合成生物学相关文章
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当前共找到 130 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-06-04 |
Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021
PMID:38942381
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研究论文 | 本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统，显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率 | 提出多模块组装的mPE系统，相比原始PE2系统，在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升，尤其擅长多碱基插入（平均提升197.9倍） | 研究仅针对双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草，尚未验证在其他植物中的适用性 | 解决prime editing在双子叶植物中效率低下的问题，开发系统性优化方案 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 植物合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、深度扩增子测序（20-50万clean reads） | 多模块组装prime editing系统(mPE) | 基因组测序数据 | 大规模转化实验（具体数量未明确说明） |
| 22 | 2025-06-03 |
Integrated study on the genome, transcriptome, and metabolome of Gelsemium elegans and mining of related enzyme genes involved in koumine biosynthesis
2025-May-24, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110069
PMID:40450816
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研究论文 | 本文对钩吻的基因组、转录组和代谢组进行了综合研究，并挖掘了与钩吻碱生物合成相关的酶基因 | 首次对钩吻的基因组进行测序和组装，并构建了全面的转录组cDNA文库，鉴定了29种生物碱，并验证了两个候选基因在钩吻碱生物合成中的功能 | 钩吻碱的生物合成途径研究较少，理解不足，限制了通过育种或合成生物学提高钩吻碱产量的能力 | 研究钩吻中钩吻碱的生物合成途径 | 钩吻（Gelsemium elegans） | 合成生物学 | NA | PacBio测序、液相色谱-质谱技术 | NA | 基因组、转录组、代谢组数据 | 不同组织和激素处理的钩吻样本 |
| 23 | 2025-06-03 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-May-23, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 本研究提出了一种利用光响应DNA液滴通过动态相分离控制酶级联途径的新方法 | 设计了带有偶氮苯修饰粘性末端的Y-motif序列，形成光响应DNA液滴，实现了对酶级联途径的动态调控 | 仅测试了两种酶级联系统，需要更多系统验证方法的普适性 | 开发一种调控酶级联途径的新方法 | 光响应DNA液滴和酶级联系统 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | 测试了两种酶级联系统（GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT） |
| 24 | 2025-06-02 |
Development of a chemically induced dissociation system via phage surface-displayed nanobody screening
2025-May-31, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70084
PMID:40448527
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研究论文 | 开发了一种通过噬菌体表面展示纳米抗体筛选的化学诱导解离系统，用于调控蛋白质间相互作用 | 利用噬菌体展示方法筛选出可与FDA批准小分子药物相互作用的纳米抗体，建立化学诱导解离系统（CIDiss） | NA | 开发一种可诱导调控蛋白质功能的化学方法，用于合成生物学和细胞治疗 | 丙型肝炎病毒蛋白酶NS3a与纳米抗体的相互作用 | 合成生物学 | 丙型肝炎 | 噬菌体展示 | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-06-02 |
A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine
2025-May-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102613
PMID:40449069
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research paper | 探讨噬菌体作为精准医学解决方案以应对抗生素耐药性细菌感染 | 结合基因工程、合成生物学和人工智能技术，定制化设计噬菌体以扩大宿主范围、克服细菌免疫系统并调节宿主细菌 | NA | 解决抗生素耐药性危机，提供精准医学替代方案 | 抗生素耐药性细菌感染 | precision medicine | bacterial infections | genetic engineering, synthetic biology, artificial intelligence, machine learning | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-06-02 |
Synthetic Biology for Designing Allostery and Its Potential Biomedical Applications
2025-May-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169225
PMID:40409706
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学原理设计变构调节及其在生物医学和生物技术中的应用潜力 | 通过合成生物学策略设计变构蛋白调节机制，包括变构调节剂的设计、从头变构蛋白开关的生成以及工程化变构机制在细胞功能控制中的应用 | NA | 探索合成生物学在变构调节设计中的应用及其在生物医学领域的潜力 | 蛋白质的变构调节机制 | 合成生物学 | NA | 人工智能生成蛋白质设计 | NA | NA | NA |
| 27 | 2025-06-02 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-May-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
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review | 本文综述了倍半萜醇生物合成的最新策略和进展 | 介绍了合成生物学在微生物生产倍半萜醇中的创新方法，包括适应性合成酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及对萜类相关毒性的耐受性 | 低产量和高生产成本阻碍了其工业规模应用 | 探讨倍半萜醇生物合成的最新合成生物学策略和进展 | 倍半萜醇 | 合成生物学 | NA | 微生物系统异源合成 | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-06-01 |
Kinetic modules are sources of concentration robustness in biochemical networks
2025-May-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads7269
PMID:40435256
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research paper | 该研究探讨了动力学模块在生化网络中对浓度鲁棒性的作用，并提出了一种无需参数值即可识别这些模块的方法 | 提出了一种基于稳态反应速率耦合的动力学模块识别方法，无需参数值，并发现有序结合酶机制比随机结合更能增强代谢物浓度的鲁棒性 | 研究仅基于34个代谢网络模型，可能无法涵盖所有生化网络的复杂性 | 研究动力学模块在生化网络中的作用及其对浓度鲁棒性的影响 | 生化网络中的动力学模块和代谢物浓度 | 生物化学网络 | NA | 质量作用动力学 | NA | 代谢网络模型 | 34个代谢网络模型，涵盖26种生物 |
| 29 | 2025-06-01 |
Structural Homology Fails to Predict Secretion Efficiency in Pichia pastoris: Divergent Responses of Architecturally Similar scFvs to Multi-Parametric Genetic Engineering
2025-May-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26104922
PMID:40430062
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研究论文 | 本研究通过基因剂量优化、表达盒设计和内质网分泌途径重编程三种策略，优化了Pichia pastoris中scFv的分泌效率 | 挑战了结构同源性（63%氨基酸同一性；RMSD 0.47 Å）确保一致优化结果的假设，强调了在合成生物学中需要针对蛋白质量身定制工程策略 | 研究仅针对两种结构同源的scFv变体PR961和PR953，可能不适用于其他蛋白质 | 优化Pichia pastoris中scFv的分泌效率，以支持AI驱动的生物制剂制造 | 两种结构同源的scFv变体PR961和PR953 | 合成生物学 | NA | 基因剂量优化、表达盒设计、内质网分泌途径重编程 | NA | NA | 两种scFv变体PR961和PR953 |
| 30 | 2025-06-01 |
Multi-Omics and Functional Insights into Triterpenoid Biosynthesis Pathways in Neopicrorhiza scrophulariiflora (Pennell) D.Y.Hong
2025-May-21, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14101562
PMID:40431127
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research paper | 该研究通过转录组学和代谢组学分析，探讨了濒危植物胡黄连中三萜类化合物的生物合成途径及其关键酶编码基因的表达模式 | 鉴定了8个参与三萜类生物合成的上游氧化角鲨烯环化酶（OSCs），其中NsOSC2是一种双功能酶，能催化2,3-氧化角鲨烯转化为α-香树脂醇和β-香树脂醇 | 研究未涉及其他可能影响三萜类生物合成的环境或发育因素 | 揭示胡黄连中三萜类化合物的生物合成分子机制 | 濒危多年生草本植物胡黄连（Neopicrorhiza scrophulariiflora） | 合成生物学 | NA | 转录组学、代谢组学分析 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 不同组织的胡黄连样本 |
| 31 | 2025-06-01 |
The Transformation Experiment of Frederick Griffith II: Inclusion of Cellular Heredity for the Creation of Novel Microorganisms
2025-May-15, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12050532
PMID:40428151
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research paper | 本文提出了一种改进的细菌转化实验设计（Griffith transformation experiment design 2.0），旨在实现DNA和非DNA结构及信息的有效交换，从而创造出具有显著形态/代谢表型差异的单细胞杂交微生物 | 提出了Griffith转化实验设计2.0，扩展了传统DNA转化范围，包括非DNA结构和调控信息的转移，为创造新型微生物提供了新方法 | 该方法仍处于概念阶段，实际应用效果和跨物种适用性有待验证 | 探索更高效的微生物遗传物质交换方法，创造具有新特性的杂交微生物 | 细菌细胞及其遗传物质 | 合成生物学 | NA | 细菌转化实验 | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-05-31 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-May-29, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学影响 | 探讨了5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸作为新兴核苷酸类似物的化学构建方法及其在药物设计、核苷酸酶学研究和合成生物学中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于文献综述 | 研究5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学功能 | 5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸 | 药物化学与生物技术 | NA | 磷酸酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-05-31 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
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研究论文 | 探讨在非豆科植物中实现固氮酶功能的研究进展与挑战 | 利用合成生物学和AI驱动设计在酵母线粒体中部分重建固氮酶功能，以解决氧敏感性和能量需求问题 | 尚未完全克服能量成本和氮水平反馈调节的挑战 | 实现在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性，以减少对氮肥的依赖 | 非豆科植物、固氮酶、酵母线粒体 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、AI驱动设计 | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-05-31 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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综述 | 本文综述了深度突变扫描和基于CRISPR的基因组编辑这两种方法在病毒基因组操作和功能表征中的应用 | 结合深度突变扫描和CRISPR技术，实现对病毒蛋白的全面突变和功能表征，为病毒进化和适应提供深入理解 | NA | 探讨深度突变扫描和CRISPR基因组编辑在病毒进化、功能基因组学研究中的应用及其对未来疫苗开发和治疗策略的影响 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
| 35 | 2025-05-31 |
Expression of Fluorescence Reporters and Natural Products in Native Gut Escherichia coli
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00835
PMID:40138712
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研究论文 | 本研究利用CRAGE技术对肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN进行基因工程改造，成功表达多种异源基因并优化荧光蛋白表达条件，同时实现生物活性化合物的生物合成 | 首次在原生肠道大肠杆菌中应用CRAGE技术实现多基因表达及生物活性化合物合成，拓展了合成生物学在肠道菌群中的应用潜力 | 研究仅针对两种特定菌株进行验证，尚未在更广泛的肠道菌群中测试该技术的普适性 | 开发基于原生肠道大肠杆菌的合成生物学平台 | 肠道原生大肠杆菌EcAZ-1和益生菌株EcN | 合成生物学 | NA | CRAGE（底盘独立重组酶辅助基因组工程技术） | NA | 基因表达数据、荧光信号数据 | 2种工程菌株（EcAZ-1和EcN） |
| 36 | 2025-05-31 |
Innovations, Challenges and Future Directions of T7RNA Polymerase in Microbial Cell Factories
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00139
PMID:40209062
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综述 | 本文全面探讨了T7RNA聚合酶在微生物细胞工厂中的创新、挑战及未来发展方向 | 拓宽了T7RNA聚合酶的研究范围，不仅涵盖分子结构和功能动态，还包括其在合成生物学中的应用及工程化改进 | 未提及具体实验数据或样本量，主要以理论探讨和文献综述为主 | 优化微生物细胞工厂中的转录系统，提升生物生产效率和可持续性 | T7RNA聚合酶及其变体在微生物细胞工厂中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-05-31 |
A Portable Arsenic Sensor Integrating Bacillus megaterium with CMOS Technology
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00895
PMID:40211918
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research paper | 该研究开发了一种基于巨大芽孢杆菌和CMOS技术的便携式砷传感器，用于实时检测水和土壤中的砷含量 | 通过合成生物学改造巨大芽孢杆菌用于砷检测，并将其与CMOS芯片集成，实现了可现场部署的砷检测技术 | 巨大芽孢杆菌的合成生物学工具包尚不完善，且传统全细胞传感器需要专业实验室设备读取输出 | 开发一种便携式砷检测传感器，用于资源有限环境中的实时砷检测 | 巨大芽孢杆菌及其孢子，CMOS芯片 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，CMOS技术 | NA | 生物传感器数据 | NA |
| 38 | 2025-05-31 |
Streamlining tRNA-Synthetase Evolution for Genetic Code Expansion and Deep Sequencing Analyses of Its Evolved Variants
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00117
PMID:40231936
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研究论文 | 本文介绍了一种简化的定向进化系统，用于提高吡咯赖氨酰-tRNA合成酶（PylRS）的活性，并探索其在遗传密码扩展中的应用 | 提出了一种简化的定向进化系统，仅需基础实验室设备即可实施，适合研究生操作，并通过深度测序验证了方法的效率 | 研究主要聚焦于PylRS的活性提升，未涉及其他tRNA合成酶的进化或更广泛的生物体系应用 | 提高非经典氨基酸（ncAAs）在蛋白质中的掺入效率，推动合成生物学和蛋白质工程的发展 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶（PylRS）及其定向进化变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化、深度测序 | NA | 测序数据 | 针对三种不同底物进化出的PylRS变体 |
| 39 | 2025-05-31 |
RT-EZ: A Golden Gate Assembly Toolkit for Streamlined Genetic Engineering of Rhodotorula toruloides
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00848
PMID:40232996
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research paper | 本文介绍了RT-EZ工具包，一种基于Golden Gate组装的工具，旨在简化Rhodotorula toruloides的基因工程操作 | RT-EZ工具包引入了双向启动子、2A肽、基于RFP的颜色筛选等新特性，显著提高了载体构建的速度和效率 | NA | 解决Rhodotorula toruloides基因工程操作中的高GC含量和缺乏复制质粒的问题 | Rhodotorula toruloides酵母 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-05-31 |
Genome Reduction Improves Recombinant Benzoxazole Production in Myxococcus xanthus
2025-05-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00114
PMID:40257411
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研究论文 | 本研究探讨了基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响，特别是对重组苯并恶唑生产的影响 | 通过连续移除生物合成基因簇（BGCs），显著提高了重组天然产物的产量，并发现某些BGCs的组合消除是不可行的 | 研究仅针对粘球菌，未涉及其他微生物，且某些BGCs的组合消除对细菌的耐受性有影响 | 研究基因组缩减对粘球菌生物技术性能的影响，以提高重组天然产物的产量 | 粘球菌（Myxococcus xanthus） | 合成生物学 | NA | 基因组缩减技术 | NA | 基因组数据 | NA |