合成生物学相关文章
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当前共找到 119 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-05-13 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-May-12, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
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research paper | 该研究介绍了金属酚醛网络（MPNs）在肽基凝聚物可移除膜化中的应用，为稳定和保护凝聚物免受化学有害物质侵害提供了有效策略 | 利用MPNs的氧化还原活性特性实现膜的形成与解离的可控调节，并通过调整膜厚度实现选择性渗透，模拟生物膜的关键特征 | 研究仅针对特定化学试剂（如TCEP）的保护效果进行了验证，未涉及更广泛的化学环境或生物体系中的实际应用测试 | 开发稳定的、功能化的原始细胞模型，并保护其免受外部化学威胁 | 肽基凝聚物（如聚-L-赖氨酸和三磷酸腺苷凝聚物） | synthetic biology | NA | 核磁共振波谱（NMR） | NA | 化学分析数据 | 未明确样本数量，但涉及特定试剂（如Fe⁺、单宁酸、TCEP）处理的凝聚物 |
| 82 | 2025-05-13 |
Recent Advances in Biocatalytic and Chemoenzymatic Synthesis of Oligonucleotides
2025-May-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400987
PMID:39854143
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综述 | 本文总结了生物催化和化学酶法合成寡核苷酸的最新进展，强调了酶工程、底物和反应条件优化等方面的创新 | 综述了生物催化和化学酶法在寡核苷酸合成中的最新进展，包括优化的系统和工程酶的使用，以实现化学修饰核苷酸的掺入 | 未提及具体的实验数据或样本量，可能缺乏对某些方法实际应用效果的详细分析 | 探讨生物催化和化学酶法作为寡核苷酸合成的替代策略，以提高合成效率和可持续性 | 寡核苷酸的合成方法 | 生物技术 | NA | 生物催化、化学酶法 | NA | NA | NA |
| 83 | 2025-05-13 |
Harnessing Synthetic Riboswitches for Tunable Gene Regulation in Mammalian Cells
2025-May-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202401015
PMID:39995098
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review | 本文综述了合成核糖开关在哺乳动物细胞中用于可调基因调控的最新进展 | 探讨了基于多种RNA调控机制的合成核糖开关的设计和功能实现，并强调了新兴技术 | 讨论了脱靶效应、系统稳定性以及在复杂生物环境中配体递送等挑战 | 研究合成核糖开关在哺乳动物细胞中的基因调控应用 | 合成核糖开关及其在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA调控机制 | NA | NA | NA |
| 84 | 2025-05-12 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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research paper | 提出了一种新的可解释性框架GELKcat，用于预测酶转换数（kcat），结合了预训练的酶嵌入和自适应门网络 | 利用图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入，通过自适应门网络整合底物和酶特征，提高了kcat预测的准确性和可解释性 | 性能仍依赖于酶和底物特征提取的有效性以及这两种特征的最优融合 | 改进酶转换数（kcat）的预测方法，为药物发现和合成生物学提供指导 | 酶和底物分子 | machine learning | NA | graph transformers, CNNs, word2vec | GELKcat (结合graph transformers和CNNs) | 分子结构数据 | 多物种酶-底物对转换数数据 |
| 85 | 2025-05-11 |
Synthetic biology routes to new and extinct natural products
2025-May-08, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00047e
PMID:40171247
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research paper | 该文章探讨了通过合成生物学方法生产新型和已灭绝的天然产物 | 利用基因敲除和基因交换技术，生产了多种新的代谢产物，并优化了某些抗生素的生产 | 研究主要集中在细菌和真菌中的生物合成途径，可能不适用于其他生物系统 | 探索和优化天然产物的生物合成途径 | 细菌和真菌中的生物合成途径及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、基因交换、异源表达 | NA | 基因组数据 | 多种细菌和真菌菌株 |
| 86 | 2025-05-11 |
Functional investigation of Zur in metal ion homeostasis, motility and multiple stresses resistance in cyanobacteria Synechocystis sp. PCC 6803
2025-May-07, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00224-x
PMID:40332629
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探讨了Zur在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中金属离子稳态、运动性和多重胁迫抗性中的多功能作用 | 揭示了Zur不仅调控锌离子稳态，还影响铁平衡、细菌运动性及对抗盐、氧化和抗生素胁迫的能力 | 研究仅基于转录组分析，缺乏蛋白质水平和具体调控机制的深入验证 | 探究Zur转录调控因子在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中的多功能调控作用 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803的Δzur突变体和野生型菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Δzur突变体和野生型Synechocystis sp. PCC 6803菌株 |
| 87 | 2025-05-11 |
Sustainable production of porphyrins through synthetic biology
2025-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.009
PMID:39341742
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评论 | 本文聚焦于通过合成生物学促进卟啉的可持续生产 | 讨论了卟啉生物合成在不同物种中的最新突破 | NA | 促进卟啉的可持续生产 | 卟啉化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 88 | 2025-05-11 |
A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates
2025-May, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13838
PMID:39835880
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研究论文 | 利用大肠杆菌中的稳健重构系统，通过合成生物学方法鉴定负责从特定蛋白质底物中去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶 | 采用合成生物学方法在大肠杆菌中建立重构系统，用于鉴定植物SUMO去修饰酶 | NA | 鉴定能够去除特定蛋白质底物上SUMO修饰的植物泛素样蛋白酶 | 植物泛素样蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-05-10 |
Engineering advanced bacterial therapy for tumor and inflammatory diseases
2025-May-15, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2025.125585
PMID:40216039
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综述 | 本文综述了工程化细菌疗法在肿瘤和炎症性疾病治疗中的优势、策略及研究进展 | 探讨了工程化细菌疗法通过基因重编程和表面化学修饰实现选择性功能重组和精确时空控制的新策略 | 讨论了当前工程化细菌疗法在应用中的局限性和挑战 | 探索工程化细菌疗法在疾病治疗中的潜力与前景 | 肿瘤和炎症性疾病 | 合成生物学与生物医学 | 肿瘤和炎症性疾病 | 基因重编程和表面化学修饰 | NA | NA | NA |
| 90 | 2025-05-10 |
Biosynthesis and bioactivities of triterpenoids from Centella asiatica: Challenges and opportunities
2025 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108541
PMID:39978422
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综述 | 本文综述了积雪草中三萜类化合物的生物合成、生物活性以及生物技术生产方法 | 总结了积雪草三萜类化合物的生物合成途径及生物技术生产方法，提出了未来工程化生产的指导方针 | 当前提取方法无法满足市场需求，生物技术生产仍面临挑战 | 探讨积雪草三萜类化合物的生物合成、生物活性及可持续生产方法 | 积雪草及其三萜类化合物（如积雪草酸、羟基积雪草酸、积雪草苷和羟基积雪草苷） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、微生物细胞工厂 | NA | NA | NA |
| 91 | 2025-05-10 |
Emerging biotechnological strategies advancing biological lignin valorization towards polyhydroxyalkanoates
2025-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132278
PMID:39986625
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综述 | 本文综述了将木质素转化为聚羟基脂肪酸酯（PHA）的生物技术策略，强调了微生物过程在PHA合成和木质素生物升级中的优势 | 整合微生物PHA合成与木质素生物转化，促进木质素的高值化利用和PHA的可持续生产 | 木质素的顽固性和异质性给微生物降解和高值化利用带来挑战 | 探讨木质素转化为高价值产品的生物技术策略，特别是PHA的生物合成 | 木质素和聚羟基脂肪酸酯（PHA） | 生物技术 | NA | 合成生物学技术和代谢调控策略 | NA | NA | NA |
| 92 | 2025-05-10 |
A review of MicroRNAs and flavonoids: New insights into plant secondary metabolism
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142518
PMID:40157676
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review | 该综述全面分析了miRNA的生物合成及其分子机制，重点探讨了miRNA介导的黄酮类化合物生物合成的调控 | 提出了'miRNA-多因素协同网络'的概念，并探讨了利用人工miRNA设计、CRISPR/Cas技术以及人工智能优化黄酮类代谢的新策略 | NA | 理解和改善黄酮类化合物的代谢，为代谢工程提供新的理论框架和技术路线 | 植物次级代谢产物黄酮类化合物及其调控机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas技术、合成生物学、多组学技术、人工智能 | NA | NA | NA |
| 93 | 2025-05-10 |
Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712
PMID:40174852
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研究论文 | 该论文通过合理设计末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）的引物识别位点，实现了RNA引物的高效延伸 | 通过工程化改造TdT的引物识别位点，将RNA延伸活性从20%提升至90%以上，并开发了两种微量microRNA检测的原理验证方法 | 未提及具体的临床应用验证或大规模生产可行性 | 改进酶促DNA合成技术，拓展其在RNA合成和分析中的应用 | 末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）及其RNA引物延伸能力 | 合成生物学 | NA | 酶工程、RNA-primed聚合 | NA | 酶活性数据、RNA序列分析数据 | 多种RNA引物（具体数量未明确说明） |
| 94 | 2025-05-10 |
Silaffins as functional biomacromolecules in regulating frustule morphogenesis and biosilica properties
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143105
PMID:40222518
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研究论文 | 研究硅藻中硅蛋白（silaffins）在硅壳形态发生和生物硅特性调节中的功能 | 首次通过基因过表达和CRISPR/Cas9介导的敲除方法，揭示了TpSil1和TpSil3在硅藻硅壳形态发生中的具体作用 | 无法生成双等位TpSil3敲除突变体，可能因为TpSil3是必需基因，完全敲除会导致致死 | 探究硅蛋白在硅藻硅壳形态发生和生物硅特性中的功能 | 硅藻Thalassiosira pseudonana中的硅蛋白TpSil1和TpSil3 | 合成生物学 | NA | 基因过表达、CRISPR/Cas9敲除 | NA | 形态学分析、生理学数据 | NA |
| 95 | 2025-05-10 |
The CpG Landscape of Protein Coding DNA in Vertebrates
2025-May, Evolutionary applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/eva.70101
PMID:40330995
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研究论文 | 研究探讨了DNA甲基化对脊椎动物基因组进化中CpG二核苷酸含量的影响及其在蛋白质编码DNA中的特异性 | 揭示了蛋白质编码序列中CpG含量显著高于非编码区域，并发现CpG位点在调控功能和应激反应相关基因中富集 | 研究仅涉及六种脊椎动物，可能无法全面代表所有脊椎动物的CpG分布模式 | 探讨CpG偏倚对蛋白质编码DNA的具体影响及其在脊椎动物基因组进化中的作用 | 六种脊椎动物（人类、小鼠、鸡、大山雀、青蛙和刺鱼）的基因组 | 基因组学 | NA | 全基因组分析 | NA | 基因组数据 | 六种脊椎动物的基因组数据 |
| 96 | 2025-05-09 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-May-07, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细胞构建单层人工神经网络，实现3位二进制码到格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换 | 研究尚处于早期阶段，计算能力和应用范围有限 | 探索基因工程细胞在神经形态计算中的应用 | 基因工程细胞构建的人工神经网络 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | ANN（人工神经网络） | 化学输入信号和荧光蛋白表达 | 五个工程细胞群体 |
| 97 | 2025-05-09 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-May-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
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研究论文 | 本研究揭示了glyceollins的完整生物合成途径，并通过合成生物学和代谢工程在酵母中实现了其从简单碳源的生产 | 发现了glyceollins生物合成途径中未表征的还原酶基因和五个P450酶，首次实现了glyceollins在微生物宿主中的从头合成 | NA | 阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产 | 大豆中的glyceollins化合物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究 | NA | NA | NA |
| 98 | 2025-05-09 |
Engineering a newly identified alcohol dehydrogenase from Sphingobium Sp. for efficient utilization of nicotinamide cofactors biomimetics
2025-May-05, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00870-z
PMID:40325297
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2)，并对其进行了半理性工程改造，以提高其对合成烟酰胺辅因子仿生物(NCBs)的利用效率 | 首次报道了一种能够利用全合成NCBs的天然ADH，并通过工程改造显著提高了其催化效率和辅因子特异性 | NA | 开发能够高效利用低成本NCBs的氧化还原酶 | 来自Sphingobium sp. SYK-6的醇脱氢酶(SpADH2) | 合成生物学 | NA | 半理性工程改造 | NA | 酶活性数据 | 野生型SpADH2及其变体(H43L, A290I, H43L/A290I) |
| 99 | 2025-05-09 |
Directed evolution of hydroxylase XcP4H for enhanced 5-HTP production in engineered probiotics to treat depression
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142250
PMID:40113000
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研究论文 | 通过定向进化技术增强工程益生菌中羟化酶XcP4H的活性，以促进5-HTP的生产，用于治疗抑郁症 | 采用基于遗传密码扩展的高通量筛选方法对XcP4H进行定向进化，显著提高了5-HTP的产量，并通过分子动力学模拟揭示了其机制 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 解决5-HTP的药代动力学限制，开发一种新型的抑郁症治疗方法 | 羟化酶XcP4H和工程益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 抑郁症 | 定向进化、分子动态模拟、高通量筛选 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 100 | 2025-05-08 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-May-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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research paper | 该研究开发了一种在活细胞内精确合成近红外量子点（QDs）的方法，通过控制前体的耦合和反应条件，显著提高了细胞存活率和荧光强度 | 利用细胞适应性硒代胱氨酸（(Cys-Se)）作为前体，结合Ag-谷胱甘肽（AgSG），在细胞内合成近红外AgSe量子点，同时抑制细胞毒性物质和ROS的爆发 | 研究未涉及大规模生产或临床应用的具体细节 | 开发一种在活细胞内高效、低毒合成荧光量子点的方法，用于细胞标记和生物成像 | 活细胞内的无机纳米晶体合成 | 合成生物学 | NA | 细胞内量子点合成技术 | NA | 荧光成像数据 | NA |