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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-03-23 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 本文利用机器学习模型和特征重要性分析,发现了一种新化合物,可显著提高大肠杆菌中壳寡糖的产量 | 通过机器学习模型和特征重要性分析,发现了铁这一新化合物,可将壳寡糖产量提高两倍,并揭示了未来工程步骤的重要线索 | 尽管发现了铁对壳寡糖产量的提升作用,但具体机制仍需进一步研究 | 提高大肠杆菌中壳寡糖的产量 | 大肠杆菌中的壳寡糖合成途径 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 代谢数据 | 大肠杆菌工程转录调节因子库 |
2 | 2025-03-19 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提高了催化效率,且无需NAD(P)H或双功能小分子 | NA | 开发高效降解氯苯胺类污染物的生物催化剂 | 五种氯苯胺(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | UPLC-MS | NA | 化学数据 | 五种氯苯胺 |
3 | 2025-03-15 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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研究论文 | 本文提出了一种新的可解释性框架GELKcat,用于预测酶转换数(kcat),结合了预训练的酶嵌入和自适应门网络 | 开发了一种端到端的双表示可解释性框架GELKcat,利用图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入,并通过自适应门网络整合底物和酶特征 | NA | 提高酶转换数(kcat)预测的准确性和可解释性,以支持合成生物学和早期药物发现 | 多物种酶-底物对的转换数数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图变换器、CNN、自适应门网络 | 分子数据、酶嵌入数据 | NA |
4 | 2025-03-14 |
Emerging biotechnological strategies advancing biological lignin valorization towards polyhydroxyalkanoates
2025-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132278
PMID:39986625
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综述 | 本文综述了木质素转化为高价值产品的整个途径,重点介绍了微生物过程在合成聚羟基脂肪酸酯(PHA)中的优势,并探讨了合成生物学技术和代谢调控策略在增强微生物PHA合成中的应用 | 本文的创新点在于整合了微生物PHA合成与木质素生物转化,不仅促进了木质素的增值利用,还支持了PHA的可持续生产,对生物质资源的利用和可持续发展做出了重要贡献 | 木质素的顽固性和异质性对其微生物降解和增值利用构成了重大挑战 | 研究目的是探讨木质素转化为高价值产品的途径,特别是通过微生物过程合成PHA,并促进木质素的生物升级 | 木质素和聚羟基脂肪酸酯(PHA) | 生物技术 | NA | 合成生物学技术和代谢调控策略 | NA | NA | NA |
5 | 2025-03-12 |
Biosynthesis and bioactivities of triterpenoids from Centella asiatica: Challenges and opportunities
2025 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108541
PMID:39978422
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综述 | 本文综述了积雪草中三萜类化合物的生物合成途径、生物活性及其生物技术生产方法 | 提出了基于合成生物学和微生物细胞工厂的生物技术方法作为传统提取方法的替代方案 | 当前提取方法无法满足市场对积雪草提取物和纯功能成分的需求 | 探讨积雪草中三萜类化合物的生物合成、生物活性及其可持续生产方法 | 积雪草及其主要功能性生物活性次生代谢物(如积雪草酸、羟基积雪草酸、积雪草苷和羟基积雪草苷) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、微生物细胞工厂 | NA | NA | NA |