合成生物学相关文章
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当前共找到 62 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-07-07 |
Integrating incompatible tandem photobiocatalysis in artificial cells enables metabolic modulation of natural cells
2025-Jul-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu4828
PMID:40614183
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研究论文 | 本文设计了一种光生物催化人工细胞，通过缓解酒精诱导的氧化应激来调节肝细胞代谢 | 通过纳米细胞器分隔不相容的模块，实现了光催化辅因子再生与生物催化酒精代谢的空间分离，提高了反应效率并保护酶免受氧化损伤 | 未提及具体的人工细胞在体内应用时的长期稳定性及潜在免疫反应 | 开发具有实际应用价值的人工细胞系统，用于调节活体细胞代谢 | 人工细胞与肝细胞的共培养系统 | 合成生物学 | 肝病 | 光催化与酶催化技术 | NA | 生物化学数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 22 | 2025-07-07 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-Jul, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
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research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的镍铁氢化酶的多样性和适应性 | 揭示了镍铁氢化酶在含氧环境中通过多种独立进化策略抵御氧气抑制的机制 | 未提及具体实验数据或样本量来支持这些适应性机制的普遍性 | 研究微生物氢化酶在含氧环境中的适应机制和进化历程 | 细菌和古菌中的镍铁氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-07-07 |
Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives
2025-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932
PMID:40609762
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综述 | 本文综述了中链长度α,ω-二醇（mcl-diols）的微生物生产现状与未来展望 | 提出了基于脂肪酸生物合成或反向β-氧化途径的通用生物合成路径，并探讨了合成生物学、适应性实验室进化和AI驱动酶设计等未来发展方向 | 仍面临微生物底盘选择与优化速度慢、限速酶活性不足以及中间体和终产物毒性等问题 | 开发生物基中链二醇的可持续生产方法以替代化石基工艺 | 中链长度α,ω-二醇（mcl-diols） | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、高级蛋白质工程技术、过程优化、合成生物学、适应性实验室进化、AI驱动酶设计 | NA | NA | NA |
| 24 | 2025-07-06 |
Programmable DNA Hairpin Locker: Dual-Layer Encrypted Carrier Communication
2025-Jul-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c01802
PMID:40614219
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA的可编程双加密载体通信系统，利用DNA的分子可编程性和超高信息密度实现精确的信号识别与处理 | 开发了DNA发夹锁（DHL）架构，具有Exo λ抗性并支持动态响应DNA信号，同时设计了三种变体支持九种输入/输出配置 | 未提及系统在实际生物环境中的长期稳定性和大规模应用可行性 | 开发安全可靠的分子通信系统 | DNA分子通信载体 | 合成生物学 | NA | 分子编程、lambda核酸外切酶(Exo λ) | NA | 分子信号 | NA |
| 25 | 2025-07-06 |
Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes
2025-Jul-04, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04325-8
PMID:40615742
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综述 | 本文综述了利用计算策略增强微生物维生素B12生物合成潜力的各种方法 | 讨论了CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据整合等最新进展 | 未提及具体实验验证或实际应用效果 | 提高维生素B12的微生物生物合成效率以满足全球营养和治疗需求 | 微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、CRISPR-Cas9、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA |
| 26 | 2025-07-06 |
Beyond nature's clock: Accelerating genomic diversity through hypermutation
2025-Jul-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108638
PMID:40614910
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review | 本文系统性地探讨了超突变技术在克服自然突变率不足方面的进展及其在多个领域的应用 | 比较了不同超突变工具在突变范围、速率和类型等多个维度上的差异，为选择最佳诱变工具提供了指导 | 总结了该领域仍然存在的挑战，如高通量筛选方法的开发和AI驱动的突变结果预测模型的建立 | 探讨超突变技术如何弥补自然突变率的不足，以满足生物技术应用的需求 | 超突变技术及其在合成生物学、进化研究和工业应用中的潜在应用 | synthetic biology | NA | hypermutation technologies | AI-driven predictive models | genomic data | NA |
| 27 | 2025-07-06 |
Design and construction of light-regulated gene transcription and protein translation systems in yeast P. Pastoris
2025-Jul, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.008
PMID:39117107
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research paper | 该研究设计和构建了在酵母P. Pastoris中光调控的基因转录和蛋白质翻译系统 | 通过构建光调控的转录和翻译系统，解决了传统诱导启动子在发酵安全性和表达能力上的缺陷，并避免了化学诱导剂带来的复杂性 | NA | 优化P. pastoris在生物技术和合成生物学中的应用 | 酵母P. Pastoris | 合成生物学 | NA | 光调控基因转录和蛋白质翻译系统设计 | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-07-06 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2025-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
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research paper | 探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜以实现新功能 | 结合合成生物学的最新进展，开发新型生物系统以应对全球性挑战 | NA | 研究工程生物学在细菌生物膜控制和改造中的应用 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-07-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 研究线性聚合物在二元脂质膜上的动力学，通过流体动力学模拟和单分子追踪实验揭示了聚合物与脂质筏的相互作用 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜上形成脂质筏的组分，诱导并稳定单个脂质筏，进而对聚合物施加动态限制，导致其呈现膨胀但受限的二维构象和Saffman-Delbrück型扩散性 | 研究主要基于模拟和实验，可能未完全涵盖真实生物膜中所有复杂的相互作用 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术中的应用 | 线性聚合物和二元脂质膜 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟和单分子追踪实验 | Zimm模型和Saffman-Delbrück模型 | 模拟数据和实验数据 | NA |
| 30 | 2025-07-05 |
Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide
2025-Jul-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053
PMID:40611812
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研究论文 | 本研究开发了一种灵活的无细胞（膜）蛋白质合成系统（CF(M)PS），用于研究与膜蛋白相关的糖生物学，并成功应用于糖缀合物的生产 | 开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统，促进了转录-翻译耦合和膜蛋白的溶解，成功表达了膜结合的磷酸糖基转移酶并耦合了催化反应 | 未提及具体样本量或实验规模的限制 | 扩展合成生物学工具包，研究细胞外多糖的生物合成模块 | 微生物细胞外多糖（EPS）及其生物合成途径中的关键酶和膜相关生化反应 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统（CF(M)PS），纳米脂质体膜模拟技术 | NA | 生化反应数据 | NA |
| 31 | 2025-07-05 |
Flippase-Mediated Hybrid Vesicle Division
2025-Jul-04, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504519
PMID:40613217
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研究论文 | 本文展示了在聚合物脂质混合囊泡中重组活性Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶，以实现囊泡分裂 | 通过重组Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶在混合囊泡中实现跨膜不对称性，进而引发囊泡收缩和分裂，模拟细胞分裂过程 | 研究仅针对特定组成的混合囊泡系统，未验证在其他系统中的适用性 | 开发能够实现蛋白质介导分裂的合成系统，推动自下而上的合成生物学发展 | 由磷脂和两亲性嵌段共聚物组成的聚合物脂质混合囊泡 | 合成生物学 | NA | 脂质翻转酶重组技术 | NA | 实验数据 | 使用特定组成的混合囊泡系统（含1或2.5 mol%两亲性嵌段共聚物） |
| 32 | 2025-07-05 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Jul-04, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义 | 讨论了RNA如何选择性地以序列依赖的方式与脂质膜结合，并探索了这些相互作用在合成系统中设计RNA传感器和调控元件的潜力 | NA | 探索RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学和RNA世界中的应用 | RNA和脂质的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-07-05 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025-Jul-02, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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综述 | 本文综述了噬菌体基因重组策略在治疗和环境应用中的最新进展 | 探讨了多种噬菌体工程技术，包括CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、retrons和重启方法，展示了定制功能噬菌体的潜力 | 讨论了当前工程方法的局限性，如噬菌体抗性、免疫反应等 | 探索噬菌体基因重组策略在治疗和环境应用中的潜力 | 噬菌体及其基因重组技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、retrons和重启方法 | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-07-05 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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研究论文 | 本文开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 提出了一种简单的二肽，能够自组装成微米级液滴，并作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH下形成纤维状结构作为酯酶模拟物 | NA | 开发最小化的超分子催化剂设计策略，应用于酶学和合成生物学 | 二肽自组装形成的液滴和纤维 | 合成生物学 | NA | 液相分离(LLPS) | NA | NA | NA |
| 35 | 2025-07-05 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
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研究论文 | 本文介绍了BioPKS管道，一种自动化的逆生物合成工具，结合多功能I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶，用于化学生物合成 | 开发了BioPKS管道，结合RetroTide和DORAnet工具，自动设计I型聚酮合酶与单功能酶的合成路径，扩展了化学生物合成的可能性 | 未提及具体局限性 | 通过合成生物学方法更可持续地生产化学品 | I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶 | 合成生物学 | NA | 逆生物合成工具（RetroTide和DORAnet） | NA | 化学结构数据 | 155种生物制造候选化合物 |
| 36 | 2025-07-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
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研究论文 | 提出一个抽象层次结构，用于定义生物铸造厂的工作流程和操作，以促进合成生物学研究的互操作性 | 提出一个四层互操作性抽象层次结构，优化设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，提高实验工作流程的模块化、灵活性和自动化 | NA | 提高合成生物学研究的标准化和互操作性 | 生物铸造厂的工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-07-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
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research paper | 该研究开发了一种非破坏性、无标记的中红外成像和光谱技术，用于研究单个光开关脂质体的动态变化 | 利用散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM）实现了高时空分辨率的中红外成像和光谱分析，能够以30毫秒的采样时间跟踪动态变化 | 该方法可能仅限于特定类型的光开关纳米载体研究，且未涉及体内应用验证 | 推进光药理学、药物递送、纳米诊疗和合成生物学领域的研究 | 光开关脂质体（azobenzene-based photoswitchable lipids） | 纳米技术 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM） | NA | 图像和光谱数据 | 单个光开关脂质体 |
| 38 | 2025-07-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
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研究论文 | 本文创建了一个全面的RNA设计数据集，用于机器学习和RNA建模算法的基准测试 | 提供了一个包含超过32万实验验证实例的标准化基准数据集，用于RNA设计和建模算法的开发和评估 | 数据集虽然全面，但可能无法覆盖所有RNA结构和序列的多样性 | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战，推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术中的应用 | RNA分子及其二级结构和序列 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过32万实验验证实例 |
| 39 | 2025-07-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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research paper | 该研究通过挖掘乌头属植物的转录组数据，发现并验证了多种萜类合成酶和细胞色素P450单加氧酶的功能，揭示了它们在二萜类化合物结构多样化和生物活性形成中的关键作用 | 发现了9种能够提供ent-kaurene、ent-atiserene或16α-hydroxy-ent-kaurene骨架的TPSs和14种具有多功能的P450s，其中8种P450s能够在骨架的七个不同位点催化氧化反应 | 研究主要集中在乌头属植物中的二萜类化合物，可能不适用于其他植物或化合物类型 | 探索细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum）中的二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析和突变实验 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 两种乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum） |
| 40 | 2025-07-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了Vibrio anguillarum NB10的启动子区域，该区域在极端碱性条件下增强FK506结合蛋白型肽酰-脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一种新型极端碱性诱导启动子，可用于生物技术应用，如pH响应基因表达系统的开发 | 研究仅在大肠杆菌中测试了启动子活性，未在其他宿主系统中验证 | 研究Vibrio anguillarum NB10在极端碱性条件下基因表达的调控机制 | Vibrio anguillarum NB10的启动子区域及其调控的FklB基因 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析，β-半乳糖苷酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA |