合成生物学相关文章
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当前共找到 130 篇文献，本页显示第 121 - 130 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-05-06 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
|
research paper | 提出了一种新的预训练框架，整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器，以提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测 | 整合了序列和几何编码器，模拟自然选择指导突变方向，并在三个基准测试中展示了卓越性能 | 现有方法主要依赖蛋白质序列，难以高效编码氨基酸局部环境的几何方面，且缺乏对蛋白质热稳定性预测的基本评估 | 提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测的准确性和全面性 | 蛋白质序列和结构 | synthetic biology | NA | deep learning | pre-training framework with sequential and geometric encoders | protein sequence and structure data | over 300 deep mutational scanning assays |
| 122 | 2025-05-04 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点，开发出新型人工生物催化剂，用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，成功诱导了过氧化物酶活性，显著提升了催化效率 | NA | 开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂，用于环境污染物降解 | 五种氯苯胺类化合物（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 化学分析数据 | 五种氯苯胺类化合物 |
| 123 | 2025-05-03 |
Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli
2025-May-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005
PMID:39827984
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研究论文 | 利用机器学习模型和特征重要性分析改进大肠杆菌中壳寡糖的生产 | 通过机器学习模型和特征重要性分析发现铁元素可以显著提高壳寡糖的生产效率 | 工程步骤可能无法带来足够的改进，且代谢反应中的瓶颈可能仍被隐藏 | 提高壳寡糖的生产效率和预测性 | 大肠杆菌中的壳寡糖生产途径 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 代谢数据 | 大肠杆菌工程转录调节因子库 |
| 124 | 2025-05-02 |
Elucidation of the Ultrafast Origin of Multiphasic Dynamics in a Far-Red-Sensing Cyanobacteriochrome
2025-May-01, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00487
PMID:40256925
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研究论文 | 本文研究了新发现的远红/橙光吸收蓝藻色素的光异构化动力学，使用飞秒分辨荧光和吸收方法 | 观察到远红和橙光吸收态的活性位点弛豫，并发现了远红吸收态的动态光谱调谐和橙光吸收态的动态斯托克斯位移 | 研究仅限于特定蓝藻色素的动力学，未涉及其他类似蛋白的对比分析 | 阐明蓝藻色素激发态光化学和结构动力学的超快起源 | 远红/橙光吸收蓝藻色素的异构化反应 | 生物物理学 | NA | 飞秒分辨荧光和吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
| 125 | 2025-04-27 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
|
综述 | 本文综述了利用启动子元件增强植物基因编辑的策略与进展 | 强调了组织/器官特异性及诱导型启动子在时空特异性基因编辑中的应用潜力，并探讨了合成生物学与生物信息学工具在启动子设计与优化中的创新应用 | 未涉及具体作物品种中启动子编辑的应用案例验证 | 提升植物基因编辑的精准性、效率与特异性以应对气候变化 | 植物基因编辑中的启动子调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因编辑(GE)、合成启动子设计、生物信息学分析 | NA | 基因组调控元件数据 | NA |
| 126 | 2025-04-25 |
Antibiotic conjugates: Using molecular Trojan Horses to overcome drug resistance
2025-May, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118007
PMID:40268370
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综述 | 本文综述了抗生素偶联物作为克服抗生素耐药性的新策略的研究现状 | 提出利用'特洛伊木马'策略将抗生素与生物活性成分偶联，以增强抗生素对耐药病原体的效果 | 抗生素偶联物的临床转化面临多重障碍 | 开发新型抗菌疗法以应对抗生素耐药性危机 | 抗生素与单克隆抗体(mAbs)、抗菌肽(AMPs)和铁螯合载铁体的偶联物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学和生物信息学 | NA | NA | NA |
| 127 | 2025-04-24 |
Temporal Loss of Genome-Wide and Immunogenetic Diversity in a Near-Extinct Parrot
2025-May, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17746
PMID:40130423
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研究论文 | 研究濒危物种橙腹鹦鹉基因组多样性和免疫遗传多样性的长期丧失 | 利用高质量长读长参考基因组和历史及当代重测序基因组，追踪了该物种长期的基因组侵蚀和免疫遗传多样性下降 | 样本量较小（当代19个，历史16个），且仅针对单一物种进行研究 | 评估濒危物种橙腹鹦鹉的基因组多样性和免疫遗传多样性丧失情况，为保护措施提供依据 | 橙腹鹦鹉（Neophema chrysogaster） | 基因组学 | 禽流感 | 长读长基因组测序，重测序 | NA | 基因组数据 | 当代样本19个，历史样本16个（最早可追溯至1829年） |
| 128 | 2025-04-21 |
Current application and future prospects of CRISPR-Cas in lactic acid Bacteria: A review
2025-May, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.116315
PMID:40253208
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在乳酸菌工程中的当前应用及未来前景 | 探讨了CRISPR-Cas系统在乳酸菌基因组编辑、代谢工程和合成生物学中的革命性应用及其在食品科学中的创新潜力 | 当前基因组编辑工具耗时且劳动密集型，限制了乳酸菌作为发酵食品功能增强剂的潜力开发 | 利用CRISPR-Cas系统推动乳酸菌研究及食品科学创新 | 乳酸菌（LABs） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
| 129 | 2025-04-13 |
Harnessing hyperaccumulator plants to recover technology-critical metals: where are we at?
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20449
PMID:40066815
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review | 本文回顾了植物采矿技术（phytomining）的发展现状，特别是其在镍回收方面的商业化应用，并探讨了其他技术关键金属（如钴、硒和铊）的潜在回收机会 | 文章强调了通过分子机制研究、驯化和农艺发展来改进超富集植物（hyperaccumulators）的新方法，包括定向育种和合成生物学技术 | 文章未提及植物采矿技术在实际应用中可能遇到的具体挑战或限制条件 | 探讨植物采矿技术在回收技术关键金属方面的现状和未来发展潜力 | 超富集植物及其在金属回收中的应用 | 环境生物技术 | NA | 定向育种，合成生物学 | NA | NA | NA |
| 130 | 2025-04-11 |
Expanding the toolkit for ploidy manipulation in Chlamydomonas reinhardtii
2025-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70095
PMID:40116553
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研究论文 | 本文开发了一种在Chlamydomonas reinhardtii中操纵倍性的策略，以研究倍性变化对植物进化的影响 | 利用非干扰性抗生素选择标记诱导C. reinhardtii更高倍性水平，适用于野外分离株，拓宽了可杂交的亲本单倍体菌株的遗传多样性 | 新形成的三倍体和四倍体显示出快速的异倍体化迹象 | 研究倍性变化对植物进化的直接和长期影响 | Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 基因组大小数据 | 北美野外分离株 |