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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Biosynthesis and bioactivities of triterpenoids from Centella asiatica: Challenges and opportunities
2025 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108541
PMID:39978422
|
综述 | 本文综述了积雪草中三萜类化合物的生物合成途径、生物活性及生物技术生产策略 | 系统总结了积雪草三萜类化合物的生物合成途径,并提出基于合成生物学和微生物细胞工厂的可持续生产指南 | NA | 探讨积雪草三萜类化合物的生物技术生产策略及未来发展方向 | 积雪草中的三萜类化合物(积雪草酸、羟基积雪草酸、积雪草苷、羟基积雪草苷) | 合成生物学 | NA | 植物组织培养、微生物细胞工厂构建 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物细胞 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药 |
| 82 | 2025-10-05 |
Emerging biotechnological strategies advancing biological lignin valorization towards polyhydroxyalkanoates
2025-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132278
PMID:39986625
|
综述 | 本文探讨了通过微生物将木质素转化为聚羟基脂肪酸酯(PHA)的生物技术策略 | 整合微生物PHA合成与木质素生物转化,促进木质素高值化和PHA可持续生产 | 木质素的顽固性和异质性对微生物降解和高值化利用构成重大挑战 | 推动木质素生物高值化转化为聚羟基脂肪酸酯 | 木质素和聚羟基脂肪酸酯(PHA) | 工业生物技术 | NA | 合成生物学技术,代谢调控策略 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | NA | 能源, 材料, 环境 |
| 83 | 2025-10-05 |
A review of MicroRNAs and flavonoids: New insights into plant secondary metabolism
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142518
PMID:40157676
|
综述 | 系统探讨microRNAs与类黄酮代谢的调控关系及其在代谢工程中的应用前景 | 提出“miRNA-多因子协同网络”概念,整合CRISPR/Cas13、合成生物学与人工智能等跨学科技术优化类黄酮代谢 | NA | 深入理解植物次生代谢调控机制并提升类黄酮工业化生产能力 | 植物microRNAs与类黄酮代谢途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas技术、多组学技术、人工智能 | NA | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR/Cas13 | 植物 | 类黄酮代谢通路工程 | 医药, 农业, 工业生物技术, 食品 |
| 84 | 2025-10-05 |
Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712
PMID:40174852
|
研究论文 | 通过理性设计末端脱氧核苷酸转移酶的引物识别位点,实现RNA引物的高效延伸 | 首次成功改造TdT酶的引物识别位点,将RNA引物延伸效率从20%提升至90%以上 | 未提及大规模生产应用验证 | 开发能够高效延伸RNA引物的工程化酶工具 | 末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)及其突变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、酶工程、反应动力学评估 | NA | 酶活性数据、反应动力学数据 | 多种RNA引物集合 | 理性设计 | NA | RNA编辑酶设计 | 医学,合成生物学 |
| 85 | 2025-10-05 |
Silaffins as functional biomacromolecules in regulating frustule morphogenesis and biosilica properties
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143105
PMID:40222518
|
研究论文 | 本研究通过基因过表达和CRISPR/Cas9介导的敲除方法,揭示了硅藻中silaffin蛋白TpSil1和TpSil3在硅质细胞壁形态发生和生物硅特性调控中的具体功能 | 首次系统阐明不同silaffin蛋白在硅藻细胞壁形态发生中的特异性功能,并发现其对硅藻生理和硅质材料物理化学性质的调控作用 | 由于TpSil1和TpSil2序列高度同源,无法单独敲除TpSil1;TpSil3完全敲除可能导致致死性,无法获得双等位基因敲除突变体 | 探究silaffin蛋白在硅藻硅质细胞壁形态发生和生物硅特性调控中的具体功能 | 模型生物假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana)及其silaffin蛋白TpSil1和TpSil3 | 合成生物学 | NA | 基因过表达、CRISPR/Cas9介导的基因敲除、形态学分析 | NA | 形态学数据、生理学数据、材料特性数据 | 假微型海链藻野生型和基因工程改造菌株 | CRISPR-Cas9 | 假微型海链藻 | 基因过表达和敲除系统 | 材料,医药,能源,工业生物技术 |
| 86 | 2025-10-05 |
The CpG Landscape of Protein Coding DNA in Vertebrates
2025-May, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.70101
PMID:40330995
|
研究论文 | 通过理论分析和六种脊椎动物的全基因组数据,研究蛋白质编码DNA中CpG含量的形成机制和进化意义 | 首次系统揭示蛋白质编码序列中CpG含量显著高于非编码区,并发现CpG位点在调控功能和应激反应基因中富集 | 研究仅涵盖六种脊椎动物物种,可能无法完全代表所有脊椎动物的多样性 | 探究脊椎动物蛋白质编码基因中CpG含量的形成和维持机制 | 人类、小鼠、鸡、大山雀、青蛙和刺鱼六种脊椎动物的基因组数据 | 基因组学 | NA | 全基因组分析、DNA甲基化分析 | NA | 基因组序列数据 | 六种脊椎动物物种的全基因组数据 | NA | NA | NA | 进化生物学、育种学、合成生物学 |
| 87 | 2025-10-05 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
|
研究论文 | 本研究阐明了大豆抗毒素甘氨酸素的完整生物合成途径,并通过合成生物学方法在酵母中实现了从头合成 | 发现了甘氨酸素生物合成中未表征的还原酶基因和五个介导氧化环化的P450酶,首次实现了甘氨酸素在酵母中的从头合成 | NA | 阐明甘氨酸素的完整生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘氨酸素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 本氏烟草, 酿酒酵母 | 甘氨酸素生物合成途径 | 农业, 生物学 |
| 88 | 2025-10-05 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
|
研究论文 | 本研究鉴定并改造了鞘氨醇菌来源的醇脱氢酶SpADH2,使其能高效利用烟酰胺辅因子仿生物作为辅因子 | 首次发现能利用全合成烟酰胺辅因子仿生物(tsNCBs)的天然醇脱氢酶,并通过半理性工程显著提升其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本烟酰胺辅因子仿生物的醇脱氢酶 | 鞘氨醇菌来源的醇脱氢酶SpADH2及其突变体 | 合成生物学 | NA | 酶工程、半理性设计、酶催化表征 | NA | 酶活性数据、相互作用分析 | 野生型SpADH2及三个关键突变体(H43L、A290I、H43L/A290I) | 酶工程 | Sphingobium sp. SYK-6 | NA | 工业生物技术 |
| 89 | 2025-10-05 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
|
研究论文 | 通过定向进化羟化酶XcP4H并改造大肠杆菌Nissle 1917,开发能生物合成5-HTP的工程益生菌用于治疗抑郁症 | 首次将基于遗传密码扩展的高通量筛选方法应用于XcP4H的定向进化,创建了5-HTP产量提高22倍的酶变体,并构建了能同时改善肠道和大脑功能的活体治疗剂 | 研究目前仅在小鼠模型中验证效果,尚未进行人体临床试验 | 开发能有效生产5-HTP的工程益生菌,克服5-HTP药代动力学差的限制,为抑郁症治疗提供新策略 | 羟化酶XcP4H、大肠杆菌Nissle 1917、抑郁症小鼠模型 | 合成生物学 | 抑郁症 | 酶定向进化、分子动力学模拟、基因编辑、高通量筛选 | NA | 生物化学数据、行为学数据、微生物组数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9, 基因编辑 | 大肠杆菌 | 5-HTP生物合成途径 | 医药 |
| 90 | 2025-10-05 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-May-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
|
研究论文 | 开发了一种在活细胞内合成近红外量子点的细胞适应性策略,通过精确调控前驱体耦合抑制ROS爆发 | 发现细胞适应性硒代胱氨酸可转化为生物相容性前驱体,与银-谷胱甘肽耦合合成近红外AgSe量子点,显著提高细胞活性和荧光强度 | NA | 实现活细胞内无机纳米晶体的生物合成并维持细胞功能 | 量子点合成、细胞成像、疾病进展追踪 | 合成生物学 | NA | 量子点合成、荧光成像 | NA | 荧光图像、细胞活性数据 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 前驱体转化与耦合生物合成途径 | 医学 |
| 91 | 2025-10-05 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
|
综述 | 探讨基于凝聚层的酶促微反应器最新进展及其在生物催化中的应用潜力 | 系统阐述凝聚层通过提高底物浓度、稳定中间体和提供分子拥挤环境加速酶促反应的机制 | NA | 总结凝聚层微反应器的设计原理、工作机制和应用前景 | 基于合成聚合物、肽类和核酸的凝聚层系统及酶促反应模型 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱法、核磁共振波谱 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶促微反应器系统 | 生物催化, 合成生物学, 纳米技术 |
| 92 | 2025-10-05 |
Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01198h
PMID:40104998
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综述 | 本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成与发现中的应用 | 将无细胞合成生物学技术系统应用于天然产物生物合成途径表征和新代谢物发现 | NA | 探讨无细胞合成生物学在天然产物生产中的生物化学基础及其与全细胞/化学生产路线的比较 | 天然产物生物合成基因簇及其编码的酶类 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌,植物 | 天然产物生物合成途径,包括核糖体肽、非核糖体肽、聚酮化合物和萜类化合物的生物合成通路 | 医药,农业,工业生物技术 |
| 93 | 2025-10-05 |
Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00981a
PMID:40151987
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综述 | 本文综述了蛋白质衍生辅因子的生物合成、反应机制及其在酶催化和合成生物学中的应用 | 系统整理了20年间蛋白质衍生辅因子种类从17种扩展到38种的进展,揭示了远程催化和氧化还原调控分子开关等新范式 | 对辅因子组装机制的理解仍滞后,传统诱变方法会破坏辅因子组装 | 探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新如何扩展酶催化功能 | 蛋白质衍生辅因子及其催化机制 | 生物化学 | NA | 非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱学 | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 生物技术、生物催化 |
| 94 | 2025-10-05 |
Cytomimetic calcification in chemically self-regulated prototissues
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59251-x
PMID:40319022
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研究论文 | 本研究开发了一种能够实现化学自调节钙化的细胞模拟原组织 | 通过将碱性磷酸酶无机原细胞共价固定在有机网络中,建立了具有位点特异性矿化模式和组织重塑能力的粘弹性组织样微复合材料 | NA | 开发具有协调和自适应功能的细胞模拟材料 | 碱性磷酸酶原细胞与交联有机网络组成的组织样微复合材料 | 合成生物学 | NA | 原细胞技术、化学自调节系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 具有内源性钙化和脱钙功能的二元原细胞群体系统 | 组织工程、水凝胶技术、骨仿生学 |
| 95 | 2025-10-05 |
An acoustofluidic embedding platform for rapid multiphase microparticle injection
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59146-x
PMID:40319024
|
研究论文 | 开发了一种声流体频率关联微球嵌入平台,实现微颗粒从氟化油到水相液滴的快速跨相注入 | 首次实现固体微粒在水相和油相之间的自由动态操控,建立了跨相操纵的理论模型和实践原则 | NA | 开发能够跨相操纵固体微粒的微流控技术 | 水凝胶微球和微颗粒 | 微流控技术 | NA | 声流体技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学, 生化检测 |
| 96 | 2025-10-05 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 概述细胞色素P450在植物天然产物生物合成中的关键作用及其在合成生物学中的研究进展 | 重点聚焦细胞色素P450酶在关键催化步骤中的核心作用,并整合天然产物生物合成与合成生物学的最新研究进展 | NA | 探讨细胞色素P450在植物天然产物生物合成途径中的功能与作用机制 | 植物来源的天然产物(萜类、生物碱、黄酮类、甾体皂苷等)及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 97 | 2025-10-05 |
Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability
2025 May-Jun, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70255
PMID:40325615
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综述 | 本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展,探讨了提高观赏植物抗旱性和可持续性的前沿策略 | 整合了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析等前沿技术,提出了增强观赏植物抗旱性的创新方法 | NA | 开发抗旱观赏植物品种,提高观赏园艺的可持续性 | 观赏植物 | NA | NA | CRISPR/Cas9、合成生物学、数字表型分析、多组学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 观赏植物 | NA | 农业, 环境 |
| 98 | 2025-10-05 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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研究论文 | 提出一种整合蛋白质序列和几何信息的预训练框架,用于预测蛋白质变体的功能效应和热稳定性 | 开发了同时编码蛋白质序列和三维几何结构的新型预训练框架,能够更全面地捕捉蛋白质折叠稳定性、分子相互作用和生物功能等关键信息 | NA | 提高蛋白质变体效应预测的准确性和全面性,促进高效的蛋白质工程 | 蛋白质序列和三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 预训练框架 | 蛋白质序列和结构数据 | 超过300个深度突变扫描实验 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 99 | 2025-10-05 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶活性位点,开发了能高效降解五种氯苯胺类污染物的人工生物催化剂 | 首次通过将保守苏氨酸268突变为天冬氨酸,成功诱导P450BM3产生过加氧酶活性,无需NAD(P)H或双功能小分子即可实现高效催化 | NA | 开发高效降解氯苯胺类环境污染物的生物催化剂 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 酶活性数据、质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | 定点突变 | NA | NA | 环境 |
| 100 | 2025-10-05 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 本研究利用机器学习模型和特征重要性分析,发现铁元素能显著提高大肠杆菌中壳寡糖的产量 | 首次将机器学习与特征分析相结合,从复杂代谢通路中识别出能提高壳寡糖产量的新化合物——铁 | 工程步骤可能无法带来足够改进,且代谢瓶颈可能隐藏在数百个代谢反应中 | 优化壳寡糖的生物合成途径,提高其在大肠杆菌中的产量 | 壳寡糖(COS)的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 机器学习模型,特征重要性分析 | NA | 代谢生产数据 | 工程化转录调控因子库 | NA | 大肠杆菌 | 壳寡糖生物合成途径 | 工业生物技术 |