本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-05, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
|
综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展,包括利用合成生物学和代谢模型开发微生物细胞工厂生产各类化合物的方法 | 整合合成生物学工具与数学模型加速代谢工程的设计-构建-测试-学习循环,开发具有复杂表型的酵母菌株 | NA | 通过代谢工程改造酵母菌株,实现可持续生产各类化合物 | 酵母菌株及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、数学建模 | 代谢模型 | NA | NA | NA | 酵母 | 代谢通量重定向、底物谱扩展、生理特性改良 | 工业生物技术,能源,化学品,医药 |
| 2 | 2025-10-05 |
A simple and universal quasi-modular cloning system using NEBuilder® HiFi DNA assembly kit
2025 May-Jun, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2542012
PMID:40819309
|
研究论文 | 开发了一种基于NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒的准模块化克隆系统,用于非模式生物的基因工具开发 | 将NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒扩展为使用单链寡核苷酸桥接的准模块化系统,无需限制性内切酶即可组装可重复使用的DNA片段 | NA | 开发适用于非模式生物系统的通用准模块化克隆方法 | 厌氧肠道真核生物ST7-B | 合成生物学 | NA | NEBuilder HiFi DNA组装 | NA | NA | NA | NEBuilder HiFi DNA Assembly Kit | ST7-B | 启动子-终止子组合载体 | 工业生物技术 |
| 3 | 2025-10-05 |
Direct and quantitative analysis of tRNA acylation using intact tRNA liquid chromatography-mass spectrometry
2025-05, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01086-9
PMID:39762443
|
研究论文 | 开发了一种基于完整tRNA液相色谱-质谱联用技术的直接定量分析tRNA酰化方法 | 首次使用完整tRNA的LC-MS方法直接监测aaRS活性,可检测低至0.23%的反应产率,并能检测传统方法无法检测的flexizyme酰化产物 | 需要分子生物学、液相色谱-质谱和无RNase技术的基础专业知识,完成实验至少需要5小时 | 开发定量分析tRNA酰化的新方法 | 氨基酰-tRNA合成酶(aaRSs)催化的tRNA酰化反应 | 分析化学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS),离子对反相色谱,高分辨率飞行时间质谱 | NA | 质谱数据 | NA | flexizyme | NA | NA | 合成生物学,基础研究 |
| 4 | 2025-10-05 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器 | 首次将基因改造的巨大芽孢杆菌活细胞和孢子与CMOS芯片集成,创建可现场部署的砷检测传感器 | 作为概念验证研究,传感器在实际环境中的大规模应用仍需进一步验证 | 开发用于资源有限环境的实时砷检测技术 | 砷污染检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA | 合成生物学工具 | 巨大芽孢杆菌 | 砷生物传感器 | 环境 |
| 5 | 2025-10-05 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.651767
PMID:40654943
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,通过增强HMBPP产量来激活Vγ9Vδ2 T细胞 | 首次尝试在BCG中重新设计MEP途径以改善疫苗效力,通过HMBPP感知利用宿主自我-非我识别机制 | 表达多个MEP基因可能导致途径反馈抑制,仍需进一步开发更有效的疫苗 | 测试提高BCG免疫原性是否能改善疫苗有效性同时保持其安全性 | BCG疫苗菌株和Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学方法,同线性分析,刺激试验 | NA | 基因组数据,实验数据 | 356个调查基因组,63种分枝杆菌物种 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌) | 合成MEP基因座,HMBPP合成酶GcpE过表达 | 医学 |
| 6 | 2025-10-05 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
|
研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的基因筛选平台,能够高通量评估任意长度的基因构建体并揭示基因部件组合规则 | 结合长短读长NGS测序技术,首次实现了对多kb长度基因电路设计的高通量定量评估 | NA | 加速合成生物学发展,通过筛选多样化基因电路设计并学习'组成-功能'映射关系 | 基因电路设计和遗传部件组合 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS),长短读长测序技术 | 机器学习模型 | 基因序列数据,表达谱数据 | 单次实验可测量超过10^5个基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 5-20 kb长度的多样化基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
|
研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对天然肠道大肠杆菌进行基因工程改造,成功表达荧光报告基因和生物活性化合物 | 首次将CRAGE技术应用于天然肠道大肠杆菌菌株,实现了多种异源基因表达和天然产物生物合成 | 研究仅针对两种特定大肠杆菌菌株,未涉及其他肠道微生物 | 开发天然肠道大肠杆菌作为合成生物学多功能平台 | 天然肠道大肠杆菌菌株EcAZ-1和益生菌株Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | CRAGE基因组工程技术 | NA | 基因表达数据、荧光检测数据 | 两种大肠杆菌菌株 | CRAGE | 大肠杆菌 | 荧光报告基因表达系统、天然产物生物合成途径 | 医学, 生物医学研究 |
| 8 | 2025-10-05 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
|
综述 | 系统综述微生物合成麦角硫因的研究进展与发展前景 | 系统整合麦角硫因应用、代谢途径和微生物合成策略,展望未来研究方向 | NA | 提升麦角硫因生物合成效率以满足市场需求 | 麦角硫因的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | 麦角硫因代谢途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 9 | 2025-10-05 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
|
综述 | 本综述探讨超快技术在生物技术中的变革性应用,重点关注其实时可视化和精确操控生物分子过程的能力 | 整合飞秒激光与阿秒光谱技术实现基因编辑精确定位和电子动力学观测,结合人工智能与纳米技术推动诊断和合成生物学发展 | 存在光损伤风险、与复杂生物系统整合困难及伦理考量等挑战 | 探索超快技术在生物分子过程研究和医疗应用中的潜力 | 生物分子过程(蛋白质折叠、酶催化、能量转移)、细胞动力学、基因编辑系统 | 生物技术 | 错误折叠疾病 | 飞秒激光、超快光谱、阿秒光谱、泵浦-探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射 | NA | 光谱数据、显微图像 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 10 | 2025-10-05 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
|
综述 | 系统回顾电场调控微流控系统中软物质多相体系(液滴和囊泡)输运行为的研究进展 | 深入分析囊泡双层脂膜特有的膜张力与弯曲刚度等动力学特性对电流体动力学行为的独特影响 | NA | 研究电场调控下软物质多相体系在微流控系统中的输运动力学 | 液滴和囊泡等软物质多相体系 | 微流控技术 | NA | 高精度成像、微操作、计算建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送、合成生物学、材料制造、芯片实验室、生物分析工具 |
| 11 | 2025-10-05 |
Next-Generation Vaccine Platforms: Integrating Synthetic Biology, Nanotechnology, and Systems Immunology for Improved Immunogenicity
2025-May-30, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13060588
PMID:40573919
|
综述 | 探讨整合合成生物学、纳米技术和系统免疫学的下一代疫苗平台技术 | 将合成生物学、纳米技术和系统免疫学三大前沿领域整合应用于疫苗开发 | 存在可扩展性、安全性评估和数据驱动疫苗设计的伦理问题等挑战 | 开发具有改进免疫原性的下一代疫苗平台 | SARS-CoV-2、EB病毒等病原体及癌症免疫治疗 | 生物医学工程 | 传染病、癌症 | 多组学数据分析、计算建模、纳米工程 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 哺乳动物细胞 | 自扩增结构、抗原递送系统、免疫激活回路 | 医学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-May-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
|
研究论文 | 本研究在单个大肠杆菌底盘细胞中同时构建了两种外源抗原多糖的生物合成途径 | 首次在单一宿主中实现Wzy/Wzx依赖和ABC转运蛋白依赖两种不同生物合成途径的多糖同时生产 | 共表达水平中等程度降低,诱导初期存在弱竞争相互作用 | 开发针对耐药病原体的多价结合疫苗的生产平台 | 大肠杆菌W3110细胞 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 全细胞蛋白质组分析、MFUZZ聚类、基因本体分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 双途径生物合成系统:Wzy/Wzx依赖途径和ABC转运蛋白依赖途径 | 医药 |
| 13 | 2025-10-05 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
|
研究论文 | 研究碱基修饰如何影响RNA三维结构的折叠和功能 | 首次揭示碱基修饰通过改变堆叠能量而非碱基配对来驱动RNA构象变化 | 仅研究了5mC和N1Ψ两种修饰类型 | 探索碱基修饰对RNA结构折叠和功能的影响机制 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 结构数据, 能量数据 | 两种RNA结构(合成和天然) | RNA折纸技术 | NA | RNA纳米结构 | 医学, 合成生物学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Cyanobacterial Peptides in Anticancer Therapy: A Comprehensive Review of Mechanisms, Clinical Advances, and Biotechnological Innovation
2025-May-29, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23060233
PMID:40559642
|
综述 | 本文全面综述蓝藻来源多肽作为抗癌药物的作用机制、临床进展与生物技术创新 | 系统整合蓝藻多肽的靶向递送技术、联合治疗策略及合成生物学生产方案 | 存在肿瘤选择性有限、系统毒性和生产可扩展性等挑战 | 挖掘蓝藻多肽在肿瘤治疗领域的临床应用潜力 | 蓝藻来源的生物活性多肽 | NA | 癌症 | 合成生物学、基因组挖掘 | NA | 临床研究数据、临床前研究数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 15 | 2025-10-05 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
|
综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程策略及其在不同工业领域的应用 | 系统总结了合成生物学工具(如CRISPR-Cas和动态调控回路)在优化糖酸生物生产中的应用进展 | NA | 探讨通过代谢工程优化微生物菌株实现高效糖酸生物合成的策略 | C5和C6糖酸及其生产微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶转化、全细胞生物转化、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 动态调控回路 | 食品, 建筑, 医疗, 纺织, 聚合物工业 |
| 16 | 2025-10-05 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
|
研究论文 | 本研究开发了一个用于构建重组腺相关病毒8型生产细胞系的合成生物学平台 | 将rAAV2生产细胞系构建平台成功扩展到rAAV8血清型,并通过增加AAV8 VP123基因拷贝数使病毒滴度提高20倍 | 初始构建的rAAV8生产细胞系生产力低于传统三质粒转染方法 | 建立稳定生产rAAV8病毒载体的细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型生产细胞系 | 合成生物学 | 基因治疗相关疾病 | 合成生物学平台、基因整合、细胞系构建 | NA | NA | 构建了四个rAAV8生产细胞系VH1-4 | 基因整合 | HEK293细胞 | 由基因组模块、复制模块和包装模块组成的遗传模块系统,其中包装模块用AAV8的cap基因替换了AAV2的cap基因 | 医学 |
| 17 | 2025-10-05 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
|
研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了LuxRI群体感应系统,开发了一种细胞密度依赖的重组蛋白高效表达方法 | 首次在枯草芽孢杆菌中功能性重构Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统,并通过启动子工程和终止子优化实现了重组蛋白的高效表达 | NA | 开发一种不依赖化学诱导剂、能与细胞生长协调的重组蛋白高效表达系统 | 枯草芽孢杆菌中的重组蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统重构、启动子工程、终止子优化 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 枯草芽孢杆菌 | 基于LuxRI群体感应的细胞密度依赖型基因回路,包含工程化启动子和强终止子TB5 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
|
研究论文 | 本文描述了一种通过RNA-DNA三链体调控转录的机制,该机制通过诱导DNA双链结构应变来增强或抑制转录 | 首次揭示了RNA-DNA三链体通过引起DNA双链结构应变来调控转录的分子机制 | 研究主要基于大肠杆菌系统,在更复杂生物体中的适用性需要进一步验证 | 探索非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | RNA-DNA三链体、大肠杆菌启动子架构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征、启动子文库筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 大肠杆菌 | 基于启动子的转录调控架构 | 基础研究 |
| 19 | 2025-10-05 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
|
研究论文 | 本研究通过改造σ54因子及其配对启动子,开发了三组正交表达系统 | 通过知识导向筛选和重新设计σ54的RpoN盒,创建了具有不同启动子偏好性和理想相互正交性的σ54突变体 | NA | 扩展合成生物学工具箱,实现可靠和多样化的基因表达 | σ54因子、细菌增强子结合蛋白(bEBPs)、启动子 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、蛋白质工程 | NA | NA | 在三种非模式细菌中验证 | CRISPR-Cas9 | 细菌, 非模式细菌 | 正交基因表达系统、遗传电路、生物传感器 | 工业生物技术, 环境 |
| 20 | 2025-10-05 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
|
综述 | 概述植物光感受器工程在提高植物生产力方面的应用潜力 | 整合光感受器工程与光遗传学技术用于作物育种创新 | 未提及具体实验验证数据 | 通过工程化改造植物光感受器提高作物生产力 | 植物光感受器蛋白及其调控通路 | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 作物植物 | 光感受器信号通路工程 | 农业 |