合成生物学相关文章
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当前共找到 107 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-07-07 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-May-27, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
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research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性 | 揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制 | 未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性 | 研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程 | 细菌和古菌中的镍铁氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 开发了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞尺寸脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现细胞尺寸脂质体的可靠重复生成 | NA | 开发按需生产细胞尺寸脂质体的新技术 | 细胞尺寸脂质体的生成过程 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像、数值分析 | NA | 视频数据、数值模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、生物化学研究 |
| 43 | 2025-10-05 |
Microfluidics-driven templating preparation of polymer vesicles with tailorable dimensions and rapid cellular internalization
2025-May-27, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm00377f
PMID:40237355
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研究论文 | 提出一种微球模板策略，结合微流控技术和嵌段共聚物自组装制备尺寸可调的聚合物囊泡 | 首次报道的微球模板策略，通过微流控精确控制实现按需尺寸调节（70-170纳米）和快速细胞摄取 | NA | 开发精确控制聚合物囊泡尺寸和性能的制备方法 | 聚合物囊泡的制备与性能研究 | 纳米技术 | NA | 微流控技术、动态光散射、光学显微镜、扫描电镜、透射电镜 | NA | 图像数据、性能测试数据 | 使用HUVECs和4T1细胞进行测试 | 微流控 | NA | NA | 药物递送、纳米反应器、合成生物学 |
| 44 | 2025-10-05 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-May-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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研究论文 | 本研究引入丽春红S作为选择性调节剂，用于调控和监测牛血清白蛋白和溶菌酶的液液相分离过程 | 首次发现丽春红S可作为小分子调节剂精确调控蛋白质液液相分离，并利用其荧光特性实时监测相分离过程 | 研究仅针对牛血清白蛋白和溶菌酶两种模型蛋白，尚未在其他蛋白体系中验证 | 开发能够精确调控蛋白质液液相分离的小分子工具 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 生物分子工程 | NA | 荧光监测、液液相分离分析 | NA | 荧光数据、显微镜图像 | 两种模型蛋白（牛血清白蛋白和溶菌酶） | NA | NA | NA | 生物分子工程, 药物递送, 合成生物学 |
| 45 | 2025-10-05 |
Mitigating Uricase Immunogenicity through Zwitterionic Peptide Fusion for Enhanced Gout Therapy
2025-May-27, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c00829
PMID:40374583
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研究论文 | 通过融合两性离子肽降低尿酸氧化酶的免疫原性，以增强痛风治疗效果 | 首次采用不同长度的两性离子肽（重复VPKEG序列）融合策略系统性降低尿酸氧化酶免疫原性，并发现肽段长度与保护效果正相关 | 研究仅在大鼠痛风模型中进行验证，尚未进行临床实验 | 开发低免疫原性尿酸氧化酶用于痛风治疗 | 尿酸氧化酶与两性离子肽融合蛋白 | 合成生物学 | 痛风 | 蛋白质工程、免疫原性评估 | NA | 酶活性数据、免疫反应数据、药代动力学数据 | 大鼠痛风模型 | 合成生物学 | NA | 两性离子肽-尿酸氧化酶融合蛋白设计 | 医药 |
| 46 | 2025-10-05 |
Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells
2025-May-22, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00964-8
PMID:40405135
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研究论文 | 本研究利用酵母转化相关重组(TAR)技术成功组装了昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段(>44.6 Kb) | 首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的组装，为该病毒家族的基因组工程研究提供了新方案 | 在初始合成阶段已存在特定核苷酸突变和缺失区域 | 探索TAR方法在昆虫病毒长DNA片段组装中的适用性 | Heliothesis virescens ascovirus 3h (HvAV-3h)双链DNA基因组 | 合成生物学 | 昆虫病毒 | TAR, PCR, 下一代测序(NGS), Sanger测序 | NA | DNA序列数据 | 15个2.9-3.2 Kb的DNA片段 | TAR | 酵母细胞 | 长DNA片段组装 | 工业生物技术 |
| 47 | 2025-10-05 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-20, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
|
研究论文 | 评估NEIMS算法对非天然氨基酸的电子电离质谱预测准确性 | 首次系统评估机器学习质谱预测算法在训练数据范围外分子（特别是非天然氨基酸）的预测性能 | 预测准确性在算法训练数据范围外的氨基酸中显著下降，且误差无法通过物理化学差异或衍生化状态解释 | 评估机器学习质谱预测算法的准确性，为未知生物分子检测提供参考 | 单取代α-氨基酸 | 机器学习 | NA | 电子电离质谱(EIMS), 机器学习 | NEIMS算法 | 质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 48 | 2025-10-05 |
Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells
2025-May, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01879-3
PMID:40097648
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研究论文 | 本研究开发了在合成细胞中通过遗传编码表达RNA折纸细胞骨架的方法 | 首次在合成细胞中直接表达自组装RNA折纸纳米管，替代传统DNA纳米结构 | NA | 探索基于RNA的合成细胞分子硬件开发 | RNA折纸纳米管在合成细胞中的表达与自组装 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术，分子动力学模拟 | NA | 实验数据，模拟数据 | NA | DNA纳米技术 | 合成细胞（巨型单层脂质囊泡GUVs） | RNA折纸纳米管自组装系统，适配体功能化皮层形成 | 合成生物学，生物技术 |
| 49 | 2025-10-05 |
Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414777
PMID:40125621
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研究论文 | 开发了一种在活细菌细胞内直接定量蛋白质-蛋白质相互作用的方法KD-FRET | 首次实现在活体大肠杆菌细胞内直接测量蛋白质-蛋白质相互作用的解离常数，解决了传统体外测量方法的假阳性问题 | 未明确说明方法在其他细菌物种中的适用性及测量精度范围 | 开发能够在活细胞环境中直接定量蛋白质-相互作用的测量技术 | 活体大肠杆菌细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光共振能量转移(FRET) | NA | 荧光光谱数据 | 多种异源和同源蛋白质相互作用对 | NA | E. coli, S. cerevisiae | 代谢途径工程 | 医学, 工业生物技术 |
| 50 | 2025-10-05 |
ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414877
PMID:40130725
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研究论文 | 开发了一个名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质识别和注释 | 通过两种主要模式（Seek模式和Taxonomy模式）实现自动化关键步骤，降低计算复杂度，使专业和非专业用户都能进行高效全面的宏基因组分析 | NA | 解决目标蛋白质发现在宏基因组学中的挑战，促进新型生物技术资源的发现 | 微生物群落中的蛋白质和酶 | 生物信息学 | NA | 宏基因组学分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | NA | 微生物群落 | NA | 生物技术,合成生物学,生物医学 |
| 51 | 2025-10-05 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-05-23, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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研究论文 | 本研究开发了一种基于芽孢杆菌孢子展示尼古丁氧化酶的新型活体电化学生物传感器，用于尼古丁的特异性灵敏检测 | 通过基因组整合将活性增强的NOX突变体展示在芽孢表面，结合具有分级多孔3D纳米花结构的FeSe@MHCS复合电极，实现了超低检测限和优异稳定性 | NA | 开发高灵敏度实时尼古丁检测方法以应对公共卫生挑战 | 尼古丁分子 | 生物传感器 | 尼古丁暴露相关疾病 | 电化学阻抗谱，差分脉冲伏安法 | NA | 电化学信号数据 | 血液和尿液样本 | 基因组整合 | 芽孢杆菌 | 酶展示系统，H₂O₂介导的信号放大 | 医学检测，环境监测 |
| 52 | 2025-10-05 |
Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment
2025-May-21, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06740a
PMID:40271033
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研究论文 | 本研究通过消除NCN密码子冗余，在体外实现了最大程度的义密码子重新分配 | 提出了评估密码子重新分配潜力的通用方法，并将16个NCN密码子分配给10种不同氨基酸，使编码潜力增加一倍以上 | 研究目前仅限于体外系统，尚未在活体生物中验证 | 打破61个义密码子与20种氨基酸之间的简并性，实现遗传密码的最大化扩展 | NCN密码子家族（编码丝氨酸、脯氨酸、苏氨酸和丙氨酸的16个密码子）和对应的11种tRNA | 合成生物学 | NA | mRNA展示技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传密码重新分配系统 | 合成生物学, 蛋白质功能研究, 肽库构建 |
| 53 | 2025-10-05 |
Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming
2025-May-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf440
PMID:40396492
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研究论文 | 本研究开发了一种基于量子计算原理的新型转录编程平台技术，用于构建压缩型多输入/输出遗传电路 | 首次将量子计算原理应用于合成生物学，开发了双向启动子和合成转录因子调控的压缩遗传电路，实现了1输入2输出的量子比特和泡利-X逻辑门 | NA | 提高生物系统决策操作的复杂性同时减少底盘细胞的代谢负担 | 合成遗传电路和量子启发的逻辑操作 | 合成生物学 | NA | 转录编程、遗传电路工程 | NA | NA | NA | 重组酶系统 | 底盘细胞 | 量子比特逻辑门、泡利-X逻辑门、费曼门、托佛利门、双向启动子调控的压缩遗传电路 | 生物计算 |
| 54 | 2025-10-05 |
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity
2025-May-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98800
PMID:40390360
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研究论文 | 通过动力学模型分析细菌代谢对外部扰动的响应特性 | 发现代谢动力学中存在的硬编码响应特性，揭示腺苷辅因子和网络稀疏性对代谢响应的重要影响 | 基于计算机模拟研究，需要实验验证 | 理解生化系统在扰动下的动态特性，发展稳态的定量理论 | 细菌中心碳代谢 | 计算系统生物学 | NA | 动力学模型，数值模拟 | 非线性动力学模型 | 模拟数据 | 三个不同的动力学模型 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学，生物工程 |
| 55 | 2025-10-05 |
Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity
2025-May-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02740-x
PMID:40390016
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研究论文 | 通过合成生物学技术实现创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生物合成 | 首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物，首次报道卤化去甲创新霉素衍生物，实现了创新霉素和去甲创新霉素的最高实验室产量 | 未明确说明发酵规模和生产稳定性等工程化挑战 | 开发新型抗结核药物候选物 | 创新霉素及其衍生物 | 合成生物学 | 结核病 | 异源表达、启动子优化、发酵培养基筛选、前体定向生物合成 | NA | NA | 11种卤化衍生物（其中6种纯化鉴定） | NA | 放线菌 | 创新霉素生物合成途径 | 医药 |
| 56 | 2025-10-05 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了北里孢菌属来源肽类天然产物的研究策略、结构特征及生物合成机制 | 系统归纳了北里孢菌肽类研究的两种策略（天然产物优先和酶优先方法）及其在扩展合成生物学生物催化工具箱方面的潜力 | NA | 总结北里孢菌属来源肽类天然产物的研究进展和生物合成知识 | 北里孢菌属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络 | NA | 文本 | NA | NA | 放线菌 | NA | 医药 |
| 57 | 2025-10-05 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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研究论文 | 本研究开发了一种蛋白酶响应构象抑制系统（PRCIS），用于编程人工转录因子的条件性激活 | 通过分子内连接将DNA结合域与二聚化区域偶联实现构象失活，经蛋白酶切割后恢复功能，可适配多种ATF和蛋白酶 | NA | 开发可编程的蛋白酶响应型人工转录因子调控系统 | 人工转录因子（ATF）和蛋白酶响应系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 构象抑制系统、三重正交蛋白酶响应平台、双正交化学诱导平台、布尔逻辑运算 | 医学、工业生物技术 |
| 58 | 2025-10-05 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声响应哺乳动物细胞合成生物学的最新进展，重点介绍了声遗传学在非侵入性细胞控制中的应用 | 将超声波与基因工程效应器结合，克服了组织穿透性和侵入性的限制，实现了对细胞和分子过程的非侵入精确控制 | 参数标准化不足和对潜在机制理解不充分 | 开发超声响应合成生物学工具用于研究和治疗应用 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 声遗传学 | NA | NA | NA | 基因工程 | 哺乳动物细胞 | 超声响应遗传电路 | 医学 |
| 59 | 2025-10-05 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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研究论文 | 开发了一种基于基因组特征的DNA标记系统，用于创建自认证基因组 | 提出基于Golomb标尺的基因组梳状结构，能在有限密码子内高效映射大量核苷酸序列，显著提高错误校正和数据编码能力 | NA | 开发能够确保合成基因组材料真实性和完整性的DNA标记系统 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 450万核苷酸基因组 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因组签名系统，基于密码子顺序的数据编码 | 工业生物技术 |
| 60 | 2025-10-05 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
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研究论文 | 通过组合代谢工程改造解脂耶氏酵母实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 开发了蛋白质融合和多拷贝基因整合策略，并通过调控甲羟戊酸途径、脂质合成与降解来优化前体供应 | NA | 构建能够高效生产植物源二萜醇sclareol的微生物细胞工厂 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA | 基因整合、蛋白质融合 | Yarrowia lipolytica | sclareol合成途径，包含LPPS和SCS酶，优化甲羟戊酸途径和GGPP供应 | 工业生物技术 |