合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 117 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-17 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
|
研究论文 | 通过评估大肠杆菌中近50万个独特gRNA的活性，揭示了Cas9靶向的广泛功能性及gRNA设计规则 | 首次大规模实验评估了所有独特Cas9原型间隔序列，发现93%以上的gRNA具有功能性，并识别出非功能性gRNA的自我相互作用特征，提出了简单设计规则进行排除 | 研究仅针对大肠杆菌K12 MG1655基因组，未验证其他细菌或真核宿主中的通用性 | 解决关于Cas9 gRNA特异性的矛盾报道，为微生物合成生物学提供功能性和非功能性gRNA的全面评估及实验流程 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, NGS | NA | DNA序列 | 近500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | Cas9靶向系统 | 工业生物技术，医药 |
| 2 | 2026-05-20 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
|
研究论文 | 研究合成细菌群落中劳动分工生产紫色杆菌素的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个亚群中，实现了2.5倍的产量提升，并揭示了亚群生长速率和比例对生产效率的影响 | 仅使用大肠杆菌为基础，未探索其他宿主或更复杂的群落结构 | 评估劳动分工策略在合成微生物群落中提高紫色杆菌素生产效率的可行性 | 基于大肠杆菌的合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个共培养和单培养实验条件 | NA | 大肠杆菌 | 代谢途径拆分（VioABE和VioDC亚群） | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-05-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
|
research paper | 开发了一种基于Tn5转座酶的高效全基因组基因激活系统，用于大肠杆菌的功能基因组学研究 | 基于Tn5转座酶构建高效全基因组基因激活突变文库，实现条件性基因激活和高通量筛选 | 未明确说明局限性，但可能涉及插入位点偏好性或激活效率的进一步优化需求 | 开发一种高效的全基因组基因激活工具，用于基因功能解析和菌株优化 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | synthetic biology, functional genomics | NA | Tn5 transposase-based system | NA | DNA sequence data | NA | Tn5 transposase | E. coli | inducible gene activation system with tetracycline-inducible promoter Ptet and kanamycin resistance gene | synthetic biology, industrial biotechnology |
| 4 | 2026-05-20 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
|
研究论文 | 本研究通过敲除恶臭假单胞菌中的oprF或oprI基因，揭示了两种基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次比较了oprF和oprI缺失对恶臭假单胞菌膜囊泡生产的差异效应，并发现通过过表达plsB可以改善膜完整性同时维持囊泡形成 | 研究仅在单一平台菌株KT2440中进行，且未评估这些策略在工业规模下的长期稳定性 | 探究膜囊泡工程在生物技术中的应用潜力，特别是优化蛋白质分泌系统 | 恶臭假单胞菌KT2440中oprF和oprI基因敲除株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除, 蛋白质过表达, 膜囊泡分析 | NA | 实验数据 | 多个突变株和野生型对照的比较实验 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌 KT2440 | 膜囊泡生产与蛋白质分泌系统 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-05-19 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-07-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
|
研究论文 | 通过合成生物学构建胞内c-di-GMP浓度不同的四种地杆菌菌株，揭示c-di-GMP通过调控多种与胞外电子传递相关的基因表达影响细菌电子传递过程 | 首次系统阐明胞内c-di-GMP如何通过调控金属还原地杆菌中多血红素c型细胞色素和胞外毛蛋白PilA-N的基因表达影响完整的胞外电子传递链 | c-di-GMP如何调控这些基因表达的分子机制尚不清楚 | 探究胞内c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的作用及其分子调控机制 | 金属还原地杆菌（Geobacter metallireducens） | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因表达数据 | 三种胞内c-di-GMP水平不同的工程菌株及多种基因敲除突变体 | 合成生物学 | 金属还原地杆菌 | 胞内c-di-GMP浓度调控回路 | 环境修复, 能源 |
| 6 | 2026-05-19 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
|
研究论文 | 本文设计了一种名为EPDA的合成受体，能够识别材料表面的肽配体，实现三维材料中细胞的可逆响应和空间剂量调控 | 开发了新型计算算法PETEI用于筛选单抗体，设计了可逆激活的跨膜受体平台，实现了三维水凝胶中基于肽配体空间分布的细胞激活和失活控制 | NA | 设计能够感知生物材料结合肽配体并介导细胞可逆响应的合成受体系统 | 哺乳动物细胞、硫醇-降冰片烯水凝胶、单抗体受体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 构建了超过2000个候选单抗体并测试了前30个 | NA | 哺乳动物细胞 | EPDA受体对（刺激性或抑制性）；细胞内磷酸化/去磷酸化驱动的蛋白拆分与融合开关 | 生物学研究, 再生医学 |
| 7 | 2026-05-19 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
|
研究论文 | 提出一种基于吉布森等温组装的高效体外组装方法，成功合成高达100千碱基的人类功能性免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 首次实现无痕（无外源序列残留）组装人类复杂高重复区域的IGHV基因片段，并构建30-100 kb大小的细菌人工染色体 | 未提及 | 开发高效、无痕、低成本的体外DNA组装方法，用于合成功能性IGHV基因片段 | 人类功能性免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 合成生物学 | NA | 吉布森等温组装 | NA | DNA序列 | 高达100千碱基大小的IGHV基因片段 | 吉布森组装 | 大肠杆菌 | 细菌人工染色体载体构建IGHV基因片段 | 医学, 合成生物学 |
| 8 | 2026-05-19 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
|
研究论文 | 提出一种基于合成微生物联合体的体内多细胞反馈控制架构，实现基因表达的稳定精准调控 | 通过分布式多细胞反馈环路实现跨细胞群体的分工协作，克服传统单细胞生物分子控制策略在资源竞争和化学反应不兼容方面的局限 | 未明确说明该控制架构在复杂体内环境或长期运行中的稳定性及潜在副作用 | 实现合成微生物联合体中基因表达的稳定精准调控 | 两种大肠杆菌菌株构成的微生物联合体 | 合成生物学 | NA | 基因工程、微生物联合体构建 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 分布式多细胞反馈控制回路 | 生物技术、医药 |
| 9 | 2026-05-19 |
Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00026
PMID:40536055
|
研究论文 | 本研究通过改良cDICE方法生成大小可调的巨型单层囊泡，并优化其尺寸分布 | 系统性地改变腔室旋转时间、角频率和内溶液密度等关键参数以优化GUV尺寸分布，并得到物理模型支持 | NA | 开发一种实用性方法，用于选择囊泡大小，以促进具有生物相关特性的细胞大小隔室的构建 | 巨型单层囊泡 | NA | NA | 改良cDICE方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 10 | 2026-05-19 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
|
研究论文 | 通过随机突变和理性设计，在运动发酵单胞菌中建立了一种可见报告系统，利用色素蛋白eforRed实现表型筛选和定量分析 | 首次在非模式乙醇生产革兰阴性菌中建立基于色素蛋白的可见报告系统，并通过随机易错PCR和理性设计增强其光谱特性，特别是双突变K201H-T24V能同时提高内在荧光和蛋白表达水平 | 未明确讨论该报告系统在复杂代谢工程应用中的稳定性和通用性，且可能对强启动子依赖性较强 | 在运动发酵单胞菌中建立可见报告基因系统，以促进非模式微生物的合成生物学和生物技术应用 | 运动发酵单胞菌（Zymomonas mobilis）及色素蛋白eforRed | 合成生物学 | NA | 随机易错PCR、蛋白质理性设计 | NA | 荧光强度数据、蛋白表达水平数据 | 涉及多个突变体，但未给出具体样本数量 | 随机易错PCR、蛋白质理性设计 | 运动发酵单胞菌 | 可见报告系统（含强启动子P-4S或P和突变eforRed色素蛋白） | 工业生物技术、合成生物学 |
| 11 | 2026-04-28 |
The convergence of AI and synthetic biology: the looming deluge
2025-Jul-01, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00021-1
PMID:42032179
|
评论 | 探讨人工智能与合成生物学融合带来的机遇与风险，并提出监管策略 | 首次综合性地分析AI驱动合成生物学在医学、农业和可持续发展领域的创新潜力，同时系统性地评估双重用途风险、治理缺口和伦理困境 | 未提供具体实验数据或案例研究，分析较为宏观，缺乏实证支持 | 探讨AI与合成生物学融合如何加速生物工程流程，并识别相关风险与治理需求 | AI驱动合成生物学的应用场景及治理框架 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 可持续性 |
| 12 | 2026-04-21 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
|
综述 | 本文系统总结了铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然性质潜力及关键修饰策略，以增强其功能，并讨论了其在生物医学领域的多样化应用 | 通过化学修饰、基因工程和仿生矿化等策略，克服天然铁蛋白的局限性，扩展其功能范围，特别是在精准医学、神经退行性疾病治疗和生物催化方面的应用潜力 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化方面的挑战 | 优化铁蛋白纳米颗粒的修饰策略，提高纳米递送系统的稳定性和靶向效率，并整合人工智能和合成生物学等新技术，构建高效、低毒、多功能的纳米递送系统 | 铁蛋白纳米颗粒及其修饰后的衍生物 | NA | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-03-02 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
|
综述 | 本文探讨了细菌疗法作为低成本替代方案，以应对癌症治疗中日益增长的经济负担 | 结合合成生物学和人工智能技术，开发下一代毒性更低、成本更低的细菌免疫疗法 | NA | 解决癌症治疗中的经济可及性问题，降低全球医疗成本 | 细菌免疫疗法及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学，人工智能 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 14 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
|
研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 15 | 2026-01-19 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的高效自复制DNA折纸二聚体系统，用于研究达尔文进化并应用于纳米技术 | 使用热稳定T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤，实现更快的循环时间和高达200万倍的扩增效率，并引入竞争机制以模拟达尔文式进化 | 未明确提及系统在复杂生物环境中的稳定性或长期演化潜力 | 研究人工自复制系统的竞争与灭绝机制，并探索其在生物相容性应用中的潜力 | DNA折纸二聚体自复制系统 | 合成生物学 | NA | 酶促连接（使用T4 DNA连接酶），DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 自复制DNA折纸二聚体系统，可结合其他酶如RNA聚合酶实现反馈调节 | 合成生物学，智能材料 |
| 16 | 2026-01-15 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
|
研究论文 | 本研究开发了一种群体感应控制的I型CRISPRi工具包，用于动态调控代谢通量，并在枯草芽孢杆菌中成功应用于D-泛酸和核黄素的生物合成 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰技术整合，创建了可响应细胞密度的动态基因调控工具包，并通过优化关键组件显著提升了调控效率 | 未明确说明该工具包在其他宿主微生物中的普适性，且大规模发酵应用可能面临工程菌株稳定性挑战 | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、群体感应系统、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应控制的基因调控回路，包含PhrQ/RapQ信号系统与CRISPRi的整合设计 | 工业生物技术 |
| 17 | 2026-01-05 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
|
综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展，探讨其在精准医疗和微创治疗领域的应用前景 | 将纳米工程、合成生物学与智能计算相结合，推动静态结构向能动态导航胃肠环境的智能代理发展，实现分子水平的智能微创手术 | 面临自主性控制、脱靶效应、伦理法律框架等重大挑战，临床转化仍需跨学科协作 | 探讨纳米机器人技术在胃肠外科精准医疗和微创治疗中的应用与发展路径 | 手术纳米机器人及其在胃肠环境中的应用 | NA | NA | 纳米工程、合成生物学、智能计算 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 18 | 2026-01-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
|
研究论文 | 通过流体动力学模拟和单分子追踪实验，研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学行为 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分，可诱导并稳定单个脂筏，且聚合物吸附物可作为膜异质性的生物传感器 | 研究基于简化模型和实验条件，实际生物膜环境更复杂，需进一步验证 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术和细胞过程中的作用 | 线性聚合物在二元脂质膜上的吸附与扩散行为 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟、单分子追踪实验 | Saffman-Delbrück扩散模型、Zimm模型、Stokes-Einstein模型 | 模拟数据、实验追踪数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物传感、治疗、合成生物学 |
| 19 | 2025-12-19 |
Opto-p53: A light-controllable activation of p53 signaling pathway
2025-Jul-04, Cell structure and function
IF:2.0Q4
DOI:10.1247/csf.25017
PMID:40500178
|
研究论文 | 本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53，用于通过光控制p53信号通路的激活 | 首次将光诱导二聚化系统与p53蛋白片段结合，创建了可光控激活的内源性转录因子工具 | 未在动物模型中进行验证，且光控效率可能受细胞类型和表达水平影响 | 开发选择性激活p53信号通路的实验系统，以解析其在细胞过程中的复杂功能 | p53蛋白及其信号通路在细胞应激反应中的作用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、光诱导二聚化系统 | NA | 细胞实验数据 | NA | 光诱导二聚化系统 | 哺乳动物细胞 | 通过光控二聚化系统重构p53蛋白N端和C端片段，形成光控转录激活开关 | 医学 |
| 20 | 2025-12-11 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
|
综述 | 本文综述了微生物生产类胡萝卜素torulene的现状、策略、生物特性及其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 系统总结了通过上游和下游工艺提高torulene产量的策略，并探讨了其在多个工业领域的应用潜力 | torulene的研究仍有限，其商业化潜力尚未充分开发，微生物生产面临挑战 | 总结torulene的微生物生产策略、生物特性及潜在应用，推动其商业化发展 | 红酵母生产的类胡萝卜素torulene | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 红酵母（如Rhodotorula和Sporobolomyces） | NA | 食品,化妆品,制药 |