合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-07-11	Research progress in high-throughput DNA synthesis and its applications 2025-Jul-10, Journal of materials chemistry. B DOI:10.1039/d5tb00869g PMID:40530447	综述	本文综述了高通量DNA合成技术的研究进展及其在基因组学和合成生物学中的应用	系统性地分类并比较了不同代际的高通量DNA合成技术，探讨了酶法合成技术的优势及潜在应用	未涉及具体实验数据或案例研究，主要基于文献综述	探讨高通量DNA合成技术的发展现状、优势、局限性及未来方向	高通量DNA合成技术	合成生物学	NA	光刻法、喷墨法、电化学法、热控合成技术、酶法合成	NA	NA	NA
2	2025-07-11	Magnetic metal-organic frameworks as an antisense delivery platform and their performance in a cell-free protein expression system 2025-Jul-10, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/d5nr00788g PMID:40552643	研究论文	本研究探讨了磁性金属有机框架（nMOF）作为反义传递平台的性能及其在无细胞蛋白质表达系统中的表现	展示了磁性nMOFs通过反义有效载荷传递调节基因表达且不抑制蛋白质合成，并利用无细胞蛋白质系统（CFPS）在更受控条件下研究基因表达	仅少数研究探讨了磁性nMOFs的潜在毒性及其降解对细胞机制和翻译过程的影响	评估磁性nMOFs作为药物传递载体的性能及其在基因表达调控中的应用	磁性金属有机框架（nMOF）及其在无细胞蛋白质表达系统中的表现	生物医学应用	NA	无细胞蛋白质系统（CFPS）	NA	NA	NA
3	2025-07-11	CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers 2025-Jul-09, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.00382-25 PMID:40434115	研究论文	开发了一种基于CRISPR/dCas的对抗沉默技术（CRISPRcosi），用于重新编程dCas蛋白以对抗异源沉默蛋白	首次利用CRISPR/dCas技术对抗Lsr2样异源沉默蛋白，实现无需启动子工程的反沉默效果	研究仅在放线菌中进行验证，尚未在其他生物系统中测试	开发一种精确上调异源沉默靶基因表达的新方法	Lsr2样核相关蛋白（如CgpS和Lsr2）及其靶启动子	合成生物学	NA	CRISPR/dCas系统	NA	基因组转录组数据	使用不同sgRNA/dCas组合的系统报告基因研究，全基因组转录组分析
4	2025-07-11	The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies 2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-025-01795-9 PMID:40634759	综述	本文综述了急性髓系白血病（AML）的免疫逃逸机制，并探讨了免疫检查点抑制剂、疫苗及联合治疗策略的创新方法	揭示了AML的免疫逃逸机制，并提出了针对TP53突变AML的免疫检查点抑制剂联合去甲基化药物的新策略，以及通过树突状细胞融合靶向白血病相关抗原的治疗疫苗	面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性（如贫血、细胞因子释放综合征）、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战	评估AML免疫治疗的机制、挑战及未来方向，重点关注免疫检查点抑制剂和疫苗以改善治疗效果	急性髓系白血病（AML）及其免疫微环境	肿瘤免疫学	急性髓系白血病	免疫检查点抑制剂（如抗PD-1 nivolumab、抗CD47 magrolimab）、去甲基化药物（HMAs）、树突状细胞融合疫苗、单细胞基因组学、AI、合成生物学	NA	NA	NA
5	2025-07-11	Data-driven synthetic microbes for sustainable future 2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00556-4 PMID:40624030	perspective	本文提出数据驱动的合成微生物（DDSM）作为解决全球环境危机的生物技术方案	整合组学、机器学习和系统生物学设计工程微生物，以应对PFAS降解、温室气体减排和可持续生物制造等挑战	NA	推动合成生物学向环境韧性和循环生物经济方向发展	工程微生物	合成生物学	NA	组学、机器学习、系统生物学	NA	NA	NA
6	2025-07-11	Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast 2025-Jul-03, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936 PMID:40614874	综述	本文综述了酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展	强调结构相关衍生物共有的生物合成逻辑，并将其分为两大类：叶黄素（角黄素、玉米黄质、虾青素和紫黄质）和类胡萝卜素（藏红花酸、视黄醇、β-紫罗兰酮、β-环柠檬醛和独脚金内酯）	未来工作可能需要关注在不同酵母宿主中扩大产品多样性并提高生物合成效率以实现更可持续的生产	探讨酵母中β-胡萝卜素及其衍生物的微生物生产方法	酵母，特别是酿酒酵母和解脂耶氏酵母	合成生物学	NA	代谢工程策略和发酵优化方法	NA	NA	NA
7	2025-07-10	Single-Cell Nanoencapsulation: Chemical Synthesis of Artificial Cell-in-Shell Spores 2025-Jul-09, Chemical reviews IF:51.4Q1 DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00984 PMID:40403226	综述	本文综述了受自然界隐生现象启发的单细胞纳米封装技术（SCNE）在人工孢子构建中的最新进展	通过化学合成方法构建具有保护性和功能性的'细胞-壳'结构，赋予细胞外源性表型特征	未提及具体技术瓶颈或实验限制条件	开发具有定制功能的人工孢子结构	单细胞纳米封装技术（SCNE）构建的人工孢子	合成生物学/生物医学工程	NA	单细胞纳米封装（SCNE）	NA	NA	NA
8	2025-07-10	Magnesium-Free Assembly of Cationic Peptide/DNA Nanostructures with Defined Geometries for Anticancer Drug Delivery 2025-Jul-09, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.5c07816 PMID:40560802	研究论文	本研究提出了一种利用阳离子靶向肽替代传统镁离子促进DNA纳米结构自组装的方法，用于抗癌药物递送	使用细胞穿透肽(TAT)与癌细胞靶向肽(RGD)结合的阳离子靶向肽替代镁离子，显著提高了DNA纳米结构的膜穿透性、靶向性和稳定性	研究仅在免疫缺陷小鼠肿瘤模型中进行验证，尚未在更复杂的生理环境中测试	开发更高效的DNA纳米结构药物递送系统	DNA纳米结构和抗癌药物(阿霉素和KRAS siRNA)	纳米医学	癌症	DNA纳米结构自组装技术	NA	NA	免疫缺陷小鼠肿瘤模型
9	2025-07-10	Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health 2025-Jul-07, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335 PMID:40628054	research paper	本文探讨了藻类在食品生物技术中的进展及其在营养和微生物组健康中的应用	利用合成生物学和发酵技术提升藻类营养成分，开发新型功能性食品和共生食品	未提及具体藻类品种的应用限制或规模化生产的挑战	研究藻类作为可持续营养资源的潜力及其在食品生物技术中的应用	藻类及其衍生物（如多糖、寡糖）	食品生物技术	NA	合成生物学、发酵技术、酶水解	NA	NA	NA
10	2025-07-10	Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes 2025-Jul-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152 PMID:40628214	研究论文	本研究通过合成生物学方法构建了一个工程化大肠杆菌联合体，用于增强菲的降解效率	利用SCRaMbLE方法对关键基因进行实验室进化，显著提高了菲的降解效率	研究仅针对菲这一种多环芳烃，未测试其他PAHs的降解效果	开发高效降解多环芳烃(PAHs)的生物修复系统	工程化大肠杆菌BL21(DE3)联合体	合成生物学	NA	SCRaMbLE方法	NA	NA	三种工程化大肠杆菌菌株(SCRPHE033, SCRKA065, CRSA)
11	2025-07-10	A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor 2025-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.07.03.663076 PMID:40631274	研究论文	本研究开发了一种筛选小分子增强蛋白质稳定性的流程，并以细菌孤儿受体CU228为模型系统，发现了三种能显著提高其热稳定性的配体	首次将生物信息学分析、差示扫描荧光法、微流控调制光谱和饱和转移差示NMR技术相结合，系统性地筛选并验证了孤儿PAS蛋白的小分子配体	仅测试了约760种化合物片段库，可能遗漏其他潜在配体；研究局限于单一模型蛋白CU228	开发一种系统性筛选小分子配体的方法，以增强孤儿PAS蛋白的稳定性	来自Candidatus Solibacter usitatus的PAS-HTH转录因子CU228	合成生物学	NA	差示扫描荧光法(DSF)、微流控调制光谱(MMS)、饱和转移差示NMR(STD-NMR)	NA	蛋白质结构数据、热稳定性数据、光谱数据	约760种化合物片段库筛选，最终鉴定出3种有效配体
12	2025-07-10	An artificial intelligence-based approach for identifying the proteins regulating liquid-liquid phase separation 2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbaf313 PMID:40632496	研究论文	本文提出了一种基于人工智能的方法来识别调控液液相分离（LLPS）的蛋白质	利用ESM2_t36预训练蛋白质语言模型提取蛋白质序列的语义信息，并结合多层感知机分类器，显著优于传统序列分析方法	模型在测试数据集上的准确率为0.78，仍有提升空间	识别调控液液相分离（LLPS）的蛋白质，以应用于生物技术、材料科学和医学领域	蛋白质序列	生物信息学	NA	ESM2_t36预训练蛋白质语言模型	多层感知机分类器	蛋白质序列数据	913个阳性蛋白质序列和6584个阴性蛋白质序列
13	2025-07-10	Live-cell synthesis of biocompatible quantum dots 2025-Jul, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01133-5 PMID:40097832	研究论文	开发了一种在活细胞内合成生物兼容量子点的方法，并验证了其在多种细胞中的应用	通过精确的空间和时间序列耦合细胞内代谢途径，实现了量子点在活细胞内的合成，提高了生物兼容性	需要具备化学、生物学、材料科学和合成生物学专业知识的用户才能完成该流程	开发生物兼容量子点的合成方法，以扩展其在生物医学中的应用	酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7和MDCK细胞	合成生物学	NA	活细胞合成和准生物合成	NA	NA	酵母、金黄色葡萄球菌、MCF-7和MDCK细胞
14	2025-07-10	Application of Sensor Based on Circularly Permuted Fluorescent Protein in Molecular Biology, Metabolism, and Cellular Imaging 2025-Jul, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.70071 PMID:40630016	综述	本文综述了基于循环排列荧光蛋白（cpFP）的传感器在分子生物学、代谢和细胞成像领域的应用	探讨了通过循环排列荧光蛋白调整其对环境信号（如pH、离子浓度、电压或分子相互作用）的敏感性，并动态监测细胞内过程	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证研究支持	总结cpFP传感器的形成机制、结构动态分析与优化，及其在生物医学和合成生物学中的功能应用	循环排列荧光蛋白（cpFP）及其传感器应用	分子生物学	NA	循环排列荧光蛋白技术	NA	NA	NA
15	2025-07-09	Plant-Derived Natural Products Ameliorating Hypertension via Signaling Pathways: A Review 2025-Jul-08, The American journal of Chinese medicine DOI:10.1142/S0192415X2550051X PMID:40626404	综述	本文综述了2019年至2024年间发表的具有潜在抗高血压活性的植物源天然产物，探讨了它们通过靶向氧化应激、炎症、血管重塑和神经激素途径来预防高血压发展的机制	总结了70种独特的天然产物，并将其分类为黄酮类、萜类、生物碱类和植物提取物，提出了未来研究应优先考虑具有双重抗氧化/抗炎特性的天然产物、改进的生物利用度递送系统以及整合合成生物学的跨学科方法	仅涵盖了2019年至2024年间发表的文献，可能遗漏了早期的重要研究	评估植物源天然产物在高血压治疗中的潜在应用	植物源天然产物	药理学	心血管疾病	文献综述	NA	文本	70种独特的天然产物
16	2025-07-09	PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes 2025-Jul-08, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202509127 PMID:40626944	研究论文	本文提出了一种无需PCR的位点定向诱变方法，利用DNA切割DNA酶在重复序列上进行操作	开发了名为DANDA的新方法，通过单链DNA辅助双链DNA切口，扩展了DNA酶在双链超螺旋质粒上的应用范围	未提及具体的应用限制或潜在问题	克服传统PCR方法在重复序列上位点定向诱变的局限性	包含PCR不兼容重复序列的质粒	合成生物学	NA	DNAzyme切割技术	NA	DNA序列数据	未明确提及具体样本数量
17	2025-07-09	Plant Cytochrome P450 Enzymes for Bioactive Metabolites Biosynthesis, Growth Regulation and Stress Adaptation 2025-Jul-07, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf297 PMID:40623215	综述	本文总结了植物细胞色素P450酶（CYPs）在生物活性代谢物生物合成、生长调控和应激适应中的最新研究进展	从CYPs参与植物重要生物活性化合物生物合成及其在植物生长、发育和应激适应中的生理功能两个角度进行综述	目前数据库中记录的CYPs中仅有不到0.2%经过功能表征	增强对植物CYPs功能的理解，为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用铺平道路	植物细胞色素P450酶（CYPs）	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
18	2025-07-08	Scaling Up Postbiotics Production: A Prospective Review of Processes and Health Benefits 2025-Jul-07, Probiotics and antimicrobial proteins IF:4.4Q2 DOI:10.1007/s12602-025-10643-x PMID:40622649	综述	本文综述了后生元的生产工艺及其健康益处，探讨了优化生产的技术工具和面临的挑战	总结了优化后生元生产的工具和技术，包括Plackett-Burman设计、响应面方法(RSM)、田口方法和中心复合设计(CCD)，以及分子技术如基因工程、CRISPR-Cas9和代谢工程	工业生产规模扩大仍面临稳定性、质量、产量和一致性等挑战，高细胞密度与后生元产量之间的相关性尚需深入研究	探索后生元的生产工艺优化及其健康益处	后生元及其生产工艺	生物技术	心血管疾病	基因工程、CRISPR-Cas9、代谢工程	NA	NA	NA
19	2025-07-08	Opto-p53: A light-controllable activation of p53 signaling pathway 2025-Jul-04, Cell structure and function IF:2.0Q4 DOI:10.1247/csf.25017 PMID:40500178	研究论文	本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53，用于通过光控制p53信号通路	开发了光控p53信号通路的工具Opto-p53，并通过特定突变增强了光诱导p53激活的效果	未提及在体内实验中的应用效果	开发选择性激活p53的实验系统，以解析p53在细胞过程中的复杂作用	p53蛋白及其信号通路	合成生物学	肿瘤	光遗传学	Opto-p53（基于光诱导二聚化系统LID）	细胞实验数据	NA
20	2025-07-08	Regulation of the tagatose catabolic gene cluster and development of a tagatose-inducible expression system in the probiotic Escherichia coli Nissle 1917 2025-Jul-04, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02771-4 PMID:40615889	研究论文	开发了一种在益生菌大肠杆菌Nissle 1917中基于D-塔格糖的可诱导基因表达系统	利用D-塔格糖作为可代谢诱导剂，开发了新型基因表达系统，并揭示了D-塔格糖分解代谢的关键调控元件	未提及具体局限性	开发可靠的可诱导基因表达系统以扩展益生菌大肠杆菌Nissle 1917的应用	益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其基因表达调控	合成生物学	NA	差异RNA测序和序列分析	NA	基因表达数据	NA