAPI染色 | NA | 显微镜图像和流式细胞术数据 | NA |
20 | 2025-06-04 |
Fusions of Catalytically Inactive RusA to FokI Nuclease Coupled with PNA Enable Programmable Site-Specific Double-Stranded DNA Breaks
2025-May-27, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11282
PMID:40454070
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research paper | 本研究开发了一种名为PC-FIRA的系统,结合了肽核酸(PNA)的序列特异性结合能力和FokI核酸酶与结构引导的失活RusA解离酶的融合体,实现了精确的双链DNA断裂 | PC-FIRA系统无需现有位点特异性核酸酶和结构引导核酸酶的限制,实现了高靶标特异性和切割效率 | 需要精确的反应条件和适用性验证 | 开发一种新型的位点特异性双链DNA断裂系统,用于基因组编辑 | 双链DNA | 基因组编辑 | NA | PNA耦合技术 | NA | DNA序列 | 多种DNA结构(如Holliday连接体、线性和环状DNA) |