合成生物学相关文章
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当前共找到 106 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-30 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
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研究论文 | 本文研究了5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等修饰碱基对RNA三维折叠景观及结构-功能关系的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变关键连接处的堆积能量而非碱基配对来驱动RNA构象转变，并影响其动力学成熟 | 未涉及其他常见修饰碱基（如假尿苷、N6-甲基腺苷）的影响，且仅在两种特定RNA结构中进行验证 | 阐明碱基修饰对RNA折叠和功能的影响机制，为合成生物学和治疗方法中功能性RNA的开发提供设计原则 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学， 结构生物学 | NA | 冷冻电镜， FRET | NA | 图像 | 两种RNA结构 | RNA折纸 | NA | RNA折纸纳米结构， 核酶 | 医学， 合成生物学 |
| 2 | 2026-07-30 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 提出一种利用激光诱导高速微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现按需、可靠且可重复地生成细胞大小脂质体 | 未提及具体局限性 | 开发一种按需生产脂质体的新方法，推动合成生物学和膜科学的发展 | 细胞大小的脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物化学研究，合成生物学 |
| 3 | 2026-07-29 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-05-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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研究论文 | 本研究介绍Ponceau S作为蛋白质液-液相分离的选择性调节剂，并在牛血清白蛋白和溶菌酶中监测相分离过程 | 首次发现Ponceau S可作为蛋白质液-液相分离的靶向调节剂，同时利用其荧光增强特性实现相分离的可视化监测 | 仅针对两种模型蛋白进行研究，缺乏在复杂细胞环境中的验证 | 探索小分子Ponceau S对蛋白质液-液相分离的精确调控能力 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 机器学习 | NA | 荧光光谱分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物分子工程、药物递送、合成生物学 |
| 4 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-05-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子（特别是非天然氨基酸）的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降，且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性，为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 5 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-05-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器，用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象，并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器，用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标（miRNA-21）和非核酸靶标（卡那霉素） | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统，硫代磷酸酯修饰技术，荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量，但检测限达到100 fM（miRNA-21）和100 pM（卡那霉素） | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-07-19 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-05-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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研究论文 | 通过设计生物相容性前体，精确调控细胞内量子点的合成，实现细胞长期追踪 | 发现细胞适应性硒代胱氨酸可被还原为低毒硒前体，与及时添加的Ag-谷胱甘肽结合生成近红外AgSe量子点，抑制细胞毒性物质产生并显著提高细胞活力和量子点荧光强度 | NA | 实现细胞内近红外量子点的生物相容性合成，并维持细胞增殖和肿瘤发生能力以用于长期追踪 | 细胞及其合成的近红外AgSe量子点 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 图像 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 生物相容性前体耦合法用于细胞内量子点合成 | 医学, 生物成像 |
| 7 | 2026-07-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 开发了一种多模块组装先导编辑系统（mPE），显著提高双子叶植物中精确多碱基插入效率 | 首次在双子叶植物中通过拆分PE系统并利用pol II策略表达pegRNA，构建mPE系统，实现高达1288.5倍的效率提升，并能在原始PE2无法编辑的位点进行编辑 | 仅在拟南芥和本氏烟草两种模式植物中验证，尚未在作物或其他双子叶植物中测试，且多碱基插入的改善机制需进一步阐明 | 解决双子叶植物中先导编辑效率低下和不一致的问题 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 数字病理学 | NA | 先导编辑（PE）、农杆菌介导转化、深度扩增子测序 | NA | 序列数据 | 0.2-0.5百万条总清晰读长的深度扩增子测序数据 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装先导编辑系统（mPE） | 农业, 植物合成生物学 |
| 8 | 2026-05-12 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-05-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
|
研究论文 | 揭示了甘草素完全生物合成途径，并通过合成生物学方法在酵母中实现从简单碳源的从头重建 | 首次完整阐明甘草素生物合成途径，特别是氧化环化步骤，并鉴定出之前未表征的还原酶和五个P450酶基因 | 未提及具体局限性 | 阐明甘草素生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘草素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养实验、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草、酿酒酵母 | 甘草素从头生物合成途径 | 农业、生物学 |
| 9 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 11 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗，使其产生更多HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增，旨在提高抗结核疫苗的免疫原性 | 首次尝试通过改造BCG中的MEP途径来提升疫苗效力，并利用HMBPP感知机制触发宿主自我-非我识别，这是一种新的策略 | 虽然过表达GcpE能有效诱导Vγ9Vδ2 T细胞扩增，但开发更有效的疫苗仍需大量后续工作，且合成MEP基因座未能增强T细胞扩增，表明多基因异位表达可能导致反馈抑制 | 测试提高BCG的免疫原性能否在保持其安全性的同时改善疫苗效果 | BCG疫苗菌株、Vγ9Vδ2 T细胞、HMBPP磷酸抗原 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、重组菌株构建、刺激试验 | NA | 基因组数据、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌） | 设计合成MEP基因座以特异性过量生产HMBPP，并测试过表达限速基因GcpE | 医学 |
| 12 | 2026-03-31 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-05-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了利用微生物系统异源合成倍半萜醇的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了包括适应性倍半萜醇合酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及应对萜类化合物毒性的耐受性策略在内的多种创新方法 | NA | 推进倍半萜醇生物合成研究，以克服其工业化应用面临的产量低、成本高等挑战 | 倍半萜醇化合物及其微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇生物合成途径 | 制药, 食品, 化妆品 |
| 13 | 2026-03-14 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-05-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
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研究论文 | 本研究在单个大肠杆菌底盘细胞中同时引入Wzy/Wzx依赖型和ABC转运蛋白依赖型两种抗原多糖生物合成途径，实现了两种结构不同多糖的共表达，为疫苗开发提供了一种简化且可扩展的策略 | 首次在单个宿主细胞中同时构建并表达两种不同生物合成途径的抗原多糖，并实现体内生物偶联生成糖蛋白，简化了多价结合疫苗的生产流程 | 共表达水平有所降低，诱导初期存在弱竞争相互作用，可能源于膜空间竞争或活化单糖前体的共享使用 | 开发一种合成生物学平台，用于在单个细菌宿主中共同表达多种多糖，以设计和生产针对耐药病原体的多价结合疫苗 | 大肠杆菌W3110细胞，两种抗原多糖（Wzy/Wzx依赖型和ABC转运蛋白依赖型） | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | Wzy/Wzx依赖型和ABC转运蛋白依赖型生物合成途径，体内生物偶联，全细胞蛋白质组学分析，MFUZZ聚类，基因本体分析 | NA | 蛋白质组学数据 | 工程化大肠杆菌菌株 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 双途径生物合成系统，用于同时生产两种抗原多糖，并偶联至载体蛋白形成糖蛋白 | 医学 |
| 14 | 2026-02-08 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，并训练机器学习模型预测基因回路行为 | 结合长读长和短读长NGS技术，首次实现对多kb长度基因回路设计（>10^5种）的并行定量评估，建立了“组成-功能”映射关系 | NA | 加速合成生物学中基因回路的设计与优化，建立数据驱动的复杂遗传系统设计方法 | 包含多种遗传元件组合的基因回路设计（5-20 kb长度） | 合成生物学 | NA | 长读长与短读长下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 单次实验可测量超过10^5种基因回路设计 | NA | 人类细胞 | 基因回路（包含多种遗传元件组合） | 工业生物技术 |
| 15 | 2025-12-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文全面综述了在微流控系统中，利用外部电场调控软物质多相系统（如液滴和囊泡）的传输动力学 | 系统性地探讨了电场强度、流体性质与膜特性之间的耦合作用，并强调了囊泡双层脂膜带来的独特动力学行为，为下一代微流控设备设计提供了新视角 | NA | 研究电场如何调控软物质多相系统在微流控通道中的传输行为，以优化其操控与应用 | 软物质多相系统，特别是液滴和囊泡 | NA | NA | 高精度成像、微操控、复杂计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送、合成生物学、材料制造、芯片实验室平台、生物分析工具 |
| 16 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-05, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展，包括利用合成生物学和代谢模型开发微生物细胞工厂生产各类化合物的方法 | 整合合成生物学工具与数学模型加速代谢工程的设计-构建-测试-学习循环，开发具有复杂表型的酵母菌株 | NA | 通过代谢工程改造酵母菌株，实现可持续生产各类化合物 | 酵母菌株及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、数学建模 | 代谢模型 | NA | NA | NA | 酵母 | 代谢通量重定向、底物谱扩展、生理特性改良 | 工业生物技术,能源,化学品,医药 |
| 17 | 2025-10-05 |
A simple and universal quasi-modular cloning system using NEBuilder® HiFi DNA assembly kit
2025 May-Jun, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2542012
PMID:40819309
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研究论文 | 开发了一种基于NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒的准模块化克隆系统，用于非模式生物的基因工具开发 | 将NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒扩展为使用单链寡核苷酸桥接的准模块化系统，无需限制性内切酶即可组装可重复使用的DNA片段 | NA | 开发适用于非模式生物系统的通用准模块化克隆方法 | 厌氧肠道真核生物ST7-B | 合成生物学 | NA | NEBuilder HiFi DNA组装 | NA | NA | NA | NEBuilder HiFi DNA Assembly Kit | ST7-B | 启动子-终止子组合载体 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
Direct and quantitative analysis of tRNA acylation using intact tRNA liquid chromatography-mass spectrometry
2025-05, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01086-9
PMID:39762443
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研究论文 | 开发了一种基于完整tRNA液相色谱-质谱联用技术的直接定量分析tRNA酰化方法 | 首次使用完整tRNA的LC-MS方法直接监测aaRS活性，可检测低至0.23%的反应产率，并能检测传统方法无法检测的flexizyme酰化产物 | 需要分子生物学、液相色谱-质谱和无RNase技术的基础专业知识，完成实验至少需要5小时 | 开发定量分析tRNA酰化的新方法 | 氨基酰-tRNA合成酶(aaRSs)催化的tRNA酰化反应 | 分析化学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS)，离子对反相色谱，高分辨率飞行时间质谱 | NA | 质谱数据 | NA | flexizyme | NA | NA | 合成生物学，基础研究 |
| 19 | 2025-10-05 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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研究论文 | 本研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器 | 首次将基因改造的巨大芽孢杆菌活细胞和孢子与CMOS芯片集成，创建可现场部署的砷检测传感器 | 作为概念验证研究，传感器在实际环境中的大规模应用仍需进一步验证 | 开发用于资源有限环境的实时砷检测技术 | 砷污染检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA | 合成生物学工具 | 巨大芽孢杆菌 | 砷生物传感器 | 环境 |
| 20 | 2025-10-05 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对天然肠道大肠杆菌进行基因工程改造，成功表达荧光报告基因和生物活性化合物 | 首次将CRAGE技术应用于天然肠道大肠杆菌菌株，实现了多种异源基因表达和天然产物生物合成 | 研究仅针对两种特定大肠杆菌菌株，未涉及其他肠道微生物 | 开发天然肠道大肠杆菌作为合成生物学多功能平台 | 天然肠道大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | CRAGE基因组工程技术 | NA | 基因表达数据、荧光检测数据 | 两种大肠杆菌菌株 | CRAGE | 大肠杆菌 | 荧光报告基因表达系统、天然产物生物合成途径 | 医学, 生物医学研究 |