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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2025-05-08 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
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综述 | 本文综述了基于凝聚层的酶微反应器的最新进展,重点讨论了凝聚层加速酶反应的机制及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的潜在应用 | 探讨了凝聚层作为酶微反应器的创新应用,包括增强底物和酶浓度、稳定中间产物以及提供分子拥挤环境 | 讨论了在凝聚层内监测反应的挑战,以及当前可用的技术如荧光技术、色谱和核磁共振光谱的局限性 | 研究凝聚层微反应器的设计及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的应用 | 合成聚合物、肽和核酸为基础的凝聚层系统 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱、NMR光谱 | NA | NA | NA |
102 | 2025-05-08 |
Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01198h
PMID:40104998
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综述 | 本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用及其优势与局限 | 探讨了无细胞合成生物学在天然产物生物合成中的新兴应用,包括路径原型设计和新型代谢物生产 | 与全细胞或化学生产路线相比,无细胞合成生物学存在一定的局限性 | 研究无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学 | NA | NA | NA |
103 | 2025-05-08 |
Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00981a
PMID:40151987
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review | 本文综述了蛋白质衍生辅因子的生物合成、反应性、代谢调控及其在合成生物学和生物技术中的应用 | 揭示了蛋白质衍生辅因子的多样性和扩展功能,包括远程催化和氧化还原调控的分子开关等新范式 | 对辅因子组装机制的理解仍滞后于其发现速度 | 探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新及其对酶催化的扩展作用 | 蛋白质衍生辅因子 | 生物化学 | NA | 非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱 | NA | NA | NA |
104 | 2025-05-08 |
Cytomimetic calcification in chemically self-regulated prototissues
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59251-x
PMID:40319022
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research paper | 该研究开发了一种能够进行协调和适应性功能的细胞模拟材料,通过共价键将碱性磷酸酶无机原细胞固定在交联有机网络上,形成类似组织的微复合材料 | 通过化学自调节机制实现原组织的内源性钙化,模拟了骨组织中成骨细胞和破骨细胞的相互作用 | NA | 开发具有协调和适应性功能的细胞模拟材料,推动自下而上的合成生物学发展 | 碱性磷酸酶无机原细胞和交联有机网络组成的微复合材料 | 合成生物学 | NA | 化学自调节机制 | NA | NA | NA |
105 | 2025-05-08 |
An acoustofluidic embedding platform for rapid multiphase microparticle injection
2025-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59146-x
PMID:40319024
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研究论文 | 开发了一种声流体频率相关微球嵌入平台,实现从氟化油到水滴的微尺度快速微粒注入 | 首次实现了固体微粒在水相和油相之间的自由动态操控,并建立了跨相操控的理论模型和实用原则 | NA | 增强现有液滴操控技术,实现多相和跨相操作 | 水凝胶微球 | 微流控技术 | NA | 声流体技术 | 理论模型 | NA | NA |
106 | 2025-05-08 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-May, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展和前景,包括生产燃料、化学品、蛋白质和肽的酵母菌株开发 | 强调了合成生物学工具和数学建模在酵母代谢工程中的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏具体案例支持 | 探讨酵母作为微生物细胞工厂在工业生物技术中的应用 | 酵母菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、数学建模 | NA | NA | NA |
107 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-May-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) |
108 | 2025-05-07 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源性天然产物生物合成中的关键作用 | 重点探讨了细胞色素P450在天然产物下游合成途径和结构修饰中的重要作用,并总结了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 深入了解细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的作用,促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源性天然产物及其生物合成途径中的细胞色素P450酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
109 | 2025-05-07 |
Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability
2025 May-Jun, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70255
PMID:40325615
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review | 本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展,探讨了干旱胁迫对植物形态、生理、生化及美学价值的影响,并介绍了CRISPR/Cas9、合成生物学和数字表型分析等前沿技术在培育抗旱观赏植物中的应用 | 整合了多组学方法、先进育种技术和数字工具,加速关键抗旱基因和性状的鉴定,并探讨了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析在培育更具抗逆性和美学价值的观赏植物中的潜力 | 虽然对植物干旱胁迫响应的理解取得了显著进展,但如何将这些知识有效转化为观赏植物的实际育种策略仍存在空白 | 开发抗旱观赏植物,以应对干旱胁迫对观赏园艺的挑战,满足对美观且可持续景观日益增长的需求 | 观赏植物 | 园艺学 | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 数字表型分析, 多组学方法 | NA | NA | NA |
110 | 2025-05-06 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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research paper | 提出了一种新的预训练框架,整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器,以提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测 | 整合了序列和几何编码器,模拟自然选择指导突变方向,并在三个基准测试中展示了卓越性能 | 现有方法主要依赖蛋白质序列,难以高效编码氨基酸局部环境的几何方面,且缺乏对蛋白质热稳定性预测的基本评估 | 提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测的准确性和全面性 | 蛋白质序列和结构 | synthetic biology | NA | deep learning | pre-training framework with sequential and geometric encoders | protein sequence and structure data | over 300 deep mutational scanning assays |
111 | 2025-05-04 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提升了催化效率 | NA | 开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂,用于环境污染物降解 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 化学分析数据 | 五种氯苯胺类化合物 |
112 | 2025-05-03 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 利用机器学习模型和特征重要性分析改进大肠杆菌中壳寡糖的生产 | 通过机器学习模型和特征重要性分析发现铁元素可以显著提高壳寡糖的生产效率 | 工程步骤可能无法带来足够的改进,且代谢反应中的瓶颈可能仍被隐藏 | 提高壳寡糖的生产效率和预测性 | 大肠杆菌中的壳寡糖生产途径 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 代谢数据 | 大肠杆菌工程转录调节因子库 |
113 | 2025-05-02 |
Elucidation of the Ultrafast Origin of Multiphasic Dynamics in a Far-Red-Sensing Cyanobacteriochrome
2025-May-01, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00487
PMID:40256925
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研究论文 | 本文研究了新发现的远红/橙光吸收蓝藻色素的光异构化动力学,使用飞秒分辨荧光和吸收方法 | 观察到远红和橙光吸收态的活性位点弛豫,并发现了远红吸收态的动态光谱调谐和橙光吸收态的动态斯托克斯位移 | 研究仅限于特定蓝藻色素的动力学,未涉及其他类似蛋白的对比分析 | 阐明蓝藻色素激发态光化学和结构动力学的超快起源 | 远红/橙光吸收蓝藻色素的异构化反应 | 生物物理学 | NA | 飞秒分辨荧光和吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
114 | 2025-04-27 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
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综述 | 本文综述了利用启动子元件增强植物基因编辑的策略与进展 | 强调了组织/器官特异性及诱导型启动子在时空特异性基因编辑中的应用潜力,并探讨了合成生物学与生物信息学工具在启动子设计与优化中的创新应用 | 未涉及具体作物品种中启动子编辑的应用案例验证 | 提升植物基因编辑的精准性、效率与特异性以应对气候变化 | 植物基因编辑中的启动子调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因编辑(GE)、合成启动子设计、生物信息学分析 | NA | 基因组调控元件数据 | NA |
115 | 2025-04-25 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了抗生素偶联物作为克服抗生素耐药性的新策略的研究现状 | 提出利用'特洛伊木马'策略将抗生素与生物活性成分偶联,以增强抗生素对耐药病原体的效果 | 抗生素偶联物的临床转化面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对抗生素耐药性危机 | 抗生素与单克隆抗体(mAbs)、抗菌肽(AMPs)和铁螯合载铁体的偶联物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学和生物信息学 | NA | NA | NA |
116 | 2025-04-24 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-May, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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研究论文 | 研究濒危物种橙腹鹦鹉基因组多样性和免疫遗传多样性的长期丧失 | 利用高质量长读长参考基因组和历史及当代重测序基因组,追踪了该物种长期的基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降 | 样本量较小(当代19个,历史16个),且仅针对单一物种进行研究 | 评估濒危物种橙腹鹦鹉的基因组多样性和免疫遗传多样性丧失情况,为保护措施提供依据 | 橙腹鹦鹉(Neophema chrysogaster) | 基因组学 | 禽流感 | 长读长基因组测序,重测序 | NA | 基因组数据 | 当代样本19个,历史样本16个(最早可追溯至1829年) |
117 | 2025-04-21 |
Current application and future prospects of CRISPR-Cas in lactic acid Bacteria: A review
2025-May, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.116315
PMID:40253208
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在乳酸菌工程中的当前应用及未来前景 | 探讨了CRISPR-Cas系统在乳酸菌基因组编辑、代谢工程和合成生物学中的革命性应用及其在食品科学中的创新潜力 | 当前基因组编辑工具耗时且劳动密集型,限制了乳酸菌作为发酵食品功能增强剂的潜力开发 | 利用CRISPR-Cas系统推动乳酸菌研究及食品科学创新 | 乳酸菌(LABs) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
118 | 2025-04-13 |
Harnessing hyperaccumulator plants to recover technology-critical metals: where are we at?
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20449
PMID:40066815
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review | 本文回顾了植物采矿技术(phytomining)的发展现状,特别是其在镍回收方面的商业化应用,并探讨了其他技术关键金属(如钴、硒和铊)的潜在回收机会 | 文章强调了通过分子机制研究、驯化和农艺发展来改进超富集植物(hyperaccumulators)的新方法,包括定向育种和合成生物学技术 | 文章未提及植物采矿技术在实际应用中可能遇到的具体挑战或限制条件 | 探讨植物采矿技术在回收技术关键金属方面的现状和未来发展潜力 | 超富集植物及其在金属回收中的应用 | 环境生物技术 | NA | 定向育种,合成生物学 | NA | NA | NA |
119 | 2025-04-11 |
Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70095
PMID:40116553
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研究论文 | 本文开发了一种在Chlamydomonas reinhardtii中操纵倍性的策略,以研究倍性变化对植物进化的影响 | 利用非干扰性抗生素选择标记诱导C. reinhardtii更高倍性水平,适用于野外分离株,拓宽了可杂交的亲本单倍体菌株的遗传多样性 | 新形成的三倍体和四倍体显示出快速的异倍体化迹象 | 研究倍性变化对植物进化的直接和长期影响 | Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 基因组大小数据 | 北美野外分离株 |