合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2025-05-31	Insight into Optogenetics for Diabetes Management 2025-05-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00549 PMID:40279455	研究论文	本文探讨了光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力	光遗传学作为一种合成生物学方法，通过光激活工程细胞实现用户控制的激素分泌，为糖尿病管理提供了新的治疗策略	需要进一步研究照射参数、红移视蛋白和宿主细胞相互作用，以实现光遗传学在临床中的全面应用	探索光遗传学在糖尿病管理中的应用及其潜力	胰腺和非胰腺来源的转基因细胞	合成生物学	糖尿病	光遗传学	NA	NA	小鼠模型
42	2025-05-31	A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli 2025-05-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00044 PMID:40327816	research paper	该研究开发了一种基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器，用于在大肠杆菌中控制基因表达	首次在细菌中建立了动态范围超过230倍的正交远红光传感器，并鉴定了远红光调控（FLR）基序	研究主要局限于大肠杆菌，未在其他细菌中验证传感器的适用性	开发用于合成生物学应用的远红光传感器	大肠杆菌和蓝藻的远红光光适应（FaRLiP）基因簇	合成生物学	NA	光遗传学	NA	基因表达数据	NA
43	2025-05-31	Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow 2025-05-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00812 PMID:40331904	research paper	开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法，用于构建表达可调库	提出了一种自动化的一步多基因组装方法，优化了穿梭载体以提高组装效率，并实现了高通量基因组装	未提及该方法在不同生物体系中的适用性或潜在的技术挑战	改进基因组装方法，提高合成生物学中的并行和高通量遗传工程效率	酵母基于的多基因库	synthetic biology	NA	in vivo homologous recombination	NA	genetic data	NA
44	2025-05-30	Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering 2025-May-29, Biofabrication IF:8.2Q1 DOI:10.1088/1758-5090/add568 PMID:40334674	研究论文	本文介绍了一种利用混沌3D打印技术制造具有多层微结构的水凝胶构造物的方法，以模拟自然微生物生态系统中的部分隔离现象	使用混沌3D打印技术制造微结构化的细菌生态系统，模拟自然微生物群落的空间组织	研究仅使用了简化的肠道微生物群落模型，可能无法完全反映复杂自然生态系统的所有特性	开发一种能够精确控制微生物空间分布的技术，以更好地研究微生物相互作用	混合微生物群落，特别是人类肠道微生物群落的简化模型	微生物工程	NA	混沌3D打印、荧光显微镜、菌落计数、定量PCR	NA	图像、菌落计数数据、PCR数据	简化的细菌群落模型（具体菌株未明确说明数量）
45	2025-05-30	dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion 2025-May-29, The journal of physical chemistry letters IF:4.8Q1 DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763 PMID:40401918	research paper	该研究探讨了非天然核苷dTAT1在遗传密码扩展中的光物理和细胞毒性行为	发现dTAT1在390 nm激发下占据三重态但细胞毒性极低，且产生的单线态氧量子产率仅为17%，三重态寿命比dTPT3短2.7倍	未明确说明实验所用细胞类型或具体实验条件	评估dTAT1在遗传密码扩展中的安全性和潜在治疗应用	非天然核苷dTAT1	合成生物学	NA	光物理分析、活性氧检测	NA	化学分析数据	NA
46	2025-05-29	Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets 2025-May-28, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d5lc00149h PMID:40302460	研究论文	本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法	采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体，实现了按需生产	NA	开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法，推动膜科学和合成生物学领域的发展	细胞大小脂质体	合成生物学	NA	激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析	NA	视频数据（高速摄像）、数值模拟数据	NA
47	2025-05-28	Microfluidics-driven templating preparation of polymer vesicles with tailorable dimensions and rapid cellular internalization 2025-May-27, Biomaterials science IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d5bm00377f PMID:40237355	研究论文	本文提出了一种基于微流控技术的聚合物囊泡制备方法，实现了对囊泡尺寸的可控调节和快速细胞摄取	首次报道了微球模板策略，结合微流控精确控制和嵌段共聚物自组装，克服了传统方法的限制	NA	开发一种可控尺寸和快速细胞摄取的聚合物囊泡制备方法	聚合物囊泡	纳米技术	NA	微流控技术	NA	NA	NA
48	2025-05-28	Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation 2025-May-27, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432 PMID:40353860	研究论文	本研究介绍了Ponceau S作为一种选择性调节剂，用于诱导和监测蛋白质的液-液相分离（LLPS）	首次提出Ponceau S作为小分子调节剂，能够精确调控蛋白质的液-液相分离，并通过其荧光特性监测相分离过程	研究仅针对牛血清白蛋白和溶菌酶两种蛋白质，未验证其在更广泛蛋白质体系中的适用性	探索小分子对蛋白质液-液相分离的精确调控方法	牛血清白蛋白和溶菌酶	生物分子工程	NA	荧光监测技术	NA	实验数据	两种蛋白质（牛血清白蛋白和溶菌酶）
49	2025-05-28	Mitigating Uricase Immunogenicity through Zwitterionic Peptide Fusion for Enhanced Gout Therapy 2025-May-27, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acs.langmuir.5c00829 PMID:40374583	研究论文	通过合成生物学方法将两性离子肽与尿酸氧化酶融合，降低其免疫原性，从而增强痛风治疗效果	利用不同长度的两性离子肽（重复VPKEG序列）融合尿酸氧化酶，显著降低其免疫原性，并提高酶活性、底物亲和力及血液循环时间	研究仅在大鼠痛风模型中进行验证，尚未进行人体临床试验	开发低免疫原性的尿酸氧化酶以增强痛风治疗效果	尿酸氧化酶及两性离子肽融合蛋白	合成生物学	痛风	合成生物学	NA	NA	大鼠痛风模型
50	2025-05-26	Assembly of ascovirus HvAV-3h long DNA fragment using the Transformation-Associated Recombination (TAR) approach in yeast cells 2025-May-22, BMC biotechnology IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12896-025-00964-8 PMID:40405135	研究论文	本研究利用酵母细胞中的转化相关重组（TAR）方法，成功组装了来自昆虫病毒HvAV-3h的长DNA片段	首次将TAR方法应用于昆虫病毒长DNA片段的组装，为基因组工程研究提供了新思路	研究中发现了初始合成时存在的突变和缺失，可能影响组装片段的准确性	探索TAR方法在昆虫病毒基因组工程研究中的适用性	Heliothesis virescens ascovirus 3h (HvAV-3h) dsDNA基因组	合成生物学	NA	TAR, PCR, NGS	NA	DNA序列数据	15个约2.9-3.2 Kb的DNA片段组装成44.6 Kb长片段
51	2025-05-25	Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids 2025-May-20, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286 PMID:40329886	research paper	评估NEIMS质谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性，以改进未知生物分子检测	首次评估NEIMS算法对超出训练数据的氨基酸的预测准确性，并指出其不足	预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确，且无法通过物理化学差异或氨基酸衍生化状态解释这些不准确性	改进质谱预测算法，以扩展数据库覆盖范围，包括理论分子	单取代α-氨基酸	machine learning	NA	mass spectrometry	NEIMS	mass spectral data	NA
52	2025-05-25	Genetic encoding and expression of RNA origami cytoskeletons in synthetic cells 2025-May, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-025-01879-3 PMID:40097648	研究论文	本文介绍了RNA折纸细胞骨架模拟物作为合成细胞的核酸分子硬件，并展示了其在巨型单层脂质囊泡中的表达和应用	首次将RNA折纸技术应用于合成细胞的细胞骨架构建，实现了在等温条件下由DNA模板直接表达和自组装RNA折纸纳米管	研究仅局限于体外合成细胞系统，尚未在真实细胞环境中验证其功能	开发基于RNA的合成细胞分子硬件	RNA折纸纳米管和合成细胞	合成生物学	NA	RNA折纸技术、分子动力学模拟	NA	分子结构数据	NA
53	2025-05-25	Direct Quantification of Protein-Protein Interactions in Living Bacterial Cells 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414777 PMID:40125621	研究论文	该文章介绍了一种名为KD-FRET的方法，用于在活细菌细胞中定量测量蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的解离常数（K）	开发了KD-FRET方法，能够在活细菌细胞中直接定量测量PPIs，克服了体外测量中的假阳性信号问题，并能够测量在标准缓冲条件下不稳定的相互作用对	未明确提及方法的局限性，但可能包括荧光共振能量转移（FRET）技术本身的技术限制	开发一种在活细胞中直接定量测量蛋白质-蛋白质相互作用的方法，以促进合成生物学、蛋白质工程和药物发现	活细菌细胞（E. coli和S. cerevisiae）中的蛋白质-蛋白质相互作用	合成生物学	NA	荧光共振能量转移（FRET）	NA	荧光信号数据	未明确提及具体样本数量，但涉及E. coli和S. cerevisiae中的蛋白质相互作用对
54	2025-05-25	ProteoSeeker: A Feature-Rich Metagenomic Analysis Tool for Accessible and Comprehensive Metagenomic Exploration 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414877 PMID:40130725	研究论文	介绍了一个名为ProteoSeeker的命令行工具，用于简化宏基因组蛋白质的识别和注释	开发了一个自动化工具ProteoSeeker，用于高效识别和注释宏基因组中的蛋白质，支持用户自定义蛋白质家族筛选和宿主生物分类学分析	未提及具体的性能对比或与其他工具的基准测试结果	加速生物技术、合成生物学和生物医学研究与创新	宏基因组中的蛋白质	生物信息学	NA	宏基因组分析	NA	宏基因组数据	NA
55	2025-05-24	Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection 2025-05-23, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.5c00275 PMID:40329593	research paper	本研究开发了一种新型的活体电化学生物传感器，用于高灵敏度和实时检测尼古丁	通过合成生物学和材料工程的结合，开发了具有增强活性和热稳定性的基因工程NOX突变体，并将其展示在孢子表面，结合FeSe@MHCS复合电极，实现了超低检测限和出色的稳定性	NA	开发一种高灵敏度和实时检测尼古丁的方法	尼古丁	生物传感器	NA	电化学阻抗谱(EIS), 差分脉冲伏安法(DPV)	NA	电化学数据	血液和尿液样本
56	2025-05-24	Removing redundancy of the NCN codons in vitro for maximal sense codon reassignment 2025-May-21, Chemical science IF:7.6Q1 DOI:10.1039/d4sc06740a PMID:40271033	research paper	该研究探讨了通过消除NCN密码子的冗余性，在体外实现最大程度的有义密码子重新分配，以扩展遗传密码的应用	提出了一种评估密码子重新分配潜力的通用流程，并将16个密码子分配给10种不同的氨基酸，显著提高了编码潜力	研究主要在体外进行，体内应用的可行性和效果尚待验证	扩展遗传密码，为合成生物学、蛋白质功能研究和多肽库的创建提供更多可能性	NCN密码子及其对应的tRNA	合成生物学	NA	mRNA展示技术	NA	NA	NA
57	2025-05-24	Quantum-inspired logic for advanced Transcriptional Programming 2025-May-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf440 PMID:40396492	研究论文	该研究提出了一种基于量子计算原理的新型合成生物学工具包，用于构建具有多输出基因控制的压缩遗传电路，以增强转录编程的生物计算能力	利用量子计算原理设计合成双向启动子和转录因子，构建了1输入2输出的生物量子比特和PAULI-X逻辑门，并进一步开发了更复杂的FEYNMAN和TOFFOLI门，以及2输入4输出的量子操作	NA	提高生物系统决策操作的复杂性，同时最小化对底盘细胞的代谢负担	合成遗传电路和量子启发的逻辑操作	合成生物学	NA	合成双向启动子工程、合成转录因子调控、重组酶记忆操作	量子启发的逻辑门（QUBIT、PAULI-X、FEYNMAN、TOFFOLI）	NA	NA
58	2025-05-23	Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane 2025-May-21, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202500327 PMID:40400158	综述	本文回顾了SLIPT-PM化学遗传学平台的发展、主要特点、当前应用及未来挑战，该平台用于在活细胞中控制蛋白质定位	介绍了SLIPT-PM这一新型化学遗传学平台，能够快速将目标蛋白从细胞质招募到质膜，并具有可控的可逆性和重复性	未明确提及具体局限性	开发用于操纵细胞信号网络的化学遗传学工具	细胞信号蛋白和脂质	化学生物学与合成生物学	NA	SLIPT（自定位配体诱导蛋白转位）技术	NA	NA	NA
59	2025-05-23	Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics revealed hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity 2025-May-20, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.98800 PMID:40390360	研究论文	通过计算机模拟分析细菌代谢动力学对外部扰动的响应，揭示了代谢网络中辅因子和网络稀疏性的硬编码响应特性	发现三种不同动力学模型在非线性状态下对扰动表现出一致的强响应，并识别出腺苷辅因子和网络结构是影响代谢系统响应性的关键因素	研究基于计算机模拟，需要进一步实验验证	发展定量稳态理论，理解生化系统在扰动下的动力学特性	细菌中心碳代谢的动力学模型	计算系统生物学	NA	动力学模型模拟	非线性动力学模型	计算机模拟数据	三种不同的动力学模型
60	2025-05-23	Targeted high-level production of chuangxinmycin and its halogenated derivatives with antitubercular activity 2025-May-19, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02740-x PMID:40390016	研究论文	该研究通过合成生物学技术实现了创新霉素及其卤化衍生物的高效定向生产，并评估了其抗结核活性	首次通过生物合成而非化学合成获得创新霉素衍生物，并首次报道卤化去甲创新霉素衍生物，实现了实验室水平的最高产量	未提及临床前或临床试验数据，活性测试仅限于体外实验	开发新型抗结核药物候选物	创新霉素及其衍生物	合成生物学	结核病	异源表达、激活子过表达、启动子优化、发酵培养基筛选、HR-MS、HR-MS/MS、NMR	NA	化学分析数据、生物活性数据	11种卤化创新霉素衍生物（其中6种纯化鉴定）