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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
|
综述 | 本文系统评述了工程化蛋白质支架在癌症免疫治疗中的双重应用:治疗递送和肿瘤微环境分子成像 | 开发能够同时解决肿瘤穿透性不足和提供实时监测能力的多功能蛋白质支架平台 | 在将这些有前景的平台转化为临床应用方面仍面临持续挑战 | 开发用于癌症免疫治疗的多功能蛋白质支架平台 | 工程化蛋白质支架及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | 生成模型、强化学习 | 结构生物学数据、计算模型数据 | NA | 理性工程设计 | 重组表达系统 | 多功能蛋白质支架设计 | 医学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶的分子工程和生物技术进展及其工业应用 | 系统总结了多种酶工程策略(包括异源表达、CRISPR-Cas9、组学方法和纳米固定化)在提升β-葡萄糖苷酶性能方面的创新应用 | 未明确说明现有策略在工业放大过程中的具体实施障碍和成本效益分析 | 改善β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性以促进生物转化过程的工业应用 | β-葡萄糖苷酶及其工程化改造 | 工业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 使用里氏木霉Pcdna1启动子进行异源表达 | 能源, 食品, 医药 |
| 63 | 2025-10-05 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组水平鉴定了蛇根草中与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了三个Op10HGOs的酶活性 | 首次在蛇根草中全基因组鉴定15个10HGOs,并证实Op10HGO2和Op10HGO3在喜树碱生物合成中的关键作用 | 仅对三个Op10HGOs进行了酶活性验证,其他12个10HGOs的功能尚未明确 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为异源重建生物合成途径提供基因元件 | 蛇根草(Ophiorrhiza pumila)中的10-羟基香叶醇氧化还原酶 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行详细功能验证 | 转基因技术 | 蛇根草 | 喜树碱生物合成途径 | 医药 |
| 64 | 2025-10-05 |
Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential
2025-Jul, Archiv der Pharmazie
IF:4.3Q1
DOI:10.1002/ardp.70058
PMID:40685808
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综述 | 本文全面综述了香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的抗癌机制及临床潜力 | 系统阐述香豆雌酚衍生物通过调控多条信号通路抑制癌症的机制,并提出结合合成生物学、生物信息学和人工智能提升疗效的新方法 | 香豆雌酚类化合物存在生物利用度低、水溶性差、代谢快等临床应用挑战 | 探讨香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的机制及临床转化潜力 | 香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异秦皮啶和补骨脂定等香豆雌酚衍生物 | NA | 乳腺癌,卵巢癌,前列腺癌 | 合成生物学,生物信息学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 65 | 2025-10-05 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2025-Jul-20, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达技术在本氏烟草中成功重构了茄科植物甾体糖苷生物碱和甾体皂苷的生物合成途径 | 发现了番茄SlGAME2-NEW酶作为木糖转移酶的功能,并首次在本氏烟草中通过多基因组合表达成功合成了20种甾体代谢产物 | NA | 在异源植物宿主中重构复杂甾体代谢物的生物合成途径 | 番茄和茄子的甾体糖苷生物碱和甾体皂苷 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达技术、多基因组合表达 | NA | NA | NA | 瞬时表达系统 | 本氏烟草 | 甾体糖苷生物碱和甾体皂苷生物合成途径,涉及9-15个基因的组合表达 | 医药 |
| 66 | 2025-10-05 |
De novo designed protein guiding targeted protein degradation
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62050-z
PMID:40676011
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中使用的引导蛋白标记和降解系统(GPlad),能够精确降解多种蛋白质 | 使用从头设计的引导蛋白和精氨酸激酶实现无需预融合的靶向蛋白降解,并扩展出可逆抑制、光遗传调控和生物嵌合化等工具 | 目前仅在大肠杆菌中验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发无需预融合的靶向蛋白降解系统 | 荧光蛋白、代谢酶和人类蛋白质 | 合成生物学 | NA | 靶向蛋白降解技术 | NA | NA | NA | CRISPR干扰 | 大肠杆菌 | ON/OFF开关、信号放大器、振荡器 | 合成生物学,代谢工程 |
| 67 | 2025-10-05 |
Efficient, cell-type-specific production of flavonols by multiplexed CRISPR activation of a suite of metabolic enzymes
2025-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61742-w
PMID:40670339
|
研究论文 | 开发了一种在植物中实现细胞类型特异性CRISPR激活的系统,用于高效生产黄酮醇 | 首次实现了在稳定转基因植物中细胞类型特异性的多重基因激活,能够精确控制特定细胞层中的代谢通路 | 需要依赖荧光报告系统在细胞水平评估表达效果 | 开发植物合成生物学工具,实现细胞类型特异性的代谢工程 | 拟南芥根部内皮层和表皮细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统,荧光报告系统,原位荧光检测 | NA | 荧光图像,基因表达数据 | myb12突变体植物 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | 代谢途径重编程,黄酮醇生物合成通路 | 农业,工业生物技术 |
| 68 | 2025-10-05 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
|
研究论文 | 开发了一种高效的无疤痕体外组装方法,成功构建了百kb级别的人类功能性免疫球蛋白重链可变区基因片段 | 首次实现百kb级别复杂人类基因组片段的体外无疤痕组装,解决了高度重复区域的技术难题 | NA | 开发大规模人类基因组片段的高效组装方法 | 人类免疫球蛋白重链可变区基因片段 | 合成生物学 | NA | Gibson等温组装 | NA | DNA序列 | NA | Gibson Assembly | NA | 功能性免疫球蛋白基因片段 | 医学, 基础研究 |
| 69 | 2025-10-05 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
|
研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的系统,用于在大肠杆菌中实现高效全基因组基因激活 | 利用Tn5转座酶构建了首个近随机整合的全基因组基因激活系统,能够同时实现选择性生长和条件性基因激活 | NA | 开发高效的全基因组基因激活工具以促进细菌工程和功能基因组学研究 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | Tn5转座酶介导的转座 | NA | 基因组数据 | NA | Tn5转座酶 | 大肠杆菌 | 四环素诱导型启动子Ptet控制的基因激活系统 | 工业生物技术 |
| 70 | 2025-10-05 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
|
研究论文 | 本研究在运动发酵单胞菌中通过随机诱变和理性设计建立了可见报告基因系统 | 通过随机易错PCR和蛋白质理性设计增强eforRed色蛋白的光谱特性,特别是在非模式微生物中建立可见报告系统 | 研究局限于单一菌株和特定色蛋白,未在其他非模式微生物中验证通用性 | 开发用于生物制造和合成生物学的可见报告基因系统 | 运动发酵单胞菌和eforRed色蛋白 | 合成生物学 | NA | 随机易错PCR、蛋白质理性设计、光谱分析 | NA | 光谱数据、蛋白质表达数据 | NA | 随机诱变、理性设计 | 运动发酵单胞菌 | 可见报告系统,使用强启动子P-4S或P驱动突变eforRed表达 | 工业生物技术, 生物制造 |
| 71 | 2025-10-05 |
Biofortified Bacteria: The Role of Selenium-Enriched Microorganisms in Enhancing Animal Selenium Uptake-A Review
2025-Jul-17, Journal of animal physiology and animal nutrition
IF:2.2Q1
DOI:10.1111/jpn.70001
PMID:40674621
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综述 | 探讨富硒微生物(特别是细菌)作为新型有机硒补充策略在畜禽营养中的应用潜力 | 利用基因工程和合成生物学开发能够增强硒吸收、转化和积累的工程菌株 | 需要优化菌株选择、发酵工艺、生物安全性,并通过长期饲养试验验证效果 | 研究富硒微生物在改善动物硒营养状况中的应用 | 家禽和反刍动物 | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化遗传电路、硒响应生物传感器、可控生物转化途径 | 农业、生物医学、环境修复 |
| 72 | 2025-10-05 |
Computational Strategies to Enhance Vitamin B12 Biosynthesis Potential of Microbes
2025-Jul-04, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04325-8
PMID:40615742
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综述 | 讨论利用计算生物学方法增强微生物维生素B12生物合成能力的策略 | 整合CRISPR-Cas9基因组编辑、人工智能驱动的途径优化和多组学数据融合等最新技术 | NA | 提高微生物维生素B12的生物合成能力以满足全球营养和治疗需求 | 微生物维生素B12生物合成系统 | 计算生物学 | 营养缺乏症 | 代谢工程、合成生物学、比较基因组学、分子对接、多组学数据分析 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 维生素B12生物合成途径优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 73 | 2025-10-05 |
Regulation and induction of fungal secondary metabolites: a comprehensive review
2025-Jul-01, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04386-0
PMID:40590991
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综述 | 全面分析真菌次级代谢产物的调控机制、鉴定方法和增产策略 | 整合组学技术与计算模型优化发酵过程,倡导合成生物学与AI驱动代谢工程的跨学科创新 | 未明确提及具体研究局限性(综述文章特性) | 解析真菌次级代谢产物的生物合成调控机制并提升其产量 | 真菌次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 组学技术、响应面方法、人工神经网络 | 人工神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 74 | 2025-10-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 通过流体动力学模拟和单分子追踪实验研究线性聚合物在二元脂质膜上的动力学行为 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附到膜筏形成组分上可诱导并稳定单个脂筏,聚合物与脂筏共定位形成动态限制 | NA | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术中的应用 | 线性聚合物在二元脂质膜上的吸附和扩散行为 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟, 单分子追踪实验, 正态模态分析 | Saffman-Delbrück模型, Zimm模型, Stokes-Einstein模型 | 模拟数据, 实验追踪数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 生物传感, 治疗学, 合成生物学 |
| 75 | 2025-10-05 |
Combining synthetic biology with synthetic electrochemistry to expand the chemical space of the indolocarbazole family
2025-Jul-16, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d5ob00766f
PMID:40576641
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研究论文 | 本研究结合合成生物学与合成电化学技术,开发了一种环境友好的吲哚咔唑类化合物合成方法 | 首次将多步生物级联反应与电催化相结合,实现了吲哚咔唑类化合物的绿色合成,并观察到前所未有的N-N同源二聚化现象 | NA | 开发环境友好的吲哚咔唑类化合物合成方法,扩展该类化合物的化学空间 | 吲哚咔唑类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学, 合成电化学, 酶促糖基化, 电化学转化 | NA | 化学合成数据, 生物活性数据 | 17种化合物在20种人类肿瘤细胞系中测试 | 模块化共培养工程 | NA | 代谢通路重构, 生物级联反应 | 医药 |
| 76 | 2025-10-05 |
Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173
PMID:40600973
|
研究论文 | 提出管道代谢模型作为食品合成生物学的概念和操作框架,用于改善功能性食品分子的生产 | 将代谢网络抽象为管道(代谢途径)和阀门(关键酶)的网络,实现更直观的可视化和模块化工程 | NA | 降低合成生物学研究障碍,促进可持续食品生产创新 | 功能性食品分子(碳水化合物、蛋白质和脂肪)的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | 管道代谢模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢途径抽象为管道网络,关键酶作为阀门控制 | 食品, 工业生物技术 |
| 77 | 2025-10-05 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-Jul-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
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研究论文 | 本研究开发了一种新型脂质聚合物,通过将聚脯氨酸链锚定在膜上实现可逆相分离和微区形成,从而调控膜渗透性 | 首次合成了由L-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物,实现了膜锚定聚脯氨酸的可逆相分离和微区动态控制 | NA | 开发能够控制膜微区形成和渗透性的新型脂质聚合物系统 | 脂质囊泡和膜锚定聚脯氨酸聚合物 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜、FRAP(荧光漂白恢复)分析 | NA | 显微镜图像、扩散特性数据 | NA | NA | NA | 膜锚定聚脯氨酸微区形成系统 | 药物递送, 合成生物学 |
| 78 | 2025-10-05 |
Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide
2025-Jul-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053
PMID:40611812
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研究论文 | 开发了一种灵活的无细胞膜蛋白合成系统用于研究胞外多糖生物合成 | 开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统,实现了膜蛋白的转录翻译偶联和增溶 | NA | 扩展合成糖生物学工具包以研究复杂微生物代谢物 | 胞外多糖生物合成途径中的膜蛋白和关键酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统,纳米脂质体膜模拟技术 | NA | 生物化学数据 | NA | CF(M)PS | 无细胞系统 | 糖缀合物生物合成途径,左聚糖生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 79 | 2025-10-05 |
A digital plating platform for robust and versatile microbial detection and analysis
2025-Jul-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11525-6
PMID:40653544
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研究论文 | 提出一种结合传统平板培养与数字生物检测技术的数字平板平台,用于微生物快速分离、定量和表型分析 | 将传统平板培养原理与数字生物检测技术相结合,通过可更换琼脂盖片实现微环境灵活调控 | NA | 开发一种快速、高效的微生物检测和分析平台 | 微生物(包括大肠杆菌等) | 微生物检测技术 | NA | 数字生物检测技术、微阵列芯片技术 | NA | 微生物培养数据、表型特征数据 | NA | 微流控芯片 | 大肠杆菌 | NA | 临床诊断、环境微生物学、合成生物学 |
| 80 | 2025-10-05 |
Synthetic biology for space exploration
2025-Jul-12, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00488-7
PMID:40651964
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综述 | 探讨合成生物学在解决太空探索关键挑战中的应用前景 | 首次系统提出合成生物学在太空探索中解决资源利用、生命支持、辐射防护等关键问题的应用框架 | NA | 为太空探索中的生物再生生命支持系统、原位资源利用和辐射防护提供解决方案 | 太空探索中的生物技术应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 太空探索, 环境 |