合成生物学相关文章
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当前共找到 120 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-01-19 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
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研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的高效自复制DNA折纸二聚体系统，用于研究达尔文进化并应用于纳米技术 | 使用热稳定T4 DNA连接酶替代化学光交联步骤，实现更快的循环时间和高达200万倍的扩增效率，并引入竞争机制以模拟达尔文式进化 | 未明确提及系统在复杂生物环境中的稳定性或长期演化潜力 | 研究人工自复制系统的竞争与灭绝机制，并探索其在生物相容性应用中的潜力 | DNA折纸二聚体自复制系统 | 合成生物学 | NA | 酶促连接（使用T4 DNA连接酶），DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 自复制DNA折纸二聚体系统，可结合其他酶如RNA聚合酶实现反馈调节 | 合成生物学，智能材料 |
| 2 | 2026-01-15 |
A quorum sensing-controlled type I CRISPRi toolkit for dynamically regulating metabolic flux
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf693
PMID:40682826
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研究论文 | 本研究开发了一种群体感应控制的I型CRISPRi工具包，用于动态调控代谢通量，并在枯草芽孢杆菌中成功应用于D-泛酸和核黄素的生物合成 | 首次将群体感应系统与I型CRISPR干扰技术整合，创建了可响应细胞密度的动态基因调控工具包，并通过优化关键组件显著提升了调控效率 | 未明确说明该工具包在其他宿主微生物中的普适性，且大规模发酵应用可能面临工程菌株稳定性挑战 | 开发动态代谢调控工具以促进可持续生物制造 | 枯草芽孢杆菌的代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、群体感应系统、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应控制的基因调控回路，包含PhrQ/RapQ信号系统与CRISPRi的整合设计 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-01-05 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
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综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展，探讨其在精准医疗和微创治疗领域的应用前景 | 将纳米工程、合成生物学与智能计算相结合，推动静态结构向能动态导航胃肠环境的智能代理发展，实现分子水平的智能微创手术 | 面临自主性控制、脱靶效应、伦理法律框架等重大挑战，临床转化仍需跨学科协作 | 探讨纳米机器人技术在胃肠外科精准医疗和微创治疗中的应用与发展路径 | 手术纳米机器人及其在胃肠环境中的应用 | NA | NA | 纳米工程、合成生物学、智能计算 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-01-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 通过流体动力学模拟和单分子追踪实验，研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学行为 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分，可诱导并稳定单个脂筏，且聚合物吸附物可作为膜异质性的生物传感器 | 研究基于简化模型和实验条件，实际生物膜环境更复杂，需进一步验证 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术和细胞过程中的作用 | 线性聚合物在二元脂质膜上的吸附与扩散行为 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟、单分子追踪实验 | Saffman-Delbrück扩散模型、Zimm模型、Stokes-Einstein模型 | 模拟数据、实验追踪数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物传感、治疗、合成生物学 |
| 5 | 2025-12-19 |
Opto-p53: A light-controllable activation of p53 signaling pathway
2025-Jul-04, Cell structure and function
IF:2.0Q4
DOI:10.1247/csf.25017
PMID:40500178
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研究论文 | 本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53，用于通过光控制p53信号通路的激活 | 首次将光诱导二聚化系统与p53蛋白片段结合，创建了可光控激活的内源性转录因子工具 | 未在动物模型中进行验证，且光控效率可能受细胞类型和表达水平影响 | 开发选择性激活p53信号通路的实验系统，以解析其在细胞过程中的复杂功能 | p53蛋白及其信号通路在细胞应激反应中的作用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、光诱导二聚化系统 | NA | 细胞实验数据 | NA | 光诱导二聚化系统 | 哺乳动物细胞 | 通过光控二聚化系统重构p53蛋白N端和C端片段，形成光控转录激活开关 | 医学 |
| 6 | 2025-12-11 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
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综述 | 本文综述了微生物生产类胡萝卜素torulene的现状、策略、生物特性及其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 系统总结了通过上游和下游工艺提高torulene产量的策略，并探讨了其在多个工业领域的应用潜力 | torulene的研究仍有限，其商业化潜力尚未充分开发，微生物生产面临挑战 | 总结torulene的微生物生产策略、生物特性及潜在应用，推动其商业化发展 | 红酵母生产的类胡萝卜素torulene | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 红酵母（如Rhodotorula和Sporobolomyces） | NA | 食品,化妆品,制药 |
| 7 | 2025-12-09 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2025-Jul-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了将非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统转化为理性设计平台的最新进展 | 整合基因组挖掘、高通量筛选、合成生物学工具和计算建模（包括深度学习方法），以加速定制天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 8 | 2025-12-06 |
The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies
2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01795-9
PMID:40634759
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综述 | 本文综述了急性髓系白血病（AML）免疫治疗的机制、挑战与未来方向，重点探讨了免疫检查点抑制剂和疫苗策略 | 系统解码AML的免疫逃逸途径，并整合检查点阻断、疫苗及联合策略等新兴免疫疗法，提出通过单细胞基因组学、人工智能和合成生物学识别新靶点及改善患者分层 | 面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性（如贫血、细胞因子释放综合征）、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战 | 评估AML免疫治疗的机制、挑战与未来方向，旨在改善临床疗效 | 急性髓系白血病（AML）及其免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2025-12-05 |
Modeling of Phage-Mediated CRISPRi System to Inhibit Antibiotic Resistances in Bacteria
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC58623.2025.11253443
PMID:41337296
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研究论文 | 本文提出了一种基于工程化噬菌体递送CRISPR干扰系统以抑制细菌抗生素耐药性的创新策略，并开发了数学模型来模拟其动态过程 | 利用工程化噬菌体递送CRISPRi系统来精确沉默耐药基因，并结合数学模型评估系统性能及长期疗效潜力 | NA | 开发合成生物学方法以对抗抗菌素耐药性 | 抗生素耐药性病原体 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR干扰系统 | 数学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | CRISPRi递送系统 | 医学 |
| 10 | 2025-10-24 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究开发了一种基于GP1糖蛋白PPSPX基序和pH敏感内含肽的蛋白质锚定与可控释放系统 | 发现PPSPX基序是蛋白质锚定微藻细胞壁的关键信号，并首次将pH敏感内含肽用于可控释放锚定蛋白 | NA | 开发蛋白质空间定位和可控释放的技术平台 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学、Western blot分析 | NA | 荧光数据、蛋白质印迹数据 | NA | 内含肽介导的蛋白质融合 | 微藻 | 基于GP1 PPSPX基序的蛋白质锚定系统和pH敏感内含肽介导的释放系统 | 靶向药物递送,环境生物传感,生物催化剂部署 |
| 11 | 2025-10-05 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 本文提出DySEEP方法，通过动态通量平衡分析和经济指标评估工业生物产品的生产潜力，并以PHB生产为案例进行研究 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标评估的新型方法DySEEP，用于系统评估生物产品生产的经济潜力 | 由于DFBA模拟的性质，无法预测某些关键聚合物性质 | 评估不同微生物生产PHB的经济潜力，优化生物塑料生产工艺 | 重组大肠杆菌、重组谷氨酸棒杆菌和重组罗尔斯通氏菌的PHB生产能力 | 代谢工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | 代谢网络模型 | 代谢通量数据 | 三种重组微生物的模拟分析 | CRISPR-Cas9, 基因敲除, 合成生物学 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌, 罗尔斯通氏菌 | 遗传拨动开关, NADPH依赖的PHB合成途径, 代谢途径调控 | 工业生物技术, 环境 |
| 12 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Heterologous Protein Expression and Natural Product Synthesis by Aspergillus
2025-Jul-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11070534
PMID:40985424
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综述 | 综述曲霉属真菌在异源蛋白表达和天然产物合成领域的最新研究进展 | 系统总结了CRISPR-Cas9在曲霉遗传修饰中的应用现状，并重点探讨了其在萜类化合物异源生物合成中的具体应用 | NA | 总结曲霉作为异源表达平台在蛋白质和天然产物合成中的研究进展 | 曲霉属真菌（包括黑曲霉、米曲霉等） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 曲霉（包括黑曲霉、米曲霉等） | 异源蛋白表达系统、天然产物生物合成途径 | 工业生物技术,医药 |
| 13 | 2025-10-05 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 开发用于蛋白质结构预测和设计工具的容器化解决方案，以解决高计算需求和部署难题 | 开发了针对多种计算架构优化的容器化解决方案，并创建了OmniFold包装平台实现多工具并行运行和自动质量报告生成 | 未提及具体性能提升的量化数据或与其他部署方法的直接比较 | 解决蛋白质结构预测和设计工具的高计算需求和部署困难问题 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion等蛋白质结构预测和设计工具 | 计算生物学 | NA | 容器化技术、GPU优化计算 | 深度学习模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、疾病治疗 |
| 14 | 2025-10-05 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 开发了一种能够检测和治疗肠道炎症的微生物生物传感器 | 首次开发了针对临床验证生物标志物钙卫蛋白的合成生物传感器，兼具诊断记录和治疗功能 | NA | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物系统 | 肠道炎症生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症疾病 | 合成生物学技术 | NA | 生物分子数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 锌摄取调节因子(Zur)控制启动子与记忆电路耦合的生物传感器，结合抗炎细胞因子IL10产生系统 | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
Advancing fungal phylogenetics: integrating modern sequencing, dark taxa discovery, and machine learning
2025-Jul-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04392-2
PMID:40643763
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综述 | 本文综述了现代分子技术如何革新真菌系统发育学研究，重点关注DNA指纹图谱、新一代测序和三代测序技术在物种鉴定、系统发育重建和疾病管理中的应用 | 整合现代测序技术、暗分类群发现和机器学习方法，提出解决真菌分类难题和抗药性预测的多组学综合研究框架 | 在解决基因组内变异、协调基因树不一致性以及标准化大规模真菌群体研究流程方面仍存在挑战 | 推进真菌系统发育学研究，提高真菌疾病诊断和管理能力 | 真菌多样性、进化关系和致病机制 | 生物信息学 | 真菌感染疾病 | 新一代测序(NGS)、三代测序(TGS)、DNA指纹图谱、多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | 机器学习算法 | 基因组数据、分子标记数据 | NA | CRISPR、合成生物学平台 | NA | NA | 农业、医疗、环境 |
| 16 | 2025-10-05 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2025-Jul-25, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
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研究论文 | 通过分析人类和小鼠的核糖体分析数据集，提出翻译效率协变概念并揭示跨细胞类型的协调翻译模式 | 首次提出翻译效率协变概念，发现不依赖于RNA或蛋白质共表达的基因功能协调机制 | NA | 探索跨细胞类型的翻译协调模式及其在基因调控中的作用 | 人类117种和小鼠94种组织与细胞系的3,819个核糖体分析数据集 | 生物信息学 | NA | 核糖体分析 | NA | 基因组学数据 | 3,819个数据集（涵盖人类117种、小鼠94种组织与细胞系） | NA | 人类, 小鼠 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-Jul, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本研究通过化学探针分析揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要关注特定核糖开关，其机制在其他类型核糖开关中的普适性仍需验证 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探针分析、荧光淬灭检测 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控电路、转录终止/抗终止机制 | 医学, 合成生物学 |
| 18 | 2025-10-05 |
Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots
2025-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01133-5
PMID:40097832
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研究论文 | 开发了一种在活细胞内合成生物相容性量子点的新方法 | 通过精确时空序列耦合细胞内代谢途径实现活细胞合成量子点，并建立仿细胞内环境的无细胞合成系统 | NA | 开发生物相容性量子点的合成方法 | 量子点 | 合成生物学 | NA | 活细胞合成，无细胞合成系统 | NA | NA | 酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞、MDCK细胞 | 代谢工程 | 酿酒酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7细胞、MDCK细胞 | 代谢途径耦合 | 医学 |
| 19 | 2025-10-05 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
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综述 | 本文系统综述了糖修饰的异源核酸(XNA)的结构分类、构象特性及其在生物技术和合成生物学中的应用前景 | 提出了XNA字母表的概念，系统分类了能与天然核酸相互作用和正交的两类XNA系统，阐明了糖组分对XNA构象空间和杂交特性的决定性作用 | NA | 总结糖修饰XNA系统的构象行为原理及其在合成遗传学、核酸治疗等领域的应用潜力 | 糖修饰的异源核酸(XNA)系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学诊断, 纳米技术 |
| 20 | 2025-10-05 |
A Strictly Inducible and Orthogonal Dre-rox System for Precise and Markerless Genome Editing in Bacillus subtilis
2025-Jul-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2505.05006
PMID:40730489
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研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中建立了一种严格诱导且正交的Dre-rox系统，用于精确无标记基因组编辑 | 开发了茶碱诱导型核糖开关严格控制Dre表达以减少渗漏重组，首次证明Dre与Cre在各自识别位点上无串扰正交工作，支持单次诱导同步多位点切除 | NA | 扩展微生物基因组工程工具包，开发与Cre性能相当且能正交功能的位点特异性重组酶系统 | 枯草芽孢杆菌基因组编辑系统 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组，基因组编辑 | NA | NA | NA | Dre-rox系统，Cre-lox系统 | 枯草芽孢杆菌 | 茶碱诱导型核糖开关控制的Dre表达系统，正交重组系统 | 工业生物技术 |