合成生物学相关文章
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当前共找到 107 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Protocol for the generation and purification of minicells from Lactiplantibacillus plantarum
2025-May, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2412002
PMID:40468658
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研究论文 | 本文开发了从植物乳杆菌生成和纯化微细胞的实验方案 | 首次在植物乳杆菌中通过删除minD基因成功构建微细胞生产平台，拓展了微细胞技术在非模式益生菌中的应用 | NA | 建立从益生菌植物乳杆菌生产微细胞的技术方案 | 植物乳杆菌微细胞 | 合成生物学 | NA | 质粒介导的同源重组、差异离心、过滤、药物处理、显微镜检查、流式细胞术 | NA | NA | NA | 同源重组 | 植物乳杆菌 | 通过删除minD基因破坏细胞分裂形成球形微细胞 | 医药 |
| 22 | 2025-10-05 |
Fusions of Catalytically Inactive RusA to FokI Nuclease Coupled with PNA Enable Programmable Site-Specific Double-Stranded DNA Breaks
2025-May-27, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11282
PMID:40454070
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研究论文 | 开发了一种结合PNA序列特异性结合能力和FokI核酸酶催化效率的PC-FIRA系统，用于实现程序化位点特异性DNA双链断裂 | 将催化失活的RusA与FokI核酸酶融合，并与PNA偶联，克服了现有位点特异性核酸酶的引导依赖性和脱靶效应限制 | 需要优化反应条件（温度、缓冲液组成、离子浓度和切割时间）并进行适用性验证 | 开发新型程序化位点特异性DNA双链断裂系统 | DNA分子（包括Holliday连接体、线性和环状DNA） | 合成生物学 | NA | PNA（肽核酸）技术、核酸酶融合技术 | NA | 分子生物学实验数据 | 多种DNA结构测试 | PNA, FokI核酸酶, RusA解离酶 | NA | NA | 生物技术, 医学, 农业, 合成生物学 |
| 23 | 2025-10-05 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 开发了一种多模块组装型Prime Editing系统，显著提高了双子叶植物中精确多碱基插入的编辑效率 | 首次在双子叶植物中开发了多模块组装型Prime Editing系统，相比原始PE2系统编辑效率提升1.3-1288.5倍，特别在多碱基插入方面平均提升197.9倍 | 研究主要局限于模式植物拟南芥和本氏烟草，尚未在其他双子叶植物中验证 | 解决Prime Editing在双子叶植物中编辑效率低的问题，开发系统性改进方案 | 双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草 | 植物合成生物学 | NA | Prime Editing, 农杆菌介导转化, 深度扩增子测序 | NA | 基因组测序数据 | 大规模转化实验，测序数据量20-50万条clean reads | CRISPR-Cas9, Prime Editing | 拟南芥, 本氏烟草 | 多模块组装型Prime Editing系统，采用pol II策略表达pegRNA，将PE系统拆分为多个模块 | 农业, 植物育种 |
| 24 | 2025-10-05 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统 | 首次利用噬菌体展示技术筛选出可被FDA批准小分子药物破坏的纳米抗体，建立化学诱导蛋白相互作用的解离系统 | NA | 开发能够可诱导调控蛋白质功能的后翻译化学方法 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示技术 | NA | NA | NA | 噬菌体展示 | 人类细胞 | 化学诱导解离系统 | 医学 |
| 25 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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综述 | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了微生物合成倍半萜醇的多种创新策略，包括酶筛选、通路调控和区室化表达 | 未提及具体实验数据验证策略效果，主要基于文献综述 | 推动倍半萜醇生物合成研究发展 | 倍半萜醇化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇合成通路 | 医药,食品,化妆品 |
| 26 | 2025-10-05 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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研究论文 | 本文揭示了动力学模块作为生化网络中浓度鲁棒性来源的机制 | 无需参数值即可基于稳态反应速率耦合识别大规模生化网络中的动力学模块，并发现有序结合酶机制比随机结合具有更高的浓度鲁棒性 | 研究基于34个代谢网络模型，可能未覆盖所有生物系统类型 | 探索生化网络中动力学模块与浓度鲁棒性的关系 | 26个生物的34个代谢网络模型 | 系统生物学 | NA | 质量作用动力学分析 | 代谢网络模型 | 生化网络数据 | 34个代谢网络模型（来自26个生物） | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 27 | 2025-10-05 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过多参数遗传工程优化毕赤酵母中scFv抗体的分泌效率，发现结构同源蛋白对优化策略存在不同响应 | 挑战了结构同源性可预测优化效果的假设，揭示了蛋白特异性阈值对遗传工程策略的影响 | 仅研究两种scFv变体，样本量有限 | 优化毕赤酵母系统中单链抗体片段的分泌效率 | 两种结构同源的scFv变体（PR961和PR953） | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌通路重编程 | NA | 蛋白分泌效率数据 | 两种scFv变体 | 基因敲除、过表达 | 毕赤酵母 | 分泌通路重编程（涉及21个基因的三个功能模块） | 工业生物技术 |
| 28 | 2025-10-05 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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研究论文 | 通过转录组学和代谢组学分析揭示胡黄连中三萜类化合物生物合成途径的关键基因与分子机制 | 首次鉴定出NsOSC2双功能酶能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇，并建立了高效的再生系统和稳定遗传转化体系 | NA | 阐明胡黄连三萜类化合物生物合成的分子机制 | 胡黄连(Neopicrorhiza scrophulariiflora)的不同组织部位 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 代谢组学, 遗传转化 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 胡黄连 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药 |
| 29 | 2025-10-05 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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研究论文 | 提出基于格里菲斯转化实验的合成生物学新方法，用于创建具有显著表型差异的杂交微生物 | 提出格里菲斯转化实验2.0设计，能够同时交换DNA和非DNA结构与调控信息 | 目前仅限于密切相关的细菌物种，供体与受体细胞间代谢通量和周转的调控匹配仍具挑战 | 开发能够整合多种遗传信息的合成生物学方法以创建新型微生物 | 细菌细胞及其遗传物质交换机制 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验、水平基因转移、体细胞核移植 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | DNA、大分子、拓扑、控制论和细胞遗传信息的整合系统 | 工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-05 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计在非豆科植物中重构固氮酶，并探索在酵母线粒体低氧环境下工程化固氮酶 | 固氮酶的氧敏感性、金属簇组装复杂性及高能量需求尚未完全解决 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在植物体系中的功能重建 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 人工智能驱动设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酵母 | 固氮酶重构, 线粒体低氧表达系统 | 农业 |
| 31 | 2025-10-05 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和CRISPR基因编辑技术在病毒基因组研究中的应用 | 整合深度突变扫描与CRISPR技术，实现对病毒基因组的精准操作和功能表征 | NA | 探讨病毒进化分子机制及疫苗和治疗策略开发 | 病毒基因组和病毒蛋白 | NA | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因编辑, 测序技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 32 | 2025-10-05 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
|
综述 | 全面探讨T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的应用、挑战与未来发展方向 | 突破以往仅关注分子结构与功能的研究局限，提供T7RNAP变体的综合应用指南并强调工程化改造的最新进展 | NA | 优化微生物细胞工厂的转录系统并推动可持续生物生产 | T7RNA聚合酶及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 精细调控的电路设计 | 工业生物技术 |
| 33 | 2025-10-05 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
|
研究论文 | 本研究开发了一种简化的定向进化系统，用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶的活性，以促进遗传密码扩展 | 开发了仅需基础实验室设备的简化定向进化系统，通过串联密码子随机化策略发现PylRS的叠加突变效应 | NA | 提高非经典氨基酸掺入效率，优化遗传密码扩展技术 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化，深度测序，串联密码子随机化 | NA | 测序数据，酶活性数据 | 针对三种不同底物进化的PylRS变体 | 定向进化 | NA | 正交tRNA和氨基酸酰-tRNA合成酶对 | 医学，工业生物技术 |
| 34 | 2025-10-05 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
|
研究论文 | 开发了基于Golden Gate组装技术的RT-EZ工具包，用于简化圆红冬孢酵母的基因工程操作 | 首次开发了专门针对圆红冬孢酵母的Golden Gate组装工具包，包含双向启动子、2A肽、RFP颜色筛选等新特性，可单次组装反应构建四基因表达盒 | NA | 解决圆红冬孢酵母因高GC含量和缺乏复制型质粒导致的基因操作困难 | 圆红冬孢酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Rhodotorula toruloides | 多基因表达盒，包含脂肪酸延伸酶和去饱和酶共表达系统 | 工业生物技术, 医药, 能源 |
| 35 | 2025-10-05 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究通过基因组缩减策略提高粘球菌中重组苯并噁唑类天然产物的产量 | 首次证明在粘球菌中连续移除生物合成基因簇可显著提高重组天然产物产量，并发现某些BGC组合删除会导致细胞不可存活 | 未明确说明具体删除了哪些BGC及其对细胞生理的全面影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响 | 粘球菌（Myxococcus xanthus） | 合成生物学 | NA | 基因组工程 | NA | NA | NA | 基因组删除 | 粘球菌（Myxococcus xanthus） | 重组苯并噁唑生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 36 | 2025-10-05 |
Insight into Optogenetics for Diabetes Management
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00549
PMID:40279455
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综述 | 本文概述了光遗传学在糖尿病管理中的应用，重点探讨了通过光控技术实现胰岛素分泌的方法 | 将光遗传学作为合成生物学方法应用于糖尿病管理，实现用户通过光控远程调节激素分泌 | 需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用 | 探索光遗传学在糖尿病治疗中的应用潜力 | 胰腺细胞、非胰腺细胞、小鼠模型 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 小鼠、高等动物细胞 | 光敏蛋白表达系统、胰岛素分泌通路调控 | 医学 |
| 37 | 2025-10-05 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
|
研究论文 | 本研究基于蓝藻远红光光适应系统开发了一种用于大肠杆菌的远红光传感器 | 首次在细菌中建立了动态范围超过230倍的正交远红光传感器系统 | NA | 开发用于合成生物学的远红光调控工具 | 蓝藻RfpABC信号系统和大肠杆菌基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌,蓝藻 | 远红光生物传感器,基因表达调控回路 | 工业生物技术 |
| 38 | 2025-10-05 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
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研究论文 | 开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法，用于构建表达可调文库 | 利用体内同源重组实现自动化一步多基因组装，相比体外方法更高效 | NA | 开发高效的多基因组装方法以构建表达可调文库 | 酵母表达系统和多基因文库 | 合成生物学 | NA | 体内同源重组 | NA | NA | NA | 生物铸造厂工作流程 | 酵母 | 代谢途径，表达可调多基因文库 | 工业生物技术 |
| 39 | 2025-10-05 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering
2025-May-29, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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研究论文 | 本文开发了一种混沌3D生物打印技术，用于制造具有微观结构的细菌生态系统，模拟自然微生物群落的空间组织 | 首次将混沌3D打印技术应用于细菌共培养系统的构建，实现了微米级精度的空间控制 | 研究仅使用了简化的肠道微生物模型，尚未在更复杂的自然微生物群落中验证 | 开发能够模拟自然微生物生态系统空间结构的体外研究平台 | 细菌共培养系统，特别是人类肠道微生物模型 | 合成生物学 | NA | 混沌3D生物打印，荧光显微镜，菌落计数，定量PCR | NA | 图像数据，微生物生长数据 | NA | 3D生物打印，Kenics静态混合器打印喷嘴 | 多种细菌菌株（包括严格厌氧菌） | 多层微观结构共培养系统，模拟自然微生物生态系统的部分隔离 | 医学，环境，合成生物学 |
| 40 | 2025-10-05 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-29, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
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研究论文 | 本研究评估了非天然核苷dTAT1在紫外光下的光物理特性和细胞毒性，发现其具有较低的光细胞毒性 | 首次系统研究dTAT1在紫外光激发下的三重态特性和活性氧产生机制，揭示其相比dTPT3具有更短的三重态寿命和更低的光细胞毒性 | 研究主要聚焦于光细胞毒性评估，对dTAT1在其他生理条件下的长期安全性研究不足 | 评估dTAT1非天然核苷的光细胞毒性特性，为安全遗传密码扩展提供依据 | dTAT1非天然核苷及其与dNaM形成的非天然碱基对 | 合成生物学 | NA | 紫外光激发、活性氧检测、光物理特性分析 | NA | 光谱数据、细胞毒性数据、量子产率数据 | NA | 遗传密码扩展技术 | 细胞培养系统 | 非天然碱基对dTAT1-dNaM，用于遗传信息存储和检索扩展 | 医学, 生物技术 |