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当前共找到 117 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-18 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究在微藻中开发了一种利用GP1糖蛋白的PPSPX基序将蛋白质锚定在细胞壁上，并通过pH敏感内含肽实现可控释放的双系统 | 首次鉴定出GP1糖蛋白中的PPSPX基序是细胞壁锚定的关键信号，并创新性地结合pH敏感内含肽实现了蛋白质的时空可控释放 | 摘要中未明确说明该系统的局限性 | 开发一种在微藻中实现蛋白质细胞壁锚定和可控释放的双系统，以优化蛋白质定位和环境触发释放 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统，包括GP1糖蛋白、PHL7塑料降解酶、mCherry荧光蛋白和RecA来源的pH敏感内含肽 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学分析、Western blot分析 | NA | 蛋白质表达与释放数据、荧光数据、Western blot图像 | NA | 内含肽介导的蛋白质剪接 | 微藻 | GP1-PPSPX锚定系统与pH敏感内含肽切割释放系统组合 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-02 |
Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores
2025-07-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984
PMID:40403226
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综述 | 本文综述了通过单细胞纳米封装技术合成人工细胞-壳孢子的最新进展，重点介绍了有机、杂化及无机材料在保护细胞和增强功能方面的应用。 | 创新点在于系统分类和总结了单细胞纳米封装技术中不同材料类型（有机、杂化、无机）的应用，并强调了纳米壳在赋予细胞外源表型特性方面的多功能作用，为定制化人工孢子的设计提供了新方向。 | 本文未提及局限性，但可能因综述性质而缺乏对具体技术的深入实验验证。 | 旨在总结单细胞纳米封装技术的最新进展，并提出未来研究方向，以实现细胞内和周细胞水平的精细化学调控，构建定制化人工孢子。 | 人工细胞-壳结构，即通过化学合成方法制备的纳米封装细胞。 | 合成生物学、材料科学、生物医学工程 | NA | 单细胞纳米封装技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物化学、材料科学、生物医学工程 |
| 3 | 2026-08-27 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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研究论文 | 提出一种计算工具，通过机器学习模型预测ColE1样质粒拷贝数，强调启动子强度和RNA折叠动力学在复制起点中的作用 | 首次实现从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件解决方案，突破现有模型缺失的局限 | 未明确提及具体限制，但模型依赖于从复制起点提取的特征，可能对非ColE1样质粒适用性有限 | 简化质粒拷贝数设计，改进合成生物学和工业应用中的质粒工程流程 | ColE1样质粒的复制起点序列及其拷贝数 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | 序列数据 | 未提供具体样本数量 | NA | NA | 质粒复制起点 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-08-25 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-07-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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研究论文 | 本文应用迭代深度学习设计合成增强子，通过结合实验验证和模型再优化，实现对两种人类细胞系的细胞类型特异性表达。 | 通过迭代深度学习结合实验数据，设计出具有强差异活性的合成增强子，并发现短至50bp的增强子仍能维持特异性，且嵌入的转录因子结合位点基序频率更高、词汇更选择性。 | 文章未明确讨论泛化性，依赖特定细胞系初步训练，可能限制在其他细胞类型或体内应用的推广。 | 解决合成生物学中如何将基因表达靶向特定细胞类型的问题，设计具有高度特异性的合成增强子。 | 人类细胞系中的合成增强子序列。 | 深度学习、合成生物学 | 无 | NGS（染色质可及性测序等）、深度学习模型 | 深度学习模型（如CNN） | DNA序列数据、染色质可及性数据、增强子活性数据 | 两种人类细胞系（未具体说明数量） | 无 | 人类细胞系 | 合成增强子 | 医学 |
| 5 | 2026-08-23 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-07-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
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研究论文 | 本文介绍了基于非离子表面活性剂的巨型单层囊泡（GUNs）作为合成细胞模型的平台，利用液滴微流控生成单分散的Span 80基GUNs，展示其膜流动性和选择性通透性，并通过诱导相分离和代谢级联反应验证功能。 | 提出巨型单层囊泡（GUNs）作为合成细胞新平台，具有高膜流动性、固有选择性通透性及成本效益，无需嵌入转运蛋白即可实现小分子和质子通透，并成功重建糖酵解-线粒体级联驱动肌动蛋白聚合。 | 未在摘要中明确提及。 | 开发一种稳健且成本效益高的合成细胞模型，以克服现有囊泡（如脂质体、聚合物囊泡和脂肪酸囊泡）的局限性，并展示其功能性应用。 | 基于Span 80的非离子表面活性剂巨型单层囊泡（GUNs）。 | 合成生物学 | NA | 液滴微流控 | NA | NA | NA | 液滴微流控 | NA | pH响应性液-液相分离和糖酵解-线粒体级联反应 | 合成生物学、药物递送 |
| 6 | 2026-08-19 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-07-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究合成了由L-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的新型脂聚合物，通过将聚脯氨酸链锚定到膜上，实现了可逆的相分离和微域形成，从而调控膜通透性和分子释放。 | 首次将聚脯氨酸脂聚合物锚定在脂质膜上，实现温度调控的微域形成和分散，动态控制膜组成和通透性，并展示其在药物递送和合成生物学中的潜力。 | 摘要未提及具体局限性，如微域形成的效率、长期稳定性或体内应用可行性。 | 开发一种能够模拟蛋白质行为的膜锚定聚脯氨酸系统，动态调节脂质囊泡的膜微域形成和通透性，用于药物递送和合成生物学。 | 脂质囊泡及其膜上锚定的聚脯氨酸链。 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜、荧光恢复后光漂白（FRAP） | NA | 图像数据（显微镜图像） | 未指明样本数量，涉及不同膜组成和多种负载分子（合成聚合物和酶）的脂质囊泡。 | NA | NA | 温度响应性微域形成系统，通过聚脯氨酸链的相分离实现膜通透性调控。 | 药物递送、合成生物学 |
| 7 | 2026-08-12 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-07, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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研究论文 | 该研究开发了一种简单的二肽，可自凝聚成微米级液滴或形成纤维状组装体，并具有酯酶模拟活性，作为酶模拟物应用。 | 设计了一种仅由疏水残基和极性组氨酸残基组成的二肽，实现了自凝聚成液滴和纤维形成，无需多种大分子组分，为最小化酶模拟物提供新策略。 | 未明确说明，摘要中未提及。 | 开发基于二肽的凝聚液滴和纤维，作为酶模拟物，应用于酶学和合成生物学。 | 二肽及其自组装结构（液滴和纤维）。 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 酶学, 合成生物学 |
| 8 | 2026-07-23 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-07-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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研究论文 | 探讨基于细菌的免疫疗法作为癌症治疗的经济替代方案，以降低全球医疗成本 | 结合合成生物学与人工智能技术，开发低成本（每剂<10美元）、无需冷链的细菌疗法，实现相比细胞疗法超过30000倍的成本节约 | 未具体说明细菌疗法的临床有效性和安全性数据，以及大规模生产的可行性挑战 | 解决癌症治疗中昂贵免疫疗法的可及性问题，提出细菌免疫疗法作为经济可行替代方案 | 癌症患者群体及全球癌症护理系统 | 机器学习 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌免疫治疗回路 | 医学，工业生物技术 |
| 9 | 2026-07-14 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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研究论文 | 在毕赤酵母中设计和构建光调控基因转录与蛋白质翻译系统 | 首次在毕赤酵母中构建了光调控的基因转录和蛋白质翻译双系统，通过光敏传感器和稀有密码子刹车设计实现精确调控 | 光调控系统的性能优化可能依赖于特定配置（如LRE位置和拷贝数），且可能未在复杂蛋白表达场景中验证 | 开发具有优异表达能力和光敏感性的光调控基因转录与蛋白质翻译系统，以优化毕赤酵母在生物技术和合成生物学中的应用 | 光调控基因转录和蛋白质翻译系统 | 合成生物学 | NA | 光调控基因表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 光敏传感器（WC-1）、顺式元件（LRE）设计、稀有密码子刹车 | 毕赤酵母（P. pastoris） | 光诱导启动子、光抑制启动子、光抑制翻译系统（稀有密码子刹车） | 生物技术、合成生物学 |
| 10 | 2026-07-07 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-07-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
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研究论文 | 开发CRISPR/dCas介导的反沉默方法，通过将dCas蛋白重新编程为异源沉默因子的拮抗剂，实现对放线菌中Lsr2样沉默蛋白靶基因的精确上调 | 首次利用核酸酶缺陷的dCas酶（dCas9和dCas12a）对抗Lsr2样异源沉默蛋白，无需启动子序列修饰即可实现反沉默，具有高特异性和低脱靶效应 | 不同靶位置和链上存在CRISPR干扰效应的强度差异，可能需要进一步优化gRNA设计以平衡沉默与干扰 | 开发一种不依赖启动子工程的反沉默策略，精确上调异源沉默蛋白靶向的基因表达 | 天蓝色链霉菌中的CgpS沉默蛋白和结核分枝杆菌中的Lsr2沉默蛋白及其靶基因簇 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas介导的反沉默（CRISPRcosi）、全基因组转录组分析 | NA | RNA-seq数据 | 多个天蓝色链霉菌和结核分枝杆菌菌株 | CRISPR-dCas9, CRISPR-dCas12a | 天蓝色链霉菌, 结核分枝杆菌 | CRISPR/dCas介导的反沉默系统（CRISPRcosi），通过gRNA/dCasDNA结合靶向沉默蛋白的成核位点 | 生物技术, 合成生物学 |
| 11 | 2026-07-03 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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研究论文 | 通过挖掘乌头转录组，发现多功能P450酶驱动二萜类化合物结构多样化和功能分化，实现生物活性化合物tripterifordin和隐存atiserenoids的合成 | 首次揭示多功能P450酶催化二萜骨架七个不同位点的氧化，并发现关键残基调控P450活性和产物谱，同时发现tripterifordin在乌头中的趋同进化合成 | 未进一步探索下游二萜途径的详细机制，且体内功能验证可能受限于异源表达系统 | 研究细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构多样化和功能分化 | 乌头（Aconitum carmichaelii 和 Aconitum coreanum）中的二萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 转录组测序,功能验证,蛋白质分析,定点诱变,组合生物合成 | NA | 序列数据 | 两个乌头物种的转录组样本 | NA | NA | 组合生物合成途径，用于生产tripterifordin、guan-fu二萜类化合物A和14种新atiserenoids | 医药 |
| 12 | 2026-06-26 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 通过体外重建和突变分析，揭示了两种聚酮链通过非经典缩合结构域融合形成马来环丙醇活性丁烯内酯核心的机制 | 首次阐明硫模板介导的聚酮链头对头融合及还原环化构建丁烯内酯的非常规生物合成途径，扩展了合成生物学工具箱 | 未明确提及该反应在体内的效率或对病原菌整体毒力的定量影响 | 揭示马来环丙醇中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 类鼻疽伯克霍尔德菌群的毒力因子马来环丙醇及其生物合成酶系 | 合成生物学 | 类鼻疽伯克霍尔德菌感染 | 化学合成、体外重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（用于突变分析） | NA | 由PKS-NRPS杂合合成酶催化的聚酮链融合及还原环化丁烯内酯形成途径 | 医学（抗毒力策略开发） |
| 13 | 2026-06-26 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 通过光响应DNA液滴动态相分离控制酶级联途径 | 提出利用光响应DNA液滴通过液-液相分离选择性隔离酶，实现紫外光和可见光调控酶级联反应，无需改变总酶浓度 | 未提及在复杂生物环境中的稳定性和长期应用效果 | 开发光响应DNA液滴用于精确调控酶级联途径 | 光响应DNA液滴和酶级联系统（GOx、HRP、CAT和GAO、MPO、CAT） | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 光响应DNA液滴（Y-motif序列与偶氮苯修饰的粘性末端）和酶级联途径 | 合成生物学, 微反应器设计, 生物工程 |
| 14 | 2026-06-17 |
When good guides go bad: empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2025-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.651106
PMID:40475487
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研究论文 | 通过评估大肠杆菌中近50万个独特gRNA的活性，揭示了Cas9靶向的广泛功能性及gRNA设计规则 | 首次大规模实验评估了所有独特Cas9原型间隔序列，发现93%以上的gRNA具有功能性，并识别出非功能性gRNA的自我相互作用特征，提出了简单设计规则进行排除 | 研究仅针对大肠杆菌K12 MG1655基因组，未验证其他细菌或真核宿主中的通用性 | 解决关于Cas9 gRNA特异性的矛盾报道，为微生物合成生物学提供功能性和非功能性gRNA的全面评估及实验流程 | 大肠杆菌K12 MG1655基因组中的独特gRNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, NGS | NA | DNA序列 | 近500,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | Cas9靶向系统 | 工业生物技术，医药 |
| 15 | 2026-05-20 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 研究合成细菌群落中劳动分工生产紫色杆菌素的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个亚群中，实现了2.5倍的产量提升，并揭示了亚群生长速率和比例对生产效率的影响 | 仅使用大肠杆菌为基础，未探索其他宿主或更复杂的群落结构 | 评估劳动分工策略在合成微生物群落中提高紫色杆菌素生产效率的可行性 | 基于大肠杆菌的合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 产量数据 | 多个共培养和单培养实验条件 | NA | 大肠杆菌 | 代谢途径拆分（VioABE和VioDC亚群） | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-05-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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research paper | 开发了一种基于Tn5转座酶的高效全基因组基因激活系统，用于大肠杆菌的功能基因组学研究 | 基于Tn5转座酶构建高效全基因组基因激活突变文库，实现条件性基因激活和高通量筛选 | 未明确说明局限性，但可能涉及插入位点偏好性或激活效率的进一步优化需求 | 开发一种高效的全基因组基因激活工具，用于基因功能解析和菌株优化 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | synthetic biology, functional genomics | NA | Tn5 transposase-based system | NA | DNA sequence data | NA | Tn5 transposase | E. coli | inducible gene activation system with tetracycline-inducible promoter Ptet and kanamycin resistance gene | synthetic biology, industrial biotechnology |
| 17 | 2026-05-20 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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研究论文 | 本研究通过敲除恶臭假单胞菌中的oprF或oprI基因，揭示了两种基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次比较了oprF和oprI缺失对恶臭假单胞菌膜囊泡生产的差异效应，并发现通过过表达plsB可以改善膜完整性同时维持囊泡形成 | 研究仅在单一平台菌株KT2440中进行，且未评估这些策略在工业规模下的长期稳定性 | 探究膜囊泡工程在生物技术中的应用潜力，特别是优化蛋白质分泌系统 | 恶臭假单胞菌KT2440中oprF和oprI基因敲除株 | 合成生物学 | NA | 基因敲除, 蛋白质过表达, 膜囊泡分析 | NA | 实验数据 | 多个突变株和野生型对照的比较实验 | CRISPR-Cas9 | 恶臭假单胞菌 KT2440 | 膜囊泡生产与蛋白质分泌系统 | 工业生物技术 |
| 18 | 2026-05-19 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-07-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
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研究论文 | 通过合成生物学构建胞内c-di-GMP浓度不同的四种地杆菌菌株，揭示c-di-GMP通过调控多种与胞外电子传递相关的基因表达影响细菌电子传递过程 | 首次系统阐明胞内c-di-GMP如何通过调控金属还原地杆菌中多血红素c型细胞色素和胞外毛蛋白PilA-N的基因表达影响完整的胞外电子传递链 | c-di-GMP如何调控这些基因表达的分子机制尚不清楚 | 探究胞内c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的作用及其分子调控机制 | 金属还原地杆菌（Geobacter metallireducens） | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因表达数据 | 三种胞内c-di-GMP水平不同的工程菌株及多种基因敲除突变体 | 合成生物学 | 金属还原地杆菌 | 胞内c-di-GMP浓度调控回路 | 环境修复, 能源 |
| 19 | 2026-05-19 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 本文设计了一种名为EPDA的合成受体，能够识别材料表面的肽配体，实现三维材料中细胞的可逆响应和空间剂量调控 | 开发了新型计算算法PETEI用于筛选单抗体，设计了可逆激活的跨膜受体平台，实现了三维水凝胶中基于肽配体空间分布的细胞激活和失活控制 | NA | 设计能够感知生物材料结合肽配体并介导细胞可逆响应的合成受体系统 | 哺乳动物细胞、硫醇-降冰片烯水凝胶、单抗体受体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 构建了超过2000个候选单抗体并测试了前30个 | NA | 哺乳动物细胞 | EPDA受体对（刺激性或抑制性）；细胞内磷酸化/去磷酸化驱动的蛋白拆分与融合开关 | 生物学研究, 再生医学 |
| 20 | 2026-05-19 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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研究论文 | 提出一种基于吉布森等温组装的高效体外组装方法，成功合成高达100千碱基的人类功能性免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 首次实现无痕（无外源序列残留）组装人类复杂高重复区域的IGHV基因片段，并构建30-100 kb大小的细菌人工染色体 | 未提及 | 开发高效、无痕、低成本的体外DNA组装方法，用于合成功能性IGHV基因片段 | 人类功能性免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 合成生物学 | NA | 吉布森等温组装 | NA | DNA序列 | 高达100千碱基大小的IGHV基因片段 | 吉布森组装 | 大肠杆菌 | 细菌人工染色体载体构建IGHV基因片段 | 医学, 合成生物学 |