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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Integrated Approach for Improving Lutein Production of Chlorella sp. via Adaptive Evolution and Casein Acid Hydrolysate
2025-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05279-0
PMID:40358910
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研究论文 | 本研究通过适应性进化和酪蛋白酸水解物调控开发了提高小球藻叶黄素产量的综合方法 | 结合适应性进化(苯酚胁迫)和代谢调控(NaCl与酪蛋白酸水解物)的集成策略显著提升微藻叶黄素产量 | 未探讨其他环境胁迫因子或代谢调控物质的协同效应 | 提高小球藻的叶黄素生产能力 | 小球藻(Chlorella sp.)及其进化菌株P30 | 合成生物学 | NA | 适应性进化、代谢调控 | NA | 生物化学分析数据 | 经过30代适应性进化的P30菌株及原始菌株 | 适应性进化 | 小球藻(Chlorella sp.) | NA | 工业生物技术 |
| 22 | 2025-10-05 |
How many plasmids can bacteria carry? A synthetic biology perspective
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240378
PMID:40730232
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综述 | 从合成生物学视角探讨细菌携带多重质粒的能力及其应用 | 首次系统探讨单个微生物携带独特质粒的最大数量问题 | NA | 研究细菌维持多重独特质粒的理论与实践可能性 | 细菌质粒系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 质粒载体 | 细菌 | 多质粒系统 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 23 | 2025-10-05 |
Structural modification strategies for ferritin nanoparticles and their applications in biomedicine: a narrative review
2025-Jul-31, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr01369k
PMID:40668604
|
综述 | 系统总结铁蛋白纳米颗粒的结构特性、天然优势及关键修饰策略,并讨论其在生物医学领域的多样化应用 | 全面梳理铁蛋白结构修饰策略及其在生物医学应用中的最新进展,提出结合人工智能和合成生物学等新技术的未来发展方向 | 仍面临生物安全性、规模化制备和临床转化等挑战 | 总结铁蛋白纳米颗粒的结构修饰策略及其生物医学应用进展 | 铁蛋白纳米颗粒 | 纳米医学 | 神经退行性疾病 | 化学修饰、基因工程、仿生矿化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、环境修复、工业生物技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
Monodisperse Giant Unilamellar Niosomes as Minimal Synthetic Cells
2025-Jul-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09950
PMID:40670353
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于非离子表面活性剂的巨型单层尼奥体(GUNs)作为合成细胞模型 | 首次利用液滴微流控技术制备单分散Span 80基GUNs,具有优异膜流动性和对小分子及质子的固有选择性渗透性 | NA | 开发更稳定、经济且具有良好渗透性的合成细胞模型 | 巨型单层尼奥体(GUNs) | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 糖酵解-线粒体级联反应系统 | 仿生微系统,合成生物学,药物递送 |
| 25 | 2025-10-05 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-Jul-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
|
研究论文 | 本研究揭示了病原体毒力因子malleicyprol中反应性丁烯酸内酯核心结构的生物合成机制 | 首次阐明通过两个聚酮链头对头融合形成硫模板化丁烯酸内酯的生物合成途径 | NA | 解析malleicyprol毒力因子中丁烯酸内酯核心结构的生物合成机制 | Burkholderia pseudomallei病原体中的malleicyprol毒力因子 | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学合成、体外生物转化重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 26 | 2025-10-05 |
Advances and obstacles of T cell-based immunotherapy in gynecological malignancies
2025-Jul-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02411-w
PMID:40713697
|
综述 | 全面分析CAR-T细胞疗法在妇科肿瘤中的进展、挑战及未来策略 | 整合临床前见解与转化临床数据,建立妇科肿瘤过继性T细胞疗法的战略框架,强调CAR-T技术与个性化新抗原疫苗及微环境重编程剂的协同潜力 | 治疗持久性和制造一致性仍存在持续限制 | 推进妇科恶性肿瘤中基于T细胞的免疫治疗 | 妇科恶性肿瘤(卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌) | NA | 妇科肿瘤 | CAR-T细胞疗法、合成生物学方法、多组学引导的抗原选择 | NA | 临床数据、临床前数据 | NA | CAR-T | T淋巴细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 27 | 2025-10-05 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
|
综述 | 探讨肿瘤内微生物群(特别是胞内细菌)在肿瘤演进中的作用及其在癌症治疗中的应用前景 | 系统阐述胞内细菌在肿瘤进展中的新机制,并提出基于合成生物学和工程化药物递送系统的靶向治疗新策略 | NA | 解析肿瘤内微生物群在癌症发生发展中的作用机制并探索其治疗应用 | 肿瘤内微生物群(特别是胞内细菌)及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 癌症 | 二代测序、生物信息学分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 28 | 2025-10-05 |
An enzyme-based approach for highly efficient self-replication of DNA origami dimers
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500160122
PMID:40674426
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于酶的高效DNA折纸二聚体自复制系统 | 使用耐热T4 DNA连接酶替代化学光交联,实现无UV照射的自复制,并引入竞争机制研究达尔文式进化 | NA | 研究DNA折纸结构的自复制行为和达尔文进化机制 | DNA折纸二聚体 | 合成生物学 | NA | DNA连接酶技术 | NA | NA | NA | DNA折纸技术 | NA | 自复制系统,竞争性生长机制 | 合成生物学,智能材料 |
| 29 | 2025-10-05 |
Protein design of two-component tubular assemblies similar to cytoskeletons
2025-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62076-3
PMID:40695817
|
研究论文 | 开发了一种受自然启发的蛋白质设计方法,利用两种不同蛋白质单元构建类似细胞骨架的动态管状结构 | 首次实现了两种不同蛋白质单元在精心设计条件下组装成具有动态柔性的管状结构,能够响应环境刺激可逆组装 | NA | 探索蛋白质高级结构组装的设计原理,模拟天然细胞骨架系统的动态行为 | 两种不同蛋白质单元及其组装形成的管状结构 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜 | NA | 结构图像数据 | NA | 蛋白质理性设计 | NA | 仿肌动蛋白丝和微管的管状组装结构 | 材料科学, 合成生物学 |
| 30 | 2025-10-05 |
Identification of cognate recombination directionality factors for large serine recombinases by virtual pulldown
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf691
PMID:40701553
|
研究论文 | 本研究利用AlphaFold2-multimer预测并实验验证了大丝氨酸重组酶的匹配重组方向性因子 | 首次使用AlphaFold2-multimer系统性地预测RDFs,成功识别了超过半数测试重组酶的潜在RDFs | RDFs缺乏序列保守性且与噬菌体整合酶基因缺乏同线性,增加了识别难度 | 开发识别大丝氨酸重组酶匹配重组方向性因子的计算方法 | 98个大丝氨酸重组酶及其重组方向性因子 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2-multimer预测、实验验证 | AlphaFold2-multimer | 蛋白质序列和结构数据 | 98个大丝氨酸重组酶测试集,其中9个作为测试案例 | 大丝氨酸重组酶系统 | NA | 整合型重组系统(噬菌体或移动元件插入模拟) | 合成生物学、基因组编辑 |
| 31 | 2025-10-05 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
|
研究论文 | 本研究开发了基因'保质期'电路来控制合成细菌的寿命,用于安全的环境修复应用 | 设计了可调节寿命的前馈激活网络电路,结合合成小调控RNA和基于asd的营养缺陷系统,实现了细菌程序化自毁 | NA | 开发合成细菌的生物安全控制策略,确保其在环境应用中的安全部署 | 工程化大肠杆菌及其基因调控电路 | 合成生物学 | NA | 基因电路设计、合成生物学工程 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 前馈激活网络、细胞裂解电路、营养缺陷系统 | 环境 |
| 32 | 2025-10-05 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
|
研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现完整的合成生物学计算系统,采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译,支持权重更新为负值 | NA | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA | NA | NA | 包含计算训练组件、测试组件和学习算法的DNA杂交反应电路 | 生物计算 |
| 33 | 2025-10-05 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-Jul-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 本研究开发了一种通过光响应DNA液滴动态调控酶级联途径的新方法 | 利用偶氮苯修饰的Y型DNA序列构建光响应液滴,首次实现了通过光控相分离动态调控酶级联反应 | 仅验证了两种酶级联系统,需要进一步测试更复杂的代谢途径 | 开发动态调控酶级联途径的新方法 | 酶级联反应系统(GOx/HRP/CAT和GAO/MPO/CAT) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离,光控技术 | NA | 生化实验数据 | 两种酶级联系统 | DNA纳米技术 | NA | 光响应DNA液滴系统,酶隔离与释放机制 | 合成生物学, 生物工程, 微反应器设计 |
| 34 | 2025-10-05 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨计算生物学在癌症治疗中的应用,重点介绍从头设计蛋白质和多肽结合剂的方法与前景 | 整合计算设计、定向进化和人工智能技术,突破天然蛋白质支架限制,开发高特异性癌症靶向分子 | 计算工具(如Rosetta和AlphaFold)对无序区域和构象动力学的预测准确性仍存在局限 | 开发新型蛋白质和多肽结合剂以改善癌症精准治疗 | 从头设计的蛋白质和多肽结合剂(如DARPins、PD-1/PD-L1微型蛋白抑制剂) | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | 医学 |
| 35 | 2025-10-05 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜结构揭示了噬菌体蛋白gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的转录调控机制 | 首次解析了gp79通过N端侵入RNA通道取代σ4,并在遇到gp36时改变构象稳定RNAP-启动子开放复合物的分子机制 | NA | 阐明噬菌体phiEco32蛋白gp79同时抑制宿主转录和激活自身转录的双重调控机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79和gp36、同源启动子 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、结构分析、生化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 36 | 2025-10-05 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
|
研究论文 | 开发了一种基于机器学习的计算工具,用于从复制起点序列预测ColE1类质粒的拷贝数 | 首个能够从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件工具,强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 简化质粒拷贝数设计,重新定义质粒工程工作流程 | ColE1类质粒的复制起点序列 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | DNA序列数据 | NA | 质粒工程 | NA | 质粒复制起点设计 | 工业生物技术,医学 |
| 37 | 2025-10-05 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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综述 | 本文通过机器学习视角探讨细胞内的模式识别机制,分析人工神经网络与生物信号通路之间的相似性 | 将机器学习概念框架应用于生物学系统,提出信号通路和基因调控网络具有内在计算能力的新观点 | NA | 探索人工神经网络与生物信号通路在结构和功能上的相似性与差异 | 细胞信号通路、基因调控网络、人工神经网络 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2025-10-05 |
High-Throughput 19F NMR Chiral Analysis for Screening and Directed Evolution of Imine Reductases
2025-Jul-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00498
PMID:40726787
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研究论文 | 开发了一种基于19F NMR的高通量手性分析方法,用于亚胺还原酶的筛选和定向进化 | 首次将19F NMR技术应用于高通量手性分析,能够同时评估对映选择性、立体偏好性和反应产率 | NA | 开发高效快速的手性分析方法以推动生物催化和合成生物学发展 | 亚胺还原酶及其在合成抗帕金森药物罗替戈汀中间体中的应用 | 合成生物学 | 帕金森病 | 19F NMR | NA | NMR光谱数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药 |
| 39 | 2025-10-05 |
Unraveling the Complexity of Plant Trichomes: Models, Mechanisms, and Bioengineering Strategies
2025-Jul-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26147008
PMID:40725255
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综述 | 本文综述了植物表皮毛的发育、结构和功能研究进展,重点探讨腺毛在植物合成生物学中的应用潜力 | 整合分子机制与新兴技术,提出了利用表皮毛进行可持续农业和生物制造的前瞻性框架 | NA | 探讨植物表皮毛的发育机制及其在合成生物学中的应用策略 | 植物表皮毛,特别是关键物种的腺毛分泌毛(GSTs) | 植物合成生物学 | NA | 模块化基因工程、代谢通道策略 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 可持续农业,天然产物发现,生物制造 |
| 40 | 2025-10-05 |
The V5-Epitope Tag for Cell Engineering and Its Use in Immunohistochemistry and Quantitative Flow Cytometry
2025-Jul-20, Biology
DOI:10.3390/biology14070890
PMID:40723447
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研究论文 | 系统评估V5表位标签及其抗体在细胞工程中的应用,包括免疫组织化学和定量流式细胞术 | 首次系统评估鼠源和人源化抗V5标签抗体在不同实验条件下的性能,并优化免疫组织化学方法以减少非特异性信号 | V5标签信号受特定固定剂和分离试剂影响,可能限制其在某些实验条件下的应用 | 开发用于合成生物学应用的V5标签检测工具箱 | V5标签融合蛋白、鼠源和人源化抗V5抗体、体外和体内实验样本 | 合成生物学 | NA | 免疫组织化学、流式细胞术、抗体人源化 | NA | 组织样本图像、流式细胞数据 | 46种人类正常或癌组织样本 | 表位标签技术 | 哺乳动物细胞 | 异源融合蛋白组装 | 医学 |